周曉瑩 黃國(guó)輝 謝 瑩
(廣西醫(yī)科大學(xué)生命科學(xué)研究院 廣西·南寧 530021)
《生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)》是基于廣西醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)實(shí)驗(yàn)中心構(gòu)建的基因組學(xué)研究平臺(tái)、蛋白質(zhì)組學(xué)研究平臺(tái)和細(xì)胞與免疫研究平臺(tái)等大型儀器設(shè)備為基礎(chǔ),針對(duì)醫(yī)學(xué)門類下一年級(jí)學(xué)術(shù)型研究生開(kāi)設(shè)的一門專業(yè)學(xué)位課,綜合了目前醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)研究相關(guān)的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)技術(shù)。本課程主要教授醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中涉及的最具代表性的實(shí)驗(yàn)技術(shù)及應(yīng)用,了解實(shí)驗(yàn)研究中的策略及技術(shù)應(yīng)用,涵蓋了基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及細(xì)胞與免疫研究平臺(tái)的基礎(chǔ)技術(shù),包括細(xì)胞培養(yǎng)、免疫組織化學(xué)染色、多聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)、免疫印跡法(Western-blot)等等。課程宗旨是幫助科研入門的學(xué)術(shù)型研究生建立對(duì)常用實(shí)驗(yàn)方法的基本原理、實(shí)驗(yàn)儀器、實(shí)驗(yàn)材料及操作流程的認(rèn)識(shí)。通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)能使研究生對(duì)目前常用的生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)有一定的了解,對(duì)其基本原理及應(yīng)用領(lǐng)域有了加深認(rèn)識(shí),為開(kāi)展研究課題奠定基礎(chǔ)。
為了在有限的課時(shí)中實(shí)實(shí)在在地讓學(xué)生了解和掌握現(xiàn)代分子生物學(xué)基本理論和有關(guān)實(shí)驗(yàn)的基本方法和技術(shù)原理,以提高學(xué)生的動(dòng)手能力和創(chuàng)造性思維能力,本課程更注重研究生的實(shí)驗(yàn)操作能力的培養(yǎng),將3/5的課時(shí)安排(18學(xué)時(shí))為實(shí)驗(yàn)課。然而,經(jīng)調(diào)查發(fā)現(xiàn),學(xué)生對(duì)于課堂的知識(shí)僅僅止于實(shí)驗(yàn)技術(shù)原理和實(shí)驗(yàn)操作的掌握,但實(shí)際開(kāi)展課題研究的時(shí)候則仍然會(huì)迷惘,不能很好的應(yīng)用課堂所學(xué)知識(shí)。單純的傳授每一個(gè)知識(shí)點(diǎn),猶如每一片分散的拼圖。結(jié)合科研案例進(jìn)行教學(xué),可以有效指導(dǎo)學(xué)生如何拼接各知識(shí)點(diǎn)。
本課程以教師發(fā)表的科研論文為案例載體,從課題設(shè)計(jì)思路到實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì),再到實(shí)驗(yàn)技術(shù)原理講解,再到數(shù)據(jù)分析方法,系統(tǒng)性的幫助學(xué)生形成較完整的科研思維,真正理解和掌握在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中探索什么科學(xué)問(wèn)題,需要使用什么實(shí)驗(yàn)技術(shù),且熟悉如何開(kāi)展實(shí)驗(yàn)。我們以廣西高發(fā)的特色腫瘤-鼻咽癌的科研論文 Inactivation of 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 promotes proliferation and metastasis of nasopharyngeal carcinoma by iron retention,Br J Cancer.2020 Jan;122(1):102-110為教學(xué)案例進(jìn)行闡述。
已知3-羥基丁酸脫氫酶2型(BDH2)是一種催化哺乳動(dòng)物鐵載體生成和調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)鐵代謝的酶?;谇捌诘纳镄畔W(xué)分析發(fā)現(xiàn) BDH2基因在鼻咽癌組織中轉(zhuǎn)錄失活,因此本案例論文主要目的探究BDH2在鼻咽癌中這個(gè)基因的異常表達(dá)及其可能的生物學(xué)功能。
研究的樣本除了來(lái)源于鼻咽癌組織和正常對(duì)照組織樣本,還可以是體外培養(yǎng)的鼻咽癌細(xì)胞系和正常鼻咽上皮細(xì)胞系。由此引入體外細(xì)胞培養(yǎng)的概念,即通過(guò)在體外模擬體內(nèi)環(huán)境,使細(xì)胞得以生存、生長(zhǎng)、繁殖,并能維持其主要結(jié)構(gòu)和功能的一種技術(shù)。
教授內(nèi)容:(1)掌握細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)室的設(shè)備使用方法和保養(yǎng)。(2)掌握細(xì)胞培養(yǎng)的基本知識(shí):培養(yǎng)細(xì)胞的特性,培養(yǎng)細(xì)胞生長(zhǎng)的條件。(3)掌握實(shí)驗(yàn)器材的清洗和消毒滅菌方法。(4)掌握細(xì)胞培養(yǎng)常用試劑的要求和配制方法。(5)熟悉細(xì)胞培養(yǎng)常用合成培養(yǎng)液的特性。
討論交流:如何判斷細(xì)胞是否發(fā)生了污染?傳授學(xué)生相關(guān)經(jīng)驗(yàn),一旦發(fā)生細(xì)胞污染,應(yīng)當(dāng)如何處置,避免繼續(xù)大面積的污染。
應(yīng)用拓展:(1)原代細(xì)胞培養(yǎng)。(2)細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn):細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)、克隆形成實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)等。
為證實(shí) BDH2基因在鼻咽癌細(xì)胞系和組織中的異常轉(zhuǎn)錄表達(dá),需要使用PCR技術(shù)。PCR主要將五大要素混合,即:特異性引物、酶、dNTP、DNA模板和緩沖液(其中需要Mg2+),通過(guò)三個(gè)經(jīng)典的步驟:變性—退火—延伸,得以實(shí)現(xiàn)短時(shí)間內(nèi)在體外快速擴(kuò)增基因片段的目的。由于本研究研究對(duì)象是 RNA,因此需要使用反轉(zhuǎn)錄 PCR(RTPCR),即將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,再以此為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。實(shí)時(shí)熒光定量PCR,是在PCR反應(yīng)體系中加入特異性的熒光染料或探針,熒光信號(hào)的變化真實(shí)地反映了體系中模板的增加,通過(guò)檢測(cè)熒光信號(hào)達(dá)到定量的目的。
教授內(nèi)容:(1)掌握基因組DNA提取及純化的原理和方法,學(xué)會(huì)使用高速離心機(jī)和紫外分光光度計(jì)。(2)通過(guò)應(yīng)用PCR方法擴(kuò)增目的基因,掌握PCR反應(yīng)的基本原理與技術(shù)。(3)掌握瓊脂糖凝膠電泳技術(shù)。(4)掌握使用實(shí)時(shí)熒光定量 PCR方法檢測(cè)基因 mRNA表達(dá)的原理和方法,學(xué)會(huì)使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。
討論交流:實(shí)時(shí)熒光定量PCR的實(shí)驗(yàn)方法有絕對(duì)定量法、相對(duì)定量法以及DDCT法,該如何進(jìn)行選擇?通過(guò)深入討論并凝練出三種方法的異同點(diǎn),闡明其檢測(cè)原理,進(jìn)一步舉例說(shuō)明什么情況下可以使用何種方法。
應(yīng)用拓展:(1)染色質(zhì)免疫共沉淀-PCR。(2)數(shù)字PCR技術(shù)。
為進(jìn)一步證實(shí)鼻咽癌中 BDH2分子在蛋白水平的表達(dá)改變,引入免疫組織化學(xué)染色技術(shù)。這是一種通過(guò)在抗體上結(jié)合可呈色的化學(xué)物質(zhì),利用免疫學(xué)原理中抗原和抗體間專一性的結(jié)合反應(yīng),檢測(cè)細(xì)胞或組織中是否有目標(biāo)抗原的存在。該方法不僅可以用來(lái)檢測(cè) BDH2的蛋白表達(dá)量,也可以觀察BDH2所表達(dá)的定位。
教授內(nèi)容:(1)掌握免疫組化及免疫熒光標(biāo)記的原理和方法。(2)掌握免疫組化石蠟標(biāo)本的制備、石蠟切片的撈取及脫蠟、抗體標(biāo)記及顯色的方法。(3)學(xué)會(huì)病理圖像分析儀,以及染色結(jié)果的評(píng)分方法。
討論交流:導(dǎo)致免疫組化假陽(yáng)性或者假陰性發(fā)生的相關(guān)因素和預(yù)防措施。強(qiáng)調(diào)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照的必要性,對(duì)免疫組織化學(xué)染色結(jié)果的判斷應(yīng)持科學(xué)的、慎重的態(tài)度。
應(yīng)用拓展:(1)免疫熒光染色法;雙重免疫熒光染色法。(2)細(xì)胞爬片-免疫染色法。
實(shí)驗(yàn)已經(jīng)驗(yàn)證 BDH2從轉(zhuǎn)錄和蛋白水平均在鼻咽癌組織中異常低表達(dá),為了探究其對(duì)鼻咽癌細(xì)胞惡性生物學(xué)行為的影響,研究人員構(gòu)建了BDH2的真核表達(dá)載體,通過(guò)外源性轉(zhuǎn)染的方法轉(zhuǎn)入鼻咽癌細(xì)胞中。為了驗(yàn)證轉(zhuǎn)染是否成功,采用Western-blot方法驗(yàn)證轉(zhuǎn)染后鼻咽癌細(xì)胞中 BDH2蛋白的表達(dá)水平。該技術(shù)通過(guò)把電泳分離后的細(xì)胞或組織中蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到固相支持物 NC膜或PVDF膜上,然后用特異性抗體檢測(cè)某特定抗原的一種蛋白質(zhì)檢測(cè)技術(shù),其可以通過(guò)蛋白分子量大小來(lái)判斷其是否為特異性蛋白。
教授內(nèi)容:(1)掌握Western-Blot檢測(cè)的原理及應(yīng)用。(2)掌握細(xì)胞、組織等總蛋白質(zhì)提取及蛋白濃度的測(cè)定。(3)掌握Western-Blot檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)流程及關(guān)鍵條件的優(yōu)化。(4)學(xué)會(huì)SDS聚丙烯酰胺凝膠的制備、蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)印和化學(xué)發(fā)光ECL試劑盒的使用。
討論交流:Western-blot和免疫組織化學(xué)染色法都可以檢測(cè)蛋白的表達(dá)量,兩者分別有什么優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)?通過(guò)對(duì)比加深印象,有助于學(xué)生對(duì)科研過(guò)程中對(duì)實(shí)驗(yàn)手段選擇的判斷。
應(yīng)用拓展:(1)免疫共沉淀。(2)單細(xì)胞Western-blot技術(shù)。
流式細(xì)胞術(shù)是一種用于對(duì)懸浮于流體中的細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)和分選。這種技術(shù)可以用來(lái)對(duì)流過(guò)光學(xué)或電子檢測(cè)器的一個(gè)個(gè)細(xì)胞進(jìn)行連續(xù)的多種參數(shù)分析,包括定量測(cè)定細(xì)胞DNA含量、細(xì)胞體積、蛋白質(zhì)含量、細(xì)胞表面抗原等。對(duì)于腫瘤生物學(xué)方面的研究來(lái)說(shuō),流式細(xì)胞術(shù)最常用于檢測(cè)腫瘤細(xì)胞的凋亡和細(xì)胞周期。
教授內(nèi)容:(1)掌握流式細(xì)胞儀的工作原理。(2)熟悉細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期檢測(cè)的原理。(3)學(xué)會(huì)制備細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期檢測(cè)的細(xì)胞樣本。(4)熟悉流式細(xì)胞儀的使用方法。
討論交流:如何選擇合適的熒光素?包括抗原密度、自發(fā)熒光、非特異性結(jié)合等等多方面考慮,從而培養(yǎng)學(xué)生從多個(gè)角度思考問(wèn)題。
應(yīng)用拓展:(1)分選流式細(xì)胞術(shù)。(2)質(zhì)譜流式細(xì)胞術(shù)。
案例教學(xué)是一種開(kāi)放式、互動(dòng)式的教學(xué)方法,教學(xué)過(guò)程重參與、重感悟,是一種沉浸式的學(xué)習(xí)課堂,充滿了理性的思維。本課程事先安排學(xué)生通讀案例論文,為學(xué)生搭建一個(gè)模擬的科研場(chǎng)景,讓學(xué)生把自己納入研究過(guò)程中,仿佛作為研究人員全程參與了其中的主要實(shí)驗(yàn)。通過(guò)討論、交流等互動(dòng)方式,加強(qiáng)師生之間的交流,進(jìn)一步達(dá)到啟示理論和啟迪思維的目的,提高學(xué)生分析和解決問(wèn)題的能力,更有獲得感[1]。
在《生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)》課程中,我們的教學(xué)目標(biāo)不僅包括知識(shí)目標(biāo),還有能力目標(biāo)和情感目標(biāo)。知識(shí)目標(biāo)是學(xué)生可以掌握醫(yī)學(xué)科學(xué)研究領(lǐng)域中常用的實(shí)驗(yàn)技術(shù),掌握其原理及其應(yīng)用領(lǐng)域,熟練掌握實(shí)驗(yàn)的操作。能力目標(biāo)包含學(xué)生獲取新知識(shí)的能力、批判性思維的能力、分析和解決問(wèn)題的能力、交流和合作的能力、創(chuàng)新思維的能力。情感目標(biāo)主要有:(1)通過(guò)討論交流、聯(lián)合開(kāi)展實(shí)驗(yàn)等,體驗(yàn)合作研究的快樂(lè)。(2)認(rèn)同腫瘤給家庭和社會(huì)帶來(lái)的影響,增強(qiáng)對(duì)患者的同情關(guān)愛(ài)之心和對(duì)社會(huì)的責(zé)任使命感。
教師作為案例教學(xué)的主導(dǎo)者,其不再是單個(gè)知識(shí)點(diǎn)的教授方式,而是需要承上啟下,將課程內(nèi)容恰當(dāng)?shù)卮谝粋€(gè)研究型案例中。教師圍繞整體教學(xué)內(nèi)容,有針對(duì)性地選擇好案例。本課程選擇了任課老師參與發(fā)表的SCI論文,內(nèi)容為廣西常見(jiàn)高發(fā)腫瘤-鼻咽癌的發(fā)病機(jī)制研究。一方面鼻咽癌為廣西醫(yī)科大學(xué)特色科研方向之一,增強(qiáng)學(xué)生對(duì)區(qū)域特色高發(fā)腫瘤的關(guān)注度和認(rèn)識(shí)度;一方面真正實(shí)現(xiàn)科研反哺教學(xué),將科研運(yùn)用于教學(xué)有助于培養(yǎng)學(xué)生的創(chuàng)新意識(shí)和創(chuàng)新能力[2]。任課老師熟悉論文研究的過(guò)程,可以更好的作為案例討論過(guò)程的“引導(dǎo)者”,不斷推動(dòng)學(xué)生的思維探究活動(dòng)向縱深發(fā)展,以達(dá)成多維度的教學(xué)目標(biāo)。
在案例教學(xué)中,學(xué)生是教學(xué)的主體,他們主動(dòng)閱讀文獻(xiàn)、查閱資料、做實(shí)驗(yàn)步驟設(shè)計(jì)、操作實(shí)驗(yàn)并分析結(jié)果,整合加工有效的知識(shí)點(diǎn)。在討論交流過(guò)程中,傾聽(tīng)他人觀點(diǎn),并且陳述個(gè)人的見(jiàn)解,互相取長(zhǎng)補(bǔ)短,從而對(duì)知識(shí)的理解也更系統(tǒng)和全面。學(xué)生在自主學(xué)習(xí)和體驗(yàn)的過(guò)程中還收獲了不論是成功或是失敗的經(jīng)驗(yàn),體驗(yàn)到科學(xué)探究的艱辛與樂(lè)趣,體驗(yàn)到科研人員的辛勤付出,體驗(yàn)到醫(yī)學(xué)科學(xué)進(jìn)步給人類健康帶來(lái)的巨大推動(dòng)作用,激發(fā)起學(xué)術(shù)型研究生為醫(yī)學(xué)科研事業(yè)奉獻(xiàn)的熱情。