馬 俊,王志遠(yuǎn),梁杏玲,鄭澤中,楊漢春,張桂紅,4,王 衡,5*
(1.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院 廣東省臨床重大疾病綜合防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州 510642;2.國家非洲豬瘟區(qū)域?qū)嶒?yàn)室(廣州),廣州 510642; 3.中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,北京 100193;4.嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室茂名分中心,茂名 525000;5.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)非洲豬瘟防控技術(shù)研究中心與國家生豬種業(yè)工程技術(shù)研究中心,廣州 510642)
非洲豬瘟(African swine fever,ASF)是由非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一種對家豬和野豬具有高發(fā)病率與致死率的高度接觸性傳染病[1]。不同年齡的家豬與野豬,包括非洲疣豬、叢林豬與歐亞野豬等均易感,軟蜱是ASFV傳播過程中重要的生物媒介與儲存宿主[2]。家豬急性感染的最初臨床表現(xiàn)為發(fā)熱(體溫40~42 ℃)、食欲減退及嗜睡,隨后病情可發(fā)展為嘔吐、出血性腹瀉,以及懷孕母豬流產(chǎn)等。臨床檢查可見與血管炎相關(guān)的典型病理改變,包括皮膚紅斑、肺水腫、充血性脾腫大、出血性淋巴結(jié)炎,以及各器官的點(diǎn)狀出血。幾乎90%~100%有這些癥狀的豬將在7 d內(nèi)死亡[3]。1921年,ASF首次報道于非洲肯尼亞,在過去的一個世紀(jì),該病在世界五大洲范圍內(nèi)陸續(xù)被報道,已成為危害全球養(yǎng)豬業(yè)的重大傳染病之一,被世界動物衛(wèi)生組織列為法定報告的動物疫病[4-6]。自2018年傳入我國東北地區(qū)以來,該病在各省迅速傳播蔓延,給我國生豬產(chǎn)業(yè)帶來巨大挑戰(zhàn),是我國的一類動物疫病[7]。
ASFV是非洲豬瘟病毒家族已知的唯一成員,屬于有囊膜的雙鏈DNA病毒,基因組大小為170~193 kb,編碼68種結(jié)構(gòu)蛋白與超過100種非結(jié)構(gòu)蛋白[8]。其中,p30與p54蛋白作為病毒的囊膜蛋白,具有較強(qiáng)免疫原性,均能誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生中和抗體[9]。p30蛋白主要參與病毒內(nèi)化,在病毒感染早期即有較高水平表達(dá)[10];p54蛋白主要參與病毒粒子的組裝,在病毒感染早期可誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[11]。
目前,在我國山東與河南等地已經(jīng)分離出了不同程度的減毒變異毒株,在臨床常造成慢性潛伏性感染[12-13],且尚無針對ASFV的有效上市疫苗,因此對ASFV的監(jiān)測及早期精準(zhǔn)診斷成為疫情防控的重點(diǎn)工作內(nèi)容。酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)是世界動物衛(wèi)生組織推薦的常規(guī)血清學(xué)診斷方法之一。目前,基于p30與p54等蛋白的血清學(xué)診斷方法被廣泛建立[14-17],但傳統(tǒng)的重組蛋白作為診斷抗原局限于大規(guī)模表達(dá)與純化等生產(chǎn)工藝,在臨床的應(yīng)用效果各異。因此,本研究利用噬菌體展示十二肽庫篩選ASFV p30與p54蛋白抗原表位,并設(shè)計(jì)合成表位串聯(lián)多肽為包被抗原,建立能夠特異性檢測ASFV血清抗體的間接ELISA方法,對現(xiàn)有檢測方法進(jìn)行補(bǔ)充,為建立精準(zhǔn)、穩(wěn)定的ASFV檢測技術(shù)提供思路。
ASFV陰性參考血清由本實(shí)驗(yàn)室制備并應(yīng)用法國ID-VET ASFV 間接ELISA抗體檢測試劑盒檢測確認(rèn);ASFV標(biāo)準(zhǔn)陽性血清購自中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;經(jīng)典豬瘟病毒(CSFV)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)、豬細(xì)小病毒(PPV)、豬偽狂犬病病毒(PRV)參考陽性血清與小鼠陰性血清均為本實(shí)驗(yàn)室收集保存。ASFV p30蛋白mAb由本實(shí)驗(yàn)室制備與保存;ASFV p54蛋白mAb由普萊柯生物工程股份有限公司惠贈。Ph.D.-12噬菌體展示肽庫試劑盒為NEB公司產(chǎn)品;HRP-羊抗豬IgG為KPL公司產(chǎn)品,HRP-羊抗鼠IgG購自博士德生物公司;可溶性單組份TMB底物溶液購自天根生化科技有限公司;可拆卸ELISA酶標(biāo)板購自廣州潔特公司;商品化的ASFV間接ELISA抗體檢測試劑盒購自北京金諾百泰生物技術(shù)有限公司。多肽由上海強(qiáng)耀生物科技公司完成合成及純化。其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.2.1 p30與p54蛋白mAbs特異性親和噬菌體的生物淘選與測序分析 針對p30蛋白mAb的生物淘選與表位肽鑒定方法見本課題組已發(fā)表文章[18]。參照該方法對另一株針對ASFV p54蛋白的mAb(1B11)進(jìn)行特異性親和噬菌體的淘選與測序分析。試驗(yàn)采用固相淘選的方法,將靶分子用0.1 mol·L-1NaHCO3溶液(pH 8.6)稀釋至100 μg·mL-1,包被酶標(biāo)板,每孔150 μL;樣品于濕盒中4 ℃孵育過夜;使用2%BSA溶液封閉,于4 ℃孵育1 h;以0.1%TBST溶液作為第1、2輪洗滌液,0.5%TBST溶液作為第3、4洗滌液;每輪淘選加入100 μL噬菌體文庫(滴度控制在1×1011CFU),于室溫下孵育1 h;快速洗板10次;加入100 μL 0.2 mol·L-1Glycine-HCl溶液(pH 2.2),于室溫下孵育15 min,以洗脫特異性結(jié)合的噬菌體;加入15 μL mol·L-1Tris-HCl溶液(pH 9.1),以中和洗脫液;取10 μL產(chǎn)物進(jìn)行滴度測定,余下產(chǎn)物擴(kuò)增后用于下一輪淘選。隨機(jī)挑取第3、4輪淘選洗脫產(chǎn)物進(jìn)行單克隆噬菌體的擴(kuò)增及純化鑒定,將陽性噬菌體單克隆的PCR產(chǎn)物送至上海生物工程有限公司測序(引物如下,F(xiàn)-M13:5′-TCACCTCGAAAGCAAGCTGA-3′;R-M13:5′-CCCTCATAG-TTAGCGTAACG-3′),運(yùn)用MegAlign(Version 11.0)進(jìn)行比對分析,篩選獲得與p54蛋白氨基酸序列同源性高的十二肽序列,在此基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)合成多肽。
1.2.2 ELISA鑒定合成多肽與p54蛋白mAb的反應(yīng)原性 試驗(yàn)方法參照已發(fā)表文章[18]。多肽以碳酸鹽緩沖液稀釋至0.2 μg·孔-1,以100 μL·孔-1包被酶標(biāo)板,4 ℃孵育過夜,設(shè)置空白與陰性小鼠血清對照孔,p54蛋白mAb(初始濃度為0.2 mg·mL-1)用PBST進(jìn)行10-3倍~10-5倍稀釋,小鼠陰性血清10-3倍稀釋,其他操作參照間接ELISA常規(guī)程序。
1.2.3 ASFV不同基因型毒株間p54蛋白氨基酸同源性比較分析 通過NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene)下載獲取21種不同基因型ASFV毒株的p54蛋白氨基酸序列,以及12株ASFV基因Ⅱ型毒株序列,利用MegAlign(Version 11.0)進(jìn)行同源比對,分析上述鑒定的表位多肽氨基酸位點(diǎn)的保守性。
1.2.4 ASFV p30與p54蛋白空間構(gòu)象分析 使用QUARK(https://zhanggroup.org/QUARK/)從頭算法預(yù)測ASFV/HLJ/2018株p30與p54蛋白的空間構(gòu)象,分析試驗(yàn)鑒定的p30與p54蛋白表位多肽在空間上的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。
1.3.1 包被抗原種類的確定 以本研究通過生物淘選獲得與鑒定的抗原多肽結(jié)果為基礎(chǔ),設(shè)計(jì)合成以氨基酸GGG為接頭的ASFV p30與p54蛋白表位串聯(lián)多肽,分別在N端偶聯(lián)BSA與OVA,參照“1.2.2”的間接ELISA方法,將ASFV陰、陽性血清做1∶40、1∶80、1∶160、1∶320稀釋,設(shè)置空白與陰性對照孔,比較不同種類包被抗原與血清樣本的反應(yīng)效果,選擇最佳的ELISA的包被抗原用于后續(xù)試驗(yàn)。
1.3.2 反應(yīng)條件的優(yōu)化 采用棋盤滴定法,按照間接ELISA常規(guī)程序分別對多肽包被濃度(1.25、2.5、5和10 μg·mL-1,100 μL·孔-1,4 ℃孵育過夜),待檢血清稀釋度(1∶100、1∶200、1∶400和1∶800,100 μL·孔-1,37 ℃,1 h),HRP標(biāo)記抗體稀釋度(1∶5 000、1∶10 000和1∶20 000,100 μL·孔-1,37 ℃,30 min),封閉液(1%明膠溶液、2%BSA溶液、5%脫脂奶粉溶液和10%馬血清),封閉時間(1、2和3 h),血清稀釋液(0.05%PBST溶液、1%明膠溶液、2%BSA溶液和5%脫脂奶粉溶液),血清反應(yīng)時間(45、60和90 min)進(jìn)行優(yōu)化,以P值接近1.0且P/N值最大為標(biāo)準(zhǔn),確定該方法的最佳反應(yīng)條件。
用本研究建立的間接ELISA方法檢測已知的CSFV、PRRSV、PCV2、PPV與PRV抗體陽性血清各3份,每份血清設(shè)3個重復(fù)孔,設(shè)置陰、陽性對照孔,分析該方法特異性。
用本研究建立的間接ELISA方法檢測釋1∶100、1∶200、1∶400、1∶800、1∶1 600、1∶3 200倍比稀釋的陽性參考血清,分析該方法的檢測靈敏度。
隨機(jī)選取ASFV抗體強(qiáng)陽性、弱陽性與陰性血清各3份,使用同批次包被的酶標(biāo)板進(jìn)行5次重復(fù)試驗(yàn),檢驗(yàn)該方法的批內(nèi)穩(wěn)定性;使用3個不同批次包被的酶標(biāo)板進(jìn)行檢測,檢驗(yàn)該方法的批間穩(wěn)定性;分別計(jì)算出變異系數(shù),分析該方法的重復(fù)性。
使用本試驗(yàn)建立的間接ELISA方法檢測金宇保靈生物藥品有限公司所饋贈的ASFV感染試驗(yàn)的血清及本課題組2018年前收集的臨床血清,并與商品化的ASFV間接ELISA抗體檢測試劑盒(包被抗原為桿狀病毒表達(dá)的重組p30蛋白)的檢測結(jié)果相比較,利用SPSS軟件統(tǒng)計(jì)并繪制ROC曲線來評價該方法相對的檢測敏感性與特異性,并計(jì)算兩者的符合率。
針對p30蛋白mAb的生物淘選與表位多肽鑒定結(jié)果見本課題組已發(fā)表文章[18]。將與p54蛋白mAb特異性親和的噬菌體PCR產(chǎn)物送公司測序,測序結(jié)果與ASFV/HLJ/2018株p54蛋白氨基酸序列進(jìn)行比對,結(jié)果提示該蛋白mAb對應(yīng)表位分布于146PAEPYTT152之間(圖1)。在此基礎(chǔ)上,前后延長合成一段多肽進(jìn)行活性分析,多肽序列見表1。
圖1 p54蛋白mAb特異性親和噬菌體測序分析Fig.1 Sequencing analysis of p54 monoclonal antibody specific affinity phages
表1 合成肽信息
將合成多肽作為包被抗原與p54蛋白mAb進(jìn)行結(jié)合力驗(yàn)證,間接ELISA結(jié)果顯示,多肽在0.2~5 μg·孔-1的包被區(qū)間與p54蛋白mAb具有相似的結(jié)合力,隨著mAb稀釋倍數(shù)增加,結(jié)合能力下降,而陰性小鼠血清與多肽幾乎不反應(yīng)(圖2)。
Peptide-SA在N端與BSA相連Peptide-SA was coupled with BSA in N terminal圖2 多肽與p54蛋白mAb結(jié)合能力Fig.2 Binding activities of the synthetic peptides to p54 monoclonal antibody
ASFV p54蛋白氨基酸序列比對結(jié)果顯示:141SAPAHPAEPYTT152多肽序列在ASFV 21種不同基因型毒株間相對保守,其中,145與149位氨基酸位點(diǎn)存在一定程度變異(圖3),但在12株ASFV基因Ⅱ型毒株間高度保守(圖4)。
ASFV/HLJ/2018株p30與p54蛋白空間構(gòu)象預(yù)測結(jié)果顯示,p30蛋白116—124位多肽主要位于α螺旋區(qū)域,而p54蛋白141—152位多肽主要位于不規(guī)則卷曲區(qū)域,但兩者均暴露于蛋白表面(圖5)。
2.5.1 包被抗原種類的確定 根據(jù)上述結(jié)果設(shè)計(jì)合成的表位串聯(lián)多肽序列信息見表2。間接ELISA結(jié)果顯示,以O(shè)VA作為N端偶聯(lián)物的多肽抗原與BSA相比具有較低的非特異性血清結(jié)合背景,且陰性對照組(OVA)均不與血清反應(yīng)(表3)。
2.5.2 反應(yīng)條件的優(yōu)化 通過對間接ELISA方法的優(yōu)化,最終確定:最佳抗原包被濃度為2 μg·mL-1,血清稀釋度為1∶100,HRP標(biāo)記抗體稀釋度為1∶5 000(表4);最佳封閉條件為1%明膠溶液封閉1 h(表5);最佳血清反應(yīng)條件為使用封閉液稀釋并作用60 min(表6);綜上,得到ELISA檢測的基本流程見表7。
圖3 ASFV不同基因型毒株間p54蛋白氨基酸同源性比較分析Fig.3 Comparative analysis of amino acid homology of p54 protein among ASFV genotypes
圖4 ASFV基因Ⅱ型毒株間p54蛋白氨基酸同源性比較分析Fig.4 Comparative analysis of amino acid homology of p54 protein among ASFV genotype Ⅱ strains
a. ASFV/HLJ/2018株 p30蛋白;b. ASFV/HLJ/2018株 p54蛋白a. ASFV/HLJ/2018 strain p30 protein; b. ASFV/HLJ/2018 strain p54 protein圖5 ASFVp30和p54蛋白空間構(gòu)象Fig.5 Conformational structure of ASFV p30 and p54 protein
表2 合成的表位串聯(lián)多肽信息
表3 包被抗原種類的確定(OD450 nm)
2.5.3 間接ELISA閾值的確立 利用本研究建立的間接ELISA方法對90份豬陰性血清進(jìn)行檢測(表8),統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果計(jì)算可得:檢測結(jié)果的陽性臨界值為0.339;即設(shè)立間接ELISA檢測結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn)如下:在陰性對照兩孔平均OD450 nm值<0.286,陽性對照兩孔平均OD450 nm≥0.571的情況下檢測結(jié)果成立,當(dāng)OD450 nm<0.286判為陰性,0.286≤OD450 nm<0.339判為可疑,OD450 nm≥0.339判為陽性,可疑樣品復(fù)檢,若仍小于0.339,則判為陰性。
表4 抗原包被濃度、血清稀釋度及HRP標(biāo)記抗體稀釋度的確定
表5 最佳封閉液條件的確定
表6 最佳血清稀釋液及作用時間的確定
表7 間接ELISA的操作流程
采用本研究建立的間接ELISA方法分別檢測CSFV、PRRSV、PCV2、PPV與PRV抗體陽性血清樣本,結(jié)果如圖6a所示,該方法能特異性檢測ASFV抗體血清,具有良好的特異性。
利用建立的間接ELISA方法檢測倍比稀釋的ASFV陽性血清(稀釋倍數(shù)為1∶100、1∶200、1∶400、1∶800、1∶1 600、1∶3 200),結(jié)果顯示,該方法最低可檢測到1∶1 600稀釋的陽性血清樣本(圖6b)。
表8 陰性血清樣本在優(yōu)化條件下檢測的OD值
圖6 間接ELISA特異性(a)和敏感度(b)試驗(yàn)結(jié)果Fig.6 The specificity (a) and sensitivity (b) test results by the indirect ELISA
利用建立的間接ELISA方法對9份血清樣本的批內(nèi)及批間重復(fù)試驗(yàn)的變異系數(shù)均小于10%(表9),表明該方法具有較好的重復(fù)性。
表9 間接ELISA方法的重復(fù)性試驗(yàn)結(jié)果
用本研究建立的間接ELISA方法與北京金諾公司生產(chǎn)的ASFV抗體檢測試劑同時檢測320份豬血清樣品。統(tǒng)計(jì)結(jié)果并利用SPSS軟件分析評估,圖7結(jié)果顯示,該方法與商品化試劑盒的相對敏感性為97.3%;相對特異性為97.6%(P<0.001);兩者總體符合率達(dá)97.5%(表10)。
a. 間接ELISA檢測的散點(diǎn)圖,“0”和“1”分別表示商品化試劑盒檢測為陰性和陽性的血清樣本(n0=244,n1=76);b. 間接ELISA檢測結(jié)果的ROC分析a. Dot plot of the indirect ELIS, “0” and “1” represent negative and positive samples detected by commercial kit, respectively (n0=244,n1=76); b. ROC analysis of indirect ELISA result圖7 臨床血清樣品的間接ELISA檢測結(jié)果Fig.7 Indirect ELISA results of clinical serum samples
表10 間接ELISA與商品化試劑盒符合率試驗(yàn)結(jié)果
僅依據(jù)感染豬的臨床癥狀對ASF進(jìn)行診斷,容易和經(jīng)典豬瘟(CSF)、高致病性豬繁殖與呼吸綜合征(HP-PRRS)等具有相似臨床癥狀的疫病混淆,因此要輔助采取實(shí)驗(yàn)室檢測方法進(jìn)行最終診斷[19-20]。其中,以抗體ELISA檢測為代表的血清學(xué)診斷方法具備良好的診斷特異性與敏感性,已被廣泛應(yīng)用于非洲豬瘟的監(jiān)測和防控工作中[21-22]。當(dāng)豬被低毒力毒株感染時,高特異性與靈敏度的血清學(xué)診斷可能是監(jiān)測被感染動物的最佳方法。因此,研發(fā)出高質(zhì)量的血清學(xué)診斷試劑具有十分重要的意義。
ELISA作為世界動物衛(wèi)生組織推薦的ASFV血清學(xué)檢測方法,目前常用p30、p54、p72與p62等蛋白作為商業(yè)化試劑盒主要的包被抗原,且常見的診斷抗原分子多為全蛋白[14, 23],表達(dá)與純化等生產(chǎn)工藝煩瑣,容易造成非特異性識別。本研究應(yīng)用合成的表位串聯(lián)多肽分子作為診斷抗原,抗原成分單一,合成工藝成熟,保證了檢測的敏感性與特異性,常被用于相關(guān)病原的ELISA診斷方法研究。
ASFV p30和p54蛋白作為重要的抗原結(jié)構(gòu)蛋白,其抗原核心區(qū)域已被廣泛研究。Wu等[24]利用抗原截短與表位作圖的方法鑒定出了ASFV Georgia/2007株p30蛋白的4個獨(dú)立的線性表位,其中位于116—125 aa的抗原區(qū)在宿主抗體反應(yīng)中具有免疫優(yōu)勢。Murgia等[25]聯(lián)合使用ASFV OURT88/3株及真核表達(dá)ASFV BA71V株p30蛋白的免疫血清鑒定了位于111—130 aa的免疫優(yōu)勢區(qū)域。曹琛福[17]利用生物信息分析工具結(jié)合ASFV標(biāo)準(zhǔn)血清驗(yàn)證了TAN/08株p54蛋白的抗原位點(diǎn)為114HPTEPYT120。高瞻[26]利用生物信息預(yù)測與合成多肽驗(yàn)證鑒定了與ASFV陽性血清具有較高反應(yīng)原性的ASFV/HLJ/2018株p54蛋白145—151 aa區(qū)域。本研究通過新型的生物淘選方法篩選得到的p30(116TSSFETLFE124)和p54(143PAHPAEPYTT152)蛋白表位多肽再次驗(yàn)證了上述結(jié)果,且兩段表位多肽序列在不同基因型毒株間的保守度高,有利于發(fā)展免疫學(xué)診斷方法。
本試驗(yàn)以上述鑒定的兩段表位為基礎(chǔ),設(shè)計(jì)串聯(lián)多肽抗原,驗(yàn)證并選取了N端偶聯(lián)OVA的表位串聯(lián)多肽為診斷抗原,成功建立了能夠特異性檢測ASFV抗體的間接ELISA方法。
以噬菌體生物淘選方法獲得1株ASFV p54蛋白mAb所識別的抗原表位(143PAHPAEPYTT152),結(jié)合本課題組已發(fā)表的p30蛋白抗原表位篩選結(jié)果,建立了以ASFV p30與p54蛋白的表位串聯(lián)多肽作為診斷抗原的間接ELISA方法。應(yīng)用該方法檢測臨床血清樣本,與商品化試劑盒檢測結(jié)果的符合率為97.5%。該研究結(jié)果可為ASFV免疫學(xué)診斷方法提供新的思路,為ASFV的防控提供科學(xué)工具。