宋志強,楊喜愛,張曉偉,郭兵,肖愛平,肖清明,梅時勇
(中國農(nóng)業(yè)科學院麻類研究所,湖南 長沙 410205)
擬鞘線蟲(HemicriconemoidesChitwood & Birchfield,1957)是一類植物根系遷移性外寄生線蟲,主要分布于全世界較溫暖地區(qū),包括非洲、美洲、南歐、澳大利亞、東亞、南亞、東南亞等[1-2]。目前世界上報道擬鞘線蟲的種類已達55種,我國記載的有18種[2],可寄生和危害水稻、玉米、柑橘、芒果、荔枝、龍眼、香蕉、葡萄、枇杷、番石榴等作物和果樹的根系,導致根系發(fā)育不良,植株生長衰退[3-4]。此外,擬鞘線蟲侵染根系造成的傷口有利于真菌、細菌等植物病原物的侵染,加重對植物的危害。
苧麻(Boehmerianivea)俗稱“中國草”,是一種多年生宿根性旱地草本纖維作物,我國苧麻種植面積和產(chǎn)量均占全世界總種植面積和產(chǎn)量的90%以上[5]。苧麻全株均可利用,目前主要應用于纖維紡織、動物飼料、食用菌培養(yǎng)基質、環(huán)保型麻地膜、土壤重金屬污染修復、燃料乙醇、造紙等方面[6]。盡管我國苧麻栽培歷史悠久,但目前尚未見擬鞘線蟲為害苧麻的報道。
2018年11月,作者在湖南省益陽市苧麻線蟲病的調查過程中,從苧麻根際土壤中分離到一種擬鞘線蟲,通過形態(tài)學和分子生物學相結合的方法對該線蟲進行鑒定,以明確苧麻根際擬鞘線蟲的種類,從而為該病害的準確診斷和有效防治提供科學指導。
樣品采自湖南省益陽市沅江市榨南湖村的苧麻根際,取樣深度為5~25 cm,每份樣品約500 g,放入封口袋中,標明寄主植物、采樣地點、采樣時間等,帶回實驗室。采用淺盤法分離土壤中的線蟲。
將分離獲得的線蟲經(jīng)溫熱殺死后,制成臨時玻片,在尼康顯微鏡(Nikon E200型)下對線蟲的整體形態(tài)和內部結構進行觀察和拍照,采用de Man公式對線蟲進行形態(tài)測計。
1.3.1 線蟲DNA提取
參照宋志強等[7]的方法提取單條線蟲的DNA。在體視顯微鏡下,用挑針挑取單條線蟲放入含有8 μL ddH2O和1 μL 10×PCR buffer(Mg2+free)的0.2 mL PCR管中;將PCR管放入液氮中冷凍1 min后,再置于85 ℃下2 min,重復5次;向PCR管中加入1 μL 1 mg/mL蛋白酶K,56 ℃孵育15 min,95 ℃加熱10 min,獲得的DNA提取液可直接用于PCR擴增或者置于-20 ℃中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.2 PCR擴增
利用通用引物18s(5′-TTGATTACGTCCCTGCCCTTT-3′)和26s(5′-TTTCACTCGCCGTTACTAAGG -3′)[8]以及D2A(5′-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTG-3′)和D3B(5′-TCGGAAGGAACCAGCTACTA-3′)[9]分別擴增線蟲的rDNA-ITS區(qū)和28S rDNA-D2/D3區(qū)序列。PCR反應體系為25 μL,其中10×EasyTaqbuffer(含Mg2+)2.5 μL,2.5 mmol/L dNTPs 2 μL,10 μmol/L正反向引物各1 μL,5 U/μLEasyTaqDNA聚合酶0.5 μL,模板DNA 5 μL,補足ddH2O至25 μL。反應程序:94 ℃預變性4 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。
1.3.3 PCR產(chǎn)物的克隆及測序
PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳切膠回收、純化后,與克隆載體pEASY-T1(北京全式金生物技術有限公司)連接,再轉化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中后,挑取陽性克隆送至北京擎科生物科技有限公司湖南分公司測序。測序獲得的序列經(jīng)BioXM 2.6軟件拼接編輯后,提交至GenBank數(shù)據(jù)庫獲取序列號。
1.3.4 系統(tǒng)進化樹構建
從GenBank數(shù)據(jù)庫下載擬鞘屬線蟲的rDNA-ITS區(qū)和28S rDNA-D2/D3區(qū)序列,利用MEGA X軟件中的ClustalW程序對序列進行比對,采用鄰接法(neighbor-joinning method,NJ)構建系統(tǒng)進化樹,并用Bootstrap值分析分支聚類的可靠性。
從苧麻根際土壤中僅分離到擬鞘線蟲的雌蟲,未見到雄蟲。雌蟲形態(tài)特征及形態(tài)測計值見圖1、表1。雌蟲蟲體圓柱形,熱殺死后稍向腹面彎曲。體長387.0~464.8 μm,體環(huán)89~98個,環(huán)較寬大,平滑,不后翻,體中部體環(huán)寬3.5~5.6 μm(圖1-A)。頭部頂端平圓,有唇盤,唇環(huán)2個??卺槹l(fā)達,長63.6~74.7 μm,占13~22個體環(huán),口針基部球前緣突起。具典型的環(huán)形食道,食道前體部與中食道球融合,中食道球發(fā)達,后食道腺梨形,與腸分界清楚。排泄孔位于腸的前端,到頭端的距離為92.6~130.3 μm,體環(huán)23~30個(圖1-B)。陰道向內前傾,單卵巢,前伸。陰門橫裂,距肛門3~4個體環(huán),距尾端9~13個體環(huán)。肛門距尾端5~10個體環(huán)。尾部呈圓錐形,末端鈍圓(圖1-C~F)。
本研究從苧麻根際分離得到的擬鞘線蟲雌蟲的形態(tài)特征和測計值與楊意伯等[4]和Decraemer等[10]描述的加德擬鞘線蟲基本吻合,故將此擬鞘線蟲群體初步鑒定為加德擬鞘線蟲[Hemicriconemoidesgaddi(Loos, 1949)Chitwood & Birchfield, 1957]。該線蟲隸屬于墊刃目(Tylenchida),墊刃亞目(Tylenchina),環(huán)總科(Criconematoidea),環(huán)科(Cricomenatidea),環(huán)亞科(Criconematinae),擬鞘線蟲屬(Hemicriconemoides)。
注:A:整體;B:體前部;C~F:尾部圖1 加德擬鞘線蟲雌蟲的形態(tài)特征Fig.1 Morphological characteristics of Hemicriconemoides gaddi female
表1 加德擬鞘線蟲益陽群體與文獻描述群體的雌蟲測計值
Table 1 Morphometrics of females ofHemicriconemoidesgaddiYiyang population and the previous described population
測計特征益陽群體福州群體[4]巴布亞新幾內亞群體[10]n203735L/μm413.5±19.6(387.0~464.8)481.0±26.6 (437.1~464.8)400.0±40.8(330.0~530.0)W/μm29.6±2.0 (27.2~35.7)29.5±1.4 (24.4~34.7)33.0±3.1(23.0~38.0)Stylet/μm67.6±2.8(63.6~74.7)67.9±3.7 (61.4~75.6)68.7±3.6(61.0~75.0)Tail/μm26.9±1.1 (25.0~28.2)28.3±4.0 (23.8~33.1)25.9±4.9(17.0~39.0)a14.0±1.0 (12.1~15.8)16.3±1.8 (14.2~18.6)12.3±1.7 (9.4~17.0)b3.8±0.5 (3.4~4.3)4.1±0.3(3.6~4.4)2.9±0.6(2.4~4.2)c15.4±2.0 (14.2~17.9)17.1±2.1(15.3~20.6)15.8±2.2 (11.2~20.0)V/%89.7±0.7 (88.7~91.2)89.7±0.6(88.7~90.6)89.3±1.6(83.4~92.0)Ex.P/μm114.4±8.5(92.6~130.3)138.7±9.6(120.5~151.4)111.4±3.2(86.0~143.0)VL/VB1.8±0.2(1.7~2.1)2.0±0.3(1.7~2.4)1.9±0.2(1.5~2.2)
續(xù)表1
測計特征益陽群體福州群體[4]巴布亞新幾內亞群體[10]R94.5±2.3(89.0~98.0)103.0±5.0(96.0~109.0)104.8±3.2(99.0~110.0)RB4.7±0.5(3.5~5.6)3.2±0.2(3.0~3.6)-Rst16.1±2.0(13.0~22.0)18.0±1.0(16.0~19.0)-Rex27.0±1.8(23.0~30.0)31.0±2.0(28.0~34.0)32.2±1.2(30.0~35.0)RV10.9±1.0(9.0~13.0)13.0±1.0(12.0~15.0)11.5±1.3(9.0~16.0)Ran7.1±1.0(5.0~10.0)9.0±1.0(8.0~10.0)-RVan3.8±0.4(3.0~4.0)5.0±1.0(4.0~6.0)4.3±1.1(3.0~8.0)
注:n=樣本數(shù),L=體長,W=最大體寬,Stylet=口針長,Tail=尾長,a=體長/最大體寬,b=體長/頭端至食道與腸連接處的距離,c=體長/尾長,V=陰門至頭端的距離/體長×100,Ex.P. =排泄孔至頭端的距離,VL/VB=陰門至尾端的距離/陰門處體寬,R=體環(huán)數(shù),RB=蟲體中部的體環(huán)寬度,Rst=唇盤至口針基部球之間的體環(huán)數(shù),Rex=唇盤至排泄孔后第一環(huán)之間的體環(huán)數(shù),RV=陰門至尾端之間的體環(huán)數(shù),Ran=肛門至尾端之間的體環(huán)數(shù),RVan=陰門至肛門之間的體環(huán)數(shù)。
測序結果表明,擬鞘線蟲益陽群體rDNA-ITS區(qū)的擴增片段長度為997 bp(GenBank登錄號:MK050499),28S rDNA-D2/D3區(qū)片段長度為768 bp(GenBank登錄號:MK050500)。序列分析結果顯示,該群體的rDNA-ITS區(qū)序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的加德擬鞘線蟲福州群體(KC520471)相似性達97%,與其它擬鞘屬線蟲種的同源性約為82%~91%。該群體的28S rDNA-D2/D3區(qū)序列與加德擬鞘線蟲福州群體(KC520470)相似性為97%,與其它種的序列同源性為86%~95%。從基于rDNA-ITS區(qū)和28S rDNA-D2/D3區(qū)序列構建的系統(tǒng)發(fā)育樹可知(圖2、 3),該群體與加德擬鞘線蟲處于同一進化分支上,與其它擬鞘屬線蟲進化關系較遠。
綜合形態(tài)學特征比較和分子生物學特征分析,從苧麻根際分離到的擬鞘線蟲最終鑒定為加德擬鞘線蟲。
圖2 基于rDNA-ITS區(qū)序列構建的擬鞘屬線蟲系統(tǒng)進化樹Fig.2 Phylogenetic tree of Hemicriconemoides species based on rDNA-ITS sequences
圖3 基于28S rDNA-D2/D3區(qū)序列構建的擬鞘屬線蟲系統(tǒng)進化樹Fig.3 Phylogenetic tree of Hemicriconemoides species based on 28S rDNA-D2/D3 sequences
加德擬鞘線蟲益陽群體的形態(tài)特征與文獻描述的巴布亞新幾內亞群體[10]和福州群體[4]相符。益陽群體的形態(tài)測計值與巴布亞新幾內亞群體相比,除體環(huán)數(shù)(89~98)和唇盤至排泄孔后第一環(huán)之間的體環(huán)數(shù)(23~30)分別比巴布亞新幾內亞群體的(99~100)和(30~35)偏小外,其它測計值均與巴布亞新幾內亞群體相吻合。益陽群體的口針長、尾長、b值、c值和VL/VB值與福州群體完全相符,其它測計值雖然存在一定差異,但均有范圍重疊。同種線蟲不同群體間存在形態(tài)測量差異,這些差異可能是由群體地理分布、土壤環(huán)境條件和寄主不同所致。
由于擬鞘線蟲種類較多,種間形態(tài)學特征比較相似,僅依靠形態(tài)學特征難以進行準確鑒定,故需結合分子生物學方法對擬鞘線蟲做進一步鑒定。目前擬鞘線蟲的種類鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析主要采用rDNA(ITS序列、18S序列和28S序列)和mtDNA(COI序列)的部分序列[2, 11]。本研究利用rDNA的ITS區(qū)序列和28S的D2/D3區(qū)序列對苧麻根際的擬鞘線蟲進行種類鑒定,結果表明,該擬鞘線蟲益陽群體的rDNA-ITS區(qū)和28S rDNA-D2/D3區(qū)序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的加德擬鞘線蟲相似性均為97%,系統(tǒng)發(fā)育分析顯示該線蟲群體與加德擬鞘線蟲的親緣關系最近。因此,分子生物學方法進一步證明了該線蟲群體為加德擬鞘線蟲。
加德擬鞘線蟲是Loos[12]于1949年在斯里蘭卡茶樹上首次發(fā)現(xiàn),其后在美國、印度、巴布亞新幾內亞、斐濟、紐埃、薩摩亞、湯加等地均有報道,寄主包括茶樹、咖啡、山茶等一些木本植物[10, 13]。在我國,加德擬鞘線蟲于2013年在福建省福州地區(qū)首次被發(fā)現(xiàn),主要寄生和危害龍眼、香蕉等果樹[4, 14]。苧麻屬于蕁麻科苧麻屬多年生草本植物,是加德擬鞘線蟲的新寄主,該線蟲對苧麻的危害程度還有待進一步研究。