基于生物信息學(xué)的十二指腸腺瘤核心致病基因及其靶向治療中藥活性成分篩選

馮瑤，陳新怡，宋厚盼，劉濤，楊燾，劉恒銘，仇婧玥，曾梅艷

(湖南中醫(yī)藥大學(xué) 1.中醫(yī)診斷學(xué)湖南省重點實驗室；2.醫(yī)學(xué)院；3.中醫(yī)學(xué)院，湖南 長沙 410208)

十二指腸腺瘤(duodenal adenoma, DA)是一類發(fā)生在十二指腸黏膜上皮的良性腫瘤，為十二指腸息肉最常見的一種表現(xiàn)形式。據(jù)報道，在接受食管胃十二指腸鏡檢查的患者中，DA發(fā)病率約0.4%，其中男性高于女性[1-2]。DA是最容易可視化的小腸增生性病變，也是唯一可以在早期階段通過傳統(tǒng)內(nèi)窺鏡檢查方法檢出、切除和隨訪的病變。DA作為一種癌前病變，?？稍谀[瘤中同時觀察到良性組織與惡性組織，目前已廣泛接受十二指腸腺瘤-腺癌發(fā)展假說[3]?，F(xiàn)有研究表明，DA發(fā)生可能與Wnt/β-連環(huán)蛋白信號通路或鼠類肉瘤病毒癌基因(KRAS)、腫瘤抑制基因(APC)異常表達(dá)密切相關(guān)[4-5]，但其具體發(fā)病機制目前仍不清楚。因此，本研究利用生物信息學(xué)方法，從GEO數(shù)據(jù)庫獲取DA基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù)，并應(yīng)用DAVID和STRING等數(shù)據(jù)庫從分子水平對獲取的數(shù)據(jù)進行分析，通過比較毒物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(Comparative Toxicogenomics Database, CTD)篩選出潛在的靶向治療DA的藥物，旨在獲得更多與DA發(fā)生發(fā)展過程相關(guān)分子機制的生物學(xué)信息。

1 材料與方法

1.1 十二指腸腺瘤芯片數(shù)據(jù)采集

輸入網(wǎng)址“http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/gds”，進入GEO數(shù)據(jù)庫，在搜索欄輸入檢索詞“Duodenal Adenoma”，搜索后獲得符合研究需求的基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù)集GSE102208。該數(shù)據(jù)集基于GPL21185芯片分析平臺，由Sakaguchi 等[6]于2017年提交。GSE102208包含8個樣本，其中4例DA患者十二指腸組織樣本和4例健康者十二指腸組織樣本。

1.2 GSE102208芯片數(shù)據(jù)的均一化處理

使用統(tǒng)計軟件R3.2.1，運用affy程序包，采用相對對數(shù)表達(dá)(relative logarithmic expression, RLE)法進行質(zhì)量控制，通過對原始數(shù)據(jù)進行穩(wěn)健多陣列平均值模型(robust multi-array average, RMA)背景校正、標(biāo)準(zhǔn)化處理，再利用芯片平臺的注釋包將芯片數(shù)據(jù)集的所有探針符號轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)基因名，采用KNN法補充基因缺失值，將探針的平均值作為基因表達(dá)值，匯總后獲取均一化表達(dá)水平數(shù)據(jù)。

1.3 GSE102208芯片數(shù)據(jù)的主成分分析

主成分分析(principal component analysis, PCA)主要功能是將多維特征映射到方差最大的多維空間，有助于簡化分析和可視化多維數(shù)據(jù)，計算樣本與樣本之間的差異性。將芯片各樣本矩陣數(shù)據(jù)導(dǎo)入OmicShare網(wǎng)站，繪制PCA圖，觀察DA患者和健康者十二指腸組織基因表達(dá)數(shù)據(jù)的分層狀況。

1.4 差異表達(dá)基因篩選

對DA組與健康組基因樣本芯片數(shù)據(jù)進行過濾和標(biāo)準(zhǔn)化處理后，利用GEO2R分析工具對GSE102208中的數(shù)據(jù)進行分析，獲取全部差異表達(dá)基因(differentially expressed genes, DEGs)。以調(diào)整后P值≤0.05且|log2FC|≥1為篩選條件，利用ggplots包制作可視化DA組與健康組十二指腸黏膜DEGs火山圖；進一步以調(diào)整后P值≤0.01且|log2FC|≥2為篩選條件，獲得DA組與健康組十二指腸黏膜顯著性DEGs，繪制可視化DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs層次聚類熱圖。

1.5 顯著性DEGs基因本體論功能富集分析

基因本體論(gene ontology, GO)是將DEGs從生物學(xué)過程、細(xì)胞組成和分子功能三個方面進行生物學(xué)功能注釋的一種方法。將顯著性DEGs輸入DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫，Identifier選擇“Official gene symbol”，物種選擇“Homo sapiens”，點擊“submit list”后收集“Biological process”、“Cell component”、“Molecular function”三個部分的數(shù)據(jù)進行顯著性DEGs的GO功能富集分析。

1.6 顯著性DEGs京都基因與基因組百科全書通路富集分析

京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析常用來分析靶點蛋白在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的作用，尋找DEGs所富集的關(guān)鍵通路。將顯著性DEGs輸入DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫，Identifier選擇“Official gene symbol”，物種選擇“Homo sapiens”，點擊“submit list”后收集KEGG項下的數(shù)據(jù)進行顯著性DEGs的信號通路富集分析。

1.7 DEGs涉及的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

將獲得的DGEs導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫，構(gòu)建DA組與健康組十二指腸黏膜DEGs蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction, PPI)網(wǎng)絡(luò)，導(dǎo)出tsv格式的PPI數(shù)據(jù)，通過網(wǎng)絡(luò)圖像化軟件Cytoscape 3.7.2(http:∥www.cytoscape.org/)對構(gòu)建的生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)中的區(qū)域進行關(guān)聯(lián)度分析并導(dǎo)出可視化結(jié)果。

1.8 核心DEGs篩選

Cytohubba插件可提供11種分析PPI網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浞治龇椒?，以篩選生物網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因。常用的拓?fù)浞治龇椒òɑ谧疃搪窂降亩戎?degree)、邊緣滲透分量、最大鄰域分量、最大鄰域分量密度、最大集團中心度和六個中心點等。采用cytohubba分析“1.7”獲得的PPI網(wǎng)絡(luò)，選擇最常用的“度值”算法，獲取核心DEGs。

1.9 靶向作用于DA核心致病基因的中藥活性成分篩選

CTD涵蓋了化學(xué)成分、基因、表型和疾病關(guān)系的人工策劃信息，通過化學(xué)成分-基因相互作用，化學(xué)成分-疾病與基因-疾病關(guān)聯(lián)，化學(xué)成分-表型相互作用和環(huán)境暴露數(shù)據(jù)四個領(lǐng)域幫助研究者了解疾病的易感性和潛在的防治策略[7]。在Search下拉列表中點擊“Chemical-Gene Interaction”選項，依次在“Gene”輸入框中將“1.8”獲得的核心DEGs輸入，獲得可能靶向治療DA的中藥活性成分。

2 結(jié)果

2.1 芯片數(shù)據(jù)均一化處理結(jié)果

運用R軟件對基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集GSE102208進行標(biāo)準(zhǔn)化正態(tài)處理，并繪制芯片數(shù)據(jù)相對表達(dá)值均一化箱線圖(圖1)。結(jié)果顯示，8個樣本的中位數(shù)基本位于一條水平直線(5.0左右)，提示基因芯片質(zhì)量良好，無異常表達(dá)，兩分組之間的數(shù)據(jù)具有比較意義，可繼續(xù)用于下一步分析研究。

圖1 DA患者與健康者十二指腸組織基因芯片數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化處理

2.2 芯片數(shù)據(jù)主成分分析結(jié)果

如圖2所示，圖中每個點代表一個樣本，樣本間距離遠(yuǎn)近反映樣本差異。經(jīng)過批次校正后將遺傳背景相似的個體聚類在一起，DA組與健康組樣本之間可見明顯分層，提示處理之后的芯片數(shù)據(jù)分布效果較好。DEGs能夠有效地代表DA患者與健康者十二指腸組織樣本間基因表達(dá)譜的差異。

圖2 DA患者與健康者十二指腸組織基因芯片數(shù)據(jù)主成分分析圖

2.3 DA患者與健康者十二指腸組織DEGs分析結(jié)果

通過分析基因芯片GSE102208中的數(shù)據(jù)，共篩選出DEGs 36 866個。利用GEO 2R分析工具，以調(diào)整后P值≤0.05，|log2FC|≥1為初步篩選條件繪制火山圖(圖3)，圖中每個點代表一個基因，紅色為上調(diào)表達(dá)基因，綠色為下調(diào)表達(dá)基因，灰色代表無明顯差異的表達(dá)基因。獲得DA組與健康組DEGs 2 335個，其中上調(diào)基因1 379個(59.06%)，下調(diào)基因956個(40.94%)。

圖3 DA患者與健康者十二指腸組織DEGs分布火山圖

2.4 DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs篩選結(jié)果

以調(diào)整后P值≤0.01，|log2FC| ≥2為篩選條件，對GSE102208數(shù)據(jù)進行深度分析，共得到DA組與健康組十二指腸黏膜顯著性DEGs 373個。其中顯著上調(diào)基因270個(72.39%)，顯著下調(diào)基因103個(27.61%)。圖4中每個方格代表一個基因，紅色代表上調(diào)基因，綠色代表下調(diào)基因，方格顏色越深表示基因表達(dá)值越高。熱圖的每一行代表同一基因在不同樣本中的表達(dá)情況，每一列代表所有顯著性DEGs在同一樣本中的表達(dá)情況。由此提示，DA患者與健康者十二指腸組織存在顯著的DEGs。

圖4 DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs層次聚類熱圖

2.5 顯著性DEGs GO功能富集分析結(jié)果

進行GO功能富集分析共獲得GO條目358條，其中生物學(xué)過程34條(9.50%)，細(xì)胞組成294條(82.13%)，分子功能30條(8.37%)。選取差異最顯著的8個功能進行排序分析。結(jié)果顯示(圖5)，生物學(xué)過程變化主要涉及膽固醇流出、膽固醇穩(wěn)態(tài)、膽固醇輸入、脂蛋白生物合成、三酰甘油穩(wěn)態(tài)等功能簇；分子功能變化主要涉及高密度脂蛋白顆粒結(jié)合、金屬內(nèi)肽酶活性、化學(xué)排泄物活性、氧轉(zhuǎn)運體活性、細(xì)胞因子受體活性等功能簇；細(xì)胞組分變化主要涉及質(zhì)膜組成成分、外泌體、刷狀緣、極低密度脂蛋白顆粒、細(xì)胞表面等功能簇。

圖5 DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs GO功能富集分析

2.6 顯著性DEGs KEGG通路分析結(jié)果

KEGG通路富集分析結(jié)果顯示(圖6)，DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs主要富集于20條信號通路，分別為維生素消化吸收相關(guān)通路、碳水化合物消化吸收相關(guān)通路、蛋白質(zhì)消化吸收相關(guān)通路、膽汁分泌相關(guān)通路、礦物吸收相關(guān)通路、非洲錐蟲病、脂肪消化吸收相關(guān)通路、細(xì)胞色素P450對外源物質(zhì)代謝的相關(guān)通路、ABC轉(zhuǎn)運蛋白相關(guān)通路、PPAR信號通路、脂肪細(xì)胞因子信號通路、PI3K-Akt信號通路、神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路、瘧疾、心肌細(xì)胞腎上腺素能信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、胰高血糖素相關(guān)信號通路、胰島素抵抗相關(guān)信號通路、腎素-血管緊張素系統(tǒng)相關(guān)通路、AMPK信號通路、脂肪細(xì)胞脂解調(diào)節(jié)相關(guān)信號通路。

2.7 DEGs的PPI網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果

將篩選出的顯著性DEGs導(dǎo)入STRING在線分析軟件，得到由269個基因構(gòu)成的PPI網(wǎng)絡(luò)，再將PPI網(wǎng)絡(luò)信息導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2，得到由106個特征性基因靶點和196條蛋白互作關(guān)系構(gòu)成的網(wǎng)絡(luò)圖，對上調(diào)表達(dá)基因和下調(diào)表達(dá)基因分別進行顏色標(biāo)記，粉色表示上調(diào)基因，藍(lán)色表示下調(diào)基因(圖7)。其中，上調(diào)基因77個(72.64%)，下調(diào)基因29個(27.36%)。

圖6 DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs KEGG通路分析

2.8 核心DEGs篩選結(jié)果

應(yīng)用Cytohubba插件篩選DA組與健康組十二指腸黏膜核心DEGs，以度值為篩選標(biāo)準(zhǔn)，共得到載脂蛋白B(APOB)、表皮細(xì)胞生長因子(EGF)、載脂蛋白A1(APOA1)、葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白2(SLC2A2)、麥芽糖酶糖化酶(MGAM)、載脂蛋白A4(APOA4)、二肽基肽酶- 4(DPP4)、磷酸烯醇式丙酮羧激酶-1(PCK1)、神經(jīng)肽Y(NPY)、葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G6PC)等10個關(guān)鍵基因。這10個基因的度值分別為26、26、21、21、16、14、14、14、13、13。其中，度值最大的基因為APOB和EGF。分析發(fā)現(xiàn)APOB、EGF、APOA1、SLC2A2、MGAM、APOA4、PCK1、NPY、G6PC為上調(diào)表達(dá)基因，DPP4為下調(diào)表達(dá)基因。見圖8。

圖7 DA患者與健康者十二指腸組織顯著性DEGs PPI網(wǎng)絡(luò)

圖8 DA患者與健康者十二指腸組織核心DEGs

2.9 靶向治療DA的中藥活性成分篩選結(jié)果

將上述得到的10個核心DEGs導(dǎo)入CTD數(shù)據(jù)庫，以Count數(shù)為篩選條件，得到作用于APOB、EGF、APOA1、SLC2A2、MGAM、APOA4、DPP4、PCK1、NPY、G6PC的中藥活性成分分別為6、5、5、5、1、2、3、5、3、3個，結(jié)果見表1。

表1 靶向作用于DA核心致病基因的中藥活性成分

續(xù)表1

3 討論

本文通過對GEO數(shù)據(jù)庫GSE102208芯片數(shù)據(jù)進行分析，獲得DA組與健康組十二指腸黏膜DEGs，其中顯著性DEGs共373個，包含270個上調(diào)基因和103個下調(diào)基因。GO功能富集分析顯示，這些基因主要富集于膽固醇輸入、膽固醇穩(wěn)態(tài)、膽固醇流出、脂蛋白合成、三酰甘油穩(wěn)態(tài)等生物學(xué)過程。膽固醇是細(xì)胞膜的基本組成部分，在細(xì)胞增殖和生長中具有不可或缺的作用。快速增殖的腫瘤細(xì)胞往往需要大量的膽固醇和脂肪酸，這反映了DA組織中細(xì)胞增殖旺盛[8]。近年來研究也已證實，腫瘤的發(fā)生與膽固醇維持質(zhì)膜的流動性和滲透性有關(guān)，膜膽固醇外流可通過推動腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞再變性促進腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[9]。脂蛋白是一類富含固醇脂和三酰甘油的球狀微粒。在腫瘤患者中經(jīng)?？梢杂^察到脂蛋白的異常，高脂血癥可為腫瘤進展提供足夠的致瘤脂質(zhì)[10]。但當(dāng)前對于高密度脂蛋白和癌癥發(fā)病率之間的關(guān)系仍存在爭議，二者關(guān)系可能與腫瘤類型有關(guān)[11]。本研究發(fā)現(xiàn)，顯著性DEGs在分子功能中主要富集在高密度脂蛋白顆粒結(jié)合過程，提示高密度脂蛋白可能會促進DA的發(fā)生。

KEGG結(jié)果顯示，DA顯著性DEGs主要富集在PI3K-Akt、PPAR、碳水化合物消化吸收、蛋白質(zhì)消化吸收、脂肪消化吸收、膽汁分泌等信號通路。PI3K-Akt是一條調(diào)節(jié)細(xì)胞生長的信號通路，在蛋白質(zhì)翻譯、細(xì)胞凋亡調(diào)控中均發(fā)揮重要作用，已證實在多種癌癥中過度激活[12]。PPAR信號通路過表達(dá)時，腫瘤生長能力增強，血管密度增高，且更易轉(zhuǎn)移[13]。同時，這些信號途徑也富集在三大營養(yǎng)物質(zhì)代謝過程，與DA患者腸道功能紊亂密切相關(guān)。另有研究表明，腺瘤的腫瘤轉(zhuǎn)化可能由十二指腸中高濃度膽汁酸和胰液誘發(fā)，在膽囊切除后，這種表現(xiàn)更加明顯[14]。本文結(jié)果結(jié)合上述已有的研究結(jié)果表明，我們所預(yù)測的信號通路異常表達(dá)與DA發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，提示針對上述信號通路開展靶向治療可能具有較好的可行性。

進一步研究發(fā)現(xiàn)，DA組與健康組核心DEGs與其他DEGs之間存在大量的相互作用，這些基因與DA發(fā)生、發(fā)展、浸潤及轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。其中，APOB、APOA1和APOA4屬載脂蛋白家族，其生物學(xué)功能主要富集在膽固醇轉(zhuǎn)運、脂蛋白生物合成及三酰甘油三酯穩(wěn)態(tài)等功能簇。APOB是在肝臟和小腸中合成的主要載脂蛋白，對促進飲食和內(nèi)源性合成脂質(zhì)在體內(nèi)的運輸中發(fā)揮重要作用。雖然沒有確切證據(jù)證明APOB與DA的相關(guān)性，但Kim等[15]指出，結(jié)腸腺瘤的發(fā)生隨葡萄糖代謝水平升高而增加，同時伴隨著APOB水平升高，這可能與APOB的糖基化作用相關(guān)。低密度脂蛋白可通過促使葡萄糖與APOB賴氨酸形成共價鍵而進行糖基化，APOB糖基化與細(xì)胞異常增殖有關(guān)，且與腫瘤關(guān)系密切。Al-Jawadi等[16]研究發(fā)現(xiàn)，果糖攝入過多可特異性刺激小腸APOB表達(dá)，進而誘發(fā)高三酰甘油血癥并促進小腸腫瘤生長，以上機制同樣適用于DA，提示通過改善生活方式如限制糖的攝入以改善血糖代謝參數(shù)可抑制DA發(fā)展。APOA1是高密度脂蛋白的主要成分，具有抗炎、抗凋亡和抗氧化功能并參與膽固醇運輸以及免疫應(yīng)答調(diào)節(jié)。Zhang等[17]研究指出，APOA1可通過促進膽固醇外流抑制腸道腫瘤生長和轉(zhuǎn)移。本文預(yù)測結(jié)果與上述研究結(jié)果相符，預(yù)示APOA1異常表達(dá)可能誘導(dǎo)DA發(fā)生與發(fā)展。

EGF是人體分泌的一種重要的細(xì)胞生長因子，其主要功能是促進表皮細(xì)胞分裂。在結(jié)腸癌患者中，EGF通過誘導(dǎo)血管內(nèi)皮生長因子的產(chǎn)生而激活血管內(nèi)皮細(xì)胞，促進腫瘤血管生成，并與其受體EGFR作用以促進腫瘤細(xì)胞增殖[18]。E-鈣黏蛋白屬鈣黏蛋白超家族經(jīng)典成員，是維持上皮細(xì)胞間連接和上皮表型的必需蛋白，其在各種腫瘤中表達(dá)降低并與癌的分化、侵襲和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[19]。新近研究證明，E-鈣黏蛋白在結(jié)腸腫瘤的發(fā)展中具有促進作用，E-鈣黏蛋白乙?；赏ㄟ^上調(diào)β-連環(huán)蛋白通路促進結(jié)直腸腫瘤細(xì)胞的生長[20-21]。同時，EGF可通過下調(diào)E-鈣黏蛋白誘導(dǎo)大腸癌細(xì)胞上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化，從而促使癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移，促進腫瘤發(fā)展[22]。由此提示EGF-E-鈣黏蛋白通路在DA惡性進展中發(fā)揮重要作用，通過抑制EGF表達(dá)或能阻止腺瘤進一步惡化。SLC2A2是一種可運輸葡萄糖的脂溶載體，屬SLC2A家族，對葡萄糖具有較高親和力。SLC2A高表達(dá)可滿足癌細(xì)胞的高葡萄糖代謝，促使腺瘤惡化[23]。Jeppsson等[24]研究指出，神經(jīng)肽Y可通過上調(diào)腸上皮細(xì)胞PI3k-Akt途徑調(diào)節(jié)上皮細(xì)胞增殖與凋亡，從而促使腫瘤發(fā)生，而G6PC則在葡萄糖代謝和細(xì)胞周期調(diào)控起重要作用[25]。

通過CTD數(shù)據(jù)庫對靶向作用于DA核心致病基因的中藥活性成分進行篩選，發(fā)現(xiàn)結(jié)合度較高的成分有白藜蘆醇、槲皮素、人參皂苷、姜黃素和雷公藤甲素等。白藜蘆醇是一種葡萄、漿果、花生及其他植物來源的天然多酚化合物，已廣泛用于治療和預(yù)防癌癥的各種研究。白藜蘆醇可通過調(diào)節(jié)成纖維細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和T細(xì)胞相關(guān)信號通路發(fā)揮抑瘤作用，同時保護細(xì)胞免于氧化損傷和維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)[26]。在結(jié)直腸癌中，白藜蘆醇可增強E-鈣黏蛋白表達(dá)，并通過AKT/GSK3β/Snail信號通路抑制腫瘤細(xì)胞侵襲和遷移[27]。槲皮素屬黃酮醇類化合物，普遍存在于水果和蔬菜中。槲皮素可通過調(diào)節(jié)P13K/Akt/mTOR、Wnt/β-catenin等途徑使細(xì)胞活力喪失，促進腫瘤細(xì)胞凋亡和自噬[28]。雖然目前沒有臨床證據(jù)表明槲皮素可以用于預(yù)防和治療人類癌癥，但可作為飲食補充劑和低毒性治療分子用于腫瘤的預(yù)防。人參皂苷是一種主要存在于人參屬藥材中的固醇類化合物。人參皂苷Rg3R可通過顯著下調(diào)大腸癌干細(xì)胞基因表達(dá)和抑制其上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化治療結(jié)直腸癌[29]。已證明人參皂苷Rb2可通過抑制TGF-β/Smad信號通路抑制大腸癌細(xì)胞上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化[30]。姜黃素是從姜黃根部獲取的活性物質(zhì)，已被證實可通過多種方式抑制結(jié)直腸腫瘤發(fā)展。Telang等[31]研究指出，姜黃素可減少家族性腺瘤性息肉病患者的腺瘤數(shù)和復(fù)發(fā)，這為DA治療提供了一定理論依據(jù)。雷公藤甲素是一種從中草藥雷公藤中分離出的化合物，可抑制癌細(xì)胞生長并在包括急性髓細(xì)胞白血病在內(nèi)的多種癌癥如結(jié)腸癌、卵巢癌、肺癌中表現(xiàn)出臨床前抗腫瘤活性，其抗腫瘤基礎(chǔ)側(cè)重于對細(xì)胞凋亡、自噬和上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化的調(diào)節(jié)[32]。

綜上所述，本研究采用生物信息學(xué)方法深入挖掘十二指腸腺瘤芯片數(shù)據(jù)，獲得 373個顯著性DEGs及其相關(guān)通路，這些顯著性DEGs涉及膽固醇穩(wěn)態(tài)、膽固醇流出、脂蛋白合成、三酰甘油穩(wěn)態(tài)、高密度脂蛋白顆粒結(jié)合等多個生物學(xué)過程和分子功能，參與PI3K-Akt、PPAR、膽汁分泌等多條信號通路。研究還表明，APOB、EGF、APOA1、SLC2A2、MGAM、APOA4、DPP4、PCK1、NPY、G6PC異常表達(dá)可能在DA發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用。進一步研究發(fā)現(xiàn)，白藜蘆醇、槲皮素、人參皂苷、姜黃素、雷公藤甲素等中藥活性成分可能是有效治療DA的靶向藥物。