王紫荊,方 劍,胡小林,侯曉華,謝屹峰,朱 靜,馬云馳,莊 琴
(成都兒童專科醫(yī)院內(nèi)科一病區(qū),四川 成都 610015)
肺炎是住院兒童中常見的疾病,對(duì)兒童的生長發(fā)育和身心健康影響較大,給家庭和社會(huì)帶來十分沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[1]。兒童肺炎可由多種呼吸道病原體感染引起,不同呼吸道病原體感染引起的肺炎臨床癥狀、體征相似,因此,臨床醫(yī)師僅僅依靠臨床癥狀、體征,很難對(duì)肺炎作出準(zhǔn)確的病原學(xué)診斷[2]。如何早期確定兒童肺炎的病原體,對(duì)肺炎患兒進(jìn)行精準(zhǔn)的治療,一直是臨床醫(yī)師面臨的難題[3]。本研究采用多重逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)聯(lián)合毛細(xì)管電泳方法,對(duì)兒童肺炎常見13種呼吸道病原體進(jìn)行多重核酸檢測(cè),旨在了解成都地區(qū)兒童非典型病原體肺炎的病原構(gòu)成和流行病學(xué)特征。
1.1 研究對(duì)象選取2019年3月至2020年2月成都兒童專科醫(yī)院收治的128例肺炎住院患兒,入選標(biāo)準(zhǔn):①年齡≤14歲;②病程≤7天;(臨床癥狀體征及胸片檢查結(jié)果均符合肺炎診斷標(biāo)準(zhǔn)(參照全國高等學(xué)校教材供基礎(chǔ)、臨床、預(yù)防、口腔醫(yī)學(xué)類專業(yè)用《兒科學(xué)》第8版肺炎診斷標(biāo)準(zhǔn));④血常規(guī)+CRP檢測(cè):WBC正?;蚪档?、CRP正?;蜉p度增高(CRP≤30 mg/L)。排除標(biāo)準(zhǔn):①年齡≤28天;②痰培養(yǎng)、PCT等檢查提示細(xì)菌感染者。128例患兒中男79例,女49例,年齡(4.49±3.25)歲;<1歲組16例,1~3歲組28例,3~6歲組51例,≥6歲組33例。
1.2 方法儀器和試劑:全自動(dòng)核酸提取儀(由臺(tái)灣圓點(diǎn)奈米技術(shù)股份有限公司生產(chǎn),型號(hào):Smart Lab Assistant SLA-32)、全自動(dòng)基因擴(kuò)增儀(由北京東勝創(chuàng)新生物科技有限公司生產(chǎn),型號(hào):ETC 811)、3500DX基因分析儀(由賽默飛世爾科技公司生產(chǎn),型號(hào):3500DX)、13項(xiàng)呼吸道病原體多重檢測(cè)試劑盒(由寧波海爾施基因科技有限公司生產(chǎn))。咽拭子標(biāo)本的處置:將加有保存液的咽拭子標(biāo)本置于渦旋混勻儀上充分渦旋10秒鐘,以洗下咽拭子標(biāo)本上粘附的病原及含有病原的細(xì)胞。核酸提取:使用“核酸提取或純化試劑”(備案號(hào):浙溫械備20150246號(hào))在自動(dòng)化提取工作站Smart LabAssist-16/32(備案號(hào):國械備20140202)上進(jìn)行自動(dòng)核酸提取?;蛘呤褂谩昂怂崽崛』蚣兓噭?備案號(hào):浙溫械備20150006號(hào))進(jìn)行手動(dòng)核酸提取。吸取相應(yīng)體積的樣本(包括陽性對(duì)照和陰性對(duì)照)并加入2 μl的RT-PCR內(nèi)參共同提取。RT-PCR多重?cái)U(kuò)增和毛細(xì)電泳分離檢測(cè):在同一個(gè)PCR反應(yīng)體系中構(gòu)建多對(duì)引物,不同引物可與不同呼吸道病原的目的基因特異性結(jié)合。首先通過對(duì)13種呼吸道病原體的檢測(cè)靶點(diǎn)和3個(gè)內(nèi)參靶點(diǎn)進(jìn)行特異性的逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)多重?cái)U(kuò)增,再采用毛細(xì)管電泳技術(shù)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行分離和檢測(cè),從而得到相應(yīng)病原體的檢測(cè)結(jié)果。收集患兒的臨床資料,并記錄咽拭子多重核酸檢測(cè)結(jié)果。在患兒入院當(dāng)天采集咽拭子,采用多重逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)聯(lián)合毛細(xì)管電泳方法,檢測(cè)13種呼吸道非典型病原體的核酸(RNA類:甲型流感病毒、甲型流感病毒H1N1、甲型流感病毒H3N2、乙型流感病毒、副流感病毒、偏肺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、冠狀病毒;DNA類:腺病毒、博卡病毒、肺炎支原體、肺炎衣原體)。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法應(yīng)用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和分析。各年齡組患兒病原檢出陽性率和多病原混合感染檢出率的比較采用χ2檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 病原檢出情況在128例標(biāo)本中,檢出至少1種病原的有78例,檢出陽性率60.94%。各年齡階段患兒病原檢出陽性率比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.51,P>0.05)。見表1。
表1 不同年齡組肺炎患兒病原檢出陽性率比較
2.2 病原季節(jié)分布趨勢(shì)甲型流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒存在季節(jié)流行特征,以冬春季節(jié)多見,其它病原無明顯季節(jié)性。
2.3 不同種類病原檢出情況128例患兒中,不同種類病原檢出率見圖1,其中檢出率居于前3位的病原依次是:肺炎支原體、鼻病毒、甲型流感病毒,偏肺病毒、博卡病毒、冠狀病毒檢出率最低。各年齡組患兒中,不同病原檢出率見表2。
圖1 不同種類病原檢出率
表2 不同年齡組患兒病原檢出率 [n(%)]
2.4 多病原檢出情況在128例標(biāo)本中,同時(shí)檢出2種病原的有19例,混合感染檢出率14.84%。在各年齡階段患兒中,同時(shí)檢出2種病原檢出率比較見表3。在不同年齡組之間,混合感染檢出率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2= 14.51,P< 0.05),其中1~3歲組混合感染檢出率最高。沒有發(fā)現(xiàn)超過兩種病原混合感染的病例。
表3 不同年齡階段患兒中同時(shí)檢出2種病原檢出率比較
在兒童非典型病原體肺炎中,多種病原體混合感染的現(xiàn)象日益增多,目前傳統(tǒng)的病原學(xué)檢查方法包括:病原分離和培養(yǎng)、免疫學(xué)、分子生物學(xué)等檢測(cè)方法。雖然病原的分離和培養(yǎng)是病原檢測(cè)最可靠的方法[4],但是其培養(yǎng)條件要求苛刻、技術(shù)要求高、靈敏度低、耗時(shí)較長,不適合用于臨床早期診斷;免疫學(xué)法雖然是臨床常見的病原檢測(cè)方法,且操作簡單、快速,但易受患兒的病程、年齡等因素影響較大[5],特異度和靈敏度低,可出現(xiàn)假陰性,臨床應(yīng)用受限;常規(guī)PCR法雖然具有快速、敏感度和特異度高,但檢測(cè)通量低,每次只能檢測(cè)一種病原體,可能會(huì)錯(cuò)過和延遲對(duì)復(fù)合感染的診斷和治療。故呼吸道病原多重核酸檢測(cè)技術(shù)就應(yīng)運(yùn)而生[6,7],它是以普通PCR檢測(cè)方法為基礎(chǔ),進(jìn)一步發(fā)展演變而來的,可同時(shí)檢測(cè)多種病原體,不僅技術(shù)簡單、快速、準(zhǔn)確、高效,還可以提高樣本的使用效率[8~10]。
本組患兒結(jié)果顯示,兒童肺炎非典型病原體檢出陽性率較高,其中以肺炎支原體、鼻病毒、甲型流感病毒最為常見。在各年齡組患兒中,檢出率高的病原種類有所差異:在<1歲組患兒中,鼻病毒、呼吸道合胞病毒、甲型流感病毒檢出率較高,其中呼吸道合胞病毒感染多見于1歲以下患兒;在1~3歲組患兒中,鼻病毒、甲型流感病毒、副流感病毒檢出率較高;在3~6歲組患兒中,肺炎支原體、鼻病毒、甲型流感病毒(或腺病毒)檢出率較高,其中支原體感染多見于3歲以上患兒;在≥6歲組患兒中,肺炎支原體、肺炎衣原體、鼻病毒(腺病毒或乙型流感病毒)檢出率較高。甲型流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒具有明顯季節(jié)流行特征,以冬春季多見。
在兒童肺炎中,多種病原混合感染現(xiàn)象比較常見,以1~3歲組患兒混合感染檢出率最高。沒有發(fā)現(xiàn)超過兩種以上病原體混合感染的病例出現(xiàn),估計(jì)與本研究納入患兒的病情不是太嚴(yán)重有關(guān)。