中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所研究團(tuán)隊(duì)構(gòu)建首個(gè)油菜基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫

近日， 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼，構(gòu)建了油菜十萬余個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄全景圖，使得油菜基因功能研究第1 次有了標(biāo)準(zhǔn)的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫， 將有力支撐油菜功能基因的相關(guān)研究。 該項(xiàng)研究成果在線發(fā)表在《The Plant Journal》（植物學(xué)報(bào)）上。

據(jù)團(tuán)隊(duì)首席科學(xué)家劉勝毅研究員介紹，油菜基因組包含約12 億個(gè)堿基和十余萬個(gè)基因，如何解讀這些海量的基因組信息成為功能基因研究的重要任務(wù)。根據(jù)中心法則，基因通過轉(zhuǎn)錄形成mRNA 再翻譯成蛋白質(zhì)。 由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式，因此一個(gè)基因可形成許多種不同的mRNA。此前，由于技術(shù)和資源的限制，缺乏油菜全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA 數(shù)據(jù)庫，因此導(dǎo)致油菜基因功能研究缺乏可查詢、參考的基因注釋信息。 為了突破這一瓶頸，該團(tuán)隊(duì)采用最新的三代測(cè)序技術(shù)，準(zhǔn)確測(cè)定了油菜全長轉(zhuǎn)錄組，并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法，繪制油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖，構(gòu)建油菜標(biāo)準(zhǔn)的參考轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫。 該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目和中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目資助。