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    鹽堿土壤中微生物菌株的分離、篩選與功能評價

    2019-12-27 09:28:09武芳李勇路兆軍
    安徽農(nóng)學通報 2019年23期
    關鍵詞:分離篩選鹽堿

    武芳 李勇 路兆軍

    摘 要:通過對鹽堿土壤中微生物菌株的分離、篩選和功能評價,結果表明,菌株DY23具有較好的耐鹽堿能力,在培養(yǎng)基的NaCl濃度達到20%且pH值為12.0的條件下仍可生長;對棉枯萎病、黃瓜枯萎病、小麥紋枯病和煙草赤星病均具有生防作用;具有較好的溶磷能力;可分泌生長素IAA,對小白菜有較好的促生作用;經(jīng)16SrRNA序列的測序結果與NCBI數(shù)據(jù)庫的比對,顯示其為阿氏芽孢桿菌(Bacillus aryabhattai)。

    關鍵詞:鹽堿;分離;篩選;功能評價;阿氏芽孢桿菌

    中圖分類號 S156.4文獻標識碼 A文章編號 1007-7731(2019)23-0024-05

    Isolation,Screening and Functional Evaluation of Microbial Strains in Saline Alkali Soil

    Wu Fang1 et al.

    (1Yantai Diyuan Biotechnology Co.,Ltd.,Yantai 264003,China)

    Abstract:Through isolation,screening and functional evaluation of microbial strains in saline-alkali soil,it was found that strain DY23 had good salt-alkali tolerance,and could grow when NaCl concentration reached 20% and pH value was 12.0;it had biocontrol effects on Cotton Fusarium wilt,Cucumber Fusarium wilt,Wheat Sheath Blight and tobacco brown spot;it had good phosphorus-soluble ability;It secretes auxin IAA;It also has a good growth promoting effect on Chinese cabbage. By comparing the 16S rRNA sequence with NCBI database,it was shown that it was Bacillus aryabhattai.

    Key words:Saline-alkali;Isolation;Screen;Functional evaluation;Bacillus aryabhattai

    近年來,隨著土地鹽堿化的日益加劇,對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和生態(tài)環(huán)境的影響越來越嚴重。從世界范圍來看,約有20%的耕地和接近50%的灌溉農(nóng)田產(chǎn)量嚴重受到高濃度鹽堿土壤的影響。在中國,約有670萬hm2的次生鹽漬化農(nóng)田,占耕地總面積的10%。如何減輕鹽堿土壤對農(nóng)業(yè)產(chǎn)量的影響、更好地利用鹽堿地,提高農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)的經(jīng)濟、社會和生態(tài)效益,是現(xiàn)代農(nóng)林業(yè)所關注的重大問題之一[1]。在國內外鹽堿地改良研究領域,先后提出了“種稻改堿”[2]農(nóng)業(yè)改良措施,“灌水洗鹽”[3]工程改良措施,以及利用石膏、氯化鈣、工業(yè)廢酸、燃煤煙氣脫硫物等化學改良措施。這些措施見效快,取得了顯著的成果,但與此同時,也存在改良成本高,資源耗費大,且產(chǎn)生了養(yǎng)分流失、污染下游、改良效果不穩(wěn)定、容易返鹽等問題。

    隨著對鹽堿土壤的不斷研究,并結合環(huán)保改良理念,人們開始從恢復生態(tài)的角度將鹽堿地的改良和利用結合起來,即“寓改良到利用中,改良與利用并行”,發(fā)現(xiàn)以生物利用為核心的生態(tài)恢復技術是未來鹽堿地改良修復的突破口。目前,生物改良包括種植耐鹽堿植物、使用微生物菌肥等。而開發(fā)高效的微生物菌肥制劑,首先要獲得在高鹽條件下能夠促進植物生長的微生物菌株。本研究通過針對性的采取樣品,并經(jīng)過分離、篩選及功能評價等措施,得到了1株在高鹽堿環(huán)境下具有促生和防病潛力的菌株,經(jīng)鑒定為阿氏芽孢桿菌(Bacillus aryabhattai),為加速以生物利用為核心的生態(tài)修復技術的應用具有重要意義。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 樣品? 本研究的樣品共2份,1份于2009年10月采自四川瀘州白酒生產(chǎn)廠的中層窯泥,編號為1號;另1份于2009年8月采自天津靜海地區(qū)玉米地的表層土壤,編號為2號。

    1.1.2 培養(yǎng)基

    1.1.2.1 Gibbons改良培養(yǎng)基[4] 干酪素5.0g,檸檬酸鈉3.0g,酵母浸粉10.0g,KCl2.0g,蛋白胨5.0g,MgSO4·7H2O2.0g,NaCl100g,pH值9.0[5]。固體培養(yǎng)基需每1000mL加20g瓊脂。

    1.1.2.2? 蒙金娜有機培養(yǎng)基[6]? Glucose 10g,(NH4)2SO40.5g,NaCl0.3g,KCl0.3g,F(xiàn)eSO4·7H2O0.03g,SO4Mn 4H2O0.03g,Lecithin(卵磷脂)0.2g,Yeast extract paste 0.4g,Agar 20g,蒸餾水補足至1000mL,pH7.0~7.5。

    1.1.2.3? PKO無機培養(yǎng)基[6]? Ca3(PO4)23.0g,Sucrose 10g,(NH4)2SO4 0.5g,NaCl 0.1g,MgSO4·7H2O 0.1g,KCl 0.3g,F(xiàn)eSO4 0.002g,MnSO4 0.004g,Yeast extract paste 0.5g,Agar 15g,蒸餾水補足至1000mL,pH 6.8~7.2。

    1.1.2.4? 亞歷山大羅夫培養(yǎng)基[7]? 蔗糖5g,Na2HPO4 2g,MgSO4.·7H2O 0.5g,F(xiàn)eCl3 0.005g,CaCO3 0.1g,土壤礦物1g,瓊脂20g,pH 7.0~7.5。

    1.1.2.5? CCM液體培養(yǎng)基[8]? 甘露醇5.0g,蔗糖5.0g,乳酸0.5mL,MgSO4·7H2O 0.2g,KH2PO4 0.2g,K2HPO4 0.8g,CaCl2·2H2O 0.06g,NaCl 0.1g,NaMoO4·2H2O 2.5mg,酵母粉0.1g,F(xiàn)e-EDTA 4mL(1.64%),NH4NO3 1g,色氨酸0.1g,pH值7.0。

    1.1.2.6? 保存培養(yǎng)基? 牛肉膏5g,蛋白胨10g,NaCl 5g,瓊脂18g,加蒸餾水配成1000mL,pH值調至7.2~7.4,121℃滅菌20min倒斜面?zhèn)溆谩?/p>

    1.1.3 供試植物和土壤? 試驗植物為小白菜,盆栽土壤選取山東陵縣鹽堿地未改良土。

    1.2 方法

    1.2.1 菌株分離純化? 首先,將土壤樣品進行風干處理,而后分別稱取10g,磨碎后加入到裝有90mL0.9%的無菌生理鹽水和少量玻璃珠的三角瓶中,200r振蕩20min后,進行梯度稀釋。取0.1mL經(jīng)適當稀釋后梯度的樣品涂布于Gibbons改良培養(yǎng)基平板上。置于30℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)8d。待長出單菌落后,挑取單一菌落進行劃線培養(yǎng),并通過反復平板劃線得到純菌株。然后將純菌株接種到斜面培養(yǎng)基上,于30℃下恒溫培養(yǎng)4d后,放入4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.2 耐鹽堿微生物菌株的篩選及鹽堿耐受力的測定 通過不斷分別提高Gibbons改良培養(yǎng)基的鹽度和堿度,來進行耐鹽堿微生物菌株的篩選。首先使Gibbons改良培養(yǎng)基pH值保持為9.0,逐次將培養(yǎng)基的鹽度提高2%,使NaCl濃度分別為10%、12%、14%、16%、18%和20%;然后再將Gibbons改良培養(yǎng)基鹽度的NaCl濃度保持10%不變,每次將培養(yǎng)基的pH值提高1個單位,即pH值分別為8、9、10、11和12。將斜面培養(yǎng)基上保存的菌株接種到上述平板上,置于30℃環(huán)境下培養(yǎng)8d,以菌株是否可以長出來作為評判菌株是否耐鹽堿的標準,從而篩選出具有耐鹽堿能力的菌株。

    1.2.3 耐鹽堿微生物菌株的生防作用評價 采用平板對峙法,評價部分功能菌株對棉花枯萎病、黃瓜枯萎病、小麥紋枯病、煙草赤星病等4種病原菌的拮抗能力。將篩選得到的6株耐鹽堿能力較好的菌株與4種病原菌在PDA平板上作對峙培養(yǎng),平板中央接種新鮮的病原菌,在距離平板邊緣1cm處用接種環(huán)涂直徑為0.5cm的細菌菌斑,28℃恒溫培養(yǎng)3~5d后,觀察各個菌株對病原菌拮抗作用的有無。

    1.2.4 耐鹽堿微生物菌株溶磷、解鉀能力評價 利用菌株自身產(chǎn)生有機酸,經(jīng)滲透擴散將其周圍的有機或無機磷溶解從而形成1個透明的環(huán)。采用有機磷(蛋黃卵磷脂)和無機磷(Ca3(PO4)2)固體培養(yǎng)基溶磷圈法進行功能菌株溶磷能力的測定,每個供試菌株分別點接于蒙金娜有機磷和PKO無機磷培養(yǎng)基培養(yǎng),每培養(yǎng)皿3個接菌點,每菌3個重復,置生化培養(yǎng)箱28℃下恒溫培養(yǎng),每天測量菌落直徑和溶磷透明圈直徑,至其無明顯變化止。每個菌種分別點接于亞歷山大羅夫培養(yǎng)基,每個培養(yǎng)皿3個接菌點,每株菌3個重復,置生化培養(yǎng)箱28℃下恒溫培養(yǎng),每天測量菌落直徑和解鉀透明圈直徑,至其無明顯變化。

    1.2.5 耐鹽堿微生物菌株促生能力評價 植物生長激素(IAA)對作物的生長、產(chǎn)量及品質、均有較大的影響。采用Salkowski比色法[9-11]測定細菌分泌植物生長激素(IAA),將供試菌株接種CCM液體培養(yǎng)基(培養(yǎng)基中需加入色氨酸)的三角瓶中,每瓶盛有50mL培養(yǎng)基,每菌株重復3次,置于28℃搖床,180r震蕩培養(yǎng)4d。取100μL菌懸液滴于白色陶瓷板上,同時加100μLSalkowski比色液(50mL 35%HClO4和1mL0.5M FeCl3混合)。對照只在比色液中加入50μL50mg/L的IAA。白色陶瓷板于室溫避光放置30min后觀察,顏色變紅者表示能夠分泌IAA。

    1.2.6 盆栽效果評價試驗

    1.2.6.1? 耐鹽堿微生物菌株菌液的制備? 菌液的制備方法為于-70℃冰箱中取出原始菌株,在LB平板上劃線,28℃下培養(yǎng)24h,待長出單菌落,挑取其接入含有5mL LB培養(yǎng)液的試管中,28℃,200r培養(yǎng)24h,制成種子液;以1%的接種量將種子液接種于裝有500mL LB培養(yǎng)液的1L規(guī)格的大三角瓶里,28℃,200r培養(yǎng)22~24h,以得到濃度為1~10×108cfu/mL的菌液。

    1.2.6.2? 盆栽效果評價實驗? 選用30cm栽培盆,生長速度快的小白菜作為供試作物,土壤選取山東陵縣鹽堿地未改良土,共設置8個處理,分別為:(1)清水對照,(2)培養(yǎng)基對照,(3)DY07菌液,(4)DY08菌液,(5)DY12菌液,(6)DY19菌液,(7)DY23菌液,(8)DY24菌液。每個處理24棵苗,每盆1棵苗。待小白菜長出2片真葉時,濃度為1×108CFU/mL的菌液緩慢灌入小白菜苗根圍,每株20mL,隨后置于溫室中培養(yǎng),28℃,70%相對濕度以上,16/8h光周期,觀察小白菜生長情況。生長15d后對小白菜的株高、根長和鮮重進行測量,求出平均值。

    1.2.7 菌株鑒定 鑒定方法為16S rRNA基因片段序列測序。采用上海賽百盛基因技術有限公司的基因組DNA快速提取試劑盒,提取細菌的基因組DNA,以提取的DNA產(chǎn)物為模板,用細菌16S rDNA擴增通用引物U8-27、L1494-1514從基因組DNA中擴增出16S rDNA基因片段。

    引物:U8-27(F)5'-AAGTTTGA TC(AC)TGGCT-AG-3';

    L1494-1514(R)5'-CTACGG(AG)TACCTTGTTAC-AC-3'

    反應體系:10×PCR Buffer ………………… 2.5μL

    Mg2+ …………………………… 3.75μL

    dNTP ……………………………2μL

    引物P1/P2 ………………………0.6μL

    模板DNA …………………………1μL

    rTaq 酶 ………………………… 0.5μL

    加超純水至 ………………………25μL

    反應參數(shù):[94°C …… 5min94°C …… 1min56°C …… 1min72°C …… 2min72°C …… 10min12°C …… forever30 cycles]

    PCR產(chǎn)物用1%(w/v)的瓊脂糖凝膠電泳進行檢測,電壓120V,15min,EB染色20min,用凝膠回收試劑盒回收所需條帶。將目標片段連接至載體pMD19-T,然后轉入大腸桿菌(Escherichia coli)Top-10感受態(tài)細胞中,挑取單克隆,搖菌,測序。獲得的16S rDNA序列在Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)進行比對,獲得鑒定結果。

    2 結果與分析

    2.1 耐鹽微生物菌株的鹽堿耐受力 以四川瀘州白酒生產(chǎn)廠的中層窯泥樣品樣本和天津靜海地區(qū)玉米地表層土壤樣本為來源,在Gibbons改良培養(yǎng)基上分離得出50株菌株,并通過鹽堿耐受力篩選得到6株具有耐鹽堿的菌株,其中菌株DY23的耐鹽能力最好,在NaCl濃度為20%的培養(yǎng)基上即可長出;而菌株DY24的耐堿能力最強,在pH值為12.0的培養(yǎng)基上即可長出(如表1和表2)。同時,提高Gibbons改良培養(yǎng)基的鹽(NaCl)濃度和堿濃度(pH值),以菌株是否長出來比較各菌株的同時耐鹽、堿能力。結果顯示,只有1株同時既耐鹽又耐堿的菌株DY23,當培養(yǎng)基的NaCl濃度達到20%且pH值為12.0的條件下仍可生長(如表3)。

    2.2 耐鹽微生物菌株的生防作用 通過平板對峙法,發(fā)現(xiàn)篩選出的耐鹽堿菌株表現(xiàn)出了不同程度的拮抗作用,其中菌株DY07對棉枯萎病、黃瓜枯萎病和煙草赤星病有拮抗作用,菌株DY08和DY19對棉枯萎病菌和煙草赤星病有拮抗作用,菌株DY12只對棉枯萎病有拮抗作用,而菌株DY23和菌株DY24對4種病原菌均表現(xiàn)出拮抗作用(如表4)。

    2.3 耐鹽堿微生物菌株溶磷、解鉀能力 通過在蒙金娜有機磷和PKO無機磷培養(yǎng)基培養(yǎng)上的測定,發(fā)現(xiàn)菌株DY07、DY08、DY19、DY23和DY24均有不同程度的溶磷能力,其中菌株DY08和DY23的溶磷能力最強;通過在亞歷山大羅夫培養(yǎng)基上的檢測,發(fā)現(xiàn)只有菌株DY12有解鉀能力(如表5)。

    2.4 耐鹽堿微生物菌株促生能力 通過Salkowski比色法測定,發(fā)現(xiàn)菌株DY19、DY23和DY24可分泌IAA,其中菌株DY23分泌IAA的能力更強(如表6)。

    2.5 盆栽效果 通過盆栽效果評價試驗,發(fā)現(xiàn)施用菌劑的小白菜在株高、根長和鮮重方面指標都明顯優(yōu)于2個對照組,且培養(yǎng)基對照組和清水對照有不出苗和死苗的現(xiàn)象,其中DY23菌劑處理組的株高、根長和鮮重都明顯優(yōu)于其他處理組(如表7)

    2.6 菌株測序結果 通過以上試驗發(fā)現(xiàn),菌株DY23有較好的耐鹽堿能力,當培養(yǎng)基的NaCl濃度達到20%且pH值為12.0的條件下仍可生長;對棉枯萎病、黃瓜枯萎病、小麥紋枯病和煙草赤星病均有生防作用;具有較好的溶磷能力;可分泌生長素IAA,并對小白菜有較好的促生作用,故該菌在鹽堿環(huán)境中可能有較好的促生和生防作用,經(jīng)16S rRNA序列的測序結果與NCBI數(shù)據(jù)庫的比對,顯示其為阿氏芽孢桿菌(Bacillus aryabhattai),相似度為98.9%(如表8)。

    3 結論與討論

    科學家們根據(jù)微生物菌株的耐鹽程度,提出了不同的耐鹽性分類系統(tǒng)[12-17],其中最常用的為Larsen等(1987)和Vreeland(1987)提出的分類系統(tǒng)。根據(jù)微生物菌株對NaCl的敏感程度,將其分為以下4大類:(1)非嗜鹽微生物(nonhalophilic):生長不需NaCl,低濃度的NaCl即會對其生長產(chǎn)生抑制作用;(2)輕度嗜鹽微生物(slighthalophilic):生長需少量NaCl,其生長最適NaCl濃度為1%~3%;(3)中度嗜鹽微生物(moderately halophilic):生長需少量NaCl,其生長最適NaCl濃度為5%~10%;(4)極端嗜鹽微生物(extreme halophilic):生長所需NaCl濃度為9%~32.5%,生長最適NaCl濃度為20%。再根據(jù)微生物菌株對堿的耐受力不同,也被分為了4類,分別為:(1)耐堿微生物(alkalotolerant microbes),pH值7~9生長,pH值>9.5不能生長;(2)嗜堿微生物(alkalophiles或稱嗜堿生物),pH值10~12生長;(3)極端嗜堿微生物(extreme alkaliphile),最適生長pH值≥10,pH值低于8.9~9則不生長,為專性極端嗜堿微生物;(4)兼性嗜堿微生物(facultative alkaliphile),指該微生物具有能在2種或2種以上不同環(huán)境下生存和繁衍后代的能力,如其既可以在pH>7的環(huán)境中生存,也可在pH<7的環(huán)境中生存。而根據(jù)耐堿性微生物菌株對鹽的耐受力,又可分為嗜堿菌和耐鹽性嗜堿菌。嗜堿菌為可以在pH>9的環(huán)境生長,在pH=10時生長最為良好,不需要高濃度的鹽環(huán)境。而耐鹽性嗜堿菌則在pH>9、鹽濃度為9%~32.5%的環(huán)境下也可生存[18]。由此可見,本研究中的阿氏芽孢桿菌(Bacillus aryabhattai)屬于耐鹽嗜堿微生物,具有較強的耐鹽堿能力。

    阿氏芽孢桿菌除可耐鹽堿以外,在大分子降解、產(chǎn)物合成以及促進植物生長等方面也表現(xiàn)出突出作用,在一些國內外發(fā)明專利上,發(fā)表了阿氏芽孢桿菌在植物抗病害和促生長方面的作用。如李祖紅[19]等研究發(fā)現(xiàn),阿氏芽孢桿菌對防治煙草黑脛病有顯著效果,且對人、畜、農(nóng)作物無害;另有證明阿氏芽孢桿菌AB211[20]可溶解無機磷酸鹽,合成鐵載體,并能產(chǎn)生吲哚乙酸(IAA)等激素。但是對于阿氏芽孢桿菌在鹽堿環(huán)境中既產(chǎn)生促生、又產(chǎn)生抗病的研究比較少,只有井大煒[21]等研究阿氏芽孢桿菌在重鹽堿環(huán)境中可促進怪柳的生長,但并未提到其抗病作用。在現(xiàn)實環(huán)境中,高鹽環(huán)境往往同時伴隨著高堿性,所以本研究中提到的阿氏芽孢桿菌(Bacillus aryabhattai)可在鹽堿環(huán)境中既起到促生又起到抗病的作用,具有更高的實際應用潛力。

    參考文獻

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    (責編:張宏民)

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