紅蘋果,人人愛??墒?,蘋果皮為什么能進化出誘人的紅色,是個有趣而復(fù)雜的問題。
近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所蘋果資源與育種創(chuàng)新團隊在完成了蘋果花藥培育純系高質(zhì)量基因組測序的基礎(chǔ)上,揭示了反轉(zhuǎn)座子控制紅蘋果著色的分子機制。
“栽培蘋果通常是二倍體,基因組高度雜合且經(jīng)過全基因組復(fù)制,致使常規(guī)品種基因組測序組裝困難?!痹撗芯繄F隊成員張利義表示,利用花藥培養(yǎng)可以獲得純系,從而降低組裝難度,獲得更高質(zhì)量的基因組測序結(jié)果。
以往蘋果基因組測序都是以“金冠”品種為材料,這次重測序,研究人員以“寒富”蘋果花藥培育純系HFTH1為材料,基于第三代測序技術(shù)進行了全基因組測序,組裝了目前世界上最完整的蘋果基因組。通過與已發(fā)表的金冠基因組比較,研究人員獲得了大量的結(jié)構(gòu)變異,為理解不同基因型蘋果遺傳多樣性、分子標記的開發(fā)和分子育種提供了重要信息。
另外,結(jié)合148份蘋果自然群體和1個雜交組合分離群體驗證,研究人員發(fā)現(xiàn),一個Gypsy-like反轉(zhuǎn)座子充當(dāng)增強子控制著蘋果著色。這個增強子被命名為redTE?!安灰字钠贩N是由于缺少這一增強子,不能有效合成花青素?!睆埨x說。研究團隊進一步推斷,一系列紅色芽變品種是這個轉(zhuǎn)座子與其調(diào)控的基因,同周圍環(huán)境綜合作用引起的表觀遺傳結(jié)果,這無疑增進和豐富了科學(xué)家對蘋果著色的理解和認識。更加重要的是,基于這一反轉(zhuǎn)座子開發(fā)的分子標記,能精準地進行果色預(yù)先選擇。(據(jù)《中國科學(xué)報》)