高 媛,涂 亮,王安貴,郭向陽(yáng),劉鵬飛,祝云芳,陳澤輝,吳 迅*
(1.貴州大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,貴州 貴陽(yáng) 550025; 2.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 旱糧研究所,貴州 貴陽(yáng) 550006)
玉米為禾本科、一年生的雌雄同株的異花授粉植物,起源于中美洲,由大芻草經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期馴化而成[1],在16世紀(jì)時(shí)傳入我國(guó),通常表現(xiàn)為莖強(qiáng)壯,植株高大。玉米在我國(guó)各地均有種植,“鐮刀彎地區(qū)”是我國(guó)玉米主產(chǎn)區(qū),主要分為東北地區(qū)、西南地區(qū)以及華南地區(qū)。玉米是我國(guó)重要的糧食作物,同時(shí)也是飼料、能源作物之一。玉米雄穗相關(guān)性狀作為雄穗大小的衡量指標(biāo),與籽粒產(chǎn)量的形成有十分密切的聯(lián)系。隨著經(jīng)濟(jì)的發(fā)展、人口的增加、生活水平的提高,人們對(duì)糧食作物的需求量不斷增加,對(duì)品質(zhì)要求也越來(lái)越高。因此,為滿(mǎn)足人們?nèi)找嬖鲩L(zhǎng)的物質(zhì)文化需求,通過(guò)玉米雄穗相關(guān)性狀的遺傳改良實(shí)現(xiàn)玉米的提質(zhì)增產(chǎn)。雄穗屬于典型的、復(fù)雜的數(shù)量性狀,位于植株的頂端,受多個(gè)微效等位基因共同控制,也易受遺傳背景和環(huán)境條件的影響[2-4]。不同研究者利用不同環(huán)境下的不同玉米親本材料,對(duì)玉米雄穗相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位,在玉米的10條染色體上均定位成功。雄穗在進(jìn)行育種和種子生產(chǎn)時(shí),被證明是重要的農(nóng)藝性狀之一。玉米雄穗分枝數(shù)也決定著產(chǎn)量的高低,但研究者們對(duì)玉米雄穗分枝數(shù)的基因研究報(bào)道相對(duì)較少。因此,通過(guò)綜述玉米雄穗發(fā)育及雄穗相關(guān)性狀的QTL定位,利用新技術(shù)和新方法進(jìn)一步解析玉米雄穗發(fā)育的遺傳基礎(chǔ),為玉米育種的遺傳改良提供科學(xué)依據(jù)。
雄穗俗稱(chēng)天花,屬圓錐花序,是生長(zhǎng)在莖稈頂部的雄性花蕊。雄穗由直立較粗的花序軸與較細(xì)的分枝組成,品種不同,雄穗分枝數(shù)也各不相同?;ㄐ蜉S周?chē)嘈谐蓪?duì)小穗,而分枝上僅著生2行成對(duì)小穗。每個(gè)節(jié)上各著生2個(gè)小穗(有柄和無(wú)柄),分別位于上下方。小穗基部的兩側(cè)各著生1片護(hù)穎,護(hù)穎間著生2朵雄花,每朵花均由1片內(nèi)外穎(稃)和3個(gè)雄蕊組成[5]。
穗分化的各個(gè)時(shí)期對(duì)玉米產(chǎn)量的形成均很重要,是玉米產(chǎn)量形成的基礎(chǔ),主要分為生長(zhǎng)錐未伸長(zhǎng)期、生長(zhǎng)錐伸長(zhǎng)期、小穗分化期、小花分化期和性器官發(fā)育形成期共5個(gè)時(shí)期[6]。其中,小穗分化期被證明是雄穗分枝形成的關(guān)鍵時(shí)期,主要表現(xiàn)為莖的生長(zhǎng)點(diǎn)繼續(xù)伸長(zhǎng),基部出現(xiàn)分枝突起,突起先發(fā)育成雄穗分枝,后分化為成對(duì)排列的小穗。中部出現(xiàn)小穗原基,后分化成2個(gè)大小不同的小穗突起,大的在上,有柄;小的在下,無(wú)柄。此時(shí)期延續(xù)5~7 d,葉齡指數(shù)40左右,可見(jiàn)葉11~13片,展開(kāi)葉7.4~9.6片[7]。
雄穗分枝數(shù)是植株頂端雄花序所有分枝的總數(shù),雄穗分枝數(shù)與玉米的種子繁殖能力有關(guān)[8]。GERALDI等[9]研究發(fā)現(xiàn),玉米雄穗分枝數(shù)與玉米籽粒產(chǎn)量呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。但在種子生產(chǎn)過(guò)程中,為提高制種產(chǎn)量,降低制種成本,雙親中的父本植株應(yīng)有較大的雄穗[10]。大小適中的雄穗可作為玉米的理想株型,較大的雄穗會(huì)影響株型的冠層結(jié)構(gòu)[11],降低通透性[12]。研究表明:耐旱性與雄穗分枝數(shù)之間有顯著相關(guān)性,這可能是玉米耐旱性群體在育種及改良過(guò)程中間接導(dǎo)致分枝數(shù)減少的原因[13-14]。DUVICK等[15]研究表明,美國(guó)先鋒雜交種在20年間雄穗降低了36%。因此,玉米小穗分化期決定著雄穗分枝的數(shù)目,在育種過(guò)程中起重要作用。
霍仕平[16]采用數(shù)量遺傳學(xué)方法對(duì)6個(gè)不同世代的玉米雄穗相關(guān)性狀進(jìn)行遺傳分析表明,雄穗分枝數(shù)符合加性、顯性遺傳,認(rèn)為在選擇雄穗時(shí),對(duì)分枝數(shù)進(jìn)行早代選擇是比較有效的。孫振等[17]對(duì)多個(gè)玉米材料的雄穗相關(guān)性狀進(jìn)行遺傳分析表明,不同氮環(huán)境下的雄穗分枝數(shù)性狀存在顯著的基因型和基因型×氮水平的互作差異,廣義遺傳力為0.52~0.86,F(xiàn)1代有中親遺傳和超顯性遺傳的優(yōu)點(diǎn),并表現(xiàn)出正向雜種優(yōu)勢(shì)。王迪[18]在聯(lián)合環(huán)境下對(duì)2個(gè)群體的雄穗分枝數(shù)及雄穗重進(jìn)行遺傳分析表明,2個(gè)群體中雄穗分枝數(shù)的遺傳力均較高,并在3個(gè)試驗(yàn)點(diǎn)中基本呈極顯著的正相關(guān)關(guān)系。楊釗釗等[19]通過(guò)對(duì)11個(gè)RIL群體及其親本的雄穗性狀進(jìn)行遺傳分析表明,在不同環(huán)境下,雄穗性狀有明顯差異;相同環(huán)境不同群體間的表型值也達(dá)顯著差異。雄穗分枝數(shù)的遺傳力為0.92~0.96,在3個(gè)雄穗相關(guān)性狀中最高,相關(guān)性分析表明,雄穗一級(jí)分枝數(shù)在遺傳上相對(duì)獨(dú)立。
玉米雄穗分枝數(shù)是復(fù)雜的數(shù)量性狀,因品種不同,分枝個(gè)數(shù)也存在一定的差異。通過(guò)對(duì)雄穗分枝數(shù)性狀進(jìn)行遺傳分析,可為該性狀在育種過(guò)程中提供更有價(jià)值的理論參考。
2.2.1 國(guó)內(nèi)研究進(jìn)展 隨著科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步和現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展,玉米10條染色體上均鑒定出了控制玉米雄穗分枝數(shù)的QTL,并對(duì)雄穗分枝數(shù)性狀的QTL進(jìn)行整合(表1)。
表1 玉米雄穗分枝數(shù)性狀QTL信息整合
王迪等[20]以黃早四為共同親本的F2:3群體為材料,結(jié)合2年多點(diǎn)的表型鑒定對(duì)多種環(huán)境下的玉米雄穗相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位,共檢測(cè)到40個(gè)雄穗分枝數(shù)性狀的QTL(Q/H群體23個(gè),Y/H群體17個(gè)),其中包括5個(gè)主效QTL,并在Q/H群體中確定了2個(gè)重要的QTL,即位于bin7.01的Qqtpbn7-1和位于bin7.02的Qqtw7-2。檢測(cè)到11個(gè)雄穗重性狀的QTL:Q/H群體9個(gè),Y/H群體2個(gè)。王召輝等[21]對(duì)MU6×SDM和Mo17×SDM構(gòu)建的F2∶3群體進(jìn)行雄穗分枝數(shù)的QTL定位,在2個(gè)群體中,各檢測(cè)到1個(gè)和3個(gè)QTL。在Mo/S群體中檢測(cè)到2個(gè)主效QTL:MN-2a和MN-4a,各解釋表型變異的10.85%和10.36%。
楊釗釗等[22]以黃早四為共同親本材料構(gòu)建了11個(gè)不同組合的RIL群體,采用完備區(qū)間作圖法,在單環(huán)境和多個(gè)不同環(huán)境下對(duì)玉米雄穗相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位,在單環(huán)境下,11個(gè)群體中共檢測(cè)到雄穗一級(jí)分枝數(shù)、主軸長(zhǎng)、雄穗干重的QTL分別為79個(gè)、84個(gè)和88個(gè);在多環(huán)境下,共檢測(cè)到15個(gè)能夠穩(wěn)定表達(dá)的“環(huán)境鈍感”主效QTL。在染色體bin3.04區(qū)域,齊319和旅28群體均定位到1個(gè)主效QTL,其平均貢獻(xiàn)率分別為17.4%和14.4%。白成銀等[23]以3237×1212的玉米回交群體為材料,通過(guò)SSR標(biāo)記構(gòu)建遺傳圖譜,進(jìn)行玉米雄穗相關(guān)性狀的QTL定位,共檢測(cè)到7個(gè)QTL,其中,控制雄穗分枝數(shù)的4個(gè)QTL位于第2、3、5、7條染色體上,可解釋10.96%~24.75%的表型變異。
張媛等[24]對(duì)親本為甜玉米材料的F2、F2∶3群體的雄穗分枝數(shù)進(jìn)行QTL定位表明,在F2群體中共檢測(cè)到6個(gè)QTL,其中4個(gè)QTL的表型貢獻(xiàn)率均大于10%,為主效QTL;在F2∶3群體中共檢測(cè)到8個(gè)QTL,僅有1個(gè)QTL的表型貢獻(xiàn)率大于10%。CHEN等[25]通過(guò)昌7-2×787的F2群體為材料,運(yùn)用GBS技術(shù)構(gòu)建一個(gè)超高密度的遺傳圖譜,進(jìn)行雄穗相關(guān)性狀的QTL定位,共檢測(cè)到10個(gè)QTL,其中,表型效應(yīng)最大的qTBN4和qTBN7,各解釋6.2%和6.3%的表型變異,參考基因組定位的遺傳距離為6.1 Mb和1.6 Mb。
吳迅等[26]基于中國(guó)NAM群體,共鑒定出28個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL,可解釋表型變異的73.03%,其中12個(gè)QTL與單個(gè)重組自交系群體的定位一致,可解釋表型變異的平均值為10.19%;基于美國(guó)NAM群體,共鑒定出35個(gè)雄穂分枝數(shù)相關(guān)的QTL,其中29個(gè)QTL與單群體的定位一致,可解釋表型變異的平均值為10.73%。一致性分析發(fā)現(xiàn),在2個(gè)群體中同時(shí)檢測(cè)到13個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL。在基因組范圍內(nèi),共定位到125個(gè)雄穗相關(guān)性狀的QTL。劉軍霞等[27]以掖488×Va35-2構(gòu)建F2∶3群體,運(yùn)用復(fù)合區(qū)間作圖法在不同環(huán)境下的進(jìn)行雄穗相關(guān)性狀的QTL定位與遺傳分析表明,在單個(gè)環(huán)境下,共檢測(cè)到7個(gè)雄穗分枝數(shù)QTL和8個(gè)雄穗主軸長(zhǎng)QTL,位于第1號(hào)、2號(hào)、3號(hào)、4號(hào)、5號(hào)、6號(hào)、7號(hào)、9號(hào)和10號(hào)染色體,單個(gè)QTL的表型貢獻(xiàn)率范圍為3.38%~17.01%,僅有第8染色體上未定位到;在2個(gè)環(huán)境下,同時(shí)檢測(cè)到8個(gè)穩(wěn)定表達(dá)的QTL(4個(gè)雄穗分枝數(shù)的QTL位點(diǎn):bin3.04的qTBN-Ch.3-1,bin5.04的qTBN-Ch.5-1,bin7.02的qTBN-Ch.7-1,bin9.01-9.02的qTBN-Ch.9-1)。代資舉等[28]以鄭58×昌7-2構(gòu)建了188個(gè)不同組合的重組自交系群體,通過(guò)288個(gè)多態(tài)性分子標(biāo)記(SNP)構(gòu)建遺傳連鎖圖譜,進(jìn)行玉米雄穗分枝數(shù)性狀的QTL定位,共檢測(cè)到5個(gè)一致性主效QTL,各位于5條不同染色體上。通過(guò)連續(xù)回交及分子標(biāo)記輔助育種(MAS)構(gòu)建了位于bin5.05區(qū)域的主效QTL-qTBN5近等基因系(NIL),將其定位在13.2 Mb區(qū)間內(nèi),為玉米雄穗分枝數(shù)主效基因的精細(xì)定位及分子育種奠定基礎(chǔ)。
賈波等[29]通過(guò)RA×M5P構(gòu)建205個(gè)家系的重組自交系群體,在2個(gè)環(huán)境下,運(yùn)用復(fù)合區(qū)間作圖法,對(duì)玉米雄穗分枝數(shù)進(jìn)行QTL定位。共檢測(cè)到5個(gè)QTL,分別位于第1、2、3、9號(hào)染色體上,可解釋3.66%~8.41%的表型變異。在2個(gè)環(huán)境中均能穩(wěn)定檢測(cè)到染色體bin1.04、bin9.03區(qū)域。這些不同環(huán)境下穩(wěn)定檢測(cè)到的雄穗性狀QTL位點(diǎn)可以為進(jìn)一步的遺傳研究提供理論基礎(chǔ)。田然等[30]以掖478為遺傳背景、齊319為供體親本的染色體片段導(dǎo)入系CL103為父本,與背景親本回交并自交構(gòu)建含955個(gè)單株的F2分離群體,利用完備區(qū)間作圖法對(duì)控制玉米雄穗分枝數(shù)的主效QTL進(jìn)行精細(xì)定位,最終將qTBN7精細(xì)定位在第7染色體物理位置110088645~110160101 bp區(qū)域內(nèi),LOD值為25.06,可解釋11.47%的表型變異,該區(qū)間包含14個(gè)候選基因,包括已報(bào)道的控制玉米雄穗分枝數(shù)的基因ramosa1(ra1)。
2.2.2 國(guó)外研究進(jìn)展 UPADYAYULA等[10]利用回交1代群體,在第4、7號(hào)染色體上檢測(cè)到1個(gè)控制雄穗分枝數(shù)的QTL,各解釋11.7%和7.9%的表型變異。HAMMAD等[31]利用K12466/1×K47/2-2-1-3-3-1-1-1構(gòu)建F2:3群體,共檢測(cè)到5個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL,可解釋14.73%的表型變異。BERKE等[32]利用染色體片段導(dǎo)入系群體檢測(cè)到7個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL,均位于第5染色體上。BROWN等[4]利用5 000份重組自交系群體組成的(NAM)群體,檢測(cè)到39個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL。MICKELSON等[33]通過(guò) B73×Mo17構(gòu)建RIL群體,共檢測(cè)到6個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL,位于第2號(hào)染色體umc53a位置附近的QTL的表型貢獻(xiàn)率為19.2%,3個(gè)雄穗分枝角度相關(guān)的QTL,可解釋表型變異的35.6%。UPADYAYULA等[34]用1個(gè)群體檢測(cè)到2個(gè)雄穗分枝數(shù)相關(guān)的QTL,分別位于bin7.02位置和bin9.02位置。
前人的研究報(bào)道對(duì)于深度解析玉米雄穗性狀變異的遺傳基礎(chǔ),以及快速改良玉米雄穗性狀提供了大量的科學(xué)支撐。但比較發(fā)現(xiàn),不同研究報(bào)道結(jié)果之間存在部分研究結(jié)果的一致性,但大部分研究者因?yàn)樗玫牟牧?、?biāo)記類(lèi)型和數(shù)量的不同,其定位結(jié)果也存在一定的差異。一定程度上揭示了不同材料之間的重組差異,也反應(yīng)出不同的標(biāo)記類(lèi)型和數(shù)量,其檢測(cè)的分辨率差異。因此,結(jié)合高通量的基因型鑒定策略、新的QTL統(tǒng)計(jì)模型和精準(zhǔn)表型評(píng)價(jià)手段等,深入發(fā)掘不同來(lái)源玉米種質(zhì)內(nèi)蘊(yùn)藏的控制雄穗性狀變異的關(guān)鍵遺傳區(qū)段和基因,對(duì)高效改良玉米雄穗相關(guān)性狀具有十分重要的理論意義和實(shí)踐利用價(jià)值。
目前,玉米育種的重點(diǎn)方向之一是選育雄穗大小適中、適宜當(dāng)?shù)厣鷳B(tài)環(huán)境的品種。玉米雄穗分枝數(shù)是復(fù)雜的數(shù)量遺傳性狀,其 QTL定位易受親本、群體的密度和類(lèi)型及環(huán)境因素等影響。迄今為止,控制玉米雄穗分枝數(shù)性狀的基因研究報(bào)道相對(duì)較少,前人針對(duì)不同材料的研究結(jié)果表明:不同材料間雄穗分枝數(shù)差異明顯,從而遺傳結(jié)果也不完全相同。不同的研究者利用不同親本、標(biāo)記類(lèi)型和數(shù)量的差異,在玉米10條染色體上均定位出了控制玉米雄穗分枝數(shù)性狀的QTL。因此,通過(guò)對(duì)玉米雄穗相關(guān)性狀基因的定位,研究玉米雄穗相關(guān)性狀的候選基因的遺傳基礎(chǔ)及效應(yīng),發(fā)掘具有優(yōu)勢(shì)的雄穗性狀的玉米新基因資源,為玉米籽粒產(chǎn)量和株型相關(guān)性狀的遺傳改良提供理論依據(jù)。
隨著科學(xué)技術(shù)及現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展,少數(shù)研究者通過(guò)構(gòu)建SNP遺傳連鎖圖譜[35-36],檢測(cè)到一些控制雄穗相關(guān)性狀的QTL,但受群體、標(biāo)記類(lèi)型和數(shù)目影響,QTL鑒定的區(qū)間較大,新的穩(wěn)定QTL位點(diǎn)仍有待挖掘。近年來(lái)發(fā)展的GBS技術(shù)能夠大大提高QTL定位的準(zhǔn)確性,并且縮小了定位區(qū)間,避免了傳統(tǒng)的基因型鑒別方法的不足,對(duì)QTL的定位起到了重要作用[34]。同時(shí),結(jié)合連鎖分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析策略,可以保證檢測(cè)結(jié)果的可靠性,同時(shí)還能提高檢測(cè)結(jié)果的分辨率,鑒定出更多的重組事件。近些年新發(fā)展的技術(shù)和方法的應(yīng)用將為玉米雄穗相關(guān)性狀基因座的精細(xì)定位和候選基因的圖位克隆提供更豐富的理論支持,有效促進(jìn)玉米雄穗發(fā)育研究。