廖昕萌,潘煒倫,馮俊杰,李博
(南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院檢驗醫(yī)學科,廣州 510515)
細胞外囊泡(extracellular vesicles, EVs)是活細胞分泌到細胞外的膜性囊泡,依據(jù)粒徑和來源可將其分為:外泌體、微囊泡和凋亡小體[1]。EVs內(nèi)含有多種生物分子,可參與細胞間信息交流,并反映疾病狀況以輔助臨床診斷和治療[2]。EVs廣泛分布于血漿、尿液、腦脊液等各類體液[3],其中血漿標本因具有采集、處理和保存的方法成熟、取材方便、EVs含量豐富(108~1013顆粒/mL)[3]、不同生理和病理條件下EVs數(shù)量及其內(nèi)容物含量差異大等特點,故而血漿EVs在疾病的早期診斷、療效監(jiān)測和預后判斷中具有極大優(yōu)勢,成為了近年來研究的熱點。但血漿EVs的傳統(tǒng)分離方法受到多種血漿成分的干擾,難以實現(xiàn)EVs的高效分離,因此,近年來發(fā)展了許多新型分離方法以應對傳統(tǒng)血漿EVs分離遇到的難題。本文將分析傳統(tǒng)血漿EVs分離和鑒定方法,并重點從新型親和法、微流控法和聯(lián)合應用法3個方面介紹新型分離方法的研究進展,以期為血漿EVs分離方法的發(fā)展提供參考和借鑒。
傳統(tǒng)的血漿EVs分離方法包括超速離心法(ultracentrifuge, UC)、超濾法(ultrafiltration, UF)、沉淀法(precipitation)、色譜法(size exclusion chromatography, SEC)和免疫親和法(immunoaffinity)等(表1)。由于受到血漿中多種復雜成分的干擾,使用傳統(tǒng)方法分離血漿EVs存在分離效率低、純度低、特異性低、EVs受損變性或生物活性低等缺陷,因此,分離后常需使用多種鑒定方法從不同維度驗證分離產(chǎn)物(表2)。
表1 常用的傳統(tǒng)血漿EVs分離方法
表2 常用的血漿EVs鑒定方法
如今許多新型血漿EVs分離方法能克服傳統(tǒng)分離方法的缺陷,實現(xiàn)血漿EVs快速分離,并提高產(chǎn)率、純度和特異性,滿足多種應用的需求。常見的新型血漿EVs分離方法包括:(1)新型親和法;(2)微流控法;(3)聯(lián)合應用法。
2.1新型親和法 親和法因高度特異性而被廣泛用于血漿EVs的分離,利于不同疾病的深入研究(表3)。除了免疫親和法外,脂質親和法和二氧化鈦(TiO2)親和法也是近年來血漿EVs分離的新策略。此外,親和法中的配體也可以是適配體、多肽類、跨膜蛋白和肝素。
表3 新型親和法在血漿EVs分離中的應用
然而,所有親和法都存在一定局限性:(1)截至目前,沒有研究發(fā)現(xiàn)存在于所有EVs的通用型表面標志物,因此,表面標志物的數(shù)量和表達量會影響分離產(chǎn)率,使得產(chǎn)率小于實際樣本中的EVs數(shù)量,導致EVs所含的重要信息在后續(xù)檢測中被遺漏;(2)許多疾病的特異性表面生物學標志物依舊未知,故而無法通過親和法進行相關疾病的EVs分離[24];(3)特異性結合物會破壞EVs的生物活性和功能,影響其下游實驗的檢測和應用;(4)血漿中的雜質蛋白會與配體、反應板或EVs表面多個競爭性結合位點發(fā)生非特異性結合,導致EVs的捕獲率、釋放率和分離純度降低;(5)試劑和材料成本較高,難以在臨床應用中推廣和普及。
2.2微流控法 近年來血漿EVs分離方法發(fā)展的主流趨勢是建立微流控分離平臺。這種分離方法通過結合聲學、電泳或電磁場等先進技術,根據(jù)EVs的物理和生化特性實現(xiàn)高通量的非接觸式分離(表4)。該方法無需特殊的生物學標志物,產(chǎn)率較高,能保護EVs的結構、內(nèi)容物和功能不受破壞,實現(xiàn)分級分離,是血漿EVs分析實驗前處理的理想方法。同時,微流控分離法能將血漿EVs的分離、表征和檢測同時結合在單個裝置上,實現(xiàn)其研究的集成化和一體化。雖然目前微流控分離法仍缺乏成熟的行業(yè)標準和規(guī)范,且分離效果易受實驗試劑和外界環(huán)境的影響[25],但其體積小、分離樣本量下限低、自動化程度高等特點使它仍具有廣闊的臨床應用前景。
表4 非接觸式微流控平臺在血漿EVs分離中的應用
2.3聯(lián)合應用方法 血漿EVs的分離方法各有優(yōu)缺點,適用于不同的標本類型,為了彌補單一方法的局限性,目前許多研究聯(lián)合使用多種分離方法以達到更優(yōu)的分離效果(表5)。通常情況下,UC、UF作為血漿EVs分離策略的前幾步驟,用于去除血漿中的死細胞、細胞碎片等大顆粒雜質,而SEC、沉淀法等則用于后續(xù)EVs的純化分離,如Koh等[32]先用UC濾除血漿中大分子物質,再用SEC濾除可溶性蛋白質,該聯(lián)合方法的產(chǎn)率、雜質蛋白清除率均明顯高于單獨使用UC或SEC。近年來,許多研究也將新舊分離方法相結合,不僅能延續(xù)傳統(tǒng)方法的優(yōu)勢,實現(xiàn)更快速、精準的分離,也能讓分離平臺更加小型化、便攜化,利于分離方法在臨床應用中的發(fā)展。不過,雖然聯(lián)合應用方法能取長補短,但往往操作步驟繁瑣,分離過程中EVs的損失較多,分離產(chǎn)率不理想。
表5 聯(lián)合應用方法在血漿EVs分離中的應用
截至目前,仍然沒有一種分離方法能適用于所有血漿EVs的研究目的,也無法完全去除血漿中干擾物質對EVs分離的影響,分離血漿EVs仍存在許多困難和挑戰(zhàn)。血漿EVs分離過程中常見的干擾物質有血漿蛋白、脂蛋白、游離核酸等生物有機大分子,而一些細胞、細胞碎片和病毒顆粒[39]因形態(tài)和體積與EVs相似,也會影響UC、UF和SEC等物理分離方法。此外,血漿的粘度、密度和離子強度等環(huán)境因素會影響部分微流控分離法。這些干擾因素都使得在分離血漿EVs時需要更謹慎地選擇分離方法。
由于下游研究目的不同,導致實驗對EVs純度、來源和產(chǎn)量等要求不同,故而樣本類型、采集和前處理方法對于分離臨床樣本中的血漿EVs也至關重要。血液中多數(shù)的EVs由血小板釋放產(chǎn)生,血液凝固、采血針孔過小和反復凍融操作等都極易誘發(fā)血小板釋放EVs[40]。因此,如果需要研究血小板EVs或下游實驗需要大量囊泡結構,則選用血清樣本進行EVs分離會更高效;而如果要檢測特定類型的疾病特異性EVs亞群,則推薦選用血漿樣本,以最大程度去除血小板EVs,并避免血小板持續(xù)產(chǎn)生EVs而導致后續(xù)分析出現(xiàn)錯誤結果[41],還原樣本中最接近實際情況的EVs濃度和比例。此外,臨床標本采集中使用的抗凝劑也會影響血漿EVs的分離和鑒定,如肝素能與EVs結合、促進血小板活化及抑制PCR反應[42]。雖然國際血栓和止血協(xié)會(International Society on Thrombosis and Haemostasis)推薦選用檸檬酸鹽作為血漿EVs研究時的抗凝劑[43],但其抑制血小板活化的效果弱于乙二胺四乙酸(EDTA)和ACD抗凝劑[44]。因此,應具體根據(jù)下游分析和實驗目的選擇合適的抗凝劑。
血漿EVs 在疾病檢測、診斷、治療、預后和藥物傳遞中的應用潛力已被許多研究證實[45]。傳統(tǒng)EVs分離方法已經(jīng)不再能滿足研究的需求,人們對EVs研究興趣的增長又促使許多先進新型分離方法的誕生。由于各類方法具有不同的分離原理和步驟,為了能更高質量地獲得所需的EVs,聯(lián)合應用方法已成為許多研究的共同趨勢。而根據(jù)實驗目的選擇合適的分離方法,可以大大減少血漿EVs分離過程中的主要干擾因素,更有效地接駁后續(xù)分析研究和下游應用,例如:(1)UC、UF和微流控法的產(chǎn)率較高,適用于血漿EVs需求量大的研究;(2)免疫親和法的產(chǎn)物純度和特異性高,適用于血漿中特定EVs表面標志物的研究;(3)SEC、微流控法和免疫親和法的血漿蛋白和脂蛋白清除率高,適用于篩選血漿EVs蛋白標志物;(4)微流控法的產(chǎn)物結構相對完整、粒徑均一[27],且產(chǎn)物核酸含量能滿足后續(xù)檢測的需求[9],適用于血漿EVs的表征等受物質形態(tài)影響較大的研究,也適用于疾病的基因分析,利于疾病早期篩查。而隨著現(xiàn)代生物技術不斷進步,血漿EVs分離方法在未來也會持續(xù)推陳出新,大力推動EVs研究和“液體活檢”的發(fā)展。