研究病毒合作抗疫

一種與呼吸道疾病相關的新型冠狀病毒

上海公共衛(wèi)生臨床中心和復旦大學公共衛(wèi)生學院教授張永振等人與合作者對2019-nCov的基因組序列進行了分析。相關研究成果近期發(fā)表于Nature。該病毒基因組從就職于出現(xiàn)病例的海鮮市場的一名病人身上獲得?；蚪M分析顯示，該病毒與此前在蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒有相關性。對從該患者收集的支氣管肺泡灌洗液（肺分泌物）進行了基因組測序，鑒定出了一種新型病毒，發(fā)現(xiàn)該病毒基因組與蝙蝠體內發(fā)現(xiàn)的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性，還需要更多研究確認病毒來源。為了進一步了解該病毒對人類的潛在感染性，論文還比較了該病毒和SARS冠狀病毒及蝙蝠SARS樣冠狀病毒刺突蛋白上的受體結合域。

新型冠狀病毒早期進化機制研究進展

中國科學院上海巴斯德研究所、中科院生物安全大科學中心上海分部崔杰研究組成員魏小曼、李祥等根據(jù)目前發(fā)表的新型冠狀病毒（2019-nCoV）分析結果及公共數(shù)據(jù)庫里上傳的基因組比對結果，進行綜合分析，推測出此次暴發(fā)的新型冠狀病毒的早期進化機制。研究結果發(fā)表于National Science Review。論文指出，新型冠狀病毒在早期進化中顯示較弱的感染力，也可在人與人之間傳播，但傳播能力不容忽視。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示病毒缺少拓撲結構，聚類不明顯。病毒應該是在發(fā)生人與人之間傳播后開始產(chǎn)生突變。至于病毒有沒有發(fā)生適應性進化，目前還無法定論，需要更多的病毒基因組分析及后續(xù)針對突變位點的功能實驗驗證。

抗2019新型冠狀病毒藥物篩選方面研究進展

中國科學院武漢病毒研究所/生物安全大科學研究中心與軍事科學院軍事醫(yī)學研究院國家應急防控藥物工程技術研究中心研究人員開展聯(lián)合研究，在抑制2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）藥物篩選方面取得進展。相關研究成果以《瑞得西韋和磷酸氯喹能在體外有效抑制新型冠狀病毒（2019-nCoV）》為題發(fā)表于中國自主知識產(chǎn)權的國際知名學術期刊Cell Research（《細胞研究》）。研究表明，瑞得西韋（Remdesivir，GS-5734）和磷酸氯喹（Chloroquine）在細胞水平上能有效抑制2019-nCoV的感染，其在人體上的作用還有合作研究，待臨床驗證。

中國預先公布新型冠狀病毒3CL水解酶高分辨率晶體結構

上?？萍即髮W免疫化學研究所和中國科學院上海藥物研究所抗2019-nCoV冠狀病毒感染聯(lián)合應急攻關團隊及時公布了由上?？萍即髮W饒子和/楊海濤課題組測定的2019-nCoV冠狀病毒3CL水解酶（Mpro）的高分率晶體結構（數(shù)據(jù)收集在上海光源完成）。晶體結構的坐標已經(jīng)上載于PDB蛋白質結構數(shù)據(jù)庫（Protein Data Bank， PDB）。研究團隊快速表達了2019-nCoV水解酶（Mpro）并獲得了高分辨率晶體結構，該預先公布新型冠狀病毒3CL水解酶高分辨率晶體結構能夠方便更多的科技工作者，特別是藥物研發(fā)的科技人員使用，協(xié)助國內外同行專家研發(fā)出更多更好的抗新型肺炎藥物。

新型冠狀病毒（2019-nCoV）或來源于蝙蝠

中國科學院武漢病毒研究所/生物安全大科學研究中心、武漢市金銀潭醫(yī)院及湖北省疾病預防控制中心合作針對2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）展開了鑒定研究，揭示新型冠狀病毒（2019-nCoV）或來源于蝙蝠。相關研究成果近期發(fā)表于Nature。研究團隊從早期的5位患者樣本中獲得了該病毒的全基因組序列，來自5位患者的病毒序列相似性達到99.9%，與SARSCoV的序列一致性為79.5%。進一步將2019-nCoV基因組與實驗室早期檢測的冠狀病毒的部分基因序列進行比較，發(fā)現(xiàn)該病毒與來源于蝙蝠樣本的一株冠狀病毒（簡稱TG13）的基因相似，兩種病毒序列一致性高達96%。至今，中國科學家仍然與各國科學家一起致力于開展病毒源頭和傳播途徑的全球科學研究。

新型冠狀病毒的進化來源和傳染人的分子作用機制研究

中國科學院上海巴斯德研究所郝沛、軍事醫(yī)學研究院國家應急防控藥物工程技術研究中心鐘武和中科院分子植物卓越中心合成生物學重點實驗室李軒合作，闡述了新型冠狀病毒的進化來源和傳染人的分子作用機制。研究結果發(fā)表于SCIENCE CHINA Life Sciences。研究者利用新型冠狀病毒和收集到大量冠狀病毒數(shù)據(jù)進行了遺傳進化分析。由于新型冠狀病毒的進化鄰居和外類群都在各類蝙蝠中有發(fā)現(xiàn)，推測新型冠狀病毒的自然宿主也可能是蝙蝠。新型冠狀病毒在從蝙蝠到人的傳染過程中很可能存在著未知的中間宿主媒介。該研究為病毒防控，以及開發(fā)檢測和干預技術手段提供了研究基礎。

新型冠狀病毒易感性研究

同濟大學附屬東方醫(yī)院左為教授團隊通過單細胞測序RNA-Seq技術發(fā)現(xiàn)新冠病毒（2019-nCoV）的受體ACE2在亞洲男性肺泡細胞中高表達；即僅從病毒受體方面分析，亞裔人群可能更容易感染新冠病毒，尤其是亞裔男性。相關成果發(fā)表于預印本文獻庫bioRxiv。該研究通過單細胞RNA測序技術以單細胞分辨率報道了ACE2在人肺中的RNA表達譜，并經(jīng)過統(tǒng)計分析表明ACE2受體與性別和族裔相關。嘗試解釋了臨床統(tǒng)計數(shù)據(jù)中出現(xiàn)的一些科學問題，同時也猜測了2019-nCoV大流行的生物學原因。然而，值得關注的是，截至論文投遞，該研究進行分析的樣品過少，相關結論仍然有待進一步驗證。

新型冠狀病毒感染的肺炎初期傳播動力

中國疾病預防控制中心、湖北省疾病預防控制中心、香港大學等十幾個單位的專業(yè)人員協(xié)作，根據(jù)截至2020年1月23日上報的425例確診病例（包括15名醫(yī)務人員）所做了回顧性分析，開展了新型冠狀病毒感染的肺炎在傳播初期的傳播動力學分析。相關論文發(fā)表于新英格蘭雜志NEJM。截止到論文投遞的時間，論文基于425例病例流行病學調查資料做出了回顧性推論，提出了“2019年12月份即在密切接觸者中發(fā)生了人際傳播”的觀點。該調查結果以科學專業(yè)的態(tài)度刊發(fā)，有助于國內外專業(yè)同行及時了解疾病的特征，共同評估和研判疫情，改進防控策略，體現(xiàn)了積極發(fā)揮建設性引領作用的擔當和科學精神。