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    間充質(zhì)干細(xì)胞深低溫保藏技術(shù)體系的建立與初步分析

    2021-12-06 03:02:18朱志浩高家明沈君顏祝建波劉海亮
    關(guān)鍵詞:成骨干細(xì)胞誘導(dǎo)

    朱志浩,高家明,沈君顏,祝建波,劉海亮,*

    (1 新疆植物藥資源利用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,新疆 石河子 832003; 2 同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院/附屬東方醫(yī)院再生醫(yī)學(xué)研究所,上海 200123)

    間充質(zhì)干細(xì)胞的組織來(lái)源骨髓基質(zhì)細(xì)胞最初在骨髓基質(zhì)中被發(fā)現(xiàn)后,間充質(zhì)干細(xì)胞已經(jīng)從幾個(gè)成人和胎兒組織中分離和鑒定,包括脂肪,真皮(皮膚),滑膜液,骨膜,臍帶血,胎盤(pán)和羊水。脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞的發(fā)現(xiàn)給生命科學(xué)帶來(lái)劃時(shí)代的改變,充分利用脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞的分化潛能在臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用,治愈重大疾病,如腦血栓、心肌梗死、糖尿病等。它可以分化成這些壞死的細(xì)胞,進(jìn)入這些器官,行使和死亡細(xì)胞一樣的功能,徹底治愈這類(lèi)疾[1-4]。并且它也可以分化成這些器官的年輕細(xì)胞,替代器官內(nèi)衰老的細(xì)胞,將分化后的年輕細(xì)胞植入該器官并成活后,進(jìn)而替代功能衰竭或者損毀的器官,如腎損傷,肝壞死,心臟的衰竭,從而延緩衰老。

    干細(xì)胞凍存是研究干細(xì)胞生物學(xué)功能的重要方法之一,凍存劑的選擇起到了關(guān)鍵性的作用。目前細(xì)胞凍存劑主要有兩種類(lèi)型:一種是滲透性保護(hù)劑包括:甘油、二甲基亞砜(DMSO)、乙二醇(EG)、丙二醇(PG)、甘油(GLY)。其原理屬低分子中性物質(zhì),易與溶液中水分子結(jié)合,易于穿透細(xì)胞;另一種是非滲透性保護(hù)劑:聚乙烯吡咯烷酮(PVP),蔗糖、聚乙二醇、葡聚糖、白蛋白等。其原理屬大分子物質(zhì),不能穿透細(xì)胞;在冰晶形成之前,優(yōu)先結(jié)合溶液中水分子;降低細(xì)胞外溶液的電解質(zhì)濃度,減少陽(yáng)離子進(jìn)入細(xì)胞的數(shù)量。已有較多研究對(duì)多種凍存劑進(jìn)行了分析,雖然DMSO在毒性方面要大于EG,PG,GLY,但是其凍存效果仍然較好。DMSO與PVP凍存效果相似。近年來(lái),相對(duì)于傳統(tǒng)的凍存劑(DMSO,GLY,Tre),左旋肉堿(L-carnitine)、海藻糖(Trehalose)也顯示出比較好的凍存效果,在細(xì)胞毒性方面,也顯示出較大的優(yōu)勢(shì)[5-8]。

    目前,在干細(xì)胞廣泛研究和應(yīng)用的基礎(chǔ)上,建立臨床級(jí)間充質(zhì)干細(xì)胞標(biāo)準(zhǔn)制備工藝技術(shù)和干細(xì)胞庫(kù)就顯得尤為重要。臨床級(jí)干細(xì)胞,就再生醫(yī)學(xué)而言,可以隨時(shí)投入臨床使用的干細(xì)胞,即可用于人類(lèi)的臨床研究,制備標(biāo)準(zhǔn)嚴(yán)格,具有“臨床級(jí)”質(zhì)量,不需要昂貴而又危險(xiǎn)的轉(zhuǎn)換過(guò)程。臨床級(jí)干細(xì)胞的提供途徑消除了基于細(xì)胞的療法發(fā)展的重大障礙,而且臨床級(jí)干細(xì)胞的分離與擴(kuò)增是干細(xì)胞產(chǎn)業(yè)化過(guò)程中的重要環(huán)節(jié)。標(biāo)準(zhǔn)化,產(chǎn)業(yè)化的干細(xì)胞生產(chǎn),這意味著每批細(xì)胞都符合臨床使用所需的質(zhì)量和安全標(biāo)準(zhǔn)。標(biāo)準(zhǔn)化能更快地為患者提供救生療法[9-12]。因此,開(kāi)發(fā)標(biāo)準(zhǔn)性干細(xì)胞分離純化和保藏的新技術(shù)是進(jìn)一步推動(dòng)干細(xì)胞臨床應(yīng)用的必然趨勢(shì)。從而更能實(shí)現(xiàn)干細(xì)胞治療產(chǎn)品生產(chǎn)的標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)?;\(yùn)行,質(zhì)量達(dá)到臨床應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)。經(jīng)過(guò)綜合分析,本研究重點(diǎn)分析DMSO、 L-carnitine和Trehalose這3種凍存劑凍存脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞的效果與能力。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    DMEM/F12(Thermo),NEAA (non-essential amino acids),胎牛血清(FBS),0.25% 胰蛋白酶-EDTA(Sigma公司),海藻糖(上海國(guó)藥),肉毒堿(美國(guó)AMRESCO公司),地塞米松(Sigma公司),維生素C(Sigma 公司),硫代甘油(Sigma 公司),成骨誘導(dǎo)分化培養(yǎng)基(CYAGEN),CCK-8試劑,油紅O染液,脂肪干細(xì)胞,神經(jīng)干細(xì)胞,293細(xì)胞。

    細(xì)胞培養(yǎng)箱(Heraeus),超凈工作臺(tái)(Forma Scientific Inc),倒置顯微鏡(OLYMPUS公司),光學(xué)顯微鏡(OLYMPUS公司),低溫離心機(jī)(Heraeus儀器公司),-80 ℃冰箱(Forma Scientific 公司),液氮罐,流式細(xì)胞儀(美國(guó)Beckmen Coulter 公司),酶標(biāo)儀。細(xì)胞培養(yǎng)瓶(美國(guó)Corning):T25,T75;細(xì)胞培養(yǎng)板(美國(guó) Corning):6,12,24孔;細(xì)胞培養(yǎng)皿:10 cm2;移液管(美國(guó)Forma):5 mL,10 mL;離心管:15 mL;凍存管:1.8 mL;酶標(biāo)板:平底96孔透明酶標(biāo)板。

    1.2 細(xì)胞凍存

    配制各種細(xì)胞凍存液。取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞,去除舊培養(yǎng)基,用PBS清洗。去除PBS,加入適量胰蛋白酶(覆蓋培養(yǎng)皿表面)把單層生長(zhǎng)的細(xì)胞消化下來(lái)。1 500 r·min-1,離心5 min。去除胰蛋白酶,加入適量配制好的凍存培養(yǎng)液,用吸管輕輕吹打混勻,計(jì)數(shù),調(diào)節(jié)凍存液中細(xì)胞的最終密度[13-15]。一般為5×106或1×107個(gè)·mL-1。將細(xì)胞分裝于凍存管中,每管1 mL。在凍存管管中標(biāo)明細(xì)胞的名稱(chēng),凍存時(shí)間及操作者。也可將凍存管放入4 ℃,2h,-80 ℃,過(guò)夜,放入液氮中。

    1.3 細(xì)胞復(fù)蘇

    從液氮容器中取出凍存管,直接浸入37 ℃溫水中,并不時(shí)搖動(dòng)令其盡快融化。從37 ℃水浴鍋中取出凍存管,打開(kāi)蓋子,用吸管吸出細(xì)胞懸液,加到離心管并滴加10倍以上培養(yǎng)液,混勻。離心,1 500 r·min-1,離心5 min。棄去上清,加入新鮮培養(yǎng)液重懸細(xì)胞,計(jì)數(shù),調(diào)整細(xì)胞密度,接種于培養(yǎng)瓶中,37 ℃培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)。

    1.4 間充質(zhì)干細(xì)胞活性檢測(cè)

    細(xì)胞活力測(cè)定,對(duì)凍存1、3、7 d的ADSC,在復(fù)蘇后24 h和48 h進(jìn)行細(xì)胞活性檢測(cè),分析不同凍存劑凍存時(shí)間長(zhǎng)短和復(fù)蘇后不同時(shí)間的細(xì)胞活性。CCK-8檢測(cè)步驟。向各孔中加入100 μL細(xì)胞懸液,向各孔中加入各濃度的待測(cè)溶液10 μL,在37 ℃下孵育培養(yǎng)板。向各孔中加入10 μL的CCK-8溶液,37 ℃孵育1~4 h,測(cè)定450 nm處的OD值。

    1.5 細(xì)胞周期檢測(cè)

    收集復(fù)蘇后的特定傳代ADSC細(xì)胞,細(xì)胞個(gè)數(shù)為1×106個(gè)。離心棄上清,加入300 μL預(yù)冷的PBS制成單細(xì)胞懸液。加入700 μL預(yù)冷的無(wú)水乙醇固定,-20 ℃放置待測(cè)。上機(jī)檢測(cè)前加入PBS稀釋細(xì)胞,離心棄上清,加入終濃度500 μg·mL-1的。RnaseA置于37 ℃孵育30 min。加入終濃度50 μg/mL的碘化丙啶,4 ℃避光孵育30 min。流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞DNA含量,軟件分析。

    1.6 成骨誘導(dǎo)

    取特定代次生長(zhǎng)良好的ADSC細(xì)胞,胰酶消化,1×105個(gè)·mL-1的濃度接種于6孔板,用完全培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h后,更換成骨誘導(dǎo)培養(yǎng)基。每3天換一次液,以未加誘導(dǎo)培養(yǎng)基的細(xì)胞培養(yǎng)孔作空白對(duì)照,共誘導(dǎo)培養(yǎng)基28 d。誘導(dǎo)期間用倒置顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)的變化,并拍照記錄。取成骨誘導(dǎo)培養(yǎng)基誘導(dǎo)14 d和28 d后的細(xì)胞進(jìn)行茜素紅染色。

    1.7 RNA提取及RNA-seq分析

    使用TRIzol(Invitrogen,Carlsbad,CA,USA)從凍存前和凍存后的ADSC細(xì)胞中提取總RNA,并用NanoDrop 1000(Thermo Fisher Scientific)進(jìn)行定量。將符合質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)(260/280 nm> 1.8)的樣品進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。測(cè)序數(shù)據(jù)分析均基于高質(zhì)量的數(shù)據(jù),使用Bowtie v2.0.6(bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2)軟件構(gòu)建參考基因組的索引,并使用TopHat v2.0.9(ccb.jhu.edu/software/tophat)軟件將配對(duì)末端的干凈讀數(shù)與參考基因組對(duì)齊?;诨蜷L(zhǎng)度和映射到該基因的讀數(shù)計(jì)數(shù),并考慮測(cè)序深度和基因長(zhǎng)度對(duì)讀數(shù)計(jì)數(shù)的影響,計(jì)算出每千個(gè)轉(zhuǎn)錄本的讀數(shù),每個(gè)基因的百萬(wàn)個(gè)圖譜讀數(shù)(RPKM)。差異基因通過(guò)權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)計(jì)算,畫(huà)圖[16-18]。

    1.8 統(tǒng)計(jì)分析

    通過(guò)單因素方差分析確定,*表示P<0.05,**表示P<0.01,***表示P<0.001。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 細(xì)胞活性檢測(cè)

    本實(shí)驗(yàn)采用3種凍存劑,六組實(shí)驗(yàn);1號(hào),5% DMSO+10% FBS;2號(hào),5% DMSO;3號(hào),5% Trehalose+10%FBS;4號(hào),5% Trehalose;5號(hào),5% L-carnitine+10% FBS;6號(hào),5% L-carnitine;分別凍存ADSC,實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),4號(hào)和6號(hào)凍存ADSC后,細(xì)胞死亡率很大,無(wú)法進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn),因此后續(xù)實(shí)驗(yàn)只對(duì)1號(hào),2號(hào),3號(hào)和5號(hào)進(jìn)行。在ADSC凍存1、3、7 d后復(fù)蘇。培養(yǎng)24 h后,檢測(cè)細(xì)胞活性。

    結(jié)果如圖1所示:1號(hào)實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞活性最高,在凍存1、3、7 d復(fù)蘇后,其均值分別為0.413 3、0.265 5和0.218 4,隨著凍存時(shí)間的增加呈現(xiàn)出逐漸下降趨勢(shì);2號(hào)實(shí)驗(yàn)組在凍存1、3、7 d復(fù)蘇后其細(xì)胞活性均值分別為0.152 9、0.201 6和0.283 1,并隨時(shí)間表現(xiàn)出逐漸上升的趨勢(shì);在3號(hào)實(shí)驗(yàn)組中,細(xì)胞凍存1 d和3 d后細(xì)胞活性并沒(méi)有表現(xiàn)出很大差別,而在凍存7 d復(fù)蘇后細(xì)胞活性略有上升;5號(hào)實(shí)驗(yàn)組中,細(xì)胞活性雖時(shí)間表現(xiàn)出先上升后下降的趨勢(shì),在凍存1 d復(fù)蘇后,其細(xì)胞活性為0.153 9,凍存3 d復(fù)蘇后,細(xì)胞活性為0.167 7,凍存7 d后為0.148 7。

    總體變化不大。復(fù)蘇后培養(yǎng)48 h細(xì)胞活性與24 h具有相似的特點(diǎn)(圖1)。

    以上結(jié)果表明,1號(hào)實(shí)驗(yàn)組在細(xì)胞凍存復(fù)蘇24 h后具有最高活性,說(shuō)明1號(hào)實(shí)驗(yàn)組為該實(shí)驗(yàn)條件下的最佳凍存劑組合。與1號(hào)實(shí)驗(yàn)組相比,2號(hào)實(shí)驗(yàn)組ADSC細(xì)胞在凍存1 d和3 d,復(fù)蘇后其活性顯著的低于1號(hào)實(shí)驗(yàn)組。當(dāng)凍存時(shí)間延長(zhǎng)至7 d時(shí),2號(hào)實(shí)驗(yàn)組的細(xì)胞活性顯著上升且明顯高于1號(hào)實(shí)驗(yàn)組,這一現(xiàn)象表明在進(jìn)行長(zhǎng)時(shí)間的凍存時(shí),F(xiàn)BS可能會(huì)對(duì)細(xì)胞活性產(chǎn)生一定的影響。

    從實(shí)驗(yàn)結(jié)果中不難發(fā)現(xiàn),在細(xì)胞凍存過(guò)程中,F(xiàn)BS在對(duì)細(xì)胞活性的保護(hù)中起到了關(guān)鍵性作用。FBS是細(xì)胞培養(yǎng)中用量最大的天然培養(yǎng)基,含有豐富的細(xì)胞生長(zhǎng)必須的營(yíng)養(yǎng)成分。提供結(jié)合蛋白,能識(shí)別維生素,脂類(lèi),金屬和其他激素等,能結(jié)合或調(diào)變他們所結(jié)合的物質(zhì)活力。但其具體的影響機(jī)制仍需進(jìn)行進(jìn)一步的探究。

    3號(hào)實(shí)驗(yàn)組和5號(hào)實(shí)驗(yàn)組與1號(hào)實(shí)驗(yàn)組相比,其細(xì)胞活性要明顯低于1號(hào)實(shí)驗(yàn)組。這一實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,DMSO在細(xì)胞凍存過(guò)程中對(duì)細(xì)胞活性的影響要略低于Trehalos和L-carnitine,DMSO更適合作為ADSC細(xì)胞凍存劑在實(shí)驗(yàn)中使用。綜上,5%DMSO+10%FBS為當(dāng)前實(shí)驗(yàn)條件下最適的凍存劑組合。在同樣的低溫,DMSO條件下,F(xiàn)BS對(duì)維持ADSC存活起到了關(guān)鍵性作用。

    2.2 細(xì)胞周期檢測(cè)

    當(dāng)凍存劑組合1號(hào)為5% DMSO+10% FBS時(shí),對(duì)凍存1、3、7 d后復(fù)蘇的ADSC進(jìn)行流式細(xì)胞分析,結(jié)果如圖2所示,G1期細(xì)胞所占比例由凍存1 d的79.85%,到3 d的 75.74%,再到7 d的89.88%。G1含量呈現(xiàn)先下降后上升的趨勢(shì)。

    S期,1 d,11.15%,3 d,17.24%,7 d,3.35%。隨凍存天數(shù)的增加,S期總體呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì)。當(dāng)凍存劑為2號(hào)5% DMSO時(shí),對(duì)凍存1、3、及7 d后復(fù)蘇的ADSC進(jìn)行流式細(xì)胞分析,結(jié)果如圖2所示,G1期細(xì)胞所占比例,1 d,65.78%,3 d,66. 15%,7 d,89.94%。G1期細(xì)胞所占比例,隨凍存天數(shù)增加,呈上升趨勢(shì)。S期細(xì)胞所占比例,1 d,27.38%,3 d,26.34%,7 d,2.9%,S期含量呈下降。

    以上結(jié)果表明,DMSO試劑對(duì)細(xì)胞有保護(hù)作用,低溫抑制細(xì)胞的生長(zhǎng)與分化。綜上,1號(hào)實(shí)驗(yàn)組與2號(hào)實(shí)驗(yàn)組相比,尤其是凍存1 d和3d后,S期,1號(hào)數(shù)據(jù)小于2號(hào)。分別為10.58%和18.87%。

    說(shuō)明在有FBS情況下,凍存1~3 d,確實(shí)影響了ADSC細(xì)胞的增值效率。但是凍存7 d后,幾乎沒(méi)有差別。

    圖2 不同凍存劑凍存ADSC 1、3、 7 d復(fù)蘇后細(xì)胞周期檢測(cè)

    當(dāng)凍存劑為5% Trehalos+10% FBS,對(duì)凍存1、3、7 d后復(fù)蘇的ADSC進(jìn)行流式分析(圖3)。在凍存1、3、7 d后,G1含量分別為80.73%,85.58%,93.15%。隨凍存天數(shù)的增加,G1含量總體呈上升趨勢(shì)。在凍存1、3、7 d后,S期含量分別為9.93%,11.85%,2.17%。隨凍存天數(shù)的增加,S期含量呈現(xiàn)先上升后下降趨勢(shì)。當(dāng)凍存劑為5% L-carnitine+10% FBS時(shí)。凍存1、3、7 d后復(fù)蘇,流式細(xì)胞分析結(jié)果見(jiàn)圖4。凍存1、3、7 d后,G1含量分別為91.55%,78.54%,88.57%。隨凍存天數(shù)的增加,G1含量總體呈下降趨勢(shì)(圖4)。在凍存1、3、7 d后,S期含量分別為5.09%,17.74%,3%。隨凍存天數(shù)的增加,S期含量呈現(xiàn)先上升后下降趨勢(shì)。

    從細(xì)胞周期來(lái)看,短期(1 d~3 d凍存),不同凍存劑確實(shí)可以引起細(xì)胞周期的改變,尤其是對(duì)于細(xì)胞增殖來(lái)說(shuō),但是如果凍存時(shí)間較長(zhǎng)(如7 d)就會(huì)大大縮小這個(gè)差距,凍存劑之間差別不明顯。并且我們可以看到,凍存劑中包含F(xiàn)BS一定程度上會(huì)影響ADSC的增殖(圖2)。

    2.3 成骨誘導(dǎo)分析

    為了進(jìn)一步驗(yàn)證凍存是否會(huì)對(duì)ADSC的分化潛能有影響,我們進(jìn)一步選擇1號(hào)和2號(hào)凍存劑進(jìn)行ADSC成骨分化,分別凍存1 d和5d后復(fù)蘇進(jìn)行成骨誘導(dǎo)。

    從誘導(dǎo)的顏色來(lái)看,紅色較深,誘導(dǎo)成骨效果較好。1號(hào)凍存劑,凍存1 d后,復(fù)蘇細(xì)胞誘導(dǎo)成骨細(xì)胞較多,出現(xiàn)大量紅色聚集斑塊。凍存5 d后,誘導(dǎo)成骨細(xì)胞也較多,兩者效果差別不明顯(圖3A、3B)。而使用2號(hào)凍存劑,可以明顯看到,不管是凍存1 d還是5 d,成骨分化的效果較1號(hào)凍存劑誘導(dǎo)效果要弱(圖3C、3D)。因此,在同樣的低溫,DMSO條件下,F(xiàn)BS對(duì)維持ADSC的分化潛能起到非常關(guān)鍵的作用。

    A:1號(hào)凍存劑,凍存ADSC 1 d 成骨分化;B:1號(hào)凍存劑, 凍存ADSC 5 d成骨分化;C:2號(hào)凍存劑,凍存ADSC 1 d成骨分化; D:2號(hào)凍存劑,凍存ADSC 5 d成骨分化;成骨分化圖片(50 μm)。圖3 1號(hào)和2號(hào)凍存劑凍存ADSC1d和5 d后復(fù)蘇, 誘導(dǎo)成骨分化檢測(cè)

    2.4 RNA-seq表達(dá)譜分析

    為了驗(yàn)證凍存劑在凍存過(guò)程中對(duì)細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)的影響,我們又選擇以1號(hào)凍存劑:5% DMSO+10% FBS,分別對(duì)凍存前和凍存后的ADSC細(xì)胞進(jìn)行了RNA-seq表達(dá)譜結(jié)合生物信息WGCNA分析,結(jié)果表明,在凍存過(guò)程中,凍存劑的存在會(huì)對(duì)細(xì)胞的整體表達(dá)譜會(huì)產(chǎn)生一定的影響(圖4)。但是這個(gè)影響是因?yàn)閮龃娈a(chǎn)生的還是因?yàn)閮龃鎰┑挠绊懏a(chǎn)生的,還需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

    總之,這在一定程度上說(shuō)明,如果是要通過(guò)表達(dá)譜確定ADSC的相關(guān)參數(shù),一定要選取相同條件的細(xì)胞,更為可靠的最好是復(fù)蘇后培養(yǎng)一段時(shí)間再進(jìn)行檢測(cè)。

    ME:Module Eigengenes (基因簇特征向量矩陣),縱向不同顏色 代表不同的共表達(dá)基因簇。圖4 RNA-seq表達(dá)譜分析1號(hào)凍存劑凍存 ADSC前后基因表達(dá)水平

    2.4.1 樣品間維恩圖分析

    凍存前有811個(gè)特異性表達(dá)基因,而凍存后有590個(gè)特異性表達(dá)基因,兩者共有基因數(shù)目為15 287(圖5)。共有基因數(shù)目遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于凍存前后的特異性基因數(shù)目,說(shuō)明細(xì)胞凍存雖然對(duì)脂肪干細(xì)胞的整體活性具有一定的影響,然而這種影響相對(duì)比較小。

    圖5 樣品間維恩圖分析

    2.4.2 DEG層次聚類(lèi)分析

    根據(jù)各個(gè)樣品基因表達(dá)水平,我們檢測(cè)樣品之間的差異表達(dá)基因(DEG),使用 DEseq2和 PossionDis 方法進(jìn)行差異檢測(cè)。根據(jù)需求,我們對(duì) DEG 進(jìn)行層次聚類(lèi) (圖6)。該圖直觀地反映了差異基因上下調(diào)的聚類(lèi)情況,同時(shí)適用于不同差異方案間DEG差異倍數(shù)的比較。

    X軸代表進(jìn)行聚類(lèi)分析的差異比對(duì),Y軸代表差異基因。 顏色代表log2轉(zhuǎn)換過(guò)的差異倍數(shù), (顏色越紅代表上調(diào)倍數(shù)越大,越藍(lán)代表下調(diào)倍數(shù)越大)。圖6 DEG層次聚類(lèi)熱圖

    2.4.3 差異表達(dá)基因GO功能分析

    通過(guò)GO富集性分析,低溫凍存對(duì)細(xì)胞代謝和調(diào)控影響最大 (圖7)。整體上,細(xì)胞凍存過(guò)程對(duì)脂肪干細(xì)胞的代謝和信號(hào)調(diào)控過(guò)程影響較大。

    X軸代表DEG數(shù)目,Y軸代表GO功能分類(lèi)圖7 差異基因GO功能分類(lèi)圖

    3 討論

    科學(xué)家們開(kāi)始意識(shí)到了許多重大疾病或特殊生物學(xué)現(xiàn)象的發(fā)生機(jī)制都可以從干細(xì)胞角度從新認(rèn)識(shí),這意味著臨床上的許多疾病的防止研究可以從干細(xì)胞的角度進(jìn)行,也意味著一些新的防止方法和手段的產(chǎn)生。本實(shí)驗(yàn)從不同凍存劑凍存應(yīng)用更加廣泛的ADSC細(xì)胞后,對(duì)其細(xì)胞增殖,細(xì)胞周期,成骨分化潛能以及基因表達(dá)譜的研究,從一定角度了解了ADSC細(xì)胞對(duì)于不同凍存劑凍存的反應(yīng),為后面詳細(xì)而細(xì)致的研究奠定了基礎(chǔ)[19-20]。

    細(xì)胞活性檢測(cè)結(jié)果表明:對(duì)照組細(xì)胞在凍存后的復(fù)蘇效果優(yōu)于實(shí)驗(yàn)組,且不同凍存劑之間的凍存效果也存在一定差異。對(duì)照組(5% DMSO+10% FBS)表現(xiàn)出最好的凍存效果,在進(jìn)行液氮凍存1、3、7 d后,其細(xì)胞在復(fù)蘇24 h后的活性分別為0.413、0.267和0.218,復(fù)蘇48 h后的活性分別為0.532、0.366和0.256,均高于2號(hào)(5% DMSO)、3號(hào)(5% T+10% FBS)和5號(hào)(5% L+10% FBS)實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞分別在凍存復(fù)蘇后的活性。細(xì)胞周期檢測(cè)結(jié)果表明:在進(jìn)行凍存復(fù)蘇之后,處于G1期的細(xì)胞所占比例最大,處于G2期的細(xì)胞所占比例最小。在對(duì)處于S期的細(xì)胞進(jìn)行進(jìn)一步分析后發(fā)現(xiàn),在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行短期凍存后(1~3 d),2號(hào)實(shí)驗(yàn)組中處于S期細(xì)胞所占比例最大,分別為27.38%和26.34%,顯著的高于對(duì)照組11.15%和17.24%。當(dāng)凍存時(shí)間延長(zhǎng)至7 d后,對(duì)照組中處于S期的細(xì)胞所占比對(duì)最大,為3.35%,5號(hào)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組效果相似,但略低于對(duì)照組,為3%。

    在培養(yǎng)液中加入誘導(dǎo)液后,會(huì)把間充質(zhì)干細(xì)胞能夠誘導(dǎo)成為成骨細(xì)胞,使用油紅O染液染色,誘導(dǎo)成為成骨細(xì)胞能夠被染成紅色,紅色越深或者越多,表示被誘導(dǎo)的細(xì)胞越多。誘導(dǎo)最多的是凍存劑為5% DMSO+10% FBS下凍存1 d,其次是凍存劑為5% DMSO+10% FBS下凍存5 d,誘導(dǎo)最少的是5% L+10% FBS凍存1 d。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,在經(jīng)過(guò)凍存處理之后,脂肪干細(xì)胞的基因表達(dá)譜發(fā)生變化,說(shuō)明凍存處理確實(shí)會(huì)對(duì)細(xì)胞的基因表達(dá)產(chǎn)生影響。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)檢測(cè)不同凍存劑條件下細(xì)胞復(fù)蘇后的生物學(xué)特性,比較了不同凍存劑對(duì)細(xì)胞活性和細(xì)胞周期的影響,并通過(guò)表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析了5% DMSO+10% FBS凍存劑對(duì)脂肪干細(xì)胞基因表達(dá)的影響,深低溫凍存確實(shí)對(duì)脂肪干細(xì)胞的基因表達(dá)差生了影響。為充分利用干細(xì)胞進(jìn)行生物組織構(gòu)建、細(xì)胞移植以及其他方面的研究奠定了一定的基礎(chǔ)。

    經(jīng)過(guò)整體性分析,1號(hào),5% DMSO+10% FBS,為該實(shí)驗(yàn)的最佳凍存劑組合。本實(shí)驗(yàn)雖然嘗試用其它凍存劑來(lái)代替DMSO,但是在相同濃度下,它們并沒(méi)有表現(xiàn)的比DMSO要好,并不能很好的保護(hù)ADSC細(xì)胞,因此,在本實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)缺少組的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,是因?yàn)閮龃婧螅?xì)胞就已經(jīng)不能存活或者存活百分比較低,不能進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn),后期能否通過(guò)改變濃度或者尋找更安全,更有效的凍存劑還需要驗(yàn)證。

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