鐘東明,賴星星,張明清,舒 琥
大刺鰍基因克隆及表達(dá)分析
鐘東明,賴星星,張明清,舒 琥
(廣州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣東 廣州 510006)
【】了解大刺鰍() 肌肉生長抑制素(myostatin) 基因的序列及其在生長發(fā)育中的調(diào)控功能。利用RACE方法克隆大刺鰍全長cDNA序列,采用熒光定量PCR分析其在不同組織和胚胎發(fā)育階段的表達(dá)情況。大刺鰍cDNA序列全長2 690 bp,包含200 bp 5′非編碼區(qū)、1 359 bp 3′非編碼區(qū)和1 131 bp開放閱讀框,編碼376個(gè)氨基酸。前22個(gè)氨基酸殘基為信號肽,第37 ~ 254位氨基酸殘基為TGF-β前肽域,第282 ~ 376位是TGF-β結(jié)構(gòu)域,具蛋白酶水解位點(diǎn)RARR和C端生物活性區(qū)的9個(gè)保守半胱氨酸殘基。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,大刺鰍MSTN氨基酸序列與合鰓目、鱸形目魚類同源性較高,與哺乳動(dòng)物、鳥類、爬行類、兩棲類同源性較低。實(shí)時(shí)定量PCR分析表明,大刺鰍基因在各組織中均有表達(dá),肌肉中表達(dá)量最高,眼、腦次之,鰓表達(dá)量最低;大刺鰍胚胎發(fā)育的各階段基因均有表達(dá),囊胚期表達(dá)量最高,其次為多細(xì)胞期,出膜期表達(dá)量最低。
大刺鰍;;基因;克隆;表達(dá)
肌肉生長抑制素 (myostatin, MSTN) 又稱生長/分化因子8 (growth/differentiation factor,GDF-8),由McPherron等[1]1997年首先從小鼠 () 骨骼肌cDNA文庫中克隆獲得。MSTN具有轉(zhuǎn)化生長因子-β (transforming growth factor β, TGF-β) 家族共有的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):N端有一段由非親水性氨基酸序列構(gòu)成的信號肽,C端具保守的蛋白酶水解位點(diǎn)RXXR,C端活性區(qū)含多個(gè)保守半胱氨酸(Cys)殘基,靠分子間的二硫鍵形成二聚體發(fā)揮功能[2-3]。基因在哺乳動(dòng)物中分布較為保守,主要存在于肌肉中,抑制肌肉細(xì)胞增殖和分化,是肌肉生長的負(fù)調(diào)控因子[4]:敲除的小鼠,肌肉細(xì)胞增殖加快,骨骼肌量明顯增加[5];在過表達(dá)的轉(zhuǎn)基因小鼠中,肌肉量明顯降低[6];比利時(shí)蘭牛() 和皮埃蒙特牛()由于基因突變,出現(xiàn)“雙臀”表型[7-8]。因?yàn)榛蛟诩∪馍L中的負(fù)調(diào)控作用,近年來廣受關(guān)注。目前,魚類基因也被大量克隆,其中包括鯉形目的蘭格湖裸鯉()[10]、淇河鯽()[11]、縮骨鯽(var.)[12]、草魚()[13]、鳡()[14],鮭形目的鮭()[15]、虹鱒()[16],鯡形目的刀鱭()[17],鱸形目的真鯛()[18]、鱖()[19],鰈形目的牙鲆()[20]等。Lee等[22]通過轉(zhuǎn)RNAi和MSTN重組前肽產(chǎn)物可抑制牙鲆基因表達(dá),促進(jìn)魚類肌肉增長和體質(zhì)量增加。證實(shí)對魚類肌肉生長與發(fā)育的負(fù)調(diào)控作用。
大刺鰍 () 俗稱納錐、石錐、粗麻割、辣椒魚、刀槍魚,隸屬于合鰓目( Symbranchiformes)、刺鰍科( Mastacembelidae)、刺鰍屬 ()[23],廣泛分布于東南亞等國家,主要棲息于巴基斯坦、印度、斯里蘭卡、孟加拉和中國等不同的水系[24-25],我國主要分布于福建、廣東、廣西、貴州、云南和海南等地區(qū)。大刺鰍富含多種氨基酸,營養(yǎng)價(jià)值高,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。近年來,因過度捕撈,中國各地大刺鰍野生資源急劇減少,已被福建、廣東、湖南等省列為重點(diǎn)保護(hù)野生水生動(dòng)物。對于大刺鰍的研究主要集中在群體遺傳[26-28]、形態(tài)差異[29-30]、生理生化[31-32]、養(yǎng)殖技術(shù)[33-34]等方面。在養(yǎng)殖生產(chǎn)過程中大刺鰍生長相對較慢,制約了該產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。迄今有關(guān)大刺鰍肌肉生長方面的研究很少,筆者克隆大刺鰍全長cDNA序列,并分析大刺鰍基因在不同組織和胚胎發(fā)育時(shí)期的表達(dá),為研究大刺鰍肌肉生長和發(fā)育的分子機(jī)制以及繁殖育種提供基礎(chǔ)。
大刺鰍成魚購自廣東廣州增城,體質(zhì)量(80±5)g。無傷病,體格健壯。胚胎樣本取自廣東佛山大健魚苗水產(chǎn)有限公司。
總RNA提取試劑盒RNAprep Pure Tissue Kit購自天根生化科技(北京)有限公司;大腸桿菌()感受態(tài)細(xì)胞DH5α購自生工生物工程(上海)有限公司;Taq酶、pMD-I9-T、PrimeScript? II 1st Strand cDNA Synthesis Kit、SMARTer? RACE 5′/3′ Kit購自寶生物工程(大連)有限公司(TaKaRa)。ChamQ SYBR qPCR Master Mix試劑盒、HiScript II Q RT SuperMix for qPCR (+gDNA wiper) 試劑盒購自南京諾唯贊生物科技有限公司。所有引物、測序由生工生物工程(上海)有限公司完成。
用MS-222試劑麻醉大刺鰍成魚,剖取腦、肌肉、心臟、肝臟、腎臟、脾臟、胃、腸、眼、鰓、精巢和卵巢等12種組織,迅速放入液氮中凍存,用RNAprep Pure Tissue Kit提取總RNA。取多細(xì)胞期、囊胚期、原腸胚期、肌節(jié)出現(xiàn)期、出膜期的胚胎,出膜后3、7、15、30 d仔魚,成魚肌肉樣品置于液氮中,提取總RNA。瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA完整性,用分光光度計(jì)檢測總RNA濃度及純度。采用TaKaRa公司PrimeScript? II 1st Strand cDNA Synthesis Kit反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成第一鏈。
根據(jù)GenBank的黃鱔()(登錄號:KM103284.1)、尖吻鱸()(登錄號:XM_018696695.1)等物種基因序列通過同源克隆法設(shè)計(jì)引物MSTNF1和MSTNR1(表1)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到大刺鰍部分片段。大刺鰍cDNA 5′端和3′端非編碼區(qū)的擴(kuò)增采用 SMARTer? RACE 5′/3′ Kit擴(kuò)增試劑盒,按照說明書要求操作,所用特異性引物見表1。將所得PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后克隆到pMD-19-T載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌(DH5α)后,挑選陽性克隆進(jìn)行測序。大刺鰍cDNA拼接全長序列應(yīng)用BLAST工具(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)進(jìn)行同源性比對分析。用ExPASy工具(https://web.expasy.org/ protscale/)推測其開放閱讀框和編碼的氨基酸序列。應(yīng)用Clustal X軟件(http://www.clustal.org)進(jìn)行氨基酸序列比對。利用MEGA7.0軟件(https://www. msgasoftware.net)以鄰接法(Neighbor-Joining, NJ)-Poisson Correction 模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,自引導(dǎo)檢驗(yàn)(Bootstrap) 獲得系統(tǒng)分支的置信度(重復(fù)1 000次)。
以實(shí)時(shí)qPCR法測定基因在大刺鰍成魚各組織、胚胎和胚后發(fā)育各時(shí)期的表達(dá)量。以(表1) 為內(nèi)參,依據(jù)已克隆的大刺鰍基因cDNA 全長設(shè)計(jì)的MSTN-Real-F和MSTN-Real-R 為大刺鰍的特異性引物,反轉(zhuǎn)錄按HiScript II Q RT SuperMix for qPCR (+gDNA wiper) 試劑盒要求進(jìn)行。Real-time qPCR 按ChamQ SYBR qPCR Master Mix試劑盒要求操作;反應(yīng)體系20 μL:SYBR 10 μL,cDNA模板2 μL,上下游引物各0.4 μL,DEPC水7.2 μL;每個(gè)樣品重復(fù)3次。擴(kuò)增反應(yīng)在Roche Light Cycler480儀上進(jìn)行,反應(yīng)程序:95 ℃30 s;95 ℃15 s,60 ℃ 30 s,40個(gè)循環(huán)。PCR反應(yīng)后溫度從60 ℃上升到95 ℃,繪制熔解曲線,以判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的正確性。用2–ΔΔct法計(jì)算不同組織的相對表達(dá)量,用SPSS17.0軟件分析差異顯著性,結(jié)果用平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤(mean±SE)表示,用Excel 2010作圖。
表1 大刺鰍分子克隆和實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物序列
Table 1 Primers used for cloning and quantitative expression of M. armatus mstn gene
所克隆大刺鰍基因cDNA全長2 690 bp。其中5′ 非編碼區(qū)長200 bp,3′ 非編碼區(qū)長1 359 bp,編碼區(qū)長1 331 bp,包含AATAA典型轉(zhuǎn)錄終止子加A信號,共編碼376個(gè)氨基酸(圖1)。有RXXR保守結(jié)構(gòu)和9個(gè)保守的半胱氨酸殘基活性區(qū)。GenBank登錄號MN121847。經(jīng)預(yù)測,MSTN氨基酸序列前22個(gè)氨基酸殘基組成信號肽,切割位點(diǎn)在Ser22與Asp23之間;理化性質(zhì)分析表明,大刺鰍MSTN蛋白等電點(diǎn)為5.56,相對分子質(zhì)量為42 605.64。其氨基酸組成中以亮氨酸(Leu)的含量最高(8.0%),絲氨酸(Ser)次之(7.4%),色氨酸(Trp)含量最低(1.6%)。該蛋白不穩(wěn)定系數(shù)為61.07,是一種不穩(wěn)定蛋白。此外,蛋白質(zhì)氨基酸殘基親疏水性總平均值為-0.404,為親水蛋白。MSTN氨基酸序列保守區(qū)域,第37 ~ 354位氨基酸殘基是TGF-β前肽保守域,第282 ~376位氨基酸殘基為TGF-β功能區(qū)。
雙下劃線部分為信號肽序列,方框?yàn)榈鞍姿馕稽c(diǎn);單下劃線和波浪下劃線分別為TGF-β前肽域和TGF-β結(jié)構(gòu)域;圓圈字母C為保守的半胱氨酸殘基;*為終止密碼子;陰影部分為加尾信號。
The double-underline and box were the sequences of signal peptide and conservative hydrolytic site;Thesingle underline and wave underline were the conserved domain of TGF-β propeptide and TGF-β; The letters C with circle are conservative cysteine residues; The “*” indicates the stop codon (TGA); The shadow indicates tailing signal.
圖1 大刺鰍基因序列和氨基酸序列
Fig. 1 Nucleotide sequence and putative amino acid sequence ofin
經(jīng)對比(圖2),大刺鰍MSTN編碼序列與GenBank上其他23種動(dòng)物(表2)均存在9個(gè)保守的半胱氨酸(Cys)殘基,且近C-端區(qū)域內(nèi)的序列高度保守。大刺鰍MSTN與尖吻鱸、大黃魚()、斑鱖()同源度較高,分別為94.68%、93.09%、92.55%;在分子系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3)上與同屬于合鰓目的黃鱔聚為一支,親緣關(guān)系最近。根據(jù)圖3,魚類與哺乳動(dòng)物形成獨(dú)立進(jìn)化分子,與形態(tài)學(xué)系統(tǒng)發(fā)育樹相吻合。
“*”表示所有物種的氨基酸殘基相同,“.”表示氨基酸殘基相似。矩形方框?yàn)镽XRR蛋白水解位點(diǎn);箭頭表示 9 個(gè)保守的半胱氨酸殘基,各種動(dòng)物MSTN的 GenBank 登錄號見表2。
表2 大刺鰍MSTN氨基酸序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化樹所用物種信息
圖3 大刺鰍與其他物種MSTN系統(tǒng)進(jìn)化樹
基因在大刺鰍腦、肌肉等11個(gè)不同組織中表達(dá)量不同(圖4),在肌肉中表達(dá)量最高 (< 0.05),其次為眼、腦、性腺和心臟,鰓中表達(dá)量最低。
字母不同者差異顯著(P < 0.05);O,卵巢;T,精巢;B,腦;Mu,肌肉;L,肝臟;E,眼;Sp,脾;K,腎臟;I,腸;St,胃;Gi,鰓;H,心臟
大刺鰍胚胎和胚后發(fā)育各階段均檢測到mRNA的表達(dá),囊胚期表達(dá)量較高,其次為原腸胚期,肌節(jié)出現(xiàn)期和出膜期表達(dá)量較低。胚后發(fā)育呈現(xiàn)逐漸遞增的趨勢,在成魚背部肌肉表達(dá)量最高(圖5)。
凡含一個(gè)相同字母者則差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P > 0.05);1. 多細(xì)胞期;2. 囊胚期;3. 原腸胚期;4. 肌節(jié)出現(xiàn)期;5. 出膜期;6. 出膜后3 d;7. 出膜后7 d;8. 出膜后15 d;9. 出膜后30 d;10. 成魚背部肌肉
本研究利用RACE方法首次克隆得到大刺鰍基因全長序列,其編碼的蛋白質(zhì)N末端具有分泌必需的信號肽序列、蛋白水解位點(diǎn)RXXR和9個(gè)保守半胱氨酸殘基,與其他物種MSTN具有相同特征。大刺鰍MSTN信號肽剪切及蛋白水解位點(diǎn)同合鰓目的黃鱔、鱸形目大黃魚等種類相同,切割位點(diǎn)均在Ser22和Asp23之間,類胰蛋白酶作用位點(diǎn)為“RARR”。MSTN與TGF-β超家族其他成員一樣,先合成較長的前體蛋白,切除信號肽后,在RXRR位點(diǎn)水解形成潛在相關(guān)肽和成熟肽,隨后形成肌抑素復(fù)合物調(diào)控肌肉生長[22]。大刺鰍MSTN蛋白序列同合鰓目黃鱔、鱸形目尖吻鱸等魚類MSTN同源性最高,親緣關(guān)系最近;而與哺乳類和鳥類同源性較低,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。魚類中存在-1、-2兩個(gè)基因亞型,草魚[13]、斑馬魚()[35]等魚類中均發(fā)現(xiàn)了兩種形式的。本研究所克隆的大刺鰍MSTN在系統(tǒng)進(jìn)化樹上與其他魚類MSTN-1聚為一大支,因此推測其可能為大刺鰍-1型。實(shí)驗(yàn)未能擴(kuò)增出-2型基因序列,大刺鰍是否存在-2還有待進(jìn)一步研究。
對牛等哺乳動(dòng)物的相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),主要在骨骼肌中高表達(dá)。由于魚類存在多個(gè)同源基因,不同基因亞型的表達(dá)水平和分布均存在差異。-2型通常僅在腦和肌肉中表達(dá)[36],-1型分布較廣泛,除肌肉外,腦、眼、肝臟、脾臟、鰓、腸、腎、卵巢、精巢等多個(gè)組織中均有表達(dá)。本研究中,大刺鰍在肌肉中高表達(dá),其次是眼、腦,其他組織表達(dá)量較低,這與縮骨鯽[12]、鮭[15]等魚中的研究結(jié)果相一致。盡管在不同魚類組織間存在表達(dá)水平的差異,但在各種魚類的肌肉組織中均檢測到基因不同水平的表達(dá),表明基因在魚類肌肉生長發(fā)育中的重要調(diào)控作用?;蛟诓煌~類腦組織中均被證實(shí)表達(dá)量較高,僅次于或者高于肌肉,表明腦也是的重要表達(dá)場所,該基因可能參與成魚神經(jīng)系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)的發(fā)育[36]。大刺鰍胚胎發(fā)育過程中,在整個(gè)發(fā)育階段均有表達(dá),類似的結(jié)果在對淇河鯽[11]、斑馬魚[35]、青海湖裸鯉()[37]研究中也有發(fā)現(xiàn)。在不同物種胚胎發(fā)育階段的表達(dá)趨勢也存在較大差異,草魚隨著胚胎發(fā)育的進(jìn)行,表達(dá)量逐步升高[38]。青海湖裸鯉表現(xiàn)為先升后降的趨勢[37]。大刺鰍胚胎發(fā)育階段的表達(dá)趨勢同淇河鯽、斑馬魚相似,在囊胚期和原腸胚期表達(dá)水平較高,神經(jīng)胚期顯著降低,出膜期有所上升,這可能與神經(jīng)胚期肌節(jié)形成具有一定相關(guān)性[39]。此外,隨著胚后發(fā)育的進(jìn)行,表達(dá)量逐漸升高,在成魚背部肌肉中表達(dá)量最高,這可能與MSTN在個(gè)體發(fā)育不同階段所起的調(diào)控作用有關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn),與大刺鰍胚胎發(fā)育時(shí)期存在一定趨勢性表達(dá)差異,推測與其參與調(diào)控胚胎各時(shí)期肌肉形成和發(fā)育的功能相關(guān),但對其調(diào)控機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。此外,作為調(diào)控肌肉形成發(fā)育的相關(guān)基因,唐永凱等[40]在吉富羅非魚中發(fā)現(xiàn)其內(nèi)含子Ⅱ內(nèi)的1個(gè)SNPs表現(xiàn)多態(tài)性,與吉富羅非魚體型(體厚/體長、體高/體長)存在顯著相關(guān)(< 0.05)。另外,張世勇等[41]在斑點(diǎn)叉尾鮰()多態(tài)性研究中發(fā)現(xiàn)SNP位點(diǎn)g.4355 G>C與斑點(diǎn)叉尾鮰的體質(zhì)量和體長呈顯著性負(fù)相關(guān)。本研究首次獲得大刺鰍的基因全長,可為其生產(chǎn)表型差異的關(guān)聯(lián)性研究以及其遺傳改良等研究提供基礎(chǔ)。
[1] MCPHERRON A C, LAWLER A M, LEE S J. Regulation of skeletal muscle mass in mice by a new TGF-beta superfamily member[J]. Nature, 1997, 387(6628): 83-90.
[2] CHEIFETZ S, WEATHERBEE J A, TSANG L S, et al. The transforming growth factor-β system, a complex pattern of cross-reactive ligands and receptors[J]. Cell, 1987, 48(3): 409- 415.
[3] 劉恩秀, 朱仙珍, 李云, 等. 巖原鯉MSTN基因克隆及饑餓對MSTN表達(dá)的影響[J]. 淡水漁業(yè), 2018, 48(4): 16-22.
[4] 趙浩斌, 彭扣, 王玉鳳, 等. 魚類肌肉生長抑制素研究進(jìn)展[J]. 水生生物學(xué)報(bào), 2006, 30(2): 227-231.
[5] LIN J, ARNOLD H B, DELLA-FERA M A, et al. Myostatin knockout in mice increases myogenesis and decreases adipogenesis[J]. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2002, 291(3): 701-706.
[6] REISZ-PORSZASZ S, BHASIN S, ARTAZA J N, et al. Lower skeletal muscle mass in male transgenic mice with muscle-specific overexpression of myostatin [J]. American Journal of Physiology. Endocrinology and Metabolism, 2003, 285(4): 876-888.
[7] GROBET L, MARTIN L J R, PONCELET D, et al. A deletion in the bovine myostatin gene causes the double-muscled phenotype in cattle[J]. Nature Genetics, 1997, 17(1): 71-74.
[8] MCPHERRON A C, LEE S J. Double muscling in cattle due to mutations in the myostatin gene[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1997, 94(23): 12457-12461.
[9] SHIN S, SONG Y, AHN J, et al. A novel mechanism of myostatin regulation by its alternative splicing variant during myogenesis in avian species[J]. American Journal of Physiology-Cell Physiology, 2015, 309(10): 650-659.
[10] 張馳, 劉飛, 王萬良, 等. 蘭格湖裸鯉肌肉生長抑制素基因(MSTN)的克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 水產(chǎn)學(xué)雜志, 2019, 32(5): 25-30.
[11] 田雪, 王良炎, 劉洋洋, 等. 淇河鯽肌肉生長抑制素基因的克隆與表達(dá)[J]. 水產(chǎn)學(xué)報(bào), 2017, 41(1): 11-20.
[12] 楊揚(yáng), 許炎坤, 舒琥, 等. 縮骨鯽MSTN基因的克隆與組織表達(dá)分析[J]. 淡水漁業(yè), 2017, 47(2): 23-29.
[13] 濮劍威, 孫成飛, 蔣霞云, 等. 草魚兩個(gè)肌肉生長抑制素cDNA克隆、表達(dá)及過量表達(dá)對胚胎發(fā)育的影響[J]. 生物技術(shù)通報(bào), 2011(8): 153-160; 166.
[14] 郁建鋒, 張營, 王星果, 等. 鳡肌肉生長抑制素(MSTN)基因的克隆及其組織特異性表達(dá)分析[J]. 水產(chǎn)學(xué)報(bào), 2010, 34(10): 1486-1494.
[15] ?STBYE T K, GALLOWAY T F, NIELSEN C, et al. The two myostatin genes of Atlantic salmon () are expressed in a variety of tissues[J]. European Journal of Biochemistry, 2001, 268(20): 5249-5257.
[16] RESCAN P Y, JUTEL I, RALLIèRE C. Two myostatin genes are differentially expressed in myotomal muscles of the trout ()[J]. Journal of Experimental Biology, 2001, 204(20): 3523-3529.
[17] 杜富寬, 聶志娟, 徐鋼春, 等. 刀鱭MSTN基因的克隆及其組織表達(dá)[J]. 中國水產(chǎn)科學(xué), 2014, 21(4) : 684-692.
[18] 葉寒青, 陳松林. 真鯛肌肉生長抑素MSTN基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 高技術(shù)通訊, 2006, 16(7): 718-724.
[19] 張敏, 趙金良, 鄧燕飛. 鱖肌肉生長抑制素Myostatin cDNA克隆與組織表達(dá)分析[J]. 動(dòng)物學(xué)雜志, 2010, 45(3): 1-10.
[20] 徐建勇, 陳松林. 牙鲆肌肉生長抑素(MSTN)基因克隆[J]. 水產(chǎn)學(xué)報(bào), 2008, 32(4): 497-506.
[21] 孔慶輝, 晁燕, 夏明哲, 等. 黃河裸裂尻魚MSTN基因RNA干擾研究[J]. 中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào), 2016, 24(4): 344-350.
[22] LEE S B, KIM J H, JIN D H, et al. Myostatin inhibitory region of fish () myostatin-1 propeptide[J]. Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2016, 194-195: 65-70.
[23] NELSON J S. Fishes of the world [M]. 4th Ed. Hoboken: Wiley and Sons, 2006: 316-317.
[24] RAINBOTH W. Inland fishes of India and adjacent countries[J]. Reviews in Fish Biology and Fisheries, 1994, 4(1): 135-136.
[25] ESEN ?akmak, AHMET Alp. Morphological differences among the Mesopotamian spiny eel,(Banks & Solander, 1794), populations[J]. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 2010, 10(1): 87-92.
[26] 林婷婷. 大刺鰍()微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)及野生群體遺傳多樣性分析[D]. 廣州: 廣州大學(xué), 2017.
[27] 楊華強(qiáng), 李強(qiáng), 舒琥, 等. 華南及鄰近地區(qū)大刺鰍遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 水生生物學(xué)報(bào), 2016, 40(1): 63-70.
[28] 江小璐. 華南及鄰近地區(qū)不同群體大刺鰍的遺傳多樣性及親緣地理研究[D]. 廣州: 廣州大學(xué), 2018.
[29] 舒琥, 江小璐, 楊華強(qiáng), 等. 華南地區(qū)7個(gè)大刺鰍野生群體的形態(tài)差異分析[J]. 廣州大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版), 2017, 16(3): 8-14.
[30] 周惠強(qiáng), 李芬, 舒琥, 等. 大刺鰍雌雄個(gè)體形態(tài)差異分析[J]. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào), 2019, 39(1): 1-6.
[31] HAN C, LI Q, LIN J F, et al. Characterization of complete mitochondrial genomes ofand(Synbranchiformes: Mastacembelidae) and phylogenetic studies of Mastacembelidae[J]. Conservation Genetics Resources, 2018, 10: 295–299.
[32] 初慶柱, 陳剛, 張健東, 等. 大刺鰍消化系統(tǒng)的組織學(xué)研究[J]. 淡水漁業(yè), 2016, 39(2): 14-18.
[33] 陳方平, 李林春, 查廣才, 等. 大刺鰍催產(chǎn)效率與積溫的相關(guān)性研究[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2015, 43(19): 116-117.
[34] 曾慶祥, 方園, 劉春蓮, 等. 大刺鰍池塘仿生態(tài)養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 中國水產(chǎn), 2019, 520(3): 85-86.
[35] BIGA P R, ROBERTS S B, ILIEV D B, et al. The isolation, characterization, and expression of a novel GDF11 gene and a second myostatin form in zebrafish,[J]. Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2005, 141(2): 218-230.
[36] LIU Z F, XUE L Y, SUN S, et al. Myostatin-2 isolation and spatiotemporal expression comparison between myostatin-1 and -2 in[J]. Genes & Genomics, 2014, 36(5): 599-609.
[37] TONG C, ZHANG C F, SHI J Q, et al. Characterization of two paralogous myostatin genes and evidence for positive selection in Tibet fish:[J]. Gene, 2015, 565(2): 201-210.
[38] ZHENG G D, SUN C F, PU J W, et al. Two myostatin genes exhibit divergent and conserved functions in grass carp ()[J]. General and Comparative Endocrinology, 2015, 214: 68-76.
[39] HELTERLINE D L I, GARIKIPATI D, STENKAMP D L, et al. Embryonic and tissue-specific regulation of myostatin-1 and -2 gene expression in zebra fish[J]. General and Comparative Endocrinology, 2007, 151(1): 90-97.
[40] 唐永凱, 李建林, 俞菊華, 等. 吉富羅非魚MSTN基因結(jié)構(gòu)及其多態(tài)性與生長性狀的相關(guān)性[J]. 中國水產(chǎn)科學(xué), 2010(1): 46-53.
[41] 張世勇, 王明華, 鐘立強(qiáng), 等. 斑點(diǎn)叉尾鮰MSTN基因4個(gè)SNP位點(diǎn)及其與生長性狀的相關(guān)性[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué), 2017(1): 38-41.
Molecular Cloning and Expression Profiles of Myostatin Gene in
ZHONG Dong-ming, LAI Xing-xing, ZHANG Ming-qing, SHU-Hu
(,,510006,)
To characterize thecDNA sequence and study its regulatory function in growth and development of.Full-lengthcDNA of ofwas cloned by the RACE techniques, and quantitative real time PCR was used to analyze the expression ofin different embryonic development stages andt tissues.The full length cDNAis 2 690 bp with 200-bp 5′-untranslated region, 1 359-bp 3′-untranslated region, and 1131-bp open reading frame (ORF)encoding 376 amino acids pre-proprotein. The putative mstn contained a 22 amino acid signal peptide, a TGF-β propeptide domain (37 – 254), a TGF-β domain (282 – 376). A conserved proteolytic processing site RIRR and 9 cysteine residues in can be found in conserved locations of the protein. Phylogenetic analysis showed that the MSTN was homologous with that of the synbranchians and perciformes. However, it has low similarity to MSTN of mammals, birds, reptiles and amphibians. Quantitative real-time PCR analysis showed that thegene was expressed in most tissues examined, with the highest expression detected in the muscle, followed by the eye and brain, and the lowest expression was detected in the gill.gene transcript was found in all stages of embryo development with the highest expression in blastocyst stage followed by multi-cell stage, and the lowest expression was detected in hatching stage.
;; gene; cloning; expression
Q78;Q959.482
A
1673-9159(2020)03-0014-08
10.3969/j.issn.1673-9159.2020.03.003
2019-12-28
中國-東盟海上合作基金項(xiàng)目(2018.01—2020.12);國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))重大專項(xiàng)(201303048);廣東省海洋漁業(yè)科技攻關(guān)與研發(fā)項(xiàng)目(A201601A05;2017A0007)
鐘東明(1994―),男,碩士研究生,研究方向?yàn)轸~類生理與分子生物學(xué)。Email:1558256177@qq.com
舒琥(1965―),男,教授,博士。 E-mail: shuhu001@ 26.com
鐘東明,賴星星,張明清,等. 大刺鰍基因克隆及表達(dá)分析[J]. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào),2020,40(3):14-21.
(責(zé)任編輯:劉慶穎)