鄧潔薇,楊運(yùn)云,林 里,欒天罡,
(1.廣東工業(yè)大學(xué)生物醫(yī)藥學(xué)院,廣州510006;2.廣東省科學(xué)院,廣東省測試分析研究所(中國廣州分析測試中心),廣東省化學(xué)危害應(yīng)急檢測技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東省原位電離質(zhì)譜分析工程技術(shù)中心,廣州510070;3.中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,有害生物控制與資源利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和南海生物資源開發(fā)與利用協(xié)同創(chuàng)新中心,廣州510275)
溞屬(Daphnia)生物是一類枝角類淡水浮游動物,體長在0.2~5.0 mm之間,生活在沼澤、池塘、湖泊及河流等多種水環(huán)境中[1]. 溞屬生物屬于一類重要的淡水浮游動物,在水生生態(tài)系統(tǒng)中起著重要的能量和養(yǎng)分輸送作用,常用作生態(tài)學(xué)、遺傳學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)和環(huán)境科學(xué)研究的模式生物[2,3]. 大型溞(Daphnia magna)和蚤狀溞(Daphnia pulex)是Daphnia的2大類最常見物種,它們的形態(tài)特征非常相似,肉眼難以區(qū)分. 傳統(tǒng)的Daphnia物種鑒定是基于顯微鏡或電子顯微鏡的形態(tài)學(xué)觀察,操作簡便直觀,但需要經(jīng)驗(yàn)豐富的專家對細(xì)微的形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行識別和鑒定,并且存在細(xì)微差異的近緣種或者近似種因形態(tài)特征相似而難以鑒別區(qū)分[4]. 近年來,基于分子生物學(xué)[4,5]和蛋白組學(xué)[6,7]的生物鑒定方法得到迅速發(fā)展,這對形態(tài)特征極其相似的近緣種或近似種等生物的分類起到了積極作用. 然而,這些方法操作繁瑣,需要多步驟樣品處理,無法實(shí)現(xiàn)物種的快速識別和分類. 因此,開發(fā)快速、可靠的生物分子鑒定與分類方法具有重要意義.
脂質(zhì)是生物體的重要活性化學(xué)物質(zhì),在細(xì)胞膜組成、能量儲存和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物功能中發(fā)揮著重要作用[8]. 生物體具有獨(dú)特的脂類特征,特定的脂類組學(xué)信息與生理或病理狀態(tài)下的各種生物過程有關(guān). 這些分子特征可為深入了解與脂質(zhì)組成相關(guān)的生物學(xué)功能以及生物種屬鑒定提供重要依據(jù). 質(zhì)譜(MS)具有靈敏度高、選擇性好、特異性好及信息豐富等優(yōu)點(diǎn),是進(jìn)行脂質(zhì)組學(xué)研究的主流技術(shù)手段[9~11]. 近年來,常壓敞開式質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展迅速,該技術(shù)具有原位、實(shí)時、直接、快速和高通量分析的特點(diǎn),為常壓敞開環(huán)境條件下的直接生物脂質(zhì)分析和組學(xué)研究提供了重要手段[12,13]. 如,Cooks等[14]利用解吸電噴霧電離質(zhì)譜(DESI-MS)分析了人腦膠質(zhì)瘤和腦實(shí)質(zhì)的脂質(zhì)代謝特征;Vertes 等[15]利用激光燒蝕電噴霧離子化質(zhì)譜(LAESI-MS)研究了非洲爪蟾卵細(xì)胞和胚胎細(xì)胞的磷脂組成與差異;Liu等[16]采用常壓敞開式聲波噴霧離子化質(zhì)譜(EASI-MS)技術(shù)研究了不同生長周期活體藻類細(xì)胞中脂質(zhì)化合物的變化和組成差異;Quyang 等[17]利用液滴微連接表面采樣探針質(zhì)譜(LMJ-SSP-MS)技術(shù)分析了大鼠不同組織器官中脂質(zhì)化合物及雙鍵異構(gòu)體的分布差異;Abliz等[18]利用空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜(AFADESI-MS)研究了原生狀態(tài)下的腫瘤相關(guān)脂質(zhì)代謝物和代謝酶.
表面修飾探針納升電噴霧質(zhì)譜(SCP-nanoESI-MS)是本課題組針對生物微尺度、原位、活體脂質(zhì)組學(xué)分析開發(fā)的一種固相微萃取與敞開式納升電噴霧質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù),其通過制備對脂質(zhì)化合物具有高富集能力的微尺度表面修飾探針,實(shí)現(xiàn)了小型生物甚至單細(xì)胞內(nèi)的脂質(zhì)化合物的高效萃取和敞開式納升電噴霧質(zhì)譜分析[19~21].
本文采用SCP-nanoESI-MS 技術(shù),對Daphnia屬D. magna和D. pulex個體進(jìn)行直接、原位、快速質(zhì)譜分析,建立了2種Daphnia的脂質(zhì)指紋圖譜,并進(jìn)行了脂質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定,結(jié)合化學(xué)計量學(xué)方法分析實(shí)現(xiàn)了D. magna和D. pulex的區(qū)分,為生物物種快速鑒別提供了新的技術(shù)手段.
甲醇和氯仿(色譜純,美國Burdick&Jackson 公司);二水氯化鈣、二水硫酸鎂、碳酸氫鈉、氯化鉀、高錳酸鉀、重鉻酸鉀和氫氧化鈉(分析純,廣州化學(xué)試劑廠);二甲基十八烷基[3-(三甲氧基硅基)丙基]氯化銨(50%甲醇溶液,德國Fluorochem 公司);殼聚糖(分子量326700)和三聚磷酸鈉(美國Sigma-Aldrich公司);實(shí)驗(yàn)用水為美國Mili-Q公司超純水儀制備的超純水.
LTQ-Orbitrap Elite 型線性離子阱-靜電場軌道阱高分辨質(zhì)譜儀(美國Thermo Fisher 公司);Sarix X 7T FT-ICR型傅里葉變換離子回旋共振質(zhì)譜儀(德國Bruker Daltonics公司);三維移動平臺(北京卓立漢光儀器有限公司);DM IL型倒置顯微鏡(德國Leica Microsystems 公司);BG12-94-4-N-20型納升電噴霧針(美國New Objective公司).
參照文獻(xiàn)[20]方法,采用RS-6065 型顯微解剖鎢針制作表面修飾探針:先用甲醇/水溶液(體積比1∶1)將顯微解剖鎢針的表面清洗干凈,然后置于含30 g/L 高錳酸鉀和15 g/L 重鉻酸鉀的30%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))硫酸溶液中,于90 ℃加熱回流24 h. 將鎢針取出,用超純水洗滌干凈,置于30%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))的氫氧化鈉溶液中,于90 ℃加熱回流24 h,使其表面羥基化. 將表面羥基化的鎢針浸入50 mL無水N,N-二甲基甲酰胺溶液中,加入2.5 mL 二甲基十八烷基[3-(三甲氧基硅基)丙基]氯化銨,在氮?dú)獗Wo(hù)下于120 ℃加熱回流反應(yīng)12 h. 然后,將探針浸入20 mL 殼聚糖溶液(4 mg/mL,溶于2%乙酸)中超聲30 min,向體系中繼續(xù)加入10 mL三聚磷酸鈉溶液(0.5 mg/mL)超聲1 h. 反應(yīng)完成后,取出探針,用甲醇沖洗干凈,晾干后即得表面修飾探針,置于干凈試管中待用.
D. magna購自廣州市微生物研究所,D. pulex由寧波大學(xué)贈送,二者均為本實(shí)驗(yàn)室連續(xù)培養(yǎng)三代以上的單克隆品系.D. magna和D. pulex采用靜水式培養(yǎng),于人工淡水(1000 mL 超純水中加入58.5 mg二水氯化鈣、24.7 mg二水硫酸鎂、13.0 mg碳酸氫鈉和1.2 mg氯化鉀,曝氣24 h)中培養(yǎng),培養(yǎng)溫度(20±1)℃,光暗比16∶8,每天喂食淡水藻(Scenedesmus subspicatus)2次.
使用制備的表面修飾探針進(jìn)行采樣和萃取. 在倒置顯微鏡觀察下,用精密三維操作臺控制探針精確地插入到D. magna或D. pulex的腹部進(jìn)行采樣和萃?。⊿cheme 1),采樣深度為50 μm,采樣時間為60 s. 采樣結(jié)束后,將探針從D. magna或D. pulex體內(nèi)取出,放入純水中清洗10 s,自然晾干后,待分析.
Scheme 1 Schematic diagram for analysis of D. magna and D. pulex by SCP?nanoESI?MS
使用微量注射器將1 μL解吸/噴霧溶劑加入到一支納升電噴霧針的尖端位置. 將萃取后的微尺度表面修飾探針裝載到納升電噴霧針中,使探針的尖端置于解吸/噴霧溶劑中進(jìn)行脂質(zhì)化合物的解吸,解吸時間為30 s. 隨后,將表面修飾探針與納升電噴霧針一起安裝到三維移動臺上,使納升電噴霧針的尖端對準(zhǔn)質(zhì)譜入口并距離質(zhì)譜入口5 mm. 施加+3.0 kV高壓電場于探針上,誘導(dǎo)解吸/噴霧溶劑產(chǎn)生納升電噴霧離子化進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析.
質(zhì)譜分析采用LTQ-Orbitrap-MS(分辨率約為1.2×105)和FT-ICR-MS(4M 記錄模式,質(zhì)量分辨率約2×105)進(jìn)行. 離子傳輸管溫度300 ℃;鞘氣和輔氣均為0 arb;質(zhì)譜記錄采用全掃描模式,掃描質(zhì)量范圍為m/z200~1200. 多級質(zhì)譜分析采用LTQ-Orbitrap-MS的高能碰撞解離(HCD)進(jìn)行. 儀器控制和數(shù)據(jù)處理采用Xcalibur 2.2和FT-MS control軟件.
將質(zhì)譜圖扣除背景信號和同位素峰,脂質(zhì)化合物采用精確質(zhì)量數(shù)(質(zhì)量數(shù)誤差<0.005 Da)和二級質(zhì)譜離子碎片信息進(jìn)行鑒定,并結(jié)合脂質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品和脂質(zhì)數(shù)據(jù)庫(http://lipid MAPS.org)進(jìn)行比對;統(tǒng)計分析采用Microcal Origin 8.0 軟件(美國Northampton 公司);主成分分析采用SIMCA-P 11.5 軟件(瑞典Umetrics公司).
SCP-nanoESI-MS 分析D. magna和D. pulex的過程如Scheme 1 所示. 實(shí)驗(yàn)采用的微尺度表面修飾探針的基體是尖端為1 μm的顯微解剖鎢探針,經(jīng)表面羥基化和硅烷化修飾上對脂質(zhì)化合物具有高選擇性和高富集能力的涂層材料,再經(jīng)離子凝膠化在探針表面進(jìn)一步修飾上殼聚糖聚合物外層,以提高探針的生物相容性,所獲得的微尺度表面修飾探針的尖端直徑小于5 μm,非常有利于對單個小型生物微尺度的原位萃取采樣[20]. 該探針對復(fù)雜生物樣品中的長鏈脂質(zhì)化合物如磷脂酰膽堿(PC)和甘油三酯(TAG)具有選擇性吸附能力,對不同PC的富集能力達(dá)100~300倍,且具有良好的生物相容性和抗干擾能力,可重復(fù)使用100次以上.
實(shí)驗(yàn)采用的D. magna和D. pulex大小為3~5 mm,制備的探針可以實(shí)現(xiàn)對單個小型水生生物的原位萃取和采樣及脂質(zhì)組學(xué)研究. 本文采用微尺度表面修飾探針從Daphnia體內(nèi)進(jìn)行脂質(zhì)化合物的萃取和富集,然后在常壓敞開條件下,通過直接nanoESI-MS分析探針上富集的脂質(zhì),并實(shí)現(xiàn)脂質(zhì)種類和結(jié)構(gòu)的鑒定. 前文[20]曾探討過D. magna不同部位(腹部、頭部、背部和尾部)脂質(zhì)的組成差異,結(jié)果表明,D. magna腹部的脂質(zhì)最豐富,含量也最高,其次是背部、頭部及尾部. 因此,本文選擇腹部作為采樣點(diǎn).
對D. magna和D. pulex腹部的脂質(zhì)進(jìn)行了SCP-nanoESI-MS 分析[圖1(A)和(B)],發(fā)現(xiàn)D. magna和D. pulex的脂質(zhì)指紋圖譜非常相似,在m/z700~950 范圍內(nèi)均可觀察到豐富的脂質(zhì)化合物信號,以m/z778.5344,782.5657,804.5511,843.6456,859.6194,873.6917,889.6660,899.7086 和915.6817等高豐度的離子信號為主.
Fig.1 Lipidomic fingerprints of D. magna(A)and D. pulex(B)
對于脂質(zhì)化合物的鑒定,可通過高分辨質(zhì)譜的一級精確質(zhì)量數(shù)(絕對誤差≤0.005 Da)和脂質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析來推導(dǎo)可能的分子式,結(jié)合二級質(zhì)譜離子碎片信息鑒定脂質(zhì)化合物的不飽和度和脂肪酸鏈組成. 如,質(zhì)量數(shù)為m/z778.5370 的離子,經(jīng)LIPID MAPS 數(shù)據(jù)庫搜索為C42H78NO8PNa([PC(34∶3)+Na]+,δ1.64)或C44H77NO8P([PC(36∶6)+H]+,δ―1.45). 對該離子進(jìn)行HCD實(shí)驗(yàn),在獲得的二級質(zhì)譜圖中可觀察到3 個高豐度的碎片離子(圖2).m/z719.4618 和595.4683 的碎片離子分別對應(yīng)于N(CH3)3和C2H5PO4的連續(xù)丟失,表明存在PC 類磷脂酰膽堿的基團(tuán);m/z573.4873 碎片離子與m/z595.4683的質(zhì)量差為22,對應(yīng)于在m/z595.4683處的鈉離子丟失和氫離子加合,提示m/z778.5370是[PC(34∶3)+Na]+而不是[PC(36∶6)+H]+. 此外,在其二級質(zhì)譜圖中還可以觀察到一系列低豐度的碎片離子.m/z478.3284 和500.3137 碎片離子對應(yīng)于[PC(34∶3)-C(18∶3)]+和[PC(34∶3)-C(16∶0)]+,m/z441.2376和463.2220碎片離子對應(yīng)于[M+Na-N(CH3)3-FA(18∶3)]+和[M+Na-N(CH3)3-FA(16∶0)]+,m/z239.2367和261.2208碎片離子分別對應(yīng)為[FA(16∶0)-H2O]+和[FA(18∶3)-H2O]+,均表明該脂質(zhì)化合物由C(16∶0)和C(18∶3)2 條脂肪鏈組成,由此可鑒定m/z778.5370 的結(jié)構(gòu)為[PC(16∶0_18∶3)+Na]+.
Fig.2 MS/MS spectrum of m/z 778.5352
D.magna和D.pulex的脂質(zhì)鑒定結(jié)果列于表1,可見,二者的脂質(zhì)指紋圖譜主要包含PC和TAG 2大種類,且多為鈉/鉀加合物信號,這是由于生物體內(nèi)含有大量的鈉/鉀鹽,脂質(zhì)可以以鈉/鉀加合物的形式穩(wěn)定存在.此外,D.magna和D.pulex的脂質(zhì)化合物種類和脂質(zhì)化合物脂肪鏈組成的比例存在一定差異:D.magna的脂質(zhì)以PC(16∶0_16∶1),PC(16∶0_18∶3),PC(18∶2_18∶2),TAG(16∶0_16∶4_18∶3),TAG(16∶0_16∶1_20∶5)和TAG(18∶1_18∶3_18∶3)等為主;D. pulex的脂質(zhì)以PC(16∶0_16∶1),PC(16∶0_18∶1),PC(18∶2_18∶2),TAG(16∶0_16∶1_18∶3),TAG(16∶0_16∶1_20∶4)和TAG(18∶1_18∶3_18∶3)等為主[圖1(A)和(B)].
Table 1 List of the identified lipids from D.magna and D.pulex using SCP-nanoESI-MS
由脂質(zhì)指紋圖譜和鑒定結(jié)果可知,在D. magna和D. pulex的脂質(zhì)組成中甘油三酯的豐度很高. 為研究其甘油三酯的組成特征,進(jìn)一步對20 只D. magna和20 只D. pulex進(jìn)行了SCP-nanoESI-MS 分析.m/z839.68,841.67,843.68,845.70,847.71,849.73,851.74 和853.77 的碎片離子分別對應(yīng)不同飽和度從9到2的各個C50甘油三酯[如TAG(50∶9)表示該甘油三酯中3條脂肪鏈的碳原子總數(shù)為50,雙鍵個數(shù)為9],即TAG(50∶9),TAG(50∶8),TAG(50∶7),TAG(50∶6),TAG(50∶5),TAG(50∶4),TAG(50∶3)和TAG(50∶2).m/z867.67,869.68,871.70,873.71,875.73和877.75的碎片離子分別對應(yīng)不同飽和度(從9 到4)的各個C52甘油三酯,即TAG(52∶9),TAG(52∶8),TAG(52∶7),TAG(52∶6),TAG(52∶5)和TAG(52∶4). 由圖3可見,D. magna甘油三酯組成比例的不飽和度較高,C50甘油三酯中豐度最高的是不飽和度為7 的TAG(50∶7),C52甘油三酯中豐度最高的是不飽和度為6 的TAG(52∶6)[圖3(A)];而D. pulex 甘油三酯組成的不飽和度比D. magna低,C50甘油三酯中豐度最高的是TAG(50∶4),C52甘油三酯中豐度最高的是TAG(52∶5)[圖3(B)],提示D. magna和D. pulex 脂質(zhì)組成特征具有一定的規(guī)律性.
采用SIMCA-P統(tǒng)計分析軟件對D. magna和D. pulex樣本進(jìn)行了主成分分析,以脂質(zhì)化合物的質(zhì)譜相對豐度為變量,以D. magna和D. pulex樣本為觀察對象,原始數(shù)據(jù)矩陣經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化處理,再對其進(jìn)行運(yùn)算. 主成分個數(shù)提取原則為主成分對應(yīng)的特征值大于1的前m個主成分. 從方差貢獻(xiàn)率來看,第一主成分貢獻(xiàn)率為48.67%,貢獻(xiàn)率最大,包含的信息最多;第二主成分貢獻(xiàn)率為20.02%;第三主成分貢獻(xiàn)率為11.84%. 前3個主成分的累計貢獻(xiàn)率達(dá)到80.53%,基本能反映D. magna和D. pulex的基本特征. 分別以第一、第二和第三主成分來建立坐標(biāo)系,進(jìn)行投影即可得到所有樣本的PCA得分圖和載荷圖,結(jié)果如圖4所示. 由圖4(A)的PCA得分圖可見,D. magna(M1―M20)和D. pulex(P1―P20)的數(shù)據(jù)點(diǎn)得到了良好區(qū)分.D. magna和D. pulex能夠明顯地分為2大類,代表這2個物種的脂質(zhì)組成存在著顯著差異. 圖4(B)為PCA載荷圖,圖中每個點(diǎn)代表1個脂質(zhì)化合物. 脂質(zhì)化合物的系數(shù)絕對值在載荷圖中得分越高,代表該化合物對樣品分類所起的作用越大. 由圖4(B)可見,m/z841.63,843.65,873.69和871.68,這4個離子與D. magna分布呈正相關(guān),而m/z847.68,849.69,877.72和875.71這4個離子與D. pulex分布呈正相關(guān),表明這些脂質(zhì)是區(qū)分D. magna和D. pulex的潛在生物標(biāo)記物.
Fig.4 PCA score plot(A)and loading plot(B)of D. magna and D. pulex
采用SCP-nanoESI-MS技術(shù)對Daphnia屬D. magna和D. pulex個體進(jìn)行直接、快速、原位質(zhì)譜分析和脂質(zhì)組學(xué)研究,建立了2種Daphnia屬生物的脂質(zhì)指紋圖譜,并進(jìn)行了脂質(zhì)標(biāo)記物的結(jié)構(gòu)鑒定. 采用該方法獲得了大型溞和蚤狀溞的脂質(zhì)指紋圖譜,并研究了二者體內(nèi)的脂質(zhì)組成特征,結(jié)合化學(xué)計量學(xué)手段實(shí)現(xiàn)了二者的快速區(qū)分,鑒定了相關(guān)的脂質(zhì)生物標(biāo)志物. 由此可見,基于SCP-nanoESI-MS的脂質(zhì)組學(xué)方法適用于Daphnia屬D. magna和D. pulex的快速識別和鑒定.