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    新疆天山雪嶺云杉根際土壤中鏈霉菌的分離培養(yǎng)及其抑菌活性的初步探究

    2020-11-20 07:25:58趙磊木沙江托乎提牛麗娟茍漁林富順郭飛
    關(guān)鍵詞:放線菌霉菌抗生素

    趙磊,木沙江·托乎提,牛麗娟,茍漁,林富順,郭飛*

    (1 石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院,新疆 石河子 832002;2 新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆 烏魯木齊 830001)

    數(shù)十年來,抗生素的出現(xiàn)以及不斷推陳出新,極大地降低了臨床感染率和死亡率[1],抗生素的研發(fā)在科學(xué)研究中一直占據(jù)重要地位。天然抗生素主要分離自微生物的次級(jí)代謝產(chǎn)物中[2]。而放線菌恰恰是這些次級(jí)代謝產(chǎn)物最主要的生產(chǎn)者[3]。放線菌大體可以分為兩大類,占據(jù)大多數(shù)的鏈霉菌屬以及除此之外的稀有放線菌[4]。其中鏈霉菌是主要的抗生素生產(chǎn)者,據(jù)已有的報(bào)道表明,目前已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)的抗生素種類已經(jīng)超過了20000種,但是其中真正服務(wù)于人類的抗生素不過百余種,而這其中的大多數(shù)都來源于放線菌中的鏈霉菌屬[5]。

    從Waksman發(fā)現(xiàn)鏈霉菌中的鏈霉素[6]到后來萬古霉素的問世[7],人們對(duì)新抗生素研發(fā)的腳步從未停止過。但相較于細(xì)菌耐藥性的發(fā)展,新型抗生素的發(fā)展顯得十分緩慢[8]。因此對(duì)新型抗生素的開發(fā)依然是非常急迫的。新疆位于亞歐大陸腹地,為我國(guó)最大的省份。自然環(huán)境多樣且特殊,近些年來,對(duì)于新疆地區(qū)放線菌資源的報(bào)道也層出不窮。研究者們已從羅布泊[9],天池[10]等環(huán)境中獲取了大量的放線菌資源。但對(duì)于天山地區(qū)具有抑菌活性的放線菌鏈霉菌屬的研究還未見報(bào)道。天山山脈在我國(guó)境內(nèi)綿延1 700多公里,且雪嶺云杉為其單優(yōu)樹種,并為天山山脈所特有[11]。

    歷經(jīng)風(fēng)雨之后,方知社會(huì)是復(fù)雜的,水仙芝不想把它看得更復(fù)雜。她想過一種簡(jiǎn)單的生活,一種純凈、沒有污染的生活。讀了很多書,她更不相信書,倒相信感覺。

    為了發(fā)現(xiàn)更多對(duì)臨床病原菌有抑制作用的放線菌資源,以及豐富我們對(duì)新疆放線菌資源的認(rèn)識(shí),本課題組從天山山脈的不同區(qū)域的雪嶺云杉根際部位,采集了5份土壤樣品。從中篩選放線菌中的鏈霉菌屬進(jìn)行鑒定以及抑菌活性初步分析,為獲取更多有價(jià)值的微生物資源以及開發(fā)新疆特色抗生素奠定基礎(chǔ)。

    在抓實(shí)生態(tài)文明體制改革的同時(shí),云南省環(huán)境污染第三方治理、環(huán)境監(jiān)管執(zhí)法工作、水污染防治和水功能區(qū)管理等改革取得突破。狠抓中央環(huán)境保護(hù)督察反饋問題的整改落實(shí),建立省級(jí)環(huán)保督察機(jī)制,全省實(shí)現(xiàn)對(duì)16個(gè)州市環(huán)境保護(hù)督察全覆蓋。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 樣品采集與處理

    2019年5月采集自烏魯木齊南山雪嶺云杉森林。選取了5個(gè)采樣地點(diǎn),采集貼敷于雪嶺云杉根須的土壤,用無菌袋封裝土壤樣品。在運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室之前,保存在4 ℃的車載冰箱內(nèi)。

    牛津杯法菌株的抑菌活性篩選:

    表1 雪嶺云杉根際土壤采樣地點(diǎn)信息

    1.1.2 培養(yǎng)基制備

    聲檢查時(shí),患者的體位不一致,可能會(huì)對(duì)檢查造成一定的影響。因此,在以后的研究中可以增大研究的樣本量,選擇有經(jīng)驗(yàn)的超聲科醫(yī)生,讓患者保持最佳的檢查體位,提高研究結(jié)果的說服力。

    50 mg·L-1重鉻酸鉀溶液(每種分離培養(yǎng)基在高壓滅菌后,溫度降至60 ℃左右時(shí),加入3%的重鉻酸鉀溶液)。

    1.1.3 抑制劑

    發(fā)酵培養(yǎng)基:可溶性淀粉15 g,酵母浸粉5 g,牛肉膏蛋白胨2 g,蒸餾水1 000 mL,pH調(diào)整至7.2。

    基于配變負(fù)載歷史數(shù)據(jù),對(duì)采樣數(shù)據(jù)進(jìn)行分類預(yù)測(cè)模型的選擇,通過比較分類模型的優(yōu)劣選出最優(yōu)模型。分類器模型的選擇過程以及分類器的準(zhǔn)確率如下圖所示。

    待檢菌株培養(yǎng)基:營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基。

    種子培養(yǎng)基:液體高氏一號(hào)培養(yǎng)基,液體ISP2培養(yǎng)基。

    分離培養(yǎng)基:(1) SEA培養(yǎng)基(土壤浸出液培養(yǎng)基):土壤浸出液的制備:稱取500 g土壤樣品,加入1000 mL去離子水,2 g NaOH浸泡過夜。10 000 r·min-1,60 min離心,收集上清液調(diào)整PH至7.5,即為土壤浸出液。然后加入2%的吉蘭糖膠。121 ℃,15 min高壓滅菌。(2)SEG培養(yǎng)基:土壤浸出液1 000 mL,1/10濃度的高氏一號(hào)培養(yǎng)基,2%瓊脂。(3)SEISP2培養(yǎng)基:土壤浸出液1000 mL,1/10濃度ISP2培養(yǎng)基,2%瓊脂。(4)高氏一號(hào)培養(yǎng)基:可溶性淀粉20 g,KNO31 g,K2HPO40.5 g,0.5 g MgSO4·7 H2O,0.5 g NaCl,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g,瓊脂 20 g,1 L去離子水,pH調(diào)節(jié)至7.5。(5)ISP2培養(yǎng)基:麥芽浸粉10 g,酵母浸粉4 g,D-葡萄糖4 g,瓊脂20 g,1 L去離子水,pH調(diào)節(jié)至7.2。

    1.1.4 抑菌活性實(shí)驗(yàn)檢測(cè)菌株

    1.2.5 與抗生素合成有關(guān)的基因簇檢測(cè)

    在重選樣中我們選擇重砂1、重砂3、重砂5及重選尾礦進(jìn)行了全方位考察。鈮鉭礦物、黃鐵礦等金屬硫化物及其他比重較大的礦物主要富集于重砂1中,為此又對(duì)重砂1進(jìn)行了浮選分離(表6),分離出以硫化物為主的硫精礦(浮硫精)和以氧化物為主的硫尾礦(浮硫尾)。重砂5中除石英外,云母含量亦較高,云母為銣的重要載體礦物,故我們對(duì)重砂5中云母進(jìn)行了浮選富集。重選尾礦樣經(jīng)X衍射分析結(jié)果表明,成分主要為云母、石英和長(zhǎng)石類礦物。

    1.1.5 主要試劑及儀器

    很多企業(yè)的內(nèi)控制度并不健全,領(lǐng)導(dǎo)及員工的內(nèi)部控制意識(shí)淡薄。這主要表現(xiàn)為:①有的企業(yè)沒有設(shè)置內(nèi)部控制制度。②有的企業(yè)雖然制定了內(nèi)部控制制度,但該制度存在缺陷,缺乏可操作性。③有的企業(yè)設(shè)定了有效的內(nèi)控制度,但是員工并沒有按制度執(zhí)行。

    綜上所述,在當(dāng)前我國(guó)高校建設(shè)和發(fā)展中,為了拓展高校教育建設(shè)資源,對(duì)于圖書館職能的建設(shè)和優(yōu)化也越來越重視,通過對(duì)圖書館建設(shè)中的管理系統(tǒng)開發(fā)設(shè)計(jì),能夠更好地管理圖書資源,實(shí)現(xiàn)對(duì)圖書資源管理的科學(xué)化部署能力提升。通過本文的研究和分析,將高職院校圖書館管理系統(tǒng)開發(fā)與設(shè)計(jì)主要從以下幾點(diǎn)進(jìn)行了研究:一是數(shù)據(jù)庫(kù)的開發(fā)與設(shè)計(jì);二是功能模塊設(shè)計(jì)和優(yōu)化;三是管理系統(tǒng)的優(yōu)化設(shè)計(jì),借助這種系統(tǒng)優(yōu)化設(shè)計(jì)分析,能夠?qū)⒄w的高職院校圖書館管理系統(tǒng)設(shè)計(jì)好,便于高職院校圖書館建設(shè)的科學(xué)化發(fā)展。

    溶菌酶,蛋白酶K,RNA酶,醋酸鈉等DNA提取用品購(gòu)于索萊寶公司;DNA Marker,Premix Taq購(gòu)于Takara;引物由上海生工生物工程股份有限公司合成;立式壓力蒸汽滅菌器LDZX-50KBS,上海申安醫(yī)療器械廠;恒溫震蕩搖床HZQ-2,金壇市醫(yī)療器械廠;潔凈工作臺(tái)SW-CF-2FD,上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;離心機(jī)centrifuge 5430R,德國(guó)Eppendorf公司;旋渦混勻器XH-C,金壇市醫(yī)療儀器廠;PCR擴(kuò)增儀PowerCycler SL 96 Gradient,德國(guó)Biometra公司;電泳儀DYY-6C型,北京市六一儀器廠;凝膠成像儀Gel Doc-It2 310 Imager,美國(guó)Bio-Rad公司。

    1.2 方法

    1.2.1 樣品處理

    將采集的樣品放入200目細(xì)目篩中過篩處理,自然風(fēng)干28 d。取1 g風(fēng)干的土壤樣品,加入9 mL去離子水。在旋渦混勻器上劇烈震蕩10 min,靜止5 min。取上清液1 mL置于無菌管中,將土壤懸液終濃度調(diào)整至10-4g·mL-1,備用。

    1.2.2 根際土壤菌株的篩選分離

    將1.2.1中制備好的土壤懸液,取200 μL均勻涂布于5種分離培養(yǎng)基上。放置培養(yǎng)箱中30 ℃培養(yǎng)28 d。按照伯杰氏細(xì)菌手冊(cè)所描述的鏈霉菌屬特征,將疑似菌株(干燥、產(chǎn)生色素、孢子成堆等特點(diǎn))小心挑取進(jìn)行純化培養(yǎng)。

    (1)發(fā)酵液的制備:挑取已經(jīng)純化好的菌株或刮取少量的菌苔于10 mL的種子培養(yǎng)基中,放入恒溫震蕩培養(yǎng)箱中30 ℃,160 r·min-1培養(yǎng)72 h。用移液器吸取種子培養(yǎng)基中的菌液加入發(fā)酵培養(yǎng)基中,使菌液的濃度占據(jù)發(fā)酵培養(yǎng)基的5%。以同樣的條件放入搖床培養(yǎng)2周。將搖好的菌液12 000 r·min-1,10 min離心收上清,并用0.22 μm的濾膜將上清液過濾備用。

    具體DNA提取方法步驟參考姜淑梅等人的方法進(jìn)行改良[12]。PCR擴(kuò)增引物為27 F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492 R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)。擴(kuò)增體系為25 μL:12.5 μL的2×Premix Taq,10 pmol 27 F,10 pmol 1492R,50 ng的DNA模板,加滅菌水至25 μL。反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min。95 ℃變性30 s,55 ℃退火2 min以及72 ℃延伸2 min進(jìn)行35個(gè)循環(huán)。最后72 ℃延伸10 min。所得PCR產(chǎn)物通過1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)并送去生工(上海)生物工程股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。運(yùn)用NCBI的BLAST程序?qū)y(cè)序所得序列進(jìn)行比對(duì),選取有效發(fā)表的同源性較高的序列,用DNAMAN進(jìn)行多序列比對(duì),采用MEGA7.0軟件中的鄰接(neighbor-joiningmethod,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[13]。

    1.2.4 篩選所得菌株的抑菌活性檢測(cè)

    此外,“冒進(jìn)”風(fēng)險(xiǎn)也不容小覷。各地興起的“糧食銀行”以企業(yè)自發(fā)行為居多,在發(fā)展定位、管理水平、操作流程等方面參差不齊,有的在小規(guī)模儲(chǔ)售糧時(shí)運(yùn)作自如,往往產(chǎn)生盲目樂觀的心態(tài),提出“大干快上”的目標(biāo),形成經(jīng)營(yíng)風(fēng)險(xiǎn)。

    1.2.3 菌株DNA的提取及16SrRNA生物分子學(xué)分析

    (2)將待檢測(cè)病原菌株用滅菌水將其濃度稀釋至0.5麥?zhǔn)媳葷峁埽⑽?00 μL涂布于NA培養(yǎng)基上。而后將滅菌牛津杯(內(nèi)徑6 mm,外徑8 mm,高10 mm的圓柱不銹鋼小管)放置其上。每個(gè)牛津杯中加入(1)中制備好的過濾上清液200 μL。30 ℃,培養(yǎng)48 h后觀察抑菌情況并記錄抑菌圈大小。

    大腸桿菌(Escherichia coil)標(biāo)準(zhǔn)株ATCC25922,金黃色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)標(biāo)準(zhǔn)株ATCC25923,以上兩種菌株由中國(guó)科學(xué)院(新疆)微生物研究所保藏。臨床分離株耐甲氧西林金葡菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)、產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶(Extended-spectrum β-lactamases,ESBLs)大腸桿菌、銅綠假單胞菌(pseudomonas aeruginosa,PA)由石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院提供。

    《經(jīng)濟(jì)學(xué)人》中國(guó)專欄的報(bào)道并非只有諷刺或消極類,也有一些報(bào)道對(duì)中國(guó)的經(jīng)濟(jì)狀況或現(xiàn)象持肯定態(tài)度。2016年6月11日的中國(guó)專欄中,其中有一篇報(bào)道了關(guān)于溫州經(jīng)濟(jì)的現(xiàn)狀。該報(bào)道中包含三則概念隱喻——“對(duì)抗金融危機(jī)是戰(zhàn)爭(zhēng)”、“銀行是人”和“經(jīng)濟(jì)發(fā)展是旅程”。在“對(duì)抗金融危機(jī)是戰(zhàn)爭(zhēng)”概念隱喻中,金融危機(jī)對(duì)應(yīng)于敵人,對(duì)抗金融危機(jī)對(duì)應(yīng)于戰(zhàn)爭(zhēng)(例14)。在“銀行是人”概念隱喻中,銀行逐漸從金融危機(jī)的陰影中走出來對(duì)應(yīng)于人逐漸恢復(fù)健康(例15)。在“經(jīng)濟(jì)發(fā)展是旅程”概念隱喻中,用于承擔(dān)風(fēng)險(xiǎn)對(duì)應(yīng)于勇敢面對(duì)旅途中的危險(xiǎn)(例16)。

    PSKⅠ擴(kuò)增基因?yàn)镵1F(5′-TSAAGTCSAACATCGGBCA-3′)和M6R(5′-CGCAGG-TTSCS-GTACCAGTA-3′),PSKⅡ擴(kuò)增基因?yàn)镵Sα(5′-TSGCSTGCTTCGAYGCSATC-3′)KSβ(5′-TGGAANCCGCCGAABCCGCT- 3′)。非核糖體肽合成酶(nonribosomal peptide synthetase,NRPS)擴(kuò)增基因?yàn)锳3F(5′-GCSTACSYSATSTACACSTCSGG-3′),A7R (5′-SASGTCVCCSGTSCGGTAS-3′)[14-15]。三對(duì)引物均上海生工合成。

    3對(duì)引物反應(yīng)體系均與1.2.3中的相同,PSKⅠ反應(yīng)條件為95 ℃,5 min預(yù)變性。95 ℃,30 s,55 ℃,2 min,72 ℃,90 s。30個(gè)循環(huán)。72 ℃,10 min。PSKⅡ反應(yīng)條件為95 ℃,5 min預(yù)變性。95 ℃,30 s,60 ℃,2 min,72 ℃,60 s。30個(gè)循環(huán)。72 ℃,10 min。NRPS反應(yīng)條件為95 ℃,5 min預(yù)變性。95 ℃,30 s,59 ℃,30 s,72 ℃,60 s。30個(gè)循環(huán)。72 ℃,10 min。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 雪嶺云杉根際土壤可培養(yǎng)鏈霉菌分離結(jié)果分析

    從5份樣品,5種培養(yǎng)基中共分離得到160株菌株,而后根據(jù)形態(tài)學(xué)去除冗余,并通過PCR技術(shù)擴(kuò)增16SrRNA基因?qū)赀M(jìn)行鑒定。經(jīng)過序列比對(duì)分析得出:我們共分離出77株放線菌,其中鏈霉菌屬41株,占據(jù)53.38%。所分離的菌株TS007與有效序列Streptomyces griseoincarnatus(MK928393),Streptomyces variabilis(KF551876),Streptomyces sp.(JX244132)的相似性分別為97.97%、97.43%以及97.96%。菌株TS054與已知菌株Streptomyces venezuelae strain(MF077023),Streptomyces exfoliatus(KF730770.1)的相似性分別為98.11%和98.10%、TS066與有效菌株Streptomyces ambofaciens(KR47-6414),Streptomyces sp.(KX279622)的同源性在96.92%,96.99%。利用MEGA7.0軟件中的鄰接法(Neighbour-Joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹如圖1所示。三株菌株均與鏈霉菌屬的有效菌株聚在一起,且形成獨(dú)立的分支,可能為潛在新種。在菌株分離結(jié)果中,我們觀察到培養(yǎng)基的濃度影響著菌株分離的多樣性以及新鏈霉菌的分離,潛在新種TS007分離自SEA培養(yǎng)基,TS054和TS066分離自改良低濃度ISP2培養(yǎng)基。在一般商品化培養(yǎng)基,高氏一號(hào)培養(yǎng)基,改良高氏一號(hào)培養(yǎng)基以及ISP2培養(yǎng)基未分離出潛在新種。

    圖1 基于16S rRNA基因序列構(gòu)建的菌株TS007、TS054、TS066與其相近種的N-J系統(tǒng)進(jìn)化樹

    2.2 抑菌活性分析

    牛津杯法抑菌試驗(yàn)結(jié)果表明,至少對(duì)一種病原菌有抑菌作用的菌株一共22株,占比53.66%。具體抑菌情況如表2所示。結(jié)果顯示TS014抑菌活性最為突出,對(duì)于所選菌株均有抑制作用。其中對(duì)金黃色葡萄球菌抑制作用非常明顯,抑菌圈達(dá)到35 mm。

    賽事組織者作為體育賽事的組織、承辦者,在整合體育賽事資源方面具有得天獨(dú)厚的優(yōu)勢(shì),理論上能夠最大化地實(shí)現(xiàn)體育賽事轉(zhuǎn)播權(quán)的價(jià)值轉(zhuǎn)化。但是在權(quán)源上,它不像參賽者那樣貼近體育賽事,而更像是一個(gè)代理商:除了通過合同約定之外,很難證明其對(duì)體育賽事享有權(quán)利的正當(dāng)性。參賽者則不同,作為體育賽事的直接參與者,其對(duì)體育賽事的權(quán)利訴求更為合理。但是體育賽事往往是多名參賽者共同完成的,尤其是足球聯(lián)賽這類大型競(jìng)技類運(yùn)動(dòng),往往涉及到十幾支參賽球隊(duì)。如果由參賽者自行處理其體育賽事轉(zhuǎn)播權(quán),不僅容易出現(xiàn)爭(zhēng)執(zhí),而且在效率上也是不經(jīng)濟(jì)的。

    表2 分離自雪嶺云杉根際土壤鏈霉菌的抑菌活性

    2.3 功能基因的篩選結(jié)果

    本實(shí)驗(yàn)選取了3對(duì)功能基因的引物對(duì)41株菌株進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示:大部分菌株都至少具有一條功能基因。一共32株,占比78.04%。其中PSKⅠ基因陽性13株,占比31.70%;PSKⅡ基因陽性菌株22株,占比53.66%;NRPS基因陽性菌株25株,占比60.98%。其中TS008、TS046、TS056在3種基因的檢測(cè)中均表現(xiàn)為陽性,且在抑菌活性實(shí)驗(yàn)中均表現(xiàn)出了良好的抑菌效果。具體占比情況如表3所示。

    表3 雪嶺云杉根際土壤分離獲得的代表性鏈霉菌菌株功能基因篩選

    3 討論

    鏈霉菌屬一直是抗生素研發(fā)的主力,目前運(yùn)用于臨床的抗生素有超過70%都來源于鏈霉菌菌株的次級(jí)代謝產(chǎn)物[5]。近些年來已經(jīng)有很多研究機(jī)構(gòu)對(duì)新疆放線菌資源進(jìn)行研究,但就新疆具有抑菌活性鏈霉菌屬的報(bào)道還較為少見。本實(shí)驗(yàn)中,我們從5份土壤樣品中共分離到41株鏈霉菌,且菌株TS007、TS054、TS066經(jīng)過系統(tǒng)發(fā)育分析,可能為潛在新種。值得注意的是,TS007分離自SEA寡營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基,TS054和TS066分離自低濃度改良ISP2培養(yǎng)基。且經(jīng)過驗(yàn)證,這三株菌株可在添加了土壤浸出液的高氏一號(hào)培養(yǎng)基、ISP2培養(yǎng)基中生長(zhǎng)良好。但是在普通蒸餾水配置的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)緩慢或不產(chǎn)生氣生菌絲。這些現(xiàn)象表明,土壤浸出液中的某些營(yíng)養(yǎng)成分是培養(yǎng)基的營(yíng)養(yǎng)成分更接近于這3株菌株的自然生長(zhǎng)環(huán)境,更適宜它們的生長(zhǎng)。同時(shí),我們也推測(cè)寡營(yíng)養(yǎng)和低營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基更適合此地新型放線菌的分離。

    目前在世界范圍內(nèi),濫用抗生素的現(xiàn)象依然普遍。使得耐藥菌株的種類越來越多,甚至出現(xiàn)了對(duì)大多數(shù)抗生素都產(chǎn)生耐藥作用的“超級(jí)細(xì)菌”[16]。目前臨床上耐藥性情況最為嚴(yán)峻的為腸桿菌屬,金黃色葡萄球菌,肺炎克雷伯菌,屎腸球菌,銅綠假單胞菌,鮑氏不動(dòng)桿菌。這6類病原菌被合并簡(jiǎn)稱為ESKAPE[17]。其中耐甲氧西林金葡菌(MRSA)與HBV、AIDS已并列成為臨床三大感染性疾患[18]。根據(jù)這一嚴(yán)峻情況,本實(shí)驗(yàn)選用了其中的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌,產(chǎn)β內(nèi)酰胺酶腸桿菌為靶標(biāo)進(jìn)行了抑菌活性初步研究,另外選取了敏感型大腸桿菌,金黃色葡萄球菌以及銅綠假單胞菌。其中對(duì)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌具有抑制作用的有7株,對(duì)產(chǎn)β內(nèi)酰胺酶腸桿菌具有抑制作用的有4株。對(duì)二者均具有抑制作用的有2株。值得一提的是,三株潛在新種鏈霉菌有兩株都能抑制耐甲氧西林金葡菌的生長(zhǎng),且三株菌株都具備抗生素合成相關(guān)基因PSKⅠ、PSKⅡ、NRPS[19]。但TS054在本次抑菌實(shí)驗(yàn)中未顯現(xiàn)出抑菌性,可能與發(fā)酵條件有關(guān)。

    與此同時(shí),抗生素合成相關(guān)基因檢測(cè)結(jié)果中至少具有其中一種基因的菌株共32株,總占比78.04%。其中PSKⅠ基因陽性13株,占比31.70%;PSKⅡ基因陽性菌株22株,占比53.66%;NRPS基因陽性菌株25株,占比60.98%。此比例要明顯高于抑菌實(shí)驗(yàn)結(jié)果,在一定程度上可以指導(dǎo)我們預(yù)測(cè)具有抗生素研發(fā)潛力的菌株,也提醒研究人員可以嘗試對(duì)某些菌株的發(fā)酵條件進(jìn)行進(jìn)一步的優(yōu)化。但同時(shí),比較兩組實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn),菌株TS014經(jīng)過3種基因檢測(cè),結(jié)果均為陰性。我們分析推測(cè),可能菌株TS014具有除實(shí)驗(yàn)中所選3種基因之外的其他抗生素合成相關(guān)基因,例如PKSⅢ[20]。也可能是某種未知的功能基因,值得我們進(jìn)一步設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行研究。

    4 結(jié)論

    通過以上研究結(jié)果分析,新疆天山地區(qū)雪嶺云杉根際土壤中,具有豐富的鏈霉菌資源。并且所分離出的菌株大多數(shù)都具有與抗生素合成有關(guān)的基因,同時(shí)在實(shí)驗(yàn)中超過半數(shù)對(duì)臨床上常見的幾種病原菌表現(xiàn)出了良好的抑菌活性。這為后續(xù)研發(fā)新型抗生素以及具有新疆特色的抗生素奠定基礎(chǔ)。

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