陳小康,李芳芳,王文斌,單衛(wèi)星,杜 羽
(1.西北農(nóng)林科技大學(xué) 園藝學(xué)院,陜西楊凌 712100;2.西北農(nóng)林科技大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,陜西楊凌 712100)
馬鈴薯(SolanumtuberosumL.)是全球第四大重要糧食作物,同時(shí)在中國(guó)也是重要的蔬菜作物[1]。其營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高、適應(yīng)性強(qiáng)、產(chǎn)量大,在人類生活中發(fā)揮著非常重要的作用,但是生物和非生物脅迫對(duì)馬鈴薯造成的損失仍然不容忽視。隨著中國(guó)市場(chǎng)對(duì)馬鈴薯的需求不斷增加,馬鈴薯產(chǎn)量的提升、農(nóng)藝性狀的改良以及優(yōu)質(zhì)品種的選育已成為馬鈴薯產(chǎn)業(yè)的戰(zhàn)略性目標(biāo)。然而,由于栽培馬鈴薯屬于部分異源四倍體,雜合性高,利用常規(guī)雜交育種手段很難在較短時(shí)間內(nèi)育成優(yōu)良品種,近年來(lái)人們?cè)噲D用基因工程技術(shù)對(duì)馬鈴薯品種進(jìn)行農(nóng)藝性狀改良。目前四倍體和二倍體的馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化體系不斷被優(yōu)化,但是關(guān)于馬鈴薯的遺傳轉(zhuǎn)化仍然存在基因依賴性問(wèn)題[2-3],對(duì)馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化體系的改良和優(yōu)化仍然是基因工程的重要技術(shù)改革。馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化的改良和優(yōu)化包括載體的選擇和轉(zhuǎn)化方法的優(yōu)化,載體的選擇取決于基因的功能,一般對(duì)于基因功能的驗(yàn)證包括過(guò)表達(dá)和基因沉默,本研究主要利用RNAi載體進(jìn)行基因沉默,并獲得一種高效的馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化體系。目前,在作物中借助RNAi載體并結(jié)合遺傳轉(zhuǎn)化驗(yàn)證基因功能的報(bào)道有很多,例如李奇科等[4]構(gòu)建了以PVY的CP為靶標(biāo)的RNAi表達(dá)載體pROKY300,實(shí)現(xiàn)了馬鈴薯Y病毒CP基因在煙草中的沉默;安然等[5]利用RNAi表達(dá)載體pCEI-PFR,通過(guò)沉默馬鈴薯Sgt1-3基因來(lái)減少塊莖糖苷生物堿積累;水稻抗旱基因OsbHLH120RNAi干擾載體的構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化為進(jìn)一步研究OsbHLH120在水稻抗旱過(guò)程中的作用奠定基礎(chǔ)[6]。關(guān)于利用RNAi載體在馬鈴薯中的運(yùn)用也有報(bào)道,如沉默馬鈴薯周皮層中StKCS6基因?qū)е履舅ㄙ|(zhì)和蠟化合物的鏈長(zhǎng)減少,同時(shí)增強(qiáng)表皮蒸騰作用;利用RNAi技術(shù)沉默馬鈴薯中的PVS基因,可以減少植物抗毒素的生成從而促進(jìn)致病疫霉菌的侵染;RNAi介導(dǎo)的內(nèi)源性Vlnv基因沉默可穩(wěn)定降低馬鈴薯冷誘導(dǎo)產(chǎn)生的甜味[7-9]。對(duì)馬鈴薯作物而言,目前發(fā)掘?qū)嵱们腋咝У腞NAi沉默系統(tǒng)和改良遺傳轉(zhuǎn)化體系仍然具有重要意義。
RNA沉默(RNA interference,RNAi)是指生物體內(nèi)源性或外源性雙鏈RNA(dsRNA)介導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)mRNA被特異性降解,導(dǎo)致靶標(biāo)基因被沉默,從而產(chǎn)生相應(yīng)的功能表型的缺失現(xiàn)象[10]。RNAi技術(shù)在植物體內(nèi)應(yīng)用廣泛,其原理為:將構(gòu)建的RNAi植物表達(dá)載體導(dǎo)入植物體內(nèi),形成轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物dsRNA(double stranded RNA,dsRNA),然后dsRNA被植物體內(nèi)的內(nèi)切核酸酶Dicer切割成由正義和反義序列組成的,大小為21~25nt的干擾性小dsRNA(small interfering RNA, siRNA),由siRNAs中的反義鏈指導(dǎo)形成RNA介導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA-induced silencing complex,RISC)會(huì)特異性降解與siRNA同源的靶標(biāo)mRNA,從而實(shí)現(xiàn)基因沉默[11]。
在植物中,MAPK(絲裂原活化蛋白激酶)級(jí)聯(lián)途徑與生物及非生物脅迫響應(yīng)、細(xì)胞分化和發(fā)育以及激素反應(yīng)密切相關(guān)。MAPK 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)由 MAPK 級(jí)聯(lián)反應(yīng)逐級(jí)傳遞,在感受刺激后,上游的 MAPKKK 首先被磷酸化并特異激活 MAPKK,MAPKK 被激活后,緊接著磷酸化并激活下游的 MAPK,MAPK 被激活后可以磷酸化下游特定的轉(zhuǎn)錄因子或相關(guān)蛋白,并調(diào)節(jié)各類應(yīng)答基因表達(dá)[12]。目前在植物中對(duì)于 MAPK 的研究報(bào)道較多,例如,AtMEKK1在水楊酸介導(dǎo)的防御反應(yīng)中和活性氧穩(wěn)態(tài)的調(diào)節(jié)過(guò)程中發(fā)揮重要作用[13],擬南芥 MKK1蛋白信號(hào)通路調(diào)節(jié)應(yīng)答效應(yīng)子的基因表達(dá),并在病原體防御中發(fā)揮重要作用[14]。擬南芥mkk2突變體植株對(duì)鹽害的耐受性減弱,反之,過(guò)表達(dá) MKK2的轉(zhuǎn)基因植株對(duì)鹽害的耐受性增加,表明擬南芥MKK2介導(dǎo)植物對(duì)冷害和鹽害的脅迫響應(yīng)[15]。番茄SlMKK2和SlMKK4正調(diào)控番茄對(duì)灰葡萄孢的免疫反應(yīng)[16]。棉花GhMKK1通過(guò)降低PR基因的表達(dá)水平負(fù)調(diào)控棉花對(duì)青枯菌的抗性[17]。目前關(guān)于MKK1基因在擬南芥、番茄、棉花、水稻、玉米作物中的作用均有報(bào)道[14-19],但在馬鈴薯中還未報(bào)道,MKK1作為 MAPK 級(jí)聯(lián)反應(yīng)的中間核心成員,在植物生長(zhǎng)發(fā)育以及植物免疫調(diào)節(jié)中發(fā)揮著非常重要的作用。本研究通過(guò)克隆AtMKK1在馬鈴薯中的同源基因StMKK1,選定StMKK1保守且特異的靶序列,利用 RNA干擾技術(shù),構(gòu)建由 CaMV35S 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的內(nèi)含“正向StMKK1靶標(biāo)片段-pdk intron-反向StMKK1靶標(biāo)片段”結(jié)構(gòu)的 RNAi 植物表達(dá)載體,利用根癌農(nóng)桿菌將其轉(zhuǎn)入馬鈴薯品種 Desiree 中,從而獲得沉默StMKK1基因的馬鈴薯轉(zhuǎn)基因植株。以期為馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化體系優(yōu)化和技術(shù)改良提供新的思路和方法,同時(shí)為研究StMKK1在馬鈴薯生長(zhǎng)發(fā)育和免疫調(diào)節(jié)中可能發(fā)揮的功能奠定基礎(chǔ)。
四倍體馬鈴薯栽培品種Desiree來(lái)自西北農(nóng)林科技大學(xué),組培苗于西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院組培間培養(yǎng),MS30培養(yǎng)基配方為: 4.43 g·L-1MS(粉末購(gòu)自美國(guó)Phytotech公司)+30 g·L-1蔗糖+8 g·L-1瓊脂,培養(yǎng)條件為23 ℃ 16 h光照培養(yǎng),光照度3 000 lx,16 ℃ 8 h黑暗培養(yǎng)。取苗齡大約5~7周生長(zhǎng)健壯的無(wú)菌苗用于試驗(yàn)。試驗(yàn)所用激素:2, 4-二氯苯氧乙酸(2,4-D)和激動(dòng)素(Kinetine)均購(gòu)自Phytotech公司,卡那霉素(Kanamycine)、萬(wàn)古霉素(Vancomycine)和塞胞霉素(Cefotaxime)均購(gòu)自索萊寶公司,萘乙酸(NAA)、6-芐基嘌呤(6-BA)、反式玉米素(trans-Zeatin-riboside)均購(gòu)自Sigma公司。R3B培養(yǎng)基配方為:4.43 g·L-1MS+30 g·L-1蔗糖,pH調(diào)至5.8后用ddH2O定容,最后加入8 g·L-1Agar,121 ℃高壓滅菌30 min,待稍冷卻后加入2.0 mg·L-1NAA和1.0 mg·L-16-BA;PACM液體培養(yǎng)基配方為:4.43 g·L-1MS+30 g·L-1蔗糖+2.0 g·L-1水解酪蛋白, pH調(diào)至6.5后用ddH2O定容,121 ℃高壓滅菌30 min,待稍冷卻后加入0.5 mg·L-1激動(dòng)素和1 mg·L-12, 4-D;Zcvk固體培養(yǎng)基配方為: 4.43 g·L-1MS+20 g·L-1蔗糖,調(diào)pH至5.8后加入8 g·L-1Agar,121 ℃高壓滅菌30 min,冷卻后加入100 mg·L-1卡那霉素、200 mg·L-1的塞胞霉素(Cefotaxime)、200 mg·L-1萬(wàn)古霉素(Vancomycine)以及1.0 mg·L-1的反氏玉米素。500 mL LB培養(yǎng)基配方為: Trptone 5 g,yeast extract 2.5 g,NaCl 5 g,Agar 3.8 g(液體培養(yǎng)基不加瓊脂),用ddH2O 定容,高壓滅菌后使用。
所用高保真酶Fast pfu DNA polymerase、DNA聚合酶EasyTaqDNA Polymerase、連接酶T4DNA Ligase、限制性內(nèi)切酶(promega):EcoRI、KpnⅠ、XbaⅠ、HindⅢ、XhoⅠ、NotⅠ等??股兀蝴}酸壯觀霉素、利福平霉素、慶大霉素、卡那霉素。瓊脂糖、hydragreen無(wú)毒核酸染料、DNA loading Buffer、DNA marker Ⅲ(購(gòu)自天根生化科技有限公司)。PCR儀、電泳儀、化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)(BIO-RAD)、藍(lán)光儀(TGreen Transilluminator Plus)電穿孔儀等。
試驗(yàn)所用農(nóng)桿菌的菌株為GV3101,大腸桿菌DH5α,所用載體為PKANNIBAL和植物表達(dá)載體pART27,均來(lái)自旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。
1.2.1 RNAi載體構(gòu)建 根據(jù) National Center for Biotechnology Information(NCBI)和茄科數(shù)據(jù)庫(kù)(https://solgenomics.net/)上公布的StMKK1序列信息,其GeneBank號(hào)為(XM_006353485.2),利用 Bioedit和DNAMAN 6.0 軟件比對(duì)StMKK1與其他物種的保守區(qū)段,確定特異靶標(biāo)序列,并利用 primer 5.0 軟件設(shè)計(jì)來(lái)自正向靶標(biāo)序列的特異性引物StMKK1RNAi1EcoRI-F和StMKK1RNAi1KpnⅠ-R以及來(lái)自反向靶標(biāo)序列的特異性引物StMKK1RNAi1XbaⅠ-F和StMKK1RNAi1HindⅢ-R,引物序列見(jiàn)表 1。載體構(gòu)建部分參照李奇科等[4]的方法,以 Desiree 的 cDNA 為模板對(duì)正反向靶標(biāo)序列進(jìn)行克隆。反應(yīng)程序: 95 ℃預(yù)變性 2 min;95 ℃變性 20 s,52 ℃退火 20 s,72 ℃延伸 20 s,循環(huán) 35 次。在瓊脂糖凝膠中檢測(cè),135 V恒壓30 min 電泳,使用化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)(BIO-RAD)拍照,利用膠回收試劑盒回收目的基因片段。以旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室已有的通過(guò)NotⅠ酶切位點(diǎn)連接的 PKANNIBAL和 pART27 雙元重組載體 35s-pART27 為基礎(chǔ),將質(zhì)粒 35s-pART27 進(jìn)行HindⅢ和XbaⅠ雙酶切反應(yīng),與被HindⅢ 和XbaⅠ 雙酶切的StMKK1的反向靶標(biāo)序列進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞 DH5α,得到含有反向片段的重組克隆載體,測(cè)序正確后,命名為 35s-StMKK1R-pART27。然后對(duì) 35s-StMKK1R-pART27 進(jìn)行EcoRI和KpnⅠ 雙酶切反應(yīng),與同樣進(jìn)行EcoRI 和KpnⅠ 雙酶切的StMKK1的正向靶標(biāo)序列進(jìn)行連接,然后轉(zhuǎn)化大腸桿菌,最終得到反向重復(fù)序列的重組 RNAi 表達(dá)載體,測(cè)序正確后命名為35s-StMKK1-pART27-RNAi,然后將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到 GV3101 的農(nóng)桿菌菌株中。
1.2.2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化 農(nóng)桿菌的活化:取出-80 ℃冰箱凍存的含有質(zhì)粒的GV3101農(nóng)桿菌菌株,在含有Spec(壯觀霉素)、Gen(慶大霉素)和Rif(利福平霉素)抗性的LB平板上劃線;挑取菌落到2 mL液體LB(含Spec、Gen和Rif),在水平搖床上200 r/min 28 ℃過(guò)夜培養(yǎng)。待OD達(dá)到0.5后收集菌液,利用離心機(jī)2 500 g離心10 min,加入與原菌液等體積的LB重懸菌體,得到細(xì)菌轉(zhuǎn)化液。提前24 h用手術(shù)刀切2~5 mm馬鈴薯莖段作為外植體,將其轉(zhuǎn)移到R3B培養(yǎng)基中,之后在培養(yǎng)皿中加入2 張無(wú)菌濾紙以及2 mL的液體PACM進(jìn)行預(yù)培養(yǎng)(培養(yǎng)條件為23 ℃, 16 h光照培養(yǎng),光照度3 000 lx, 16 ℃ 8 h黑暗培養(yǎng)),然后將外植體轉(zhuǎn)移到細(xì)菌轉(zhuǎn)化液中,浸泡5~10 min后用無(wú)菌濾紙干燥,然后將其放回新的R3B培養(yǎng)基中,用封口膜封口,初步誘導(dǎo)愈傷組織,黑暗培養(yǎng)48 h后,將其轉(zhuǎn)到Zcvk培養(yǎng)基中培養(yǎng),誘導(dǎo)愈傷組織和芽分化。培養(yǎng)半個(gè)月后,更換新的Zcvk培養(yǎng)基,直到獲得轉(zhuǎn)基因植株。當(dāng)誘導(dǎo)出芽后,將其轉(zhuǎn)移到帶有卡那抗性的MS30培養(yǎng)基中進(jìn)行篩選鑒定。愈傷組織誘導(dǎo)率=形成愈傷的外植體數(shù)/外植體總數(shù)×100%,芽誘導(dǎo)率=形成芽的愈傷數(shù)/形成愈傷的外植體數(shù)×100%,轉(zhuǎn)化率=形成芽的愈傷數(shù)/外植體總數(shù)×100%。
1.2.3 轉(zhuǎn)基因植株P(guān)CR檢測(cè) 參照Fan等[20]的方法,提取馬鈴薯擬轉(zhuǎn)化植株的基因組DNA。流程為:取葉片組織0.2 g,在液氮下磨碎至粉末狀,用干凈的藥勺轉(zhuǎn)移粉末到2 mL離心管,加入800 μL提前預(yù)熱的CTAB buffer。混勻后放置65 ℃水浴中保溫30~40 min,并不時(shí)輕輕搖動(dòng)試管。冷卻至室溫后,加入約640 μL Tris-飽和酚(pH 8.0,含體積分?jǐn)?shù)為1%的2-巰基乙醇),顛倒混勻,室溫靜置10 min。加入160 μL氯仿,充分混勻后置于冰上5 min,然后12 000 g 4 ℃離心15 min,轉(zhuǎn)移上清至新的離心管(約1 mL),緊接著加入640 μL的異丙醇,混勻,在-20 ℃沉淀 1 h以上,然后室溫12 000 g離心15 min,回收DNA沉淀。用體積分?jǐn)?shù)為80%乙醇清洗DNA,室溫12 000 g離心5 min,棄去上清液,再次離心10 s,用槍頭移去殘留液后,置超凈工作臺(tái)中干燥約2 min,將DNA溶于20 μL ddH2O。取1 μL DNA作為模板進(jìn)行PCR 檢測(cè),并以特異引物StMKK1RNAi1KpnⅠ-R:5′-GGGGTACCTAGC- TCAGTAAGTGTTGCCAATG-3′和pKAN-F:5′-CAATCCCACTATC CTTCGCA-3′進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,引物由北京奧科公司合成。PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性8 min;94 ℃變性30 s,52 ℃退火25 s,72 ℃延伸30 s,循環(huán)30次。所用體系為: 0.5 μg·μL-1DNA 模板1 μL,10×EasyTaqbuffer 2.5 μL,引物各0.5 μL,2.5 mmol·L-1dNTPs 2 μL, EasyTaqDNA polymerase 0.2 μL ,用ddH2O定容至總體積25 μL。預(yù)期擴(kuò)增片段大小為302 bp左右,以未轉(zhuǎn)化Desiree植株為陰性對(duì)照。擴(kuò)增產(chǎn)物使用10 g·L-1瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳。
1.2.4 轉(zhuǎn)基因植株qRT-PCR檢測(cè) 植物總RNA提取完全參照Plant RNA Kit試劑盒說(shuō)明書(shū)(貨號(hào)R6827-01)進(jìn)行,完全按照TaKara公司反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTMRT regent kit,貨號(hào)RR047A)說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。完全參照FastStart Universal SYBR Green Master(ROX)(貨號(hào)為No.04913914001)說(shuō)明書(shū),以25 μL體系在Life Technologies公司生產(chǎn)的Q5實(shí)時(shí)定量PCR儀上進(jìn)行反應(yīng)和檢測(cè)。使用特異引物StMKK1-transgeneqpcr-F:5′-TTGCTAATCAATCACA-GAGGTG-3′和StMKK1-transgeneqpcr-R:5′-TGTCGCTTTTGTAATCATAGGC-3′。
表1 引物序列Table 1 Primer sequences
利用StMKK1的正反向靶標(biāo)序列的特異性引物分別擴(kuò)增得到大小為302 bp的正向干擾片段和反向干擾片段(圖1-A),將載體重組質(zhì)粒35s-pART27進(jìn)行XbaⅠ和HindⅢ雙酶切反應(yīng),與空質(zhì)粒相比,酶切后的質(zhì)粒條帶更大,證明載體已被線性化(圖1-B),酶切后的35s-pART27與反向干擾片段連接并轉(zhuǎn)化,菌落PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳后,得到300 bp左右的目標(biāo)條帶,測(cè)序驗(yàn)證后,獲得含有反向干擾片段的重組克隆載體,命名為35s-StMKK1R-pART27(圖1-C),然后用EcoRI和KpnⅠ分別酶切正向干擾片段和35s-StMKK1R-pART27載體(圖1-D)并連接,進(jìn)行菌落PCR檢測(cè),結(jié)果顯示在瓊脂糖凝膠中出現(xiàn)300 bp左右大小的條帶(圖1-E),提取重組表達(dá)載體送北京奧科公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果完全正確,得到含有反向重復(fù)序列的重組RNAi植物表達(dá)載體35s-StMKK1-pART27-RNAi。并創(chuàng)建35s-StMKK1-pART27-RNAi載體的結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)圖(圖2)。
以馬鈴薯莖段作為外植體,在含有35s-StMKK1-pART27-RNAi質(zhì)粒的細(xì)菌轉(zhuǎn)化液中,浸泡5~10 min(圖3-A),完成侵染后用無(wú)菌濾紙進(jìn)行外植體干燥,將其放回R3B培養(yǎng)基中用封口膜封口,黑暗培養(yǎng)48 h后,將其轉(zhuǎn)移到Zcvk培養(yǎng)基中(圖3-B)培養(yǎng),每半月更換Zcvk培養(yǎng)基,直到獲得轉(zhuǎn)基因植株(圖3-C~圖3-F)。當(dāng)誘導(dǎo)出芽后,將其轉(zhuǎn)到帶有卡那抗性的MS30培養(yǎng)基中進(jìn)行篩選鑒定,經(jīng)統(tǒng)計(jì)共切了90個(gè)莖段外植體,誘導(dǎo)出愈傷約為72個(gè),分化不定芽約為53個(gè),所用體系的愈傷誘導(dǎo)率可達(dá)80%,芽分化率可達(dá)74%。
2.3.1 馬鈴薯轉(zhuǎn)基因植株的PCR檢測(cè) 隨機(jī)挑選經(jīng)過(guò)卡那抗生素篩選的17株馬鈴薯轉(zhuǎn)化植株提取基因組DNA,以此為模板用pKAN-F和StMKK1RNAi1KpnⅠ-R引物進(jìn)行PCR檢測(cè),以未轉(zhuǎn)化的Desiree植株作為對(duì)照,結(jié)果顯示有16株轉(zhuǎn)基因苗擴(kuò)增出302 bp左右的目標(biāo)條帶,對(duì)照Desiree沒(méi)有擴(kuò)增出目標(biāo)條帶。初步證明StMKK1靶序列已整合到馬鈴薯的基因組中(圖4)。
A.目的基因的擴(kuò)增,1~2. StMKK1正向和反向干擾序列擴(kuò)增片段;B. 35s-pART27重組質(zhì)粒的HindⅢ和XbaⅠ酶切檢測(cè),1. 重組質(zhì)粒35s-pART27,2~3.35s-pART27質(zhì)粒被HindⅢ和XbaⅠ雙酶切后的條帶;C.連接反向干擾片段載體的菌落PCR檢測(cè),1~5. 挑選的5個(gè)候選菌落;D.重組35s- StMKK1R-pART27質(zhì)粒的EcoRⅠ和KpnⅠ雙酶切檢測(cè),1.重組 StMKK1反向片段質(zhì)粒35s- StMKK1R-pART27,2~3.35s- StMKK1R-pART27質(zhì)粒被EcoRⅠ和KpnⅠ雙酶切后的條帶;E.連接正向干擾片段的菌落PCR檢測(cè),1~8.挑選的8個(gè)候選菌落; M.DNA marker Ⅲ
CaMV35S.35s啟動(dòng)子;Noster.終止子;PDK Intron.丙酮酸磷酸雙激酶內(nèi)含子;MCS.多克隆酶切位點(diǎn);StMKK1F.StMKK1的正向干擾片段;StMKK1R.StMKK1的反向干擾片段
2.3.2 馬鈴薯轉(zhuǎn)基因植株的qRT-PCR檢測(cè) 將PCR鑒定結(jié)果為陽(yáng)性的株系提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄后以此為模板,對(duì)外源基因表達(dá)情況進(jìn)行分析。以馬鈴薯的Stactin-7like基因(XM_006350963)作為內(nèi)參基因,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)馬鈴薯轉(zhuǎn)化植株葉片中StMKK1基因的表達(dá)量,結(jié)果表明:與未轉(zhuǎn)化的Desiree相比,StMKK1基因在轉(zhuǎn)基因植株(RNAi-2-RNAi12)中的表達(dá)量均顯著下降(其中RNAi-9植株除外),降幅達(dá)到92%以上,與未轉(zhuǎn)化Desiree相比,RNAi-9植株中StMKK1基因的表達(dá)量沒(méi)有顯著差異,充分證明轉(zhuǎn)基因植株中StMKK1基因的表達(dá)基本都受到一定程度的干擾(圖5)。
A.馬鈴薯莖段剛接種;B.外植體轉(zhuǎn)移到Zcvk培養(yǎng)基誘導(dǎo)愈傷組織;C.轉(zhuǎn)移到Zcvk培養(yǎng)基誘導(dǎo)出不定芽;D.將芽轉(zhuǎn)移到MS30培養(yǎng)基誘根;E.生根;F.植株再生
M.DNA markerⅢ;CK.Desiree;1~20.轉(zhuǎn)基因植株的PCR擴(kuò)增條帶
RNAi主要過(guò)程是dsRNA被內(nèi)切核酸酶切割成21~25 nt的干擾性小RNA(siRNA),同時(shí)由siRNA介導(dǎo)識(shí)別并靶向切割同源性靶mRNA分子。一般所用RNAi載體的基本構(gòu)成就是在強(qiáng)組成型啟動(dòng)子下游插入反向重復(fù)片段的重組雙元載體,是導(dǎo)致RNA沉默的基本結(jié)構(gòu),所建成的35s-StMKK1-pART27-RNAi就是采用在基因組中產(chǎn)生反向重復(fù)序列的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,實(shí)現(xiàn)沉默StMKK1基因的目的。本研究利用pKANNIBAL載體兩個(gè)多克隆位點(diǎn)間的間隔序列構(gòu)建尾尾相連而導(dǎo)致基因產(chǎn)生自我互補(bǔ)的hpRNA(分子dSRNA)結(jié)構(gòu)。RNAi沉默載體中反向重復(fù)序列結(jié)構(gòu)中的間隔序列可以是任一段核酸,據(jù)相關(guān)試驗(yàn)證明[21],間隔序列為內(nèi)含子的反向重復(fù)序列,具有良好的穩(wěn)定性,更有利于dsRNA的產(chǎn)生和RNA沉默的誘導(dǎo)。
StMKK1在野生型Desiree和8個(gè)獨(dú)立的轉(zhuǎn)基因植株中的表達(dá)水平
近些年來(lái),隨著CRISPR-Cas9定點(diǎn)基因編輯技術(shù)在植物中的應(yīng)用,由于其可以進(jìn)行基因敲除(單個(gè)基因敲除,多基因敲除以及大片段缺失)以及精確的堿基編輯,轉(zhuǎn)錄激活和轉(zhuǎn)錄抑制,逐漸成為人們使用的熱門(mén)技術(shù)[22]。在擬南芥、小麥、高粱、煙草、水稻、玉米、苔蘚植物以及地錢(qián)等植物中實(shí)現(xiàn)了定點(diǎn)基因組編輯的成功應(yīng)用[23]。但是在馬鈴薯上應(yīng)用的報(bào)道較少,一方面可能是由于馬鈴薯是四倍體,基因組信息復(fù)雜,數(shù)據(jù)庫(kù)信息不完整可能容易脫靶,另外一方面就是馬鈴薯CRISPR-Cas9體系仍然需要改進(jìn)和優(yōu)化,使其具有廣譜性。目前很多學(xué)者在馬鈴薯上進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化仍然使用RNAi干擾技術(shù)。本研究利用RNAi干擾技術(shù)對(duì)StMKK1基因在馬鈴薯中進(jìn)行沉默,獲得了高達(dá)92%以上的沉默效率,故所使用的RNAi載體具有高程度的干擾效率。
關(guān)于馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化體系的報(bào)道有很多,如在Desiree中穩(wěn)定表達(dá)StMYB44,通過(guò)抑制StPHO1的表達(dá)來(lái)負(fù)調(diào)控馬鈴薯中的Pi轉(zhuǎn)運(yùn)[24]。在馬鈴薯中過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)化PiSIF3可以顯著促進(jìn)致病疫霉的侵染[25]。辛翠花等[26]以Desiree的葉片和莖段為外植體,獲得了具有抗晚疫病功能的馬鈴薯轉(zhuǎn)基因植株。使用artificial microRNA技術(shù)在馬鈴薯中沉默CBP80/ABH1基因,提高馬鈴薯的抗旱性[27]。但是關(guān)于馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化體系,不同的實(shí)驗(yàn)室體系有差異,其轉(zhuǎn)化條件也不一樣。即使同一材料的遺傳轉(zhuǎn)化方法也是有差異的,一般認(rèn)為馬鈴薯的遺傳轉(zhuǎn)化效率受植物的基因型、農(nóng)桿菌菌株類型、外植體類型、激素配比、侵染時(shí)間、共培養(yǎng)時(shí)間、農(nóng)桿菌菌液濃度等因素的影響。辛翠花等[26]研究發(fā)現(xiàn),以馬鈴薯葉片作為外植體,愈傷誘導(dǎo)率為60%,芽分化率為50%,遺傳轉(zhuǎn)化效率為30%,明顯低于本研究以莖段作為外植體所獲得的80%愈傷誘導(dǎo)率和74%的芽分化率以及59%的遺傳轉(zhuǎn)化效率。而裴瑞芳等[28]以馬鈴薯試管薯作為侵染材料,同樣獲得馬鈴薯的轉(zhuǎn)化植株,證實(shí)馬鈴薯的多個(gè)組織均可以被用作侵染材料從而獲得轉(zhuǎn)化植株。安然等[5]以馬鈴薯品種‘莊薯3號(hào)’和Favorita 組培苗作為侵染材料,以莖段作為外植體,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法,所用激素與本研究大致相同,獲得了60.23%的芽分化率,而本研究以四倍體栽培種Desiree組培苗作為侵染材料,獲得了74%的芽分化率,但獲得轉(zhuǎn)化植株從宏觀角度顯示馬鈴薯品種不同轉(zhuǎn)化效率也是不一致的。本研究利用常規(guī)的農(nóng)桿菌介導(dǎo)方法,以莖段作為外植體,農(nóng)桿菌的侵染濃度為OD=0.5,侵染時(shí)間為7 min,PACM培養(yǎng)基用來(lái)輔助侵染和預(yù)培養(yǎng),利用R3B培養(yǎng)基誘導(dǎo)愈傷組織,Zcvk培養(yǎng)基誘導(dǎo)芽分化。轉(zhuǎn)化周期為90 d左右,經(jīng)統(tǒng)計(jì)誘導(dǎo)出愈傷約為72個(gè),分化不定芽約為53個(gè),所用體系的愈傷誘導(dǎo)率可達(dá)80%,芽分化率可達(dá)74%,轉(zhuǎn)化率可達(dá)59%。所以本研究所用的馬鈴薯轉(zhuǎn)化體系效率是較高的。
本研究轉(zhuǎn)化了一個(gè)馬鈴薯絲裂原活化蛋白激酶StMKK1,關(guān)于MKK蛋白在生物和非生物脅迫中的研究有很多,MAPKK可以被上游的促絲裂原活化蛋白質(zhì)激酶激酶激酶(MAPKKK)磷酸化其保守區(qū)域中絲/蘇氨酸殘基從而激活MAPKK,同時(shí)也可以磷酸化下游MAPK第七和第八亞結(jié)構(gòu)域之間的絲/蘇氨酸和酪氨酸殘基從而激活MAPK[29],在植物生長(zhǎng)發(fā)育和植物免疫調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。本研究通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化方法獲得StMKK1的轉(zhuǎn)基因植株,為后期解析其調(diào)控植物免疫機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
本研究以Desiree莖段作為外植體,構(gòu)建融合StMKK1基因反向重復(fù)序列的RNAi表達(dá)載體,采用農(nóng)桿菌侵染的遺傳轉(zhuǎn)化方法,獲得了馬鈴薯絲裂原活化蛋白激酶StMKK1沉默的轉(zhuǎn)基因馬鈴薯植株。qRT-PCR檢測(cè)結(jié)果表明,在馬鈴薯轉(zhuǎn)基因植株中,StMKK1基因表達(dá)量的降幅大于92%。研究結(jié)果為進(jìn)一步研究StMKK1基因在馬鈴薯響應(yīng)脅迫和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用奠定基礎(chǔ)。