高艷,朱雅楠,李秋方,蘇松坤,聶紅毅
轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析意大利蜜蜂腦部哺育行為相關(guān)基因
高艷,朱雅楠,李秋方,蘇松坤,聶紅毅
(福建農(nóng)林大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院(蜂學(xué)學(xué)院),福州 350002)
【目的】意大利蜜蜂()哺育行為在維護蜂群穩(wěn)定和生產(chǎn)蜂王漿方面發(fā)揮重要作用。本研究通過人工組建蜂群獲得相同日齡的哺育蜂和采集蜂,篩選出排除日齡因素干擾后哺育蜂腦部與哺育行為密切相關(guān)的差異表達基因,揭示哺育蜂腦部調(diào)控哺育行為的分子網(wǎng)絡(luò)?!痉椒ā客ㄟ^人工組建蜂群的方法獲得3日齡工蜂、10日齡哺育蜂和采集蜂、21日齡哺育蜂和采集蜂,解剖各組工蜂頭部獲得腦組織樣本,應(yīng)用RNA-seq技術(shù)對5組腦部樣本(3日齡工蜂、10日齡哺育蜂、10日齡采集蜂、21日齡哺育蜂、21日齡采集蜂)中基因表達量進行轉(zhuǎn)錄組測序的全面分析,篩選出哺育蜂腦部哺育行為密切相關(guān)的差異表達基因,并對這些差異表達基因進行GO和KEGG富集分析。同時利用實時熒光定量PCR(qPCR)對隨機選取的4個差異表達基因的表達模式進行驗證?!窘Y(jié)果】RNA-seq分析篩選得到32個與哺育蜂哺育行為密切相關(guān)的差異表達基因,這些基因在10日齡哺育蜂腦中表達量均顯著高于3日齡工蜂、10日齡采集蜂、21日齡采集蜂,且在21日齡哺育蜂腦中的表達量也顯著高于21日齡采集蜂。GO富集分析發(fā)現(xiàn)上調(diào)差異表達基因主要參與氧化還原酶活性、氣味結(jié)合、跨膜運輸?shù)裙δ?。KEGG富集結(jié)果顯示,上調(diào)的差異表達基因主要參與蛋白質(zhì)代謝(核糖體)、能量代謝(氧化磷酸化、碳代謝、三羧酸循環(huán)、淀粉和蔗糖代謝、氮代謝、其他聚糖降解通路)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(Toll和Imd信號通路、光傳導(dǎo)、鞘脂代謝)、消化作用(溶酶體),其中顯著性富集在鞘脂代謝和其他聚糖降解通路。qPCR結(jié)果顯示3個上調(diào)差異表達基因(、、)和1個下調(diào)差異表達基因()表達模式的檢測結(jié)果與測序數(shù)據(jù)一致?!窘Y(jié)論】通過對3日齡工蜂、10日齡哺育蜂、10日齡采集蜂、21日齡哺育蜂、21日齡采集蜂5組樣本腦部進行全面分析,獲得相同日齡哺育蜂和采集蜂腦部基因的轉(zhuǎn)錄組圖譜,分析得到了腦部哺育行為相關(guān)的32個上調(diào)差異表達基因。哺育蜂腦部的差異表達基因主要通過信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和能量代謝等途徑調(diào)控哺育蜂的哺育行為。
意大利蜜蜂;哺育蜂;腦部;哺育行為;蜂王漿;RNA-seq
【研究意義】蜜蜂腦是調(diào)節(jié)其生物學(xué)各項行為的中心器官,腦部的神經(jīng)系統(tǒng)能夠調(diào)控蜜蜂表現(xiàn)出的各種行為響應(yīng),其中包括從哺育行為到采集行為的生命過渡過程,如分泌蜂王漿哺育幼蟲、采集、識別顏色和嗅覺線索、舞蹈交流、群體防御等[1-3]。工蜂的哺育行為在蜜蜂幼蟲生長發(fā)育、維護蜂群穩(wěn)定等方面發(fā)揮重要作用,同時工蜂的哺育行為也受到幼蟲信息素的調(diào)節(jié)[4]。蜂王漿的分泌由哺育蜂哺育行為所介導(dǎo),這一哺育行為已被人工用于生產(chǎn)蜂王漿供人類食用。一般認為,蜂王漿由適齡工蜂的咽下腺、上顎腺共同分泌,同時哺育行為介導(dǎo)的蜂王漿分泌過程離不開腦部復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)機制調(diào)控[5-6]。因此,研究哺育蜂腦部調(diào)控哺育行為相關(guān)的分子網(wǎng)絡(luò)機制可為深入解析意大利蜜蜂()蜂王漿分泌的分子機理提供新的思路和線索?!厩叭搜芯窟M展】隨著日齡的發(fā)育,工蜂從巢內(nèi)工作向巢外采集活動轉(zhuǎn)變,包括環(huán)境調(diào)節(jié)的行為變化[7-9],這一過程涉及大腦的結(jié)構(gòu)、基因表達和蛋白質(zhì)合成的變化[10];同樣也涉及到腦中激素和神經(jīng)化學(xué)物質(zhì)的生理過程以及成千上萬基因表達的變化[11],例如,其在功能和形態(tài)方面的轉(zhuǎn)變會受保幼激素的控制[12]。此外,腦部中樞神經(jīng)系統(tǒng)通過調(diào)控咽下腺和上顎腺相關(guān)基因的表達,促進這些腺體的發(fā)育并且增強它們分泌蜂王漿的功能[13]。研究表明,哺育蜂的大腦對蜂王漿分泌產(chǎn)生了一種獨特的神經(jīng)肽,哺育蜂分泌蜂王漿能力的增強與調(diào)節(jié)行為過程中高度增強的神經(jīng)肽有關(guān),并通過調(diào)節(jié)水穩(wěn)態(tài)、對幼蟲信息素的識別、采集能力和收集花粉來增加蜂群群體的營養(yǎng)供應(yīng)進而提高蜂王漿的分泌,從而在提高蜂王漿產(chǎn)量方面發(fā)揮了作用[13]。哺育蜂腦中高量表達的基因可能參與軸突形成和細胞黏附,這些基因可能涉及到哺育蜂在轉(zhuǎn)向采集活動之前的腦結(jié)構(gòu)變化[7]。哺育蜂腦部磷脂酰肌醇信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和花生四烯酸代謝水平的提高有助于增強嗅覺對幼蟲信息素刺激的反應(yīng)[14]?!颈狙芯壳腥朦c】關(guān)于腦部調(diào)控蜂王漿分泌機制的研究主要集中于不同日齡工蜂腦部磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)和膜蛋白質(zhì)組學(xué)方面,以及不同日齡普通意大利蜜蜂與高產(chǎn)王漿意大利蜜蜂之間的腦部蛋白質(zhì)組學(xué)[2,6,10,13]。此外,借助微陣列分析技術(shù)展開不同日齡工蜂腦部基因表達變化也有相關(guān)的報道[15]。目前,尚未有排除日齡因素影響而全面開展的腦部調(diào)控蜂王漿分泌網(wǎng)絡(luò)機制相關(guān)的研究?!緮M解決的關(guān)鍵問題】為了排除日齡因素的干擾,人工組建蜂群,收集3日齡工蜂、10日齡哺育蜂、10日齡采集蜂、21日齡哺育蜂、21日齡采集蜂,利用RNA-seq技術(shù)全面篩選哺育蜂腦部哺育行為相關(guān)的關(guān)鍵差異表達基因(differentially expressed gene,DEG),為深入研究哺育蜂腦部調(diào)控蜂王漿分泌的分子機制提供參考。
供試蜂群為‘蜂強1號’意大利蜜蜂蜂種,樣品于2017年10月至2018年8月采自福建農(nóng)林大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院(蜂學(xué)學(xué)院)教學(xué)蜂場。
體視顯微鏡1臺、冷光源儀器1臺、DEPC水(上海生工生物工程股份有限公司)、SYBR? Premix Ex TaqTMII(Tli RNaseH Plus)(TaKaRa公司)、75%酒精、干冰、碎冰。
試驗所用蜂群為正常健康的5群強群,每群蜂中至少含有2—3張即將出房的封蓋子脾。在組建新的蜂群之前,去除封蓋子脾上的蜜蜂,放于恒溫恒濕培養(yǎng)箱(34.5℃,相對濕度60%)中,每隔24 h用不同顏色的記號筆在剛出房的蜜蜂胸部或腹部做好標記,連續(xù)標記5 d,每天標記剛出房工蜂數(shù)目約為2 000—3 000頭。標記完后投入由一只蜂王、一張蜜粉脾、一張幼蟲脾組建的人工蜂群。
標記的工蜂發(fā)育到第3天時,直接收取工蜂作為3日齡工蜂;第10、21天時,收集頭部伸到有幼蟲巢房且持續(xù)時間超過10 s的工蜂作為哺育蜂;第10、21天時,在巢門口收集后足花粉筐中載有花粉的外勤蜂,將其作為采集蜂。按照這個要求,收集3日齡工蜂(3 d)、10日齡哺育蜂(10 dN)、10日齡采集蜂(10 dF)、21日齡哺育蜂(21 dN)、21日齡采集蜂(21 dF)。
參考趙元洪等[16]解剖蜜蜂大腦的方法,解剖5組樣品(3 d、10 dN、10 dF、21 dN、21 dF)的腦部,每組解剖10—15只,每組均設(shè)置3個生物學(xué)重復(fù)。3 d的3個生物學(xué)重復(fù)分別為3 d_1、3 d_2、3 d_3;10 dN的3個生物學(xué)重復(fù)分別為10 dN_1、10 dN_2、10 dN_3;10 dF的3個生物學(xué)重復(fù)分別為10 dF_1、10 dF_2、10 dF_3;21 dN的3個生物學(xué)重復(fù)分別為21 dN_1、21 dN_2、21 dN_3;21 dF的3個生物學(xué)重復(fù)分別為21 dF_1、21 dF_2、21 dF_3。委托北京諾禾致源生物有限公司開展總RNA質(zhì)量控制、cDNA文庫構(gòu)建和Illumina測序。
根據(jù)FPKM(Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped reads)值法計算每個基因在5組樣本中的表達量。利用DESeq2軟件分析差異表達基因,將校正后的-adjust<0.05作為篩選DEG的標準[17],其中l(wèi)og2fold change (FC)>0和log2FC<0分別作為篩選上調(diào)和下調(diào)DEG的標準。
篩選與哺育行為密切相關(guān)的DEG的標準如下:DEG在10 dN腦中的表達量顯著高于3 d和21 dF;DEG在10 dN腦中的表達量顯著高于10 dF;DEG在21 dN腦中的表達量顯著高于21 dF;DEG在10 dN與21 dN腦中的表達量無顯著差異。將10 dN與3 d之間產(chǎn)生的DEG記為10 dN3 d組,10 dN與21 dF之間產(chǎn)生的DEG記為10 dN21 dF組,10 dN與10 dF之間產(chǎn)生的DEG記為10 dN10 dF組,21 dN與21 dF之間產(chǎn)生的DEG記為21 dN21dF組,10 dN與21 dN產(chǎn)生的DEG為10 dN21 dN組。
通過韋恩圖分析,10 dN3 d與10 dN21 dF、10 dN10 dF、21 dN21 dF做交集會產(chǎn)生共有的DEG,這一共有DEG包括調(diào)控哺育行為及日齡發(fā)育等相關(guān),最后為減少日齡發(fā)育對篩選的影響,從共有DEG中去除10 dN21 dN與其交集產(chǎn)生的DEG,最后得到的即為嚴格篩選條件下與哺育行為密切相關(guān)的DEG。
通過clusterProfiler R軟件包和基因本體(GO)將關(guān)鍵DEG映射到GO數(shù)據(jù)庫中。通過BLAST軟件將篩選得到的DEG與KEGG數(shù)據(jù)庫比對。利用諾禾Novogene售后工具平臺(https://magic.novogene.com/ public/customer/main#/tool_rna/add_tool)對DEG進行KEGG pathway富集分析。
在DEG中隨機選取4個基因。利用Primer Premier 6設(shè)計特異性引物(表1),其中以(NM_001185146.1)作為內(nèi)參基因,委托上海生工生物工程有限公司進行引物合成。反應(yīng)體系:SYBR Premix Ex Taq Ⅱ(TaKaRa公司,日本)5 μL,引物(2 μmol·L-1)2 μL,模板(500 ng·μL-1)2 μL,ddH2O補充至10 μL。PCR程序分為3步:第一步為95℃預(yù)變性30 s;第二步為95℃變性5 s,60℃退火30 s,共 40個循環(huán);最后一步為熔解曲線分析:65℃開始,每5 s上升0.5℃,直至上升到95℃。整個反應(yīng)程序在熒光定量PCR儀(Bio-Rad公司,美國)上進行,按照說明書進行操作。以2-ΔΔCt法[18]計算哺育蜂腦部DEG的相對表達量。
15個工蜂腦樣品經(jīng)建庫和測序,有效讀段數(shù)介于56 348 822—82 964 416,樣本的單一匹配率均在72%以上,Q30值也都在88%以上,說明RNA-Seq數(shù)據(jù)質(zhì)量較好,測序數(shù)據(jù)可靠性高(表2)。
韋恩圖分析發(fā)現(xiàn),10 dN3 d有1 596個DEG;10 dN21 dF有578個DEG;10 dN10 dF有166個DEG;21 dN21 dF有1 315個DEG,將這4組進行交集分析得到42個DEG(圖1-A),這42個DEG包括調(diào)控哺育行為及日齡發(fā)育等相關(guān)。為減少日齡對篩選與哺育行為相關(guān)DEG的干擾,去除10 dN21 dN與42個DEG交集產(chǎn)生的1個DEG,最后得到41個DEG(圖1-B)。
表1 qPCR引物信息
表2 RNA-seq數(shù)據(jù)總覽
41個DEG的表達量熱圖聚類分析發(fā)現(xiàn),這些DEG主要在21 dN和10 dN組表達量較高(圖1-C);其中,在哺育蜂階段均上調(diào)表達的DEG有32個,均下調(diào)表達的有6個,剩余的3個DEG除在10 dN3 d中呈上調(diào)表達外,其余都是在哺育蜂階段呈下調(diào)表達(表3)。
A、B:篩選哺育蜂腦部哺育行為相關(guān)DEG韋恩圖 Venn diagram of selected-DEGs related to nursing behavior of nurses;C:41個DEG表達量聚類熱圖 41 DEGs expression clustering heat map
32個在哺育蜂階段均上調(diào)表達的DEG為腦中與哺育行為密切相關(guān)的DEG。將32個DEG在10 dN10 dF和21 dN21 dF中按照log2FC值從高到低的順序排列,其中差異倍數(shù)最大的為編碼王漿主蛋白1(MRJP1)的基因(log2FC (10 dN10 dF)=9.44,log2FC (21 dN21 dF)=5.71),該基因在哺育蜂階段高量表達(10 dN、21 dN腦中FPKM值分別為1 564.78和510.71),在3日齡工蜂和采集蜂階段呈低量表達(3 d、10 dF和21 dF腦中FPKM值分別為0.40、2.27和9.64);其次為(編碼毒酸磷酸酶Acph-1樣)、(編碼突觸小泡糖蛋白2C)、(編碼羧肽酶Q樣)、(編碼葡萄糖基神經(jīng)酰胺酶4),其中在哺育蜂階段呈高量表達(10 dN和21 dN腦中FPKM值分別為75.03、50.90),在3日齡工蜂和采集蜂階段呈低量表達(3 d、10 dF和21 dF腦中FPKM值分別為2.83、7.81和8.63);還在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)編碼氣味結(jié)合蛋白(odorant binding protein,OBP)的3個基因、、,以及編碼細胞色素P450家族之一的基因(表4)。
表3 腦部41個DEG基于日齡依賴性在5組樣本中的顯著性趨勢
↑:顯著性上調(diào)significantly up-regulated;↓:顯著性下調(diào)significantly down-regulated;ns:兩組樣本之間無顯著性差異No significant difference
表4 腦部前11個上調(diào)DEG在5組樣本中的表達信息
GO富集分析(表5)發(fā)現(xiàn)32個上調(diào)DEG主要參與氧化還原酶活性(4個DEG)、氣味結(jié)合(3個DEG)、跨膜運輸(2個DEG),GO富集中未發(fā)現(xiàn)有顯著性富集的基因。
通過KEGG富集分析,發(fā)現(xiàn)上調(diào)表達的DEG(圖2)主要參與蛋白質(zhì)代謝(核糖體)、能量代謝(氧化磷酸化、碳代謝、三羧酸循環(huán)、淀粉和蔗糖代謝、氮代謝、其他聚糖降解通路)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(Toll和Imd信號通路、光傳導(dǎo)、鞘脂代謝)、消化作用(溶酶體),其中顯著性富集在鞘脂代謝和其他聚糖降解通路上。
表5 上調(diào)DEG富集的GO條目
為驗證測序數(shù)據(jù)的準確性,從41個DEG中選取3個上調(diào)基因(、和)和1個下調(diào)基因(),結(jié)果顯示這些基因表達水平的趨勢變化與RNA-seq數(shù)據(jù)中的變化趨勢基本一致(圖3),證實了測序結(jié)果的可信性。
圖2 哺育蜂哺育行為相關(guān)DEG的KEGG功能富集分析
黑色柱狀圖表示RNA-seq數(shù)據(jù)中基因的FPKM值,灰色表示qPCR數(shù)據(jù)中基因的相對表達量,縱坐標均為相應(yīng)取過以2為底的對數(shù)值The black bar graph represents the FPKM value of the gene in the RNA-seq data, and the gray represents the relative expression of genes in the qPCR data; the ordinates are the corresponding logarithmic values with a base of 2。圖中數(shù)據(jù)為平均值±標準誤,采用單因素方差分析 Data in the figure are the mean±SE, One-way Anova. *P<0.05; **P<0.01; ***P<0.001
蜜蜂腦部的研究大多基于腦細胞的化學(xué)功能、結(jié)構(gòu)、內(nèi)分泌活動以及腦部基因和蛋白質(zhì)表達的時態(tài)變化,如保幼激素、生物胺、多巴胺、5-羥色胺和章魚胺在腦中對蜜蜂行為發(fā)育的調(diào)節(jié)起著關(guān)鍵作用[19]。此外,神經(jīng)分子(例如神經(jīng)肽)被稱為中樞神經(jīng)系統(tǒng)回路中的神經(jīng)遞質(zhì)和神經(jīng)調(diào)節(jié)劑[20],對蜜蜂腦中神經(jīng)功能的肽能調(diào)節(jié)產(chǎn)生重大影響[21],也有研究表明腦部神經(jīng)肽組的重構(gòu)用以適應(yīng)蜂王漿高產(chǎn)的需要[14]。哺育蜂對幼蟲的哺育行為是建立在其大腦對幼蟲信息素信號的接收和反饋基礎(chǔ)上的[4,14]。哺育蜂哺育行為介導(dǎo)的蜂王漿分泌機制的研究大多集中在咽下腺和上顎腺[6,22-23],有關(guān)腦部調(diào)控哺育行為介導(dǎo)蜂王漿分泌的分子機制方面的研究相對較少。
本研究人工組建蜂群收集3日齡工蜂,10日齡哺育蜂、采集蜂,21日齡哺育蜂、采集蜂,利用RNA-seq技術(shù),在減小日齡的干擾下嚴格篩選出41個DEG,其中32個與哺育蜂哺育行為密切相關(guān)。WHITFIELD等通過基因芯片技術(shù)檢測到哺育蜂和采集蜂腦之間約有1 800個DEG[7],而本研究只篩選出41個DEG,主要有以下原因:首先本研究的試驗樣本來自人工構(gòu)建相同日齡的哺育蜂和采集蜂;構(gòu)建兩個時間點(10日齡和21日齡)的同日齡哺育蜂和采集蜂,然后取共有的DEG。這兩個嚴格條件可以排除日齡的影響,導(dǎo)致篩選的DEG數(shù)目較少,進一步保證結(jié)果更加可靠。GO富集分析顯示上調(diào)DEG主要參與氧化還原酶活性、氣味結(jié)合、跨膜運輸;KEGG富集通路顯示這些上調(diào)DEG主要參與蛋白質(zhì)代謝、能量代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等(圖2),其中顯著性富集在鞘脂代謝和其他聚糖降解通路上。
突觸囊泡糖蛋白2(SV2)具有許多功能,包括囊泡運輸、穩(wěn)定神經(jīng)遞質(zhì)囊泡負載、錨定囊泡蛋白、協(xié)助囊泡運輸、調(diào)節(jié)鈣敏感性以及與細胞外基質(zhì)相互作用;在脊椎動物中,SV2家族由3個副產(chǎn)物組成,包括SV2A、SV2B和SV2C,其中SV2C的表達是最受限制的,僅局限于進化古老的大腦區(qū)域,在紋狀體、中腦和腹側(cè)蒼白球均有較強的表達,而在新皮層的表達很少[24]。SV2C參與中樞系統(tǒng)中多巴胺的釋放,其缺失可以引起小鼠運動障礙、增加-突觸核蛋白單體的聚集和降低紋狀體多巴胺的釋放[25]。本研究在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)編碼SV2C的基因,該基因在3日齡工蜂和采集蜂階段基本不表達(3 d、10 dF和21 dF中該基因的FPKM值分別為0.22、0.47和0.60),而在哺育蜂階段的表達量相對較高(10 dN和21 dN腦中FPKM值分別為12.81和11.96)?;瘜W(xué)神經(jīng)傳遞對神經(jīng)元之間的交流至關(guān)重要,在這個交流過程中,Ca2+涌入突觸前末端,觸發(fā)神經(jīng)遞質(zhì)釋放進入突觸,作用于突觸后受體[24]。此外,GO富集結(jié)果也顯示參與跨膜運輸功能,推測工蜂腦部的在調(diào)節(jié)Ca2+敏感性,促進神經(jīng)遞質(zhì)作用于突觸后受體,從而引發(fā)哺育行為方面發(fā)揮重要作用。
葡萄糖神經(jīng)酰胺是300多種結(jié)構(gòu)不同的鞘糖脂(包括神經(jīng)節(jié)苷脂和硫苷脂)的骨架,對于哺乳動物的發(fā)育至關(guān)重要。葡萄糖神經(jīng)酰胺是一種膜鞘磷脂,是許多糖脂的前體[26]。葡糖苷神經(jīng)酰胺合成酶催化神經(jīng)酰胺產(chǎn)生葡萄糖神經(jīng)酰胺,它是神經(jīng)節(jié)苷脂類的前體物質(zhì)[27]。在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)編碼葡萄糖基神經(jīng)酰胺酶的基因和,KEGG富集結(jié)果顯示這兩個基因顯著性富集在鞘脂代謝路徑上。鞘脂及其代謝產(chǎn)物不僅是構(gòu)成細胞膜的重要結(jié)構(gòu)分子,而且參與調(diào)節(jié)細胞的生長、分化、衰老和細胞程序性死亡等許多重要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,使細胞產(chǎn)生各種不同的生物學(xué)功能[28]。
藥理學(xué)研究表明,在發(fā)育的大腦中,sn-1特異性二?;视椭久富钚允禽S突生長和引導(dǎo)所必需的[29-30]。在哺育蜂階段富集的光傳導(dǎo)途徑可能表明該通路在哺育蜂從事巢外工作接受光信號中發(fā)揮重要作用[31]。本研究在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)編碼sn-1特異性二酰基甘油脂肪酶的基因富集在光傳導(dǎo)途徑中。
在昆蟲中,氣味結(jié)合蛋白(OBP)和化學(xué)感受蛋白(chemosensory protein,CSP)在運載疏水性氣味分子和信息素穿過淋巴液的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮重要作用[32-33]。OBP14在蜂群的上顎腺中含量豐富,與單萜類結(jié)構(gòu)有較好的親和力;OBP21在老蜂體內(nèi)含量豐富,并與法尼素結(jié)合,而法尼素是一種吸引蜂群的信息素[34]。OBP和CSP可以與多種配體結(jié)合,但是與蜜蜂的幼蟲信息素有更高的結(jié)合力[33,35]。本研究在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)了、、;Nie等在意蜂的觸角轉(zhuǎn)錄組中發(fā)現(xiàn)、、,其中、在觸角中的表達量從剛出房工蜂到哺育蜂階段呈增加趨勢,而在哺育蜂階段到采集蜂階段呈減小趨勢[36],這與本研究在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)的這兩個基因的表達趨勢基本一致,推測這兩個基因可能在腦部化學(xué)信息的傳遞和調(diào)控方面發(fā)揮重要作用。
哺育蜂通過調(diào)節(jié)對幼蟲信息素的識別和采集蜂的采集能力等來增加蜂群群體的營養(yǎng)供應(yīng)進而提高蜂王漿的分泌。細胞的一切行為都需要信號分子和受體結(jié)合,通過信號轉(zhuǎn)導(dǎo)實現(xiàn)。這些與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因(和)在哺育蜂腦中呈上調(diào)表達,暗示哺育蜂可能通過這些基因增強信號轉(zhuǎn)導(dǎo),進而在感知揮發(fā)物信息素后啟動高效蛋白合成的機制。
氧化磷酸化是真核生物體內(nèi)有機物包括糖、脂、氨基酸等在分解過程中發(fā)生氧化并驅(qū)動ATP合成的過程,生物體內(nèi)95%的ATP來自這種方式[37]。腦部為滿足其較高的代謝速率需要消耗很多的ATP,因此有大量的線粒體位于大腦細胞中。除氧化磷酸化外,三羧酸循環(huán)(TCA循環(huán))和碳代謝也是生物體能量代謝產(chǎn)生ATP的重要途徑。在細胞和器官中,三羧酸循環(huán)(TCA循環(huán))是產(chǎn)生能量的關(guān)鍵過程,本研究在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)編碼琥珀酸脫氫酶[泛醌]黃素蛋白亞基的基因,表明哺育蜂腦部可能通過有氧氧化(TCA循環(huán))葡萄糖產(chǎn)生大量ATP。此外,該基因還顯示富集在氧化磷酸化、碳代謝、三羧酸循環(huán)通路,這些結(jié)果表明哺育蜂腦部可能通過多種途徑為哺育行為提供充足的能量。
昆蟲細胞色素P450酶參與多種代謝活動,包括外源性物質(zhì)降解、保幼激素和蛻皮類固醇生物合成、信息素代謝[9]。在相同日齡哺育蜂和采集蜂腦中,發(fā)現(xiàn)在10日齡哺育蜂和21日齡哺育蜂腦中的表達量均顯著高于相同日齡采集蜂中表達量;GO富集分析表明該基因參與氧化還原酶活性。唐曉偉根據(jù)細胞色素P450與血紅素結(jié)合區(qū)域設(shè)計的簡并引物克隆出一段蜜蜂細胞色素P450基因片段,進而克隆得到該基因全長,并由細胞色素P450命名委員會命名為[38]。該基因?qū)儆贑YP6家族成員,但是關(guān)于該基因的功能尚未有深入研究。在果蠅中,CYP6家族的成員羥化了月桂酸的ω-1位置,這表明CYP6家族的成員參與了昆蟲的脂肪酸羥化反應(yīng)[23,39]。BOUTIN等通過在清理行為和非清理行為工蜂腦部的差異表達基因中發(fā)現(xiàn)在清理行為工蜂腦部高表達的細胞色素P450基因,推測可能是清理行為工蜂對外源性物質(zhì)(如幼蟲發(fā)出的信息素等氣味)的高敏感性引發(fā)細胞色素P450基因的高量表達[40]。在哺育蜂腦中發(fā)現(xiàn)上調(diào)表達,推測該基因可能在哺育蜂腦部調(diào)控脂肪酸羥基化或降解幼蟲釋放的請求飼喂的信息素過程中發(fā)揮作用。哺育蜂能夠感知幼蟲信息素并通過外圍化學(xué)感受器官傳輸信號到大腦;通過高級中樞神經(jīng)器官-大腦調(diào)控上顎腺和咽下腺合成蛋白質(zhì)和脂肪酸等重要大分子物質(zhì),引發(fā)腦部產(chǎn)生哺育行為,進而促進咽下腺和上顎腺等腺體產(chǎn)生蜂王漿分泌的行為。上述富集的通路說明大腦在這一時期的基礎(chǔ)能量供應(yīng)和蛋白、脂肪酸合成都得到加強,這樣更有利于大腦進行信息處理和行為調(diào)控,從而促進哺育蜂的哺育行為。
值得注意的是,在上調(diào)DEG中發(fā)現(xiàn)編碼王漿主蛋白1(MRJP1)的,目前該基因尚未有相關(guān)功能的報道。該基因在NCBI意大利蜜蜂基因組新版本Amel_HAv3.1中尚未注釋,但以前版本Amel_4.5中有注釋。針對該基因特異序列設(shè)計引物,通過熒光定量檢測該基因在腦中表達,且在哺育蜂腦中顯著高量表達(圖3),該基因有可能是蜂王漿主蛋白家族的新成員,后續(xù)可以通過克隆基因全長進行驗證。前人在蜜蜂腦中也檢測到蜂王漿主蛋白家族基因的表達,但在腦中發(fā)揮的作用尚不明確。RNA-seq測序?qū)⒕哂行l(wèi)生行為和不具有衛(wèi)生行為工蜂腦進行比較[40],也發(fā)現(xiàn)在這兩種行為工蜂腦部高量表達。蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)MRJP1、MRJP2和MRJP7蛋白在哺育蜂腦中的含量顯著高于采集蜂腦中含量,推測這些基因可能為腦中蛋白質(zhì)的合成過程儲存氨基酸[41]。在本研究構(gòu)建的相同日齡哺育蜂和采集蜂腦的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,檢測到()在哺育蜂腦中顯著高量表達,暗示該基因可能在哺育行為調(diào)控蜂王漿合成和分泌過程中發(fā)揮重要作用。
在mRNA組學(xué)水平對3日齡工蜂、10日齡哺育蜂、10日齡采集蜂、21日齡哺育蜂、21日齡采集蜂5組樣本腦組織進行全面表征分析,獲得了相同日齡哺育蜂和采集蜂腦部基因的轉(zhuǎn)錄組圖譜,分析得到了哺育行為密切相關(guān)的32個上調(diào)差異表達基因。哺育蜂腦部的差異表達基因主要通過信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和能量代謝等途徑調(diào)控哺育蜂的哺育行為,研究結(jié)果可為闡明哺育蜂哺育行為的分子機制提供理論參考。
[1] BEZABIH G, CHENG H, HAN B, FENG M, XUE Y, HU H, LI J K. Phosphoproteome analysis reveals phosphorylation underpinnings in the brains of nurse and forager honeybees ()., 2017, 7: 1973.
[2] HAN B, FANG Y, FENG M, HU H, HAO Y, MA C, HUO X, MENG L, ZHANG X, WU F, LI J K. Brain membrane proteome and phosphoproteome reveal molecular basis associating with nursing and foraging behaviors of honeybee workers., 2017, 16(10): 3646-3663.
[3] SIALANA F J, MENEGASSO A R S, SMIDAK R, HUSSEIN A M, ZAVADIL M, RATTEI T, LUBEC G, PALMA M S, LUBEC J. Proteome changes paralleling the olfactory conditioning in the forager honey bee and provision of a brain proteomicsdataset., 2019, 19(13): e1900094.
[4] CONTE Y L, MOHAMMEDI A, ROBINSON G E. Primer effects of a brood pheromone on honeybee behavioural development., 2001, 268(1463): 163-168.
[5] FUJITA T, KOZUKA-HATA H, AO-KONDO H, KUNIEDA T, OYAMA M, KUBO T. Proteomic analysis of the royal jelly and characterization of the functions of its derivation glands in the honeybee., 2012, 12(1): 404-411.
[6] ALTAYE S Z, MENG L F, LI J K. Molecular insights into the enhanced performance of royal jelly secretion by a stock of honeybee () selected for increasing royal jelly production., 2019, 50(4): 436-453.
[7] WHITFIELD C W, CZIKO A M, ROBINSON G E. Gene expression profiles in the brain predict behavior in individual honey bees.,2003, 302(5643): 296-299.
[8] KUCHARSKI R, MALESZKA R. Evaluation of differential gene expression during behavioral development in the honeybee using microarrays and northern blots., 2002, 3(2): RESEARCH0007.
[9] RODRIGUEZ-ZAS S L, SOUTHEY B R, SHEMESH Y, RUBIN E B, COHEN M, ROBINSON G E, BLOCH G. Microarray analysis of natural socially regulated plasticity in circadian rhythms of honey bees., 2012, 27(1): 12-24.
[10] HERNáNDEZ L G, LU B, DA CRUZ G C, CALáBRIA L K, MARTINS N F, TOGAWA R, ESPINDOLA F S, YATES J R, CUNHA R B, DE SOUSA M V. Worker honeybee brain proteome., 2012, 11(3): 1485-1493.
[11] PAERHATI Y, ISHIGURO S, UEDA-MATSUO R, YANG P, YAMASHITA T, ITO K, MAEKAWA H, TANI H, SUZUKI K. Expression ofof the gustatory receptor family in honey bee is correlated with nursing behavior., 2015, 10(11): e0142917.
[12] KNECHT D, KAATZ H H. Patterns of larval food production by hypopharyngeal glands in adult worker honey bees., 1990, 21(5): 457-468.
[13] HAN B, FANG Y, FENG M, HU H, QI Y P, HUO X M, MENG L F, WU B, LI J K. Quantitative neuropeptidome analysis reveals neuropeptides are correlated with social behavior regulation of the honeybee workers., 2015, 14(10): 4382-4393.
[14] 韓賓. 工蜂勞動分工與蜂王漿高產(chǎn)機理的大腦神經(jīng)肽組、膜蛋白質(zhì)組和膜磷酸化蛋白質(zhì)組研究[D]. 北京: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院, 2017.
HAN B. Investigation of molecular basis associating with division of labor and high royal jelly yields by analyzing brain neuropeptidome, membrane proteome and membrane phosphoproteome[D]. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences, 2017. (in Chinese)
[15] TSUCHIMOTO M, AOKI M, TAKADA M, KANOU Y, SASAGAWA H, KITAGAWA Y, KADOWAKI T. The changes of gene expression in honeybee () brains associated with ages., 2004, 21(1): 23-28.
[16] 趙元洪, 趙曉蒙, 蘇松坤. 蜜蜂全腦解剖新方法的研究. 中國蜂業(yè), 2014, 65(Z1): 4-7.
ZHAO Y H, ZHAO X M, SU S K. New method on dissection of whole brain of honeybee., 2014, 65(Z1): 4-7. (in Chinese)
[17] ANDERS S, HUBER W. Differential expression analysis for sequence count data., 2010, 11(10): R106.
[18] LIVAK K J, SCHMITTGEN T D. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2?ΔΔCTmethod., 2001, 25(4): 402-408.
[19] SCHULZ D J, BARRON A B, ROBINSON G E. A role for octopamine in honey bee division of labor., 2002, 60(6): 350-359.
[20] XU G, TENG Z W, GU G X, QI Y X, GUO L, XIAO S, WANG F, FANG Q, WANG F, SONG Q S, STANLEY D, YE G Y. Genome- wide characterization and transcriptomic analyses of neuropeptides and their receptors in an endoparasitoid wasp,., 2019, 103(2): e21625.
[21] PRATAVIEIRA M, DA SLIVA MENEGASSO A R, ESTEVES F G, SATO K U, MALASPINa O, PALMA M S. MALDI imaging analysis of neuropeptides in africanized honeybee () brain: effect of aggressiveness., 2018, 17(7): 2358-2369.
[22] LIU Z, JI T, YIN L, SHEN J, SHEN F, CHEN G. Transcriptome sequencing analysis reveals the regulation of the hypopharyngeal glands in the honey bee,Pollmann., 2013, 8(12): e81001.
[23] WU Y Q, ZHENG H Q, CORONA M, PIRK C, MENG F, ZHENG Y F, HU F L. Comparative transcriptome analysis on the synthesis pathway of honey bee () mandibular gland secretions., 2017, 7(1): 4530.
[24] STOUT K A, DUNN A R, HOFFMAN C, MILLER G W. The synaptic vesicle glycoprotein 2: structure, function, and disease relevance., 2019, 10(9): 3927-3938.
[25] MAZZUCCHELLI C, BRAMBILLA R. Ras-related and MAPK signalling in neuronal plasticity and memory formation., 2000, 57(4): 604-611.
[26] ASTUDILLO L, THERVILLE N, COLACIOS C, SéGUI B, ANDRIEU-ABADIE N, LEVADE T. Glucosylceramidases and malignancies in mammals., 2016, 125: 267-280.
[27] 孫九麗, 林慧珍, 茍萍. 鞘脂代謝及其相關(guān)疾病研究進展. 生物技術(shù), 2011, 21(5): 93-97.
SUN J L, LIN H Z, GOU P. Research progress of sphingolipid metabolism and related diseases., 2011, 21(5): 93-97. (in Chinese)
[28] SHI J, ANDERSON D, LYNCH B A, CASTAIGNE J G, FOERCH P, LEBON F. Combining modelling and mutagenesis studies of synaptic vesicle protein 2A to identify a series of residues involved in racetam binding., 2011, 39(5): 1341-1347.
[29] BISOGNO T, HOWELL F, WILLIAMS G, MINASSI A, CASCIO M, LIGRESTI A, MATIAS I, SCHIANO-MORIELLO A, PAUL P, WILLIAMS E J, GANGADHARAN U, HOBBS C, DI MARZO V, DOHERTY P. Cloning of the first sn1-DAG lipases points to the spatial and temporal regulation of endocannabinoid signaling in the brain., 2003, 163(3): 463-468.
[30] BRITTIS P A, SILVER J, WALSH F S, DOHERTY P. Fibroblast growth factor receptor function is required for the orderly projection of ganglion cell axons in the developing mammalian retina., 1996, 8(2/3): 120-128.
[31] RIDGE K D, ABDULAEV N G, SOUSA M, PALCZEWSKI K. Phototransduction: crystal clear., 2003, 28(9): 479-487.
[32] STEINBRECHT R A. Odorant-binding proteins: expression and function., 1998, 855(1): 323-332.
[33] BRIAND L, SWASDIPAN N, NESPOULOUS C, BéZIRARD V, BLON F, HUET J C, EBERT P, PERNOLLET J C. Characterization of a chemosensory protein (ASP3c) from honeybee (L.) as a brood pheromone carrier., 2002, 269(18): 4586-4596.
[34] IOVINELLA I, DANI F, NICCOLINI A, SIMONA S, MICHELUCCI E, GAZZANO A, TURILLAZZI S, FELICIOLI A, PELOSI P. Differential expression of odorant-binding proteins in the mandibular glands of the honey bee according to caste and age., 2011, 10(8): 3439-3449.
[35] WU F, FENG Y L, HAN B, HU H, FENG M, MENG L F, MA C, YU L S, LI J K. Mechanistic insight into binding interaction between chemosensory protein 4 and volatile larval pheromones in honeybees ()., 2019, 141: 553-563.
[36] NIE H Y, XU S P, XIE C Q, GENG H Y, ZHAO Y Z, LI J H, HUANG W F, LIN Y, Li Z G, SU S K. Comparative transcriptome analysis ofantennae of workers performing different tasks., 2017, 293(1): 237-248.
[37] LESNEFSKY E J, HOPPEL C L. Oxidative phosphorylation and aging., 2006, 5(4): 402-433.
[38] 唐曉偉. 西方蜜蜂細胞色素P450單加氧酶特性初步研究[D]. 北京: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院, 2011.
TANG X W. Preliminary study on cytochrome P450 monooxygenase of[D]. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences, 2011. (in Chinese)
[39] HELVIG C, TIJET N, FEYEREISEN R, WALKER F A, RESTIFO L L.CYP6A8, an insect P450 that catalyzes lauric acid (omega-1)-hydroxylation., 2004, 325(4): 1495-1502.
[40] BOUTIN S, ALBURAK M, MERCIER P L, GIOVENAZZO P, DEROME N. Differential gene expression between hygienic and non-hygienic honeybee (L.) hives., 2015, 16(1): 500.
[41] GARCIA L, GARCIA C H, CALáBRIA L K, DA CRUZ G C, Puentes A S, BáO S N, FONTES W, RICART C A, ESPINDOLA F S, DE SOUSA M V. Proteomic analysis of honey bee brain upon ontogenetic and behavioral development., 2009, 8(3): 1464-1473.
Transcriptomic analysis of genes related to nursing behavior in the brains of
GAO Yan, ZHU YaNan, LI QiuFang, SU SongKun, NIE HongYi
(College of Animal Sciences (College of Bee science), Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002)
【Objective】The nursing behavior ofplays an important role in maintaining colony stability and production of royal jelly (RJ). In this study, samples (3-day-old worker bees, 10-day-old nurses/foragers, 21-day-old nurses/foragers) were obtained by constructing artificial colony, which can eliminate the influence of age on nursing behavior. Moreover, genes closely related to the nursing behavior were strictly screened out in the brain of these samples, which could reveal the molecular network of brain regulation of nursing behavior.【Method】The 3-day-old worker bees, 10-day-old nurses and foragers, 21-day-old nurses and foragers were obtained by constructing artificial bee colony. And then the head of different group’s worker bees was dissected to obtain brain tissues of these samples. RNA-seq was used to analyze the transcriptome sequencing of the 5 groups (3-day-old worker bees, 10-day-old nurses, 10-day-old foragers, 21-day-old nurses, 21-day-old foragers) of brain samples. Differentially expressed genes (DEGs) which are closely related to the nursing behavior in the nurses’ brain were screened out. GO and KEGG enrichment analysis were carried out for these genes. qPCR was used to verify the expression patterns of 4 randomly selected DEGs.【Result】RNA-seq analysis screened out 32 DEGs that were closely related to the nursing behavior of nurses. These genes were significantly up-regulated in the brain of 10-day-old nurses than 3-day-old worker bees, 10-day-old foragers and 21-day-old foragers, and the expression level in the brain of 21-day-old nurses was significantly higher than that in 21-day-old foragers. Go enrichment analysis showed that the up-regulated DEGs were mainly involved in oxidoreductase activity, odor binding, transmembrane transport and other functional items. KEGG enrichment results showed that the up-regulated DEGs were mainly involved in protein metabolism (ribosome), energy metabolism (oxidative phosphorylation, carbon metabolism, the citrate cycle (TCA cycle), starch and sucrose metabolism, nitrogen metabolism and other glycan degradation pathway), signal transduction (Toll and Imd signaling pathways, phototransduction, sphingolipid metabolism), digestive function (lysosome). Of them, only sphingolipid metabolism and other glycan degradation pathway were notably enriched. qPCR results showed that the expression patterns of 3 up-regulated DEGs (,,) and 1 down-regulated DEG () were consistent with the sequencing data.【Conclusion】To obtain gene expression profiles of brains from age-matched nurses and foragers, the brains of 5 groups (3-day-old worker bees, 10-day-old nurses, 10-day-old foragers, 21-day-old nurses, and 21-day-old foragers) were comprehensively analyzed using transcriptome sequencing, revealing that the 32 up-regulated DEGs were associated with brain nursing behavior. These genes were mainly involved in signal transduction and energy metabolism, which can affect the nursing behavior.
; nurses; brain; nursing behavior; royal jelly; RNA-seq
2020-01-17;
2020-03-10
國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(蜜蜂)(CARS-44-KXJ4)、福建省自然科學(xué)基金(2018J05043)、福建省省屬高??蒲许椖浚↗K2017014)
高艷,E-mail:2726820378@qq.com。通信作者蘇松坤,E-mail:susongkun@zju.edu.cn。通信作者聶紅毅,E-mail:hnhynie@126.com
(責(zé)任編輯 岳梅)