宋靜,戎建榮
(山西醫(yī)科大學(xué)附屬白求恩醫(yī)院(原名山西大醫(yī)院)檢驗(yàn)科,山西 太原 030000)
碳青霉烯類耐藥腸桿菌科細(xì)菌的感染已嚴(yán)重威脅到公共衛(wèi)生健康,其檢出率呈現(xiàn)逐年上升的趨勢(shì)。CRE對(duì)碳青霉烯類抗生素敏感性下降的主要機(jī)制是產(chǎn)碳青霉烯酶[1-2]。本研究是以聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction, PCR)技術(shù)對(duì)腸桿菌科細(xì)菌耐藥基因的檢測(cè)作為金標(biāo)準(zhǔn),就mCIM試驗(yàn)對(duì)于產(chǎn)碳青霉烯酶腸桿菌科細(xì)菌的表型檢測(cè)的診斷價(jià)值作一系統(tǒng)評(píng)價(jià),以期為臨床微生物實(shí)驗(yàn)室工作的開展提供依據(jù)。
1.1 文獻(xiàn)納入及排除標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn):(1)以mCIM試驗(yàn)與PCR法比較的產(chǎn)碳青霉烯酶CRE的表型診斷試驗(yàn)的文獻(xiàn);(2)研究中以PCR試驗(yàn)為金標(biāo)準(zhǔn);(3)研究對(duì)象為臨床收集的對(duì)任何碳青霉烯類抗菌藥物耐藥(即多利培南、美羅培南或亞胺培南最小抑制濃度(minimal inhibitory concentration,MIC)≥4 mcg/mL,或厄他培南(MIC≥2 mcg/mL)或產(chǎn)碳青霉烯酶腸桿菌科細(xì)菌。(4)待評(píng)價(jià)試驗(yàn)為mCIM試驗(yàn)。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)數(shù)據(jù)報(bào)道不完整;(2)無法提取四格表資料;(3)會(huì)議交流論文、通訊及信件。
1.2 方法
1.2.1 文獻(xiàn)檢索 以“enterobac teriaceae”、“carbapenemase”、“PCR”、“mCIM”、“sensitivity”、“specificity”等為檢索詞檢索Pubmed、Cochrane圖書館、EMBASE數(shù)據(jù)庫,并輔以文獻(xiàn)追溯、手工檢索。以“腸桿菌科細(xì)菌”、“改良碳青霉烯類滅活試驗(yàn)”、“碳青霉烯酶”、“PCR”、“靈敏度”、“特異度”等為檢索詞檢索中國CNKI學(xué)術(shù)總庫、萬方數(shù)據(jù)庫、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBM)。檢索起始時(shí)間為2015年1月1日-2019年6月16日。
1.2.2 文獻(xiàn)篩選 由兩名研究者分別閱讀所獲文獻(xiàn)的題目和摘要,在排除不符合納入標(biāo)準(zhǔn)的研究后,對(duì)可能符合納入標(biāo)準(zhǔn)的研究進(jìn)行全文詳細(xì)閱讀,共同商榷是否真正符合納入標(biāo)準(zhǔn)。
1.2.3 資料提取 提取資料主要包括:作者、年代、國家、納入樣本數(shù)、菌種及相關(guān)基因型,診斷參數(shù)(真陽性值TP、假陽性值FP、假陰性值FN、真陰性值TN)。
2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果 經(jīng)初步篩選,8篇來自中國知網(wǎng),1篇來自萬方,19篇來自CBM。檢索EMBASE 10篇,Cochrane 1篇,Pubmed 7篇,重復(fù)文獻(xiàn)15篇,排除不符合納入標(biāo)準(zhǔn)1篇,剩余文獻(xiàn)31篇進(jìn)行全文復(fù)篩。進(jìn)一步分析排除:未提供敏感性和特異性數(shù)據(jù)的研究15篇,資料類型不符的有3篇,對(duì)mCIM試驗(yàn)進(jìn)行改良的文獻(xiàn)有3篇,最終入選的合格的文獻(xiàn)為8篇。
2.2 納入文獻(xiàn)基本特征及質(zhì)量評(píng)價(jià) Meta分析納入的8篇文獻(xiàn)均為2017年-2019年出版,其中7篇來自中國,一篇來自美國。通過文中數(shù)據(jù)可直接得到或計(jì)算出真陽性(TP)、假陽性(FP)、假陰性(FN)和真陰性(TN)例數(shù),納入研究基本特征見表1。
臨床適用性(applicability concerns)方面,“patient selection”與“index test”偏倚方面所納入文獻(xiàn)均為低風(fēng)險(xiǎn),“reference standard”低偏倚文獻(xiàn)所占比例較大87.5%。說明本研究所納入的文獻(xiàn)質(zhì)量總體質(zhì)量較佳。
本研究結(jié)果顯示分別在中英文共6個(gè)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行連續(xù)4年相關(guān)文獻(xiàn)的檢索。最終納入8篇文獻(xiàn),文獻(xiàn)都集中在2018年發(fā)表。對(duì)納入研究的文獻(xiàn)采用QUADAS-2進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估,結(jié)果顯示:臨床適用性(applicability concerns)方面,“patient selection”與“index test”偏倚方面所納入文獻(xiàn)均為低風(fēng)險(xiǎn),“reference standard”低偏倚文獻(xiàn)所占比例較大87.5%。說明本研究所納入的文獻(xiàn)質(zhì)量總體較佳[3-8]。
本研究的meta-disc分析結(jié)果顯示,納入的8篇文章中,提示mCIM為陰性時(shí)腸桿菌科細(xì)菌不產(chǎn)碳青霉烯酶的可能性大;DOR合并=1402.35(95%CI:431.00-4562.84);SROC AUC=0.9984,提示mCIM對(duì)于產(chǎn)碳青霉烯酶腸桿菌科細(xì)菌表型檢測(cè)的診斷效能很高。
綜上所述,當(dāng)前研究顯示mCIM對(duì)于產(chǎn)碳青霉烯酶CRE的檢測(cè)具有很高的敏感度、特異度及準(zhǔn)確性,臨床微生物實(shí)驗(yàn)室可以通過嚴(yán)格遵守CLSI操作指南,盡可能減少認(rèn)為因素誤差來提高檢測(cè)的敏感性及特異型,可有效輔助臨床開展對(duì)CRE的早期篩查。