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      一株產(chǎn)低溫脂肪酶酵母菌的鑒定及酶學(xué)性質(zhì)

      2022-10-30 12:21:20史程風(fēng)賈冉冉閻振麗惠豐立
      化工進(jìn)展 2022年10期
      關(guān)鍵詞:脂肪酶瓊脂低溫

      史程風(fēng),賈冉冉,閻振麗,惠豐立

      (1 南陽師范學(xué)院生命科學(xué)與農(nóng)業(yè)工程學(xué)院,河南 南陽 473061;2 河南天冠企業(yè)集團(tuán)有限公司車用生物燃料技術(shù)國家重點實驗室,河南 南陽 473000)

      脂肪酶(EC3.1.1.3)又稱為三?;视退饷?,不僅可催化甘油三酯水解為游離脂肪酸和甘油,還能催化酯化、酯交換、酸解、醇解和氨解等反應(yīng)。作為水解酶,脂肪酶參與的反應(yīng)過程中不需要輔因子,表現(xiàn)出良好的化學(xué)、區(qū)域以及對映選擇性,因而成為最通用的生物催化劑。

      目前工業(yè)上應(yīng)用廣泛的脂肪酶是中高溫脂肪酶。中高溫脂肪酶在30~50℃之間表現(xiàn)出較高酶活性,在0℃時幾乎為零,而低溫脂肪酶在0~20℃范圍內(nèi)就可以表現(xiàn)出較高的酶活性,在30℃左右酶活性達(dá)到最高。低溫脂肪酶為適應(yīng)寒冷環(huán)境進(jìn)化出了一系列的結(jié)構(gòu)特征,表現(xiàn)為高靈活性、高彈性,具有高催化活性、低活化能、高底物親和力、熱不穩(wěn)定性等特點,在低溫環(huán)境中具有廣泛的應(yīng)用前景。

      在生物質(zhì)能源領(lǐng)域,低溫脂肪酶催化酯化反應(yīng)生產(chǎn)生物柴油可代替目前以酸或堿為催化劑的化學(xué)法,可解決工藝復(fù)雜、能耗高、污染大等制約其發(fā)展的瓶頸,且使生物柴油具有良好的發(fā)動機低溫啟動性能。在養(yǎng)殖業(yè),低溫脂肪酶水解油脂產(chǎn)生的短鏈脂肪酸可作為生理功能添加劑替代傳統(tǒng)抗生素,用于維護(hù)腸道健康,解決仔豬斷奶應(yīng)激問題。低溫脂肪酶還可解決溫度處理帶來的諸多難題,如在油脂、啤酒及奶制品等加工過程中可避免長時間高溫滅活酶而影響其質(zhì)量和風(fēng)味。在皮制品工業(yè),低溫脂肪酶可以實現(xiàn)對皮革低溫脫脂,省卻加熱和冷卻步驟,在不損壞皮革質(zhì)量的基礎(chǔ)上省時省耗。工業(yè)廢水為自然溫度,甚至10℃以下,利用低溫脂肪酶可實現(xiàn)冷水除污,有利于節(jié)省能源,保護(hù)環(huán)境。

      現(xiàn)有報道的低溫脂肪酶最適反應(yīng)溫度一般為24~37℃,主要來源于海洋深處、極地和高山地區(qū)等極端環(huán)境中的低溫微生物,主要包括耶式酵母屬()、紅酵母屬()、假單胞菌屬()、耶爾森氏菌()、芽孢桿菌屬()、曲霉屬()、沙雷氏菌屬()、 伯克霍爾德氏菌屬()等。為了尋找工業(yè)上有應(yīng)用價值的低溫脂肪酶,國內(nèi)對其產(chǎn)生菌已進(jìn)行了較為深入的研究,但主要是細(xì)菌。謝玉婷等對伯克霍爾德氏菌sp.JXJ-16低溫脂肪酶的酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究,該酶在35℃、pH 8.5~9 有最大水解活性,對硝基苯酚辛酸酯為最適底物。王春雨等研究了蘇云金芽胞桿菌sp.CZW001 低溫脂肪酶的性質(zhì),該低溫脂肪酶最適反應(yīng)溫度為25℃,最適反應(yīng)pH為8,對Ca有較大依賴性。國外學(xué)者Park 等篩選出一株嗜溫畢赤酵母NRRL Y-7723,但僅對該菌產(chǎn)低溫脂肪酶條件進(jìn)行了優(yōu)化。Maharana等從南極東部湖泊沉積物樣品中分離得到一株耐冷紅酵母sp. Y-23,該菌所產(chǎn)的低溫脂肪酶最適反應(yīng)pH 為8,最適反應(yīng)溫度為35℃,且在pH為5、溫度20℃時更具穩(wěn)定性。

      本文作者課題組從實驗室所保藏的55 株產(chǎn)低溫脂肪酶菌株中篩選出一株高產(chǎn)酵母菌株NYNU 19160,對該菌株進(jìn)行鑒定,并對該菌株所產(chǎn)脂肪酶進(jìn)行初步純化,研究其酶學(xué)性質(zhì),為工業(yè)低溫脂肪酶資源的開發(fā)及應(yīng)用提供理論依據(jù)。

      1 材料和方法

      1.1 材料

      1.1.1 菌株

      55 株產(chǎn)低溫脂肪酶酵母菌株是從我國東北及西北地區(qū)采集的土壤樣品中分離獲得,保藏于本實驗室。

      1.1.2 試劑與儀器

      試劑:棕櫚酸對硝基苯酯(PNPP),上海麥克林生化有限公司;無水乙醇,天津市風(fēng)船化學(xué)試劑科技有限公司;阿拉伯膠,美國生命科學(xué)與高科技集團(tuán)公司;TritonX-100,北京索萊寶科技有限公司;Ezup 柱式酵母基因組DNA 抽提試劑盒,生工生物工程(上海)股份有限公司;BCA 蛋白濃度測定試劑盒,北京索萊寶科技有限公司。

      主要儀器:YQT-33QCE 全自動生化培養(yǎng)箱,上海申安醫(yī)療器械設(shè)備有限公司;STIK 高壓蒸汽滅菌器,施都凱儀器設(shè)備上海有限公司;ZWYRD2403恒溫培養(yǎng)振蕩器,上海智城分析儀器制造有限公司;磁力攪拌器,海門市其林貝爾儀器制造有限公司;多功能酶標(biāo)儀,珀金埃爾默股份有限公司。

      1.1.3 培養(yǎng)基

      YM 液體培養(yǎng)基(g/L):無水葡萄糖10,麥芽粉3,酵母粉3,蛋白胨5,pH自然。

      YM 固體培養(yǎng)基:YM 液體培養(yǎng)基基礎(chǔ)上添加瓊脂20g/L。

      羅丹明B 篩選培養(yǎng)基(g/L):無水葡萄糖10,麥芽粉3,酵母粉3,蛋白胨5,瓊脂20,羅丹明B 0.01,三丁酸甘油酯乳化液1%(體積分?jǐn)?shù)),pH自然。三丁酸甘油酯乳化液參照文獻(xiàn)[23]制備。

      發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):無水葡萄糖10,玉米漿40,三水磷酸氫二鉀6.6,硝酸鈉5,三丁酸甘油酯2.5,吐溫80 1,pH 7.0。

      YCBS 固體培養(yǎng)基(g/L):酵母碳源基礎(chǔ)17.9,硫酸銨0.1,瓊脂20。

      5%麥芽粉固體培養(yǎng)基(g/L):麥芽粉50,瓊脂20。

      1%玉米瓊脂培養(yǎng)基(g/L):玉米粉50,瓊脂10(需將玉米粉70℃水浴至水發(fā)白,用紗布過濾后添加瓊脂配制)。

      2%玉米瓊脂培養(yǎng)基(g/L):玉米粉50,瓊脂20(需將玉米粉70℃水浴至水發(fā)白,用紗布過濾后添加瓊脂配制)。

      氮源同化測試基礎(chǔ)培養(yǎng)基(BMN)(g/L):酵母碳源基礎(chǔ)17.9。

      碳源同化測試基礎(chǔ)培養(yǎng)基(BMC)(g/L):酵母氮源基礎(chǔ)10。

      YEPD 固體培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖20,蛋白胨20,酵母粉10,瓊脂20。

      維生素基礎(chǔ)固體培養(yǎng)基(g/L):維生素基礎(chǔ)培養(yǎng)基17,瓊脂20。

      1.2 菌株篩選

      (1)初篩 將待篩選菌株在YM固體培養(yǎng)基上涂布平板,15℃培養(yǎng)3天,挑取單菌落轉(zhuǎn)移到羅丹明B 篩選平板上,15℃培養(yǎng)3 天,于350nm 紫外光下觀察。依據(jù)培養(yǎng)平板上形成的熒光圈的早晚和熒光圈直徑與菌落直徑比值的大小進(jìn)行篩選,直徑比大的菌落表明水解脂肪酶能力強。

      (2)復(fù)篩 將初篩的菌株挑取單菌落接入YM液體培養(yǎng)基,15℃、200r/min搖瓶培養(yǎng)1~2天,以10%接種量接種于發(fā)酵培養(yǎng)基,15℃、200r/min 搖瓶發(fā)酵3~7 天后,12000r/min 離心20min,取上清液即得粗酶液,測定酶活性。

      酶活性測定參考Margesin 等的測定方法并略作修改。取棕櫚酸對硝基苯酯(PNPP)溶液0.3mL( 體 系 為 0.0378g PNPP、 0.1g 阿 拉 伯 膠、0.4mLTritonX-100溶于50mmol pH7.0的Tris-HCl 緩沖液中,加熱至溶解,定容至100mL),待測酶液0.2mL,充分混合后15℃條件下反應(yīng)15min,立即取出加入0.5mL無水乙醇終止反應(yīng)。分別取200μL反應(yīng)液加入96孔板中,滅活的酶液作為空白對照,測定410nm 下吸光值。1 個酶活性單位定義為:在15℃條件下,脂肪酶水解棕櫚酸對硝基苯酯,每分鐘生成1μmol對硝基苯酚所需酶量,單位以U表示。

      1.3 形態(tài)和培養(yǎng)特征

      菌株NYNU 19160的形態(tài)學(xué)和培養(yǎng)特征的觀察依據(jù)文獻(xiàn)[25]進(jìn)行。在YM固體培養(yǎng)基平板上劃線,15℃培養(yǎng)4~7天后,觀察菌落形態(tài)。在YM液體培養(yǎng)基中,15℃靜置培養(yǎng)3天后,顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)。在1%玉米瓊脂培養(yǎng)基中,15℃培養(yǎng)15~20天,定期鏡檢,觀察假菌絲。在YCBS 固體培養(yǎng)基、5%麥芽粉固體培養(yǎng)基和2%玉米瓊脂培養(yǎng)基上,15℃培養(yǎng)2~10周,定期鏡檢,觀察擔(dān)孢子。

      1.4 生理生化特征

      參考文獻(xiàn)[25-26]對菌株NYNU 19160進(jìn)行生理生化鑒定。除了特別說明外,菌株培養(yǎng)溫度均為15℃。利用杜氏管發(fā)酵法進(jìn)行糖發(fā)酵測試,連續(xù)2周每天觀察記錄杜氏管中氣泡現(xiàn)象。分別采用BMN 和BMC 培養(yǎng)基對菌株進(jìn)行饑餓培養(yǎng),7 天后進(jìn)行碳源、氮源轉(zhuǎn)接實驗,觀察記錄15 天內(nèi)菌株同化或生長情況。設(shè)定4~45℃溫度梯度,YEPD固體培養(yǎng)基作為溫度測試培養(yǎng)基。利用維生素基礎(chǔ)固體培養(yǎng)基進(jìn)行維生素生長測試,配制生長測試培養(yǎng)基進(jìn)行其他生長測試實驗。

      1.5 ITS和26S rDNA序列分析

      1.5.1 基因組DNA的提取

      挑取單菌落于YM 液體培養(yǎng)基中,15℃、200r/min過夜培養(yǎng)24h,離心棄上清液,收集菌體。提取基因組DNA 操作步驟依據(jù)酵母基因組DNA 抽提試劑盒進(jìn)行。

      1.5.2 ITS和26S rDNA PCR擴增和測序

      利用引物ITS1(5′-TCC GTA GGT GAA CCT GCG G-3′) 和ITS4 (5′-TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC-3′)PCR 擴增ITS 區(qū)域序列;利用引物NL1 (5′-TAA GCG GAG GAA AAG-3′) 和NL4(5′-GGT CCG TGT TTC AAG ACG G-3′)PCR 擴增26S rDNA D1/D2區(qū)域序列。PCR擴增條件:94℃預(yù)變性5min,30 個循環(huán)(94℃變性40s,55℃退火40s,72℃延伸30s)72℃延伸5min。擴增完成后以1%的瓊脂糖凝膠電泳對產(chǎn)物進(jìn)行檢測,送到生工生物工程技術(shù)服務(wù)(上海)有限公司測序。

      1.5.3 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹

      通過NCBI 中blastn 工具,將測序得到的菌株NYNU 19160 ITS 序列以及26S rDNA D1/D2 區(qū)域序列在GeneBank 核酸數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行序列相似搜索,利用Clustal X軟件按照最大同源性的原則,將親緣關(guān)系較近的典型菌株作為參比對象進(jìn)行比對。利用MEGA 7.0 軟件采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。選擇1000 次重復(fù)取樣進(jìn)行進(jìn)化樹拓?fù)浞治?,確定進(jìn)化地位。

      1.6 脂肪酶的純化

      將發(fā)酵液離心取上清液即得粗酶液,在冰水浴及磁力攪拌條件下緩慢加入研磨好的硫酸銨粉末,添 加 至 飽 和 度(20%~100%), 靜 置30min,10000r/min冷凍離心,取上清液測定酶活性。以上清液中的酶活性對硫酸銨飽和度作圖。根據(jù)確定出的硫酸銨飽和度進(jìn)行分級沉淀,沉淀復(fù)溶于PBS(50mmol/L,pH7.0)中,4℃透析12~14h 后進(jìn)行濃縮,0.22μm 濾膜過濾后,測定酶活性并使用BCA 蛋白濃度測定試劑盒測定蛋白含量,計算酶純化倍數(shù)和活性回收率。保存純化后的酶液用于后續(xù)酶學(xué)性質(zhì)研究。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 菌株篩選

      經(jīng)過羅丹明B 平板初篩,篩選出12 株熒光圈與菌落直徑比值較大的菌株(表1)。通過對上述菌株進(jìn)行復(fù)篩,菌株NYNU 19160產(chǎn)脂肪酶活性較高,達(dá)到34.47U/mL。

      表1 不同的菌株脂肪酶活性

      2.2 菌株鑒定

      2.2.1 形態(tài)與培養(yǎng)特征

      菌株NYNU 19160 在YM 固體培養(yǎng)基中,15℃培養(yǎng)5 天后,菌落呈奶油色,表面光滑且有光澤,具有完整邊緣。在YM 液體培養(yǎng)基15℃靜置培養(yǎng)3天后鏡檢,細(xì)胞呈卵圓形(圖1),單個或成對出現(xiàn),細(xì)胞大小為[(3~6)μm×(3~5)μm],呈極性出芽。在1%玉米瓊脂培養(yǎng)基中15℃培養(yǎng)15~20 天,定期鏡檢,不形成假菌絲。在YCBS 固體培養(yǎng)基、5%麥芽粉固體培養(yǎng)基和2%玉米瓊脂培養(yǎng)基中15℃培養(yǎng)2~10周,定期鏡檢,不形成擔(dān)孢子。

      圖1 菌株NYNU 19160的細(xì)胞形態(tài)

      2.2.2 生理生化特征

      菌株NYNU 19160不發(fā)酵糖??衫靡野贰⑾跛猁}、D-色氨酸、亞硝酸鹽、氨基葡萄糖、肌酸、D-葡萄糖、D-半乳糖、蔗糖、木糖醇、D-麥芽糖、5-酮-D-葡糖糖鹽、水楊苷、L-阿拉伯糖醇,不可利用尸胺、肌酐、L-賴氨酸、L-山梨糖、甲醇、D,L-乳酸,弱同化咪唑、D-阿拉伯糖,延遲同化核糖醇、檸檬酸、乙醇。在維生素基礎(chǔ)固體培養(yǎng)基上可生長。在15~25℃下生長較快,在40~45℃下不生長。在添加0.01%放線菌酮培養(yǎng)基中弱生長,在添加0.1%放線菌酮、1%乙酸培養(yǎng)基中均不可生長(表2)。菌株NYNU 19160形態(tài)和生理生化特征與最相近。

      表2 菌株NYNU 19160的生理生化特征

      2.2.3 ITS和26S rDNA序列分析

      擴增菌株NYNU 19160 的ITS 和26S rDNA D1/D2 區(qū)域序列,序列長度分別為504 bp 和597 bp。在GeneBank 核酸數(shù)據(jù)庫中,通過NCBI 中blastn 工具進(jìn)行比對后,發(fā)現(xiàn)菌株NYNU 19160 的ITS 序列與EX F-4087的相似性為100%,26S rDNA D1/D2 區(qū)域序列與EX F-4087相似性為99.83%。圖2 為菌株NYNU 19160 與所 構(gòu) 建 系 統(tǒng) 發(fā)育樹。由系統(tǒng)發(fā)育樹可以看出,菌株NYNU 19160與EX F-4087聚為一群。結(jié)合形態(tài)學(xué)和生理生化特征,將菌株NYNU 19160鑒定為。

      圖2 菌株NYNU 19160 ITS和26S rDNA D1/D2區(qū)域序列系統(tǒng)發(fā)育樹

      2.3 低溫脂肪酶的純化

      菌株NYNU19160 硫酸銨沉淀上清液中低溫脂肪酶活性變化曲線表明,飽和度為20%~60%時,酶活性較高,其中飽和度為30%時酶活性最高,為65.6U/mL,隨著硫酸銨飽和度增加到70%,酶活性急劇下降,當(dāng)飽和度達(dá)到90%時,酶活性很低,表明該飽和度下大部分脂肪酶已沉淀(圖3)。因此可選用30%飽和度進(jìn)行硫酸銨一級沉淀,以除去部分雜質(zhì)蛋白,選用90%飽和度進(jìn)行硫酸銨二級沉淀。

      圖3 菌株NYNU 19160硫酸銨沉淀上清液中脂肪酶活性變化曲線

      經(jīng)過粗酶液、一級沉淀上清液以及濃縮后酶液的總蛋白質(zhì)量和總酶活性的計算,得出純化后酶液的比活性為97.93U/mg,純化倍數(shù)為2.12,酶活性回收率為33.5%,見表3。

      表3 菌株NYNU 19160低溫脂肪酶純化結(jié)果

      2.4 低溫脂肪酶酶學(xué)性質(zhì)

      2.4.1 酶最適反應(yīng)溫度及溫度對酶穩(wěn)定性的影響

      取純化后的酶液,于0~50℃條件下分別進(jìn)行酶反應(yīng), 測定酶活性。 結(jié)果表明, 菌株NYNU19160 所產(chǎn)脂肪酶在20℃條件下酶活性達(dá)到最高,0℃仍有12%的相對酶活性,25~35℃條件下相對酶活性在60%以上,證明該酶符合低溫酶的特性(圖4)。將酶液在不同溫度下保溫不同時間后測定剩余酶活性,菌株NYNU19160 脂肪酶在20~30℃條件下酶活性穩(wěn)定性最好,但熱穩(wěn)定性較差,在50℃下保溫30min酶活性損失80%(圖5)。

      圖4 溫度對低溫脂肪酶活性的影響

      圖5 溫度對低溫脂肪酶穩(wěn)定性的影響

      2.4.2 酶最適反應(yīng)pH及其酸堿穩(wěn)定性

      在最適反應(yīng)溫度條件下,將純化后的酶液置于不同pH反應(yīng)體系中,測定酶活性。pH為7~8.5時酶活性達(dá)80%以上,最適反應(yīng)pH為7.5。將酶液在不同pH 緩沖液中保溫處理1h,以原酶活性為100%,測定剩余酶活性。隨著pH增大,酶穩(wěn)定性逐漸提高,pH 為7~8 時仍存留80%酶活性,pH為4 以下時酶活性幾乎喪失,剩余3.87%,證明菌株NYNU19160脂肪酶在酸性環(huán)境中不穩(wěn)定(圖6)。

      圖6 低溫脂肪酶最適反應(yīng)pH及酸堿穩(wěn)定性

      2.4.3 金屬離子對酶活性的影響

      將Mg、Ni、Mn、Ba、Zn、K、Li、Na、Ca、Co、Fe、Cu、Pb、La添加到酶反應(yīng)體系中,使終濃度為1mmol/L,以未與金屬離子混合的原酶液作為對照,在最適反應(yīng)條件下反應(yīng)15min后測定酶活性,考察不同金屬離子對菌株NYNU19160 脂肪酶的影響。由圖7 可知,Co、Cu、La可明顯促進(jìn)酶活性,其中Cu對酶活性促進(jìn)作用最為顯著,達(dá)到186%,Li可能影響了該酶蛋白構(gòu)象,明顯抑制了酶活性,使酶活性降低近60%。

      圖7 金屬離子對低溫脂肪酶活性的影響

      2.4.4 有機溶劑對酶活性的影響

      添加一定濃度的有機溶劑可在酶促有機合成應(yīng)用中起重要作用。由圖8 可以看出,菌株NYNU19160 脂肪酶活性隨著有機溶劑極性減弱而降低。苯與正己烷均對該酶有抑制作用,30%的正己烷在4℃混合1h 酶活性僅剩30%,而乙腈、甲醇、乙酸、異丙醇均對酶活性有促進(jìn)作用,但濃度增大抑制了酶活性,正丁醇、乙醚、乙醇對酶活性促進(jìn)作用不明顯。

      圖8 不同有機溶劑對低溫脂肪酶的影響

      2.4.5 底物特異性

      選取不同碳鏈長度的對硝基苯酚酸酯作為底物分別進(jìn)行酶反應(yīng),結(jié)果如圖9所示。該脂肪酶對對硝基苯酚丁酸酯(-nitrophenyl butyrate,NPC4)催化活性最大,對對硝基苯酚硬脂酸酯(nitrophenyl Stearate,NPC18)催化活性最小,說明菌株NYNU19160脂肪酶對中短鏈底物具有特異性。

      圖9 低溫脂肪酶對不同碳鏈對硝基苯酚酯的水解活性

      3 結(jié)論

      本文從實驗室所保藏的55 株產(chǎn)低溫脂肪酶酵母菌株中篩選出一株高產(chǎn)菌株,對該菌株進(jìn)行了鑒定,經(jīng)初步純化后,研究了該酶的酶學(xué)性質(zhì),結(jié)果如下。

      (1)通過初篩和復(fù)篩獲得一株低溫脂肪酶高產(chǎn)酵母菌株NYNU 19160,通過形態(tài)學(xué)、生理生化以及ITS和26S rDNA D1/D2區(qū)域序列分析,將該菌株鑒定為。

      (2)粗酶液通過硫酸銨分級沉淀、透析、濃縮,純化后酶液比活性為97.93U/mg,純化倍數(shù)為2.12,酶活性回收率為33.5%。

      (3)菌株NYNU 19160 產(chǎn)生的脂肪酶最適反應(yīng)溫度為20℃,在溫度20~30℃的條件下,酶較穩(wěn)定,但對熱敏感,在50℃下處理30min僅殘留20%的酶活性;酶的適宜作用pH范圍在6.5~8.5,最適pH 為7.5;Cu對該脂肪酶有顯著的激活作用,而Li顯著抑制了酶活性;該脂肪酶適宜與極性較強且濃度較低的有機溶劑混合反應(yīng),如乙腈、甲醇、乙酸等,而苯和正己烷則對酶活性抑制作用較強;對硝基苯酚丁酸酯為該脂肪酶的最適反應(yīng)底物。

      (4)該脂肪酶為典型低溫堿性脂肪酶,在生物質(zhì)能源、洗滌劑、皮制品、廢水處理等低溫堿性環(huán)境中具有廣泛的應(yīng)用前景。

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