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    面向深度學(xué)習(xí)的胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割方法研究進(jìn)展

    2022-12-06 11:05:54曹路洋李建微
    關(guān)鍵詞:切片胰腺卷積

    曹路洋,李建微

    (福州大學(xué) 物理與信息工程學(xué)院,福州 350116)

    1 引 言

    胰腺癌是一種具有高惡性程度的消化系統(tǒng)腫瘤,早期診斷異常困難,且侵襲速度極快,其中約90%起源于導(dǎo)管腺癌[1,2].據(jù)美國(guó)癌癥中心最新統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,近5年胰腺癌生存率僅為10%[3].臨床手術(shù)切除是較為有效的治愈方案,術(shù)前醫(yī)生需要對(duì)病人的CT、MRI等醫(yī)學(xué)影像進(jìn)行逐層描繪,將二維切片在人腦中逐層轉(zhuǎn)化為三維立體影像,從而獲得病理組織與其周?chē)鞴俳M織的空間關(guān)系,這需要醫(yī)生具有豐富的讀片經(jīng)驗(yàn)以及較強(qiáng)的三維空間想象能力,且需要投入大量的時(shí)間和精力[4].影像中的偽影、氣影等也會(huì)產(chǎn)生一定的噪聲干擾,影響醫(yī)生的判斷[5],并且不同醫(yī)生之間的診斷結(jié)果不具有客觀一致性,容易因疲勞或經(jīng)驗(yàn)不足造成誤判[4,6].

    因此,為實(shí)現(xiàn)醫(yī)學(xué)影像中目標(biāo)器官的快速有效分割,研究者提出了基于閾值的圖像分割方法[7],基于區(qū)域的圖像分割方法[8-10]以及基于邊緣的圖像分割方法[11,12],但傳統(tǒng)方案在胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)了較大的弊端.由于胰腺在影像序列中占比較小、形態(tài)個(gè)體特異性強(qiáng)且組織邊緣灰度像素不均[13-17],而傳統(tǒng)分割方案需要過(guò)多的人工介入完成目標(biāo)提取,自我學(xué)習(xí)能力較弱,不具備抵抗偽影、氣影等噪聲干擾的能力,導(dǎo)致胰腺的語(yǔ)義分割結(jié)果較差.

    針對(duì)傳統(tǒng)方法遇到的問(wèn)題,研究者開(kāi)始將深度學(xué)習(xí)引入醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域.相比于依賴數(shù)學(xué)模型的表層學(xué)習(xí),深度學(xué)習(xí)減少了人為干擾,能夠?qū)W習(xí)到更抽象、更高維的特征,具有優(yōu)異的特征學(xué)習(xí)能力,快速高效的實(shí)現(xiàn)病灶區(qū)域檢測(cè)、病灶分割和分類(lèi).目前,基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像分割方案已經(jīng)應(yīng)用到各個(gè)腹部器官,如肝臟、腎臟、脾臟等,其分割結(jié)果的DSC系數(shù)已經(jīng)達(dá)到95%以上[18]但在胰腺這類(lèi)小器官的語(yǔ)義分割上,平均DSC系數(shù)仍然不能突破90%[19,20].截止2021年8月25日,本文在Web of Science上通過(guò)“胰腺”與“分割”兩個(gè)關(guān)鍵詞進(jìn)行初篩,排除眼科、血液學(xué)、社會(huì)學(xué)等不相關(guān)領(lǐng)域,共獲得文獻(xiàn)278篇,其中綜述性文章10篇,與深度學(xué)習(xí)相關(guān)綜述類(lèi)文獻(xiàn)3篇.Yao等人[21]綜述了2019年之前的胰腺分割方法,分為基于圖譜、區(qū)域、邊緣、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)以及其他五大類(lèi)別,涵蓋面較廣,但對(duì)基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的分割方案評(píng)述較少,無(wú)法構(gòu)建神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域的系統(tǒng)性認(rèn)知體系.Kumar等人[22]將檢索到的胰腺自動(dòng)分割相關(guān)文獻(xiàn)基于不同的算法進(jìn)行四元分類(lèi),對(duì)每類(lèi)文獻(xiàn)的DSC以及Jaccard系數(shù)加權(quán)平均后進(jìn)行多維度比較,但相關(guān)文獻(xiàn)年限截止到2019年,缺乏近幾年的文獻(xiàn)評(píng)述,并且同樣缺少基于深度學(xué)習(xí)的胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割方案的系統(tǒng)化總結(jié).Rehman等人[23]對(duì)基于深度學(xué)習(xí)的腹部器官分割方法進(jìn)行了系統(tǒng)性綜述,包括肝臟、腎臟、胰腺和胃,胰腺部分只粗略介紹了6篇具有代表性的分割方案,無(wú)法獲得更多相關(guān)信息.目前尚未檢索到中文的基于深度學(xué)習(xí)的胰腺分割綜述,因此現(xiàn)有文獻(xiàn)情況表明基于深度學(xué)習(xí)的胰腺分割領(lǐng)域探索性研究文章較少且缺乏系統(tǒng)性的總結(jié)性的文獻(xiàn).為解決上述問(wèn)題,本文總結(jié)了近五年來(lái)基于深度學(xué)習(xí)的胰腺分割方案,內(nèi)容分5個(gè)章節(jié)展開(kāi),梳理了常用的胰腺分割數(shù)據(jù)集,并對(duì)胰腺的深度學(xué)習(xí)分割方法進(jìn)行了較為詳盡的分類(lèi)與總結(jié),重點(diǎn)介紹了每種分割網(wǎng)絡(luò)的原理、基本思想、網(wǎng)絡(luò)架構(gòu),評(píng)述了方案的優(yōu)缺點(diǎn),并在統(tǒng)一評(píng)價(jià)指標(biāo)上進(jìn)行分割精度的比較.最后本文提出了現(xiàn)有的基于深度學(xué)習(xí)的胰腺分割方法存在的問(wèn)題,并對(duì)未來(lái)的研究趨勢(shì)進(jìn)行了展望.

    2 胰腺分割數(shù)據(jù)集

    深度學(xué)習(xí)的模型構(gòu)建依賴于大量的標(biāo)記數(shù)據(jù)集,但在醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域,數(shù)據(jù)稀缺問(wèn)題非常嚴(yán)重.計(jì)算機(jī)科學(xué)家由于沒(méi)有專(zhuān)業(yè)的醫(yī)學(xué)知識(shí),醫(yī)療設(shè)備及患者來(lái)源的支撐,不能完成批量性質(zhì)的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)采集,而滿足數(shù)據(jù)采集條件的醫(yī)學(xué)研究者由于數(shù)據(jù)的隱私性以及道德問(wèn)題不能將采集到的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)進(jìn)行公開(kāi)發(fā)布,且醫(yī)學(xué)影像人工標(biāo)注的時(shí)間成本以及圖像解析成本較為昂貴,限制了短時(shí)間內(nèi)大批量生產(chǎn)公開(kāi)性醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)的可能.

    為解決這一問(wèn)題,MICCAI等機(jī)構(gòu)收集了大量的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù),并在官網(wǎng)上公開(kāi)發(fā)布,為醫(yī)學(xué)圖像分割提供了強(qiáng)有力的數(shù)據(jù)支持,但即便如此,相較于肝臟、肺等常見(jiàn)的腹部器官,可公開(kāi)的帶有標(biāo)注的胰腺數(shù)據(jù)集仍然稀缺,目前只有NIH胰腺分割數(shù)據(jù)集以及醫(yī)學(xué)影像十項(xiàng)全能數(shù)據(jù)集為可公開(kāi)使用的胰腺醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù),如表1所示.

    表1 胰腺分割數(shù)據(jù)庫(kù)

    NIH胰腺分割數(shù)據(jù)集[24](NIH-82)包含來(lái)自80名受試者的82次腹部增強(qiáng)三維CT掃描(門(mén)靜脈造影劑注射后70秒),其中男性53名、女性27名.65名受試者沒(méi)有大范圍的胰腺器官病變或腹腔器官病變,17名受試者接受了腎臟切除手術(shù)的術(shù)前掃秒,為健康的器官捐贈(zèng)者.CT體積大小為512×512×D,其中D∈[181,466],表示沿人體長(zhǎng)軸方向的切片樣本數(shù)量,厚度從0.5毫米到1.0毫米不等,一名醫(yī)學(xué)生逐層對(duì)胰腺切片進(jìn)行了人工手動(dòng)標(biāo)記,并由經(jīng)驗(yàn)豐富的放射科醫(yī)生進(jìn)行檢驗(yàn)和修正.該數(shù)據(jù)集是公開(kāi)可用的,并且廣泛用于對(duì)胰腺CT分割框架進(jìn)行性能評(píng)估.

    醫(yī)學(xué)影像十項(xiàng)全能公開(kāi)數(shù)據(jù)集[25]包含10類(lèi)腹部器官,其中Task07_Pancreas公開(kāi)數(shù)據(jù)集由接受胰腺腫塊(導(dǎo)管內(nèi)粘液瘤、胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤或胰腺導(dǎo)管腺癌)切除術(shù)的患者組成,共有420個(gè)3D CT掃描序列,其中含有真實(shí)標(biāo)記的樣例數(shù)量為281例、測(cè)試樣例數(shù)量為139例.空間分辨率等于512×512像素,胰腺和胰腺腫塊(囊腫或腫瘤)由腹部放射學(xué)專(zhuān)家使用Scout應(yīng)用程序?qū)γ繌堃认貱T切片進(jìn)行手動(dòng)注釋.

    除了以上兩種帶有標(biāo)記的公開(kāi)數(shù)據(jù)集外,其他胰腺數(shù)據(jù)集基本為私有數(shù)據(jù)集,由研究者自行采集與標(biāo)記.此外,由于CT影像數(shù)據(jù)成像便捷且成本較低,相較于MRI影像數(shù)據(jù),胰腺的CT影像數(shù)據(jù)使用頻次更多.

    3 基于卷積維度的胰腺分割改進(jìn)方案

    胰腺的醫(yī)學(xué)影像既可呈現(xiàn)為三維體數(shù)據(jù)也可延固定軸向切分為多個(gè)二維圖像片層展現(xiàn),因此卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)輸入維度具有高度的靈活性,這也使網(wǎng)絡(luò)的卷積形式產(chǎn)生多樣性.受計(jì)算機(jī)設(shè)備限制,目前應(yīng)用最多的為二維卷積,二維卷積運(yùn)算量較小,網(wǎng)絡(luò)更容易實(shí)現(xiàn)輕量化與高效化,但由于二維卷積容易忽視片間特征關(guān)系,需要通過(guò)輔助手段對(duì)片間關(guān)系進(jìn)行學(xué)習(xí).三維卷積克服了建模片間關(guān)系的難題,但由于增加了一個(gè)維度,計(jì)算量也呈指數(shù)型增長(zhǎng).因此三維卷積特征提取能力雖然優(yōu)于二維卷積,但要求顯卡有較大的內(nèi)存量.偽三維卷積能在減少計(jì)算量的同時(shí)實(shí)現(xiàn)三維卷積片間建模功能.但采用該種卷積方式的模型泛化能力較差,尤其在標(biāo)記數(shù)據(jù)量稀缺的胰腺分割場(chǎng)景中,偽三維卷積不能呈現(xiàn)明顯的優(yōu)勢(shì).3.1節(jié)-3.3節(jié)將對(duì)此展開(kāi)詳細(xì)介紹.

    3.1 二維卷積

    近年來(lái)基于二維數(shù)據(jù)的深度學(xué)習(xí)胰腺分割方法較為普遍[32,33],將CT圖像的三維體積數(shù)據(jù)沿不同軸向分解為二維CT切片,單張切片在神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中進(jìn)行逐像素分類(lèi),進(jìn)而得到單層切片的分割結(jié)果,隨后集成冠狀面,矢狀面以及橫斷面的全局切片分割結(jié)果即可構(gòu)建胰腺的三維模型.但二維切片分割方案普遍通過(guò)提高單張切片的分割精度來(lái)提高胰腺三維數(shù)據(jù)的分割精度.由于胰腺切片間具有序列關(guān)系,僅依靠單張切片的片內(nèi)關(guān)系建模并不能獲取胰腺片間數(shù)據(jù)的非線性關(guān)系,因此二維分割方案往往不能涵蓋胰腺醫(yī)學(xué)圖像序列的全局特征,忽略了胰腺的片間空間連續(xù)性.

    Zhou等人[34]將胰腺的三維體數(shù)據(jù)沿冠狀、矢狀和橫斷3個(gè)不同軸向拆分為二維片層數(shù)據(jù),為減少胰腺類(lèi)不平衡問(wèn)題的影響,首先通過(guò)二維卷積網(wǎng)絡(luò)獲取胰腺三維體素的邊界框進(jìn)行ROI剪裁,剪裁過(guò)后的切片輸入細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)獲得不同軸向單層切片的最終分割,最后獲得胰腺三維立體分割數(shù)據(jù).其網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖1所示,雖然這種方法大量減少了背景像素干擾,但片間特征交流較少,忽略了胰腺的片間空間連續(xù)性,這也是二維卷積本身的缺陷所在.

    圖1 Zhou等人的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)[34]

    Fu等[35]同樣采用二維卷積對(duì)胰腺切片進(jìn)行處理,但與Zhou等人不同的是,F(xiàn)u等將不同卷積層的胰腺特征圖進(jìn)行融合,并通過(guò)多層上采樣結(jié)構(gòu)還原胰腺的多尺度信息來(lái)提高網(wǎng)絡(luò)對(duì)胰腺單層片層特征的學(xué)習(xí)能力.這種方法雖然增強(qiáng)了不同特征圖間的交流,能夠獲取單張切片分割過(guò)程中的上下文信息,但同樣沒(méi)有關(guān)注胰腺CT序列本身的三維時(shí)序信息.

    綜上所述,雖然在二維片層胰腺分割中可以通過(guò)不同的方法增強(qiáng)胰腺數(shù)據(jù)片內(nèi)特征的學(xué)習(xí),但處理單張切片的2D網(wǎng)絡(luò)會(huì)忽略相鄰切片之間的胰腺三維空間特征關(guān)系[4].這阻礙了胰腺片層間時(shí)序特征的提取,限制了網(wǎng)絡(luò)分割性能.因此,若采用二維卷積作為網(wǎng)絡(luò)主卷積方式,可設(shè)計(jì)時(shí)序特征學(xué)習(xí)結(jié)構(gòu)建模胰腺片間關(guān)系,如采用LSTM結(jié)構(gòu)對(duì)胰腺序列進(jìn)行卷積處理,或使用少量的三維卷積來(lái)增加網(wǎng)絡(luò)對(duì)于時(shí)序特征的關(guān)注度,進(jìn)而提高網(wǎng)絡(luò)的分割性能.

    3.2 三維卷積

    為使神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠捕獲胰腺時(shí)序信息,進(jìn)一步學(xué)習(xí)胰腺影像切片間的特征關(guān)系,研究者提出了3D網(wǎng)絡(luò)[36-39],3D網(wǎng)絡(luò)的輸入圖像從單層切片擴(kuò)展為多層時(shí)序切片,卷積維度也從二維擴(kuò)展為三維,具有時(shí)序維度的三維卷積可以對(duì)每個(gè)影像體塊進(jìn)行卷積操作,從而學(xué)習(xí)胰腺的片間關(guān)系.然而,由于維度的增加,3D網(wǎng)絡(luò)需要占用大量的計(jì)算和內(nèi)存資源,因此對(duì)設(shè)備要求較高[4].并且現(xiàn)有的3D網(wǎng)絡(luò)深度較淺,不能通過(guò)構(gòu)造深層網(wǎng)絡(luò)來(lái)提取胰腺醫(yī)學(xué)影像的深層語(yǔ)義信息,典型的3D網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖2所示.

    圖2 3D網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)[40]

    Oktay[38]采用的是典型的3D UNet架構(gòu),雖然其提出的注意力機(jī)制使網(wǎng)絡(luò)分割精度有所提高,但由于3D卷積的介入,盡管基線網(wǎng)絡(luò)深度較淺,模型的計(jì)算成本仍然偏高.

    為減少三維網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算量,研究者在使用三維網(wǎng)絡(luò)分割前會(huì)采用不同的方案對(duì)胰腺位置進(jìn)行定位剪裁,該處理方法能夠在減少網(wǎng)絡(luò)計(jì)算量的同時(shí)減少胰腺類(lèi)不平衡問(wèn)題帶來(lái)的影響.Oda等人[41]為保留3D卷積的優(yōu)勢(shì),同時(shí)降低設(shè)備內(nèi)存消耗,使用三維FCN提取胰腺的全局特征信息,之后通過(guò)回歸森林估計(jì)胰腺的邊界框,根據(jù)邊界框內(nèi)的胰腺概率圖集進(jìn)行精細(xì)的胰腺分割,相較于Attention Unet[38],降低了單張切片的學(xué)習(xí)成本,且減少了復(fù)雜多變的背景像素的干擾.Roth等[40]舍棄了傳統(tǒng)的矩形ROI剪裁方案,采用訓(xùn)練的粗分割階段網(wǎng)絡(luò)沿腹部器官邊界框定候選分割區(qū)域,該方案相較于矩形框選方案能大大減少背景像素的干擾,從而為下一個(gè)3D訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò)減少不必要的學(xué)習(xí)任務(wù),進(jìn)而減少3D網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練內(nèi)存占用量.然而,Roth等人在輸入前繼續(xù)將候選區(qū)域隨機(jī)采樣為多個(gè)子體塊,由于每個(gè)體塊邊界分割結(jié)果不一致[42],拼接時(shí)體塊銜接處不能達(dá)到完全重合,這對(duì)于胰腺這類(lèi)小器官的分割十分不利,因此相較于實(shí)驗(yàn)中的肝臟與脾臟,胰腺DSC結(jié)果最低.He等人[43]為減少三維網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算量提出了一種引導(dǎo)分割方案,采用馬爾可夫鏈蒙特卡羅(MCMC)來(lái)引導(dǎo)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)胰腺的三維圖像進(jìn)行分割,MCMC負(fù)責(zé)在胰腺的先驗(yàn)空間中選擇胰腺三維體塊,使卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的學(xué)習(xí)區(qū)域能夠自適應(yīng)的集中在目標(biāo)像素區(qū)域,訓(xùn)練好的3D-UNet負(fù)責(zé)對(duì)預(yù)選體塊進(jìn)行精細(xì)分割,之后逐塊融合獲得胰腺的整體預(yù)測(cè)分割結(jié)構(gòu).此引導(dǎo)分割方案雖然優(yōu)于文獻(xiàn)[40,41]的ROI剪裁與邊界剪裁,大大減少了第2階段3D網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算量,但其依賴于先驗(yàn)空間預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和MCMC的初始目標(biāo)體塊選擇準(zhǔn)確性,因此仍具有局限.Wang等人[44]設(shè)計(jì)了三維胰腺區(qū)域回歸網(wǎng)絡(luò)(PancreasNet)用于檢測(cè)胰腺位置,之后在檢測(cè)到的目標(biāo)區(qū)域內(nèi)通過(guò)兩種尺度的SEVoxNet進(jìn)行注意力機(jī)制特征提取以及精細(xì)分割.在經(jīng)過(guò)了PancreasNet的胰腺區(qū)域定位后,SEVoxNet的處理速度明顯優(yōu)于文獻(xiàn)[15,39,60]中提出的網(wǎng)絡(luò),以上方案表明三維卷積與定位剪裁相結(jié)合在胰腺語(yǔ)義分割領(lǐng)域具有一定的優(yōu)勢(shì).

    Fang等人[16]提出了漸進(jìn)融合網(wǎng)絡(luò),如圖3所示,該網(wǎng)絡(luò)在編碼部分通過(guò)三維卷積提取胰腺的三維信息,解碼部分采用二維卷積完成胰腺的單張切片概率預(yù)測(cè),并通過(guò)全局引導(dǎo)分支獲取胰腺的全局特征,這種將三維卷積與二維卷積分別用于編碼器與解碼器的分割方式,有效解決了網(wǎng)絡(luò)計(jì)算量過(guò)大以及單純的二維卷積無(wú)法獲取三維時(shí)序信息的問(wèn)題,也為后續(xù)偽三維卷積的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ).

    圖3 Fang等人網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)[16]

    雖然三維卷積網(wǎng)絡(luò)在胰腺的分割上展現(xiàn)了良好的分割性能,但根據(jù)Lai 等人[45]的研究,三維卷積顯著增加了計(jì)算成本(2D:51.56分鐘,3D:173.73分鐘),對(duì)計(jì)算機(jī)內(nèi)存消耗量巨大,因此也限制了網(wǎng)絡(luò)深度的增加以及感受野的擴(kuò)張,無(wú)法獲取更深層次的胰腺三維特征.若想采用三維卷積進(jìn)行分割可事先對(duì)胰腺醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行ROI剪裁,減少矩陣計(jì)算量,也可采用Fang等人[16]的編解碼方式,在三維卷積中加入二維卷積,通過(guò)減少卷積維度的方式使網(wǎng)絡(luò)整體的計(jì)算量得到降低.

    3.3 偽三維卷積

    2D卷積忽略了切片間的時(shí)序信息,而三維卷積涉及的高維矩陣運(yùn)算計(jì)算成本過(guò)高,部分胰腺分割網(wǎng)絡(luò)的感受野與網(wǎng)絡(luò)深度受限.為解決這些問(wèn)題Giddwani[46]等人引入2P1D卷積,如圖4所示,該卷積用2D卷積與1D卷積的組合卷積形式代替3D卷積,在減少計(jì)算量同時(shí)增強(qiáng)了模型對(duì)時(shí)序信息的捕捉能力以及對(duì)全局特征的優(yōu)化能力.

    圖4 2P1D卷積的可視化視圖[46]

    與Giddwani等人[46]不同的是Liu等人[47]通過(guò)改變輸入數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)偽三維卷積,通過(guò)超像素聚類(lèi)相似像素區(qū)域,對(duì)每個(gè)聚類(lèi)區(qū)域進(jìn)行分類(lèi)判定獲得胰腺候選區(qū)域.隨后將連續(xù)切片中提取的胰腺候選區(qū)域作為2.5D切片輸入到5個(gè)具有不同損失函數(shù)的模糊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),輸出中間切片的胰腺標(biāo)記數(shù)據(jù).該2.5D切片可充分利用相鄰切片信息,同時(shí)避免了3D卷積帶來(lái)的巨大內(nèi)存消耗.Zhou等人[48]也采用了2.5D切片作為網(wǎng)絡(luò)的輸入數(shù)據(jù),但其獲取方法與Liu等人[47]略微不同,Zhou將中間層的原始圖像與相鄰切片二值化分割結(jié)果結(jié)合從而獲得2.5D切片,該種切片能對(duì)中間層的細(xì)分割概率圖進(jìn)行時(shí)序維度的分割約束,將該概率圖與對(duì)應(yīng)的粗分割概率圖融合卷積后可得到更加精確的的胰腺語(yǔ)義分割.Zhu等人[49]將偽三維卷積與可微分的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)自動(dòng)搜素方案結(jié)合,該架構(gòu)可根據(jù)不同的三維胰腺CT體素情況自動(dòng)搜索合適的卷積核(2D、3D或偽3D)以及網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),能夠在多種模塊中選擇出最優(yōu)的組合方案,該方案也證明了偽三維卷積減少了卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的內(nèi)存消耗,并且保留了更多的胰腺切片間信息以及相較于純2D卷積與3D卷積的有效性.

    偽三維卷積可通過(guò)改變卷積形式或輸入數(shù)據(jù)形式來(lái)實(shí)現(xiàn),偽三維卷積的使用可使網(wǎng)絡(luò)具有三維卷積的時(shí)序特征提取能力,同時(shí)也可減少網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算量,這不失為一種調(diào)和二維卷積與三維卷積缺陷的方式,但偽三維卷積由于其組合的特殊性,現(xiàn)有的偽三維卷積的應(yīng)用均具有一定的條件限制,如輸入數(shù)據(jù)的限制以及二維三維卷積組合方式的限制等,因此在泛化能力上有待提高.

    如表2所示,在卷積方式的改進(jìn)方面,二維卷積雖然參數(shù)量少,但沒(méi)有考慮切片間序列特征;三維卷積雖然能使網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)基于體積的醫(yī)學(xué)圖像特征,但帶來(lái)的巨大計(jì)算量會(huì)使三維卷積的性價(jià)比較低;偽三維卷積雖然在二維卷積與三維卷積中達(dá)到了微妙的平衡,使網(wǎng)絡(luò)能夠在參數(shù)量較少的情況下獲取片間信息,但現(xiàn)有文獻(xiàn)提出的方案均針對(duì)特殊的應(yīng)用場(chǎng)景,其泛化能力還有待提升.在胰腺分割的實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,二維卷積可通過(guò)不斷增加網(wǎng)絡(luò)的深度與廣度提升模型單張切片的分割精度,也可通過(guò)設(shè)計(jì)時(shí)序特征提取模塊使網(wǎng)絡(luò)注意到切片間的序列特征;三維卷積可結(jié)合粗細(xì)分割框架提取胰腺位置減少背景信息的干擾,從而減少精細(xì)網(wǎng)絡(luò)分割過(guò)程計(jì)算量,也可在一定程度上削弱胰腺分割類(lèi)不平衡問(wèn)題帶來(lái)的影響,但卷積維度的選取同樣需綜合考慮實(shí)驗(yàn)設(shè)備性能,網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜程度,胰腺醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)特點(diǎn)等多方因素,才能達(dá)到較為理想的分割結(jié)果.

    表2 基于卷積維度的改進(jìn)方案

    4 基于網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的胰腺分割改進(jìn)方案

    當(dāng)前胰腺分割算法在網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)上可分為基于UNet網(wǎng)絡(luò)的改進(jìn),基于長(zhǎng)短時(shí)記憶網(wǎng)絡(luò)的改進(jìn)以及基于生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)的改進(jìn).不同的網(wǎng)絡(luò)框架作用于胰腺醫(yī)學(xué)圖像具有不同的分割效果,UNet框架具有良好的分割穩(wěn)定性,長(zhǎng)短時(shí)記憶網(wǎng)絡(luò)框架能關(guān)注到胰腺醫(yī)學(xué)影像的各層切片關(guān)系,生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)能有效解決胰腺真實(shí)標(biāo)記數(shù)量較少的問(wèn)題,此外基于以上優(yōu)點(diǎn)研究者也針對(duì)胰腺的成像特點(diǎn)以及生理特點(diǎn)制定了不同改進(jìn)方案,4.1節(jié)-4.3節(jié)中將展開(kāi)詳細(xì)介紹.

    4.1 基于UNet網(wǎng)絡(luò)的胰腺分割方案

    UNet網(wǎng)絡(luò)由Ronneberger等[50]在2015年MICCAI會(huì)議上提出,主要解決醫(yī)學(xué)圖像中像素級(jí)別的分類(lèi)問(wèn)題.相對(duì)于自然圖像數(shù)據(jù)集,醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集的標(biāo)簽需醫(yī)學(xué)專(zhuān)家進(jìn)行標(biāo)注,具有臨床意義的標(biāo)簽數(shù)據(jù)集較少,涵蓋的病例類(lèi)別也不夠多,因此過(guò)擬合問(wèn)題在是醫(yī)學(xué)影像分割的常見(jiàn)問(wèn)題.UNet網(wǎng)絡(luò)可以動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)每層的channel數(shù)量以及模型深度來(lái)減少參數(shù)量,可通過(guò)更為輕量級(jí)的網(wǎng)絡(luò)完成圖像識(shí)別與像素分類(lèi),盡量避免訓(xùn)練過(guò)程中出現(xiàn)過(guò)擬合問(wèn)題.對(duì)醫(yī)學(xué)圖像分割來(lái)說(shuō),病灶本身的形態(tài)特征與其周?chē)鞴俳M織的空間位置特征對(duì)目標(biāo)分割均有很大的幫助,因此每個(gè)尺度的圖像信息都很重要.UNet的跳躍鏈接可解決上采樣過(guò)程中高分辨率特征丟失的問(wèn)題,增大局部特征表達(dá)與全局特征表達(dá),所以UNet網(wǎng)絡(luò)呈現(xiàn)了優(yōu)良的分割性能.基于以上優(yōu)點(diǎn),Unet網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)經(jīng)常作為胰腺分割網(wǎng)絡(luò)的基本架構(gòu),研究者在此基礎(chǔ)上結(jié)合胰腺特征對(duì)Unet網(wǎng)絡(luò)提出了多種改進(jìn)方案.

    Oktay等人[38]將注意力門(mén)集成到了UNet[50]模型中,提出了Attention UNet,網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖5所示.注意力門(mén)可抑制模型與任務(wù)無(wú)關(guān)的部分,同時(shí)加強(qiáng)學(xué)習(xí)與任務(wù)有關(guān)的特征.該方案舍棄了在胰腺分割中表現(xiàn)良好的粗細(xì)分割框架,消除了級(jí)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)對(duì)器官進(jìn)行粗分割定位的需要,注意力門(mén)具有較高的靈活性與復(fù)用性,可高度集成化至不同的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),因此該方案在不同的數(shù)據(jù)集上均具有良好的表現(xiàn).

    圖5 Oktay等人網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)[38]

    Lu等人[51]同樣提出了注意力模塊的改進(jìn),與Oktay等人[38]不同的是,CBAM注意力模塊是對(duì)通道特征以及空間特征分別進(jìn)行注意力加權(quán),將下采樣過(guò)程中提取的特征通過(guò)CBAM注意力模塊進(jìn)行過(guò)濾后融合至上采樣,保證胰腺高分辨率的細(xì)節(jié)特征不會(huì)丟失.此外該方案也改進(jìn)了Unet的卷積模塊,將普通的UNet卷積模塊替換為環(huán)形殘差模塊,有效地利用上下文的空間信息,進(jìn)一步解決網(wǎng)絡(luò)退化問(wèn)題,確保隨著網(wǎng)絡(luò)深度的加深,提取的胰腺特征圖像仍然可以保留更多的細(xì)節(jié)信息,用于減少胰腺器官邊界模糊帶來(lái)的影響.Li等人[52]將仍然將Unet結(jié)構(gòu)作為基線結(jié)構(gòu),但改進(jìn)了網(wǎng)絡(luò)的特征圖輸入方式,將傳統(tǒng)的胰腺三維體數(shù)據(jù)劃分為多個(gè)堆棧數(shù)據(jù),代替?zhèn)鹘y(tǒng)的體數(shù)據(jù)輸入到基于堆棧結(jié)構(gòu)的UNet網(wǎng)絡(luò),該結(jié)構(gòu)對(duì)每個(gè)胰腺堆棧數(shù)據(jù)進(jìn)行建模,獲得胰腺空間維度的局部上下文信息,并通過(guò)堆棧結(jié)構(gòu)對(duì)胰腺分割結(jié)果進(jìn)行集成,為保證單張胰腺切片的分割精度,使用模型驅(qū)動(dòng)的正則化策略約束胰腺切片間關(guān)系,并使用滑動(dòng)窗口算法提高相鄰胰腺切片的分割連續(xù)性,使堆棧數(shù)據(jù)在融合過(guò)程中得到更加連續(xù)平滑的分割邊界.

    綜上所述,UNet網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)由于其穩(wěn)定的分割性能被多種胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割方案所采用,但面對(duì)胰腺分割這類(lèi)目標(biāo)區(qū)域較小,器官特征不明顯的醫(yī)學(xué)圖像,仍然會(huì)存在過(guò)分割與漏分割的缺陷.在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可通過(guò)以下方案對(duì)Unet架構(gòu)進(jìn)行改進(jìn):1)增加Unet的深度與廣度來(lái)提升網(wǎng)絡(luò)的分割精度;2)增加注意力機(jī)制,如空間注意力、通道注意力等,提升網(wǎng)絡(luò)對(duì)于目標(biāo)區(qū)域的關(guān)注度;3)改進(jìn)Unet傳統(tǒng)的卷積方式,例如將傳統(tǒng)卷積替換為殘差卷積、膨脹卷積、深度可分離卷積等來(lái)增加網(wǎng)絡(luò)的深度;4)通過(guò)級(jí)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)等優(yōu)化方案對(duì)不同的區(qū)域進(jìn)行多尺度建模,進(jìn)行全局聯(lián)合優(yōu)化,使網(wǎng)絡(luò)提取到更多的有用信息,提升UNet的網(wǎng)絡(luò)性能.

    4.2 基于長(zhǎng)短時(shí)記憶網(wǎng)絡(luò)的胰腺分割方案

    長(zhǎng)短時(shí)記憶(LSTM)網(wǎng)絡(luò)在序列數(shù)據(jù)上有優(yōu)秀的建模能力,擁有長(zhǎng)跨度記憶功能,可以有效捕獲序列信息.在基礎(chǔ)的LSTM結(jié)構(gòu)中,元胞狀態(tài)保存了鏈?zhǔn)骄W(wǎng)絡(luò)中的長(zhǎng)期狀態(tài)信息,使其相對(duì)于傳統(tǒng)RNN展現(xiàn)了更加優(yōu)秀的長(zhǎng)期記憶能力.胰腺本身的醫(yī)學(xué)影像具有時(shí)序特征,切片間具有一定的非線性關(guān)系,因此不少研究者將LSTM模塊融入到胰腺的分割方案中,用于提取胰腺的時(shí)序特征,但由于LSTM需要占用大量的計(jì)算資源,因此在網(wǎng)絡(luò)精度提升的同時(shí),網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練也較為困難,并且它并沒(méi)有完全解決RNN的梯度問(wèn)題,因此在一些研究中[28,53,54],研究者僅將LSTM特性作為單個(gè)模塊嵌入網(wǎng)絡(luò)模型內(nèi)提取胰腺序列特征,而不是大范圍采用LSTM作為網(wǎng)絡(luò)的主結(jié)構(gòu).

    Cai等人[28]通過(guò)CLSTM模塊來(lái)解決胰腺CT切片時(shí)序特征學(xué)習(xí)的問(wèn)題,該模塊能夠集成連續(xù)相鄰的切片,對(duì)單張切片的標(biāo)記預(yù)測(cè)實(shí)施空間一致性約束分割.端到端的分割方式可針對(duì)上下文特征對(duì)CNN的分割結(jié)果進(jìn)行進(jìn)一步優(yōu)化,相鄰切片間的分割結(jié)果將具有空間一致性.在2018年,Cai等人[55]對(duì)CLSTM模塊進(jìn)行了進(jìn)一步的優(yōu)化,實(shí)驗(yàn)采用的Bi-direction CLSTM模塊如圖6所示,該結(jié)構(gòu)能夠使分割結(jié)果受到前向切片與后向切片的綜合性約束,進(jìn)一步優(yōu)化胰腺的軸向切片時(shí)序特征.受Cai等人的啟發(fā),Jiang等人[31]將Bi-direction CLSTM模塊加入U(xiǎn)Net網(wǎng)絡(luò)的跳躍鏈接中,用于提取特征圖不同的時(shí)間特征與空間特征,進(jìn)而獲得具有時(shí)空相關(guān)性的胰腺多尺度混合特征圖.此外網(wǎng)絡(luò)通過(guò)可變形卷積來(lái)增強(qiáng)對(duì)胰腺?gòu)?fù)雜多變的幾何形態(tài)的建模能力,并增加了密集連接模塊,提高特征圖的重復(fù)利用率,訓(xùn)練參數(shù)量大大降低,且緩解了梯度消失問(wèn)題.

    圖6 Bi-direction CLSTM模塊[55]

    綜上,基于LSTM的分割框架中,LSTM模塊通常作為主分割網(wǎng)絡(luò)之后的單一優(yōu)化細(xì)分模塊[53].因此在胰腺分割的任務(wù)場(chǎng)景下,LSTM可以作為時(shí)序注意力機(jī)制集成在基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)中,利用時(shí)序特征對(duì)單層切片的分割結(jié)果做空間約束,也可集成在分割網(wǎng)絡(luò)后方,對(duì)預(yù)測(cè)后的二維切片進(jìn)一步做時(shí)序維度的空間平滑處理.事實(shí)上,使用LSTM框架分割胰腺醫(yī)學(xué)圖像雖然使網(wǎng)絡(luò)分割性能有所提升,但其計(jì)算資源需求量巨大,往往與其提升的精度不成正比.因此當(dāng)胰腺分割網(wǎng)絡(luò)的輕量化重要性大于分割精度重要性時(shí),最好仍選擇傳統(tǒng)的二維卷積,以此降低網(wǎng)絡(luò)對(duì)設(shè)備的內(nèi)存需求.

    4.3 基于生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)的胰腺分割方案

    Goodfellow 等人[56]基于博弈論思想提出了一種由判別網(wǎng)絡(luò)和生成網(wǎng)絡(luò)所構(gòu)成的深度學(xué)習(xí)模型——GAN(Generative Adversarial Networks).生成網(wǎng)絡(luò)用來(lái)生成接近真實(shí)標(biāo)記數(shù)據(jù)的預(yù)測(cè)分割數(shù)據(jù),判別網(wǎng)絡(luò)用于判斷輸入數(shù)據(jù)為真實(shí)標(biāo)記數(shù)據(jù)或預(yù)測(cè)分割數(shù)據(jù),兩種網(wǎng)絡(luò)相互對(duì)抗,相互博弈,共同達(dá)到最理想的預(yù)測(cè)狀態(tài).目前,胰腺公共數(shù)據(jù)集稀缺問(wèn)題嚴(yán)重,現(xiàn)有的數(shù)據(jù)集并不能夠提供足量的訓(xùn)練數(shù)據(jù),在訓(xùn)練過(guò)程中很容易出現(xiàn)過(guò)擬合問(wèn)題.因此近年來(lái)生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)也用在胰腺的醫(yī)學(xué)圖像分割上,解決胰腺醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)量較少的問(wèn)題.生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練過(guò)程中可以生成大批的預(yù)測(cè)分割數(shù)據(jù),使分割網(wǎng)絡(luò)在較少的源數(shù)據(jù)支持下仍能獲得較為精確的分割結(jié)果.

    Ning等人[57]使用生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)的分割框架如圖7所示,其中生成模塊由膨脹卷積自動(dòng)編碼器模塊(DCAE)與局部長(zhǎng)短時(shí)記憶模塊(Local-LSTM)組成,DCAE網(wǎng)絡(luò)使用膨脹卷積在不增加計(jì)算量的情況下擴(kuò)大卷積核的感受野,局部長(zhǎng)短時(shí)記憶模塊(Local-LSTM)根據(jù)片間時(shí)空相關(guān)性進(jìn)一步約束胰腺的邊界分割;對(duì)抗模塊則基于全局分布來(lái)進(jìn)一步指導(dǎo)分割網(wǎng)絡(luò)獲得更加精確的分割結(jié)果.

    圖7 Ning等人生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)框架[57]

    Khosravan等人(2019)[58]的對(duì)抗訓(xùn)練框架由3個(gè)網(wǎng)絡(luò)組成,其中生成網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的全卷積網(wǎng)絡(luò),也是胰腺分割的主體網(wǎng)絡(luò).空間語(yǔ)義網(wǎng)絡(luò)為第1個(gè)對(duì)抗網(wǎng)絡(luò),用于調(diào)節(jié)主分割網(wǎng)絡(luò)在空間維度上的分割性能,而第2個(gè)對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)通過(guò)2D投影獲得3D語(yǔ)義信息,在不增加輸入維度以及網(wǎng)絡(luò)卷積復(fù)雜度的情況下,使分割網(wǎng)絡(luò)的分割結(jié)果更接近于胰腺的三維幾何形態(tài).

    綜上,采用GAN作為網(wǎng)絡(luò)分割框架具有較高的靈活性,生成網(wǎng)絡(luò)與對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)均可構(gòu)造不同的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),且可以采用多個(gè)對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)對(duì)生成網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)節(jié)與改進(jìn).如表3所示,雖然生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)分割方案能生成更接近真實(shí)標(biāo)記數(shù)據(jù)的胰腺醫(yī)學(xué)圖像,在一定程度上解決了醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)集較少的問(wèn)題,但胰腺本身就是較難精確分割的器官,生成網(wǎng)絡(luò)與對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)難以同時(shí)達(dá)到最優(yōu)解,因此基于生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)的胰腺分割方案在改進(jìn)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的同時(shí)需要對(duì)網(wǎng)絡(luò)的損失函數(shù)加以改進(jìn),盡量設(shè)計(jì)聯(lián)合優(yōu)化函數(shù)使生成網(wǎng)絡(luò)與對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)能在訓(xùn)練過(guò)程中同時(shí)達(dá)到最優(yōu),進(jìn)而使分割網(wǎng)絡(luò)達(dá)到較高的分割精度.

    表3 基于網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的改進(jìn)方案評(píng)估結(jié)果

    5 基于增強(qiáng)特征表達(dá)的胰腺分割改進(jìn)方案

    胰腺生理特征使其在影像學(xué)上的表達(dá)具有幾何形態(tài)較小、形狀易變以及邊緣像素模糊等特點(diǎn),神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在分割過(guò)程中將面臨嚴(yán)重的類(lèi)不平衡、幾何形態(tài)難以學(xué)習(xí)以及邊界像素分割溢出等問(wèn)題,因此提升胰腺在醫(yī)學(xué)圖像上的特征表達(dá),使胰腺分割網(wǎng)絡(luò)捕捉到關(guān)鍵特征尤為重要.目前的主流分割方案大多采用粗細(xì)分割框架提取目標(biāo)區(qū)域,粗分割階段會(huì)對(duì)胰腺進(jìn)行粗略的定位或分割,生成胰腺目標(biāo)的候選區(qū)域,該候選區(qū)域提升了胰腺目標(biāo)區(qū)域的整體占比,減少背景像素的干擾.除了粗細(xì)分割方案外,研究者也會(huì)通過(guò)注意力機(jī)制提升胰腺的特征表達(dá)能力,比如空間注意力可提升片內(nèi)特征表達(dá),通道注意力可提升片間特征表達(dá),LSTM模塊可以提升胰腺序列特征的表達(dá)等.5.1節(jié)和5.2節(jié)中將展開(kāi)詳細(xì)介紹.

    5.1 粗細(xì)分割框架

    由于胰腺在腹腔CT序列中占比較小(<0.5%)[34]在嚴(yán)重的類(lèi)不平衡的影響下,網(wǎng)絡(luò)容易學(xué)習(xí)到大量無(wú)關(guān)的背景像素特征,因此為減少冗余信息對(duì)特征學(xué)習(xí)的干擾,研究者們提出了從粗到細(xì)的兩階段胰腺分割框架,以克服單個(gè)網(wǎng)絡(luò)的學(xué)習(xí)模式對(duì)背景像素的敏感性[34,39-41].該框架下胰腺分割被劃分為兩個(gè)階段:第1階段為粗分割,在該階段需完成胰腺區(qū)域定位,獲得目標(biāo)區(qū)域;第2階段為細(xì)分割,在該階段粗分割獲得的目標(biāo)區(qū)域?qū)⒆鳛檩斎霐?shù)據(jù)進(jìn)入細(xì)分割網(wǎng)絡(luò),并在該區(qū)域下執(zhí)行進(jìn)一步的精細(xì)分割.

    Roth等人[24]在粗分割階段選用超像素方法生成胰腺的候選區(qū)域,之后將候選區(qū)域?qū)敕指罹W(wǎng)絡(luò)進(jìn)行局部的剪枝細(xì)化,超像素區(qū)域由于其不規(guī)則性,進(jìn)入細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)時(shí)需要對(duì)每個(gè)候選區(qū)域進(jìn)行變形處理,由于圖像在一定程度上失真,胰腺的統(tǒng)一特征更加難以學(xué)習(xí),為細(xì)分割造成了干擾,且該方案中超像素候選區(qū)域召回率仍舊存在3%的誤差,變形干擾與召回率誤差限制了該方法的分割性能.Zhou,Zhu等[34,39]利用三維胰腺醫(yī)學(xué)影像訓(xùn)練粗分割網(wǎng)絡(luò)尋找胰腺目標(biāo)邊界框.兩者不同之處在于Zhou等人[34]對(duì)冠狀面,矢狀面,橫斷面均進(jìn)行了特征建模,但采用FCN-8s初始化網(wǎng)絡(luò),相較于Zhu等人[39]提出的ResDSN模型,F(xiàn)CN卷積過(guò)程中會(huì)丟失大部分語(yǔ)義信息,網(wǎng)絡(luò)分割性能較差.與傳統(tǒng)的單細(xì)分網(wǎng)絡(luò)不同,Zhao等[59]采用兩個(gè)細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)對(duì)胰腺分割進(jìn)行細(xì)化.可分割極小目標(biāo)以及可變形度高的器官.在獲得粗分割結(jié)果后,胰腺的候選區(qū)域?qū)⑤斎氲絻蓚€(gè)并行的細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)從而獲得不同的胰腺預(yù)測(cè)結(jié)果,該結(jié)果經(jīng)過(guò)邊際投票后與上采樣的粗分割結(jié)果進(jìn)行組合.由于其在訓(xùn)練階段使用標(biāo)簽數(shù)據(jù)獲取胰腺邊界框,與測(cè)試階段獲取方式不同,邊界框定位準(zhǔn)確性不能通過(guò)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練階段加以提升,導(dǎo)致分割結(jié)果有一定的局限性.

    由于粗細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)缺乏全局能量函數(shù)優(yōu)化,且缺少上下文信息,在分割胰腺時(shí)兩個(gè)階段的分割網(wǎng)絡(luò)無(wú)法達(dá)到全局最優(yōu).Yu等人[60]就這類(lèi)問(wèn)題提出了一個(gè)遞歸顯著性變換網(wǎng)絡(luò),粗分割網(wǎng)絡(luò)用于獲取胰腺的相關(guān)概率圖譜,與原始影像結(jié)合后進(jìn)行區(qū)域剪裁,送入細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)對(duì)候選區(qū)域進(jìn)行細(xì)分與優(yōu)化,經(jīng)過(guò)多次遞歸后,兩個(gè)網(wǎng)絡(luò)的經(jīng)過(guò)聯(lián)合優(yōu)化達(dá)到全局最優(yōu),獲得更加精確的胰腺分割網(wǎng)絡(luò).與Yu等人解決方法不同的是,Xie等人[61]提出了一種遞歸顯著性變換網(wǎng)絡(luò)(RSTN),顯著性變換模塊將粗分割網(wǎng)絡(luò)的概率圖譜轉(zhuǎn)化為像素權(quán)重,其與輸入圖像合并后由該模塊進(jìn)入細(xì)分割網(wǎng)絡(luò),因此粗細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)通過(guò)顯著性變換模塊得以連接.由于顯著性變換模塊的可微性,梯度可以反向傳播到整個(gè)網(wǎng)絡(luò),使得粗細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)可以被聯(lián)合優(yōu)化,迭代的執(zhí)行該分割流程也提高了網(wǎng)絡(luò)的分割精度.Hu[33]等人也加入了顯著性感知模塊,與Xie等人[61]不同的是,該模塊以測(cè)地線距離生成胰腺的顯著信息,并通過(guò)顯著信息來(lái)幫助細(xì)尺度模型意識(shí)到胰腺與周?chē)尘暗娘@著性區(qū)別,能夠更好的處理胰腺高度可變形外觀,得到更精確的分割結(jié)果.

    Man等人[17]提出了一種基于DQN引導(dǎo)的胰腺分割方案,以解決類(lèi)不平衡以及胰腺分割的非剛性幾何特征難以學(xué)習(xí)的問(wèn)題.該方案基于切片的上下文自適應(yīng)定位胰腺所在區(qū)域,產(chǎn)生精確且與冗余度低的胰腺定位邊界框,使用可變形卷積來(lái)學(xué)習(xí)胰腺的非剛性幾何特征,提高了網(wǎng)絡(luò)對(duì)胰腺特征的提取能力.Xue等人[32]提出了級(jí)聯(lián)的多任務(wù)引導(dǎo)的3DFCN分割方案,如圖8所示,在粗略分割快速定位后,細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)用來(lái)進(jìn)行體素分割以及提取胰腺骨架,該骨架包含豐富的胰腺候選區(qū)域信息,經(jīng)過(guò)級(jí)聯(lián)后胰腺骨架得到多次優(yōu)化,用來(lái)引導(dǎo)后續(xù)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行胰腺的精細(xì)分割,骨架引導(dǎo)的分割方法豐富了胰腺CT切片信息,使網(wǎng)更多的專(zhuān)注于胰腺特征學(xué)習(xí).

    圖8 Xue等人網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)[32]

    與傳統(tǒng)的矩形ROI區(qū)域分割不同,Peng等人[62]采用粗分割網(wǎng)絡(luò)獲取胰腺的輪廓ROI,之后細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)只對(duì)靠近該區(qū)域的樣本進(jìn)行像素級(jí)分類(lèi),從而減少網(wǎng)絡(luò)的學(xué)習(xí)參數(shù),減少類(lèi)不平衡問(wèn)題帶來(lái)的影響.Wang等人[63]對(duì)雙階段粗細(xì)分割進(jìn)行了改進(jìn),提出了三階段的胰腺粗細(xì)分割方案,首先通過(guò)解剖先驗(yàn)定位粗略剔除背景區(qū)域;第2階段使用DASUNet進(jìn)行粗略分割,該網(wǎng)絡(luò)可聚合胰腺的跨層次深度特征和并利用Ground Truth進(jìn)行深度監(jiān)督,隨后利用雙向卷積長(zhǎng)短時(shí)記憶網(wǎng)絡(luò)[64]提取切片上下文信息優(yōu)化分割結(jié)果,并進(jìn)一步利用優(yōu)化結(jié)果進(jìn)行二次背景剔除,進(jìn)一步縮小單張胰腺CT切片的分割區(qū)域,最后利用DASUNet完成胰腺的精細(xì)分割.該網(wǎng)絡(luò)的3種不同的分割階段分別解決了胰腺的類(lèi)不平衡問(wèn)題,跨層次特征圖信息提取與信息交流問(wèn)題以及胰腺影像序列特征學(xué)習(xí)問(wèn)題,實(shí)驗(yàn)證實(shí)每個(gè)階段的改進(jìn)均對(duì)胰腺分割準(zhǔn)確度的提升有所幫助.

    綜上,粗細(xì)分割框架能有效剔除胰腺影像存在的部分冗余信息,削弱類(lèi)不平衡問(wèn)題的影響,提升網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練速度與分割精度.且該分割框架具有較高的靈活性,粗分割與細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)可以采用不同的分割方案,包括但不限于超像素,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等,并且粗細(xì)分割網(wǎng)絡(luò)的組合方式可以采用一對(duì)一,一對(duì)多,多對(duì)多等.相對(duì)的,多網(wǎng)絡(luò)分割也是該框架的弊端,通常兩種或兩種以上的網(wǎng)絡(luò)分割方案不能達(dá)到端到端的聯(lián)合優(yōu)化,需要過(guò)多的人工干預(yù),且部分方案無(wú)法使分割網(wǎng)絡(luò)同時(shí)達(dá)到全局最優(yōu),因此具有一定的局限性.

    5.2 多尺度信息融合

    受實(shí)驗(yàn)設(shè)備的限制,當(dāng)網(wǎng)絡(luò)計(jì)算量達(dá)到顯卡內(nèi)存承載量時(shí),研究者不能繼續(xù)通過(guò)增加網(wǎng)絡(luò)的深度與廣度提高網(wǎng)絡(luò)的分割精度,由于基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)不能提取更深入的特征和豐富的語(yǔ)義信息,且隨著卷積的增多,層與層之間無(wú)法實(shí)現(xiàn)更多的特征交流,很容易遺失重要的語(yǔ)義特征.針對(duì)該問(wèn)題部分研究者提出了信息融合策略,通過(guò)融合多尺度特征信息,使網(wǎng)絡(luò)能夠捕捉到胰腺的深層特征并突出更多的胰腺顯著性特征.

    Li等人[19]將3種跨領(lǐng)域信息融合策略融入到自己的分割網(wǎng)絡(luò)中.第1種策略為UNet的跳躍鏈接,通過(guò)跳躍連接向解碼網(wǎng)絡(luò)傳遞編碼網(wǎng)絡(luò)的高分辨率語(yǔ)義信息,有效地抑制過(guò)分割與漏分割.第2種策略是殘差網(wǎng)絡(luò),主要是通過(guò)小范圍的跨域連接來(lái)解決卷積過(guò)程的信息丟失問(wèn)題.第3種為多尺度殘差網(wǎng)絡(luò),在殘差網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上增加了多尺度卷積操作,能夠更準(zhǔn)確地學(xué)習(xí)胰腺形狀,結(jié)合不同的感受野特征圖抑制過(guò)分割和欠分割.與Li等人[19]的多尺度策略不同,Giddwani等人[65]通過(guò)改變卷積擴(kuò)張率獲取不同感受野的特征圖,這種集成多擴(kuò)張率的深度擴(kuò)張網(wǎng)絡(luò)模塊結(jié)構(gòu)如圖9所示,不同的卷積核擴(kuò)張率捕獲不同感受野的空間信息,集成不同感受野的信息來(lái)實(shí)現(xiàn)信息融合,提取每個(gè)胰腺CT序列的空間上下文信息.該模塊具有較高的靈活性,能夠集成到網(wǎng)絡(luò)的任意階段.

    圖9 深度擴(kuò)張網(wǎng)絡(luò)模塊[65]

    Zhang等人[66]的策略與Giddwani等人[65]不同,他們將信息提取過(guò)程由全局空間卷積分割為空間卷積與通道卷積兩個(gè)階段,多尺度混合注意力機(jī)制如圖10所示,有效捕捉胰腺CT序列的空間信息與通道信息,從而提高網(wǎng)絡(luò)的分割精度.

    圖10 多尺度混合注意力機(jī)制[66]

    Li等人[20]提出了一種概率圖引導(dǎo)的雙向遞歸UNet(PBR-UNet)架構(gòu),該架構(gòu)通過(guò)2D UNet提取像素級(jí)概率圖,將輸入圖像與相鄰切片的概率圖組合成多通道混合數(shù)據(jù),如圖11所示.該架構(gòu)的亮點(diǎn)為雙向遞歸模塊,如圖12所示,中心切片的預(yù)測(cè)結(jié)果受前向切片與后向切片預(yù)測(cè)概率圖譜的雙重影響,循環(huán)更新機(jī)制有效的利用了前后片間序列信息,實(shí)現(xiàn)了多跨度,多時(shí)空維度的跨域信息交流.此方案能夠避免中心切片丟失上下文信息,進(jìn)而保留胰腺更多的細(xì)節(jié)特征,提升分割精度.

    圖11 構(gòu)建局部3D混合信息多通道數(shù)據(jù)[20]

    圖12 雙向遞歸模塊[20]

    Yu等人[67]的多尺度信息融合策略為構(gòu)建密集鏈接,為提高特征的重復(fù)利用率,下采樣層的高分辨率信息通過(guò)密集鏈接傳遞到每一個(gè)上采樣層,使卷積過(guò)程中的低、中、高語(yǔ)義信息得到充分融合.該方案中RRFM對(duì)特征圖進(jìn)行重組和再校準(zhǔn),并通過(guò)注意力機(jī)制對(duì)原始特征圖進(jìn)行加權(quán),激發(fā)更具辨識(shí)度的胰腺特征,提升胰腺的特征表達(dá).Yang等人[68]對(duì)片內(nèi)信息與片間信息采用了不同的特征表達(dá)策略,通過(guò)多網(wǎng)絡(luò)并聯(lián)的方式對(duì)不同的切片提取片內(nèi)上下文信息,增強(qiáng)胰腺的片內(nèi)特征融合與特征表達(dá).Bi-Directional Convolutional GRU(BDC-GRU)用于提取片間信息,值得注意的是該模塊能夠同時(shí)獲取正向與反向的上下文信息,雙向上下文信息提取方式使切片預(yù)測(cè)受到正向反向序列特征的約束,同時(shí)也能夠保存正向序列與反向序列的聯(lián)合序列特征,能夠使網(wǎng)絡(luò)捕捉到更多的片間特征關(guān)系,增強(qiáng)胰腺的特征表達(dá).

    如表4所示,網(wǎng)絡(luò)在分割過(guò)程中融合多尺度信息能夠使胰腺更多的隱含特征得到表達(dá),從而提高網(wǎng)絡(luò)的分割精度.多尺度信息融合策略有多種改進(jìn)方案:1)從特征的時(shí)間特性與空間特性進(jìn)行改進(jìn),在時(shí)空維度上增加注意力機(jī)制,之后進(jìn)行時(shí)空維度的特征融合,使網(wǎng)絡(luò)更多的關(guān)注于胰腺的時(shí)空特征;2)從胰腺的序列特征進(jìn)行改進(jìn),如雙向LSTM模塊,能夠獲取雙向序列特征,增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)于切片間特征的建模能力;3)從感受野方向進(jìn)行改進(jìn),通過(guò)融合多尺度感受野信息,增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)于細(xì)節(jié)特征與全局特征的整體把握,從而使更多的胰腺特征得到充分的表達(dá);4)從網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)方向進(jìn)行改進(jìn),增加更多的跳躍鏈接與密集鏈接模塊,使不同階段的特征圖完成特征重用與信息融合,進(jìn)而減弱網(wǎng)絡(luò)丟失更多細(xì)節(jié)特征的可能性.

    表4 增強(qiáng)特征表達(dá)的改進(jìn)方案評(píng)估結(jié)果

    6 基于輕量化網(wǎng)絡(luò)的胰腺分割改進(jìn)方案

    研究者通常通過(guò)增加網(wǎng)絡(luò)的深度與廣度提高胰腺的特征獲取能力,同時(shí)三維卷積與LSTM模塊的引入也使網(wǎng)絡(luò)分割精度得到提高,但卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)本身的浮點(diǎn)矩陣乘法將帶來(lái)巨大的計(jì)算量,設(shè)備內(nèi)存消耗也隨矩陣維度以及LSTM模塊的時(shí)序維度成指數(shù)型增長(zhǎng).由于在提高分割精度的同時(shí)分割網(wǎng)絡(luò)在訓(xùn)練過(guò)程中需要涉及到大量的計(jì)算,網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練難度增加,模型參數(shù)量過(guò)大,這不利于網(wǎng)絡(luò)朝輕量化方向發(fā)展.現(xiàn)如今,胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割也在向臨床應(yīng)用方向邁進(jìn),因此需要?jiǎng)?chuàng)造更加輕量型的網(wǎng)絡(luò)完成移動(dòng)端的移植.如表5所示,為減少深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)計(jì)算量的依賴性,使網(wǎng)絡(luò)能夠更容易投入到臨床移動(dòng)設(shè)備的應(yīng)用中,Heinrich等人[69]提出了三值網(wǎng)絡(luò),其計(jì)算原理如圖13所示,使用三元權(quán)重以及三元激活近似神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的可訓(xùn)練權(quán)重以及神經(jīng)激活.該方案消除了卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中浮點(diǎn)矩陣乘法所需的巨大內(nèi)存消耗和計(jì)算量,并采用保留能量和時(shí)間的二元算子和種群計(jì)數(shù)來(lái)替代.該方法在NIH數(shù)據(jù)集上雖然只獲得了71%的DSC,但內(nèi)存需求減少了15倍,速度提高了10倍,有助于推動(dòng)基于深度學(xué)習(xí)的胰腺分割方法用于移動(dòng)設(shè)備的醫(yī)療診斷等應(yīng)用.

    表5 網(wǎng)絡(luò)輕量化改進(jìn)方案評(píng)估結(jié)果

    圖13 Heinrich等人方法示意圖[69]

    Askari等人[70]提出了一種UNet體系結(jié)構(gòu)的量化方法.以降低量化精度為代價(jià),盡可能的減少存儲(chǔ)模型參數(shù)以及實(shí)現(xiàn)浮點(diǎn)型矩陣運(yùn)算所需的巨大內(nèi)存消耗.在用于腹部CT掃描中胰腺分割的公共NIH數(shù)據(jù)集上它們的定點(diǎn)量化方案將網(wǎng)絡(luò)內(nèi)存需求減少了8倍,其中權(quán)重使用4位,激活使用6位,在該條件下胰腺分割的DICE僅損失2.09%.

    Gibson等人[18]提出了DenseVNet分割網(wǎng)絡(luò),通過(guò)密集連接實(shí)現(xiàn)特征重用,3種不同分辨率特征圖通過(guò)上采樣實(shí)現(xiàn)多尺度信息融合,減少了卷積過(guò)程的計(jì)算消耗.此外批式空間丟失方案也大大降低了計(jì)算成本,減少網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)到的冗余特征,從而以較少的模型參數(shù)量獲得高分辨率分割圖像.但由于胰腺器官較小,在同時(shí)進(jìn)行多器官分割時(shí)很容易被誤分類(lèi)為背景像素,因此相對(duì)于脾、胃的分割結(jié)果(脾:平均DSC95%,胃:平均DSC87%),胰腺分割僅達(dá)到75%的平均DSC.

    綜上,網(wǎng)絡(luò)的輕量化改進(jìn)可以從以下幾個(gè)方面入手:1)改進(jìn)卷積計(jì)算方式代替?zhèn)鹘y(tǒng)的卷積計(jì)算,如采用膨脹卷積,深度可分離卷積等,也可設(shè)計(jì)獨(dú)特的計(jì)算方式,如Heinrich等人[69]的三值網(wǎng)絡(luò)使特征提取能夠在較少的計(jì)算量?jī)?nèi)完成;2)改進(jìn)量化方案,將浮點(diǎn)運(yùn)算改為整數(shù)運(yùn)算,或限制參與訓(xùn)練的權(quán)重位數(shù)和激活位數(shù),減少內(nèi)存占用量;3)批式參數(shù)丟失,可有選擇的丟失部分權(quán)重,或卷積過(guò)程中按批舍棄部分模型參數(shù),減少分割過(guò)程中學(xué)習(xí)的冗余特征.以上輕量化方案往往是以降低網(wǎng)絡(luò)的分割精度為代價(jià),因此,在輕量化的同時(shí)需要尋找合適的平衡點(diǎn),使網(wǎng)絡(luò)得到最優(yōu)的性價(jià)比.

    7 其他改進(jìn)方案

    除上述改進(jìn)方案外,不少研究者也提出了較為獨(dú)特的分割方案,如表6所示.Zheng等人[30]提出了基于陰影集理論的胰腺分割方法,該方法為胰腺CT切片提供像素級(jí)意義描述,通過(guò)增加不確定區(qū)域的權(quán)重使網(wǎng)絡(luò)在迭代訓(xùn)練中更加關(guān)注不確定區(qū)域,從而進(jìn)一步修正權(quán)重矩陣,獲得更加精確穩(wěn)定的分割結(jié)果.Roth等人[13]提出了一種基于概率方法的胰腺分割模型.將胰腺CT切片生成超像素,隨后采用級(jí)聯(lián)隨機(jī)森林以及深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)生成概率圖譜,將兩種概率圖譜結(jié)合對(duì)超像素進(jìn)行胰腺與非胰腺分類(lèi),最后使用基于空間連通性方法進(jìn)行后處理.Cai等[29]提出了一種結(jié)合基于圖的決策融合過(guò)程的深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(DCNN).將胰腺的組織分割結(jié)果與邊界檢測(cè)結(jié)果作為基于圖的決策融合模型中每個(gè)節(jié)點(diǎn)的特征向量.Zhang等人[71]首先使用2D CNN分割的肝臟位置來(lái)計(jì)算用于確定其邊界框的胰腺質(zhì)心.提出了胰腺和肝臟的質(zhì)心之間的線性關(guān)系.然后,采用一個(gè)以胰腺邊界框?yàn)檩斎氲娜S神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行最終分割.由于胰腺的數(shù)據(jù)集標(biāo)簽需要放射科醫(yī)師通過(guò)人工先驗(yàn)判斷進(jìn)行像素級(jí)分類(lèi)標(biāo)記,因此不能夠在短時(shí)間內(nèi)獲得大量的數(shù)據(jù)集標(biāo)簽.Zeng等人[72]提出了一種弱監(jiān)督方法,通過(guò)單張切片的圖像級(jí)標(biāo)注獲得像素級(jí)語(yǔ)義分割標(biāo)簽結(jié)果.通過(guò)遞歸殘差卷積單元獲得空間級(jí)與通道級(jí)的上下文語(yǔ)義信息,引入空間池化集合局部特征信息,并采用條件隨機(jī)場(chǎng)進(jìn)行胰腺的空間預(yù)測(cè),從而獲得體素級(jí)標(biāo)簽,解決了胰腺數(shù)據(jù)集較少的問(wèn)題.綜上,針對(duì)胰腺的生理特點(diǎn)與數(shù)據(jù)集特點(diǎn)可以設(shè)計(jì)多種不同的改進(jìn)方案,這需要研究者進(jìn)一步結(jié)合胰腺的關(guān)鍵特征構(gòu)造更適用于胰腺分割的網(wǎng)絡(luò).

    表6 其他改進(jìn)方案評(píng)估結(jié)果

    8 總結(jié)與展望

    本文研究回顧了近五年基于深度學(xué)習(xí)的胰腺分割領(lǐng)域的相關(guān)文獻(xiàn),梳理了常用的胰腺分割數(shù)據(jù)集,并對(duì)胰腺的深度學(xué)習(xí)分割方法進(jìn)行了較為詳盡的分類(lèi)與總結(jié).重點(diǎn)介紹了每種分割網(wǎng)絡(luò)的原理、基本思想、網(wǎng)絡(luò)架構(gòu),評(píng)述了方案的優(yōu)缺點(diǎn),并在統(tǒng)一評(píng)價(jià)指標(biāo)上進(jìn)行分割精度的比較.以此為入門(mén)者提供擴(kuò)展性知識(shí),并為該領(lǐng)域研究者開(kāi)拓新的研究思路及方向.現(xiàn)將基于深度學(xué)習(xí)的胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割發(fā)展方向總結(jié)為以下幾點(diǎn):

    1)增加可用的胰腺公共數(shù)據(jù)集:深度學(xué)習(xí)算法的訓(xùn)練需要依賴大量的數(shù)據(jù)集,而醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)集制作過(guò)程較為枯燥繁瑣,且依賴專(zhuān)家解剖經(jīng)驗(yàn)知識(shí),需要具有豐富經(jīng)驗(yàn)的醫(yī)師人工進(jìn)行手動(dòng)標(biāo)注,因此為推動(dòng)后續(xù)深度學(xué)習(xí)胰腺分割方法的研究,需要更多的醫(yī)療工作者給予數(shù)據(jù)支持.

    2)多模態(tài)數(shù)據(jù):在臨床應(yīng)用中,不同模態(tài)的圖像能夠突出不同的特征信息,醫(yī)生通常會(huì)結(jié)合多個(gè)模態(tài)或單個(gè)模態(tài)的多次成像來(lái)進(jìn)行病灶診斷,多模態(tài)融合方案可將不同模態(tài)特征進(jìn)行深度融合,實(shí)現(xiàn)感興趣區(qū)域的特征互補(bǔ),結(jié)合不同層次不同深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的混合特征來(lái)提取圖像更深層次的信息,提高分割的精度.

    3)開(kāi)拓弱監(jiān)督或無(wú)監(jiān)督領(lǐng)域:目前,大量胰腺分割算法均采用有監(jiān)督學(xué)習(xí)模式,然而胰腺公共數(shù)據(jù)集稀缺,依賴于大量標(biāo)記數(shù)據(jù)的有監(jiān)督學(xué)習(xí)無(wú)法發(fā)揮更好的性能,因此可開(kāi)拓弱監(jiān)督或無(wú)監(jiān)督領(lǐng)域,解決胰腺公共數(shù)據(jù)集匱乏的問(wèn)題.

    4)探索網(wǎng)絡(luò)的可解釋性:深度學(xué)習(xí)的胰腺分割方法目前仍然面臨著可解釋性低的問(wèn)題,盡管UNet 架構(gòu)目前在胰腺醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集上表現(xiàn)良好,但臨床醫(yī)生無(wú)法直接理解其運(yùn)行機(jī)制,從而不能結(jié)合更深層次的臨床醫(yī)學(xué)病灶判斷方案,創(chuàng)造更有價(jià)值的臨床胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割網(wǎng)絡(luò),這導(dǎo)致深度學(xué)習(xí)仍然無(wú)法實(shí)現(xiàn)在臨床上的應(yīng)用.

    5)分割網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)的輕量化.對(duì)于現(xiàn)階段的胰腺醫(yī)學(xué)影像分割網(wǎng)絡(luò)架構(gòu),訓(xùn)練完成的胰腺分割模型存在大量的浮點(diǎn)型矩陣運(yùn)算,大量的模型參數(shù)導(dǎo)致模型對(duì)硬件設(shè)備的計(jì)算能力以及內(nèi)存量要求較高.為盡快促進(jìn)深度學(xué)習(xí)在胰腺醫(yī)學(xué)圖像分割中的臨床應(yīng)用,今后可在保證分割準(zhǔn)確率和網(wǎng)絡(luò)穩(wěn)定性的同時(shí)壓縮胰腺分割模型參數(shù)量,實(shí)現(xiàn)胰腺醫(yī)學(xué)影像分割的臨床落地將會(huì)是未來(lái)研究的重點(diǎn).

    6)統(tǒng)一的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn):目前發(fā)布的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的胰腺分割方法中,不同的作者采用了不同的測(cè)試策略,如交叉驗(yàn)證,消融實(shí)驗(yàn)以及通過(guò)不同的數(shù)據(jù)集驗(yàn)證模型的泛化能力等.因此在網(wǎng)絡(luò)的測(cè)試方法上,并沒(méi)有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),很多網(wǎng)絡(luò)的分割性能并不能進(jìn)行統(tǒng)一比較.后續(xù)可以開(kāi)發(fā)一套統(tǒng)一的模型性能驗(yàn)證方案,以便在未來(lái)的研究中得到較為一致的評(píng)價(jià)結(jié)果.

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