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    不同方法對(duì)紅火蟻社會(huì)型鑒定效果的比較

    2020-05-11 10:04:54王晨軒賈羚藝李天楚黃大衛(wèi)
    關(guān)鍵詞:高保真蟻后紅火蟻

    王晨軒,賈羚藝,李天楚,陳 立,黃大衛(wèi),,4*

    (1.河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,河北省動(dòng)物系統(tǒng)學(xué)與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北保定 071002;2.中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所動(dòng)物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100101;3.中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所農(nóng)業(yè)蟲(chóng)害鼠害綜合治理研究國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100101;4.南開(kāi)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,天津 300350)

    紅火蟻SolenopsisinvictaBuren,膜翅目蟻科,是一種社會(huì)性昆蟲(chóng),有多個(gè)品級(jí),包括蟻后、有生殖能力的雌蟻、雄蟻,以及無(wú)生殖能力的工蟻。紅火蟻原產(chǎn)于南美洲,后傳入美國(guó)、澳大利亞、新西蘭,乃至亞洲的諸多國(guó)家和地區(qū),例如中國(guó)大陸、臺(tái)灣、香港、澳門(mén)、菲律賓、泰國(guó)、馬來(lái)西亞等(董慧和楊定,2005)。該物種擴(kuò)散能力極強(qiáng),具有很強(qiáng)的攻擊性,是世界上最成功的入侵性螞蟻之一(Tschinkel,2006),可在農(nóng)業(yè)和林業(yè)的生產(chǎn)、生態(tài)平衡,以及公共安全等方面產(chǎn)生巨大危害(Vinson,2013)。

    紅火蟻具有單蟻后(Monogyne)和多蟻后(Polygyne)兩種社會(huì)型,單蟻后型巢穴僅具有一只可繁殖蟻后,多蟻后型巢穴中具有兩只及以上可繁殖蟻后。紅火蟻?zhàn)?004年在中國(guó)大陸被發(fā)現(xiàn)后,疫情嚴(yán)重,傳播廣泛(陸永躍和曾玲,2015)。在紅火蟻傳播過(guò)程中,其社會(huì)型格局可在同一地區(qū)的不同時(shí)間發(fā)生動(dòng)態(tài)變化,不同地區(qū)間社會(huì)型格局也不相同。不同社會(huì)型的紅火蟻在行為、種群結(jié)構(gòu)、擴(kuò)張速度等方面存在較大差異,因此鑒定社會(huì)型是對(duì)紅火蟻制定有效監(jiān)控方案的關(guān)鍵步驟(邵敬國(guó)等,2008)。

    關(guān)于紅火蟻兩種社會(huì)型產(chǎn)生的機(jī)制已有較為深入的研究,紅火蟻已日漸成為研究螞蟻類(lèi)群社會(huì)結(jié)構(gòu)的模式物種。Gp-9基因?qū)t火蟻巢穴中工蟻是否接納蟻后有著很大影響(Ross,1997)。單蟻后在該基因位點(diǎn)是純合子,僅擁有Gp-9B等位基因,而多蟻后型是雜合子,擁有Gp-9B和Gp-9b兩個(gè)等位基因。不同社會(huì)型由Gp-9基因的等位基因決定,b等位基因與紅火蟻多蟻后社會(huì)型有密切關(guān)系(Ross,1998)。對(duì)Gp-9進(jìn)行測(cè)序后,發(fā)現(xiàn)該基因編碼了一種信息素結(jié)合蛋白,該蛋白與工蟻能否接受純合子蟻后或雜合子蟻后相關(guān)(Ross,2002)。

    單蟻后巢穴中,基因型為BB的雌蟻與基因型為BB的雄蟻婚飛交配后,產(chǎn)生后代均為BB型。單蟻后巢穴產(chǎn)生的BB型雌蟻個(gè)體較大,婚飛后能夠獨(dú)立建立新巢,并培育第一代工蟻。多蟻后巢穴中的Bb型蟻后會(huì)產(chǎn)生BB、Bb和bb 3種基因型后代,其中bb型工蟻或蟻后壽命很短;BB型雌蟻體型比單蟻后巢穴中的BB型雌蟻小,短距離婚飛后無(wú)法獨(dú)自建立新巢,最終回歸舊巢或加入其它多蟻后巢穴,但會(huì)逐漸被Bb型工蟻殺死(DeHeer,1999;Huang and Wang,2014),而B(niǎo)b型蟻后傾向回歸舊巢進(jìn)行繁殖(Krieger,2005),最終導(dǎo)致Bb基因型占多蟻后型巢穴基因型的90%左右,因此多蟻后型巢顯示雜合子基因型(Ross,1997)。

    單蟻后種群與多蟻后種群除蟻后數(shù)目和身體大小不同之外,還有諸多特征表現(xiàn)出明顯差異。多蟻后型蟻巢較小且蟻群密度大,繁殖能力強(qiáng)(Rossetal.,1999),具有更強(qiáng)的種間競(jìng)爭(zhēng)力(Porteretal.,1988),因此多蟻后型能夠更好的適應(yīng)入侵環(huán)境,建立新的生態(tài)平衡(Porter and Savignano,1990)。高密度多蟻后型巢穴增加了防治頻次和成本(Greenbergetal.,1992)。雖然已經(jīng)有鑒定紅火蟻種群的社會(huì)型方法報(bào)道,但缺乏一套可重復(fù)性高且操作便捷的標(biāo)準(zhǔn)化鑒定方法。

    紅火蟻的巢穴密度、外形及行為等特征可以初步判斷紅火蟻的社會(huì)型。多蟻后型紅火蟻與單蟻后型紅火蟻相比,工蟻體型較小,數(shù)量較多。多蟻后型紅火蟻巢穴之間相鄰較近,蟻巢密度較大。當(dāng)多蟻后型的工蟻遭遇同種個(gè)體的入侵時(shí),無(wú)論入侵者來(lái)自單蟻后型巢穴,還是來(lái)自于多蟻后型巢穴,都沒(méi)有很強(qiáng)的攻擊性,而單蟻后型的工蟻與之相反,對(duì)同種個(gè)體入侵的防范意識(shí)更強(qiáng)(Fritz and Meer,2003)。依據(jù)這些生物學(xué)特征,可以簡(jiǎn)單的對(duì)紅火蟻的類(lèi)型進(jìn)行區(qū)分,但是生物學(xué)觀(guān)察法容易出現(xiàn)因觀(guān)察不詳細(xì)或小樣本量對(duì)統(tǒng)計(jì)造成的誤差產(chǎn)生判斷錯(cuò)誤。利用PCR(Polymerase Chain Reaction)等分子生物學(xué)手段,能夠達(dá)到更好的鑒定效果。Gp-9基因位于紅火蟻基因組的低重組區(qū)域,通過(guò)對(duì)紅火蟻15種Gp-9基因的比較,發(fā)現(xiàn)該基因在紅火蟻類(lèi)群中十分保守,編碼區(qū)在不同物種間僅涉及點(diǎn)突變的變異(Krieger and Ross,2005)。因此可以通過(guò)對(duì)該基因及附近區(qū)段的DNA序列設(shè)計(jì)特異引物,利用PCR擴(kuò)增和凝膠電泳等手段驗(yàn)證紅火蟻DNA樣品中是否含有Gp-9等位基因B或b,進(jìn)而判斷紅火蟻種群的社會(huì)型。

    基于PCR的鑒定方法,已有大量研究報(bào)道了不同的引物或方法對(duì)紅火蟻社會(huì)型的鑒定效果,受到了國(guó)內(nèi)外學(xué)者的青睞(Chenetal.,2006;Goodismanetal.,2007;Laietal.,2008;Yangetal.,2008;Yangetal.,2009;Allenetal.,2010;Garlapatietal.,2010;Laietal.,2010;Linetal.,2010;Chirinoetal.,2012;Laietal.,2012;Yangetal.,2012;Chenetal.,2014;Kelly and Sellers,2014;Laietal.,2015;Kayetal.,2018)。目前已有多種針對(duì)Gp-9序列設(shè)計(jì)的引物,可以通過(guò)PCR對(duì)紅火蟻的Gp-9基因型進(jìn)行鑒定。本文以中國(guó)紅火蟻為材料,選取7對(duì)不同的特異引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)比不同種類(lèi)的DNA聚合酶在實(shí)驗(yàn)中的擴(kuò)增效果,從而比較實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和重復(fù)度,篩選出了一套便捷可靠的實(shí)驗(yàn)方案,為鑒定紅火蟻社會(huì)型提供了技術(shù)參考,以期為紅火蟻的相關(guān)研究提供幫助。

    1 材料和方法

    1.1 樣本采集及生物學(xué)指標(biāo)的測(cè)量

    實(shí)驗(yàn)所用紅火蟻于2018年7月和9月采集于廣東省廣州市華南農(nóng)業(yè)大學(xué)校園和廣州市黃埔區(qū)廣州科學(xué)城。觀(guān)察蟻巢大小及密度后掘土采集螞蟻,待蟻群穩(wěn)定后使用“滴水浸泡法”將蟻群從土壤中逼出,轉(zhuǎn)移至飼養(yǎng)盒中,飼養(yǎng)盒為60 cm×44 cm×36 cm的塑料整理箱,整理箱四壁涂有Fluon以防止蟻群逃逸,溫度26℃,濕度60%~70%并提供水、蜂蜜水和黃粉蟲(chóng)在實(shí)驗(yàn)室飼養(yǎng)。對(duì)各巢螞蟻進(jìn)行生物學(xué)觀(guān)察,統(tǒng)計(jì)每巢中脫翅蟻后的數(shù)量。

    1.2 基因組DNA提取

    本實(shí)驗(yàn)共采用來(lái)自華南農(nóng)業(yè)大學(xué)校園和廣州科學(xué)城不同區(qū)域的8巢紅火蟻,每巢分別隨機(jī)收集25頭工蟻,使用EasyPure Genomic DNA Kit (TransGen Biotech,Beijing,China)提取基因組DNA,使用NanoDrop-2000 Spectrophotometer (Thermo,Madison,WI,USA)測(cè)量DNA濃度和純度。最終保證使用的DNA濃度大于100 μg/μL,OD260/OD280和OD260/OD230均在1.8~2.0。

    1.3 PCR擴(kuò)增反應(yīng)

    由于不同引物所擴(kuò)增的片段長(zhǎng)度不同、引物的退火溫度不同,所以本研究中針對(duì)不同的引物,采取不同的PCR程序(表1)。此外,為對(duì)比不同DNA聚合酶的擴(kuò)增效果,對(duì)編號(hào)為7和8的紅火蟻樣品,針對(duì)相同的引物(多重PCR技術(shù)的引物,表1)使用不同的DNA聚合酶進(jìn)行擴(kuò)增。共選取4種DNA聚合酶(表2):(1)兩種不同廠(chǎng)家的熱啟動(dòng)高保真酶:Platinum? Taq DNA polymerase (Invitrogen,Carlsbad,USA),TransStart? Taq DNA Polymerase (TransGen Biotech,Beijing,China)。(2)兩種不同廠(chǎng)家的高保真酶:TransTaq? DNA Polymerase High Fidelity (TransGen Biotech,Beijing,China),KOD DNA Polymerase (Toyobo,Osaka,Japan)。

    1.4 凝膠電泳檢測(cè)及限制性?xún)?nèi)切酶檢測(cè)

    PCR產(chǎn)物使用1%凝膠電泳檢測(cè)后,選擇單蟻后型和多蟻后型PCR產(chǎn)物使用限制性?xún)?nèi)切酶HindIII (NEB,Beijing,China),按照使用說(shuō)明進(jìn)行酶切,檢測(cè)條帶大小。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 紅火蟻的生物學(xué)觀(guān)察

    通過(guò)一定時(shí)間的觀(guān)察,發(fā)現(xiàn)8號(hào)紅火蟻巢中工蟻體型較大,且僅發(fā)現(xiàn)一個(gè)脫翅蟻后。編號(hào)1-7巢中可發(fā)現(xiàn)兩個(gè)及以上脫翅蟻后,編號(hào)1-7較編號(hào)8巢中工蟻體型小。因此通過(guò)形態(tài)特征鑒定推測(cè)蟻巢8中的紅火蟻為單蟻后型,其他7巢為多蟻后型。

    2.2 不同引物擴(kuò)增紅火蟻 Gp-9 基因的結(jié)果

    以紅火蟻DNA為模板,用7對(duì)特異引物進(jìn)行擴(kuò)增,經(jīng)凝膠電泳檢測(cè)(圖1)可見(jiàn)多重PCR技術(shù)(圖1A)條帶清晰,單蟻后型與多蟻后型結(jié)果區(qū)別明顯,重復(fù)性較高(成功率0.86,n=7)。對(duì)其PCR產(chǎn)物進(jìn)行酶切之后(圖1B),多蟻后型顯示兩條大小不一的條帶,單蟻后型帶型不發(fā)生改變。針對(duì)b等位基因的一種方法(圖1C,D)可在多蟻后型樣品中擴(kuò)增出單一條帶(分別為219 bp 和259 bp),單蟻后型無(wú)條帶,重復(fù)性較高(成功率1.00,n=7)。對(duì)2013年報(bào)道的4對(duì)同時(shí)擴(kuò)增B、b等位基因的引物(Wangetal.,2013)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)(圖1E-H),發(fā)現(xiàn)4對(duì)引物的成功率均較低,或擴(kuò)增條帶不清晰,容易出現(xiàn)雜帶,對(duì)實(shí)驗(yàn)判斷造成影響。其中圖1G對(duì)應(yīng)的引物,雖然可獲得清晰條帶,但是重復(fù)性較低(成功率0.43,n=7)。

    表1 引物及其程序設(shè)定Table 1 Primers and PCR program settings

    表2 DNA聚合酶Table 2 DNA polymerases

    圖1 應(yīng)用 Gp-9等位基因檢測(cè)紅火蟻的社會(huì)型Fig.1 Gp-9 banding patterns of social forms of Solenopsis invicta注:實(shí)驗(yàn)中各引物PCR擴(kuò)增結(jié)果及條帶大小見(jiàn)電泳圖;M,DNA Marker;1,2,3,4,5,6,7,8蟻巢編號(hào);A,多重PCR技術(shù);B,對(duì) Gp-9B-specific 26BS 16BAS,Gp-9b-specific:24bS 25bAS引物PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的酶切鑒定;C,D,Gp-9b 等位基因擴(kuò)增法;E-H,其他同時(shí)擴(kuò)增B、b等位基因的引物;所使用的DNA聚合酶均為Invitrogen公司生產(chǎn)的熱啟動(dòng)酶Platinum? Taq DNA polymerase。Note:PCR amplification of each pair of primer in the experiment and their sizes were shown in electrophoresis.M,DNA Marker;1,2,3,4,5,6,7,8 Nest numbers;A,Multiplex PCR,B,Enzyme digestion of PCR amplification products of Gp-9B-specific 26BS 16BAS and Gp-9b-specific 24bS 25bAS primers;C,D,Gp-9b allele amplification;E-H,other primers that simultaneous amplification of B and b alleles;All the PCR were conducted using Platinum? Taq DNA polymerase,Invitrogen.

    2.3 不同DNA聚合酶擴(kuò)增紅火蟻 Gp-9基因的結(jié)果

    以?xún)沙布t火蟻的DNA為模板,使用相同引物(多重PCR技術(shù)的引物Gp-9B-specific:26BS 16BAS,Gp-9b-specific:24bS 25bAS),在相同的PCR反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序(表1)下,分別用4種不同的DNA聚合酶(表2)進(jìn)行擴(kuò)增,以對(duì)比不同DNA聚合酶在驗(yàn)證紅火蟻社會(huì)型PCR實(shí)驗(yàn)中的效果。經(jīng)凝膠電泳檢測(cè)發(fā)現(xiàn)4種酶的擴(kuò)增效果具有明顯差別:高保真酶TransTaq? DNA Polymerase High Fidelity擴(kuò)增產(chǎn)物無(wú)可檢出的電泳條帶(圖2A);熱啟動(dòng)酶Platinum? Taq DNA polymerase擴(kuò)增效果明顯優(yōu)于其他酶,基本沒(méi)有引物二聚體產(chǎn)生,電泳帶型易于區(qū)分單蟻后多蟻后,單蟻后型為單一條帶,多蟻后型為兩條條帶(圖2B);熱啟動(dòng)酶TransStart? Taq DNA Polymerase擴(kuò)增產(chǎn)物中有非特異擴(kuò)增的雜帶(圖2C);KOD DNA Polymerase酶擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳條帶較亮,說(shuō)明產(chǎn)物的DNA量較高,此外條帶較寬,無(wú)法區(qū)分相鄰帶型,且條帶大小與預(yù)期不符,說(shuō)明有大量非特異擴(kuò)增(圖2D)。由此可見(jiàn),所對(duì)比的4種DNA聚合酶中,熱啟動(dòng)酶Platinum? Taq DNA polymerase最為適用。

    圖2 利用多重PCR技術(shù)引物和使用不同DNA聚合酶對(duì)兩種社會(huì)型紅火蟻的擴(kuò)增結(jié)果Fig.2 Identification of two different social forms of Solenopsis invicta Buren by Multiplex PCR using different DNA polymerases.注:M,DNA Marker;7和8,蟻巢編號(hào),分別為多蟻后型和單蟻后型;圖A,用酶TransTaq? DNA Polymerase High Fidelity擴(kuò)增結(jié)果;圖B,用酶Platinum? Taq DNA polymerase擴(kuò)增結(jié)果;圖C,用酶TransStart? Taq DNA Polymerase擴(kuò)增結(jié)果;圖D,用酶KOD DNA Polymerase擴(kuò)增結(jié)果。Note:M,DNA Marker;7 and 8,nest Numbers,polygyne and monogyne respectively;A,results of PCR using TransTaq DNA Polymerase High Fidelity;B,results of PCR using Platinum? Taq DNA polymerase;C,results of PCR using TransStart Taq DNA Polymerase;D,results of PCR using KOD DNA Polymerase.

    3 結(jié)論與討論

    自紅火蟻社會(huì)型分化的調(diào)控機(jī)制報(bào)道以來(lái),針對(duì)Gp-9位點(diǎn)的PCR分子鑒定手段有很多。本研究基于這一背景進(jìn)行了各種方法之間的比較,選取了7對(duì)具有代表性的引物以及4種DNA聚合酶進(jìn)行對(duì)比,并最終獲得了實(shí)驗(yàn)室內(nèi)鑒定紅火蟻社會(huì)型的最佳實(shí)驗(yàn)方案。

    通過(guò)比較7對(duì)引物的實(shí)驗(yàn)可行性及重復(fù)性,本研究發(fā)現(xiàn)其中4對(duì)同時(shí)擴(kuò)增B、b等位基因的引物因重復(fù)性較差或擴(kuò)增條帶特異性不高(圖1E-H),不利于紅火蟻社會(huì)型的實(shí)驗(yàn)鑒定。而多重PCR技術(shù)與Gp-9b等位基因擴(kuò)增(圖1A-D)的準(zhǔn)確率較高,重復(fù)性較強(qiáng)。在多重PCR技術(shù)最早的報(bào)道中,Valles and Porter (2003)提出可以將PCR產(chǎn)物進(jìn)行限制性酶切,從而更易辨別單蟻后型和多蟻后型的條帶。在本研究的實(shí)驗(yàn)中,發(fā)現(xiàn)該方法的PCR步驟可同時(shí)擴(kuò)增出大小不一的條帶,分別對(duì)應(yīng)多蟻后型和多蟻后型。其PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳后已經(jīng)可以清晰的展現(xiàn)不同條帶大小的區(qū)別(圖1A),無(wú)需后續(xù)的酶切步驟(圖1B)即可用于判斷樣品的社會(huì)型。而Gp-9b等位基因擴(kuò)增的兩種引物(圖1C,D)只能擴(kuò)增出b等位基因的單一條帶,對(duì)B等位基因無(wú)擴(kuò)增效力,是針對(duì)b等位基因的特異引物。因此可以將Gp-9b等位基因擴(kuò)增與多重PCR技術(shù)搭配使用,二者的電泳結(jié)果可相互印證,共同判別紅火蟻的社會(huì)型。

    在對(duì)不同酶的對(duì)比中,本研究所選的4種聚合酶均具有不同強(qiáng)度的保真性,并且這4種酶中還包括兩種熱啟動(dòng)酶。酶的高保真性主要可以通過(guò)兩種手段實(shí)現(xiàn),一種是利用某些特殊的DNA聚合酶本身的保真性,另一種是將普通DNA聚合酶與具有外切酶活性的其他酶按不同比例混合。因此不同品牌的不同高保真DNA聚合酶產(chǎn)品,其保真效率也不盡相同。在本研究所對(duì)比的4種DNA聚合酶中,四者均具有高保真功能。其中高保真酶TransTaq?DNA Polymerase High Fidelity同時(shí)具有5′ → 3′的外切酶活性和3′ → 5′的外切酶活性,保真效果最好,錯(cuò)配率最低,用該酶進(jìn)行紅火蟻社會(huì)型的PCR鑒定,沒(méi)有擴(kuò)增出預(yù)期條帶。引物序列與待測(cè)樣品的序列結(jié)合并非完全一致,不能滿(mǎn)足此類(lèi)高保真DNA聚合酶的擴(kuò)增條件。另外,KOD DNA Polymerase酶使用了自然菌株(超嗜熱原始菌ThermococcuskodakaraensisKOD1株)的DNA聚合酶,該酶具有天然的3′ → 5′的外切酶活性,但活性較其他混合高保真酶類(lèi)更弱,因此非特異擴(kuò)增產(chǎn)物較多,不適用于紅火蟻的社會(huì)型鑒定。

    而熱啟動(dòng)DNA聚合酶的工作原理主要是通過(guò)對(duì)酶進(jìn)行化學(xué)修飾、加入酶抗體或其他特異蛋白等手段,減少低溫下DNA聚合酶發(fā)生鏈錯(cuò)配或產(chǎn)生引物二聚體。本研究所對(duì)比的4種DNA聚合酶中,有兩種具有熱啟動(dòng)功能,其中熱啟動(dòng)酶Platinum?Taq DNA polymerase擴(kuò)增效果優(yōu)于熱啟動(dòng)酶TransStart?Taq DNA Polymerase,其原因可能來(lái)自各個(gè)方面,例如保真酶的成分和比例、熱啟動(dòng)的原理不同等等。而與其他3種酶比較,Platinum?Taq DNA polymerase的效果也為最佳,這可能與其適中的保真性和較強(qiáng)的熱啟動(dòng)功能有關(guān),該酶在對(duì)紅火蟻社會(huì)型的PCR鑒定中較為適用。

    針對(duì)本研究所采集的8個(gè)蟻巢,生物學(xué)形態(tài)鑒定結(jié)果中僅編號(hào)8巢有單只脫翅蟻后,Gp-9b等位基因擴(kuò)增和多重PCR技術(shù)所獲得的鑒定結(jié)果與生物學(xué)觀(guān)察所得結(jié)果相互驗(yàn)證,彌補(bǔ)了生物學(xué)觀(guān)察所帶來(lái)的缺陷,最終表明1-7號(hào)巢為多蟻后型巢穴,而只有8號(hào)巢穴為單蟻后型。這表明Gp-9b等位基因擴(kuò)增和多重PCR技術(shù)的分子鑒定結(jié)果十分可靠,且重復(fù)率高,可以與生物學(xué)觀(guān)察一同用于判定紅火蟻的社會(huì)型。

    除了本研究所采用的基于PCR的分子鑒定法外,紅火蟻的社會(huì)型的判斷還有其他方法,例如蛋白質(zhì)電泳法、探針?lè)ǖ?。蛋白質(zhì)電泳法(DeHeer,1999)利用Gp-9B蛋白與Gp-9b蛋白的遷移速率不同這一原理,根據(jù)蛋白電泳條帶判斷Gp-9的基因型,從而判斷紅火蟻的社會(huì)型。但是蛋白質(zhì)電泳對(duì)提取樣品有較高的要求,必須采集活體螞蟻且每個(gè)樣本所需螞蟻數(shù)目較大,加之蛋白質(zhì)電泳技術(shù)本身的復(fù)雜性和不穩(wěn)定性,因此此方法并不適于快速鑒定紅火蟻社會(huì)型。探針?lè)ɡ门cGp-9基因結(jié)合的引物和探針檢測(cè)Gp-9基因型(Ascunceetal.,2010),有較高的靈敏度,但該方法所需探針較為昂貴,且實(shí)驗(yàn)流程繁瑣,需配備熒光定量PCR儀,不適合在所有實(shí)驗(yàn)室普及。

    此外還有多種PCR與其他實(shí)驗(yàn)手段相結(jié)合的方法,例如RFLP法(Restriction Fragment Length Polymorphism) (Lucasetal.,2015),該方法需設(shè)計(jì)多對(duì)引物進(jìn)行巢式PCR,且擴(kuò)增片段較長(zhǎng)(2 kb),增加了實(shí)驗(yàn)的難度,此外RFLP操作繁瑣,不適于快速檢測(cè)紅火蟻社會(huì)型。而HRM(高分辨率熔解曲線(xiàn))法需要借助實(shí)時(shí)熒光定量PCR完成實(shí)驗(yàn)(Oakeyetal.,2011),實(shí)驗(yàn)操作過(guò)于復(fù)雜。此外還有人提出可以利用紅火蟻cDNA擴(kuò)增Gp-9序列,但該方法需要進(jìn)行紅火蟻RNA的提取和cDNA的逆轉(zhuǎn)錄(Leal and Ishida,2008),增加實(shí)驗(yàn)步驟。

    由此可見(jiàn),上述不同方法因?yàn)閷?shí)驗(yàn)步驟繁瑣、成本較高,或需要特殊的實(shí)驗(yàn)儀器等原因并不適用于所有實(shí)驗(yàn)室。與其對(duì)比之下,本研究篩選出的多重PCR技術(shù)與Gp-9b等位基因擴(kuò)增相結(jié)合的PCR鑒定方案對(duì)螞蟻樣品的要求較低,只需使用酒精浸泡的工蟻樣本,就可通過(guò)簡(jiǎn)單的DNA提取步驟獲得實(shí)驗(yàn)所需DNA樣品。此外,基于PCR的技術(shù)簡(jiǎn)單易行,具備常規(guī)分子生物學(xué)器材配備的實(shí)驗(yàn)室均能操作,實(shí)驗(yàn)耗時(shí)短,通??稍?~3 h內(nèi)批量完成多個(gè)不同巢穴的鑒定試驗(yàn),更適用于普通實(shí)驗(yàn)室對(duì)紅火蟻社會(huì)型的鑒定。

    綜上所述,本文提出一套針對(duì)紅火蟻社會(huì)型鑒定的組合方案——將多重PCR技術(shù),Gp-9b等位基因擴(kuò)增這兩種分子生物學(xué)方法相結(jié)合,利用具有中等保真性能和較強(qiáng)熱啟動(dòng)效率的DNA聚合酶進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并輔以生物學(xué)觀(guān)察的手段進(jìn)行鑒定,通過(guò)這三者實(shí)驗(yàn)結(jié)果的相互驗(yàn)證,能更好的判斷中國(guó)紅火蟻種群的社會(huì)型。

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