李晶晶 陳麗梅 耿緒云 董學(xué)旺 孫金生
中華絨螯蟹野生群體和不同水系人工選育群體的遺傳多樣性分析*
李晶晶1,2陳麗梅3耿緒云2董學(xué)旺2孫金生1①
(1. 天津師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 天津 300387;2. 天津市水生動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心 天津 300221;3. 天津農(nóng)學(xué)院水產(chǎn)學(xué)院 天津市水產(chǎn)生態(tài)及養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 天津 300384)
本研究利用10個(gè)微衛(wèi)星分子標(biāo)記分析了中華絨螯蟹() 3個(gè)不同水系人工選育群體(“長(zhǎng)江1號(hào)”、“光合1號(hào)”和七里海河蟹)和1個(gè)海河流域自然群體的遺傳多樣性和遺傳分化水平。結(jié)果顯示,10個(gè)位點(diǎn)在4個(gè)群體中的等位基因數(shù)()為3~17,平均等位基因數(shù)為8.5~9.7,平均期望雜合度為0.720~0.745,平均觀測(cè)雜合度為0.566~0.661,平均多態(tài)信息含量為0.687~0.716,近交系數(shù)(is)范圍為–0.080~0.827。在40個(gè)群體–位點(diǎn)組合中,有13個(gè)群體–位點(diǎn)組合顯著偏離哈迪–溫伯格平衡(<0.05)。遺傳多樣性分析結(jié)果顯示,與海河自然群體相比,3個(gè)人工選育群體遺傳多樣性水平略有降低,但仍保持在較高水平,具有較大的選育潛力。遺傳分化分析結(jié)果顯示,群體間遺傳分化指數(shù)(st)范圍為0.015~0.075,遺傳相似度為0.7702~0.9401,遺傳距離為0.0617~0.2611?;贜ei’s遺傳距離構(gòu)建了群體UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹,自然群體和“光合1號(hào)”聚為一支,而七里海河蟹群體單獨(dú)聚為一支。綜上所述,4個(gè)中華絨螯蟹群體間的遺傳分化水平較低,群體遺傳多樣性較高。本研究將為中華絨螯蟹選育繁育和種質(zhì)資源利用與管理等提供理論基礎(chǔ)。
中華絨螯蟹;遺傳多樣性;遺傳分化;微衛(wèi)星
中華絨螯蟹()俗稱河蟹,自然分布于我國(guó)長(zhǎng)江、黃河、遼河和甌江等河川及附近地區(qū)(Ma, 2007; 肖起珍等, 2017)。自20世紀(jì)70年代末突破人工育苗技術(shù)難關(guān),經(jīng)過30余年的發(fā)展,中華絨螯蟹養(yǎng)殖遍布我國(guó)遼寧、河北、天津、山東、江蘇、浙江等沿海省份及廣大內(nèi)陸地區(qū),成為我國(guó)重要經(jīng)濟(jì)甲殼動(dòng)物之一(李晶晶等, 2016)。隨著中華絨螯蟹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的規(guī)?;l(fā)展,過度捕撈野生自然資源,無序引進(jìn)異地苗種,大大加劇了中華絨螯蟹種質(zhì)退化和混雜,已成為當(dāng)前養(yǎng)殖生產(chǎn)發(fā)展的瓶頸(王成輝等, 2002)。研究和保護(hù)中華絨螯蟹種質(zhì)資源,對(duì)河蟹養(yǎng)殖業(yè)的持續(xù)穩(wěn)定發(fā)展具有重要意義。近年來,科研院所和養(yǎng)殖企業(yè)積極開展中華絨螯蟹良種人工選育工作,已培育出5個(gè)國(guó)家級(jí)新品種(“光合1號(hào)”、“長(zhǎng)江1號(hào)”、“長(zhǎng)江2號(hào)”、“江海21”和“諾亞1號(hào)”)。
天津市地處環(huán)渤海中部,具有得天獨(dú)厚的海、淡水養(yǎng)殖環(huán)境條件,中華絨螯蟹養(yǎng)殖歷史悠久。轄區(qū)內(nèi)的七里海是我國(guó)重要的古海岸與古濕地保護(hù)區(qū),獨(dú)特的生態(tài)環(huán)境創(chuàng)出了味道鮮美、膏滿黃肥的天津市特色農(nóng)產(chǎn)品品牌——七里海河蟹(朱廣奇, 2012; 杜紅梅, 2014)。然而,50年代末期,天津海河入海口處建設(shè)了防潮閘,切斷了中華絨螯蟹的生殖洄游通道,導(dǎo)致本地區(qū)自然資源逐年減少。2000年,天津市水生動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心采集七里海核心區(qū)中華絨螯蟹野生群體作為選育基礎(chǔ)群體,利用群體選育技術(shù)連續(xù)選育6代,獲得快速生長(zhǎng)的七里海河蟹群體。
在傳統(tǒng)人工選育中,由于長(zhǎng)期不引進(jìn)外來親本,經(jīng)過連續(xù)多代選育獲得的新品種或新品系,其種群遺傳多樣性是否有所降低,有待進(jìn)行科學(xué)評(píng)價(jià)。一般認(rèn)為,遺傳多樣性的大小及其群體遺傳結(jié)構(gòu)跟一個(gè)物種的進(jìn)化潛力和抵御不良環(huán)境的能力密切相關(guān)(李博, 2000)。因此,分析檢測(cè)育種群體的遺傳特征,對(duì)于中華絨螯蟹選育效果預(yù)測(cè)、種質(zhì)資源保護(hù)以及養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)健康持續(xù)發(fā)展意義重大。
目前,天津地區(qū)中華絨螯蟹資源主要有人工選育群體“七里海河蟹”、“長(zhǎng)江1號(hào)”、“光合1號(hào)”以及海河流域自然群體。本研究利用10個(gè)多態(tài)性豐富的微衛(wèi)星分子標(biāo)記,比較分析了天津地區(qū)4個(gè)中華絨螯蟹群體的遺傳多樣性和群體間的遺傳分化,旨在為開展中華絨螯蟹選育和種質(zhì)資源利用與管理等工作提供理論基礎(chǔ)。
本實(shí)驗(yàn)共采集4個(gè)中華絨螯蟹群體,每個(gè)群體樣品數(shù)量為60只(表1)。七里海河蟹群體于2012年采自天津市蟹源水產(chǎn)養(yǎng)殖有限公司,為天津地區(qū)海河流域人工選育的第6代成蟹群體;自然群體于2012年采自海河入???,是天津地區(qū)海河流域野生成蟹種群;“長(zhǎng)江1號(hào)”和“光合1號(hào)”于2013年分別采自江蘇省淡水水產(chǎn)研究所和盤錦光合蟹業(yè)有限公司,為長(zhǎng)江水系和遼河水系人工選育幼蟹群體。采集的4個(gè)中華絨螯蟹群體同屬奇數(shù)年群體。分別剪取每只中華絨螯蟹步足肌肉組織,置于–20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
本研究選用了10個(gè)已發(fā)表的多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點(diǎn),用于中華絨螯蟹4個(gè)群體的遺傳分析(Li, 2016)。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,引物序列及特征見表2。
采用天根生化科技有限公司的海洋動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒,提取中華絨螯蟹肌肉組織的總DNA,并用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA質(zhì)量,紫外分光光度法測(cè)定DNA濃度和純度。用滅菌雙蒸水將DNA稀釋成100 μg/ml后,–20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
PCR反應(yīng)在10 μl體系中進(jìn)行,包括1×buffer、2 mmol/L MgCl2、0.2 mmol/L dNTP、1 μmol/L引物、0.25 UDNA聚合酶(TaKaRa)和100 ng DNA模板。PCR程序:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性1 min,退火1 min,72℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸5 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用6%的變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè),硝酸銀法染色,10 bp DNA ladder (Invitrogen)作為Marker檢測(cè)擴(kuò)增片段大小。
使用Microsatellite AnalyseR (MSA)軟件計(jì)算各微衛(wèi)星位點(diǎn)在4個(gè)群體中的等位基因數(shù)()、期望雜合度(e)和觀測(cè)雜合度(o) (Dieringer, 2003)。用公式e=1/∑i2計(jì)算有效等位基因數(shù)(e) (i表示每個(gè)位點(diǎn)第個(gè)等位基因的頻率) (Kimura, 1964)。FSTAT 2.9.3軟件(Goudet, 2001)計(jì)算每個(gè)群體每個(gè)位點(diǎn)的近交系數(shù)(is)。應(yīng)用PIC-CALC 0.6軟件計(jì)算多態(tài)信息含量(PIC)。Genepop 4.2軟件檢測(cè)10個(gè)位點(diǎn)的哈迪-溫伯格平衡(HWE)偏離情況,并比較分析各位點(diǎn)在群體間等位基因頻率(Raymond, 1995)。MSA軟件計(jì)算st值(Weir, 1984)。應(yīng)用SPAGeDi 1.1軟件(Hardy, 2002)對(duì)無效等位基因進(jìn)行校正,Bonferroni檢驗(yàn)對(duì)顯著性水平的多點(diǎn)檢測(cè)進(jìn)行校正(Rice, 1989)。使用Popgene Version 1.31計(jì)算Nei’s遺傳距離(Nei, 1978),利用MEGA 5軟件構(gòu)建群體間UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹(Tamura, 2011)。
表1 中華絨螯蟹群體的取樣時(shí)間、地點(diǎn)、群體類型和樣本數(shù)
Tab.1 The sampling time, location, population and size of E. sinensis
表2 中華絨螯蟹10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)特征
Tab.2 Characteristics of ten microsatellite loci of E. sinensis
應(yīng)用選取的10對(duì)微衛(wèi)星引物,對(duì)4個(gè)中華絨螯蟹群體共240個(gè)個(gè)體進(jìn)行擴(kuò)增分析,遺傳多樣性參數(shù)見表3。等位基因數(shù)范圍為3~17,其中,位點(diǎn)SSR352和SSR1289等位基因數(shù)最多(=17),分別出現(xiàn)在七里海河蟹群體和自然群體中。七里海河蟹、自然群體、“長(zhǎng)江1號(hào)”和“光合1號(hào)”的平均等位基因數(shù)分別為9.4、9.7、9.0和8.5;平均觀測(cè)雜合度為0.658、0.661、0.566和0.618;平均期望雜合度為0.720、0.745、0.732和0.720;平均多態(tài)信息含量為0.691、0.716、0.694和0.687,所有參數(shù)的最高平均值均出現(xiàn)在自然群體中。所有位點(diǎn)的平均觀測(cè)雜合度均略低于平均期望雜合度,4個(gè)群體均具有較高的平均期望雜合度(>0.5)和平均多態(tài)信息含量(>0.5)。
10個(gè)位點(diǎn)在4個(gè)群體中的近交系數(shù)is范圍為–0.080~0.827。在七里海河蟹群體中,位點(diǎn)SSR1240、SSR1053和SSR709的近交系數(shù)為負(fù)值;在“光合1號(hào)”群體中,位點(diǎn)SSR1289、SSR1126和SSR709的近交系數(shù)為負(fù)值;在自然群體中,位點(diǎn)SSR709的近交系數(shù)為負(fù)值,其余均為正值。經(jīng)過Bonferroni校正后,10個(gè)位點(diǎn)在4個(gè)群體中,有13個(gè)顯著偏離哈迪-溫伯格平衡(<0.05)。其中,“長(zhǎng)江1號(hào)”中偏離HWE平衡的位點(diǎn)最多,為5個(gè),七里海河蟹和海河自然群體均有3個(gè)位點(diǎn)出現(xiàn)顯著偏離,“光合1號(hào)”偏離位點(diǎn)最少,為2個(gè)。
4個(gè)群體間的st值存在顯著差異(<0.05),結(jié)果如表4所示,七里海河蟹群體與“長(zhǎng)江1號(hào)”群體、“光合1號(hào)”群體的遺傳分化程度較高,達(dá)到中等水平(st>0.05);七里海河蟹群體與自然群體、自然群體與“長(zhǎng)江1號(hào)”群體、自然群體與“光合1號(hào)”群體、“長(zhǎng)江1號(hào)”群體與“光合1號(hào)”群體的遺傳分化程度處于低水平(st<0.05)。分別對(duì)每個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行等位基因頻率的群體間兩兩比較,60個(gè)比較中有28個(gè)差異顯著(<0.05) (表6)。
表3 4個(gè)中華絨螯蟹群體10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳多樣性
Tab.3 Genetic diversities of ten microsatellite loci in four populations of E. sinensis
注:*表示顯著偏離哈迪-溫伯格平衡(<0.05)
Note: * means significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (<0.05)
4個(gè)群體兩兩間的遺傳相似度范圍為0.7702~ 0.9401,遺傳距離(c)范圍為0.0617~0.2611,群體間遺傳距離越大的遺傳相似性越低(表5)?;贜ei’s遺傳距離構(gòu)建的群體UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,自然群體與“光合1號(hào)”聚為一支后,再與“長(zhǎng)江1號(hào)”聚為一支,而七里海河蟹群體單獨(dú)聚為一支(圖1)。
表4 群體兩兩間的遺傳分化指數(shù)(st)
Tab.4 Genetic differentiation index (Fst) between any two populations
注:*表示差異顯著(<0.05),下同
Note: * means significant difference (<0.05). The same as below
表5 4個(gè)中華絨螯蟹群體的遺傳相似度和遺傳距離
Tab.5 Nei’s genetic identity and genetic distance of the four populations of E. sinensis
注:對(duì)角線以上為遺傳相似度;對(duì)角線以下為遺傳距離
Note: The diagonal above was genetic identity; the diagonal below was genetic distance
圖1 基于Nei’s (1978)遺傳距離構(gòu)建的4個(gè)中華絨螯蟹群體的UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹
表6 10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)等位基因頻率的群體間兩兩比較
Tab.6 Comparisons of allele frequency in ten microsatellite loci between any two populations
續(xù)表6
遺傳多樣性是生物多樣性的基礎(chǔ),對(duì)物種的生存、繁衍和進(jìn)化至關(guān)重要(張榮良等, 2016)。一個(gè)遺傳多樣性豐富的種群,往往具有較高的適應(yīng)能力、生存能力和進(jìn)化潛能,在育種和遺傳改良上也更具有潛力,所以對(duì)遺傳多樣性的準(zhǔn)確評(píng)估是生物多樣性保護(hù)和可持續(xù)利用的基礎(chǔ)和前提。人工選擇育種就是在保持選育群體具有一定遺傳多樣性的基礎(chǔ)上,篩選獲得具有目標(biāo)性狀的選育新品種或新品系(張榮良等, 2016)。大量相關(guān)研究表明,養(yǎng)殖群體因人工選擇作用和瓶頸效應(yīng)等原因,其遺傳多樣性往往低于未經(jīng)選育的野生群體。張輝等(2010)和王軍等(2018)分別應(yīng)用mtDNA控制區(qū)序列和微衛(wèi)星標(biāo)記分析了中國(guó)對(duì)蝦()養(yǎng)殖群體與野生群體,顯示野生群體的基因多樣性高于養(yǎng)殖群體。肖起珍等(2017)利用29對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)中華絨螯蟹長(zhǎng)江水系野生和人工繁育大眼幼體的遺傳多樣性進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)野生群體的平均等位基因數(shù)、平均有效等位基因數(shù)和平均期望雜合度均高于人工繁育群體,香農(nóng)信息指數(shù)體現(xiàn)的群體遺傳多樣性野生群體也高于人工繁育群體。在魚類群體遺傳研究中也獲得了相似的結(jié)果,曾慶凱等(2017)應(yīng)用SSR標(biāo)記比較翹嘴鱖()湖南洞庭湖野生群體和廣東、安徽養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性,分析結(jié)果也顯示野生群體的遺傳多樣性略高于養(yǎng)殖群體。
遺傳多樣性主要用多態(tài)信息含量(PIC)和雜合度()來評(píng)估。其中,多態(tài)信息含量用于評(píng)價(jià)標(biāo)志基因(或標(biāo)志序列)的多態(tài)性大小。PIC>0.5的位點(diǎn)為高多態(tài)性位點(diǎn),0.25 由于連續(xù)多代人工選育,不引進(jìn)外來親本,所以造成了中華絨螯蟹選育群體遺傳多樣性的降低,使選育群體的遺傳多樣性略低于自然群體。但在人工選育過程中,增加有效繁育親本數(shù)量,嚴(yán)格控制選育群體的近交衰退,在一定程度上保證了選育群體的遺傳穩(wěn)定性,使中華絨螯蟹的人工選育群體經(jīng)過累代繁殖多年之后,依然保持著較高的遺傳多樣性。 遺傳分化指數(shù)(st)和遺傳距離(c)是衡量群體間遺傳差異的重要參數(shù)。Wright (1978)認(rèn)為,st值在0~0.05之間,說明群體間的遺傳差異很?。籹t值在0.05~0.15之間,說明群體間發(fā)生了中等水平的遺傳分化;在0.15~0.25之間,說明群體間存在較大的遺傳差異;當(dāng)st>0.25時(shí),說明群體間高度遺傳分化。本研究中,4個(gè)群體兩兩間比較,七里海河蟹群體與“長(zhǎng)江1號(hào)”群體、“光合1號(hào)”群體間的遺傳分化達(dá)到中等水平(st>0.05);其他比較組間的遺傳分化程度處于低水平(st<0.05)。兩兩群體間的Nei’s無偏遺傳距離為0.0617~0.2611,群體間遺傳距離較小。這與肖起珍等(2017)對(duì)長(zhǎng)江水系中華絨螯蟹野生與人工繁殖群體遺傳研究的結(jié)果相似。 群體系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,自然群體和“光合1號(hào)”聚為一支后,再與“長(zhǎng)江1號(hào)”聚為一支,而七里海河蟹群體單獨(dú)聚為一支。這可能是由天津地區(qū)中華絨螯蟹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀導(dǎo)致的。自20世紀(jì)中后期,天津海河入??诮ㄔO(shè)了防潮閘后,海河流域的中華絨螯蟹自然資源逐年減少,同時(shí)養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)迅速發(fā)展。但天津地區(qū)遺傳育種研究起步晚,育種技術(shù)相對(duì)落后,本地人工繁育蟹苗量少,遠(yuǎn)遠(yuǎn)無法滿足當(dāng)?shù)仞B(yǎng)殖生產(chǎn)需求。所以,養(yǎng)殖企業(yè)大量引進(jìn)遼河、長(zhǎng)江等其他水系苗種,以“光合1號(hào)”和“長(zhǎng)江1號(hào)”居多。在養(yǎng)殖生產(chǎn)過程中,由于養(yǎng)殖群體個(gè)體逃逸,可能會(huì)與自然群體發(fā)生基因交流,從而導(dǎo)致了異地引進(jìn)群體與自然群體間的遺傳距離變小,打破了各水系中華絨螯蟹的原始分布格局。 本研究以中華絨螯蟹3個(gè)水系人工選育群體和海河流域自然群體為對(duì)象,應(yīng)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)分析各群體的遺傳多樣性和群體間的遺傳分化。結(jié)果表明,4個(gè)群體的遺傳分化程度處于中低水平,3個(gè)人工選育群體的遺傳多樣性與自然群體相比有一定程度的降低,但仍保持在較高水平上,具有較大的選育潛力。 Botstein D, White RL, Skolnick M,. Construction of genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 1980, 32: 314–331 Dieringer D, Schl?tterer C. Microsatellite analyser (MSA): A platform independent analysis tool for large microsatellite data sets. Molecular Ecology Notes, 2003, 3(1): 167–169 Du HM. Brief discussion of Qilihai crab ecological cultivation. Rural Science and Technology, 2014(3): 29 [杜紅梅. 七里海河蟹生態(tài)養(yǎng)殖淺談. 鄉(xiāng)村科技, 2014(3): 29] Goudet J. FSTAT, a program to estimate and test gene diversities and fixation indices (version 2.9.3). 2001, Available from http://www.unil.ch/izea/softwares/fstat.html Hardy OJ, Vekemans X. SPAGeDi: A versatile computer program toanalyze spatial genetic structure at the individual or population levels. Molecular Ecology Notes, 2002, 2(4): 618–620 Kimura M, Crow JF. The number of alleles that can be maintained in a finite population. Genetics, 1964, 49(4): 725–738 Li B. Ecology. Beijing: Higher Education Press, 2000, 338–341 [李博. 生態(tài)學(xué). 北京: 高等教育出版社, 2000, 338–341] Li JJ, Geng XY, Chen LM,. Identification and characterizationof thirty novel microsatellite DNA markers from the Chinesemitten crabexpressed sequence tags. BMC Research Notes, 2016, 105(9): 1–5 Li JJ, Geng XY, Dong XW,. Evaluation of visible implant elastomer tags in Chinese mitten crab. Marine Fisheries, 2016, 38(4): 400–405 [李晶晶, 耿緒云, 董學(xué)旺, 等. 中華絨螯蟹可視熒光標(biāo)記應(yīng)用研究. 海洋漁業(yè), 2016, 38(4): 400–405] Ma HT, Chang YM, Yu DM,. Microsatellite variations among four populations of. Zoological Research, 2007, 28(2): 126–133 Nei M. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 1978, 89(3): 583–590 Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University Press, 1987 Qin Y, Shi G, Sun Y. Evaluation of genetic diversity inusing SSR markers. Genetics and Molecular Research, 2013, 12(4): 5833–5841 Raymond M, Rousset F. Population genetics software for exact tests and ecumenicism. Journal of Heredity, 1995, 86(3): 248–249 Rice WR. Analyzing tables of statistical tests. Evolution, 1989, 43(1): 223–225 Takezaki N, Nei M. Genetic distances and reconstruction of phylogenetic trees from microsatellite DNA. Genetics, 1996, 144(1): 389–399 Tamura K, Peterson D, Peterson N,. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution, 2011, 28(10): 2731–2739 Wang CH, Li SF. Advances in studies on germplasm in Chinese mitten crab,. Journal of Fishery Sciences of China, 2002, 9(1): 82–86 [王成輝, 李思發(fā). 中華絨螯蟹種質(zhì)研究進(jìn)展. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué), 2002, 9(1): 82–86] Wang J, Wang QY, Kong J,. SSR Analysis on genetic diversity in breeding and wild populations of. Progress in Fishery Sciences, 2018, 39(2): 104– 111 [王軍, 王清印, 孔杰, 等. 中國(guó)明對(duì)蝦人工選育群體與野生群體遺傳多樣性的SSR分析. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展, 2018, 39(2): 104–111] Weir BS, Cockerham CC. Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution, 1984, 38(6): 1358–1370 Wright S. Evolution and the genetics of population variability within and among natural population. University of Chicago Press, Chicago, 1978, 121–124 Xiao QZ, Liu Q, Wu XG,. Genetic diversity analysis of wild and cultured megalopa population offrom Yangtze River. Genomics and Applied Biology, 2017, 36(5): 1935–1945 [肖起珍, 劉青, 吳旭干, 等. 長(zhǎng)江水系中華絨螯蟹野生和人工繁殖大眼幼體的遺傳多樣性分析. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué), 2017, 36(5): 1935–1945] Zeng QK, Sun CF, Dong JJ,. Analysis of genetic diversity in three different populations of. Genomics and Applied Biology, 2017, 36(8): 3241–3250 [曾慶凱, 孫成飛, 董浚鍵, 等. 翹嘴鱖3個(gè)不同群體的遺傳多樣性分析. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué), 2017, 36(8): 3241–3250] Zhang H, Gao TX, Zhuang ZM,. Comparative analysis of the mitochondrial control region between the cultured and wild population of Chinese shrimp (). Journal of Fisheries of China, 2010, 34(8): 1149–1155 [張輝, 高天翔, 莊志猛, 等. 中國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖群體與野生群體線粒體控制區(qū)序列的比較. 水產(chǎn)學(xué)報(bào), 2010, 34(8): 1149–1155] Zhang RL, Wang WJ, Feng YW,. Assessment of genetic variability and microsatellite analysis of Pacific oyster () after artificial selection of the shell width. Progress in Fishery Sciences, 2016, 37(4): 90–96 [張榮良, 王衛(wèi)軍, 馮艷微, 等. 長(zhǎng)牡蠣()殼寬快速生長(zhǎng)選育群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的微衛(wèi)星標(biāo)記分析. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展, 2016, 37(4): 90–96] Zhu GQ. Integration and application of key technologies for ecological cultivation of Qilihai crab. Tianjin Fisheries, 2012(1): 35–39 [朱廣奇. 七里海河蟹生態(tài)養(yǎng)殖關(guān)鍵技術(shù)集成與應(yīng)用. 天津水產(chǎn), 2012(1): 35–39] Genetic Diversity Analysis of Wild and Cultured Population offrom Different Water Systems LI Jingjing1,2, CHEN Limei3, GENG Xuyun2, DONG Xuewang2, SUN Jinsheng1① (1. College of Life Sciences, Tianjin Normal University, Tianjin 300387; 2. Tianjin Diseases Prevention and Control Center of Aquatic Animals, Tianjin 300221; 3. Tianjin Key Laboratory of Aqua-Ecology and Aquaculture, Fisheries College, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384) The Chinese mitten crabis one of the most economically important aquaculture species in China due to its taste and nutritional value. In this study, the genetic status of both wild and cultivated stocks ofwas assessed using simple sequence repeat (SSR) markers. Ten microsatellite markers reported in previous studies were selected to estimate the level of genetic diversity within one Haihe natural population and three selected artificial populations (Yangtze No.1, Guanghe No.1, and Qilihai crab) and to compare the degree of genetic differentiation among them. Unique PCR products and high levels of polymorphism were observed for all loci. For the four populations of, the number of alleles per locus ranged from 3 to 17, with a mean allele number of 8.5 to 9.7. The mean observed heterozygosities ranged from 0.566 to 0.661, while the mean expected heterozygosities ranged from 0.720 to 0.745. Additionally, the mean polymorphism information content ranged from 0.687 to 0.716. Furthermore, the inbreeding coefficient (F) ranged from-0.080 to 0.827, and there were 13 cases that significantly deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium (<0.05) among the 40 population-locus cases (4 populations × 10 loci). The results of the microsatellite survey indicated that the genetic diversity of the three artificially selected populations was slightly lower than that of the natural population, but still maintained at a high level for further breeding. The analysis of genetic differentiation showed thatFranged from 0.015 to 0.075, genetic similarity ranged from 0.7702 to 0.9401, and genetic distance ranged from 0.0617 to 0.2611. UPGMA phylogenetic analysis divided these populations into two groups. Natural population and Guanghe No.1 stocks were allocated to the same cluster, and the Qilihai crab was allocated to another cluster. In conclusion, the four populations ofpossessed high genetic diversity but low to moderate levels of genetic differentiation. The information on the genetic variation and differentiation obtained in this study will provide a theoretical basis for further breeding and utilization of germplasm resources of. ; Genetic diversity; Genetic differentiation; Microsatellite S968.2 A 2095-9869(2019)06-0105-09 10.19663/j.issn2095-9869.20180831002 http://www.yykxjz.cn/ 李晶晶, 陳麗梅, 耿緒云, 董學(xué)旺, 孫金生. 中華絨螯蟹野生群體和不同水系人工選育群體的遺傳多樣性分析. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展, 2019, 40(6): 105–113 Li JJ, Chen LM, Geng XY, Dong XW, Sun JS. Genetic diversity analysis of wild and cultured population offrom different water systems. Progress in Fishery Sciences, 2019, 40(6): 105–113 * 天津市財(cái)政資金項(xiàng)目(七里海優(yōu)質(zhì)河蟹繁養(yǎng)技術(shù)示范應(yīng)用)、天津市水產(chǎn)局科研推廣項(xiàng)目(J2013-21)、天津市水產(chǎn)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)(ITTFRS2017002)、天津市種業(yè)科技重大專項(xiàng)(15ZXZYNC00050)和天津市自然科學(xué)基金項(xiàng)目(16JCQNJC09500)共同資助 [This work was supported by Project of Tianjin Financial Funds (Demonstration and Application of Qilihai Crab Breeding and Culture Technology), Research and Extension Project of Tianjin Aquatic Products Bureau (J2013-21), Tianjin Aquaculture Research System (ITTFRS2017002), Major Project for Tianjin Seed Technology (15ZXZYNC00050), and Tianjin Natural Science Foundation (16JCQNJC09500)]. 李晶晶, E-mail: jingjingli206@163.com 孫金生,研究員,E-mail: jinshsun@163.com 2018-08-31, 2018-10-20 SUN Jinsheng, E-mail: jinshsun@163.com (編輯 馮小花)3.2 群體間的遺傳分化