趙曾強(qiáng),張析,李瀟玲,張薇*
(1.石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院,新疆 石河子 832000;2. 新疆農(nóng)墾科學(xué)院生物技術(shù)研究所,新疆 石河子 832000)
乙烯(ethylene, ET)不敏感蛋白3(ethyleneinsensitive 3,EIN3)和EIN3-like(EIL)蛋白是乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中重要的核轉(zhuǎn)錄因子,其C 端保守性較低,N 端高度保守,包含酸性氨基酸區(qū)、脯氨酸富集區(qū)、堿性氨基酸區(qū)等,含有DNA 結(jié)合的重要結(jié)構(gòu)域,能與初級(jí)乙烯響應(yīng)元件(primary ethylene reaction element, PERE)結(jié)合調(diào)節(jié)相關(guān)基因表達(dá),參與生物與非生物脅迫響應(yīng)[1-3]。 目前關(guān)于該類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子基因的研究主要在擬南芥(Arabidopsis thaliana)[4](6 個(gè)成員)、 煙草(Nicotiana tabacum)[5-6](5 個(gè)成員)、 番茄(Lycopersicon esculentum)[7-8](4 個(gè)成員)、水稻(Oryza sativa)[9-10](6 個(gè)成員)等植物中,通過(guò)擬南芥建立的乙烯響應(yīng)的線性信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)模型研究表明,EIN3/EIL家族基因是乙烯信號(hào)通路中的關(guān)鍵基因[11-12]。
在擬南芥中,乙烯受體蛋白(ethylene receptor 1, ETR1; ethylene receptor 2, ETR2)、乙烯響應(yīng)傳感蛋白(ethylene response sensor 1, ERS1; ethylene response sensor 2, ERS2)、 乙烯不敏感蛋白4(ethylene-insensitive 4, EIN4) 等是膜相關(guān)受體蛋白的主要組成成分,能夠感知乙烯信號(hào)并負(fù)調(diào)控該途徑,膜相關(guān)受體的激活態(tài)或失活態(tài)與乙烯的結(jié)合有關(guān)[13-15]。 研究表明,無(wú)乙烯存在時(shí),膜相關(guān)受體的激活態(tài)與負(fù)調(diào)控因子組成型三重響應(yīng)蛋白1(constitutive triple response 1, CTR1)結(jié)合,通過(guò)促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)途徑將信號(hào)傳遞至EIN2,從而抑制由EIN2 和EIN3 介導(dǎo)的信號(hào)通路應(yīng)答[16-17]。 乙烯存在時(shí),膜相關(guān)受體(如ETR1/2 等)失活,不能與CTR1 結(jié)合,CTR1 抑制下游乙烯響應(yīng)開(kāi)啟,從而使EIN3 蛋白在細(xì)胞核快速積累,參與調(diào)控或激活下游其他轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá)[16, 18-20]。
EIN3/EIL家族基因是否參與植物抗逆響應(yīng)?據(jù)研究報(bào)道,擬南芥ein3-1和eil1-1雙突變體對(duì)高濃度鹽的耐受性顯著降低[21]。 陳華民[22]發(fā)現(xiàn)EIN3 通過(guò)負(fù)調(diào)控水楊酸(salicylic acid, SA)信號(hào)通路調(diào)控植物的先天免疫反應(yīng); 在大豆(Glycine max)中過(guò)表達(dá)EIN3-1、EIN3-2能明顯增強(qiáng)植株對(duì)大豆疫霉根腐病的抗性[23];從矮牽牛(Petunia hybrida)中分離得到的3 個(gè)轉(zhuǎn)錄因子PhEIL1~3中,只有PhEIL1受乙烯的誘導(dǎo)[24]。 研究表明,病程相關(guān)(pathogenesis-related, PR)蛋白在植物抗病反應(yīng)中具有重要意義[25]。乙烯是重要的信號(hào)分 子,EIN2、EIN3、EIN5/AIN1、EIN6、EIN7 是 乙烯響應(yīng)的正調(diào)控因子,負(fù)責(zé)乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo);而定位于核內(nèi)的DNA 結(jié)合蛋白EIN3,直接作用于乙烯響應(yīng)因子1(Ethylene response factor 1, ERF1),調(diào)節(jié)乙烯響應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄, 激活植物防御素和PR基因表達(dá),激活植物的抗病性反應(yīng)[26]。 棉花(Gossypium)基因組分析揭示,乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因涉及2 個(gè)途徑[27],EIN3 和EIL 是相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子。韓利紅[28]將GhEIN3基因?qū)霐M南芥,并獲得過(guò)表達(dá)該基因的擬南芥, 黑暗條件下用1- 氨基環(huán)丙烷-1- 羧酸(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid, ACC)對(duì)其進(jìn)行處理,結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)GhEIN3的擬南芥植株的下胚軸短于野生型和雙突變體ein3eil1,表明GhEIN3在擬南芥中能夠響應(yīng)乙烯信號(hào);Wang 等[29]發(fā)現(xiàn)GhEIN3參與棉花耐鹽性調(diào)控。
棉花枯萎病是嚴(yán)重影響海島棉(G.barbadense)品質(zhì)及產(chǎn)量的土傳真菌病害之一,而關(guān)于棉花中是否存在響應(yīng)枯萎病菌脅迫表達(dá)的EIN3/EIL 轉(zhuǎn)錄因子基因的研究報(bào)道甚少。病毒誘導(dǎo)的基因沉默(virus-induced gene silencing, VIGS)技術(shù)不需遺傳轉(zhuǎn)化,能夠在短時(shí)間內(nèi)實(shí)現(xiàn)基因沉默,被開(kāi)發(fā)為快速、高效、高通量的反向遺傳學(xué)技術(shù), 在棉花基因功能研究中得到廣泛應(yīng)用[30]。
VIGS 技術(shù)利用注射等方式接種棉花子葉, 操作簡(jiǎn)單,不受基因型限制,沉默效率高,約2 周便可實(shí)現(xiàn)靶基因沉默,可大幅縮短研究周期[31-33]。 因此,本研究通過(guò)分析枯萎病菌誘導(dǎo)棉花根部基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)獲得EIN3/EIL 轉(zhuǎn)錄因子基因GhEIN3,利用生物信息學(xué)工具、實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) (quantitative real time polymerase chain reaction, qRT-PCR)技術(shù)和VIGS 技術(shù)初步分析該基因參與調(diào)控棉花對(duì)枯萎病抗性的途徑,以期為進(jìn)一步研究其功能提供重要依據(jù)。
棉花材料:抗枯萎病陸地棉(G.hirsutum)品種中棉所12;枯萎病菌:強(qiáng)致病力菌株7 號(hào)生理小種F430[34];VIGS 載體pTRV1 與pTRV2 載體由石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院劉慧英老師惠贈(zèng);pTRV2∷GhCLA1 重組載體由本實(shí)驗(yàn)室保存。
選籽粒飽滿的種子,經(jīng)10%(體積分?jǐn)?shù))過(guò)氧化氫浸泡3 h,無(wú)菌水沖洗5~6 次后種植于無(wú)菌蛭石中,待棉苗根部生長(zhǎng)至3 cm 左右,移入霍格蘭氏(Hogland's)溶液,置于25 ℃、光照16 h/ 黑暗8 h 的培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng),并每周更換溶液[35]。
枯萎病接菌處理:種植棉苗400 余株,在生長(zhǎng)過(guò)程中去除弱苗與長(zhǎng)勢(shì)不一致的棉苗,待棉苗第1 片真葉完全展開(kāi),選取長(zhǎng)勢(shì)一致的幼苗傷根后浸泡于孢子含量為1×107mL-1的枯萎病菌孢子懸浮液中40 min, 而后轉(zhuǎn)入霍格蘭氏溶液培養(yǎng)[36]。分別取未處理(CK)和處理后1 h、2 h、3 h、6 h、12 h、24 h、48 h 的棉苗完整根部組織,同時(shí)設(shè)置平行對(duì)照(Mock),即相同生長(zhǎng)環(huán)境下相同取樣時(shí)間的清水處理棉苗根部組織,共處理棉苗150 余株,樣品經(jīng)液氮冷凍后保存于-80 ℃冰箱備用[3]。
激素處理: 待棉苗第1 片真葉完全展開(kāi),選取長(zhǎng)勢(shì)一致的幼苗分別浸泡于含有1×10-3mol·L-1乙烯、5×10-5mol·L-1SA、1×10-3mol·L-1茉莉酸(jasmonic acid,JA)和不添加任何激素的清水(Mock)中40 min,然后轉(zhuǎn)移至新鮮霍格蘭氏溶液中,分別取未處理(CK)和處理后1 h、2 h、3 h、6 h、12 h、24 h、48 h 的棉苗完整根部組織,共處理棉苗200 余株, 樣品經(jīng)液氮冷凍后保存于-80 ℃冰箱備用[3]。
1.4.1GhEIN3 基因克隆及序列分析。 棉花根部總RNA 的提取采用改良的CTAB 方法[37],cDNA第1 鏈的合成參考TaKaRa 反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)操作。GhEIN3基因擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸4 min,32 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。 將陽(yáng)性菌株送至生工生物工程(上海) 股份有限公司進(jìn)行基因測(cè)序。 擴(kuò)增引物為GhEIN3-F:GCTCTAGAATGATGATGTTTGACGAGATGGG,GhEIN3-R:CGAGCTCCTGGAACCAGATTGAAACATCC。
利用NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)ORF finder 分 析 開(kāi) 放 閱 讀 框(open reading frame, ORF);利用SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/smart/set_mode.cgi?GENOMIC=1) 進(jìn)行蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析; 利用GOR4(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_gor4.html)進(jìn)行蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)分析;利用SWISS-MODEL(http://swissmodel.expasy.org/)進(jìn)行蛋白結(jié)構(gòu)域三級(jí)結(jié)構(gòu)的同源建模分析;利用ExPaSy ProtScale(http://web.expasy.org/cgi-bin/protscale/protscale.pl) 進(jìn)行蛋白親/疏水性分析;利用ExPaSy ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)進(jìn)行蛋白理化性質(zhì)分析;利用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/) 對(duì)GhEIN3基 因 上 游2 000 bp序列進(jìn)行啟動(dòng)子分析; 利用NCBI 中的Blast 程序(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM = blastp & PAGE _ TYPE = Blast-Search &LINK_LOC=blasthome) 進(jìn)行同源性比對(duì),數(shù)據(jù)庫(kù)選擇非冗余蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(Nonredundant protein sequence, NR), 參數(shù)為程序默認(rèn)設(shè)置,獲得的同源序列登錄號(hào)見(jiàn)表1。獲得的序列利用Mega 7.0 軟件進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析, 利用DNAMAN 6.0 軟件進(jìn)行同源性比較。
表1 GhEIN3 基因同源序列Table 1 Homologous sequences of GhEIN3 gene
1.4.2GhEIN3 基因表達(dá)特征分析。 選取在棉花根和葉中表達(dá)穩(wěn)定的GhUBQ7(DQ116441)作為內(nèi)參基因[38],qRT-PCR 反應(yīng)體系及程序參見(jiàn)TaKaRa 公司(大連)TB GreenPremix EX TaqTM說(shuō)明書(shū);設(shè)3 個(gè)重復(fù),采用2-ΔΔCt 法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)量[39]。 所用引物為qGhEIN3-F:GCCCTTACAGTGAATTTCGTT,qGhEIN3-R:TACTGACATGAGTTCGCCGAT;GhUBQ7-F:GAAGACCTACACCAAGCCCAA,GhUBQ7-R:CGGACT CTACTC AATCCCCACC。
根據(jù)GhEIN3基因序列設(shè)計(jì)特異性引物,利用PCR 擴(kuò)增目標(biāo)片段, 采用酶切連接法進(jìn)行VIGS 載體構(gòu)建, 將構(gòu)建好的pTRV2∷GhEIN3重組載體通過(guò)電擊法轉(zhuǎn)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,對(duì)菌液采用PCR 技術(shù)篩選鑒定陽(yáng)性菌株。 所用引物為GhEIN3-V-XbaI-F:GCTCTAGATGATCCTCCTCAAAGGCGAT,GhEIN3-V-KpnI-R:GGGGTACCCAAAG TTCGGCTCATCTTCAAC,下劃線示限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)。
VIGS 試驗(yàn)操作參考棉花病毒誘導(dǎo)的基因沉默體系及優(yōu)化方法[40]。GhEIN3沉默植株枯萎病抗病性鑒定:以注射pTRV2∷GhCLA1 的棉花葉片出現(xiàn)報(bào)告基因GhCLA1導(dǎo)致的白化表型后,對(duì)基因沉默的棉苗(記為T(mén)RV-GhEIN3)和對(duì)照棉苗,進(jìn)行傷根處理,并對(duì)每株棉苗接種孢子數(shù)為(注射空載體pTRV2∷00 的棉花,記為mock)1×107mL-1的枯萎病菌孢子懸浮液10 mL,然后在溫度25 ℃/23 ℃(光照/黑暗)、光照16 h/黑暗8 h,相對(duì)濕度75%條件下培養(yǎng),設(shè)3 個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)15 株,定期觀察發(fā)病情況。
沉默株系中抗病相關(guān)基因表達(dá)檢測(cè)方法:沉默植株接菌及培養(yǎng)條件同抗病性鑒定。 所檢測(cè)的抗病相關(guān)基因包括GhERF1(XM_016876293.1)、GhACO( NM_001326965 . 1 ) 、GhPR1( XM_016882081.1)、GhPR2(XM_016813433.1)、Gh PR4(XM_016893098.1)、GhPR5(XM_016893098.1)。試驗(yàn)選取在棉花根和葉中表達(dá)穩(wěn)定的GhUBQ7(DQ116441)設(shè)計(jì)內(nèi)參引物[38],qTR-PCR 反應(yīng)體系及程序參見(jiàn)TaKaRa 公司(大連)TB GreenPremix EX TaqTM說(shuō)明書(shū),設(shè)3 個(gè)重復(fù),采用2-ΔΔCt法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)量[39],利用Olig 7 軟件設(shè)計(jì)上述基因引物,其序列見(jiàn)表2。
表2 引物及其序列Table 2 Primer and their sequences
利用枯萎病菌誘導(dǎo)棉花根部基因表達(dá)譜和棉花數(shù)據(jù)庫(kù)從陸地棉中篩選獲得1 個(gè)ORF 完整且編碼氨基酸序列含有典型EIN3 蛋白結(jié)構(gòu)域的基因(圖1A、B);以棉花根部組織cDNA 為模板,通過(guò)PCR 擴(kuò)增及測(cè)序分析, 基因ORF 全長(zhǎng)為1 842 bp(Genbank 登錄號(hào):KY744279,圖1A),編碼的蛋白相對(duì)分子質(zhì)量為69 609.64,等電點(diǎn)為5.41,為親水不穩(wěn)定蛋白,該蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)分析表明,無(wú)規(guī)則卷曲的比例較高,為55.79%,是其二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要組成元件(圖1C);啟動(dòng)子序列分析表明,除啟動(dòng)核心元件和光響應(yīng)元件外,還包括干旱響應(yīng)元件,SA、脫落酸及赤霉素響應(yīng)元件,低溫響應(yīng)元件,MYB 結(jié)合位點(diǎn)和DNA 結(jié)合蛋白位點(diǎn)(圖1D)。 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,GhEIN3與澳洲棉KAA3468812.1親緣關(guān)系較近(圖2);同源比對(duì)分析表明,GhEIN3編碼的氨基酸序列與同源基因編碼的氨基酸序列的保守結(jié)構(gòu)域主要集中在N 端(圖3)。
圖1 GhEIN3 基因克隆及序列分析Fig. 1 Clone and sequence analysis of GhEIN3 gene
圖2 GhEIN3 基因與其他植物EIN3/EIL 基因編碼的氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig. 2 Phylogenetic tree of amino acid sequences encoded by GhEIN3 and EIN3/EIL genes in other plants
圖3 GhEIN3 基因與其他EIN3 基因編碼的氨基酸序列的同源比對(duì)結(jié)果Fig. 3 Alignment of deduced amino acid sequences of GhEIN3 and the other related EIN3 genes
枯萎病菌侵染后,GhEIN3在各處理時(shí)間點(diǎn)的相對(duì)表達(dá)量均高于Mock(圖4A);其中處理后24 h, 該基因的相對(duì)表達(dá)量達(dá)到最大值, 是Mock 的3.72 倍(差異顯著),顯示該基因能被枯萎病菌誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),推測(cè)該基因參與棉花枯萎病脅迫響應(yīng)。
為了進(jìn)一步檢測(cè)GhEIN3基因是否對(duì)激素信號(hào)具有應(yīng)答響應(yīng), 對(duì)抗病品種中棉所12 的棉苗分別用3 種激素(SA、JA 和ET)處理。 基因表達(dá)量檢測(cè)結(jié)果顯示:ET 處理后,該基因相對(duì)表達(dá)量呈現(xiàn)先上升后下降的變化趨勢(shì), 在處理后3 h達(dá)到峰值,且為同時(shí)期Mock 的5.43 倍,差異極顯著(圖4B);SA 與JA 處理后,該基因的表達(dá)模式相似,SA 處理后6 h 開(kāi)始其表達(dá)量均低于Mock,JA 處理后其表達(dá)量均低于Mock, 在SA處理后48 h 與JA 處理后24 h 時(shí),GhEIN3的表達(dá)量最低, 分別為Mock 的5.54%和2.07%(圖4C、D)。 據(jù)此推測(cè),ET 對(duì)GhEIN3基因的表達(dá)為正調(diào)控,SA 與JA 對(duì)GhEIN3基因的表達(dá)為負(fù)調(diào)控。
圖4 不同脅迫處理后GhEIN3 基因的表達(dá)模式Fig. 4 Expression pattern of Ghein3 gene under different stresses
以棉花根部組織的cDNA 為模板,利用特異性引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,片段為400 bp(圖5A),回收產(chǎn)物連接T 載體并進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證(圖5B)并進(jìn)行測(cè)序,選擇正確的重組質(zhì)粒,采用酶切連接的方法進(jìn)行VIGS 載體構(gòu)建,對(duì)重組載體pTRV2∷GhEIN3 進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證(圖5C),結(jié)果均與預(yù)期相一致,表明成功構(gòu)建了該基因沉默重組載體pTRV2 ∷GhEIN3。 然后用其轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌,于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
圖5 pTRV2∷GhEIN3 載體的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果Fig. 5 Agarose gel electrophoresis of pTRV2∷GhEIN3 vector
注射后10 d,pTRV2∷GhCLA1 處理植株真葉出現(xiàn)白化現(xiàn)象(圖6A),表明VIGS 體系可以成功抑制報(bào)告基因GhCLA1表達(dá),且該體系能夠用于棉花中基因功能研究。 在棉苗注射pTRV2∷GhEIN3 后10 d,GhEIN3基因表達(dá)水平檢測(cè)結(jié)果表明,GhEIN3基因在沉默植株中的表達(dá)量為注射空載體植株的16.42%,由此可知,沉默效率約84%(圖6B)。 傷根法接菌后14 d,沉默植株下部葉片快速萎蔫變黃然后變枯,與對(duì)照相比,沉默植株較感?。▓D6C~F)。
圖6 GhEIN3 基因沉默效率及沉默植株抗病檢測(cè)結(jié)果Fig. 6 Silencing efficiency of GhEIN3 gene and detection of disease resistance in silenced plants
PR1、PR2、PR4、PR5基因表達(dá)分析結(jié)果 (圖7)表明,在沉默株系中PR1、PR2、PR4的相對(duì)表達(dá)量均低于空載體對(duì)照,分別低50%、28%、30%,而PR5的相對(duì)表達(dá)量高于空載體對(duì)照46%;乙烯合成及信號(hào)通路相關(guān)基因ACO和ERF1在沉默植株中的相對(duì)表達(dá)量均顯著低于空載體對(duì)照。 由以上結(jié)果推測(cè),GhEIN3基因通過(guò)調(diào)控病程相關(guān)基因與乙烯信號(hào)通路關(guān)鍵基因的表達(dá)調(diào)控棉花對(duì)枯萎病的抗性。
圖7 GhEIN3 基因沉默植株接種F430 后抗病相關(guān)基因的表達(dá)分析Fig. 7 Expression analysis of disease resistance related genes in GhEIN3-silenced plants infected with F430
乙烯在植物生長(zhǎng)發(fā)育及逆境應(yīng)答中發(fā)揮重要的作用, 而EIN3 和EIL 是乙烯信號(hào)通路的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,EIN3 能夠特異性結(jié)合乙烯響應(yīng)相關(guān)基因啟動(dòng)子的特定DNA 序列, 進(jìn)而激活這些基因的轉(zhuǎn)錄,參與植物抗逆響應(yīng)[41]。
本研究根據(jù)枯萎病菌誘導(dǎo)棉花基因表達(dá)譜在棉花基因組中鑒定出響應(yīng)枯萎病菌的轉(zhuǎn)錄因子GhEIN3基因,ORF 全長(zhǎng)為1 842 bp,編碼613個(gè)氨基酸, 所編碼氨基酸中含有典型EIN3 結(jié)構(gòu)域,枯萎病菌侵染后,基因表達(dá)量呈上調(diào)趨勢(shì),推測(cè)其參與了棉花抗枯萎病響應(yīng)。 前人研究表明,過(guò)表達(dá)EIN3-1、EIN3-2的大豆植株對(duì)大豆疫霉根腐病的抗性明顯增強(qiáng)[23];油菜(Brassica napus)中BnEIN3基因能被核盤(pán)菌誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá), 且其在高抗病品種中的表達(dá)水平顯著高于中抗病品種和感病品種[42]。 以上研究結(jié)果與本研究結(jié)果一致。
研究表明,SA、JA 和ET 是植物抗逆信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的重要信號(hào)分子[43-44]。 研究使用外源激素SA、JA 和ET 分別處理棉花幼苗,利用qRT-PCR技術(shù)分析GhEIN3基因表達(dá)特征, 結(jié)果表明,施加ET 后,GhEIN3基因在各處理時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)量均高于同時(shí)期Mock,說(shuō)明其為ET 通路中的正調(diào)控因子, 也與前人對(duì)該基因家族研究結(jié)果一致;但施加SA、JA 后, 該基因表達(dá)量整體低于Mock,表明SA、JA 抑制GhEIN3基因表達(dá)。 研究顯示,SA 與ET 之間存在拮抗關(guān)系[45],而EIN3 在病原微生物脅迫下, 同時(shí)能負(fù)調(diào)控SA 生物合成途徑關(guān)鍵基因SID2的表達(dá)[22],也能夠抑制JA 途徑誘導(dǎo)的煙堿合成酶基因表達(dá)[46],推測(cè)該基因可能是SA 與ET 拮抗作用的節(jié)點(diǎn)。 大部分研究認(rèn)為,JA 與ET 兩個(gè)信號(hào)通路協(xié)同作用, 共同調(diào)節(jié)下游基因的表達(dá); 但也有研究表明,ET 與JA 之間也存在拮抗作用,ET 能夠抑制JA 途徑中THI2.1、VSP等關(guān)鍵基因的表達(dá)[47],暗示各個(gè)激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑所構(gòu)成的信號(hào)傳遞網(wǎng)絡(luò)中存在復(fù)雜的調(diào)節(jié)作用,而并不是單一的拮抗或者協(xié)同作用。GhEIN3基因在SA、JA 和ET 信號(hào)通路交互過(guò)程中所起到的作用也有待進(jìn)一步研究。
研究發(fā)現(xiàn),SA 通路為SA→NPR1→TGA→PR1→抗病,NPR1基因是多種信號(hào)途徑的交叉點(diǎn),通過(guò)與TGA 轉(zhuǎn)錄因子的相互作用調(diào)控PR基因 表 達(dá)[48];EIN3和EIN3-Like1 基 因 通 過(guò) 抑 制SID2編碼的ICS1 表達(dá)而負(fù)調(diào)控病原菌誘導(dǎo)的SA 合成[49]。白樺中,抑制BpEIN3表達(dá)后,轉(zhuǎn)基因植株中參與脫落酸信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的相關(guān)基因、SA 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的NPR1基因和JA 信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控基因JAZ10均上調(diào)表達(dá)[50],而NPR1 最早被發(fā)現(xiàn)在擬南芥中正向調(diào)控SA 信號(hào)通路中PR基因的表達(dá)[51],由此推測(cè),EIN3/EIL1 通過(guò)負(fù)調(diào)控SID2基因的表達(dá)調(diào)節(jié)植物體SA 合成,進(jìn)而調(diào)控PR基因表達(dá), 影響植物抗病性。 本研究利用VIGS 技術(shù)在高抗枯萎病棉花品種中棉所12 中沉默GhEIN3基因,其沉默效率較高,且接菌試驗(yàn)表明沉默株系明顯感??;對(duì)病程相關(guān)基因的表達(dá)量分析結(jié)果顯示, 沉默株系中PR5表達(dá)量高于對(duì)照, 而PR1、PR2、PR4表達(dá)量均低于對(duì)照, 暗示GhEIN3基因能夠調(diào)控PR基因表達(dá)。 但是,本研究采用的VIGS 技術(shù)只能降低GhEIN3基因的表達(dá)量(基因表達(dá)量約為未沉默株系的14%),無(wú)法完全抑制其表達(dá),所以根據(jù)上述結(jié)果僅能初步推斷GhEIN3基因參與并響應(yīng)枯萎病侵染棉花的過(guò)程,而對(duì)于該基因是否如前人研究一樣通過(guò)調(diào)控SA 合成關(guān)鍵基因SID2的表達(dá)來(lái)調(diào)節(jié)棉花對(duì)枯萎病的抗性有待后續(xù)研究。
ERF 是植物特異性轉(zhuǎn)錄因子家族乙烯響應(yīng)元件結(jié)合蛋白 (ethylene responsive element binding protein, EREBP)的成員之一,離體和活體試驗(yàn)均證實(shí)EIN3 與特定ERF1啟動(dòng)子的原初響應(yīng)元件結(jié)合形成二聚體,調(diào)節(jié)ERF1轉(zhuǎn)錄[26]。 本研究沉默GhEIN3基因的植株中,ERF1基因的表達(dá)低于對(duì)照, 由此推斷GhEIN3基因?qū)RF1基因具有調(diào)控作用。ACO基因是編碼ACC 氧化酶的關(guān)鍵基因,ACC 氧化酶是ET 合成過(guò)程中重要的氧化酶[52],而ACO 酶活性下降,可以降低內(nèi)源乙烯合成速度[53]。 本研究結(jié)果顯示,GhEIN3基因?yàn)镋T 信號(hào)通路中的正調(diào)控因子, 且GhEIN3基因沉默株系中,ACO基因的表達(dá)量下降,由此推測(cè)GhEIN3基因可能通過(guò)調(diào)控ACO基因表達(dá)調(diào)節(jié)ACC 的合成影響棉花內(nèi)源乙烯合成, 進(jìn)而影響棉花對(duì)枯萎病的抗性。
本研究就GhEIN3在不同脅迫處理下的表達(dá)特征、GhEIN3沉默后植株的抗病性與GhEIN3沉默后抗病相關(guān)基因的表達(dá)做了初步研究,為解析棉花中GhEIN3參與調(diào)控棉花對(duì)枯萎病菌抗性的機(jī)理提供了新的基礎(chǔ)信息; 植物中EIN3基因是2 個(gè)相關(guān)乙烯途徑的重要基因, 而GhEIN3如何具體參與調(diào)控棉花響應(yīng)枯萎病菌脅迫仍有待深入研究。
本研究從陸地棉中鑒定出1 個(gè)新的能夠響應(yīng)枯萎病菌和激素脅迫的EIN3/EIL基因家族成員GhEIN3,全長(zhǎng)1 842 bp,含有典型的EIN3 蛋白結(jié)構(gòu)域, 能夠響應(yīng)枯萎病菌、ET、JA 和SA 脅迫, 經(jīng)ET 與JA 誘導(dǎo)后,GhEIN3基因的整體表達(dá)水平分別顯著上調(diào)和下調(diào)。 通過(guò)VIGS 技術(shù)沉默GhEIN3的棉株中PR1、PR2、ERF1、ACO基因表達(dá)水平顯著降低,沉默棉株對(duì)枯萎病的抗性減弱,表明GhEIN3基因在棉花抗枯萎病的過(guò)程中起積極作用。