楊星鵬,張志斌*,朱 篤,2*
1江西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,江西省亞熱帶植物資源保護(hù)與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南昌 330022;2江西科技師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,江西省生物加工過程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南昌 330013
放線菌所產(chǎn)抗生素是天然活性產(chǎn)物的主要來源,在已報(bào)道的10 000多個(gè)天然活性化合物中有75% 產(chǎn)自鏈霉菌屬,其余大約25%來自稀有放線菌[1],從小單胞菌屬發(fā)現(xiàn)天然活性物質(zhì)占38.1%,位居稀有放線菌的首位[2]。小單孢菌是革蘭氏陽性稀有放線菌[3],截至2016年已報(bào)道了61個(gè)種和7個(gè)亞種[4],其所產(chǎn)次級(jí)代謝產(chǎn)物種類多樣,不僅能產(chǎn)生如鏈霉菌產(chǎn)生的氨基糖苷類、大環(huán)內(nèi)酯類等化學(xué)結(jié)構(gòu)類型的抗生素,還能產(chǎn)生抗腫瘤等高細(xì)胞毒活性的烯二炔類獨(dú)特化學(xué)結(jié)構(gòu)的生物活性物質(zhì)[5-8]。已從小單胞菌中分離到的許多著名抗生素如慶大霉素(Gentamicins)[9]、西索米星(Sisomicin)[10]和羅沙米星(Rosamicin)[11]等已被作為藥物廣泛使用。因此,利用小單孢菌并從中尋找和發(fā)現(xiàn)新的抗生素和其他生物活性資源對(duì)于拓寬我國(guó)天然化合物藥源問題具有重要意義。
近年來隨著產(chǎn)物分離技術(shù)和藥物篩選技術(shù)的不斷提高,一些結(jié)構(gòu)新穎且活性良好的化合物相繼從小單胞菌代謝產(chǎn)物中分離得到,它們表現(xiàn)出抑菌、抗腫瘤、免疫抑制劑等方面的生物活性[12,13]。雖然已有對(duì)小單孢菌在新型抗菌藥物及抗腫瘤抗生素方面的研究,但有關(guān)小單孢菌活性代謝產(chǎn)物研究綜述報(bào)導(dǎo)不多[14]。為了更全面的了解小單胞菌屬代謝產(chǎn)物研究概況,更好地開發(fā)和利用小單胞菌天然產(chǎn)物資源,本文對(duì)2015年以來從小單胞菌中分離得到的次級(jí)代謝產(chǎn)物結(jié)構(gòu)特征及其生物活性進(jìn)行了綜述。
大環(huán)內(nèi)酯類化合物是一類具有大內(nèi)酯環(huán)的化合物,該類化合物具有很好的抑菌、抗腫瘤和抗寄生蟲等生物活性,在抗生素藥物方面有重要應(yīng)用[15,16]。近幾年從小單胞菌中分離到22個(gè)大環(huán)內(nèi)酯類化合物,其中14個(gè)新化合物,從小單孢菌中發(fā)現(xiàn)新大環(huán)內(nèi)酯類化合物比例較高。
Chun等[17]從海洋MicromonosporaharpaliSCSIO GJ089代謝產(chǎn)物中分離到大環(huán)內(nèi)酯類化合物22-dehydroxymethyl-kijanolide(1)、 8-hydroxy-22-dehydroxymethyl-kijanolid(2)、Microsporanates A-F(3-8)、Tetrocarcin P(9)、Tetrocarcin A(10),B(11)和 AC6H(12),并通過核磁共振(NMR)和質(zhì)譜(MS)技術(shù)鑒定了它們的結(jié)構(gòu),其中1-9為新化合物。Gong等[18]從另一株海洋MicromonosporacarbonaceaLS276的代謝產(chǎn)物中也分離到化合物10、12,以及5個(gè)新的大環(huán)內(nèi)酯類化合物Tetrocarcin Q(13)、Tetrocarcin N(14)、Tetrocarcin H(15)、Arisostatin A(16)和Tetrocarcin F1(17)。上述研究結(jié)果表明,從海洋來源的小單孢菌中分離代謝產(chǎn)物具有出新率高的特點(diǎn)。
Maklamicin (18)是由Micromonosporasp.NBRC 110955產(chǎn)生的一個(gè)抗生素,其生物合成和聚酮合酶有關(guān),Daduang等[19]在研究聚酮合酶作用相關(guān)的基因makC2時(shí)發(fā)現(xiàn)一個(gè)新化合物29-Deoxymaklamicin(19)。后續(xù)實(shí)驗(yàn)證明化合物19是18生物合成途徑中的中間體,兩者結(jié)構(gòu)的區(qū)別是化合物19的29號(hào)位上的CH2OH變成了甲基。
2017年,Ochoa等[20]從鼠海豚(Harborporpoise)腸道附生菌MicromonosporaauratinigraRLFI1036F的代謝產(chǎn)物中分離到大環(huán)內(nèi)酯類化合物phocoenamicin(20)。2018年,Perez-Bonilla等[21]從加那利群島海洋沉積物來源的Micromonosporasp.CA-214671中也分離到化合物20,以及兩個(gè)新大環(huán)內(nèi)酯類化合物Phocoenamicin B(21)和C(22)。
大環(huán)酰胺化合物結(jié)構(gòu)上都具有酰胺鍵,而且結(jié)構(gòu)與多肽相似,因其有很好的生物活性,在生物醫(yī)藥領(lǐng)域受到關(guān)注和重視。大環(huán)內(nèi)酰胺類化合物在真菌、鏈霉菌次級(jí)代謝產(chǎn)物中分布廣泛,而從小單孢菌中分離報(bào)道不多,本文總結(jié)了近幾年從小單胞菌中分離的大環(huán)內(nèi)酰胺類化合物,在已報(bào)道的9個(gè)化合物中經(jīng)鑒定有8個(gè)為新化合物。
圖1 化合物1~22的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.1 The chemical structures of compounds 1-22
2015年,Christopher等[22]從海洋Micromonosporasp.RL09-050-HVF-A中分離得到3個(gè)新的大環(huán)酰胺類化合物L(fēng)obosamides A-C(23~25)。Hoshino等[23]將MicromonosporawenchangensisHEK-797和細(xì)菌TsukamurellapulmonisTPB0596共培養(yǎng),從中分離得到1個(gè)新的大環(huán)酰胺類化合物Dracolactams B(26)。Nie等[24]通過Sephadex LH-20和HR-TOF-MS等方法從Micromonosporasp.FIM05328代謝產(chǎn)物中分離到新大環(huán)酰胺類化合物FW05328-1(27),并確定了其結(jié)構(gòu)。Williams等[25]將海洋Micromonosporasp.RJA4480進(jìn)行固態(tài)培養(yǎng),并用乙酸乙酯萃取附有菌體的固體瓊脂培養(yǎng)基,從中分離得到4個(gè)新化合物Sporalactam B (28)、Sporalactam A(29)、Rifamycin 1(30)和Rifamycin 2(31)。通過改變培養(yǎng)策略來拓寬次級(jí)代謝產(chǎn)物種類并提高產(chǎn)量是微生物培養(yǎng)的重要手段,上述利用共培養(yǎng)、固態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)小單孢菌的方法也能為后期從發(fā)酵產(chǎn)物中分離新化合物提供好的思路。
圖2 化合物23~31的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.2 The chemical structures of compounds 23-31
醌類化合物是天然產(chǎn)物中一類比較重要的活性成分,隨著人們對(duì)微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物研究的深入,從海洋小單孢菌代謝產(chǎn)物中分離得到一些結(jié)構(gòu)新穎的醌類化合物主要為蒽醌類及其衍生物,它們表現(xiàn)出較好的抑菌、抗氧化、抗腫瘤、細(xì)胞毒性等生物活性。
Mullowney等[26]從越南東海Cát bà半島的海洋沉積物中分離得到Micromonosporasp.G039,從其代謝物中獲得3個(gè)醌類化合物lagumycin B(32),dehydrorabelomycin(33)和 WS-5995 A(34),其中化合物32的結(jié)構(gòu)首次得到表征。Jiang等[27]從海洋Micromonospora.echinosporaSCSIO 04089中分離到含苯并芴結(jié)構(gòu)的新化合物Nenestatin A (35),該化合物具有和非典型角環(huán)素單體lomaiviticins相似的碳骨架,在體外驗(yàn)證表達(dá)該化合物的生物合成基因簇時(shí)分離到其生物合成中間體homo-dehydrorabelomycin E(36)。
Yan等[28]從公共放線桿菌基因組數(shù)據(jù)庫中挖掘二炔類生物合成基因簇時(shí),從MicromonosporayangpuensisDSM 45577中分離得到一個(gè)帶烯二炔結(jié)構(gòu)的蒽醌類化合物yangpumicin A(YPM A,37)和蒽醌類化合物YPM B-E(38~41)。Adnani等[29]將來自兩種不同的海洋生物的Micromonosporasp.WMMB-235和Rhodococcussp.WMMA-185共培養(yǎng),從其代謝產(chǎn)物中分離到復(fù)雜結(jié)構(gòu)的新的醌類化合物keyicin(42)。烯二炔類抗生素具有很強(qiáng)的抗腫瘤活性,而且作用機(jī)制新穎,能發(fā)展成新型高效的抗腫瘤藥物[30-32],天然來源的烯二炔類化合物至今發(fā)現(xiàn)不多,從小單胞菌中發(fā)現(xiàn)的尤為稀少。
圖3 化合物32~42的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.3 The chemical structures of compounds 32-42
多肽化合物具有多種多樣的生理活性和藥用價(jià)值,是抗生素研究中的一個(gè)相對(duì)較新的領(lǐng)域,在小單胞菌中發(fā)現(xiàn)較多的是雜環(huán)肽類化合物。Yasushi等[33]將Micromonosporasp.ATCC 39149進(jìn)行液態(tài)發(fā)酵,直接對(duì)整個(gè)發(fā)酵液進(jìn)行HPLC和LC-ESI-MS分析,從中分離得到新的多肽ketomemicin A(43)。2016年Xu等[34]從中國(guó)云南的土壤樣品中分離得到Micromonosporasp.CPCC 202787 ,并在菌體的乙酸乙酯萃取相中發(fā)現(xiàn)10個(gè)多肽化合物44~53,其中化合物44和45為新化合物。
生物堿是一類重要的含氮雜環(huán)化合物,具有復(fù)雜多樣的化學(xué)結(jié)構(gòu)和非常廣泛的生物活性,如抗菌、抗寄生蟲、抗腫瘤或細(xì)胞毒性[35]。自然界中生物堿主要來源于植物,在微生物中也有大量產(chǎn)生,目前從不同來源的放線菌中分離到越來越多具有獨(dú)特化學(xué)結(jié)構(gòu)和生物學(xué)活性的生物堿。Hoshino等[23]將分離自湖泊沉積物的M.wenchangensisHEK-797和細(xì)菌T.pulmonisTPB0596共培養(yǎng),獲得一個(gè)新的生物堿類化合物Dracolactams A(54),證明共培養(yǎng)條件下一些沉默基因被激活可能產(chǎn)生新的代謝產(chǎn)物。Boonsnongcheep等[36]從葛根根瘤內(nèi)生Micromonosporasp.PC1052分離到生物堿類化合物S-adenosyl-N-acetylhomocysteine(55),化合物55首次從小單胞菌中分離得到,此前該化合物作為化學(xué)合成的產(chǎn)物已有報(bào)道。
圖4 化合物44~53的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.4 The chemical structures of compounds 44-53
Mullowney等[26]從海洋Micromonosporasp.G039除了發(fā)現(xiàn)三個(gè)醌類化合物lagumycin B (32),dehydrorabelomycin(33)和 WS-5995 A(34)外,還發(fā)現(xiàn)了一個(gè)具有非特異性的細(xì)胞毒性生物堿phenanthroviridone(56)。Talukdar等[37]利用氯仿萃取從土壤中分離的MicromonosporaauratinigraHK-10的發(fā)酵液,并從油性粗提物中分離獲得一個(gè)新的醌類化合物2-methylheptylisonicotinate(57)。Nie等[24]使用1D,2D NMR和HR-TOF-MS對(duì)海洋Micromonosporasp.FIM05328的主要代謝產(chǎn)物進(jìn)行了鑒定,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)生物堿類化合物aurodox(58)。Dashti等[38]從來源于地中海海綿的Micromonosporasp.RV43經(jīng)GlcNAc誘導(dǎo)后分離到一個(gè)新的生物堿類化合物3-formylindole(59)。Vizcaíno等[39]從來自2000米深的海洋沉積物的MicromonosporamatsumotoenseM-412中分離到一個(gè)生物堿類化合物,經(jīng)HRMS(高分辨質(zhì)譜)和1D、2D NMR確定結(jié)構(gòu)鑒定后發(fā)現(xiàn)是保洛霉素家族化合物,并命名為paulomycin G(60)。Zhang等[40]從中國(guó)南海分離得到MicromonosporarosariaSCSIO N160,通過對(duì)發(fā)酵液丙酮萃取,樹脂吸附等幾個(gè)分離純化步驟之后,獲得3個(gè)新的生物堿類化合物Pyrazolofluostatins A-C(61~63)。
圖5 化合物54~63的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.5 The chemical structures of compounds 54-63
萜類化合物通常是指由異戊二烯單位組成的分子式為(C6H5)n的碳?xì)浠衔?,種類豐富,是天然產(chǎn)物中最大的家族[41]。萜類化合物廣泛分布在植物中,從小單胞菌中發(fā)現(xiàn)的萜類化合物相對(duì)較少。Mullowney等[26]在篩選抑制人腫瘤細(xì)胞系NCI-60 SKOV3的放線菌時(shí),篩選到高活性菌株Micromonosporasp.G039并從其發(fā)酵液中分離到1個(gè)新的化合物isopimara-2-one-3-ol-8,15-diene(64)。Zhang等[42]從來自于海洋海鞘Symplegmabrakenhielmi的Micromonosporasp.WMMC-218中分離到2個(gè)新的雙萜類化合物Micromonohalimane A (65)和B(66)。
圖6 化合物64~66的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.6 The chemical structures of compounds 64-66
近幾年,國(guó)內(nèi)外對(duì)小單孢菌活性產(chǎn)物的研究報(bào)道日益增多,除以上報(bào)道的化合物結(jié)構(gòu)類型外,還包括脂肪酸類、酚酸類等,它們也具有一定的生物活性。Gao等[43]從海洋來源的Micromonosporasp.HS-HM-036中分離得到一種萘丙酸類似物(67)。來源于海綿的Micromonosporasp.RV43在不添加GlcNAc的情況下分離得到glutaric acid(68)、4-hydroxyphenyl acetic acid(69)、4-hydroxybenzoic acid(70)、4-hydroxybenzaldehyde(71)、3-hydroxybutyrate的不同類似物(72~77),添加GlcNAc后產(chǎn)生了新化合物guaymasol(78)[38]。
Appadurai等[44]從來自海洋沉積物中的Micromonosporasp.ICN36中分離出一種具有高效抗MRSA活性的化合物,其結(jié)構(gòu)暫未見報(bào)道。Diogo等[45]對(duì)MicromonosporaechinosporaDSMZ 43816培養(yǎng)物中的揮發(fā)性成分進(jìn)行GC/MS分析,發(fā)現(xiàn)了一類新的長(zhǎng)鏈脂肪腈族化合物。
圖7 化合物67~78 的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.7 The chemical structures of compounds 67-78
近幾年來,諸多學(xué)者對(duì)小單胞菌所產(chǎn)次級(jí)代謝產(chǎn)物的抑菌活性進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)許多化合物對(duì)大腸桿菌(Escherichiacoli)、枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis)、白色念珠菌(Candidaalbicans)等常規(guī)指示菌有較好的抑制活性,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)一些能作用于結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis)和金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的化合物。
Gui等[17]從M.harpaliSCSIOGJ089分離得到9個(gè)大環(huán)內(nèi)酯類活性化合物(3~12),它們對(duì)蘇云金桿菌 BT01 和枯草芽孢桿菌 BS01 具有較好的抗菌活性,其MIC值為0.016~8.0 μg/mL,其中化合物3和10活性最強(qiáng),對(duì)BT01和BS01的MIC值分別為0.016 μg/mL和0.03 μg/mL。Gong等[18]從M.carbonaceaLS276中分離到6個(gè)活性化合物(10,12~16),化合物10、12~16對(duì)枯草芽孢桿菌的MICs 值分別為<0.048 μM、0.5 μM、12.5 μM、1.562 μM、50 μM 和0.048 μM。Mercedes等[21]報(bào)道3個(gè)大環(huán)內(nèi)酯類活性化合物(20~22),化合物20、21和22質(zhì)量分別為4、2、4 μg時(shí)抑制枯草芽孢桿菌的抑菌圈達(dá)7 mm,同時(shí)發(fā)現(xiàn)化合物20對(duì)結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium.tuberculosis)和耐萬古霉素的屎腸球菌(EnterococcifaeciumMB5571)也有抑制作用,其MIC值范圍在16~32 μg/mL和32~64 μg/mL之間。此外,大環(huán)酰胺類化合物28能很好地抑制結(jié)核分枝桿菌,其MIC90值為0.06 μM,有開發(fā)成新的抗結(jié)核藥物的潛能[25]。
Zhang等[40]發(fā)現(xiàn)生物堿類化合物61~63對(duì)大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、蘇云金芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌和白色念珠菌都有不同程度的抑制活性。Diogo等[45]對(duì)M.echinosporaDSMZ 43816培養(yǎng)物中的揮發(fā)性成分進(jìn)行GC/MS分析,發(fā)現(xiàn)了一類新的長(zhǎng)鏈脂肪腈族化合物并研究了其生物合成途徑,生物活性檢測(cè)表明其中某些化合物對(duì)Bacillussubtilis,Micrococcusluteus和 multiresistantStaphylococcusaureus(MIC=2.0~4.0 mg/mL)有一定的抑制活性。
隨著新的抗菌藥物的不斷出現(xiàn)和臨床應(yīng)用,細(xì)菌的耐藥性已成為抗感染治療面臨的一個(gè)嚴(yán)重問題。從小單胞菌中分離到一些新的大環(huán)酰胺類化合物、醌類化合物和萜類化合物,它們對(duì)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)和甲氧西林敏感金黃色葡萄球菌(MSS)具有一定的抑制活性?;衔?8是Micromonosporasp.NBRC 110955產(chǎn)的一個(gè)抗生素,能有效抑制金黃色葡萄球菌生長(zhǎng),MIC值為13 μg/mL,Daduang等在研究化合物18的合成過程發(fā)現(xiàn)一個(gè)合成途徑中的中間體化合物19,但是化合物19對(duì)金黃色葡萄球菌的MIC值為1.6 μg/mL,遠(yuǎn)低于化合物18,化合物18對(duì)藤黃微球菌、枯草芽胞桿菌、蠟樣芽胞桿菌和糞腸球菌同樣有很強(qiáng)的抑制作用,MIC值在0.2~13 μg/mL之間[19,46]?;衔?0~22對(duì)MRSA都有抑制作用,其中化合物20抑制作用最強(qiáng),MIC值為1.0 μM,化合物21和22分別為4~8 μg/mL和32~64 μg/mL[21,22]?;衔?8~31對(duì)多種不同病原菌(包括MRSA)都有很強(qiáng)的抑制作用?;衔?8和29對(duì)MRSA的MIC90分別為7.0和1.8 μM,化合物30和31中的3-氨基取代基(R1)顯著增強(qiáng)了利福霉素支架的體外抗菌活性,對(duì)MRSA的MIC90值為0.000 8和0.000 9 μM,對(duì)E.coil、M.tuberculosis的MIC90值在0.000 1~1.8 μM之間[25]。該類化合物具有很好抗菌活性,有望成為新藥開發(fā)的前體化合物。化合物42[29]能抑制MSSA,MICS值為2.5 μM,對(duì)枯草芽孢桿菌的MICS值為9.9 μM,化合物42同時(shí)具有抑制分枝桿菌和紅球菌的活性。Talukdar等[37]發(fā)現(xiàn)具有廣譜抑制活性的化合物2-methylheptylisonicotinate (57),該化合物對(duì)金黃色葡萄球菌、枯草芽胞桿菌、普通變形桿菌(Proteusvulgaris)、大腸桿菌、銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)和膿腫分枝桿菌(Mycobacteriumabscessus)的MIC值分別為70、40、80、60、60和50 μg/mL?;衔?6[42]對(duì)MRSA有抑制作用,其MIC為40 μg/mL,化合物65對(duì)MRSA的MIC>200 μg/mL?;衔?7[43]對(duì)枯草桿菌和銅綠假單胞菌的最小抑菌濃度分別為0.016 mg/mL和8 mg/mL。
天然化合物及其衍生物是抗腫瘤化合物的重要來源之一。具有細(xì)胞毒性的化合物能作用于細(xì)胞的基本結(jié)構(gòu)或者生理過程,從而影響細(xì)胞的生存,在癌癥和腫瘤治療方面有重要的意義。細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,小單孢菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物具有比較明顯的抗腫瘤活性。Nie等[24]分離的新大環(huán)酰胺類化合物27顯示較好的細(xì)胞毒活性,對(duì)人腫瘤細(xì)胞系KYSE30、KYSE180和EC109有較好的抗增殖效果,其IC50值分別為15.92、30.77、0.000 20 μM。Mullowney等[26]以小鼠卵巢表面上皮(MOSE)和小鼠輸卵管上皮(MOE)為代表的卵巢癌前體細(xì)胞系,對(duì)化合物32、33、34和56進(jìn)行了選擇性細(xì)胞毒性評(píng)價(jià),化合物32對(duì)兩種細(xì)胞系的LC50分別為9.80 μM(MOSE)和10.8 μM(MOE),化合物33和56為非特異性的細(xì)胞毒性,對(duì)多種癌細(xì)胞都有較強(qiáng)的抑制作用,化合物34對(duì)Kuramochi卵巢癌細(xì)胞的LC50為18.6 μM。Pang等[34]對(duì)化合物44~53進(jìn)行了細(xì)胞毒性檢測(cè),結(jié)果表明化合物44~53對(duì)Sup T1細(xì)胞具有相對(duì)較低的細(xì)胞毒性?;衔?7[28]是1個(gè)帶烯二炔結(jié)構(gòu)的蒽醌類化合物,其對(duì)黑色素瘤(SKMEL-5)、乳腺癌(MDA-MB-231 和SKBR-3)、中樞神經(jīng)系統(tǒng)(SF-295)和非小細(xì)胞肺癌(NCI-H226)均表現(xiàn)出很高的抑制活性(IC50s=0.26~2.9 μM),該研究結(jié)果與報(bào)道的烯二炔類化合物具有高細(xì)胞毒性和抗腫瘤活性是一致的。
Nie等[24]從海洋Micromonosporasp.FIM05328代謝產(chǎn)物中分離到有抑制腫瘤細(xì)胞增殖效果的化合物58,該化合物對(duì)人腫瘤細(xì)胞系KYSE30,KYSE180和EC109的IC50值為22.52 μM、83.76 μM和20.56 μM,對(duì)細(xì)菌和真菌沒有抑菌活性?;衔?0[39]對(duì)人胰腺癌(MiaPaca-2)、乳腺癌(MCF-7)和肝細(xì)胞癌(HepG2)具有較強(qiáng)的細(xì)胞毒活性,IC50值分別為2.70±0.25 μM、1.58±0.12 μM和4.30±0.42 μM。化合物67[43]對(duì)人肺腺癌細(xì)胞株A549具有細(xì)胞毒性,IC50值為46.54 μg/mL?;衔?9[44]在體外試驗(yàn)中對(duì)HCT 15結(jié)腸癌細(xì)胞具有一定的殺傷活性,IC50值為8.28 μg/mL。
艾滋病(HIV)是一種免疫缺陷病,到目前為止仍然無法治愈,能對(duì)HIV病毒起到抑制作用的天然產(chǎn)物為數(shù)不多,僅包括多糖、萜類、生物堿、多肽等化合物中的少數(shù)幾種,和已報(bào)道的成千上萬種天然活性化合物相比是少之又少。最近有研究人員從小單胞菌中就發(fā)現(xiàn)一些能抑制HIV病毒的多肽類化合物,如化合物44和45對(duì)HIV-1的抑制作用較弱,IC50分別為58.0 μM和57.3 μM,而化合物46~53相對(duì)較強(qiáng),IC50為5.3~22.3 μM[34]。以上研究表明多肽類化合物在抗HIV方面顯示較好的應(yīng)用前景。
小單胞菌次級(jí)代謝產(chǎn)物除了具有抗菌活性、抗腫瘤活性和抗HIV活性外,還具有抗寄生蟲活性和抗氧化活性等。研究人員發(fā)現(xiàn)化合物23和24對(duì)布氏錐蟲(Trypanosomabrucei)有明顯的抑制作用,其IC50分別為0.8 μM和6.1 μM[22]?;衔?1[40]具有一定的抗氧化活性(EC50=48.6 μM)。本研究未報(bào)道其它代謝產(chǎn)物的抗寄生蟲和抗氧化等活性,在后續(xù)的研究工作中可以利用發(fā)酵調(diào)控的手段來提高代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量,從而發(fā)掘其新的生物學(xué)功能。
小單孢菌分布廣泛,從陸地到海洋、從土壤到動(dòng)植物,都有分離到小單孢菌的報(bào)道,通過本文統(tǒng)計(jì),小單孢菌主要來源海洋(15個(gè))、其次為土壤(2個(gè)),分別占63%和8%(圖8A)。小單孢菌屬也是產(chǎn)新型抗生素和其他活性化合物的重要來源,本論文從小單胞菌屬中分離到79個(gè)次級(jí)代謝產(chǎn)物,新化合物(48個(gè))占化合物總數(shù)的61%。從化學(xué)物結(jié)構(gòu)類型看,大環(huán)內(nèi)酯類相對(duì)較多(22個(gè)),占化合物總數(shù)的28%,其后依次為醌類(11個(gè))、肽類(11個(gè))、生物堿(10個(gè))和大環(huán)酰胺(9個(gè)),分別占化合物總數(shù)的14%、14%、13%和11%(圖8B)。已報(bào)道的化合物中有52個(gè)具有生物活性,具有抑菌活性的最多(31個(gè)),其次是抗腫瘤活性(19個(gè))、抗HIV(10個(gè))等,所占比率依次為67%、24%和13%(圖8C)。以上數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明,小單胞菌是挖掘活性天然產(chǎn)物的重要菌源,所產(chǎn)次級(jí)代謝產(chǎn)物化學(xué)結(jié)構(gòu)新穎、出新率高,生物活性研究具有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),為尋找新的藥用先導(dǎo)化合物提供了寶貴的資源。
圖8 小單胞菌來源(A)、產(chǎn)物結(jié)構(gòu)分類(B)和產(chǎn)物活性分類(C)Fig.8 Origin categories(A) of Micromonospora、Structure types(B) and Bioactive categories(C) of Micromonospora natural products
因此在充分利用現(xiàn)有小單胞菌資源的同時(shí),我們可以從以下3個(gè)方面對(duì)小單胞菌及其次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行更全面的研究:(1)加大對(duì)研究相對(duì)較少的特殊生境小單胞菌的分離篩選,如海洋沉積物、動(dòng)植物內(nèi)生環(huán)境、極熱極冷環(huán)境,以獲得更為豐富的小單胞菌資源,為天然產(chǎn)物的分離和開發(fā)奠定基礎(chǔ);(2)小單胞菌具有很強(qiáng)的產(chǎn)天然活性產(chǎn)物的潛力,但是在實(shí)驗(yàn)室的培養(yǎng)條件下,很多天然產(chǎn)物的基因合成簇表達(dá)率低,甚至沉默。隨著生物信息學(xué)和分子生物學(xué)的深入研究,我們可以對(duì)菌株的基因進(jìn)行深度地挖掘并研究其代謝通路,充分發(fā)揮小單胞菌代謝產(chǎn)物的合成潛力,以盡可能地獲得更多的天然代謝產(chǎn)物;(3)從小單胞菌中分離出來的天然產(chǎn)物,有許多都是結(jié)構(gòu)十分相似的同類物質(zhì),但活性卻各有不同。因此,可以結(jié)合化學(xué)合成和結(jié)構(gòu)修飾的方法,對(duì)現(xiàn)有天然化合物進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造,開展構(gòu)效關(guān)系研究,以從中發(fā)現(xiàn)藥物先導(dǎo)物或者藥物,為人類健康與醫(yī)藥的發(fā)展做出貢獻(xiàn)。