侯 偉,周紅輝,謝瀟瀟,李江華,姜淑芳,高志英,游艷琴
1 解放軍醫(yī)學院,北京 100853;2 解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學中心 婦產(chǎn)科,北京 100853
基于胎兒游離DNA(cell free DNA,cf-DNA)檢測的無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(noninvasive prenatal test,NIPT)用于檢測胎兒常見的非整倍體及部分性染色體異常,敏感度:21-三體為0.994(0.983~0.998),18-三體為0.977(0.952~0.989),13-三體為0.906(0.823~0.958);特異性均達到0.999以上,是目前最準確的產(chǎn)前篩查方法[1]。母體外周血中的胎兒cf-DNA主要來源于胎盤滋養(yǎng)層細胞,其遺傳成分并不總是與胎兒一致,因此NIPT無法替代侵入性產(chǎn)前診斷(羊水穿刺術或絨毛膜穿刺術)[2]。目前NIPT的適用人群為血清學篩查臨界風險、有侵入性產(chǎn)前診斷禁忌者以及錯過血清學篩查最佳時間者,高齡孕婦(預產(chǎn)期年齡 ≥ 35歲)為NIPT的慎用人群[3]。同時高齡也是侵入性產(chǎn)前診斷的指征,因此臨床上建議高齡孕婦可直接行侵入性產(chǎn)前診斷[4]。研究認為35~38歲孕婦的胎兒非整倍體發(fā)生率并無明顯上升,孕婦35歲時孕中期胎兒21-三體的患病率為4.0‰,38歲時為8.7‰,而42歲時為24.1‰;18-三體和13-三體的發(fā)病率在38歲后也明顯升高[5]。有學者因此提出,在NIPT日趨成熟的情況下,部分風險相對較低的高齡孕婦可行NIPT篩查,即37歲前可先行NIPT,篩查陽性者行侵入性產(chǎn)前診斷驗證,陰性者不再行產(chǎn)前診斷[6]。以往研究證實NIPT在高危孕婦中有著很高的敏感度和特異性[7]。本研究對接受侵入性產(chǎn)前診斷的孕婦進行NIPT,比較不同產(chǎn)前診斷指征與胎兒染色體異常的相關性,探討擴展NIPT的適用人群及臨床應用價值。
1 對象 選取2018年1月16日- 2020年6月30日,在解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學中心就診的孕婦。納入標準:1)年齡 ≥ 18歲;2)單胎妊娠;3)在解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學中心行侵入性產(chǎn)前診斷,侵入性產(chǎn)前診斷的臨床指征主要有預產(chǎn)期年齡 ≥35歲、血清學篩查高風險或灰區(qū)、NIPT結果異常、胎兒超聲結構異常或軟指標異常、不良妊娠史或遺傳學家族病史(自身為患者或攜帶者、生育過遺傳病患兒或家族中有遺傳病患者);4)經(jīng)過咨詢并簽署知情同意書。排除標準:1)妊娠合并惡性腫瘤;2) 1年內(nèi)接受過異體輸血、移植手術、異體細胞治療。本研究獲得解放軍總醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準。
2 檢測方法 1) NIPT:本研究入組孕婦均行NIPT,在侵入性產(chǎn)前診斷前兩周內(nèi)進行。每名入組孕婦采集8 mL外周血于cfDNA采血管 (Streck,USA),分離血漿后使用DNeasy Blood Kit (Qiagen)提取基DNA,基因組DNA打斷成小片段 (Covaris,S220,USA),并使用KAPA Hyper Prep Kit (KAPA,KK8504,USA)構建文庫。高通量測序在Nextseq CN500平臺(Illumina,San Diego,CA)進行,以檢測染色體非整倍體的情況。NIPT的結果表示為胎兒染色體異常高風險或低風險;若胎兒游離DNA濃度小于4%,NIPT無結果(no call)。2) 侵入性產(chǎn)前診斷:獲得的羊水細胞或絨毛膜細胞行核型分析、熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)或染色體微陣列分析(chromosome microarray analysis,CMA)。
3 危險因素分析及計算公式 采用多因素logistic回歸分析,比較不同產(chǎn)前診斷指征與胎兒染色體異常的關系。NIPT的篩查方案:低風險者不再行侵入性產(chǎn)前診斷,高風險或無結果需行進一步產(chǎn)前診斷。當不同高危因素的孕婦應用該NIPT篩查方案后,計算侵入性產(chǎn)前診斷的需求量、異常檢出率及NIPT的陰性預測值。計算公式如下:
侵入性產(chǎn)前診斷的需求量=入組孕婦總數(shù)-NIPT低風險數(shù)斷,高風險或無結果需行進一步產(chǎn)前診斷。當不同高危因素的孕婦應用該NIPT篩查方案后,計算侵入性產(chǎn)前診斷的需求量、異常檢出率及NIPT的陰性預測值。計算公式如下:
產(chǎn)前診斷的異常檢出量=胎兒異??倲?shù)-NIPT為低風險的胎兒異常數(shù)斷,高風險或無結果需行進一步產(chǎn)前診斷。當不同高危因素的孕婦應用該NIPT篩查方案后,計算侵入性產(chǎn)前診斷的需求量、異常檢出率及NIPT的陰性預測值。計算公式如下:
產(chǎn)前診斷的陽性率=產(chǎn)前診斷的異常檢出量/產(chǎn)前診斷的需求量
NIPT的陰性預測值=(NIPT低風險數(shù)-NIPT為低風險的胎兒異常數(shù))/NIPT低風險數(shù)
4 統(tǒng)計學方法 統(tǒng)計分析使用SPSS22.0軟件進行。計量資料以表示,計數(shù)資料以例數(shù)(百分比)表示,多因素分析采用logistic回歸分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
1 孕婦一般情況及產(chǎn)前診斷信息 總計有1 261例孕婦納入本研究,平均年齡(34.65±5.02)歲,行產(chǎn)前診斷時的平均孕周為(20.18±1.73)周,侵入性產(chǎn)前診斷的臨床指征及檢測項目見表1。
表1 1 261例孕婦的臨床指征及產(chǎn)前診斷Tab.1 Clinical indications and methods of prenatal diagnosis in 1 261 pregnant women
2 侵入性產(chǎn)前診斷與NIPT結果比較 侵入性產(chǎn)前診斷檢出胎兒染色體異常87例,異常檢出率為6.90%,包括21-三體35例,18-三體6例,13-三體1例,性染色體非整倍體12例,胎兒嵌合體9例,微缺失重復22例,雜合性缺失1例,單親二倍體1例。NIPT高風險或無結果82例,低風險 1179例。對于上述胎兒染色體異常,NIPT整體的特異性為97.61%(1 146/1 174),陰性預測值為97.20%(1 146/1 179),診斷符合率為95.16%(1 200/1 261)(表2)。NIPT低風險但產(chǎn)前診斷證實胎兒異常33例,其中32例來源于NIPT檢測范圍之外的染色體異常,包括胎兒微缺失重復22例、胎兒嵌合體7例、雜合性缺失1例、單親二倍體1例、等臂雙著絲粒Y染色體1例(表3)。
表2 1 261例孕婦的NIPT及產(chǎn)前診斷結果(n, %)Tab.2 Results of NIPT and prenatal diagnosis of 1 261 pregnant women (n, %)
表3 產(chǎn)前診斷結果為異常而NIPT為低風險的33例孕婦信息Tab.3 Inconsistency between NIPT and invasive prenatal diagnosis in 33 cases
3 胎兒染色體異常的相關性分析 以胎兒是否存在染色體異常作為因變量,在接受侵入性產(chǎn)前診斷的孕婦中比較不同產(chǎn)前診斷指征與胎兒染色體異常的相關性。多因素logistic全?;貧w分析顯示:在這一人群中,高齡(OR=0.470,P=0.010)和超聲異常(OR=2.939,P<0.001)與胎兒染色體異常的相關性有統(tǒng)計學意義,而血清學篩查異常(OR=0.075)和不良孕產(chǎn)史及家族史(OR=0.492)無統(tǒng)計學意義(表4)。臨床意義:在接受侵入性產(chǎn)前診斷的孕婦中,單純高齡孕婦的胎兒染色體異常風險低于這一人群的平均風險,而超聲異常的孕婦高于這一人群的平均風險。
表4 胎兒染色體異常的多因素logistic回歸分析(n, %)Tab.4 Multivariate logistic regression analysis of factors related to fetal chromosome abnormalities (n, %)
4 單純高齡孕婦應用NIPT對產(chǎn)前診斷的影響 1 261例孕婦的胎兒異常檢出率為6.90%。本研究中高齡孕婦占55.51%(700/1 261),其中高齡為唯一危險因素的孕婦占44.09%(556/1 261)。38歲以下的單純高齡孕婦應用NIPT時,產(chǎn)前診斷的需求數(shù)量減少16.34%(217/1 261),產(chǎn)前診斷的陽性率為7.87%。42歲以下的單純高齡孕婦應用NIPT時,產(chǎn)前診斷的需求數(shù)量減少35.77%(472/1 261),產(chǎn)前診斷的陽性率為10.00%。所有單純高齡孕婦應用NIPT時,產(chǎn)前診斷需求量下降42.19%(532/1 261),產(chǎn)前診斷陽性率達11.11%,陰性預測值為98.92%(圖1)。單純高齡孕婦中共發(fā)現(xiàn)6例胎兒染色體異常而NIPT為低風險,其中1例為性染色體嵌合 [X0(26%)/XY(74%)],1例為10號染色體單親二倍體,4例為微缺失重復(缺失/重復片段大小1.2~2.4 Mb),均在NIPT檢測范圍外。
圖1 改變NIPT的年齡限制對產(chǎn)前診斷的需求量及陽性率的影響Fig.1 Effects of changing age limits for NIPT on demand for prenatal diagnosis and positive rate
5 其他單一高危因素的孕婦應用NIPT對產(chǎn)前診斷的影響 唯一危險因素為超聲異常的孕婦占6.66%(84/1 281),應用NIPT可減少6.58%(83/1 261)的產(chǎn)前診斷,陰性預測值91.57%(76/83);血清學篩查異常為唯一危險因素的孕婦占19.19%(242/1 261),應用NIPT可減少18.87%(238/1 261)的產(chǎn)前診斷,陰性預測值98.32%(234/238);不良孕史或家族史為唯一危險因素的孕婦占9.60%(121/1 261),應用NIPT可減少9.60%(121/1 261)的產(chǎn)前診斷,陰性預測值97.52%(118/121)。不同危險因素的孕婦應用NIPT篩查后產(chǎn)前診斷的陽性率:血清學篩查異常為8.11%,超聲異常為6.79%,不良孕史或家族史為7.37%(表5)。
表5 單一高危因素孕婦應用NIPT對產(chǎn)前診斷的影響Tab.5 Effect of NIPT on need of prenatal diagnosis in pregnant women with a single risk factor
隨著我國二胎政策的開放以及生育觀念的改變,產(chǎn)前診斷的服務量逐年提高,并且2013年以后高齡成為產(chǎn)前診斷的最主要指征[8]。與此同時,NIPT在近十年發(fā)展迅速,2020年美國婦產(chǎn)科醫(yī)師學會提出:無論年齡或其他風險因素如何,均建議對所有孕婦進行無創(chuàng)產(chǎn)前檢測[9]。NIPT屬于一項篩查技術而非診斷技術,其結果存在一定的不確定性。NIPT假陽性的原因包括局限性胎盤嵌合體、孕婦本身為染色體非整倍體、母源性的拷貝數(shù)變異、母源性惡性腫瘤、雙胎之一胎死宮內(nèi)等;假陰性的原因包括胎兒濃度較低、胎盤低比例嵌合、胎兒嵌合但胎盤正常等[10]。目前各專業(yè)結構推薦的NIPT檢測范圍包括211813號染色體以及部分性染色體的異常,尚不推薦將檢測范圍擴展至微缺失重復以及其他染色體異常[11-12]。因此,能否通過擴展NIPT適用人群來減少產(chǎn)前診斷值得討論。
本研究主要探討擴展NIPT的適用人群及應用評價。胎兒非整倍體風險隨孕婦年齡增大而升高,35歲孕婦胎兒非整倍體風險與產(chǎn)前診斷導致的流產(chǎn)風險大致相當(約1/200),據(jù)此大多數(shù)國家的醫(yī)療機構對35歲及以上的孕婦提供產(chǎn)前診斷[13]。孕婦年齡作為篩查的敏感度和陽性預測值低,高齡作為產(chǎn)前診斷指征受到越來越多的質(zhì)疑[6]。本研究中高齡與胎兒染色體異常的相關性低于其他產(chǎn)前診斷指征,因此在高危孕婦中優(yōu)先選擇高齡孕婦應用NIPT。在單純高齡孕婦中,依據(jù)年齡逐步擴展NIPT的應用范圍,產(chǎn)前診斷的需求量下降達42.19%,產(chǎn)前診斷發(fā)現(xiàn)胎兒異常比例由6.90%升至11.11%,提高了產(chǎn)前診斷的效率,同時陰性預測值達98.92%。因此單純高齡孕婦可行NIPT,根據(jù)篩查結果決定是否行侵入性產(chǎn)前診斷。
超聲異常包括胎兒結構異常和軟指標異常,這些異常很有可能與某個遺傳綜合征或遺傳缺陷疾病相關。導致超聲異常的遺傳學因素很多,相當一部分超出了NIPT的檢測范圍,如染色體拷貝數(shù)異常(copy number variation,CNV)、胎兒嵌合體等,僅行NIPT無法除外這些遺傳學異常。Wapner等[14]研究發(fā)現(xiàn)超聲提示結構異常但核型分析正常的胎兒,可額外檢出6.7%的CNV,高于高齡孕婦(1.6%),提示胎兒結構異常與CNV之間存在相關性[14]。本研究中,當孕婦合并超聲異常時NIPT漏診風險明顯升高,NIPT陰性預測值僅為91.57%。因此對于超聲提示胎兒結構異常的孕婦,不建議行NIPT篩查,仍需侵入性產(chǎn)前診斷。
除了擴展適用人群之外,擴展NIPT的檢測范圍同樣意義重大。理論上基于全基因組測序的NIPT可以發(fā)現(xiàn)胎兒的染色體拷貝數(shù)異常,即NIPT-plus。NIPT通常采用低深度測序,增加測序的深度可以提高檢出胎兒CNV的能力,同時減少假陽性率[15]。并不是所有的CNV都適合進行篩查,需要考慮到CNV的大小、外顯率、表型、發(fā)病率等因素。CNV越小,需要的測序深度及成本越高;CNV越大,包含的基因越多,致病的可能性越高。目前已有商業(yè)化的NIPT涵蓋表型明確、外顯率高、發(fā)病率相對較高的CNV,如DiGeorge Syndrome (DGS)、1p36 Deletion、16p12.2-p11.2 Syndrome、Angelman/Prader-Willi Syndrome、Cridu-chat Syndrome等[16]。與非整倍體不同,胎兒CNV的發(fā)病率與孕婦年齡無關[17]。本研究共檢出22例微缺失重復,其中5例在NIPT中有相應發(fā)現(xiàn),敏感度為27.3%(6/22)。還有部分NIPT發(fā)現(xiàn)的微缺失重復缺乏CMA檢測及臨床驗證,本研究尚無法計算NIPT對于微缺失重復的陽性預測值,待完善新生兒隨訪作為臨床驗證,可計算NIPT檢出胎兒微缺失重復的陽性預測值及特異度。目前還需要大規(guī)模的隊列研究證實NIPT-plus效能,作為臨床常規(guī)應用的方案尚不成熟[18-19]。
綜上所述,在NIPT應用日趨完善的今天,高齡孕婦在排除其他產(chǎn)前診斷指征之后可以選擇NIPT進行篩查,出現(xiàn)陽性結果時再行產(chǎn)前診斷,從而避免有創(chuàng)操作帶來的流產(chǎn)風險。將NIPT的適用人群擴展至單純高齡孕婦可以顯著減少產(chǎn)前診斷數(shù)量,并提高產(chǎn)前診斷的效率。對于合并超聲異常、血清學篩查異常、不良孕史或遺傳學家族史的孕婦,選擇NIPT將承擔更大的漏診風險,并且漏診風險主要來源NIPT檢測范圍之外的染色體異常,如胎兒嵌合體、微缺失重復等。因此要嚴格把握NIPT適用指征,合并高齡以外產(chǎn)前診斷指征的孕婦仍需行侵入性產(chǎn)前診斷。