唐仲平 崔權(quán)哲 包 驥 蔡 瑋 趙 春▲
1.成都市第一人民醫(yī)院病理科,四川成都 610041;2.成都市第三人民醫(yī)院病理科,四川成都 610014;3.四川大學(xué)華西醫(yī)院病理研究室,四川成都 610041;4.四川省雅安市名山區(qū)人民醫(yī)院病理科,四川雅安 625100
數(shù)字病理核心是將傳統(tǒng)病理圖像電子化和網(wǎng)絡(luò)化,其關(guān)鍵技術(shù)包括全切片圖像掃描技術(shù)(whole slide images,WSI)、圖像分析信息學(xué)、信息管理系統(tǒng)和數(shù)字化體外診斷(IVD)設(shè)備。目前,數(shù)字病理的用途主要包括四類:教學(xué)[1-2]、診斷[3-8]、研究和檔案保存[9]。數(shù)字病理剛興起時(shí)由于掃描慢、圖像差、傳輸慢、存儲(chǔ)貴,只用于部分病理教學(xué)實(shí)踐及少數(shù)疑難病例或術(shù)中冰凍的遠(yuǎn)程會(huì)診[10-11]。然而以上幾點(diǎn)技術(shù)因素在最近均獲得了顯著進(jìn)步,所以數(shù)字病理在近年推廣至日常臨床診斷是可行的[12-14]。利用WSI技術(shù)將每天產(chǎn)生的所有切片掃描形成數(shù)字化切片。本研究以成都市第一人民醫(yī)院病理科日常工作中連續(xù)診斷的300 例組織學(xué)病例為對(duì)象,由作者在電腦屏幕上閱讀數(shù)字化切片并評(píng)估掃描效果,回顧性分析WSI 技術(shù)在日常病理切片的數(shù)字化掃描中的應(yīng)用效果及本科室HE 切片的主要質(zhì)量缺陷,現(xiàn)報(bào)道如下。
經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審核批準(zhǔn),本研究選取成都市第一人民醫(yī)院病理科300 例[共計(jì)493 張病理切片:384 張?zhí)K木精-伊紅(hematoxylin-eosin,HE)染色切片,57 張亞甲基藍(lán)染色切片,52 張免疫組化染色切片]由作者于2015 年9 月診斷的連續(xù)組織學(xué)病例為研究對(duì)象,其中男115 例,女185 例,年齡10 ~92 歲,平均(45±15)歲。
表1 病理常規(guī)石蠟包埋HE染色切片質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)及評(píng)分[15]
圖1 WSI 技術(shù)掃描不同類型的切片得到的數(shù)字化圖像
本研究病例來(lái)自消化系統(tǒng)155 例(60 例胃鏡,33 例腸鏡,62 例開(kāi)展其他方式檢查),乳腺及女性生殖系統(tǒng)82 例(13 例乳腺,4 例子宮,27 例宮內(nèi)膜,20例宮頸及宮頸管,8 例輸卵管,3 例卵巢,2 例外陰,5 例胎盤),皮膚34 例,軟組織與骨10 例,泌尿系統(tǒng)與男性生殖器官7 例,頭頸部7 例,造血與淋巴組織3 例,肺、胸膜、胸腺及心臟2 例。
將病理切片運(yùn)用Aperio 全自動(dòng)數(shù)字切片掃描系統(tǒng)(美國(guó)Aperio Technologies 公司)掃描成數(shù)字化切片(20 倍物鏡)。按照HE 切片評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)對(duì)數(shù)字化切片做出質(zhì)量評(píng)分。見(jiàn)表1。
在掃描切片前的提片過(guò)程中,作者發(fā)現(xiàn)2 張粘連的切片和1 張缺失的切片。對(duì)此,作者將2 張粘連的切片放入二甲苯中浸泡過(guò)夜,第二天將其分離并去除蓋玻片后重新封片;對(duì)于缺失的切片作者提取其原始蠟塊重新切片。493 張切片備齊后,作者在掃描過(guò)程中發(fā)現(xiàn)5 張切片因自動(dòng)對(duì)焦失敗而無(wú)法掃描。對(duì)此,作者在病理組織上手動(dòng)選取4 個(gè)以上焦點(diǎn)來(lái)解決該問(wèn)題。
表2 HE切片的十項(xiàng)優(yōu)質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)的得分
在用WSI 技術(shù)掃描的493 張病理切片中,共有50 張切片的掃描質(zhì)量存在不同程度的問(wèn)題,總體掃描優(yōu)良率為89.86%(443/493)。常規(guī)HE 染色切片、亞甲基藍(lán)染色切片及免疫組化染色切片的掃描優(yōu)良率分別為89.58%(344/384)、85.96% (49/57)及96.15%(50/52)。見(jiàn)圖1。
筆者將掃描不良的50 張病理切片的原始切片提出來(lái)觀察,將掃描不良的原因分為五大類:切片不整潔、封片劑收縮、切片裱貼位置不當(dāng)、切片過(guò)厚和掃描機(jī)原因,它們?cè)趻呙璨涣嫉那衅姓嫉谋戎胤?別 為44.00%(22/50),22.00%(11/50),10.00%(5/50),6.00%(3/50),18.00%(9/50)。針 對(duì) 上 述五類問(wèn)題,作者采取了擦拭灰塵,重新封片,重切薄片和調(diào)試機(jī)器等措施,結(jié)果50 張切片重新掃描后全部得到了清晰的數(shù)字化圖像。
筆者將384 張HE 切片按照HE 染色切片質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)及評(píng)分表的十項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)依次評(píng)分,計(jì)算出最終得分,并按照切片質(zhì)量分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行分級(jí)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),我科沒(méi)有不合格HE 切片且切片的總體優(yōu)良率較高(99.74%),其中評(píng)“優(yōu)”率為94.27%(362/384),評(píng)“良”率為5.47%(21/384),僅有的1 張?jiān)u“基本合格”的HE 切片來(lái)自造血和淋巴系統(tǒng)。評(píng)“良”的21 張HE 切片分別來(lái)自乳腺及女性生殖系統(tǒng)(38.09%,8/21:宮內(nèi)物4 張,胎盤2 張,宮頸1 張,輸卵管1 張),皮膚(19.05%,4/21),消化系統(tǒng)(14.29%,3/21),泌尿系統(tǒng)與男性生殖器官(14.29%,3/21),頭頸部(9.52%,2/21),造血與淋巴系統(tǒng)(4.76%,1/21)。
我科384 張HE 切片的得分范圍在74 ~100分之間,平均得分為96.269 分,平均扣分為3.731分。按照HE 染色切片質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),我科HE 切片的十項(xiàng)優(yōu)質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)的得分情況見(jiàn)表2。其中,單項(xiàng)平均扣分/總平均扣分大于10.00%的因素包括以下四項(xiàng):刀痕或裂隙(35.03%),皺褶或折疊(17.45%),切片松散或裱貼位置不當(dāng)(13.61%),切片厚或厚薄不均(12.09%)。
為了進(jìn)一步分析我科HE 切片的主要質(zhì)量缺陷,作者將HE 染色切片質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)及評(píng)分表中的質(zhì)量缺陷減分進(jìn)一步拆分成十八個(gè)減分項(xiàng)目。如表3 所示,384 張HE 切片共計(jì)扣分為1433 分,按所扣分?jǐn)?shù)的多少排序,五個(gè)主要的扣分原因依次為裂隙(26.80%),折疊(14.65%),切片裱貼位置不當(dāng)(9.77%),刀痕(8.23%),切片厚薄不均(7.26%)。如表4 所示,384 張HE 常規(guī)病理切片共計(jì)扣分項(xiàng)目為519 項(xiàng)(注:同一張切片可有多個(gè)項(xiàng)目被扣分),按照扣分項(xiàng)目的多少排序,五個(gè)主要的扣分原因依次為裂隙(36.99%),折疊(20.23%),刀痕(11.37%),切片裱貼位置不當(dāng)(5.39%), 切片厚薄不均(5.01%)。綜合表3 ~4 的數(shù)據(jù),我科HE 切片的主要質(zhì)量缺陷集中在裂隙,折疊,刀痕,切片裱貼位置不當(dāng)和切片厚薄不均五個(gè)問(wèn)題上。
與傳統(tǒng)病理相比,數(shù)字病理運(yùn)用大數(shù)據(jù)手段促進(jìn)病理學(xué)研究[16-19]。只有數(shù)字病理進(jìn)入日常病理診斷工作,那臨床的大數(shù)據(jù)研究才得以開(kāi)展。但目前國(guó)內(nèi)外的數(shù)字切片并未真正用于病理科日常診斷工作,病理醫(yī)生依然習(xí)慣在顯微鏡下而非電腦屏幕上進(jìn)行診斷,這使得病理學(xué)的發(fā)展很難廣泛利用現(xiàn)在蓬勃發(fā)展的信息技術(shù)。本研究運(yùn)用WSI 技術(shù)將300 例連續(xù)的組織學(xué)病例的病理切片進(jìn)行數(shù)字化掃描,并由作者閱讀數(shù)字化切片評(píng)估掃描效果,分析WSI 技術(shù)在日常病理切片的數(shù)字化掃描中的應(yīng)用效果。
表3 HE切片所扣分?jǐn)?shù)的分布情況
表4 HE切片扣分張數(shù)的分布情況
在切片提取過(guò)程中,作者發(fā)現(xiàn)兩個(gè)問(wèn)題:(1)有2 張相鄰切片因封片膠過(guò)多,而檔案管理員在切片未充分干燥時(shí)就將切片重疊放在切片柜中而導(dǎo)致切片粘連,無(wú)法分開(kāi);(2)有1 張切片因未及時(shí)歸檔或歸檔錯(cuò)誤,導(dǎo)致無(wú)法在相應(yīng)位置找到切片。這反映了檔案管理員在歸檔病理資料時(shí)的工作疏忽。雖然數(shù)量不多,但以后檔案管理員一定要在切片充分干燥后將病理切片及時(shí)正確地歸檔。
在掃描過(guò)程中,作者發(fā)現(xiàn)5 張切片因組織太小導(dǎo)致焦點(diǎn)數(shù)目少于4 個(gè),或焦點(diǎn)選在錯(cuò)誤的位置(非有效區(qū)域)而不在組織上,掃描機(jī)無(wú)法自動(dòng)對(duì)焦而掃描失敗。最主要的原因是臨床醫(yī)生取材過(guò)少,所以病理科要經(jīng)常與臨床科室聯(lián)系,請(qǐng)臨床醫(yī)生盡可能取足夠的組織供病理醫(yī)技人員制片和診斷。其次,可能是病理技師包埋方向不當(dāng)或修片不夠,未將組織最大面完整地展示出來(lái),所以病理醫(yī)生閱片時(shí)若發(fā)現(xiàn)組織過(guò)小,要請(qǐng)病理技師重新包埋組織或深修蠟塊,以暴露組織的最大面。
在用WSI 技術(shù)掃描的493 張病理切片中,共有50 張切片的掃描質(zhì)量存在不同程度的問(wèn)題,原因有五大類。(1)切片不整潔:切片上灰塵過(guò)多,而灰塵跟病理組織不在同一個(gè)平面,導(dǎo)致掃描機(jī)將灰塵聚焦掃描,而病理組織成像卻模糊不清;(2)封片劑收縮:技師封片時(shí)滴加封片膠過(guò)少,導(dǎo)致封片膠回縮,而掃描機(jī)掃描的是組織的單一層面,導(dǎo)致封片膠收縮的區(qū)域掃描不清;(3)切片裱貼位置不當(dāng):病理切片分為正反兩面,正面的右側(cè)為可以做標(biāo)記的磨砂面,而反面為光滑面。技師撈片時(shí)應(yīng)當(dāng)將石蠟片貼在正面,封片后在正面右側(cè)的磨砂面貼上病理標(biāo)簽。但偶爾技師在撈片時(shí)不慎將石蠟片貼在光滑的反面,封片時(shí)卻在沒(méi)有病理組織的正面蓋上蓋玻片,貼上病理標(biāo)簽。而作者往掃描機(jī)里裝載切片時(shí)是根據(jù)標(biāo)簽來(lái)判斷切片正反,所以這些撈片錯(cuò)誤的切片被掃描的是沒(méi)有病理組織的正面,自然不能得出清晰的圖像;(4)切片過(guò)厚:細(xì)胞重疊,精細(xì)的細(xì)胞形態(tài)難以看清;(5)掃描機(jī)原因:傳統(tǒng)病理切片并無(wú)質(zhì)量問(wèn)題,但掃描得出的數(shù)字化切片上卻出現(xiàn)一些明暗相間的條帶,這種情況多出自掃描機(jī)自身原因。其中,切片不整潔、封片劑收縮、切片裱貼位置不當(dāng)這三種原因?qū)?shù)字化切片質(zhì)量的影響是極大的,會(huì)導(dǎo)致病理醫(yī)生無(wú)法根據(jù)數(shù)字化切片做出診斷;而切片過(guò)厚和掃描機(jī)原因會(huì)導(dǎo)致病理醫(yī)師在診斷時(shí)花費(fèi)更多時(shí)間,診斷正確率也會(huì)有所下降。
針對(duì)上述五類問(wèn)題,作者采取了以下措施。(1)對(duì)于不整潔的切片,用干凈的棉布蘸適量的無(wú)水酒精將灰塵擦拭干凈;(2)對(duì)于封片劑收縮的切片,將其放入二甲苯中浸泡過(guò)夜,第二天去除原蓋玻片后重新封片;(3)對(duì)于裱貼位置不當(dāng)?shù)那衅瑢⑵浞湃攵妆街薪葸^(guò)夜,第二天去除原來(lái)在載玻片正面的蓋玻片后,重新在載玻片反面的組織上重新封片。值得注意的是,切忌保留原來(lái)在載玻片正面的蓋玻片,而直接在載玻片反面的組織上重新封片。雖然這樣的切片在顯微鏡下可以看清,但整個(gè)切片太厚,會(huì)導(dǎo)致切片無(wú)法插入掃描儀的切片槽,或者掃描厚切片時(shí)直接導(dǎo)致機(jī)器故障;(4)對(duì)于切得過(guò)厚的切片,提取原始蠟塊重新切薄片;(5)對(duì)于掃描儀自身造成的問(wèn)題,聯(lián)系工程師對(duì)掃描儀進(jìn)行調(diào)試校準(zhǔn)。經(jīng)過(guò)上述處理后,作者將掃描不良的50 張切片重新掃描,全部得到了清晰的數(shù)字化圖像。實(shí)際上,前四種原因是可以通過(guò)病理科醫(yī)技人員自己控制和避免的,只有第五種的掃描機(jī)原因?qū)τ诓±砜乒ぷ魅藛T算是一個(gè)相對(duì)的不可控因素。而493張切片中只有9 張切片(1.83%)是由于掃描機(jī)原因而導(dǎo)致掃描質(zhì)量不佳,這說(shuō)明運(yùn)用WSI 技術(shù)對(duì)日常病理切片進(jìn)行數(shù)字化掃描有著較高的成功率和可行性。
另外,作者還用WSI 技術(shù)形成的數(shù)字切片進(jìn)行HE 切片的質(zhì)控。結(jié)果發(fā)現(xiàn)我科HE 切片有著較高的優(yōu)良率(99.74%),僅有1 張基本合格切片,沒(méi)有不合格切片。那么我科以后的主要目標(biāo)是將評(píng)“良”的切片提升為評(píng)“優(yōu)”的切片。評(píng)“良”的切片主要來(lái)自:乳腺及女性生殖系統(tǒng)8 張(其中4 張為宮內(nèi)物)和皮膚4 張,那么宮內(nèi)物和皮膚是我科制片的難點(diǎn)。宮內(nèi)物切片不理想的主要原因是病理醫(yī)生在一個(gè)取材盒里裝入的組織太多,導(dǎo)致組織脫水不良,技師包埋困難,切片時(shí)難以得到完整的組織切面。所以,病理醫(yī)生應(yīng)當(dāng)將宮內(nèi)膜適量分裝在多個(gè)取材盒里。而皮膚的組織結(jié)構(gòu)復(fù)雜,硬度不一,韌性較大,在切片中常會(huì)出現(xiàn)皺褶,脫片等現(xiàn)象,病理醫(yī)技人員應(yīng)當(dāng)優(yōu)化從取材到制片的整個(gè)流程。
本研究還發(fā)現(xiàn),我科HE 切片最常見(jiàn)的質(zhì)量缺陷包括裂隙,折疊,刀痕,裱貼位置不當(dāng)和切片厚薄不均五個(gè)方面。下面依次分析這些問(wèn)題出現(xiàn)的原因,探討解決措施。首先,裂隙的產(chǎn)生主要是因?yàn)榻M織處理的問(wèn)題。以前我科只有一臺(tái)全封閉式全自動(dòng)脫水機(jī),只能將所有標(biāo)本混合處理,難免會(huì)出現(xiàn)標(biāo)本處理不均的現(xiàn)象。要么大的組織處理不足,要么小的組織處理過(guò)度。切片的裂隙多出現(xiàn)在固定不好、偏小、偏薄的組織,特別是細(xì)胞成分過(guò)多、含水量少的組織易被處理過(guò)度,導(dǎo)致質(zhì)地硬脆。目前,我科已引進(jìn)一臺(tái)快速脫水機(jī)專門用于小組織的處理,相信這種大小標(biāo)本分開(kāi)處理的方式會(huì)大大減少裂隙的產(chǎn)生。另外,裱片的水溫過(guò)高,切片還來(lái)不及伸展,切片的石蠟就已經(jīng)融化,也會(huì)導(dǎo)致組織切片出現(xiàn)人為的裂隙。第二,折疊的產(chǎn)生多因裱片的水溫過(guò)低,切片在水中伸展不開(kāi)。因此,要將裱片的水溫控制在45 ~ 47℃,減少切片人為裂隙和折疊的產(chǎn)生。另外,技術(shù)員的展片不佳也是折疊產(chǎn)生的一個(gè)重要原因,因此技術(shù)員應(yīng)當(dāng)多練習(xí)來(lái)提升自己的技術(shù)水平。第三,刀痕的出現(xiàn)可能是由于切片時(shí)刀座不穩(wěn)、使用的一次性刀片松動(dòng)、切片刀鈍、切片角度過(guò)于傾斜和切片動(dòng)作太快太猛等,造成切片時(shí)組織出現(xiàn)震顫。所以技術(shù)員在每次切片前要仔細(xì)檢查機(jī)器,擰固刀座,夾緊刀片,調(diào)整并固定切片的角度。第四,裱貼位置不當(dāng)主要是由于病理醫(yī)生取材時(shí)組織取得過(guò)大以及技術(shù)員的責(zé)任心不夠。只要病理醫(yī)生取材時(shí)掌握好取材的大小和厚度,技術(shù)員裱片時(shí)將組織片放到玻片中央即可。第五,切片厚薄不均多因切片刀不夠鋒利或切片機(jī)準(zhǔn)確度不高、組織脫水不理想。切片過(guò)厚會(huì)導(dǎo)致脫片、脫蠟困難、染色過(guò)深,而切片過(guò)薄會(huì)導(dǎo)致染色過(guò)淺。所以技術(shù)員切片前應(yīng)選擇鋒利的切片刀,平時(shí)勤保養(yǎng)切片機(jī),保持切片機(jī)的最佳狀態(tài);經(jīng)常更換脫水液,保持溶液的有效濃度和成分。
更重要的是,本研究發(fā)現(xiàn)了很多利用數(shù)字化切片做質(zhì)控優(yōu)于傳統(tǒng)質(zhì)控的地方。第一,傳統(tǒng)切片的每次質(zhì)控工作都需要將原始玻璃切片從切片夾中找出,閱片后還需將切片歸檔,即耗時(shí),又有損壞原始切片的風(fēng)險(xiǎn);而數(shù)字化切片一旦形成,可隨時(shí)觀看,一勞永逸。第二,傳統(tǒng)切片的質(zhì)控工作必須依賴顯微鏡進(jìn)行,一般只有在病理科才能進(jìn)行;而數(shù)字化切片形成后可經(jīng)網(wǎng)絡(luò)上傳到云端,所以只要有電腦和網(wǎng)絡(luò)的地方都可以完成數(shù)字化切片的質(zhì)控。第三,由于傳統(tǒng)原始切片只有一張,一般同一時(shí)間只能一個(gè)人對(duì)一張切片進(jìn)行質(zhì)控,即使有多頭顯微鏡,同時(shí)進(jìn)行質(zhì)控的人數(shù)也有限制;但數(shù)字化切片可以無(wú)限拷貝,可以多人在不同的電腦上同時(shí)觀看進(jìn)行質(zhì)控。第四,傳統(tǒng)切片隨著時(shí)間的延長(zhǎng),部分切片會(huì)出現(xiàn)褪色的現(xiàn)象,會(huì)影響質(zhì)控的評(píng)分;而數(shù)字化切片一旦掃描,永不褪色,無(wú)論是對(duì)日后的復(fù)診和質(zhì)控都大有益處。第五,傳統(tǒng)切片如果要用來(lái)參與室間質(zhì)控,需要郵寄原始切片,即費(fèi)時(shí),又費(fèi)錢;而數(shù)字化切片可經(jīng)網(wǎng)絡(luò)快速傳輸?shù)较嚓P(guān)單位,無(wú)論是效率還是經(jīng)濟(jì)性都優(yōu)于傳統(tǒng)切片。
總之,本研究論證了WSI 技術(shù)在常規(guī)病理切片的數(shù)字化掃描及質(zhì)量控制工作中的可行性以及優(yōu)勢(shì)。相信在不久的將來(lái),隨著數(shù)字病理進(jìn)入日常病理工作技術(shù)條件的日益成熟,“互聯(lián)網(wǎng)+”全數(shù)字病理科將是未來(lái)病理科發(fā)展的必然趨勢(shì)[20-22]。