周 潔, 王 磊, 王成海
(1. 揚(yáng)州大學(xué)附屬醫(yī)院 病理科, 江蘇 揚(yáng)州, 225000;2. 揚(yáng)州大學(xué)醫(yī)學(xué)院 病理教研室, 江蘇 揚(yáng)州, 225002)
結(jié)直腸癌(CRC)又稱大腸癌, 是消化系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤,也是癌癥相關(guān)死亡的第4大原因[1]。CRC的早期篩查和診斷主要基于光纖結(jié)腸鏡檢查結(jié)果和糞便隱血檢測(cè)結(jié)果,然而結(jié)腸鏡檢查費(fèi)用昂貴且具有侵入性,糞便隱血檢測(cè)則具有敏感性和器官特異性不高的缺點(diǎn)[2]。因此,臨床亟需探尋一種針對(duì)CRC的簡(jiǎn)單、無創(chuàng)、診療效率高的生物標(biāo)志物。轉(zhuǎn)運(yùn)RNA衍生的小RNA(TDSR)是轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)的片段,其長(zhǎng)度通常為14~50個(gè)核苷酸(nt)。TDSR失調(diào)與多種人類疾病有關(guān),如癌癥、病毒感染、代謝紊亂和神經(jīng)退行性疾病[3-4]。研究[4]表明, CRC患者血漿TDSR中的5′-tRF-Gly-GCC水平高于健康對(duì)照者,可作為CRC的一種診斷生物標(biāo)志物,且TDSR表達(dá)譜分析結(jié)果顯示5′tiRNA-Val-CAC表達(dá)水平升高。本研究探討5′tiRNA-Val-CAC在CRC組織和CRC細(xì)胞中的表達(dá)情況、病理意義及其對(duì)CRC細(xì)胞生長(zhǎng)與增殖的影響,現(xiàn)報(bào)告如下。
選取2019年1月—2021年12月在揚(yáng)州大學(xué)附屬醫(yī)院接受CRC根治術(shù)并經(jīng)病理檢查確診CRC的82例患者作為研究對(duì)象,男56例,女26例,年齡44~71歲,中位年齡55歲。納入標(biāo)準(zhǔn): ① 臨床資料、病理資料無缺失者; ② 經(jīng)病理檢查明確診斷CRC者; ③ 術(shù)前未接受放療、化療、免疫治療等抗腫瘤治療者; ④ 對(duì)本研究知情同意者。排除標(biāo)準(zhǔn): ① 合并其他部位惡性腫瘤者; ② 妊娠期或哺乳期女性; ③ 自身免疫性疾病、感染性疾病患者。選取82例患者的CRC組織進(jìn)行檢測(cè),同時(shí)選取各患者對(duì)應(yīng)的距癌組織5 cm 處的正常結(jié)直腸組織作為對(duì)照(所有癌旁正常組織經(jīng)蘇木精-伊紅染色明確無CRC細(xì)胞)。本研究經(jīng)揚(yáng)州大學(xué)附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)審核備案(2022-YKL2-21-006)。
CRC細(xì)胞系SW620、HCT116和正常人腸上皮細(xì)胞(HIEC)均購于中科院上海細(xì)胞庫。培養(yǎng)基為含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基(HyClone 公司),培養(yǎng)基中添加1%的青鏈霉素(Invitrogen公司)。將細(xì)胞置于37 ℃、5%CO2的潮濕培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。5′tiRNA-Val-CAC模擬物或抑制劑相關(guān)質(zhì)粒和對(duì)照組質(zhì)粒均購自上海生工生物科技有限公司。使用Lipofectamine 2000試劑(Invitrogen公司)將相關(guān)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到CRC細(xì)胞中,分為過表達(dá)5′tiRNA-Val-CAC組(過表達(dá)組)、Scramble對(duì)照組、敲低5′tiRNA-Val-CAC組(敲低組)和正常對(duì)照組。
使用TRIzol試劑(Invitrogen 公司)分離總RNA[260 nm處光密度與230 nm處光密度的比值(OD260 nm/OD230 nm)>1.8]。根據(jù)試劑盒說明書要求,使用Prime-Script First cDNA試劑盒(Takara公司)將總RNA逆轉(zhuǎn)錄為互補(bǔ)DNA(cDNA)。按照qRT-PCR試劑盒(Takara公司)說明書在Applied Biosystems 7500 PCR儀器上進(jìn)行qRT-PCR實(shí)驗(yàn)。反應(yīng)條件: 預(yù)變性95 ℃ 30 s, 然后95 ℃ 5 s→60 ℃ 45 s,共計(jì)40個(gè)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增循環(huán),非編碼RNA(ncRNA)的內(nèi)參為U6,信使RNA(mRNA)的內(nèi)參為GAPDH。所得實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)均與內(nèi)參對(duì)比后再進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。5′tiRNA-Val-CAC上游引物為ACGGAACCUUUCGCAGCG, 下游引物為ACGTGCTTCTGTAGTGTAGT。
82例CRC癌組織標(biāo)本進(jìn)行RISH實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)步驟按照原位雜交試劑盒(武漢博士德公司)說明書進(jìn)行。5′tiRNA-Val-CAC探針序列為GCTTC
TGTAGTGTAGTGGTT和TGGTTATCACGTTCGCCTC。根據(jù)每張癌組織切片5個(gè)高倍視野下5′tiRNA-Val-CAC陽性細(xì)胞計(jì)數(shù)占比情況將82例CRC患者分為高表達(dá)組與低表達(dá)組,其中低表達(dá)組的5′tiRNA-Val-CAC陽性細(xì)胞占比<5%, 高表達(dá)組的5′tiRNA-Val-CAC陽性細(xì)胞占比為5%~100%。
將96孔白板橫向孔依次標(biāo)注數(shù)字1→12,縱向孔依次標(biāo)注英文字母A→H, 實(shí)驗(yàn)接種選擇孔為橫向3→10孔、縱向B→F孔。3B→3E孔為培養(yǎng)液組, 4B→4E孔為正常癌細(xì)胞+培養(yǎng)液組(空白對(duì)照), 5B→5E孔為過表達(dá)組, 6B→6E孔為Scramble對(duì)照組(過表達(dá)組的對(duì)照細(xì)胞組); 7B→7E孔為敲低組,4B→4E孔為正常對(duì)照組(敲低組的正常細(xì)胞對(duì)照組)。
將SW620細(xì)胞懸浮于96孔板的孔洞里,每個(gè)孔洞加入100 μL[(4~5)×103個(gè)細(xì)胞],設(shè)置3個(gè)復(fù)孔(D→E)。將細(xì)胞置入5%CO2、37 ℃的培養(yǎng)箱里中培養(yǎng),直至鋪滿整個(gè)孔底。每個(gè)孔中加入CCK-8溶液10 μL, 輕輕擊打培養(yǎng)板使細(xì)胞與溶液混勻,于細(xì)胞培養(yǎng)箱中孵育4 h。使用酶標(biāo)儀于450 nm處檢測(cè)光密度(OD)值,分析敲低、過表達(dá)5′tiRNA-Val-CAC對(duì)細(xì)胞增殖活性的影響。
將各組SW620細(xì)胞接種于6孔板中(10 000個(gè)/孔),每2 d更換1次培養(yǎng)基,培養(yǎng)2周后,棄培養(yǎng)基。在4%多聚甲醛固定30 min后用0.4%結(jié)晶紫染色20~30 min, 于光學(xué)顯微鏡下觀察,對(duì)細(xì)胞克隆數(shù)目進(jìn)行計(jì)數(shù)。
qRT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,82例CRC組織中5′tiRNA-Val-CAC相對(duì)表達(dá)量為(3.69±0.52), 高于癌旁正常組織(設(shè)定相對(duì)表達(dá)量數(shù)值為1), 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=9.111,P=0.012); CRC細(xì)胞系SW620、HCT116中5′tiRNA-Val-CAC相對(duì)表達(dá)量分別為(4.18±0.46)、(3.47±0.68), 均高于HIEC細(xì)胞(設(shè)定相對(duì)表達(dá)量數(shù)值為1),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=11.475、7.158,P=0.008、0.019), 見圖1。
兩者比較, *P<0.05。圖1 5'tiRNA-Val-CAC在不同組織和細(xì)胞中的相對(duì)表達(dá)量
RISH實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示, CRC組織中陽性表達(dá)的5′tiRNA-Val-CAC為棕黃色顆粒,大小不一,以細(xì)胞質(zhì)染色為主, 5′tiRNA-Val-CAC在癌旁正常組織中為陰性表達(dá)或極少陽性表達(dá),見圖2。CRC組織中5′tiRNA-Val-CAC陽性表達(dá)率為82.93%(68/82), 癌旁正常組織中5′tiRNA-Val-CAC陽性表達(dá)率為7.32%(6/82), 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=31.444,P<0.001)。
A、B: 5'tiRNA-Val-CAC在CRC組織中陽性表達(dá)(陽性物質(zhì)為棕黃色顆粒,位于細(xì)胞漿中); C: 5'tiRNA-Val-CAC在癌旁正常組織中陰性表達(dá)。圖2 RISH檢測(cè)5'tiRNA-Val-CAC在不同組織中的表達(dá)情況(光學(xué)顯微鏡,放大200倍)
將5′tiRNA-Val-CAC陽性細(xì)胞占比<5%的30例CRC患者納入低表達(dá)組,將5′tiRNA-Val-CAC陽性細(xì)胞占比為5%~100%的52例CRC患者納入高表達(dá)組。高表達(dá)組腫瘤直徑≥3 cm者、中低分化者占比高于低表達(dá)組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05), 2組其他方面比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05), 見表1。由此表明, 5′tiRNA-Val-CAC高陽性表達(dá)與CRC患者腫瘤直徑和分化程度具有相關(guān)性(P<0.05), 與患者性別、年齡、發(fā)病部位、浸潤(rùn)深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和TNM 分期無相關(guān)性(P>0.05), 見表1。
表1 結(jié)直腸癌組織中5′tiRNA-Val-CAC表達(dá)與臨床病理特征的關(guān)系[n(%)]
過表達(dá)組72 h時(shí)的OD450 nm高于Scramble對(duì)照組,敲低組72 h時(shí)的OD450 nm低于正常對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05); 細(xì)胞克隆平板實(shí)驗(yàn)顯示,過表達(dá)組細(xì)胞克隆數(shù)目多于Scramble對(duì)照組,敲低組細(xì)胞克隆數(shù)目少于正常對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖3、表2。由此表明,過表達(dá)5′tiRNA-Val-CAC后細(xì)胞增殖活性增強(qiáng)、細(xì)胞克隆數(shù)目增多,而敲低5′tiRNA-Val-CAC表達(dá)后細(xì)胞增殖活性下降、細(xì)胞克隆數(shù)目減少,即5′tiRNA-Val-CAC能促進(jìn)CRC細(xì)胞增殖與生長(zhǎng)。
A、B: 各組細(xì)胞不同時(shí)點(diǎn)增殖活性(2組比較, *P<0.05); C: 各組細(xì)胞克隆平板實(shí)驗(yàn)結(jié)果。圖3 5'tiRNA-Val-CAC對(duì)SW620細(xì)胞增殖與生長(zhǎng)的影響
表2 各組SW620細(xì)胞增殖與生長(zhǎng)情況比較
在中國, CRC是第3大常見的消化系統(tǒng)癌癥[1]。每年死于CRC的患者人數(shù)占全球死亡人數(shù)的9.2%, CRC患者5年生存率和10年生存率分別為65%和58%, 死亡原因多為CRC轉(zhuǎn)移與復(fù)發(fā)。近年來, CRC(尤其是直腸癌和遠(yuǎn)端結(jié)腸癌)的總體發(fā)病率有所下降,但50歲以下人群的CRC發(fā)病率有所上升[5]。通過早期發(fā)現(xiàn)、切除癌前病變與腺瘤和廣泛的CRC篩查, CRC的發(fā)病率和病死率均明顯下降[6]。目前研究[7]認(rèn)為, CRC的誘因包括肥胖、少膳食纖維飲食、長(zhǎng)期炎癥性腸病以及腸道微生物群改變。
tRNA是一種經(jīng)典的ncRNA[8],負(fù)責(zé)將mRNA上的遺傳信息翻譯為新生的蛋白質(zhì)。在激素、缺氧和應(yīng)急等生理和病理?xiàng)l件下,tRNA可衍生出許多的片段,包括tiRNAs和tRFs, 這些tRNA衍生片段的重要功能正逐漸被發(fā)現(xiàn),并能作為信號(hào)分子和基因表達(dá)的調(diào)控因子調(diào)節(jié)腫瘤、代謝性疾病和神經(jīng)系統(tǒng)疾病等的病理過程[9-10]。SHAO Y等[11]報(bào)道, tRF-Leu-CAG在非小細(xì)胞肺癌中表達(dá)水平升高,能導(dǎo)致G0/G1細(xì)胞周期進(jìn)展,從而促進(jìn)癌細(xì)胞增殖。CRC中tRF/miR-1280表達(dá)水平下調(diào),過表達(dá)tRF/miR-1280會(huì)抑制CRC細(xì)胞的增殖和集落形成,而敲低tRF/miR-1280會(huì)促進(jìn)CRC細(xì)胞的增殖和集落形成[12]。KIM H K等[13]研究結(jié)果表明,抑制3′tRNA-Leu-CAG可誘導(dǎo)肝癌細(xì)胞凋亡,但在體內(nèi)不能誘導(dǎo)正常肝細(xì)胞凋亡。ZHAO C M等[14]在透明細(xì)胞腎癌患者血清中分離了5種5′-tRNA, 且其表達(dá)水平均下調(diào),表明其可能為腫瘤抑制因子。在乳腺癌中, tRFs可調(diào)節(jié)癌細(xì)胞的侵襲、轉(zhuǎn)移和增殖[15]。相關(guān)研究[4]TDSR表達(dá)譜分析結(jié)果顯示CRC患者5′tiRNA-Val-CAC表達(dá)上調(diào),故本研究進(jìn)一步觀察了5′tiRNA-Val-CAC在CRC組織中的表達(dá)情況,并分析5′tiRNA-Val-CAC與CRC患者臨床病理特征的關(guān)聯(lián)性及其對(duì)CRC細(xì)胞生長(zhǎng)與增殖的影響。
本研究通過RISH實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn), 5′tiRNA-Val-CAC在大多數(shù)CRC組織中呈陽性表達(dá),且qRT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示, 5′tiRNA-Val-CAC在CRC組織和CRC細(xì)胞株中表達(dá)水平升高,提示5′tiRNA-Val-CAC在CRC的發(fā)生發(fā)展過程中起著促癌基因的作用。進(jìn)一步分析5′tiRNA-Val-CAC陽性表達(dá)與CRC患者臨床病理特征的關(guān)系發(fā)現(xiàn), 5′tiRNA-Val-CAC高陽性表達(dá)與腫瘤大小和分化程度密切相關(guān),而與患者性別、年齡、發(fā)病部位、浸潤(rùn)深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和TNM 分期無相關(guān)性。由此表明,5′tiRNA-Val-CAC可能與腫瘤的增殖和分化有關(guān),即5′tiRNA-Val-CAC在CRC中表達(dá)水平越高,腫瘤細(xì)胞分化越低,越能增殖生長(zhǎng),進(jìn)一步說明5′tiRNA-Val-CAC屬于促癌基因,可影響CRC的進(jìn)展和預(yù)后。未來進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)后, 5′tiRNA-Val-CAC或可成為CRC生長(zhǎng)的生物標(biāo)志物,用于CRC的診斷和預(yù)后評(píng)估。TNM分期中的T代表原發(fā)腫瘤的大小和浸潤(rùn)深度,但本研究結(jié)果顯示5′tiRNA-Val-CAC表達(dá)與CRC的TNM分期無關(guān),這可能是因?yàn)楸狙芯縿澐值哪[瘤直徑大小與TNM分期原發(fā)腫瘤大小不一致且本研究標(biāo)本數(shù)量偏少。
本研究尚存在不足之處,例如僅在功能方面對(duì)5′tiRNA-Val-CAC進(jìn)行相關(guān)研究,而未驗(yàn)證5′tiRNA-Val-CAC的下游靶基因,也未研究5′tiRNA-Val-CAC影響CRC細(xì)胞生長(zhǎng)與增殖的具體分子信號(hào)通路,故未來還應(yīng)繼續(xù)深入探討5′tiRNA-Val-CAC對(duì)CRC細(xì)胞增殖的具體調(diào)控機(jī)制等。
綜上所述, 5′tiRNA-Val-CAC是一種新的促癌基因,在CRC組織中高表達(dá),能促進(jìn)CRC細(xì)胞的生長(zhǎng)與增殖。今后, 5′tiRNA-Val-CAC或可成為CRC增殖的分子標(biāo)志物,用于CRC的診斷和預(yù)后判斷。