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    基于力導(dǎo)引算法的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級可視化

    2022-12-30 08:16:36安沈昊于榮歡
    計算機(jī)工程與設(shè)計 2022年12期
    關(guān)鍵詞:引力層級布局

    安沈昊,于榮歡+,薛 瓊

    (1.航天工程大學(xué) 復(fù)雜電子系統(tǒng)仿真重點實驗室,北京 101416;2.中國航天系統(tǒng)科學(xué)與工程研究院 信息工程研究所,北京 100032)

    0 引 言

    網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淇梢暬夹g(shù)能夠以圖形圖像的方式清晰展現(xiàn)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點的連接情況,幫助人們有效認(rèn)識和理解網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部特征和結(jié)構(gòu)[1]。力導(dǎo)引算法作為目前最常用的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淇梢暬夹g(shù),實現(xiàn)簡單、易于理解,適用于大多數(shù)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的可視化。但隨著復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)逐漸向多層化、復(fù)雜化發(fā)展,如何在狹小的屏幕范圍內(nèi)合理地展現(xiàn)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的宏觀整體結(jié)構(gòu)與局部細(xì)節(jié)結(jié)構(gòu)為基于力導(dǎo)引算法的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淇梢暬瘞砹司薮蟮奶魬?zhàn)。因此,為兼顧復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)在宏觀整體與局部細(xì)節(jié)方面的可視化分析,本文將力導(dǎo)引算法與層次聚類算法結(jié)合,提出了一種能夠在不同細(xì)節(jié)層級下展示復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)特征的可視化方法。首先簡要介紹了幾種經(jīng)典力導(dǎo)引算法,分析了當(dāng)前復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)在可視化研究方面的不足。之后在FR(Fruchterman Reingold)算法[2]的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn),提出了一種可變力導(dǎo)引算法(variable force-directed algorithm,VFDA),通過改變同一層級結(jié)構(gòu)下節(jié)點之間的引力來有效展示社團(tuán)結(jié)構(gòu)與層次結(jié)構(gòu)。最后描述了聚類規(guī)則,通過層次聚類算法對節(jié)點進(jìn)行聚類并建立網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級模型,實現(xiàn)不同層次下的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)可視化。通過對復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)實例數(shù)據(jù)進(jìn)行實驗與對比分析,驗證了本文可視化方法的有效性與適用性。

    1 經(jīng)典力導(dǎo)引算法

    力導(dǎo)引算法又稱彈簧模型,其原理是將網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點和邊模擬為鋼環(huán)和彈簧,二者共同組成為一個物理系統(tǒng)[3]。確定初始狀態(tài)之后,彈簧的相互作用會使鋼環(huán)位移,當(dāng)系統(tǒng)總能量消耗至最小值時鋼環(huán)保持靜止。彈簧模型為了減小距離過于遠(yuǎn)的兩個節(jié)點之間的作用力,并沒有遵循胡克定律,且每次迭代都需要計算節(jié)點的受力情況,對大規(guī)模網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行布局時算法運行度較高、布局效果較差。因此,不少學(xué)者在原算法的基礎(chǔ)之上進(jìn)行了改進(jìn),例如KK(kamada kawai)算法[4]、DH(davidson harel)算法[5]、FR算法、LinLog算法[6]等。

    KK算法在彈簧模型的基礎(chǔ)上引入了胡克定律,建立了能量模型,將節(jié)點位置的求解轉(zhuǎn)換為系統(tǒng)能量最小值的求解。在胡克定律中,單個彈簧的能量為

    E=kx2/2

    其中,k為彈簧的彈力系數(shù),x為彈簧的被拉伸量。因此,KK算法的能量公式為

    其中,kij節(jié)點vi與節(jié)點vj之間引力的強(qiáng)度,pi與pj分別表示節(jié)點vi與節(jié)點vj的位置, |pi-pj| 則表示兩個節(jié)點之間的笛卡爾距離,lij表示兩個節(jié)點之間的理想距離。KK算法的優(yōu)點是進(jìn)一步優(yōu)化了節(jié)點布局,并且加快了算法的收斂。

    DH算法受到其它優(yōu)化方法的啟發(fā)而采用了模擬退火思想,即將網(wǎng)絡(luò)布局的優(yōu)化過程模擬為某些物質(zhì)系統(tǒng)的冷卻過程,當(dāng)系統(tǒng)溫度衰減至閾值時,系統(tǒng)總能量達(dá)到最小值,所有節(jié)點不再移動。DH算法的能量模型公式為

    f(G)=∑λifi(G)

    上式包含了5方面要素,分別是點與點的距離、點與邊的距離、點與邊框的距離、邊的長度、邊的交叉程度,λi為每部分權(quán)重,并可以根據(jù)所要遵守的美學(xué)標(biāo)準(zhǔn)來設(shè)置。DH算法的優(yōu)點在于布局結(jié)果能夠達(dá)到全局最優(yōu)值,其缺點是所需時間較長。

    FR算法在彈簧模型的基礎(chǔ)上引入了粒子物理理論和模擬退火思想,將節(jié)點模擬為粒子,將邊模擬為粒子間存在的引力,所有粒子間均存在斥力,引力與斥力的相互作用使粒子獲得速度與加速度,從而不停運動,多次迭代之后系統(tǒng)溫度不斷下降從而達(dá)到動態(tài)平衡狀態(tài)。在這種設(shè)定之下,兩個相互連接的節(jié)點會趨于靠近,而所有節(jié)點因斥力作用又不會距離過近,節(jié)點分布整體上較為均勻。首先對初始化所有節(jié)點的位置,之后計算每個節(jié)點的受力情況并根據(jù)受力情況更新節(jié)點位置,根據(jù)當(dāng)前系統(tǒng)溫度選擇是否迭代或停止布局。與上述力導(dǎo)引算法相比,F(xiàn)R算法的聚類效果更加突出,其布局結(jié)果的美觀程度也更高,因此本文選擇在FR算法的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)。

    LinLog算法通過引入Barnes-Hut算法[7]來減少節(jié)點的位置與受力計算量,提高了算法的效率,并且提出了表示聚類分離效果的函數(shù),能夠更好地展示網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部結(jié)構(gòu)。其能量公式如下所示,等式右邊第一部分和第二部分分別表示相互連接的兩個節(jié)點之間的引力與任意兩個節(jié)點之間的斥力。采用Barnes-Hut算法對能量最小值得求解進(jìn)行優(yōu)化,當(dāng)ULinLog(p) 達(dá)到最小值時,代表布局結(jié)果已為最優(yōu)值

    ULinLog(p)=∑(vi,vj)∈E|pi-pj|-∑(vi,vj)∈V2ln|pi-pj|

    2 基于力導(dǎo)引算法的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化

    2.1 問題分析

    隨著復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論研究的不斷深入,其越來越多的結(jié)構(gòu)特征也逐漸被人們發(fā)現(xiàn)與關(guān)注。社會與科技的發(fā)展使某些領(lǐng)域的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)規(guī)模愈加龐大、結(jié)構(gòu)也更加復(fù)雜,例如天地一體化網(wǎng)絡(luò)[8],其網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)具有明顯的分層特性,若干個一級節(jié)點相互連接組成骨干網(wǎng),每個一級節(jié)點連接著若干二級節(jié)點,每個二級節(jié)點連接著眾多三級節(jié)點,之后依次向下疊加。除此之外,大部分復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)還兼具社團(tuán)特性,即父節(jié)點與其下眾多子節(jié)點組成了一個子網(wǎng)絡(luò),或部分子節(jié)點組成了一個子網(wǎng)絡(luò),子網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部節(jié)點聯(lián)系緊密從而構(gòu)成了一個社團(tuán),社團(tuán)外的子節(jié)點單獨與父節(jié)點相連。而且,子網(wǎng)絡(luò)之間還存在聯(lián)系稀疏的節(jié)點,即相互連接的兩個節(jié)點存在于同一層級中的不同社團(tuán)中。

    目前大多數(shù)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)都具有分層特性,其可視化方法一般基于單層網(wǎng)絡(luò)可視化方法和技術(shù)來解決新問題,即將多個不同層級的網(wǎng)絡(luò)聚合到同一層面,形成一個單層網(wǎng)絡(luò),之后通過單層網(wǎng)絡(luò)布局算法進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)布局,這種方法雖然易于實現(xiàn),但忽略了節(jié)點的異質(zhì)性與邊的多元性,不能完全展示網(wǎng)絡(luò)的層次信息[9]。因此大部分學(xué)者將其與聚類算法結(jié)合,通過將不同層級的節(jié)點依次聚類,根據(jù)顯示層級展示網(wǎng)絡(luò)多層結(jié)構(gòu)。比如湯穎等[10]結(jié)合FR算法與LinLog算法的優(yōu)點,提出了一種層級視覺抽象方法,基于結(jié)合算法的初始布局結(jié)果進(jìn)行多層級視覺抽象,既能清楚地觀察網(wǎng)絡(luò)整體結(jié)構(gòu),也能有效避免大規(guī)模數(shù)據(jù)帶來的視覺雜亂。劉鳳劍等[11]針對樣本的分集處理問題,提出了一種基于力導(dǎo)引模型的聚類算法,通過控制樣本間距與樣本局部密度,提高了聚類的準(zhǔn)確率。于少波等[12]結(jié)合空間信息網(wǎng)絡(luò)的層次性等特征,總結(jié)了多層網(wǎng)絡(luò)可視化技術(shù)的發(fā)展現(xiàn)狀與特點,并分析了目前遇到的問題與挑戰(zhàn),為多層網(wǎng)絡(luò)可視化方法的研究提供了參考與技術(shù)支持。

    但是,多層特征只是復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)特征之一,其另外一個重要的結(jié)構(gòu)特征是社團(tuán)特征。而上述可視化方法的研究幾乎都僅聚焦于體現(xiàn)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的層次結(jié)構(gòu)特征,忽略了其社團(tuán)結(jié)構(gòu)特征的展示。對于兼具多層化特征與社團(tuán)化特征的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)來說,父節(jié)點與父節(jié)點、父節(jié)點與子節(jié)點、子節(jié)點與子節(jié)點之間的連接關(guān)系都需要被呈現(xiàn)出來,只展示網(wǎng)絡(luò)的層次結(jié)構(gòu)而忽略其社團(tuán)特征并不能完全展現(xiàn)其結(jié)構(gòu)特性。另外,將力導(dǎo)引算法應(yīng)用于復(fù)雜層次數(shù)據(jù)的研究目前還較少,因此接下來將基于力導(dǎo)引算法和聚類算法對復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)可視化進(jìn)行研究。

    2.2 總體思路

    FR算法可以達(dá)到一定程度的聚類效果,但由于為不同節(jié)點之間定義了一個理想距離k,遵循節(jié)點均勻分布和邊長統(tǒng)一的原則[13],這使得該算法社團(tuán)結(jié)構(gòu)的展示不明顯,主要表現(xiàn)為邊長相對一致、子節(jié)點過于分散、不同社團(tuán)的子節(jié)點交叉遮擋現(xiàn)象嚴(yán)重,難以從布局結(jié)果發(fā)現(xiàn)明顯的層次結(jié)構(gòu)或社團(tuán)結(jié)構(gòu)特征。為此,提出了可變力導(dǎo)引算法(VFDA)以改善布局效果。首先在FR算法的基礎(chǔ)上增加同一父節(jié)點下子節(jié)點之間的引力,使同一子樹、同一社團(tuán)的節(jié)點相互聚攏,通過改變同層次節(jié)點之間的邊長展示社團(tuán)結(jié)構(gòu)與層次結(jié)構(gòu)。為優(yōu)化斥力的計算,在實現(xiàn)布局的過程中引入Barnes-Hut算法。為進(jìn)一步優(yōu)化布局結(jié)果,為所有節(jié)點增加了一個中心力,使最終布局結(jié)果處于場景中心,不會發(fā)生偏離。此時,節(jié)點將受到多個力,包括來自其它所有節(jié)點的斥力、與自身相連接節(jié)點的引力、位于布局中心位置的引力。最后,在VFDA算法的布局結(jié)果上,基于層次聚類算法對同一層次的節(jié)點進(jìn)行聚類,建立網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級模型,根據(jù)顯示層級展現(xiàn)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)社團(tuán)結(jié)構(gòu)與層級結(jié)構(gòu)。

    2.3 基于多力導(dǎo)引算法的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)布局

    2.3.1 算法描述

    定義一個無向網(wǎng)絡(luò)可由二元組G(V,E) 表示,其中V表示節(jié)點集,即V={v1,v2,v3,…}, |V|=N1表示節(jié)點數(shù)量為N1。E表示邊集,連接節(jié)點vi與節(jié)點vj的邊可用元素eij∈E來表示, |E|=N2表示邊數(shù)量為N2。網(wǎng)絡(luò)G可以被劃分為多個社團(tuán),所有社團(tuán)的集合可表示為C={c1,c2,c3,…}。

    FR算法布局速度快、易于實現(xiàn),且布局結(jié)果能在一定程度上體現(xiàn)出聚類效果,因此本文選擇在FR算法的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn),其相關(guān)定義如下

    其中,k表示節(jié)點之間的理想距離,C為常數(shù),S為網(wǎng)絡(luò)布局結(jié)果所處邊框的面積,N1為節(jié)點總個數(shù),當(dāng)系統(tǒng)趨近于穩(wěn)定狀態(tài)時,節(jié)點之間的距離將趨近于理想距離k。d表示兩個不同節(jié)點之間的笛卡爾距離,fa與fr分別表示兩個相互連接的節(jié)點之間的引力與兩個節(jié)點之間存在的斥力。

    由于斥力則存在于所有節(jié)點之間,而引力只存在于兩個相互連接的節(jié)點之間,因此下一步改進(jìn)措施:一是在計算節(jié)點斥力方面引入Barnes-Hut算法,加快算法收斂速度;二是在計算節(jié)點引力方面改變相關(guān)聯(lián)節(jié)點之間的引力,從而凸顯網(wǎng)絡(luò)的社團(tuán)結(jié)構(gòu);三是增加中心力,進(jìn)一步提高布局美觀程度。

    Barnes-Hut算法是一種解決N體問題的優(yōu)化算法,即在經(jīng)典力學(xué)規(guī)則下,已知多個物體的質(zhì)量、位置和速度,在此基礎(chǔ)上求解這些物體的后續(xù)運動情況。而復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的布局問題即可模擬為一個N體問題,所有節(jié)點的初始狀態(tài)位置隨機(jī)并保持靜止,在布局過程中節(jié)點受到其它節(jié)點的作用力而不斷運動,最終保持靜止。引入Barnes-Hut算法的目的是減少節(jié)點間斥力的計算量,其基本思想是將相互接近的m個節(jié)點模擬為一個節(jié)點,這個節(jié)點的位置就是這組節(jié)點的質(zhì)心位置,其質(zhì)量為該m個節(jié)點的質(zhì)量和。這樣,這組節(jié)點斥力的計算次數(shù)就由m次縮減到了1次,大大減少了每次迭代的計算量[14]。

    通過Barnes-Hut算法計算節(jié)點斥力分為以下3個步驟:

    (1)建立節(jié)點四叉樹

    四叉樹是一種每一個父節(jié)點最多可以有4個子節(jié)點的樹形結(jié)構(gòu)。在2D平面上,將布局所在的平面不斷遞歸地分為4個同樣的子區(qū)域,每個子區(qū)域就代表父節(jié)點下的一個子節(jié)點。如果某個子區(qū)域內(nèi)沒有節(jié)點,該子區(qū)域為一個葉子結(jié)點,不再對其進(jìn)行劃分。當(dāng)某個子區(qū)域內(nèi)存在多個節(jié)點時,該子區(qū)域為一個非葉子節(jié)點,之后繼續(xù)對其進(jìn)行劃分,直至之后的子區(qū)域內(nèi)最多只存在一個節(jié)點,完成后的節(jié)點四叉樹如圖1所示。

    圖1 節(jié)點四叉樹

    (2)計算質(zhì)心

    按照面積由小至大(從四叉樹底部由下至上)依次計算每個包含節(jié)點的子區(qū)域的質(zhì)心位置,只包含一個節(jié)點的子區(qū)域的質(zhì)心位置則直接為該節(jié)點的坐標(biāo)。

    (3)計算節(jié)點斥力

    計算節(jié)點vi所受斥力時,需要從四叉樹的根節(jié)點開始由上至下遍歷樹中所有節(jié)點。令w表示非葉子節(jié)點所代表的子區(qū)域的寬度,dvi表示節(jié)點vi到該非葉子節(jié)點質(zhì)心的距離,設(shè)定判定距離大小的閾值θ。如果w/dvi<θ, 那么這個非葉子節(jié)點距離該節(jié)點足夠遠(yuǎn),則將其內(nèi)部所有節(jié)點模擬為一個節(jié)點,其位置就是該非葉子節(jié)點的質(zhì)心;如果w/dvi>θ, 則在其子節(jié)點遞歸地進(jìn)行上述操作,最終計算出節(jié)點vi所受斥力的合力。

    由于計算特定節(jié)點所受的斥力可能來自單個節(jié)點,也可能來自一組節(jié)點,因此對斥力計算公式作出改進(jìn)

    frij=-k2MvjA1/d

    其中,k與d的定義不變。定義Mvj為該組節(jié)點的質(zhì)量和或單個節(jié)點vj的質(zhì)量,考慮到本文算法的適用對象以及運算量,統(tǒng)一將每個節(jié)點的質(zhì)量設(shè)定為一個固定值,因此Mvj的值僅由該組節(jié)點的個數(shù)決定。定義A1為斥力系數(shù),可通過調(diào)整該值控制斥力大小。節(jié)點vi所受斥力的合力為

    當(dāng)應(yīng)用對象與布局范圍確定之后,理想距離k即可作為一個固定值。此時,從原始引力公式可看出最終引力值fa將只受關(guān)聯(lián)節(jié)點間的笛卡爾距離d影響。而引力值fa與笛卡爾距離d成明顯的正比關(guān)系,距離的增大會帶來引力的增大,增加的引力會拉近兩個相互連接的節(jié)點,此時距離又將減小,從而使引力減小,其它情況亦是如此,最終在多次迭代后節(jié)點間的邊長趨近一致,布局結(jié)果難以體現(xiàn)明顯的社團(tuán)結(jié)構(gòu)。因此,需要從發(fā)現(xiàn)社團(tuán)結(jié)構(gòu)的角度出發(fā),針對兩個相互連接的節(jié)點是否處于同一個子樹內(nèi)對原始引力公式進(jìn)行改進(jìn)

    strength(vi,vj)=1/(min(degree(vi),degree(vj)))faij=(d-k)*strength(vi,vj)+A2*δ(cvi,cvj)

    設(shè)定節(jié)點vi與節(jié)點vj相互連接,faij表示二者之間的引力。當(dāng)d>k時,等式右邊第一部分為正數(shù);當(dāng)d

    為進(jìn)一步對布局結(jié)果進(jìn)行美化,使其符合人們的觀察方式,在布局場景中心增加了一個中心力Fc,對所有節(jié)點產(chǎn)生引力,其中A3表示引力常數(shù)。

    最終,節(jié)點vi所受到的合力為

    F(vi)=Fa(vi)+Fr(vj)

    2.3.2 算法步驟

    VFDA算法具體步驟如下:

    (1)讀取多層網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),輸入網(wǎng)絡(luò)G(V,E), 初始化所有節(jié)點位置 {Pv1,Pv2,Pv3,…} 和系統(tǒng)溫度T。

    (2)建立節(jié)點四叉樹,并計算每個含有節(jié)點的子區(qū)域的質(zhì)心位置。

    (3)計算所有節(jié)點之間的斥力與相互連接的連個節(jié)點之間的引力,獲得其速度與加速度,更新所有節(jié)點的位置 {Pv1,Pv2,Pv3,…}。

    (4)根據(jù)當(dāng)前迭代次數(shù)計算系統(tǒng)溫度T,若溫度達(dá)到閾值,則執(zhí)行下一步,若溫度高于閾值,則從第二步繼續(xù)執(zhí)行。

    (5)輸出所有節(jié)點的位置,完成布局。

    根據(jù)模擬退火算法可知,系統(tǒng)在初始狀態(tài)具有較高溫度,通過參數(shù)T控制迭代過程中節(jié)點的運動速度,溫度越高,節(jié)點運動越劇烈,位置的改變量就越大。隨著迭代次數(shù)的增加,系統(tǒng)溫度逐漸降低,節(jié)點位置的改變量逐漸減小。當(dāng)參數(shù)T衰減至閾值時,系統(tǒng)達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài),所有節(jié)點處于靜止?fàn)顟B(tài)。

    2.4 基于層次聚類算法的網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級模型

    當(dāng)在有限的屏幕范圍內(nèi)對大規(guī)模復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化處理時,大量的節(jié)點和邊會發(fā)生擁擠、交叉或重疊等現(xiàn)象,從而影響人們辨別和理解復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)。聚類算法在數(shù)據(jù)挖掘領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,能夠按照某些標(biāo)準(zhǔn)對數(shù)據(jù)進(jìn)行分組,生成簇結(jié)構(gòu),同一簇內(nèi)的個體存在某特性下相似的現(xiàn)象。將適用于數(shù)據(jù)分析的聚類算法與數(shù)據(jù)可視化的力導(dǎo)引算法相結(jié)合,能夠有效幫助人們理解、分析其中的信息[15]。

    層次聚類算法通過計算不同個體的相似度來逐步生成簇,相似度可以選擇不同的度量標(biāo)準(zhǔn),最終建立具有嵌套結(jié)構(gòu)的層次樹,適用于層次數(shù)據(jù)的聚類分析。因此,本文基于層次聚類算法,定義了一個顯示層級結(jié)構(gòu)的參數(shù)L,并將同一根節(jié)點下子節(jié)點之間的拓?fù)渚嚯x作為相似度的度量標(biāo)準(zhǔn),采用由下至上的方式逐步建立復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級模型。參數(shù)L決定在相應(yīng)層級上顯示聚類結(jié)果,參數(shù)L高時顯示網(wǎng)絡(luò)骨干結(jié)構(gòu),參數(shù)L低時則額外顯示骨干結(jié)構(gòu)下的低層級網(wǎng)絡(luò)。

    定義一個聚類c可由一個六元組 (sc1,sc2,dc,fc,Vc,Lc) 表示,sc1和sc2分別表示聚類c的兩個子聚類,dc表示兩個子聚類之間的距離,fc表示其父聚類,Vc表示此聚類中所包含的所有原始節(jié)點的集合,Lc則表示此聚類的結(jié)構(gòu)層級。首先從最底層葉子節(jié)點開始聚類,設(shè)定葉子節(jié)點vi和vj可分別由 (null,null,0,null,vi,Lvj) 和 (null,null,0,null,vj,Lvj) 來表示,null表示空值。如果二者之間距離dij最近,則將二者進(jìn)行合并,產(chǎn)生新聚類ck,此時ck可由 (vi,vj,dij,null,(vi,vj),Lck) 表示,而葉子節(jié)點vi和vj則分別更新為 (null,null,0,ck,vi,Lvi) 和 (null,null,0,ck,vj,Lvj)。 令父聚類的位置由其兩個子聚類的平均位置確定,父聚類之間的連接關(guān)系由其子聚類間的連接關(guān)系確定。為突出顯示聚類之間規(guī)模的差異,對聚類節(jié)點的半徑進(jìn)行可視化編碼,設(shè)置其半徑為所包含的原始節(jié)點的個數(shù)。由下至上遞歸地尋找距離最近且未被合并過的葉子節(jié)點或聚類進(jìn)行合并,最終生成的網(wǎng)絡(luò)層級結(jié)構(gòu)可由圖2的網(wǎng)絡(luò)層次結(jié)構(gòu)樹狀示意圖表示。每個單獨的葉子節(jié)點可看作葉子聚類,中間節(jié)點表示葉子節(jié)點合并后生成的聚類,根節(jié)點cg表示最終生成的聚類。為不同的聚類設(shè)置不通的顯示層級L,當(dāng)L為特定值時,截取當(dāng)前顯示層級以上的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行展示。

    圖2 網(wǎng)絡(luò)層次結(jié)構(gòu)樹狀示意圖

    3 實驗結(jié)果展示與分析

    3.1 實驗數(shù)據(jù)

    為檢驗上述可視化方法的有效性,基于WebStorm軟件和D3可視化工具開發(fā)了復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化插件,進(jìn)行基于瀏覽器的測試。本文選擇測試的數(shù)據(jù)見表1,其中Data-1為某衛(wèi)星網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),包含77個節(jié)點與254條邊,節(jié)點主要為衛(wèi)星節(jié)點與地面測控站,邊可分為星間鏈路、星地鏈路與地地鏈路。Data-2為某大型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),包含1831個節(jié)點與3429條邊。上述兩個數(shù)據(jù)集都為二層網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),為方便觀察,已對不同分支下的節(jié)點進(jìn)行了顏色的可視化編碼,從表1可看出兩個網(wǎng)絡(luò)的社團(tuán)內(nèi)邊數(shù)遠(yuǎn)大于社團(tuán)間邊數(shù),尤其是Data-1數(shù)據(jù),二者社團(tuán)特征較為明顯,社團(tuán)內(nèi)部節(jié)點之間聯(lián)系緊密,各社團(tuán)之間也存在較為稀疏的聯(lián)系。通過FR算法與VFDA算法分別對兩個數(shù)據(jù)集進(jìn)行力導(dǎo)引布局,基于Data-2數(shù)據(jù)的布局結(jié)果構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)層級結(jié)構(gòu),觀察不同層級的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)并進(jìn)行對比分析,期間設(shè)置相同的引力系數(shù)與斥力系數(shù)。

    表1 實驗數(shù)據(jù)集

    3.2 可視化結(jié)果分析

    首先用FR算法對Data-1數(shù)據(jù)進(jìn)行布局,布局結(jié)果如圖3所示。雖然能在邊緣處分辨出幾個社團(tuán)結(jié)構(gòu),但在圖的中間區(qū)域節(jié)點分布較為分散,導(dǎo)致不同子樹下的子節(jié)點相互混雜,個別社團(tuán)之間存在交叉現(xiàn)象,造成了視覺干擾。對Data-1數(shù)據(jù)用VFDA算法進(jìn)行布局,布局結(jié)果如圖4所示。Data-1網(wǎng)絡(luò)可大致分為若干棵節(jié)點樹,若干父節(jié)點組成了一個骨干網(wǎng),每個父節(jié)點下連接著眾多子節(jié)點,同時二者又與其它父節(jié)點或子節(jié)點存在著連接關(guān)系,大部分父節(jié)點與子節(jié)點組成了一個社團(tuán),也存在部分子節(jié)點自行組成一個小社團(tuán)的情況,符合該衛(wèi)星網(wǎng)絡(luò)的真實形態(tài)。從圖4可看出整個區(qū)域幾乎不再存在節(jié)點混雜的現(xiàn)象,并且邊的長度不再趨于平均化,不同子樹之間的邊長普遍大于某一子樹內(nèi)部的邊長,層次結(jié)構(gòu)更加明顯。而受社團(tuán)內(nèi)外不同引力的作用,同一社團(tuán)的節(jié)點更趨向布局在一起,不同社團(tuán)在整體上更加分散,每個節(jié)點自帶的斥力也避免了因節(jié)點過度聚攏而產(chǎn)生節(jié)點重疊的情況,這使得社團(tuán)結(jié)構(gòu)更加明顯。

    圖3 Data-1FR算法布局結(jié)果

    圖4 Data-1VFDA算法布局結(jié)果

    為進(jìn)一步驗證上述可視化方法的適用性,通過FR算法與VFDA算法分別對Data-2數(shù)據(jù)進(jìn)行布局,并對布局結(jié)果(如圖5和圖6所示)進(jìn)行對比分析。從圖5可看出,當(dāng)網(wǎng)絡(luò)規(guī)模過大時,在不進(jìn)行縮小的情況下,F(xiàn)R算法在有限的屏幕空間無法展示完整的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),并且不同子樹下節(jié)點之間存在嚴(yán)重的混亂交叉現(xiàn)象,節(jié)點與邊的布局也呈現(xiàn)為一種雜亂無章的狀態(tài),給用戶觀察網(wǎng)絡(luò)整體結(jié)構(gòu)造成極大干擾。而從VFDA算法的布局結(jié)果來看,雖然仍有少數(shù)節(jié)點在屏幕之外,但已不影響用戶對網(wǎng)絡(luò)完整拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的觀察與理解。且VFDA算法對于同一子樹內(nèi)的節(jié)點具有明顯的聚攏作用,從布局結(jié)果可明顯看出該網(wǎng)絡(luò)的層次結(jié)構(gòu)與各子樹的布局情況,包括子樹的位置分布與子樹內(nèi)的社團(tuán)結(jié)構(gòu)等,大部分子樹都存在分支,父節(jié)點下的某一個子節(jié)點是另外幾條分支子樹的父節(jié)點。

    圖5 Data-2FR算法布局結(jié)果

    圖6 Data-2VFDA算法布局結(jié)果

    對于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)來說,其拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的展現(xiàn)效果主要取決于布局結(jié)果中是否存在大量節(jié)點與邊的交叉混雜的現(xiàn)象,清晰明了的子樹結(jié)構(gòu)則有助于層次結(jié)構(gòu)與社團(tuán)結(jié)構(gòu)的展示。因此,從比較父節(jié)點處的雜亂情況出發(fā),選擇Data-2中若干個父節(jié)點,將兩種算法父節(jié)點處單位面積內(nèi)的節(jié)點數(shù)目進(jìn)行對比。如表2所示,同一個數(shù)據(jù)的不同算法結(jié)果表明VFDA能夠聚攏同一子樹下的節(jié)點,減輕子樹之間的交叉重疊情況。與FR算法布局結(jié)果比較,VFDA算法能夠更清晰地展示多層網(wǎng)絡(luò)的社團(tuán)結(jié)構(gòu)與層次結(jié)構(gòu),其可視化結(jié)果更符合網(wǎng)絡(luò)真實形態(tài),也更具觀賞性。

    表2 FR算法與VFDA算法父節(jié)點附近節(jié)點數(shù)目對比

    在VFDA算法布局的基礎(chǔ)上,通過層次聚類算法建立網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級模型,展示網(wǎng)絡(luò)特定層級結(jié)構(gòu),Data-2數(shù)據(jù)聚類后的布局結(jié)果如圖7所示。從中可以看出,在該顯示層級下,同一父節(jié)點下的子節(jié)點都已與其合并為一個聚類節(jié)點,其半徑大小即表示所包含子節(jié)點的個數(shù),聚類之間的連接關(guān)系也代表了所包含的子節(jié)點的連接關(guān)系。若所選網(wǎng)絡(luò)具有更多層級,則可以依次由下至上再次進(jìn)行聚類,并進(jìn)行不同層級的視覺抽象。綜上所述,該可視化方法可以讓人們直接從視覺上簡潔明了地清楚復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)不同層級的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與同一層級內(nèi)的社團(tuán)結(jié)構(gòu)。

    圖7 Data-2層次聚類布局結(jié)果

    3.3 交互方法

    考慮到顯示屏面積、數(shù)據(jù)規(guī)模等因素的影響,上述可視化方法不能盡善盡美地展現(xiàn)多層網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),需要通過某些交互手段輔助人們獲取、分析感興趣的信息?;贘avaScript語言的D3相較于其它可視化工具,能夠完美結(jié)合數(shù)據(jù)驅(qū)動的操作方式與可視化組件,并具有更加靈活的可視化交互方式[16]。

    基于D3為上述可視化方法添加了多種交互式操作,如圖8所示,常規(guī)的放大、縮小、平移、旋轉(zhuǎn)操作能幫助用戶從不同角度、不同尺度,觀察不同區(qū)域的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),兼顧宏觀結(jié)構(gòu)的概覽與局部細(xì)節(jié)的分析。當(dāng)用戶對初始布局結(jié)果不滿意時,可先用鼠標(biāo)點擊選中某個節(jié)點,再通過拖拽操作調(diào)整被選中節(jié)點的位置,直到布局結(jié)果為滿意為止。由于在此過程中節(jié)點位置不斷發(fā)生改變,網(wǎng)絡(luò)布局也會不斷進(jìn)行迭代,最終達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài)。標(biāo)記操作通過突出顯示特定的節(jié)點與邊,有助于用戶獲得某個感興趣的節(jié)點或聚類的連接關(guān)系。當(dāng)鼠標(biāo)懸停于特定節(jié)點上時,該節(jié)點會被標(biāo)記并放大,與其相連的邊與節(jié)點的邊緣也會被標(biāo)記,可清楚看出被選中節(jié)點與父節(jié)點、其它同一層級子節(jié)點的連接關(guān)系,也可看出該節(jié)點在社團(tuán)內(nèi)部的連接關(guān)系。

    圖8 交互操作

    4 結(jié)束語

    本文首先簡要介紹了幾種經(jīng)典力導(dǎo)引算法的原理與優(yōu)劣,針對目前復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化研究方面的存在的不足與多層網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)特點,提出了一種基于力導(dǎo)引算法的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級可視化方法。首先對FR算法進(jìn)行改進(jìn),通過引入Barnes-Hut算法優(yōu)化斥力的計算,根據(jù)兩個節(jié)點是否處于同一子樹內(nèi)來改變二者之間的引力,并增加了中心力,實現(xiàn)了多力導(dǎo)引布局,然后在多力導(dǎo)引布局結(jié)果上運用層次聚類算法進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)多細(xì)節(jié)層級模型的構(gòu)建并展示。從可視化結(jié)果的展示與分析來看,該可視化方法具有簡便、直觀的特點,能夠良好地展現(xiàn)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的不同細(xì)節(jié)層級拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與同一細(xì)節(jié)層級下的社團(tuán)結(jié)構(gòu),能允許用戶通過多種靈活的交互操作實現(xiàn)高層次宏觀結(jié)構(gòu)的概覽與低層級局部網(wǎng)絡(luò)細(xì)節(jié)的分析。局限之處在于當(dāng)網(wǎng)絡(luò)規(guī)模變大時,難以在低層級網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的布局中分辨關(guān)鍵節(jié)點或高一層級的父節(jié)點。

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