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      2個大豆VOZ轉(zhuǎn)錄因子的克隆及非生物脅迫表達分析

      2022-07-07 07:00:42鄔長樂張軍何佳琦李銘楊于海偉李珊珊翟瑩
      高師理科學(xué)刊 2022年6期
      關(guān)鍵詞:擬南芥結(jié)構(gòu)域克隆

      鄔長樂,張軍,何佳琦,李銘楊,于海偉,李珊珊,翟瑩

      2個大豆VOZ轉(zhuǎn)錄因子的克隆及非生物脅迫表達分析

      鄔長樂1,2,張軍3,何佳琦1,2,李銘楊1,2,于海偉1,2,李珊珊1,2,翟瑩1,2

      (齊齊哈爾大學(xué) 1. 生命科學(xué)與農(nóng)林學(xué)院,2. 抗性基因工程與寒地生物多樣性保護黑龍江省重點實驗室,黑龍江 齊齊哈爾 161006;3. 黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 畜牧獸醫(yī)分院,黑龍江 齊齊哈爾 161005)

      為探究大豆維管植物鋅指蛋白(VOZ)轉(zhuǎn)錄因子的序列特征和非生物脅迫表達模式,采用實時熒光定量PCR對,在非生物脅迫下的表達量進行檢測,并對其進行克隆及序列分析.,對干旱、高鹽、低溫脅迫均存在響應(yīng),且干旱脅迫下表達量升高最明顯.位于大豆6號染色體上,位于大豆13號染色體上,分別編碼含有478,459個氨基酸的蛋白質(zhì),它們均含有1個保守的VOZ結(jié)構(gòu)域.GmVOZ1-1,GmVOZ1-2均含有1個核定位信號,預(yù)測均為細胞核蛋白.GmVOZ1-1與白羽扇豆LaVOZ的親緣關(guān)系最近,GmVOZ1-2與蒺藜苜蓿MtVOZ的親緣關(guān)系最近.

      大豆;VOZ轉(zhuǎn)錄因子;非生物脅迫;表達分析

      植物已經(jīng)進化出復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),能夠及時應(yīng)對環(huán)境條件的變化.當(dāng)植物遭受環(huán)境脅迫時,其體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄因子家族(如NAC,AP2/ERF,MYB,WRKY等)通過與順式作用元件的特異性結(jié)合進而調(diào)控靶基因的表達[1].這種轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用在植物抵御逆境及基因組信息表達過程中具有核心作用.維管植物鋅指蛋白(Vascular plant one-zinc finger protein,VOZ)是植物中廣泛存在且特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,它們在植物進化過程中高度保守[2].VOZ轉(zhuǎn)錄因子最早發(fā)現(xiàn)于擬南芥中(,),它們與擬南芥基因啟動子中的GCGTNx7ACGC回文序列區(qū)結(jié)合,調(diào)控花粉的發(fā)育[3]846-850.

      近年來,VOZ轉(zhuǎn)錄因子在植物應(yīng)對生物和非生物脅迫過程中發(fā)揮的作用逐漸被發(fā)現(xiàn).過表達的轉(zhuǎn)基因擬南芥對凍害和干旱脅迫的耐受性降低,但對真菌的耐受性提高[4].相反,,雙突變體對非生物脅迫耐受性增強,但對生物脅迫的耐受性降低[5]761.后續(xù)研究表明,,還可以分別作為,的轉(zhuǎn)錄抑制子,介導(dǎo)植物響應(yīng)熱脅迫[6-7].水稻受干旱、高溫、低溫、高鹽等多種逆境脅迫誘導(dǎo)表達,其超表達轉(zhuǎn)基因植株對鹽脅迫的抗性增強[8]23-46.此外,雙突變體的鋁脅迫抗性增強,它們可能作為轉(zhuǎn)錄因子的負調(diào)控因子參與水稻抗鋁毒[9].鹽、干旱、低溫脅迫可以抑制菠蘿,的表達[10]1228.

      大豆是中國五大農(nóng)作物之一,其抗逆基因的篩選和鑒定對大豆抗逆基因工程育種具有重要意義.大豆VOZ轉(zhuǎn)錄因子的非生物脅迫抗性研究尚未開展.本研究從在線數(shù)據(jù)庫中獲得2個大豆VOZ轉(zhuǎn)錄因子的基因序列,對它們的非生物脅迫表達模式及序列特征進行了探究,為基因的進一步功能鑒定及應(yīng)用奠定基礎(chǔ).

      1 材料與方法

      1.1 材料與試劑

      大豆種子(齊齊哈爾地區(qū)種植的北豆9號);大腸桿菌DH5菌株,根癌農(nóng)桿菌EHA105菌株(齊齊哈爾大學(xué)植物分子育種研究室).

      RNAiso Plus試劑,TB Green Premix ExⅡ酶,pMD18-T克隆載體(Takara公司);cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Novoprotein公司).

      1.2 實驗方法

      1.2.1 大豆幼苗非生物脅迫處理 使用沙土與草炭土(1∶1)的混合物種植大豆種子,7 d后移入Hoagland營養(yǎng)液中,水培至幼苗第1片三出復(fù)葉完全展開,進行干旱、高鹽、低溫處理.將幼苗移至20%的PEG8000營養(yǎng)液中進行干旱脅迫處理;移至200 mmol/L的NaCl營養(yǎng)液中進行高鹽脅迫處理;移至4 ℃的培養(yǎng)箱中進行低溫脅迫處理.處理過程中,分別在不同時間點剪取0.1 g第1片三出復(fù)葉,迅速置于液氮中保存?zhèn)溆茫?/p>

      1.2.2 基因表達量檢測 使用RNAiso Plus試劑提取各時間點樣品并反轉(zhuǎn)錄成第一鏈cDNA.以cDNA為模板,大豆為內(nèi)參基因[11],使用TB Green Premix ExⅡ酶,通過實時熒光定量PCR(qPCR)檢測VOZ基因的表達量.qPCR體系反應(yīng)為:2×TB Green Premix ExⅡ酶 10 μL、cDNA 2 μL、上下游引物各0.8 μL,補水至總體積20 μL.反應(yīng)參數(shù)設(shè)置為:95 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃ 5 s,58 ℃ 30 s,共循環(huán)40次.qPCR引物的設(shè)計使用Primer Premier 5軟件,引物序列見表1.所有處理進行3次重復(fù),基因相對表達量的計算采用2-△△Ct法.

      表1 qPCR和基因擴增引物序列

      1.2.3 基因克隆 從植物轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫PlantTFDB(http://planttfdb.gao-lab.org/index.php?sp=Gma),NCBI數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)搜索并下載大豆VOZ轉(zhuǎn)錄因子的基因及蛋白序列.使用Primer Premier 5軟件設(shè)計,的基因擴增引物(見表1).以大豆葉片cDNA為模板,PCR擴增,的基因編碼序列.PCR反應(yīng)程序為:94 ℃ 8 min;94 ℃ 40 s,57 ℃ 40 s,72 ℃ 1 min,循環(huán)30次;72 ℃延伸8 min.回收PCR產(chǎn)物,連接pMD18-T克隆載體,然后送生工生物公司進行測序驗證.

      1.2.4 生物信息學(xué)分析 蛋白分子量及等電點的預(yù)測使用Expasy在線軟件(https://web.expasy.org/compute_pi/);亞細胞定位的預(yù)測使用PSORT在線軟件(https://www.genscript.com/psort.html);植物VOZ蛋白序列下載于NCBI數(shù)據(jù)庫;蛋白序列的比對使用DNAMAN軟件;蛋白系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建使用MEGA5軟件.

      2 結(jié)果與分析

      2.1 GmVOZ1-1和GmVOZ1-2干旱、高鹽、低溫脅迫表達分析

      從PlantTFDB,NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取2個大豆VOZ轉(zhuǎn)錄因子(Genebank登錄號分別為XM003527355,XM006594138),分別命名為,,它們的功能均未被鑒定.實時熒光定量PCR結(jié)果見圖1.由圖1可見,,對干旱脅迫的應(yīng)答最顯著.干旱脅迫處理后,,的表達量迅速升高,的表達量在處理2 h時達到最大值,的表達量在處理1 h時達到最大值,分別達到對照0 h的220倍和106倍(見圖1a).高鹽脅迫處理后,的表達量先下降后升高,然后再下降,處理10 h時達到最大值,表達量為對照的2.2倍;的表達量在處理1 h后開始下降,處理24 h時表達量達到最低值(見圖1b).低溫脅迫處理后,,的表達量均升高,的表達量在處理5 h時達到最大值,表達量在處理24 h時達到最大值,分別達到對照的7.1,4.4倍(見圖1c).

      圖1 GmVOZ1-1和GmVOZ1-2在干旱、高鹽和低溫脅迫下的表達

      2.2 GmVOZ1-1和GmVOZ1-2克隆及序列分析

      分別從大豆葉片cDNA中擴增獲得1 437 bp的基因編碼序列,1 380 bp的基因編碼序列(見圖2).將,分別與克隆載體連接后經(jīng)測序驗證,與NCBI數(shù)據(jù)庫中登錄序列一致.

      位于大豆6號染色體上,位于大豆13號染色體上,它們分別編碼含有478,459個氨基酸的蛋白質(zhì),分子量分別為54.02,51.16 kD,等電點分別為5.56,5.83.GmVOZ1-1,GmVOZ1-2的氨基酸序列相似度達到47.62%,它們均含有1個保守的VOZ結(jié)構(gòu)域(GmVOZ1-1氨基酸序列的235-451位;GmVOZ1-2氨基酸序列的193-410位).亞細胞定位預(yù)測結(jié)果顯示,GmVOZ1-1,GmVOZ1-2的VOZ結(jié)構(gòu)域中均含有1個核定位信號,均為細胞核蛋白(見圖3).

      圖2 GmVOZ1-1和GmVOZ1-2基因的PCR擴增

      注:M為DNA分子量標記物2000;1為的PCR擴增;2為的PCR擴增.

      圖3 GmVOZ1-1和GmVOZ1-2的氨基酸序列比對

      注:方框代表預(yù)測的核定位信號;下劃線代表VOZ結(jié)構(gòu)域.

      2.3 GmVOZ1-1,GmVOZ1-2蛋白系統(tǒng)進化分析

      將GmVOZ1-1,GmVOZ1-2與其它植物中的VOZ蛋白構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,進化關(guān)系見圖4.由圖4可見,GmVOZ1-1與白羽扇豆LaVOZ的親緣關(guān)系最近,GmVOZ1-2與蒺藜苜蓿MtVOZ的親緣關(guān)系最近,這些VOZ蛋白均來自豆科植物.

      圖4 植物VOZ蛋白系統(tǒng)進化樹

      3 討論

      VOZ轉(zhuǎn)錄因子能夠調(diào)控植物應(yīng)答非生物脅迫已在擬南芥[4-7]、水稻[8-9]、菠蘿[10]中得到鑒定.序列分析顯示,GmVOZ1-1,GmVOZ1-2的氨基酸序列中均含有1個保守的VOZ DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域也具有蛋白質(zhì)二聚化功能[3]846.轉(zhuǎn)錄因子一般定位在細胞核中行使轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能.如齒肋赤蘚具有核定位潛力及轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能[12].在GmVOZ1-1,GmVOZ1-2的氨基酸序列中均預(yù)測到1個核定位信號,因此推測它們?yōu)榧毎说鞍祝瓽mVOZ1-1與LaVOZ的親緣關(guān)系最近,GmVOZ1-2與MtVOZ的親緣關(guān)系最近,推測這2個同樣來自豆科植物的VOZ轉(zhuǎn)錄因子也存在響應(yīng)非生物脅迫的可能性.

      ,能夠在大豆幼苗中應(yīng)答干旱、高鹽、低溫脅迫,推測它們的啟動子中應(yīng)該含有與脅迫相關(guān)的順式作用元件或與逆境相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點[13].,在非生物脅迫下的表達量均具有升高的趨勢,尤其在干旱脅迫下它們的表達量升高非常明顯,由此推測,在大豆中可能正調(diào)控非生物脅迫.這種調(diào)控方式前人也有報道,如水稻正調(diào)控水稻的鹽脅迫抗性[8]46,擬南芥正調(diào)控擬南芥的鹽脅迫抗性[14].此外,VOZ轉(zhuǎn)錄因子在植物生物脅迫響應(yīng)途徑中一般也發(fā)揮正調(diào)控的作用[4-5].VOZ轉(zhuǎn)錄因子對植物抗逆性的影響主要通過調(diào)控靶基因?qū)崿F(xiàn).如,對鹽脅迫抗性的正調(diào)控是通過直接或間接的調(diào)控大量鹽脅迫響應(yīng)基因的表達實現(xiàn)的,但在低溫脅迫下它們則負調(diào)控等逆境相關(guān)基因的表達[5]762-766.后續(xù)應(yīng)進一步對,的轉(zhuǎn)基因植物進行抗性鑒定,并探索它們在逆境信號網(wǎng)絡(luò)中的作用及機制,從而豐富大豆抗逆基因資源.

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      Clone and expression analysis of two VOZ transcription factors in soybean under abiotic stress

      WU Changle1,2,ZHANG Jun3,HE Jiaqi1,2,LI Mingyang1,2,YU Haiwei1,2,LI Shanshan1,2,ZHAI Ying1,2

      (1. School of Life Sciences,Agriculture and Forestry,2. Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Resistance Gene Engineering and Protection of Biodiversity in Cold Areas,Qiqihar University,Qiqihar 161006,China;3. BranchofAnimalHusbandryandVeterinaryofHeilongjiangAcademyof AgriculturalSciences,Qiqihar 161005,China)

      In order to investigate the sequence characteristics of VOZ transcription factors in soybean and their expression patterns under abiotic stress,the expression levels of,under abiotic stress were detected by real-time fluorescence quantitative PCR,and the gene cloning and sequence analysis were also carried out.,responded to drought,salt and cold stresses,and their expression levels increased most obviously under drought stress.was located on chromosome 6 of soybean and encoded a protein containing 478 amino acids.was located on chromosome 13 of soybean and encoded a protein containing 459 amino acids.The amino acid sequences of GmVOZ1-1,GmVOZ1-2 both contained a conserved VOZ domain.GmVOZ1-1 and GmVOZ1-2 both contained a nuclear localization signal,which were predicted to be nuclear proteins.GmVOZ1-1 was most closely related to LaVOZ of,and GmVOZ1-2 was most closely related to MtVOZ of.

      soybean;VOZ transcription factor;abiotic stress;expression analysis

      Q37

      A

      10.3969/j.issn.1007-9831.2022.06.014

      1007-9831(2022)06-0080-05

      2022-02-26

      齊齊哈爾大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃項目(202110232163);黑龍江省省屬高等學(xué)?;究蒲袠I(yè)務(wù)費科研項目(145109506);齊齊哈爾大學(xué)研究生創(chuàng)新科研項目(YJSCX2020041)

      鄔長樂(2001-),男,河南信陽人,在讀本科生.E-mail:wuchanglevip@icloud.com

      翟瑩(1982-),女,吉林省吉林人,教授,博士,從事大豆分子遺傳育種研究.E-mail:fairy39809079@126.com

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