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    聚焦基因科技 助力我國藍(lán)色經(jīng)濟(jì)加速發(fā)展
    ——深圳華大海洋科技有限公司發(fā)展紀(jì)實(shí)

    2021-12-17 09:10:12于海芳
    中國科技產(chǎn)業(yè) 2021年12期
    關(guān)鍵詞:華大基因組學(xué)海洋生物

    ◎ 文/于海芳 李 秋

    2012年,專注于水生生物基因組學(xué)研究、魚類分子育種與海洋藥物研發(fā)的石瓊,結(jié)束了11年國外科研生涯,接受華大集團(tuán)的邀請,回國參與組建華大海洋科研平臺。憑著一股“闖”勁,石瓊帶領(lǐng)著華大海洋科研團(tuán)隊(duì),以基因科技助力水生生物基礎(chǔ)研究為支點(diǎn),開啟了水生生物基因組學(xué)的奠基、成長、發(fā)展、推廣到產(chǎn)業(yè)應(yīng)用的光輝旅程。

    為加快海洋生物基因組學(xué)研究步伐,實(shí)現(xiàn)國家構(gòu)建海洋強(qiáng)國的戰(zhàn)略目標(biāo),石瓊及其團(tuán)隊(duì)以重要水生生物基因組學(xué)研究為著力點(diǎn),解析魚類適應(yīng)性進(jìn)化的重大理論科學(xué)問題,同時挖掘與重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記,構(gòu)建水產(chǎn)動物分子育種以及基因選擇育種的關(guān)鍵共性技術(shù)體系,篩選藥源性多肽序列,為我國水產(chǎn)動物良種培育和規(guī)?;滦退幬镅邪l(fā)奠定了扎實(shí)的理論與技術(shù)基礎(chǔ)。

    自2001年聯(lián)合國正式文件中首次提出“21世紀(jì)是海洋的世紀(jì)”以來,我國便加快了開發(fā)和利用海洋資源的步伐。根據(jù)國家海洋局公布的數(shù)據(jù),2010年中國海洋生產(chǎn)總值達(dá)3.8萬億元,而在2020年相關(guān)數(shù)值突破了8萬億元。盡管總體來看海洋產(chǎn)業(yè)正穩(wěn)步增長,但各細(xì)分領(lǐng)域間發(fā)展卻極不均衡,濱海旅游業(yè)、海洋交通運(yùn)輸業(yè)及海洋漁業(yè)三大產(chǎn)業(yè)在海洋產(chǎn)業(yè)中占比超80%,而具有改變當(dāng)前疾病治療及創(chuàng)新藥研發(fā)現(xiàn)狀的海洋生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)占比尚不到2%。

    對此,在水生生物行業(yè)扎根近30年的徐軍民頗感遺憾:“在海洋資源開發(fā)方面,我們在其他領(lǐng)域已經(jīng)發(fā)展得足夠強(qiáng)大,但是卻一直沒有人牽頭做海洋生物資源的深層開發(fā)和高值化利用,這怎么能行呢?”既然沒有領(lǐng)路人,不妨自己做開拓者。2015年,徐軍民以公司掌舵人身份加入深圳華大海洋科技有限公司(以下簡稱華大海洋),擁有著對水生生物行業(yè)的獨(dú)特情懷,對海洋生物資源開發(fā)未來的美好暢想,以及對于海洋產(chǎn)業(yè)發(fā)展的偉大愿景,徐軍民帶領(lǐng)著華大海洋走上了海洋生物資源深度開發(fā)與利用的道路。

    正是石瓊的勇“闖”無人區(qū)的精神加上徐軍民敢“創(chuàng)”敢干的創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)精神,讓華大海洋在我國海洋生物領(lǐng)域里,探索出了一條產(chǎn)研結(jié)合的創(chuàng)新發(fā)展之路,這也正是新時代深圳精神的體現(xiàn)。如今,我國迎來了藍(lán)色經(jīng)濟(jì)高速發(fā)展期,華大海洋也已形成由種源經(jīng)濟(jì)、海洋藥物與功能制品及科技服務(wù)組成的三大主要業(yè)務(wù)模塊,“三架馬車”并行,全力推動科研與產(chǎn)業(yè)聯(lián)動向前,助推深圳建設(shè)成為“全球海洋中心城市”的同時,也在助力著我國海洋藍(lán)色經(jīng)濟(jì)發(fā)展。

    華大海洋董事長徐軍民

    華大海洋首席科學(xué)家石瓊

    藍(lán)色崛起是經(jīng)濟(jì)發(fā)展的必然之路

    自成立以來,華大海洋專注于水生生物的科學(xué)研究與產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。憑借著與生俱來的科研“基因”,石瓊主持先后組建了深圳市海洋生物基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)基因組學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室海洋方向、廣東省海洋經(jīng)濟(jì)動物分子育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等,并與解放軍防化研究院陳冀勝院士團(tuán)隊(duì)合作并成立了海洋藥物方向的首批院士(專家)工作站等10余個科技創(chuàng)新平臺。這些科技創(chuàng)新平臺的創(chuàng)建,有效地彌補(bǔ)了深圳市在海洋生物基因組學(xué)領(lǐng)域研究載體存在的短板。2016年4月正式成立“深圳市華大海洋研究院”。從此,華大海洋有了自己專門的科技研發(fā)機(jī)構(gòu),開始大力發(fā)展海洋與水生生物種質(zhì)資源收集、信息分析與開發(fā)利用等基礎(chǔ)科研工作。

    與此同時,華大海洋整合資源,發(fā)揮平臺優(yōu)勢,建立了海洋生物活體庫、長江流域種質(zhì)資源庫以及集活體展示中心、數(shù)據(jù)存儲中心、樣本保存中心于一體的水產(chǎn)大數(shù)據(jù)中心。據(jù)華大海洋董事長徐軍民介紹,建設(shè)海洋基因庫和水生生物基因庫,填補(bǔ)了國內(nèi)該領(lǐng)域的空白,不僅有利于保護(hù)海洋水生生物資源,搭建水生生物大數(shù)據(jù)平臺,而且更有利于實(shí)現(xiàn)基因及數(shù)據(jù)資源的共享利用。這對推動生命科學(xué)和生物產(chǎn)業(yè)的迅速發(fā)展,搶占未來生物經(jīng)濟(jì)的戰(zhàn)略制高點(diǎn)、掌控生物基因戰(zhàn)略資源,都具有極其重要的意義。

    為解決既往經(jīng)臍單孔腹腔鏡手術(shù)需要特制手術(shù)器械的問題,我們采用了改良的自制式臍部固定器,不需要準(zhǔn)備特殊的腹腔鏡手術(shù)器械,不增加手術(shù)費(fèi)用,簡便易行,更加適宜在基層醫(yī)院推廣。本研究旨在探討改良式經(jīng)臍單孔腹腔鏡手術(shù)在婦科領(lǐng)域中的應(yīng)用價值。

    歷時九年的沉淀與積累,華大海洋已經(jīng)成長為一家產(chǎn)、學(xué)、研、用一體化綜合發(fā)展的科技型集團(tuán)公司,不僅在水生生物基因研究方面碩果累累,在海洋生物資源高端開發(fā)利用方面也居于全國領(lǐng)先地位。

    深圳市五一勞動獎狀

    目前全球已發(fā)表的120余種重要魚類基因組文章中,華大海洋就占1/6以上,有力支撐著我國水生生物基因組學(xué)在國際上的領(lǐng)先地位。華大海洋在國內(nèi)參與并完成的70多種重要經(jīng)濟(jì)水產(chǎn)動物的基因組測序與分析工作,占到全國總量的1/3,共發(fā)表學(xué)術(shù)論文130余篇,其中SCI論文110篇,2篇收錄為ESI高被引論文;出版了11部水產(chǎn)基因組學(xué)系列專著(其中4部為研究生教材)。作為國家高新技術(shù)企業(yè),華大海洋已申請國家專利200余項(xiàng),授權(quán)80余項(xiàng)(其中近40項(xiàng)為歐美PCT專利);獲得發(fā)明專利10余項(xiàng),主持制定深圳市技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)2項(xiàng)、企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)3項(xiàng)、團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)2項(xiàng)。

    華大海洋不僅在創(chuàng)新研究與產(chǎn)業(yè)發(fā)展中成績斐然,而且得到了政府主管機(jī)構(gòu)與社會各界的認(rèn)可,并先后榮獲多個獎項(xiàng)。2016年,華大海洋被評定為“國家高新技術(shù)企業(yè)”;2017年榮獲該年度廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣一等獎;2018年榮獲“中國水產(chǎn)技術(shù)創(chuàng)新企業(yè)”獎;此外,還榮獲深圳市重點(diǎn)農(nóng)業(yè)龍頭企業(yè)和知名品牌、大鵬新區(qū)十佳科技創(chuàng)新單位、大鵬伯樂榮譽(yù)獎、“沃爾瑪中國2019年度鮮食部最佳成長供應(yīng)商”等榮譽(yù)。2021年3月,華大海洋作為為數(shù)不多的海洋生物領(lǐng)域經(jīng)營企業(yè)代表,成功入選深圳全球海洋中心城市建設(shè)促進(jìn)會并成為副會長單位。2021年5月,華大海洋又相繼獲得“深圳市五一勞動獎狀”及第十五屆、第十八屆“深圳知名品牌”。

    種源經(jīng)濟(jì)為藍(lán)色發(fā)展聚勢賦能

    神秘莫測的大海就像一個蔚藍(lán)色的寶庫,蘊(yùn)含著富饒的資源。在海洋中,有許多生物,其中魚類是物種最豐富且進(jìn)化較為古老的脊椎動物類群,目前全球已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的魚類至少超過3萬多種。

    華大海洋通過創(chuàng)新研究,應(yīng)用高通量基因組學(xué)測序手段與生物信息分析技術(shù),開展了水生動物的遺傳機(jī)制及基因組進(jìn)化研究,特別在彈涂魚的兩棲習(xí)性、金線鲃的洞穴適應(yīng)性、海馬的鰭條發(fā)育等方面,取得了系統(tǒng)性、創(chuàng)新性、引領(lǐng)性且具有高水平的一系列成果。其中,2014年在Nature子刊上發(fā)表全球首個兩棲魚類——彈涂魚基因組學(xué)論文。該成果中,華大海洋系統(tǒng)地研究四種兩棲彈涂魚的功能基因組,首次系統(tǒng)性闡明了彈涂魚陸生適應(yīng)的多種分子機(jī)制,為解析脊椎動物從水生向陸生過渡的進(jìn)化機(jī)制提供了重要參考信息,并以此打造了深圳紅樹林特色的彈涂魚“生態(tài)名片”。不僅在國際上打出深圳市的“生態(tài)名片”,還通過市城管局資助經(jīng)費(fèi)在深圳灣放流大彈涂魚,為改善生態(tài)環(huán)境、帶動旅游經(jīng)濟(jì)作出示范性貢獻(xiàn)。

    2018年5月,由深圳市華大海洋研究院和深圳國家基因庫聯(lián)合發(fā)起的“千種魚類轉(zhuǎn)錄組”項(xiàng)目,正式宣布構(gòu)建了迄今為止最可靠的魚類系統(tǒng)演化樹。該項(xiàng)目通過大數(shù)據(jù)整合了144種魚類基因組數(shù)據(jù)和159種魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用新的生物信息學(xué)分析方法,篩選出1105個直系同源的外顯子序列作為分子標(biāo)記,是目前覆蓋度最廣、最可靠的魚類“生命之樹”。這棵魚類“生命之樹”解答了一直以來魚類起源和進(jìn)化研究中存在的許多爭論和難題,這也是魚類演化研究史上的里程碑式事件。

    2021年8月,華大海洋在國際知名期刊Genomics發(fā)表全球首個基于全基因組測序和組裝的巴沙魚染色體水平基因組,揭示了與巴沙魚多脂肪性狀相關(guān)的組學(xué)證據(jù)。為做好巴沙魚種質(zhì)資源保護(hù)及選育保種,華大海洋科研團(tuán)隊(duì)趕赴老撾,在湄公河上游開展相關(guān)研究工作,因?yàn)檫@個地區(qū)的巴沙魚資源保護(hù)得尚好,沒有發(fā)生種質(zhì)退化,可以更大程度地發(fā)揮巴沙魚的遺傳性狀優(yōu)勢。

    在做水生生物種源研究過程中,華大海洋發(fā)現(xiàn)行業(yè)早期經(jīng)歷的一些品種藥殘問題,根源和癥結(jié)之一就是水生物種種質(zhì)的退化。因?yàn)榉N質(zhì)退化易生病,所以導(dǎo)致養(yǎng)殖環(huán)節(jié)無規(guī)范用藥。當(dāng)然,還有一些不規(guī)范的養(yǎng)殖作業(yè)方式和非常傳統(tǒng)粗放的養(yǎng)殖模式。為此,要想實(shí)現(xiàn)水產(chǎn)行業(yè)的產(chǎn)業(yè)升級與綠色發(fā)展,華大海洋針對水產(chǎn)養(yǎng)殖、市場流通等領(lǐng)域的一系列問題,也做了長遠(yuǎn)布局和規(guī)劃。

    以種為源,華大海洋積極開展水生生物種業(yè)自主創(chuàng)新工作,在水生生物的基因組學(xué)研究基礎(chǔ)上對重要的水生經(jīng)濟(jì)動物進(jìn)行創(chuàng)新育種與示范養(yǎng)殖,搭建了從種業(yè)到餐桌的全產(chǎn)業(yè)鏈生態(tài)平臺,為消費(fèi)者提供真正安全健康的優(yōu)質(zhì)蛋白產(chǎn)品。

    華大海洋以科研為基礎(chǔ)、產(chǎn)業(yè)為主導(dǎo)、基地為依托、產(chǎn)學(xué)研相結(jié)合,打造“育繁推養(yǎng)護(hù)一體化”的海洋種業(yè)創(chuàng)新體系,建設(shè)了江蘇省鎮(zhèn)江華優(yōu)基地、鎮(zhèn)江科華基地、海南基地及老撾基地。其中,華優(yōu)基地依托華大海洋分子育種技術(shù)和江蘇省淡水水產(chǎn)研究所的蟹、蝦繁育技術(shù),通過親本基因重組測序、同胞家系選育、苗種專池培育等方式,培育出了規(guī)格大、生長快、品質(zhì)優(yōu)的蟹、蝦新品種,同時深入開展稻田綜合種養(yǎng)技術(shù)的研究,總結(jié)出適合江蘇地區(qū)的高效稻田綜合模式。該品種推廣面積超過220萬畝,創(chuàng)造200億元經(jīng)濟(jì)產(chǎn)值,為江蘇(無錫、蘇州、南京、常州、興華)、云南(昆明、曲靖)等地全面脫貧做出了突出貢獻(xiàn)。2017年,華優(yōu)基地培育的中華絨螯蟹榮獲“中國好蟹”榮譽(yù)稱號。此外, “鲃優(yōu)1號”金線鲃和“太湖2號”青蝦,這兩個新品種在2018年獲得農(nóng)業(yè)農(nóng)村部認(rèn)定,在深圳尚屬首次,為進(jìn)一步的分子育種研發(fā)提供了指導(dǎo)性支撐。2021年9月,華大海洋與中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心聯(lián)合育種成功的水產(chǎn)新品種“建鯉2號”,通過了全國水產(chǎn)原種和良種審定委員會審定。

    另外,在石斑魚、卵形鯧鲹、斑點(diǎn)叉尾鮰、南美白對蝦、青蝦和加州鱸等水產(chǎn)動物的分子標(biāo)記輔助育種和基因組選擇育種方面,也都取得了豐碩成果。如今,基因組選擇育種技術(shù)已經(jīng)成為華大海洋推進(jìn)“海上一帶一路”的重要武器。

    探秘藍(lán)色基因,開啟藍(lán)色藥庫大門

    占地球總面積高達(dá)70%的海洋,孕育了50萬余種動物和13000種植物。其中,動物界28個主要動物門有26個都生活在海洋水域。在高鹽、高壓、缺氧及少光照的環(huán)境下,海洋生物進(jìn)化形成獨(dú)特的基因,具有比陸生動植物更奇特的結(jié)構(gòu)及更顯著的活性。開發(fā)“藍(lán)色藥庫”已成為現(xiàn)今世界醫(yī)藥工業(yè)發(fā)展的重要方向。

    如今,海洋生物資源價值日益凸顯,在“海洋強(qiáng)國”戰(zhàn)略及“藍(lán)色藥庫”計(jì)劃的提出下,華大海洋同時布局海洋功能制品及海洋創(chuàng)新藥的研發(fā)。截至目前,全球共有49個來自海洋的活性物質(zhì)或其衍生物被批準(zhǔn)上市或進(jìn)入臨床,其中基于海洋天然產(chǎn)物或其衍生物開發(fā)而成功上市的藥物僅有17款,但由我國自主研發(fā)的海洋創(chuàng)新藥物僅占其中4款。面對國內(nèi)外海洋藥物研發(fā)的巨大差距,華大海洋著力于海洋藥物的創(chuàng)新研發(fā),集中國內(nèi)外優(yōu)勢科研力量,全力打造全新生物制藥生態(tài)產(chǎn)業(yè)鏈,突破了傳統(tǒng)多肽藥物因測序技術(shù)的限制僅能關(guān)注少數(shù)藥物分子及單一尺度的獨(dú)立研究不利于基礎(chǔ)研究成果向產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用轉(zhuǎn)化的困局,為我國生物醫(yī)藥企業(yè)開辟了新的道路。

    中國南海常見的20種芋螺

    2018年,華大海洋主持出版《海洋芋螺資源圖鑒》,對全球芋螺(超過700種中的343種)及芋螺毒素進(jìn)行總結(jié)性介紹。2021年2月,華大海洋聯(lián)合海南醫(yī)學(xué)院和解放軍軍事科學(xué)院防化研究院,成功破譯了全球首個芋螺(桶形芋螺Conus betulinus)的全基因組序列,揭示了芋螺毒素表達(dá)的中心法則。首次闡明了“芋螺毒素基因→毒素轉(zhuǎn)錄本→毒素蛋白→翻譯后修飾毒素肽”的最重要、最基本的生物學(xué)規(guī)律,在探索芋螺毒素的本質(zhì)及普遍規(guī)律方面起到了巨大的作用,奠定了芋螺毒素研究的理論基石,是芋螺及芋螺毒素研究領(lǐng)域的重要突破性進(jìn)展,相關(guān)成果發(fā)表于Nature子刊Cell Discovery。

    目前,華大海洋與海南醫(yī)學(xué)院、解放軍防化研究院合作,已完成多種芋螺的轉(zhuǎn)錄組測序、線粒體基因組測序與毒素挖掘工作,篩選到具有殺蟲活性的6條毒素肽,正在研發(fā)具有高度戒毒活性的毒素肽序列,或?qū)闊煱a、毒癮、嗜酒等神經(jīng)性上癮行為帶來突破性治療方案。

    更為重要的是,目前華大海洋已有一款新型免疫增強(qiáng)型海洋小分子藥物進(jìn)入系統(tǒng)臨床前研究,這是一款基于對海洋真菌天然產(chǎn)物進(jìn)行化學(xué)修飾的1.1類新藥,與現(xiàn)有的臨床使用的大分子生物藥相比,副作用更小,療效更佳且成本更低。如果能成功上市,將為腫瘤患者提供新的治療手段,為生命帶來新的希望。

    自成立以來,華大海洋已經(jīng)積累了大量有關(guān)海洋生物遺傳信息與生物活性的開發(fā)利用大數(shù)據(jù)。與此同時,華大海洋也建立了不同階段、不同深度的海洋生物樣本庫,并打造了海洋生物醫(yī)藥與功能制品研發(fā)及轉(zhuǎn)化平臺體系,開展了桶形芋螺、???、海馬、雨生紅球藻等80多種水生生物的基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組或蛋白組學(xué)研究,獲得了大量的毒素基因、毒素肽序列、抗菌肽、代謝物生物合成關(guān)鍵基因等一系列活性物質(zhì)數(shù)據(jù)。利用基因改造進(jìn)行生物合成的探索,為解決藥源瓶頸提供了新的方案,為海洋藥物的開發(fā)利用提供了深厚的科研基礎(chǔ)。

    隨著我國對海洋的認(rèn)識不斷加深,對海洋戰(zhàn)略意義的更加重視,海洋經(jīng)濟(jì)已經(jīng)成為國家戰(zhàn)略層面的重要一環(huán)。

    華大海洋作為海洋生物領(lǐng)域的企業(yè)代表,立足于獨(dú)特的基因技術(shù)及生物科技技術(shù)的資源優(yōu)勢,不斷在水生生物領(lǐng)域探索,目的是從根源上保護(hù)水生生物,從而在此基礎(chǔ)上培育出更為優(yōu)質(zhì)的品種。在發(fā)展中保護(hù)、在保護(hù)中發(fā)展!作為中國野生動物保護(hù)協(xié)會水生野生動物保護(hù)分會副會長單位,華大海洋長期關(guān)注生物多樣性保護(hù)工作,充分利用自身在水生生物基因組和基因組選擇育種方面的科研能力,為水生野生動物保護(hù)提供數(shù)據(jù)與科技支撐。這也與2021年10月我國剛剛發(fā)布的《中國的生物多樣性保護(hù)》白皮書提出的戰(zhàn)略思想不謀而合。

    除了關(guān)注水生生物領(lǐng)域外,華大海洋也一直在關(guān)注人類的健康。徐軍民說:“整個水生生物行業(yè),應(yīng)該說是彰顯國民健康的重要方面。‘少年強(qiáng)則國強(qiáng)’,從這個意義上來說,國民健康也是國家健康的一種體現(xiàn)。”從最初愿景為改善人類蛋白質(zhì)飲食結(jié)構(gòu),讓國民能擁有更健康的生活,拓展至疾病預(yù)防和藥物治療上,華大海洋將以海洋藥物為突破口,帶動種源經(jīng)濟(jì)發(fā)展,實(shí)現(xiàn)種源、藥源聯(lián)動,做出真正的成果,為人類健康發(fā)展奠定基礎(chǔ),助推我國海洋生物經(jīng)濟(jì)的可持續(xù)發(fā)展。

    回顧過去,在國家和深圳海洋經(jīng)濟(jì)產(chǎn)業(yè)格局不平衡的情況下,華大海洋創(chuàng)造了很多的“從無到有”,以“基因科技助力海洋生物經(jīng)濟(jì)發(fā)展”為使命,迅速成長為水生生物基因科研領(lǐng)域的翹楚。展望未來,華大海洋的發(fā)展不僅有利于我國海洋產(chǎn)業(yè)的升級和優(yōu)化,而且有利于未來人類的健康發(fā)展。海洋經(jīng)濟(jì)的發(fā)展是國之所需,民之所向。機(jī)遇在握,華大海洋也必將走向更為燦爛和光明的未來。

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