姚曉雨,王 斌,劉宇婷,張 晶,劉 鑫,鄭永輝
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室- 美國(guó)密歇根州立大學(xué)天然免疫聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,黑龍江 哈爾濱 150069;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海 201100)
流感病毒是負(fù)鏈RNA 病毒,為正黏病毒科,流感病毒屬成員。目前按照核蛋白和基質(zhì)蛋白的抗原性,可以將流感病毒劃分為A、B、C、D 4 類(lèi)。其中A 型流感病毒具有較為廣泛的生物學(xué)宿主,可以感染人和多種動(dòng)物,給公共衛(wèi)生安全帶來(lái)了沉重的負(fù)擔(dān)[1-3]。流感病毒為I 型包膜病毒,其進(jìn)入靶細(xì)胞的過(guò)程需要膜糖蛋白的介導(dǎo),流感病毒介導(dǎo)膜融合的包膜蛋白為血凝素蛋白(HA)。HA 蛋白在自然條件下是以三聚體的形式存在于病毒包膜上,而每個(gè)HA 單體是由 HA1 和HA2 以二硫鍵連接組成的。HA 是流感病毒囊膜表面纖突結(jié)構(gòu)的主要成分,其可在動(dòng)物體內(nèi)誘導(dǎo)中和抗體的產(chǎn)生,是流感病毒毒力的重要決定因子[4-8]。流感病毒感染宿主細(xì)胞后,釋放的核糖核蛋白復(fù)合物(RNPs)利用宿主細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)合成機(jī)制,在細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄,繼而翻譯合成病毒自身蛋白。HA 蛋白作為一種高度糖基化的蛋白,其生物合成受到宿主細(xì)胞的嚴(yán)格調(diào)控。首先在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中形成糖基化的HA0 蛋白前體模式,隨后又在高爾基體中進(jìn)一步加工,后被宿主蛋白酶切割為HA1 和HA2 亞單位[5]。在HA 蛋白合成過(guò)程中,需進(jìn)行糖基化、?;确g后修飾以及宿主蛋白酶的切割,最終成熟的HA 被轉(zhuǎn)運(yùn)到膜上以用于子代病毒粒子的組裝[8]。
蛋白在宿主細(xì)胞內(nèi)的成熟是一個(gè)合成和降解的動(dòng)態(tài)平衡過(guò)程[9]。即使在正常生理?xiàng)l件下,細(xì)胞中有30 %新合成的蛋白由于錯(cuò)誤折疊而被降解,而當(dāng)細(xì)胞處于應(yīng)激狀態(tài)時(shí),被降解的蛋白數(shù)量可能會(huì)更多[9-11]。本實(shí)驗(yàn)室前期研究證明流感病毒HA 蛋白能夠引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,并通過(guò)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)蛋白降解(ERAD)途徑被蛋白酶體降解,同時(shí)發(fā)現(xiàn)部分HA 蛋白也被溶酶體降解[12],而其機(jī)制尚不明確。本研究嘗試闡明宿主細(xì)胞通過(guò)溶酶體途徑降解流感病毒HA 蛋白的機(jī)制,為開(kāi)發(fā)新的抗病毒手段奠定基礎(chǔ)。
1.1 主要實(shí)驗(yàn)材料 人胚胎腎細(xì)胞293T 及Atg3 基因敲除的293T 細(xì)胞、質(zhì)粒pXBP1u-Luc、pCS-H5HA由本實(shí)驗(yàn)室保存;GFP-250 質(zhì)粒由Elizabeth Sztul 惠贈(zèng);表達(dá)偽狂犬病毒(PRV) gE 蛋白的重組質(zhì)粒PRV-gE 及鼠源抗gE 蛋白單克隆抗體(MAb)由田志軍研究員惠贈(zèng);Lamp2a siRNA 購(gòu)自GenePharma 公司;聚乙烯亞胺轉(zhuǎn)染試劑(Polyethylenimine,PEI)購(gòu)自 Polyscience公司;轉(zhuǎn)染試劑LipofectamineRNAiMAX 購(gòu)自 Invitrogen 公司;二甲基亞砜(DMSO)、溶酶體抑制劑BafilomycinA1(Baf-A1)、自噬抑制劑 Wortmannin 購(gòu)自 Sigma 公司;抗 H5N1-HA 兔源多克隆抗體購(gòu)自SinoBiological;兔源抗Atg3 MAb購(gòu)自Cell Signaling Technology;兔源抗LC3 多克隆抗體、鼠源抗β-actin MAb 均購(gòu)自Sigma 公司;羊抗兔和羊抗鼠IgG-HRP 購(gòu)自Jackson 公司。
1.2 HA 蛋白過(guò)表達(dá)對(duì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激的檢測(cè) 細(xì)胞中錯(cuò)誤折疊的蛋白可誘發(fā)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,而細(xì)胞為了維持自身穩(wěn)態(tài)可通過(guò)特定通路將錯(cuò)誤折疊蛋白直接降解。當(dāng)細(xì)胞處于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激狀態(tài)時(shí),可啟動(dòng)X 盒結(jié)合蛋白1 (Xbp1)的剪切。為了驗(yàn)證HA 蛋白由于自身錯(cuò)誤折疊而引起的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,本研究檢測(cè)了細(xì)胞過(guò)表達(dá)HA 蛋白是否促進(jìn)Xbp1 的剪切。將野生型293T 細(xì)胞以4×105細(xì)胞/ 孔的密度接種于六孔細(xì)胞培養(yǎng)板,待細(xì)胞密度達(dá)到70 %~80 %時(shí),利用3 μg PEI 將 1 μg pCS-H5HA 與 1 μg pXBP1u-Luc 按照常規(guī)方法共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,同時(shí)將空質(zhì)粒與pXBP1u-Luc 共轉(zhuǎn)染作為陰性對(duì)照。轉(zhuǎn)染后4 h 更換新鮮培養(yǎng)液,轉(zhuǎn)染后48 h,收集細(xì)胞,利用RIPA 裂解細(xì)胞,取25 μL 細(xì)胞裂解液置于檢測(cè)板中,再加入25 μL螢光素酶檢測(cè)底物,利用多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)熒光素酶活性,其大小反應(yīng)了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激的相對(duì)強(qiáng)弱。
1.3 HA 蛋白溶酶體降解的驗(yàn)證 為了驗(yàn)證錯(cuò)誤折疊的HA 蛋白是否通過(guò)溶酶體通路降解,按照前述方法將2 μg pCS-H5HA 轉(zhuǎn)染至 293T 細(xì)胞中,轉(zhuǎn)染后24 h,向細(xì)胞中添加溶酶體抑制劑Baf-A1 (終濃度為100 nmol/L),以DMSO 處理細(xì)胞作為陰性對(duì)照。抑制劑處理細(xì)胞24 h 后,收集細(xì)胞并裂解,蛋白樣品經(jīng)SDS-PAGE 檢測(cè)后轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜,5 %脫脂乳封閉 30 min,分別以 1∶2 000 稀釋的抗H5N1-HA 兔源多克隆抗體和1∶2 000 稀釋的鼠源抗β-actin MAb 作為一抗,羊抗兔和羊抗鼠IgG-HRP(1 ∶5 000)為二抗,western blot檢測(cè)HA蛋白及β-actin 的表達(dá),蛋白的相對(duì)表達(dá)量經(jīng)由ImagJ 軟件計(jì)算分析。
1.4 Western blot 檢測(cè)分子伴侶介導(dǎo)的自噬(CMA)情況 溶酶體相關(guān)膜蛋白2a (Lamp2a)是溶酶體膜上的受體,是CMA 途徑的主要功能性分子[13]。本研究通過(guò)檢測(cè)抑制Lamp2a 蛋白表達(dá)的293T 細(xì)胞中HA 蛋白的表達(dá)來(lái)檢測(cè)HA 蛋白是否通過(guò)CMA 途徑降解。首先對(duì)購(gòu)自GenePharma 公司的針對(duì)Lamp2a基因的干擾RNA 進(jìn)行效率驗(yàn)證。RNA 序列如表1所示。
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利用LipofectamineRNAiMAX 轉(zhuǎn)染試劑,將40 pmol 各siRNA 轉(zhuǎn)染至6 孔板中的生長(zhǎng)狀態(tài)良好的293T 細(xì)胞中,轉(zhuǎn)染后 24 h 收集細(xì)胞,以 1∶1 000 稀釋的兔源抗Lamp2a 多克隆抗體為一抗,羊抗兔IgG-HRP (1∶5 000)為二抗,western blot 檢測(cè) Lamp2a的表達(dá)水平,篩選出針對(duì)于Lamp2a 干擾效率最高的siRNA 用于后續(xù)試驗(yàn)。將相應(yīng)的Lamp2a 特異性siRNA 及對(duì)照組 siRNA 轉(zhuǎn)染 293T 細(xì)胞后 24 h,將細(xì)胞再次轉(zhuǎn)染1 μg pCS-H5HA,24 h 后收集細(xì)胞,以H5N1 兔源多克隆抗體(1∶2 000)為一抗,羊抗兔IgG-HRP (1∶5 000)為二抗,western blot 檢測(cè) HA 蛋白,同樣以上述抗體濃度檢測(cè)Lamp2a 的表達(dá),分析CMA 途徑阻斷后,HA 蛋白的表達(dá)變化。
1.5 ELISA 檢測(cè)內(nèi)吞途徑是否參與HA 蛋白的降解為驗(yàn)證內(nèi)吞途徑是否參與HA 蛋白的降解,進(jìn)行了溫度依賴的蛋白內(nèi)化試驗(yàn)[14]。HA 蛋白為囊膜糖蛋白,其在宿主細(xì)胞內(nèi)合成成熟后,被轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞膜表面,如果細(xì)胞表面的HA 蛋白經(jīng)過(guò)內(nèi)吞途徑被降解,那么當(dāng)?shù)鞍椎募?xì)胞內(nèi)吞被激活以后,細(xì)胞表面HA 蛋白的數(shù)量則相應(yīng)減少。本試驗(yàn)按照3×104細(xì)胞/ 孔的密度將293T 細(xì)胞鋪于多聚賴氨酸處理的96孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,pCS-H5HA 轉(zhuǎn)染2 個(gè)96 孔板,標(biāo)記為 1 號(hào)板和 2 號(hào)板,PRV-gE 轉(zhuǎn)染 2 個(gè) 96 孔板,標(biāo)記為3 號(hào)板和4 號(hào)板,4 個(gè)96 孔板每孔轉(zhuǎn)染0.02 μg質(zhì)粒。轉(zhuǎn)染24 h 后,輕輕棄掉細(xì)胞培養(yǎng)液,抗體使用5 %的BSA 稀釋,1 號(hào)板和2 號(hào)板以抗H5N1-HA兔源多克隆抗體(1∶2 000)孵育,3 號(hào)板和4 號(hào)板孵育鼠源抗 gE 蛋白 MAb (1∶1 000),每孔加入 100 μL稀釋后的抗體,4 ℃孵育1 h 后,1 號(hào)板和3 號(hào)板以4 %的多聚甲醛室溫固定30 min,2 號(hào)板和4 號(hào)板重新加入100 μL Opti-MEM 板置于37 ℃培養(yǎng) 45 min,以相同方法固定,PBS 洗滌4 個(gè)96 孔板兩次,加入羊抗鼠或羊抗兔IgG-HRP (1∶5 000)為二抗,室溫孵育1 h 后,加入TMB 和終止液3 mol/L 硫酸終止反應(yīng),進(jìn)行ELISA 檢測(cè),采用酶標(biāo)儀測(cè)定OD450nm值,檢測(cè)低溫條件下(1 號(hào)板和3 號(hào)板)和當(dāng)細(xì)胞重新置于37 ℃后(2 號(hào)板和4 號(hào)板)細(xì)胞膜表面的HA 蛋白。
1.6 自噬通路降解 HA 蛋白的檢測(cè) 將 2 μg pCS-H5HA 轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后24 h,向細(xì)胞中添加自噬抑制劑Wortmannin (終濃度為100 nmol/L),以DMSO 處理細(xì)胞作為陰性對(duì)照,轉(zhuǎn)染后48 h,收集細(xì)胞,提取細(xì)胞可溶性總蛋白,以抗H5N1-HA兔源多克隆抗體(1∶2 000)為一抗,羊抗兔IgG-HRP(1∶5 000)為二抗,檢測(cè)HA 蛋白的表達(dá)。同時(shí),將2 μg pCS-H5HA 分別轉(zhuǎn)染 293T 細(xì)胞 和 Atg3 敲除293T 細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后48 h,收集細(xì)胞,提取細(xì)胞可溶性總蛋白,以上述同樣方法檢測(cè)HA 蛋白,分析巨自噬途徑被抑制后HA 蛋白的表達(dá)變化。
1.7 溶酶體降解HA 蛋白形成的凝集結(jié)構(gòu)的檢測(cè)將 1 μg pCS-H5HA 和 1 μg 重組質(zhì)粒 GFP-250 共轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞[15],轉(zhuǎn)染后20 h 向細(xì)胞加入終濃度為100 nmol/L 的Baf-A1,48 h 后利用熒光顯微鏡觀察綠色熒光,即為凝集結(jié)構(gòu)。每個(gè)樣品隨機(jī)選取不同區(qū)域,拍攝15 張圖片,利用軟件ImageJ 定量分析綠色熒光。
1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 所有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)在Graphad prism 6.0 軟件中進(jìn)行配對(duì)雙尾t 檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,其中每組平均值的標(biāo)準(zhǔn)誤差(SD)在圖例中均以誤差線表示,其中*:p<0.05,表示差異顯著;**:p<0.01、***:p<0.001、****:p<0.0001,表示差異極顯著;ns:p≥0.05,表示無(wú)顯著性差異。
2.1 HA 蛋白誘發(fā)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激的檢測(cè)結(jié)果 利用pCS-H5HA 與pXBP1u-Luc 按照常規(guī)方法共轉(zhuǎn)染細(xì)胞后加入螢光素酶檢測(cè)底物,利用多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)熒光素酶活性,結(jié)果顯示在293T 細(xì)胞中,與空載體轉(zhuǎn)染組相比,轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pCS-H5HA 的細(xì)胞的熒光素酶活性明顯升高(圖1),表明過(guò)表達(dá)HA 蛋白可顯著增強(qiáng)Xbp1 的剪切,提示部分HA 蛋白由于錯(cuò)誤折疊而誘發(fā)了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激。
2.2 HA 蛋白溶酶體降解途徑的檢測(cè)結(jié)果 將過(guò)表達(dá)HA 蛋白的細(xì)胞利用溶酶體降解抑制劑Baf-A1 處理,檢測(cè)HA 的表達(dá)水平是否恢復(fù)。Western blot 結(jié)果顯示,當(dāng)加入溶酶體抑制劑Baf-A1 后,HA 蛋白表達(dá)量與DMSO 組相比極顯著增加(p<0.001) (圖2),表明Baf-A1 能夠顯著上調(diào)HA 的表達(dá)水平,提示部分HA 經(jīng)由溶酶體途徑降解。
2.3 CMA 途徑降解HA 蛋白的檢測(cè)結(jié)果 利用western blot 檢測(cè)3 條siRNA 干擾效率,結(jié)果顯示編號(hào)為 1283 的 siRNA 的干擾效果最好(圖3A、3B)。將 293T 細(xì)胞轉(zhuǎn)染 Lamp2a siRNA-1283 和 pCS-H5HA后,western blot 檢測(cè)HA 蛋白表達(dá)量,結(jié)果顯示干擾Lamp2a 表達(dá)細(xì)胞中的HA 蛋白的表達(dá)量與對(duì)照組細(xì)胞相比無(wú)明顯變化(p>0.05) (圖3C、3D),表明HA 蛋白并未通過(guò)CMA 途徑降解。
2.4 內(nèi)吞途徑降解HA 蛋白的檢測(cè)結(jié)果 利用ELISA 檢測(cè)不同時(shí)間點(diǎn)細(xì)胞膜表面HA 蛋白數(shù)量變化,以已被證實(shí)通過(guò)細(xì)胞內(nèi)吞途徑降解的PRV 囊膜糖蛋白gE[14]用作本試驗(yàn)的陽(yáng)性對(duì)照。結(jié)果顯示當(dāng)細(xì)胞被置于37 ℃45 min 后,細(xì)胞膜表面gE 蛋白與轉(zhuǎn)染起始點(diǎn)時(shí)相比明顯降低,而HA 蛋白則無(wú)明顯變化(圖4),表明內(nèi)吞途徑并未參與HA 蛋白降解。
2.5 自噬通路降解HA 蛋白的檢測(cè)結(jié)果 293T 細(xì)胞轉(zhuǎn)染pCS-H5HA 后,用自噬抑制劑Wortmannin 處理細(xì)胞,western blot 檢測(cè)HA 蛋白表達(dá)水平。結(jié)果顯示,當(dāng)自噬被抑制后(表現(xiàn)為L(zhǎng)C3-Ⅱ的降解受到抑制),HA 蛋白表達(dá)量并無(wú)明顯變化(圖5A、5B),表明自噬途徑并未參與HA 蛋白的降解。為了進(jìn)一步驗(yàn)證該結(jié)論,利用自噬相關(guān)分子Atg3 基因敲除細(xì)胞系,檢測(cè)HA 蛋白的表達(dá)。結(jié)果顯示HA 蛋白在Atg3 敲除細(xì)胞中的表達(dá)量與野生型293T 細(xì)胞相比并無(wú)明顯差異(圖5C、5D)。以上結(jié)果表明HA 蛋白并未通過(guò)自噬途徑降解。
2.6 凝集的HA 蛋白通過(guò)溶酶體降解檢測(cè)結(jié)果pCS-H5HA 與 GFP-250 共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,BAF-A1 處理細(xì)胞后,觀察細(xì)胞中綠色熒光,并做定量分析。結(jié)果顯示,HA 蛋白在293T 細(xì)胞中可形成凝集結(jié)構(gòu),且溶酶體抑制劑Baf-A1 可增加細(xì)胞凝集HA 的數(shù)量(圖6)。表明HA 蛋白在細(xì)胞內(nèi)表達(dá)時(shí),部分可溶的HA 蛋白首先發(fā)生凝集,隨后凝集的HA 通過(guò)溶酶體降解。
A 型流感病毒是自然界中最常見(jiàn)的流感病毒,可以造成世界范圍內(nèi)的大流行。目前應(yīng)對(duì)流感病毒感染的方法主要是疫苗接種和藥物治療。商品化的抗流感病毒藥物主要有NA 抑制劑藥物奧司他韋和扎那米韋以及M2 抑制劑藥物金剛烷胺和金剛乙胺[16],但這些抗病毒藥物會(huì)促使產(chǎn)生出大量耐藥病毒株。因此,有必要開(kāi)發(fā)新的抗病毒手段。HA 蛋白是流感病毒啟動(dòng)感染、致病性和傳染性的主要決定組分[5-6,8]。HA 蛋白的成熟對(duì)于流感病毒的感染有著至關(guān)重要的作用[7]。糖蛋白的加工成熟是一個(gè)易于出錯(cuò)的過(guò)程,而折疊錯(cuò)誤的蛋白質(zhì)不具備正常的生物學(xué)功能[9],其在細(xì)胞中不斷累積會(huì)對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生一定的刺激和毒性。細(xì)胞為維持穩(wěn)態(tài)則會(huì)利用蛋白降解通路降解錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)[11]。
為了探究HA 蛋白通過(guò)溶酶體降解的具體機(jī)制,本研究首先利用溶酶體抑制劑Baf-A1 處理表達(dá)HA蛋白的細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)HA 蛋白的確可通過(guò)溶酶體途徑降解。通過(guò)對(duì)溶酶體不同降解途徑的分析,發(fā)現(xiàn)HA 蛋白并未通過(guò)CMA、內(nèi)吞和自噬途徑降解,而是HA 蛋白在其表達(dá)過(guò)程中,不正確折疊的HA 不斷聚集,最終形成了一種疏水的致密性結(jié)構(gòu),即為凝集的HA,該凝集結(jié)構(gòu)可被溶酶體所降解。研究表明多種病毒感染后均可以誘導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生凝集結(jié)構(gòu),凝集結(jié)構(gòu)對(duì)于病毒的組裝以及病毒蛋白的降解等方面均發(fā)揮著作用[17-19]。有研究報(bào)道流感病毒可以劫持凝集結(jié)構(gòu)的形成機(jī)制從而利于自身病毒的侵入[20]。本研究發(fā)現(xiàn)HA 蛋白能夠形成凝集結(jié)構(gòu)并通過(guò)溶酶體降解,這有可能是宿主細(xì)胞為了對(duì)抗流感病毒,通過(guò)降解病毒相關(guān)蛋白以抑制病毒的復(fù)制,此推測(cè)需要進(jìn)一步的深入研究。本研究雖然證明部分HA 蛋白通過(guò)溶酶體降解,但對(duì)于其具體機(jī)制,特別是HA 蛋白形成凝集結(jié)構(gòu)后是如何被溶酶體所降解的,目前仍不清楚,而在這個(gè)過(guò)程中宿主細(xì)胞內(nèi)又有哪些分子參與其中,尚需進(jìn)一步探究。本研究結(jié)果為新型抗流感病毒藥物的研發(fā)奠定了基礎(chǔ)。