王志浩,劉浩昂,蘭 凱,廉 婷,張旭東
(1.西安醫(yī)學院臨床醫(yī)學院中尼友好拉吉姆醫(yī)學實驗室,陜西 西安 710021;2.西安醫(yī)學院臨床醫(yī)學院陜西省呼吸病預(yù)防與診治工程中心,陜西 西安 710021)
膠質(zhì)瘤(glioma)占成人原發(fā)惡性腦腫瘤的75%,是人類最常見的原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性腫瘤[1]。目前認為膠質(zhì)瘤源自神經(jīng)膠質(zhì)干細胞或祖細胞,根據(jù)惡性程度不同,國際上將其分為WHOⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級[2]。據(jù)相關(guān)研究統(tǒng)計,高級別的膠質(zhì)母細胞瘤(GBM,WHOⅣ級)因生長迅速、侵襲性強、發(fā)病率、致死致殘率高,其患者中位總生存期(OS)僅14.4個月,且5年生存率不足10%[3]。目前臨床上膠質(zhì)瘤的治療主要為手術(shù)大范圍切除、放化療、基因靶向治療、免疫治療及電場療法等,但其治療效果不佳[4,5]。因此,研究膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展機制對膠質(zhì)瘤患者的早期干預(yù)及尋找治療新方法十分重要。10跨膜P24販運蛋白10(transmembrane P24 trafficking protein,TMED10)又稱TMP21,是一種定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體中間體(ERGIC)上的參與蛋白轉(zhuǎn)運的膜蛋白。近年來我國學者研究發(fā)現(xiàn),TMED10在非經(jīng)典蛋白分泌(unconventional protein secretion,UPS)過程中發(fā)揮重要作用[6-8]。此外,有研究表明,其還與細胞增殖[9]、細胞自噬[10,11]有關(guān)。近年來有許多學者研究TMED10與阿爾茲海默癥[12-14]、甲狀腺癌[15]、原發(fā)性肝癌[16]、自身免疫性疾病[17]等疾病的關(guān)系及可能存在的作用機制,但TMED10在膠質(zhì)瘤中的研究還很少。因此,本研究旨在分析TMED10在膠質(zhì)瘤中的表達情況,為研究TMED10在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展中的作用及尋找治療膠質(zhì)瘤的新靶點提供參考。
1.1 資料來源 研究數(shù)據(jù)來源于癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)在線數(shù)據(jù)庫(GEPIA,http://gepia.cancer-pku.cn/);中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(Chinese Glioma Genome Atlas, CGGA, http:/www.cgga.org.cn);String數(shù)據(jù)庫(https://www.string-db.org/)。
1.2 方法 使用 CGGA、GEPIA數(shù)據(jù)庫分析 TMED10在膠質(zhì)瘤不同臨床病理條件下的差異性表達情況,檢索方法:①Analyze-mRNA data;性別(Male vs Female),年齡(>42歲 vs<42歲),不同級別狀態(tài)(WHOⅡvs WHOⅢ vs WHOⅣ),發(fā)展狀態(tài)(原發(fā) vs 復發(fā));②Data type:mRNA;③ Dataset:mRNAseq_325;④Gene:TMED10;⑤臨界值設(shè)定P-value<0.05。利用CGGA、GEPIA 數(shù)據(jù)庫分析 TMED10 相關(guān)基因的表達與膠質(zhì)瘤患者生存預(yù)后的影響,檢索方法:①AnalyzemRNA data;②Survival;③Dataset:mRNAseq_325;④Gene:TMED10。通過 String數(shù)據(jù)庫對TMED10表達蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)進行分析。檢索方法:①Proteinname:TMED10;②Organism:Homo sapiens,并利用Kaplan-Meier、Kruskal-Wallis 進行統(tǒng)計學分析。
2.1 TMED10在膠質(zhì)瘤組織和正常對照組織中的表達比較 基于GEPIA數(shù)據(jù)庫過表達基因篩查發(fā)現(xiàn)TMED10在膠質(zhì)瘤中的表達高于正常組織(P=2.66E-98),見圖1、圖2。
圖1 膠質(zhì)瘤中TMED10的差異性分析
圖2 TMED10在膠質(zhì)瘤組織和正常對照組織中的表達
2.2 TMED10在不同膠質(zhì)瘤亞型中的表達比較TMED10在高級別的原發(fā)性膠質(zhì)瘤和復發(fā)性膠質(zhì)瘤組織中呈較高表達(P=1.1e-07),見圖3。
圖3 TMED10在不同類型膠質(zhì)瘤中的表達情況
2.3 TMED10在不同性別膠質(zhì)瘤組織中的表達比較不同性別膠質(zhì)瘤患者中TMED10的表達比較,差異無統(tǒng)計學意義(P=0.083),見圖4。
圖4 MED10在不同性別膠質(zhì)瘤組織中的表達
2.4 TMED10在不同年齡膠質(zhì)瘤組織中的表達比較TMED10在42歲以上與42歲以下膠質(zhì)瘤患者組織中的表達比較,差異無統(tǒng)計學意義(P=0.2),見圖5。
圖5 TMED10在不同年齡膠質(zhì)瘤組織中的表達
2.5 TMED10在不同級別膠質(zhì)瘤組織中的表達比較TMED10與膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展呈正相關(guān);不同級別的膠質(zhì)瘤TMED10表達比較,差異有統(tǒng)計學意義(P=7e-09),見圖6。
圖6 TMED10在不同級別膠質(zhì)瘤組織中的表達
2.6 TMED10在不同進展狀況的膠質(zhì)瘤組織中的表達比較 TMED10在原發(fā)性、復發(fā)性膠質(zhì)瘤組織中的表達比較,差異無統(tǒng)計學意義(P=0.075),見圖7。
圖7 TMED10在不同進展狀況的膠質(zhì)瘤組織中的表達
2.7 TMED10在不同年齡、性別、發(fā)病階段的膠質(zhì)瘤中的表達比較 TMED10在WHOⅡ、Ⅲ、Ⅳ級膠質(zhì)瘤中的表達比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);在WHO Ⅳ級男性膠質(zhì)瘤患者中TMED10的表達高于女性(P=0.027),TMED10在原發(fā)型、復發(fā)性膠質(zhì)瘤患者組織中表達比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見圖8~圖10。
圖8 TMED10在不同年齡階段的膠質(zhì)瘤中的表達
圖9 TMED10在不同性別膠質(zhì)瘤中的表達
圖10 TMED10在不同發(fā)病階段膠質(zhì)瘤中的表達
2.8 TMED10的表達與患者生存率的相關(guān)性 TMED10在原發(fā)性、復發(fā)性膠質(zhì)瘤中的表達與患者生存率呈負相關(guān)(P<0.0001;P=0.0081),見圖11。
圖11 TMED10的表達與患者生存率及生存時間的關(guān)系
2.9 TMED10表達蛋白相關(guān)作用網(wǎng)絡(luò)分析 TMED10與TMED2、NCSTN、APH1A等多個蛋白有相互作用,見圖12。
圖12 TMED10表達蛋白相關(guān)作用網(wǎng)絡(luò)分析
目前,TMED10作為一種介導UPS的分子備受關(guān)注。越來越多的研究證明TMED10調(diào)控細胞增殖、自噬,并且與神經(jīng)退行性疾病、自身免疫性疾病及癌癥發(fā)生發(fā)展有關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),無信號肽蛋白(leaderless cargo)在胞質(zhì)中HSP90A蛋白的幫助下去折疊后,必須與TMED10相互作用并使其發(fā)生寡聚化形成蛋白通道才能進入ERGIC內(nèi)并通過囊泡包裹分泌到細胞外[6,7]。同時,還有研究發(fā)現(xiàn)TMED10是自噬調(diào)節(jié)分子,抑制TMED10的表達會嚴重影響甲狀腺癌的生長,可能是通過激活A(yù)MPK/mTOR通路誘導自噬來調(diào)節(jié)癌細胞的生長[15]。研究發(fā)現(xiàn)[16],TMED10在原發(fā)性肝細胞癌(HCC)中呈現(xiàn)高表達狀態(tài),聯(lián)合使用SiTmed10、SiTMBIM4、SiDtd2(D-tyrosyl-tRNA deacylase 2)可以顯著促進肝癌細胞系Huh7、HepG2凋亡,而正常肝細胞系THLE-2幾乎不受影響,這一結(jié)果表明TMED10的小分子抑制劑可能是肝癌治療的新靶點。最新的研究發(fā)現(xiàn)[17,18],TMED10能阻礙TGF-βⅠ型(ALK5)和 Ⅱ型受體(TβRⅡ)復合物的形成,從而抑制TGF-β信號通路,進而抑制TGF-β介導的生長抑制現(xiàn)象。還有研究報道[19],巨細胞病毒免疫逃逸素m152/gp40可以通過TMED10錨定在宿主細胞的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上進而產(chǎn)生免疫逃逸現(xiàn)象。這些發(fā)現(xiàn)提示TMED10在膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展中可能發(fā)揮重要的作用,然而TMED10在膠質(zhì)瘤中的作用目前仍不明確。
本研究基于GEPIA、CGGA數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),TMED10在膠質(zhì)瘤組織中表達高于正常對照組織(P=2.66E-98);在不同級別的膠質(zhì)瘤中,TMED10的表達量比較,差異有統(tǒng)計學意義(P=7e-09);同時TMED10在原發(fā)性、復發(fā)性膠質(zhì)瘤組織中的表達與患者生存期呈負相關(guān)(P<0.0001;P=0.0081)。表明TMED10在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展過程中具有促進作用,可能是TMED10通過調(diào)控內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激過程,促進膠質(zhì)瘤細胞的惡性增殖。最后通過String數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn)TMED10有TMED2、NCSTN、APH1A等多個相互作用蛋白,可為后續(xù)的進一步研究提供相關(guān)依據(jù)。
綜上所述,TMED10在膠質(zhì)瘤組織中呈高表達狀態(tài),且與患者的生存率密切相關(guān);并且TMED10在細胞自噬、增殖、疾病的發(fā)生發(fā)展等方面的重要作用。因此,TMED10可能成為治療膠質(zhì)瘤的潛在靶點。