雜草抗藥性分子機制研究進展

項青

（蕪湖職業(yè)技術(shù)學(xué)院園林園藝學(xué)院，安徽 蕪湖 241003）

0 引言

雜草與人類生活息息相關(guān)，其影響最大的方面就是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。雖然農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中植物病原物、農(nóng)業(yè)害蟲和農(nóng)田雜草均會給作物的產(chǎn)量和質(zhì)量造成巨大的損失，但其中以雜草造成的損失最大，可以造成34%的產(chǎn)量損失[1]。雜草主要通過與農(nóng)作物競爭水分、肥料、生存空間和的陽光等，影響作物的正常生長發(fā)育，從而影響作物的產(chǎn)量和質(zhì)量。除此之外，一些雜草還會作為病原物的載體，傳播病原。因此，防治雜草是保障糧食產(chǎn)量的重要方式。在化學(xué)除草劑出現(xiàn)之前，主要是通過物理防治，在田間人工拔除雜草。20 世紀(jì)30 年代，化學(xué)除草劑被用于防治雜草，最初除草劑能夠很好地對雜草進行防治，但是隨著大量、長期、頻繁地使用，雜草逐漸對現(xiàn)有的除草劑均產(chǎn)生了抗性[2]。由于雜草和作物之間高度的相似性，因此目前大部分的除草劑都為選擇性的除草劑。雜草對選擇性除草劑的抗性發(fā)展較廣譜的除草劑更快。目前，雜草已經(jīng)對幾乎所有類型的除草劑均產(chǎn)生了抗性。雜草抗藥性的產(chǎn)生導(dǎo)致除草劑的防效降低。為保證糧食產(chǎn)量，就需要使用更加大劑量的除草劑，這又會加劇抗藥性的發(fā)展，形成一個惡性循環(huán)，最終會導(dǎo)致無藥可用的后果。除此之外，大劑量除草劑的使用還會導(dǎo)致環(huán)境的污染，危害人類的生命健康。因此，對抗藥性的研究和治理十分緊迫[3]。

雜草抗藥性的發(fā)展是以種群為單位，建立在帶有耐藥基因型的個體在種群內(nèi)不斷積累發(fā)展起來的。在無除草劑使用的種群中包含不同基因型的個體，其中帶有敏感基因型的個體占主體，只有少量帶有耐藥基因的個體。在使用除草劑后，大量敏感個體的生長會受到抑制或死亡，而耐藥的個體受到的影響則較小。長期的除草劑使用，種群中耐藥的個體產(chǎn)生更多的子代，種群中耐藥的個體積累，達(dá)到一定的閾值，種群就會表現(xiàn)出對除草劑的抗性（圖1）。因此，對雜草抗藥性進行治理，首先是在分子水平上找到抗藥性形成的機制[4]。

圖1 雜草抗藥性在種群中的發(fā)展過程

1 雜草抗藥性的分子機制

除草劑防治雜草的作用機制是除草劑分子噴施到雜草上，進入到雜草細(xì)胞中與細(xì)胞中的受體結(jié)合，導(dǎo)致受體的正常功能紊亂，從而導(dǎo)致的雜草生長發(fā)育受到抑制或死亡。在發(fā)揮作用的過程中會存在很多的阻礙的方式，這些都會導(dǎo)致除草劑不能發(fā)揮作用，從而使雜草表現(xiàn)出耐藥的表型。根據(jù)這個過程，目前報道的主要機制包括靶標(biāo)抗性、非靶標(biāo)抗性等。

1.1 靶標(biāo)抗性

選擇性除草劑的開發(fā)主要就是依據(jù)其可以作用于特定的雜草的靶標(biāo)，而不傷害作物。因此，除草劑靶標(biāo)是抗藥性研究中的重中之重。因為除草劑分子與雜草中靶標(biāo)的接觸是特異性的，因此雜草靶標(biāo)上發(fā)生一些結(jié)構(gòu)性的變化都有可能導(dǎo)致除草劑分子與雜草靶標(biāo)的親和力受到影響，造成除草劑起不到作用。靶標(biāo)蛋白上發(fā)生的突變包括氨基酸替換、缺失、插入和可變剪接等。其中最常見的為部分位點發(fā)生點突變[4]。根據(jù)除草劑靶標(biāo)蛋白的不同，目前主要的除草劑可分類以下幾類：乙酰輔酶A 羧化酶抑制劑類、乙酰乳酸合成酶抑制劑類、光系統(tǒng)Ⅱ抑制劑類、乙酰羥酸合成酶抑制劑類和草甘膦等，分別作用于乙酰輔酶A 羧化酶（acetylˉCoA carboxylase, ACCase）、乙酰乳酸合成酶（acetolactate synthase, ALS）、光系統(tǒng)ⅡD1 蛋白（photosystem II D1 protein, PSII D1）、乙酰羥酸合成酶（acetohydroxyacid synthase, AHAS）和5-烯醇式丙酮酸莽草酸-3-磷酸合酶（5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase, EPSPS）。目前在這些靶標(biāo)蛋白上均發(fā)生過與抗藥性有關(guān)的多種點突變（表1）。Palmieri 等[5]2021 年研究了ALS 蛋白上發(fā)生的A122S、A205V、D376E、W574L 和S653N 突變與長芒莧對ALS 抑制劑類除草劑的抗性有關(guān)。除此之外，一些靶標(biāo)基因的擴增，也可導(dǎo)致抗藥性的產(chǎn)生。據(jù)報道，EPSPS 基因在至少8 種雜草中擴增最多達(dá)到150 多個拷貝[6]。

表1 不同類型除草劑作用靶標(biāo)和抗藥性相關(guān)靶標(biāo)突變位點

1.2 非靶標(biāo)抗性

除了靶標(biāo)抗性之外，一些雜草對除草劑的抗性還與其他的因素導(dǎo)致，其中主要的機制為代謝抗性[4]。一些代謝酶基因包括細(xì)胞色素P450 和谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶等代謝能力的增強，會增強對除草劑分子的代謝能力，從而將有毒的大分子轉(zhuǎn)化為無毒的代謝產(chǎn)物小分子，減小對植物的傷害。P450 通過NADPH P450 還原酶將氧分子插入除草劑分子降低其活性[7]；GST 通過將谷胱甘肽與除草劑分子結(jié)合，使其對雜草無毒性[8]。Wang 等[9]2013 年報道早熟禾和看麥娘對精惡唑禾草靈的抗性就與P450 基因過表達(dá)和基因擴增有關(guān)。Cummins 等[10]2013 年報道北方看麥娘和硬直黑麥草對多種除草劑的抗性就與GST 基因過表達(dá)和基因擴增有關(guān)。另外，通過阻礙除草劑的轉(zhuǎn)移和液泡隔離除草劑的方式也能增強雜草對除草劑的抗性。Ge 等[11]2011 年使用31P 核磁共振對抗性加拿大蓬進行研究，發(fā)現(xiàn)液泡的隔離作用與雜草的抗藥性產(chǎn)生有關(guān)。由于非靶標(biāo)抗性不具有專一性，因此通常產(chǎn)生非靶標(biāo)抗性的雜草也會對其他雜草產(chǎn)生交互抗性。

2 雜草抗藥性機制研究技術(shù)

技術(shù)進步對科學(xué)研究具有巨大的推動作用，從最開始的表型生物測定到現(xiàn)在的分子生物學(xué)檢測，技術(shù)的進步讓抗藥性的研究更加快速、方便。目前主要的研究技術(shù)主要有基于PCR 的技術(shù)、基于Sanger 測序的技術(shù)和基于二代測序的技術(shù)等。

2.1 基于PCR 的研究技術(shù)

PCR 技術(shù)廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)的研究，可以用于突變的分型和基因表達(dá)量定量。突變的分型是研究靶標(biāo)突變的主要手段。設(shè)計特異性的引物對植物靶標(biāo)基因片段進行擴增，含有特定基因型的片段可以被擴增，而不含有該基因型的片段則不會被擴增。PCR 等位基因特異性擴增（PASA）就被廣泛用于靶標(biāo)抗性基因型的檢測。2011 年，Mátyás 等[12]使用雙向等位基因特異性擴增技術(shù)（bi-directional PCR amplification of specific alleles，Bi-PASA）對抗三嗪類除草劑的豚草進行檢測，發(fā)現(xiàn)光系統(tǒng)IID1 蛋白上的S264G 與抗藥性產(chǎn)生有關(guān)?；虮磉_(dá)量定量是研究抗藥性的重要手段?；赑CR 的實時定量PCR 技術(shù)能夠?qū)D(zhuǎn)錄后的mRNA 進行定量計算。比較不同種群的雜草抗藥性候選基因的表達(dá)量，可以得到差異表達(dá)的基因，則與抗藥性表型有關(guān)。結(jié)合基因功能的研究技術(shù)，可以確定差異表達(dá)的基因是否與抗藥性有關(guān)。Gaines 等[13]2010 年使用的實時定量PCR 技術(shù)對抗藥性相關(guān)候選基因的表達(dá)量進行檢測，發(fā)現(xiàn)EPSPS 基因在抗性的長芒莧中高表達(dá)，進一步研究其表達(dá)量升高是導(dǎo)致抗藥性產(chǎn)生的原因，并且其表達(dá)量升高是由于EPSPS 基因的擴增導(dǎo)致的。

2.2 基于DNA 微陣列的技術(shù)

DNA 微整列技術(shù)又稱為基因芯片技術(shù)，在硅片、玻璃等表面排列固定一些列的DNA 片段作為探針與待測樣品的中的DNA進行雜交，雜交完成會發(fā)有熒光信號的產(chǎn)生，檢測熒光就可以定性檢測雜交是否進行和定量檢測雜交的數(shù)量。靶標(biāo)抗性突變的檢測可以設(shè)計含有特定基因型探針進行檢測，若DNA 片段雜交則說明存在特定的基因型。目前，微陣列主要用于檢測殺蟲劑靶標(biāo)抗性突變，Chung 等[14]2011 年使用低密度的特異性等位基因探針微陣列分別檢測與煙粉虱的擬除蟲菊酯抗性相關(guān)的鈉離子門控通道上的M918V、L925I、T929V 和有機磷農(nóng)藥抗性有關(guān)的乙酰膽堿酯酶上的F392W 突變，結(jié)果證明該檢測方法表現(xiàn)出了極好的便捷性和準(zhǔn)確性。檢測基因表達(dá)量的測定是在芯片表面排列代謝基因片段，根據(jù)熒光信號的強弱來判斷抗藥性相關(guān)基因是否特異性表達(dá)。Pilcher 等[15]2017 年使用微陣列技術(shù)在全基因組范圍內(nèi)對DNA 微整列的技術(shù)對小麥抗賽克嗪品種和敏感品種的基因表達(dá)量進行檢測，發(fā)現(xiàn)169 個基因的表達(dá)量上調(diào)，127個基因表達(dá)量下調(diào)。相比于基于PCR 的檢測技術(shù)，其可以初步實現(xiàn)了高通量檢測，但是也存在一些缺點的，準(zhǔn)確性不如PCR 技術(shù)，因此檢測的結(jié)果需要進行PCR 驗證。

2.3 基于測序建立的技術(shù)

隨著人類基因組計劃提出以來，基因測序的技術(shù)經(jīng)歷了飛速的發(fā)展。對基因上發(fā)生的突變的檢測，使用測序的手段無疑是最直接的了。早期的Sanger 法測序便能對靶標(biāo)的序列進行測序，比較不同個體的基因序列就能快速找出發(fā)生的突變。Loubet 等[16]對抗甲氧咪草煙和苯磺隆豚草的ALS 基因進行Sanger 測序，發(fā)現(xiàn)9 個突變與豚草對ALS 抑制劑類除草劑的抗性有關(guān)。不過這樣的測序技術(shù)需要設(shè)計引物擴增后逐個測序，費時費力。二代測序的出現(xiàn)改變了這一情況，對種群內(nèi)的抽樣的全部個體進行混樣二代測序就能一次性的測序獲得種群內(nèi)的靶標(biāo)上發(fā)生的全部突變信息，計算突變的頻率，估算抗藥性的發(fā)展情況。2020 年，Délye 等[17]使用擴增子測序技術(shù)對抗ALS 抑制劑類除草劑歐洲千里光的ALS 基因進行測序，發(fā)現(xiàn)D376E、A205T 和W574L 等突變均與其抗藥性有關(guān)。Chen 等[18]2014 年對早熟禾的種子進行轉(zhuǎn)錄組測序，檢測了ALS 蛋白上發(fā)生的突變，并計算突變的頻率，檢測結(jié)果可以用于估算雜草種群中抗藥性的發(fā)展情況。轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)是目前高通量檢測基因表達(dá)量的主要手段，通過對敏感和抗性種群進行混樣轉(zhuǎn)錄組測序，可以方便地計算代謝酶基因表達(dá)量的變化。Wang 等2021 年對抗甲基二磺隆菵草和敏感菵草進行轉(zhuǎn)錄組測序，研究導(dǎo)致其產(chǎn)生非靶標(biāo)抗性的機制，發(fā)現(xiàn)11 個contigs 在敏感和抗性種群間的表達(dá)量變化顯著，其中主要為P450 和GST。

3 雜草抗藥性機制研究展望

除草劑是現(xiàn)今集約農(nóng)業(yè)中極度依賴的工具。雜草抗藥性也是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中巨大的挑戰(zhàn)。經(jīng)過近幾十年的研究，雜草抗藥性的主要機制已經(jīng)基本明確。但是對于每種雜草每種除草劑的具體機制都不相同，可能是不同的突變也可能是不同的基因，這些都需要根據(jù)具體情況研究治理的手段。目前，雖然進行了大量的研究，但是這些研究很分散。我們要善于在已有研究的基礎(chǔ)上總結(jié)，并進行更加深入的研究。比如利用互聯(lián)網(wǎng)的便利條件，整理總結(jié)已有的研究構(gòu)建數(shù)據(jù)庫，給相關(guān)工作者提供更加全面的信息資源。同時也要善于引進新的技術(shù)，特別的組學(xué)技術(shù)不斷發(fā)展的現(xiàn)在，使用一些新的技術(shù)可能完成以前需要費時數(shù)年的任務(wù)。當(dāng)然，我們研究雜草抗藥性的機制最終是服務(wù)于雜草抗藥性的治理?；跈C制的研究，基因編輯技術(shù)可以用于編輯特定的基因型，使得雜草不再具有抗性，或者開發(fā)新型的除草劑，緩解抗藥性的進化壓力。最后，利用生物防治也是能夠緩解抗藥性發(fā)展的重要手段，如利用的動物除草等。