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      lncRNA NCK1-AS1在肝細(xì)胞肝癌組織中的表達(dá)及臨床意義*

      2021-03-17 05:09:00楊鵬生宋黎明段希斌梁馬可梁占強(qiáng)李學(xué)民
      現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生 2021年5期
      關(guān)鍵詞:靶向特異性試劑盒

      楊鵬生,宋黎明,段希斌,梁馬可,梁占強(qiáng),李學(xué)民

      (鄭州市中心醫(yī)院肝膽胰腺外科,河南 鄭州 450000)

      肝細(xì)胞肝癌(以下簡稱肝癌)是全世界最常見的惡性腫瘤之一。研究表明,我國是全球肝癌發(fā)病數(shù)和病死數(shù)最多的國家,約占全球一半以上[1-3]。目前,治療肝癌的主要方法是手術(shù)切除,但術(shù)后患者5年生存率僅約為50%,其復(fù)發(fā)率高達(dá)70%。導(dǎo)致肝癌患者預(yù)后不良的原因通常是缺乏有效的早期診斷[4-6]。因此,臨床亟須尋找一種與肝癌發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),且能預(yù)測患者復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移及預(yù)后的新型指標(biāo),從而為肝癌的早期診斷和治療提供新策略。

      越來越多的證據(jù)表明,長鏈非編碼RNA(lncRNA)的表達(dá)具有組織特異性,在多種腫瘤中經(jīng)常表達(dá)失調(diào),一些lncRNA與腫瘤復(fù)發(fā)和預(yù)后不佳相關(guān)[7-8]。lncRNA被定義為長度超過200個核苷酸的非蛋白編碼轉(zhuǎn)錄本,一般來說,約78%的lncRNA具有組織特異性。除了更高的組織特異性外,lncRNA還具有更高的發(fā)育階段特異性,以及在異質(zhì)組織(如人類新皮層)中的細(xì)胞亞型特異性[9-10]?,F(xiàn)有研究指出,lncRNA可作為癌癥患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的分子標(biāo)志物,與癌癥的進(jìn)展密切相關(guān)[11]。lncRNA NCK1-AS1是lncRNA家族成員之一,在宮頸癌、前列腺癌的相關(guān)研究中顯示,其表達(dá)與患者不良預(yù)后相關(guān)[12-13]。本研究通過分析lncRNA NCK1-AS1在肝癌組織中的表達(dá)特點(diǎn),探討其與臨床病理指標(biāo)、預(yù)后的關(guān)系,以期為肝癌的診斷提供新靶點(diǎn)。

      1 資料與方法

      1.1一般資料 選取2015年4月至2017年6月本院肝癌確診患者73例,其中男48例,女25例;年齡42~78歲,平均54.4歲。所有患者均按照世界衛(wèi)生組織中關(guān)于肝癌的診斷標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行確診,且在術(shù)前未接受過放化療。采集肝癌組織及配對的癌旁組織(癌旁組織取于距腫瘤病灶2 mm以上的肝癌組織),放入凍存管進(jìn)行標(biāo)記,液氮貯存。根據(jù)肝癌組織中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平將研究對象分為高表達(dá)組(33例)和低表達(dá)組(40例)。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),所有患者均知情且簽署知情同意書。術(shù)后對所有患者進(jìn)行上門或電話隨訪,隨訪時間為手術(shù)當(dāng)天至死亡當(dāng)天或隨訪截止日。

      1.2方法 (1)采用實(shí)時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)檢測lncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平。利用Trizol法提取組織樣品或培養(yǎng)細(xì)胞的總RNA,利用RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。以cDNA為模板,利用Primer5.0設(shè)計引物,lncRNA NCK1-AS1正向引物為5′-TTC CCA TTT CTC CCA GGT CC-3′,反向引物為5′-TGG TTA CTT TGA GCC TGC CT-3′;β-actin正向引物為5′-AGC CTC GCC TTT GCC GA-3′,反向引物為5′-CTG GTG CCT GGG GCG-3′;miR-361-5p正向引物為GGG AGG TTA TCA GAA TCT CCA GG,反向引物為CAG TGC GTG TCG TGG AGT;U6正向引物為5′-ATT GGA ACG ATA CAG AGA AGA TT-3′,反向引物:5′-GGA ACG CTT CAC GAT TTG-3′。根據(jù)PCR試劑盒添加各組試劑配制熒光定量PCR反應(yīng)體系,反應(yīng)程序采用兩步法,每組設(shè)置3個重復(fù),以β-action/U6為參照基因,采用2-ΔΔCt法計算lncRNA NCK1-AS1的相對表達(dá)水平。(2)lncRNA NCK1-AS1靶向基因預(yù)測。通過Starbase數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn)lncRNA NCK1-AS1的靶向miR-361-5p,分析lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p表達(dá)的相關(guān)性。RNA提取試劑盒、Trizol試劑、熒光定量試劑盒均購自上海百研生物科技有限公司;引物序列由北京六合華大基因科技有限公司合成;NanoDrop微量核酸測定儀購自上海創(chuàng)萌生物科技有限公司。

      2 結(jié) 果

      2.1肝癌組織和癌旁組織中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平比較 肝癌組織組中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1相對表達(dá)量高于癌旁組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見圖1。

      圖1 肝癌組織和癌旁組織中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1表達(dá)情況

      2.2不同lncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平組臨床病理參數(shù)比較 低表達(dá)組分化程度、淋巴轉(zhuǎn)移及TNM分期情況與高表達(dá)組比較,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表1。

      表1 不同lncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平組臨床病理參數(shù)比較(n)

      續(xù)表1 不同lncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平組臨床病理參數(shù)比較(n)

      2.3不同lncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平組生存期比較 低表達(dá)組中位生存期為20個月,明顯高于高表達(dá)組的15個月,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。

      2.4lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p表達(dá)的相關(guān)性分析 通過Starbase數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn),lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p存在靶向調(diào)控位點(diǎn),見圖2A。肝癌組織中miR-361-5p相對表達(dá)量低于癌旁組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見圖2B。lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(r2=0.078 6,P<0.001),見圖2C。利用Starbase數(shù)據(jù)庫進(jìn)行l(wèi)ncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p共表達(dá)分析,兩者呈負(fù)相關(guān)(P<0.05),見圖2D。

      A為lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p的靶向序列信息;B為miR-361-5p在肝癌組織和癌旁組織中的表達(dá);C為lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p表達(dá)的相關(guān)性;D為lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p共表達(dá)分析。

      3 討 論

      肝癌惡性程度高、隱匿性強(qiáng)、進(jìn)展速度快,很多患者就診時已處于中晚期,失去手術(shù)機(jī)會。另外,肝癌術(shù)后易復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致5年生存率低。肝癌的發(fā)生、發(fā)展涉及多步驟、多階段漸進(jìn)演化,囊括多種基因的異常表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的變化[14]。既往研究顯示lncRNA可參與腫瘤發(fā)生、發(fā)展過程,可能通過DNA、RNA、蛋白質(zhì)3個方面參與復(fù)雜的分子調(diào)控機(jī)制。由于lncRNA的表達(dá)量或狀態(tài)均可作為效應(yīng)分子,其表達(dá)水平高低反映腫瘤性質(zhì),故其與mRNA相比,是更好的腫瘤診斷層面標(biāo)志物[15]。lncRNA作為一種新型腫瘤標(biāo)志物,在肝癌組織發(fā)生、發(fā)展的調(diào)控過程中具有不可小覷的作用,對深入探究肝癌的發(fā)病機(jī)制并制定有效的早期診斷及治療策略具有重要意義。

      國內(nèi)外研究表明,lncRNA NCK1-AS1在膀胱癌、卵巢癌、宮頸癌、鼻咽癌中發(fā)揮重要作用。lncRNA NCK1-AS1在宮頸癌中過表達(dá),并通過與miR-134的相互作用促進(jìn)癌細(xì)胞的遷移侵襲和細(xì)胞增殖[16]。有研究發(fā)現(xiàn),lncRNA NCK1-AS1促進(jìn)NCK1表達(dá)會抑制化療過程中化學(xué)耐藥性的發(fā)展,促進(jìn)卵巢癌的發(fā)生[17]。有研究顯示,前列腺癌中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1表達(dá)會上調(diào),而沉默lncRNA NCK1-AS1抑制了這種作用,會抑制膀胱癌細(xì)胞增殖和腫瘤細(xì)胞干性[18]。沉默lncRNA NCK1-AS1表達(dá)通過上調(diào)miR-135a抑制鼻咽癌癌細(xì)胞的遷移和侵襲[19]。lncRNA NCK1-AS1表達(dá)在肝癌中的作用研究鮮有報道。本研究利用qRT-PCR檢測肝癌患者肝癌組織和癌旁組織中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1表達(dá)發(fā)現(xiàn),肝癌組織中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1表達(dá)水平明顯高于癌旁組織,lncRNA NCK1-AS1表達(dá)與分化程度、淋巴轉(zhuǎn)移和TNM分期等生物學(xué)行為相關(guān),且lncRNA NCK1-AS1高表達(dá)患者預(yù)后較lncRNA NCK1-AS1低表達(dá)患者差。提示lncRNA NCK1-AS1可能成為肝癌預(yù)后的分子標(biāo)記物。通過Starbase數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn),miR-361-5p可能為lncRNA NCK1-AS1潛在的靶向調(diào)控位點(diǎn)。肝癌患者miR-361-5p表達(dá)下調(diào),其可通過靶向血管內(nèi)皮生長因子A抑制肝癌細(xì)胞增殖和侵襲。miR-361-5p可通過抑制CXC趨化因子受體6表達(dá)而抑制肝癌細(xì)胞增殖,過表達(dá)miR-361-5p可顯著抑制裸鼠體內(nèi)腫瘤生長。本研究結(jié)果顯示,肝癌組織miR-361-5p表達(dá)下調(diào),lncRNA NCK1-AS1與miR-361-5p表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。因此,lncRNA NCK1-AS1可能通過調(diào)控miR-361-5p表達(dá)來發(fā)揮作用。

      綜上所述,肝癌組織中l(wèi)ncRNA NCK1-AS1呈高表達(dá),與患者不良預(yù)后相關(guān),其可能通過調(diào)控miR-361-5p表達(dá)來發(fā)揮作用。lncRNA NCK1-AS1可能會成為研究肝癌致病的分子機(jī)制之一,并可能成為肝癌診斷和預(yù)后判斷的新靶點(diǎn)。

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