李慧民,李 雪,Bikash R. Giri,劉軍濤,夏天奇,王立輝,2,杜鵬飛,陳永軍,Hanif Ullah,Abdul Qadeer,程國(guó)鋒
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動(dòng)物寄生蟲學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200241;2.天津農(nóng)學(xué)院,天津 300384)
p38絲裂原活化蛋白激酶(p38MAPK)是一種具有重要調(diào)控作用的蛋白激酶,已有研究表明p38在豬、牛、小鼠等哺乳動(dòng)物卵母細(xì)胞的減數(shù)分裂過(guò)程和胚胎發(fā)育中具有重要的調(diào)節(jié)作用[1-5]。在曼氏血吸蟲(Schistosoma mansoni)中,研究表明Smp38MAPK對(duì)血吸蟲的纖毛擺動(dòng)速度具有調(diào)節(jié)作用[6],而且抑制Smp38MAPK的活性會(huì)顯著降低毛蚴向母孢蚴的發(fā)育[7]。最近研究表明抑制Smp38MAPK可導(dǎo)致曼氏血吸蟲雌蟲的產(chǎn)卵量下降,成蟲體表受損,卵巢發(fā)育不全[8]。另外,還有研究表明曼氏血吸蟲Smp38MAPK還調(diào)控參與抗氧化防御、核糖體結(jié)構(gòu)組成、剪接體、細(xì)胞骨架以及嘌呤和嘧啶代謝途徑相關(guān)等重要信號(hào)通路[8]。
本實(shí)驗(yàn)室前期通過(guò)磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)日本血吸蟲Sjp38MAPK是多個(gè)信號(hào)通路的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。為深入闡明Sjp38MAPK在日本血吸蟲的生殖發(fā)育與產(chǎn)卵過(guò)程中的作用,本研究對(duì)Sjp38MAPK基因進(jìn)行了克隆、表達(dá)及鑒定。另外,利用RNA干擾技術(shù),對(duì)Sjp38MAPK在日本血吸蟲的生殖和發(fā)育中的功能進(jìn)行了初步研究。
1.1 生物材料及試劑清潔級(jí)昆明小鼠購(gòu)自上海杰思捷實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司,雄性健康小鼠,8周齡;日本血吸蟲尾蚴購(gòu)自中國(guó)疾病預(yù)防控制中心上海寄生蟲病預(yù)防控制所,經(jīng)腹部皮膚感染至昆明小鼠體內(nèi),在感染后相應(yīng)時(shí)間,通過(guò)肝門靜脈灌注法,收取蟲體。RNAiso Plus購(gòu)自上海皓嘉科技發(fā)展有限公司;包涵體蛋白提取試劑盒購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;UNICONTM qPCR SYBR?Green Master Mix(抗體法,No Rox)、2×Hieff Canace?PCR Master Mix高保真酶預(yù)混液、一步法快速克隆試劑盒購(gòu)自翌圣生物科技(上海)有限公司;Cell Titer-LumiTM發(fā)光法細(xì)胞檢測(cè)試劑盒購(gòu)自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;RPMI 1640、Gibco胎牛血清購(gòu)自上海奧吉生物技術(shù)有限公司;HiScript Ⅱ Q RT SuperMix for qPCR(+g DNA wiper)購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司;DMEM NUTRIENT MIX F12購(gòu)自英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司。
1.2 引物設(shè)計(jì)根據(jù)Sjp38MAPK的cDNA序列,在NEBuilder網(wǎng)站上設(shè)計(jì)包含KpnⅠ和Hind Ⅲ 限制性酶切位點(diǎn)的擴(kuò)增CDS全長(zhǎng)序列的引物,上游引物序列:5'-GACAGCCCAGATCTGGGTACCATG TCTTCCACCAAGGATTTG-3';下游引物序列:5'-GGTGCTCGAGTGCGGCCGCAAGCTTCTAGT TGTTTACTTTTAATTGATCCAAC-3'。利用Primer Premier 5軟件設(shè)計(jì)熒光定量引物,上游引物序列:5'-TTGAAGTCTGGCTTTGTGTC-3',下游引物序列:5'-GATTTAACCTGTCATCGTGTG-3'。根據(jù)擴(kuò)增的Sjp38MAPK的cDNA序列,設(shè)計(jì)并合成siRNAs分子,分別命名為siRNA-170、siRNA-417、siRNA-977,siRNAs核酸序列見表1。
表1 siRNAs序列Table 1 The sequences of siRNAs
1.3 生物信息學(xué)分析Sjp38MAPK序列查找其他物種中p38MAPK的同源序列,應(yīng)用ClustalW對(duì)Sjp38MAPK及其同源序列進(jìn)行多重序列分析[9],使用Neighbor joint在MEGA7.0上構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[10]。利用ScanProsite在線工具(https://prosite.expasy.org/scanprosite/)對(duì)Sjp38MAPK結(jié)構(gòu)域和特征序列(激酶ATP結(jié)合序列和MAP激酶序列)進(jìn)行了預(yù)測(cè)[11-12]。
1.4 Sjp38MAPK的克隆、表達(dá)及純化提取日本血吸蟲成蟲總RNA,反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,并將其作為PCR模板擴(kuò)增Sjp38MAPK序列。將擴(kuò)增的產(chǎn)物進(jìn)行KpnⅠ和HindⅢ雙酶切后,然后連接到同樣雙酶切的pET-32a(+)載體質(zhì)粒上,將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,涂布至含有氨芐抗生素的固體培養(yǎng)基上培養(yǎng),挑取陽(yáng)性克隆,測(cè)序鑒定。提取重組質(zhì)粒pET-32a(+)-Sjp38MAPK,將構(gòu)建成功的重組質(zhì)粒pET-32a(+)-Sjp38MAPK轉(zhuǎn)化到BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,在LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)加入1.0 mmol/L IPTG,在37℃條件下誘導(dǎo)約10 h,誘導(dǎo)產(chǎn)物應(yīng)用10%SDS-PAGE凝膠電泳進(jìn)行分離,利用His-Bind純化試劑盒獲得重組蛋白,并用MALDI-TOF-TOF質(zhì)譜進(jìn)行鑒定。
1.5 qRT-PCR分析Sjp38MAPK在日本血吸蟲不同發(fā)育階段的表達(dá)[13]通過(guò)熒光實(shí)時(shí)定量RT-PCR(qRT-PCR)方法檢測(cè)日本血吸蟲在不同發(fā)育時(shí)期(蟲卵、尾蚴和感染后第14、21、28、35 d)中Sjp38MAPK的轉(zhuǎn)錄水平。分別提取每個(gè)樣品的總RNA,制備cDNA,以日本血吸蟲煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)作為內(nèi)參對(duì)照(上游引物序列:5'-CGAGGACCGAACAGCCAGAGAGG-3',下游引物序列:5'-TCCAGACGAACTTTAGAATTC-3')進(jìn)行PCR分析。
1.6 日本血吸蟲Sjp38MAPK的體外干擾根據(jù)Sjp38MAPK的cDNA序列,設(shè)計(jì)并化學(xué)合成siRNAs分子(siRNA-170、siRNA-417、siRNA-977)和對(duì)照siRNA(negative control siRNA,NC)。取干擾后26 d的日本血吸蟲,通過(guò)電轉(zhuǎn)的方法對(duì)日本血吸蟲的Sjp38MAPK基因進(jìn)行體外干擾,將干擾后的血吸蟲轉(zhuǎn)移到12孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,每孔含有2 mL新鮮培養(yǎng)基和10條蟲體,每天更換培養(yǎng)基,并用顯微鏡觀察蟲體的活力。
在培養(yǎng)后的第5 d,收集蟲體,提取血吸蟲的總RNA,取500 ng RNA做qRT-PCR,對(duì)其干擾效果進(jìn)行評(píng)估,篩選干擾Sjp38MAPK效果最好的siRNA分子,用于功能研究。用干擾效果較好的siRNA再次干擾,并確定其干擾效果后,利用qRT-PCR分析血吸蟲的四個(gè)卵殼蛋白基因(GenBank登錄號(hào):AY222895.1、M59318.1、AY814244.1和D32205.1,引物序列見表2)的m RNA表達(dá)情況。利用CellTiter-LumiTM發(fā)光法細(xì)胞活力測(cè)定試劑盒檢測(cè)蟲體的細(xì)胞活性。
表2 qPCR引物序列Table 2 The sequences of qPCR primer
2.1 生物信息學(xué)分析Sjp38MAPK序列生物信息學(xué)分析表明Sjp38MAPK序列與曼氏血吸蟲的同源性為93.48%,與埃及血吸蟲的同源性為90.70%,與人和小家鼠的同源性均為57.10%(圖1A)。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明Sjp38MAPK與曼氏血吸蟲和埃及血吸蟲較近,與人、小鼠和斑馬魚較遠(yuǎn)(圖1B)。GenBank登錄號(hào)分別為:S.mansoni(XP_018647990.1)、S.haematobium(XP_012799766.1)、E.granulosus(ACT21201.1)、H.sapiens(NP_001306.1)和M.musculus(NP_001161980.1)。
圖1 Sjp38MAPK的序列比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育樹分析Fig.1 Sequence alignment and phylogenetic tree analysis of Sjp38MAPK
2.2 Sjp38MAPK編碼cDNA的克隆、重組蛋白的表達(dá)及純化將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物(圖2A)克隆到pET-32a(+)載體,并將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)到BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),然后用10%SDS-PAGE凝膠電泳進(jìn)行分離鑒定,結(jié)果表明在預(yù)期分子量55 kDa處呈現(xiàn)特異性的條帶(圖2B)。利用His親和層析,純化重組蛋白,電泳分析表明獲得單一條帶(圖2C),純化的重組蛋白經(jīng)質(zhì)譜鑒定為Sjp38MAPK。
圖2 Sjp38MAPK的CDS序列的克隆、表達(dá)和純化Fig.2 Cloning, expression and purification of CDS sequence of Sjp38MAPK
2.3 qRT-PCR分析Sjp38MAPK在不同發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)錄情況利用qRT-PCR檢測(cè)日本血吸蟲中Sjp38MAPK在不同發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)錄情況。結(jié)果表明,Sjp38MAPK在日本血吸蟲尾蚴、蟲卵、童蟲和成蟲時(shí)期均有表達(dá),并且在成蟲(21、28、35 d)中的表達(dá)量顯著高于蟲卵、尾蚴和童蟲時(shí)期(圖3)。
圖3 qRT-PCR分析Sjp38MAPK在日本血吸蟲中的表達(dá)Fig.3 Expression of Sjp38MAPK in S. japonicum by qRT-PCR
2.4 日本血吸蟲Sj p38MAPK的干擾利用qRT-PCR分析三種不同的siRNAs分子對(duì)Sjp38MAPK的干擾情況,結(jié)果表明siRNA-977分子具有較好的干擾效果(圖4A)。隨后,選擇干擾Sjp38MAPK效果最好的siRNA-977分子再次干擾Sjp38MAPK的mRNA(圖4B),并檢測(cè)蟲體卵殼蛋白基因的mRNA表達(dá)情況,結(jié)果表明Sjp38MAPK干擾后卵殼蛋白基因AY222895.1、M59318.1和D32205.1的轉(zhuǎn)錄水平顯著降低(圖4C)。另外,利用CellTiter-LumiTM發(fā)光法細(xì)胞活力測(cè)定試劑盒檢測(cè)蟲體的細(xì)胞活性,結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,干擾組日本血吸蟲蟲體活性顯著降低(圖4D)。
圖4 日本血吸蟲Sjp38MAPK基因的干擾Fig.4 Interference of Sjp38MAPK gene in Schistosoma japonicum
有關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,參與酶代謝、核酸調(diào)控和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等過(guò)程的蛋白分子在日本血吸蟲各生殖階段均可通過(guò)磷酸化和去磷酸化修飾,對(duì)血吸蟲的生長(zhǎng)發(fā)育和性成熟進(jìn)行調(diào)控[14]。此外,在曼氏血吸蟲的研究中表明,MAPK蛋白家族成員在不同的細(xì)胞功能中起著至關(guān)重要的作用[15]。p38MAPK為MAPK信號(hào)通路的重要成員,被認(rèn)為是眾多細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的中轉(zhuǎn)站[16]。因此,開展Sjp38MAPK的功能研究,對(duì)于深入揭示血吸蟲生長(zhǎng)發(fā)育分子機(jī)制具有重要意義。
我們對(duì)日本血吸蟲Sjp38MAPK的編碼cDNA進(jìn)行了克隆、重組蛋白表達(dá)和RNA干擾研究。如圖1A顯示,Sjp38MAPK存在蛋白激酶特有的結(jié)構(gòu)域,提示該蛋白可催化磷酸基團(tuán)的轉(zhuǎn)移使底物蛋白發(fā)生磷酸化[17]。進(jìn)一步研究表明Sjp38MAPK在血吸蟲成蟲中表達(dá)量較高(圖3),提示該蛋白可能在成蟲的寄生和發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用。對(duì)Sjp38MAPK RNA干擾研究表明,抑制Sjp38MAPK可影響蟲體卵殼蛋白基因的表達(dá)(圖4C)和蟲體活性(圖4D),提示Sjp38MAPK在蟲體的生殖發(fā)育和產(chǎn)卵中同樣發(fā)揮重要作用。