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    基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討蒼附導(dǎo)痰丸治療多囊卵巢綜合征的作用機(jī)制

    2021-07-03 08:13:04胡攀偉
    關(guān)鍵詞:靶點(diǎn)通路胰島素

    胡攀偉,李 嘉,劉 丹,楊 紅

    (上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院1.婦科,2.針灸科,3.生殖醫(yī)學(xué)中心,上海201203)

    多囊卵巢綜合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)是一種生殖內(nèi)分泌疾病,在臨床上主要表現(xiàn)為少排卵或慢性無排卵、月經(jīng)不調(diào)、高雄激素血癥(如多毛、痤瘡),高胰島素血癥和肥胖[1]。有研究表明,PCOS 流行率為8%~13%,對女性的健康和生活質(zhì)量產(chǎn)生重大影響,合并增加罹患心血管疾病的風(fēng)險,同時將子宮內(nèi)膜癌風(fēng)險提高了2.7 倍,還可能誘發(fā)妊娠并發(fā)癥和情緒困擾等問題,嚴(yán)重影響家庭和諧[2]。早期診斷和治療PCOS 具有重要意義,目前治療PCOS 西醫(yī)手段眾多,但存在一定的局限性,停藥后容易復(fù)發(fā)[3]。PCOS 在祖國醫(yī)學(xué)寶庫中并無對應(yīng)的病名,但根據(jù)其臨床表現(xiàn)可以歸屬“月經(jīng)后期”、“不孕”等中醫(yī)范疇。蒼附導(dǎo)痰丸出自《葉天士女科診治秘方》,主方由半夏、陳皮、蒼術(shù)、膽南星、茯苓、甘草、生姜、香附、枳殼構(gòu)成。全方發(fā)揮調(diào)理沖仁,化痰燥濕之功,主治經(jīng)水不足,閉經(jīng),月經(jīng)稀發(fā)等。臨床研究[4]表明,蒼附導(dǎo)痰丸能夠促進(jìn)卵泡發(fā)育,改善體內(nèi)激素水平,恢復(fù)正常月經(jīng)規(guī)律,最終改善PCOS 患者排卵率和妊娠率,在臨床治療PCOS 中發(fā)揮良好效果。但是目前研究中針對蒼附導(dǎo)痰湯治療PCOS 多以臨床試驗(yàn)為主,動物實(shí)驗(yàn)及機(jī)制分析相對較少,蒼附導(dǎo)痰湯具體的作用機(jī)制還不明確。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是近些年來新起的一門學(xué)科,將系統(tǒng)生物學(xué)、藥理學(xué)、計(jì)算機(jī)等領(lǐng)域統(tǒng)籌結(jié)合,用當(dāng)代“疾病‐藥物‐靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)對中醫(yī)學(xué)進(jìn)行科學(xué)的解釋驗(yàn)證,為中醫(yī)藥研究提供科學(xué)理論支撐,為中醫(yī)藥的深入推廣提供基奠[5]。本文使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法推測蒼附導(dǎo)痰丸治療PCOS 的潛在機(jī)制與作用靶點(diǎn),為蒼附導(dǎo)痰丸的深入應(yīng)用與研究提供理論依據(jù)。

    1 資料與方法

    1.1 蒼附導(dǎo)痰丸的主要化學(xué)成分和對應(yīng)靶點(diǎn)

    檢索TCMSP 中藥分析平臺分別獲得每一味中藥的化學(xué)成分,匯總導(dǎo)入Excel 中。根據(jù)ADME 篩選參數(shù)設(shè)置口服利用度OB≥30%,類藥性DL≥0.18[6],獲得方劑的化合物成分,并結(jié)合參考文獻(xiàn)予以校正。運(yùn)用篩選到的化合物在TCMSP 平臺中查找對應(yīng)的靶點(diǎn),然后運(yùn)用Perl 語言數(shù)據(jù)包對靶點(diǎn)名稱在全球蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(Universal Protein,Uni‐prot)進(jìn)行基因名稱轉(zhuǎn)換,并對其中未能識別的靶點(diǎn),在Uniprot 在 線 網(wǎng) 站(https://www.uniprot.org/)進(jìn)行補(bǔ)充校正,匯總得到蒼附導(dǎo)痰丸的藥物作用靶點(diǎn)。通過檢索數(shù)據(jù)庫GeneCards(https://www. genecards. org/) 和OMIM (https://www.genecards.org/),以關(guān)鍵詞“polycystic ovarian syn‐drome”檢索相關(guān)基因,并導(dǎo)出Excel 匯總,對匯總的基因進(jìn)行查重,刪除重復(fù)值,得到疾病的相關(guān)靶點(diǎn)。

    1.2 PCOS 疾病靶點(diǎn)和蒼附導(dǎo)痰丸藥物靶點(diǎn)交集篩選

    利用R 數(shù)據(jù)包對藥物靶點(diǎn)和匯總得到的PCOS疾病靶點(diǎn)取交集,繪制韋恩圖,得到關(guān)鍵作用靶點(diǎn)交集。

    1.3 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    利用R 語言下的org 數(shù)據(jù)包對關(guān)鍵靶點(diǎn)規(guī)范基因名稱得到基因ID,同時對未能識別的基因進(jìn)行PubMed 網(wǎng) 站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)查詢補(bǔ)充,最終得到藥物作用于疾病的關(guān)鍵基因ID 列表,導(dǎo)入String 在線平臺(https://string-db.org/),選擇物種來源人源,設(shè)置0.9 高置信度,隱藏游離的點(diǎn),將得到的文件導(dǎo)入Cytoscape(3.7.2)軟件,最終導(dǎo)出蛋白互作網(wǎng)絡(luò),并對得到的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行R 語言分析,選擇排名前14 的關(guān)鍵基因,繪制條形圖。

    1.4 疾病-藥物-主要活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    利用得到的藥物成分及靶點(diǎn)信息關(guān)系形成網(wǎng)絡(luò)關(guān)系文件,導(dǎo)入Cytoscape(3.7.2)軟件,得到PCOS-蒼附導(dǎo)痰丸-主要活性成分-作用靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)可視化圖形。

    1.5 KEGG 通 路 和GO 富 集 分 析

    利用得到的關(guān)鍵作用靶點(diǎn)基因ID 列表,結(jié)合R數(shù)據(jù)包,以P<0.05 為篩選條件對基因進(jìn)行京都基因和基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析和基因本體(gene on‐tology,GO)分析。

    2 結(jié)果

    2.1 蒼附導(dǎo)痰丸成分和靶點(diǎn)收集

    在TCMSP 中逐個檢索中藥成分,得到有效成分757 個。根據(jù)獲得的主要成分列表在TCMSP 中檢索對應(yīng)的作用靶點(diǎn),匯總得到藥物靶點(diǎn),去除重復(fù)值,得到蒼附導(dǎo)痰丸中有效作用靶點(diǎn)167 個,生姜53 個,枳殼75 個,膽南星68 個,香附142 個,蒼術(shù)50個,甘草141 個,陳皮54 個,半夏88 個,茯苓35 個。

    2.2 蒼附導(dǎo)痰丸、多囊卵巢綜合癥共同靶點(diǎn)篩選

    將以上藥物使用Perl 軟件經(jīng)Uniprot 數(shù)據(jù)庫對靶點(diǎn)進(jìn)行基因名稱轉(zhuǎn)換,對不能識別的靶點(diǎn)進(jìn)行Uniprot 補(bǔ)充查詢,得到藥物靶點(diǎn)對應(yīng)的基因名稱列表。使用GeneCards 和OMIM 數(shù)據(jù)庫收集到PCOS靶點(diǎn)2 270 個、624 個,合并后刪除重復(fù)值,利用在R數(shù)據(jù)包對藥物靶點(diǎn)基因列表和多囊卵巢綜合征疾病靶點(diǎn)取交集,得到105 個核心交集基因并繪制韋恩圖,見圖1。

    圖1 蒼附導(dǎo)痰丸疾病和靶點(diǎn)的韋恩圖Fig 1 Venn diagram of disease and target of Cangfu Dao?tan pill

    2.3 核心靶點(diǎn)表達(dá)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及核心靶點(diǎn)收集

    將得到的105 個共同靶點(diǎn)輸入在線String 數(shù)據(jù)庫繪制蛋白互作網(wǎng)絡(luò),設(shè)置基因來源人源,進(jìn)行蛋白互作分析,設(shè)置0.9 置信度,隱藏游離的點(diǎn),導(dǎo)出含有節(jié)點(diǎn)信息的TSV 文件,在Cytoscape(3.7.2)中分析節(jié)點(diǎn)信息并繪制網(wǎng)絡(luò)圖,包含節(jié)點(diǎn)90 個,邊234 條,見圖2。通過R 語言包對節(jié)點(diǎn)TSV 文件進(jìn)行分析,篩選前14 個核心調(diào)控基因靶點(diǎn)并繪制靶點(diǎn)數(shù)目條形圖,見圖3。

    圖2 蒼附導(dǎo)痰丸的核心蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖Fig 2 Core protein interaction network of Cangfu Daotan pill

    圖3 蒼附導(dǎo)痰丸的核心靶點(diǎn)圖Fig 3 Diagram of core targets of Cangfu Daotan pill

    2.4 疾病-藥物-主要活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)分析

    將核心交集靶點(diǎn)基因?qū)?yīng)的藥物有效成分逐個對應(yīng),按照靶點(diǎn)數(shù)目從大到小排列,發(fā)現(xiàn)其中有8種成分是成分間共有成分,給這些成分分別按照簡稱命名(A-F),然后運(yùn)用Cytoscape 構(gòu)建疾病-藥物-主要活性成分-靶點(diǎn)視化圖形,得到網(wǎng)絡(luò)有254 節(jié)點(diǎn),2 219 邊,254 個節(jié)點(diǎn)中包含9 種中藥,140 種有效活性成分,105 個作用靶點(diǎn),邊表示中藥分子化合物和靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。其中靶點(diǎn)排名前十的關(guān)鍵活性成分為槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇、羅通定、卡維丁、7-羥基-2-甲基-3-苯基苯并吡喃-4-酮、美迪紫檀素、異鼠李素、植物甾醇,對應(yīng)靶點(diǎn)數(shù)目分別為65、38、33、32、32、29、29、28、27、26,可以推測這10 種成分為蒼附導(dǎo)痰丸治療PCOS 的關(guān)鍵活性成分,見圖4。

    圖4 疾病-藥物-主要活性成分-靶點(diǎn)可視化網(wǎng)絡(luò)Fig 4 Disease-drugs-main active ingredients-target visualization network

    2.5 GO 功能富集分析和KEGG 信號通路分析

    將得到的105 個靶點(diǎn)通過R 語言下的數(shù)據(jù)包進(jìn)行GO 下的生物過程(biological process,BP)分析和KEGG 信號通路分析,共有1 900 條生物功能顯著富集(P<0.05),1 692 個富集在BP 中。選擇BP條目中排名前20 繪制條形圖,主要涉及營養(yǎng)代謝,對藥物反應(yīng),脂多糖反應(yīng),細(xì)菌來源反應(yīng),活性氧物種反應(yīng),對類固醇激素反應(yīng)等,見圖5。富集到KEGG 通 路143 條,選 前20 條 繪 制 氣 泡 圖,主 要 包括流體剪切應(yīng)力和動脈硬化,晚期糖基化終產(chǎn)物通路,雌激素信號通路,白介素通路,內(nèi)分泌阻力通路,多巴胺能突觸,GnRH 信號通路,血管內(nèi)皮生長因子通路等,見圖6。

    圖5 BP 條形圖Fig 5 Biological process(BP)bar chart

    圖6 KEGG 氣泡圖Fig 6 KEGG bubble chart

    3 討論

    多囊卵巢綜合征臨床表現(xiàn)多為月經(jīng)后期閉經(jīng)、月經(jīng)稀發(fā)等。痰淤互結(jié)是多囊卵巢綜合征的發(fā)病重要因素,痰濕和瘀血是致病后的病理產(chǎn)物,不斷累積,得見多囊患者肥胖、多毛、倦怠乏力等表現(xiàn),形肥痰閉則經(jīng)閉[7]。蒼附導(dǎo)痰丸是祛痰濕的經(jīng)典名方,以膽南星、半夏、蒼術(shù)為君藥化痰清熱燥濕,香附疏肝解郁,茯苓健脾利濕,枳殼理氣化痰,甘草調(diào)和諸藥,生姜溫中化痰,全方共奏健脾利濕,疏肝解郁,化痰散結(jié)之功。西藥在治療PCOS 上多采用避孕藥,雌孕激素等激素療法,容易產(chǎn)生副作用,而祖國醫(yī)學(xué)在治療PCOS 上有獨(dú)特的優(yōu)勢,副作用相對較少,接受度高。目前臨床上治療PCOS 多采用蒼附導(dǎo)痰丸為基礎(chǔ)方,清瘀散結(jié),力求恢復(fù)患者自身的排卵節(jié)律,恢復(fù)月經(jīng)周期。本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討蒼附導(dǎo)痰丸治療PCOS 的可能機(jī)制,構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)藥物疾病靶點(diǎn)圖,系統(tǒng)預(yù)測潛在的作用靶點(diǎn)和有效活性成分。

    經(jīng)過篩選,本研究得到了蒼附導(dǎo)痰丸治療PCOS 主要成分140 個,其中排名前十的關(guān)鍵活性成分為,槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇、羅通定、卡維丁、7-羥基-2-甲基-3-苯基苯并吡喃-4-酮、美迪紫檀素、異鼠李素、植物甾醇。

    其中羅通定為中樞性鎮(zhèn)痛藥物,有鎮(zhèn)痛、鎮(zhèn)靜的作用[8]。脫氫卡維丁為季銨堿類化合物,有護(hù)肝、抗菌、止痛鎮(zhèn)靜作用[9]。美迪紫檀素為紫檀類化合物,有抗腫瘤、抗菌、抗氧化等藥理作用[10]。β-谷甾醇、植物甾醇均為甾醇成分。研究表明甾醇能夠抑制膽固醇吸收與合成,干擾甘油三酯吸收,改善體內(nèi)血脂水平[11]。其余的關(guān)鍵活性成分為藥用價值很高的黃酮類化合物,在自然界中廣泛存在。黃酮類化合物有抗炎,改善血管通透性、降低血脂、改善凝血功能,有類雌激素作用,能發(fā)揮抗炎、抗氧化功能[12]。槲皮素能夠改善PCOS 胰島素抵抗大鼠胰島素水平,抑制TLR/NF-κB 通路,改善PCOS 炎癥微環(huán)境,逆轉(zhuǎn)胰島素抵抗[13]。研究表明山奈酚能夠激活A(yù)MPK/Nrf2/HO-1 信號通路,減少細(xì)胞凋亡,降低炎性反應(yīng),改善氧化應(yīng)激[14]。木犀草素為天然黃銅化合物,有抗炎、抗凋亡、類雌激素、調(diào)節(jié)免疫等多種藥理作用[15]。異鼠李素可以調(diào)控一氧化氮合酶活性發(fā)揮抗炎作用,還可抑制血小板聚集減少血栓形成,能清除自由基發(fā)揮抗氧化功能[16]。血糖、高胰島素、血脂升高是PCOS 血管內(nèi)皮損傷中重要致病因素[17]。PCOS 發(fā)病與炎性因子水平密不可分,炎性因子又可以增加血脂水平,加重PCOS 患者體內(nèi)炎性狀態(tài)[18]。通過對蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中的核心基因進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)蒼附導(dǎo)痰丸主要通過JUN、MAPK3、HSP90AA1、MAPK1、ESR1、NR3C1、APP、MAPK14、MAPK8、VEGFA、EGFR、RB1、AR、IL6、NCOA1、RXRA 這16 個主要靶點(diǎn)發(fā)揮調(diào)控作用。MAPK3、MAPK1、MAPK14、MAPK8 屬于絲/蘇氨酸蛋白激酶(mitogen-activated protein ki‐nases,MAPK)家族,調(diào)控炎癥、凋亡、生長因子等諸多生理活動。MAPK 通路能負(fù)反饋調(diào)節(jié)PI3K 通路,導(dǎo)致PCOS 胰島素抵抗的形成,而胰島素抵抗是PCOS 重要發(fā)病機(jī)制[19]。JUN 基因?qū)儆赯IP 家族核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子成員之一,與眾多基因啟動子結(jié)合發(fā)揮基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)作用。HSP90AA1 屬于熱休克家族成員,能夠編碼可誘導(dǎo)的分子伴侶,幫助特定的靶蛋白進(jìn)行空間折疊。研究發(fā)現(xiàn)熱休克蛋白(heat shock protein,HSP)基因編碼的HSP90 主要存在于卵巢顆粒細(xì)胞,在優(yōu)勢卵泡中HSP90 含量明顯高于非優(yōu)勢卵泡,HSP90 能夠促進(jìn)調(diào)節(jié)卵泡成熟[20]。ESR1 能夠編碼一種雌激素受體,通過結(jié)合雌激素配體發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng),在卵泡發(fā)育和成熟中發(fā)揮重要作用[21]。NR3C1 能夠編碼兩種糖皮質(zhì)激素受體蛋白,通過與配體結(jié)合影響蛋白質(zhì)、脂肪代謝,調(diào)節(jié)內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài),介導(dǎo)炎癥、免疫等多種生理病理過程[22]。VEGF基因編碼的血管內(nèi)皮生長因子在組織血管形成和許多疾病中起到關(guān)鍵作用,高表達(dá)的VEGF 與PCOS 密 切 相 關(guān),且VEGF 是 控 制 卵 巢 血管生成的關(guān)鍵因素[23]。AR 為編碼雄激素受體的基因,高雄激素水平與PCOS 的進(jìn)展密切相關(guān),高雄激素水平可導(dǎo)致PCOS 患者出現(xiàn)多毛、痤瘡等臨床癥狀。對26 例PCOS 卵巢組織與15 例正常組織的病理分析發(fā)現(xiàn),雄激素受體可以間接降低PCOS 患者的生育能力,抑制卵泡發(fā)育,減少成熟卵形成[24]。IL6基因主要編碼一種細(xì)胞因子,廣泛參與免疫炎癥反應(yīng),臨床研究[25]表明高水平的IL-6 是發(fā)生PCOS 胰島素抵抗的獨(dú)立危險因素,可加重PCOS病情發(fā)展。

    GO 功能富集分析結(jié)果涉及營養(yǎng)代謝,對藥物反應(yīng),脂多糖反應(yīng),細(xì)菌來源反應(yīng),活性氧物種反應(yīng),對類固醇激素反應(yīng)等生物過程。脂多糖是參與炎癥代謝的關(guān)鍵分子,能夠刺激多種炎癥產(chǎn)生,同時還能促進(jìn)胰島素信號通路胰島素受體底物1 磷酸化,加劇胰島素抵抗[26]。PCOS 是一種慢性炎癥表現(xiàn),而腸道細(xì)菌分子反應(yīng)與慢性炎癥有一定的聯(lián)系,細(xì)菌的異位可以讓更多的脂多糖入血,導(dǎo)致內(nèi)毒素上升,促進(jìn)卵巢環(huán)境炎性改變[27]?;钚匝跏菣C(jī)體有氧代謝的重要產(chǎn)物,在卵泡微環(huán)境中存在著動態(tài)氧化與抗氧化平衡,過量的活性氧能對機(jī)體產(chǎn)生損傷,PCOS 患者的抗氧化能力水平明顯低于正常對照組,提示PCOS 患者抗氧化能力降低,活性氧代謝失衡可能是PCOS 中的重要發(fā)病機(jī)制[28]。類固醇激素包括性激素、腎上腺皮質(zhì)激素,腎上腺皮質(zhì)激素在糖代謝、脂質(zhì)代謝、胰島素抵抗、慢性炎癥等多途徑發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,雌孕激素配合發(fā)揮募集、選擇、優(yōu)勢化功能,促進(jìn)正常排卵,雄激素介導(dǎo)脂質(zhì)代謝、胰島素抵抗等,多途徑調(diào)節(jié)PCOS 患者體內(nèi)微環(huán)境。

    通過篩選得到KEGG 前20 條信號通路,主要包括流體剪切應(yīng)力和動脈硬化通路,糖尿病并發(fā)癥年齡通路,雌激素信號通路,白介素通路,內(nèi)分泌阻力通路,多巴胺能突觸,GnRH 信號通路,血管內(nèi)皮生長因子通路等。PCOS 患者常伴胰島素抵抗、脂質(zhì)代謝異常,進(jìn)一步增加了PCOS 患者罹患心血管疾病風(fēng)險,PCOS 的心血管結(jié)局多為代謝綜合征,心血管疾病和Ⅱ型糖尿病是PCOS 遠(yuǎn)期潛在的后遺癥[29]。目前臨床治療PCOS 多以改善胰島素抵抗、降低雄激素、激素治療為主,對脂質(zhì)代謝異常及伴隨的動脈硬化、遠(yuǎn)期心血管風(fēng)險并未予以深入研究。蒼附導(dǎo)痰丸通過調(diào)控流體剪切應(yīng)力和動脈硬化信號通路,能改善脂質(zhì)代謝及動脈硬化,降低PCOS 患者遠(yuǎn)期心血管不良事件。糖尿病并發(fā)癥年齡通路與糖尿病血管并發(fā)癥關(guān)系密切,產(chǎn)生大量糖基化產(chǎn)物,造成血管彈性降低,嚴(yán)重影響血管內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)[30]。相對正常人群,PCOS 患者血液系統(tǒng)處于高凝和低纖溶狀態(tài)[31]。雌激素信號通路、內(nèi)分泌阻力通路通過參與調(diào)控卵泡的生長排出,介導(dǎo)PCOS 患者的小卵泡形成。通過KEGG 分析可以獲知,蒼附導(dǎo)痰丸主要通過調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝、改善胰島素抵抗、減少炎性反應(yīng)、降低動脈硬化及血管阻力等多途徑來達(dá)到治療PCOS 的目的。

    通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對蒼附導(dǎo)痰丸治療PCOS進(jìn)行了系統(tǒng)的多成分、靶點(diǎn)、功能分析、信號通路分析,論證了蒼附導(dǎo)痰丸通過參與調(diào)控脂質(zhì)代謝、胰島素抵抗、炎性微環(huán)境、動脈硬化血管進(jìn)程、雄激素水平等發(fā)揮治療作用。本文初步闡釋了蒼附導(dǎo)痰丸治療PCOS 的可能作用機(jī)制,為后續(xù)深入研究及反向論證提供依據(jù),期待未來有進(jìn)一步的制劑開發(fā)應(yīng)用,使更多的PCOS 患者獲益。

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