聶翔,王涓,吳清平,張菊梅,馬國祥,汪智,3,唐勝君,潘琪琪,張偉培,肖鎧姍
(1.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,廣東廣州 510642)(2.廣東省科學(xué)院微生物研究所,華南應(yīng)用微生物國家重點實驗室,廣東省微生物安全與健康重點實驗室,廣東廣州 510070)(3.華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院,廣東廣州 510006)
外膜囊泡(outer membrane vesicles,OMVs),是一種直徑在20~250 nm 之間的球形結(jié)構(gòu)[1-2],主要由革蘭氏陰性菌在生長過程中于細菌表面形成并分泌到胞外[3],內(nèi)含脂多糖、外膜蛋白、磷脂及DNA/RNA 等成分[4-6]。1963 年首次通過電子顯微鏡發(fā)現(xiàn)緊挨著細菌細胞壁處存在囊泡狀的物質(zhì),并認(rèn)為它可能和細菌的功能有關(guān)[7]。直到1999 年,Beveridge 等[8]再次通過電鏡觀察到OMVs,研究發(fā)現(xiàn)其存在多種與致病相關(guān)的物質(zhì),逐漸引起研究人員的重視。目前研究的焦點主要是OMVs 的生物學(xué)功能,如促進生物膜形成,作為毒力基因、活性物質(zhì)和信號分子等的傳輸載體,促進細胞間相互交流,與宿主細胞相互作用誘導(dǎo)免疫應(yīng)答等[9-16]。
空腸彎曲菌(Campylobacter jejuni)是一種人畜共患的革蘭氏陰性菌,廣泛分布于雞鴨等家禽中,從20 世紀(jì)80 年代起就受到國內(nèi)外廣泛重視。人感染空腸彎曲菌會導(dǎo)致急性細菌性腸炎,嚴(yán)重者還會導(dǎo)致格林-巴利綜合征(GBS)[17]??漳c彎曲菌具有多種潛在的毒力因子,包括細胞毒素[18-19]和各種酶類[20-22],但缺乏類似其他腸道病原體能直接將效應(yīng)物傳遞給靶細胞的經(jīng)典毒性相關(guān)分泌系統(tǒng)[23]。在一些菌株中也發(fā)現(xiàn)了VI 型分泌系統(tǒng)(T6SS)的存在,但是對于空腸彎曲菌中T6SS 的功能仍然不是很了解[24-25]。而OMVs是目前發(fā)現(xiàn)的另外一種毒力傳遞機制,它是革蘭氏陰性菌中一種獨有的分泌系統(tǒng)?,F(xiàn)有研究證明空腸彎曲菌OMVs 中確實存在一系列的毒力因子,如能促進空腸彎曲菌入侵腸上皮細胞的細胞質(zhì)擴張毒素和致病性相關(guān)的蛋白酶[21-22]。病原體的一個重要特征是能夠感知環(huán)境,并適當(dāng)?shù)馗淖兒驼{(diào)節(jié)毒力因子[26]。當(dāng)空腸彎曲菌的生長溫度從37 ℃從改變?yōu)?2 ℃時,OMVs 的蛋白質(zhì)豐度也發(fā)生了變化,37 ℃時OMVs 中蛋白質(zhì)PEB4 和PEB1 的豐度增加[27]。在先前的研究中發(fā)現(xiàn)PEB4 蛋白在空腸彎曲菌生物膜形成、運動及宿主細胞入侵中起重要作用[28-30]。PEB1 蛋白在與上皮細胞相互作用和在小鼠腸道定植中發(fā)揮作用[31]。另外,在空腸彎曲菌培養(yǎng)物中添加牛黃膽酸鈉(ST),能增加OMVs 的蛋白水解活性、細胞毒性和腸上皮細胞的免疫原性[22]。因此,OMVs 中含有的各種生物分子對空腸彎曲菌的生存和致病性起到關(guān)鍵性作用。
OMVs的提取是研究OMVs與空腸彎曲菌生物膜形成、耐藥性、毒力及與宿主間相互作用的基礎(chǔ)。因此,開發(fā)一種快速、高效的空腸彎曲菌OMVs 的提取方法具有重要意義?,F(xiàn)有研究中超速離心法是OMVs提取的經(jīng)典方法[26-32],但其OMVs 回收率低,不適用于OMVs 需求量大的實驗。超濾法能收集并提取大量樣本中的OMVs,可滿足研究要求。因此本研究首先通過比較菌株在不同培養(yǎng)基、培養(yǎng)時間及不同氧氣環(huán)境下的生長情況,確定空腸彎曲菌在液體環(huán)境中的最適生長條件,然后利用超濾濃縮法從培養(yǎng)的菌液中提取OMVs 并對其特性進行鑒定。本研究建立了適用于空腸彎曲菌OMVs 的提取體系,為建立高回收率的OMVs 制備方法提供依據(jù)。
1.1.1 菌株
實驗所用的空腸彎曲菌為本實驗室分離與保存。所有目標(biāo)空腸彎曲菌鑒定按照《食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗 空腸彎曲菌檢驗》GB 4789.9-2014方法進行。
1.1.2 材料與試劑
血平板、MH 肉湯粉末、布氏肉湯粉末、BHI 肉湯粉末、磷酸緩沖鹽溶液(PBS)、96 孔板,均購自廣東環(huán)凱微生物科技有限公司;4-羥乙基哌嗪乙磺酸和N-(2-羥乙基)哌嗪-N'-2-乙烷磺酸粉末(HEPES)、氯化鈉(NaCl)、乙酸、乙醇、硫代硫酸鈉、醋酸鈉,均購自廣州諾德生化科技有限公司;碳酸鈉,購自廣州化學(xué)試劑廠;硝酸銀、甲醛,購自美國Sigma 公司;BCA 蛋白定量試劑盒,購自廣州捷威斯生物公司;100 ku 超濾離心管,購自上海優(yōu)寧維生物科技股份有限公司;超速離心管,購自美國Beckman Coulter 公司。Anti-Major outer 膜蛋白抗體(cj-01)(一抗),購自艾博抗(上海)貿(mào)易有限公司;6×protein、Anti-Mouse IgG HRP(二抗)和顯影液EasySee? Western Blot Kit,購自北京全式金生物技術(shù)有限公司。
1.1.3 儀器設(shè)備
二氧化碳培養(yǎng)箱CB220,購自德國BINDER公司;大型高速冷凍離心機J-26 XP,購自德國Beckman avanti 公司;超速離心機(Optima XPN-100)和配套SW32Ti 水平轉(zhuǎn)子,均購自美國Beckman Coulter 公司。
1.2.1 細菌培養(yǎng)
將-80 ℃凍存的空腸彎曲菌接種于血平板,42 ℃培養(yǎng)48 h,挑取單菌落于血平板增菌,42 ℃培養(yǎng)48 h。
1.2.2 細菌在液體環(huán)境中最適生長條件的優(yōu)化
(1)1液體培養(yǎng)基
配制MH、布氏及BHI 液體培養(yǎng)基,將增菌后的菌株用棉簽從血平板上轉(zhuǎn)移至上述三種不同的培養(yǎng)基中,調(diào)整菌液的初始OD600為0.20,42 ℃培養(yǎng)并測定其在液體培養(yǎng)基中的生長曲線,確定空腸彎曲菌液體培養(yǎng)的最適培養(yǎng)基。
(2)2培養(yǎng)時間
菌株增菌后用棉簽從血平板上轉(zhuǎn)移至MH 液體培養(yǎng)基中,調(diào)整菌液的初始OD600為0.001、0.005、0.01、0.05,42 ℃培養(yǎng)并測定其在液體培養(yǎng)基中的生長曲線,確定空腸彎曲菌液體培養(yǎng)的最適培養(yǎng)時間。
(3)3氧氣環(huán)境
增菌后的菌株用棉簽從血平板上轉(zhuǎn)移至MH 液體培養(yǎng)基中,調(diào)整菌液的初始OD600為0.01,將其分別置于大氣環(huán)境和微需氧環(huán)境下培養(yǎng)菌株的生長情況,確定空腸彎曲菌液體培養(yǎng)的最適氧氣條件。
1.2.3 超濾濃縮法提取OMVs
將培養(yǎng)后的菌液以4800 r/min,4 ℃離心30 min,收集上清,用0.22 μm 的微孔濾頭過濾,將過濾后的上清用截留相對分子質(zhì)量100 ku 的超濾離心管以5200 r/min,4 ℃離心20 min,重復(fù)多次,直至最后的液體體積為原體積的1/6。將濃縮后的上清液轉(zhuǎn)移至超速離心管,29600 r/min,4 ℃超速離心3 h,棄去上清,將沉淀重懸于2 mL 0.01 mmol/L 的磷酸緩沖鹽溶液(PBS)中,用0.22 μm 的微孔濾頭過濾鞭毛等雜質(zhì),4 ℃保存。
1.2.4 SDS-PAGE 檢測OMVs 內(nèi)的蛋白
配制SDS-PAGE 凝膠,下層為12%的分離膠,上層為6%的濃縮膠。將提取的OMVs 樣品進行聚丙烯酰胺凝膠電泳,經(jīng)垂直電泳分離后,取下蛋白膠用超純水清洗,固定液(20 mL 乙醇、5 mL 冰醋酸、25 mL 超純水)固定30 min,用增敏液(15 mL 乙醇、35 mL 超純水、0.1 g 硫代硫酸鈉、3.4 g 醋酸鈉)增敏30 min,超純水洗三次,每次5 min,隨后配制銀染液(0.0625 g 硝酸銀粉末、25 mL 超純水、10 μL 甲醛)銀染20 min,超純水洗二次,每次1 min,最后用顯色液(1.25 g 碳酸鈉、50 mL 超純水、10 μL 甲醛)顯色2~5 min,EDTA(0.73 g EDTA-Na2-2H2O、50 mL 超純水)反應(yīng)10 min 終止顯色,超純水洗三次,每次5 min,觀察蛋白質(zhì)條帶。
1.2.5 透射電鏡觀察OMVs 形態(tài)
將提取的OMVs 樣品滴加到碳包覆銅網(wǎng)上,滴加2%醋酸雙氧鈾,PBS 洗三次,室溫干燥,在電鏡下進行檢測。
1.2.6 OMVs 總蛋白濃度檢測
用BCA 蛋白濃度試劑盒測定提取的OMVs 蛋白質(zhì)濃度,根據(jù)試劑盒說明進行樣品處理,用酶標(biāo)儀進行檢測其OD562,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線,計算出OMVs 中蛋白濃度。
1.2.7 Western blotting 檢測外膜蛋白
(1)1全菌蛋白的提?。簩⒀桨迳吓囵B(yǎng)的菌轉(zhuǎn)移到裝有1 mL PBS 的離心管中,5880 r/min 離心5 min,去掉上清,沉淀用PBS 重懸,重懸液超聲破碎5 min(功率40%),得到全菌蛋白溶液。
(2)2可溶蛋白和膜蛋白的提?。和瑯訉⒀桨迳吓囵B(yǎng)的菌轉(zhuǎn)移到裝有1 mL PBS 的離心管中,5880 r/min 離心5 min,去掉上清,沉淀用PBS 重懸,重懸液超聲破碎5 min(功率40%),之后8652 r/min 離心5 min,收集上清液在24200 r/min 下超速離心1 h,吸取最上層500 μL 作為可溶蛋白;8652 r/min 離心的沉淀用PBS 洗3 次,之后加入500 μL 1% Triton X-100,8652 r/min 離心5 min,上清為膜蛋白。
(3)3Western blot 分析:取30 μL 空腸彎曲菌的可溶蛋白、膜蛋白、全菌蛋白及OMVs 進行SDS 聚丙烯酰胺凝膠電泳,經(jīng)垂直電泳分離后,取出蛋白膠,按順序排好蛋白膠、PVDF 膜和濾紙的位置,排氣泡后放入模具內(nèi);整個電泳裝置置于含冰水混合物的冰盒中,轉(zhuǎn)膜條件為55 V 恒壓工作1.5 h;將膜浸泡5%脫脂奶粉中室溫封閉液1 h,用PBS-T 溶液洗膜,10 min/次,洗3 次;加入按1:5000 配制的含有一抗的溶液,室溫下振蕩孵育1 h,用PBS-T 溶液洗3 次;再加入按1:10000 配制的二抗溶液孵育45 min,用PBS-T溶液清洗3 次;配制顯影液對PVDF 膜進行顯影,曝光時間15 s,用Image Lab 圖像分析系統(tǒng)采集圖像。
細菌的OMVs 一般是在液體環(huán)境下釋放的,在對數(shù)后期分泌較為旺盛[26],為保證OMVs 的高回收率,則需要對空腸彎曲菌的液體培養(yǎng)環(huán)境進行優(yōu)化,從培養(yǎng)基、培養(yǎng)時間、培養(yǎng)的氧氣環(huán)境三方面使其達到最佳的生長狀態(tài)。首先,探索了氣體環(huán)境對于空腸彎曲菌的影響,發(fā)現(xiàn)在微需氧的條件下,菌株的生長能力更強(圖1a),因此,后期的實驗均是在此條件下進行。接著,探索了接種量對于空腸彎曲菌的影響,發(fā)現(xiàn)接種量越高,菌株的生長能力越強,但其達到對數(shù)生長期的時間幾乎相似(圖1b),均為12 h,為保證OMVs 分泌量,選擇15 h 作為菌株在液體培養(yǎng)中的最佳時間。后期選擇了較高的接種量進行試驗,并探索不同培養(yǎng)基對菌體生長的影響,發(fā)現(xiàn)在MH 肉湯中,其OD600能達到0.60,最終菌體密度能達到其他兩種培養(yǎng)基的3 倍左右(圖1c)。因此,空腸彎曲菌在MH液體培養(yǎng)基中微需氧培養(yǎng)15 h是提取OMVs的最適生長條件,與文獻報道相符[27]。
圖1 空腸彎曲菌液體培養(yǎng)的最適條件Fig.1 Optimum conditions for liquid culture of Campylobacter jejuni
為更好的研究空腸彎曲菌OMVs的組成部分及生物學(xué)性質(zhì),需要建立一種快速有效的OMVs提取體系。國內(nèi)關(guān)于空腸彎曲菌OMVs 研究尚未見報道,因此本研究建立了從空腸彎曲菌菌液中提取OMVs 的方法。將提取的樣品在電鏡下觀察,發(fā)現(xiàn)均為50~300 nm 間的球形囊泡狀結(jié)構(gòu),符合OMVs 的形態(tài)特征(圖2)。
圖2 OMVs 電鏡形態(tài)Fig.2 The morphology of OMVs observed by electron microscopy
目前,差速離心法(differential centrifugation)因其工藝簡單,底物可重復(fù)利用等優(yōu)點成為分離提取OMVs 最常見最基本的方法[33]。其原理即低速與高速離心交替進行,根據(jù)沉降系數(shù)的不同依次除去不同的雜質(zhì),最終利用超高速離心力使囊泡沉淀在底部達到分離的目的。超濾濃縮法是在差速離心之前,用特定孔徑的濾膜進行樣品濃縮,提高OMVs 的回收率。根據(jù)文獻報道[34],研究人員常采用100 ku 濾膜進行過濾濃縮,本實驗中同樣采用100 ku 濾膜進行濃縮,電鏡下可以看到OMVs 數(shù)量較多(圖2)。張佳星等[34]利用超濾濃縮提取的銅綠假單胞菌OMVs中存在細胞碎片、鞭毛等多種雜質(zhì),而本研究在重懸沉淀之后,用0.22 μm 的微孔濾頭對OMVs 進行了過濾,去除了部分雜質(zhì),圖中僅能看到少數(shù)截斷的鞭毛(圖2)。因此,建立的超濾濃縮法適合于空腸彎曲菌OMVs 的提取。
注:BSA:胎牛血清蛋白;M:250 ku 的蛋白預(yù)染Marker。此前研究表明OMVs 中含有大量蛋白質(zhì)[6],因此利用SDS-PAGE 及BCA 蛋白測量試劑盒對提取的OMVs 中的蛋白質(zhì)進行了測定。SDS-PAGE 鑒定結(jié)果顯示,OMVs 中包含多種不同大小的蛋白質(zhì),其條帶范圍在15~250 ku 之間(圖3)。根據(jù)BCA 蛋白濃度測定試劑盒提供的標(biāo)準(zhǔn)品檢測值與對應(yīng)濃度繪制蛋白濃度標(biāo)準(zhǔn)曲線,并生成標(biāo)準(zhǔn)曲線方程,標(biāo)準(zhǔn)方程為y=0.0004x+0.1108,R2=0.99。通過待測樣本OD562值計算待測樣品濃度,結(jié)果顯示提取的OMVs 中蛋白質(zhì)濃度為40.50 mg/mL(圖4)。因此,本研究建立的超濾濃縮法提取體系可在短時間內(nèi)從較大的樣本量中分離得到大量富含蛋白質(zhì)成分的OMVs。除超濾濃縮法外,另外一些分離OMVs 的方法還有色譜分析法(chromatography)[35]。尺寸排阻色譜法[33]是色譜分析法的一種,其利用分子篩選效應(yīng),對通過色譜柱的分子進行分離,可以獲得不同分子量的囊泡,但有些分子質(zhì)量相近的物質(zhì)無法完全分離。近年來又出現(xiàn)了一些新的分離純化方法,例如免疫親和層析分離(immunoamnity isolation)、試劑盒法、聲納過濾系統(tǒng)(acoustic nano-filter system)等[36-37]。免疫親和層析分離[36]可以利用抗原抗體的相互作用來分離囊泡,雖然分離得到的囊泡純度非常高,但需要OMVs 中具有特定的抗原,分離后對抗原抗體進行相應(yīng)檢測。因此它分離所需成本較高,且操作步驟較為繁瑣。而本研究中超濾濃縮法提取空腸彎曲菌OMVs 僅需4 h 左右便可完成,時間短,且操作簡單。
圖3 空腸彎曲菌OMVs SDS-PAGE 鑒定Fig.3 Identification of Campylobacter jejuni OMVs by SDS-PAGE
圖4 OMVs 的蛋白質(zhì)濃度Fig.4 Total protein concentration of OMVs
圖5 空腸彎曲菌OMVs 的Western blot 分析Fig.5 Western blot analysis of outer membrane protein of Campylobacter jejuni
目前研究報道[38]OMVs 是由外膜突起形成的,且含有外膜蛋白的成分,因此實驗選用空腸彎曲菌Anti-Major outer 膜蛋白抗體(cj-01)靶向超濾濃縮法分離得到的產(chǎn)物,進而表征提取物中的主要成分是否為OMVs。Western Blotting 結(jié)果顯示,空腸彎曲菌的可溶蛋白沒有條帶,而膜蛋白、全菌蛋白及OMVs 均顯示出46 ku 的正確條帶,證明了OMVs 的存在。
綜上所述,本研究首先確定了空腸彎曲形成最佳條件,通過超濾濃縮法從菌液中提取OMVs,通過透射電鏡、蛋白質(zhì)含量測定、特定外膜蛋白抗體等實驗分別對其形態(tài)、純度、含量及成分進行分析,表明本文所建立的方法OMVs 提純效率高、質(zhì)量較好。因此,本研究成功建立了一種從液體培養(yǎng)基中提取空腸彎曲菌OMVs 的提純體系,為后續(xù)研究空腸彎曲菌中OMVs 生物學(xué)功能提供技術(shù)支持。