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    NOC2L基因重組慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建及其在293T細(xì)胞中的表達(dá)

    2019-02-07 13:08易雪麗陸飛燕陳曉穎曾怡
    右江醫(yī)學(xué) 2019年12期

    易雪麗 陸飛燕 陳曉穎 曾怡

    【摘要】目的?構(gòu)建NOC2L基因重組慢病毒并使其在293T細(xì)胞中表達(dá)。方法?通過(guò)設(shè)計(jì)引物及PCR擴(kuò)增獲得NOC2L全基因片段,將 pCDH-GFP載體分別用XbaⅠ和BamHⅠ雙酶切制備線性化載體;NOC2L全基因片段和線性化載體經(jīng)切膠回收后,通過(guò)同源重組反應(yīng)將NOC2L全基因片段連接到線性化的pCDH-GFP載體上,構(gòu)建pCDH-NOC2L-GFP慢病毒表達(dá)載體;通過(guò)菌落PCR、質(zhì)粒雙酶切、測(cè)序等方法對(duì)構(gòu)建的NOC2L基因重組慢病毒表達(dá)載體進(jìn)行鑒定,利用構(gòu)建的pCDH-NOC2L-GFP包裝NOC2L慢病毒并使用該慢病毒感染293T細(xì)胞。結(jié)果?菌落PCR、質(zhì)粒雙酶切和測(cè)序結(jié)果顯示成功將NOC2L基因連接到pCDH-GFP載體上,使用構(gòu)建成功的pCDH-NOC2L-GFP轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,能夠成功轉(zhuǎn)染及包裝NOC2L基因重組慢病毒,同時(shí)包裝好的NOC2L基因重組慢病毒能夠成功感染293T細(xì)胞并過(guò)表達(dá)293T細(xì)胞中的NOC2L基因。

    結(jié)論?采用本研究方法能成功構(gòu)建 NOC2L基因重組慢病毒表達(dá)載體。

    【關(guān)鍵詞】NOC2L;NIR;慢病毒表達(dá)載體

    中圖分類號(hào):R373?文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A?DOI:10.3969/j.issn.1003-1383.2019.12.003

    【Abstract】Objective?To construct recombinant lentivirus expressing NOC2L gene,and to analyze its expression in 293T cells.

    Methods?The full-length NOC2L gene was obtained by PCR amplification from human cDNA library.The pCDH-GFP plasmid was digested with XbaⅠ and BamHⅠ to generate a linearized vector.After the NOC2L full-length gene fragment and the linearized vector were purified by gel extraction,the NOC2L full-length gene fragment was ligated into the linearized pCDH-GFP vector by homologous recombination.Positive clones of the recombinant pCDH-NOC2L-GFP lentivirus expression plasmid were identified by double restriction enzyme digestion and Sanger sequencing.The NOC2L lentivirus was packaged with the constructed pCDH-NOC2L-GFP plasmid and the 293T cells were infected with the NOC2L lentivirus subsequently.

    Results?Colony PCR,double restriction enzyme digestion and sequencing results showed that the NOC2L gene was successfully cloned into the pCDH-GFP vector.The recombinant pCDH-NOC2L-GFP plasmid was successfully transfected into 293T cells,and the NOC2L recombinant lentivirus was also successfully packaged.Meanwhile,the NOC2L recombinant lentivirus can successfully infect 293T cells and overexpress the NOC2L gene.

    Conclusion?The NOC2L recombinant lentivirus expression vector was successfully constructed by this method.

    【Key words】NOC2L;NIR;lentivirus expression vector

    NOC2L有6個(gè)轉(zhuǎn)錄物,94個(gè)直向同源物,是一個(gè)核仁相關(guān)的轉(zhuǎn)錄抑制因子。其編碼的NIR蛋白是一種新的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶抑制劑(INHAT)。組蛋白的乙?;腿ヒ阴;谡婧思?xì)胞的基因表達(dá)調(diào)控中起著關(guān)鍵作用,組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HAT)和 組 蛋 白 去 乙 酰 化 酶(histone deacetylase,HDAC)可以影響組蛋白的乙?;痆1]。NIR直接與核小體和核心組蛋白結(jié)合,防止HAT的乙?;瑥亩鸬絀NHAT的作用,且這一作用不被HDAC抑制劑阻斷。p53作為其相互作用的配偶體,NIR通過(guò)與p53結(jié)合來(lái)調(diào)節(jié)p53的轉(zhuǎn)錄活性,抑制p53下游基因的轉(zhuǎn)錄[2]。進(jìn)一步研究結(jié)果顯示,有絲分裂激酶B(Aurora B)作為NIR的另一種相互作用的配偶體,能與NIR直接結(jié)合,形成一個(gè)含有Aurora B、NIR和p53的蛋白質(zhì)復(fù)合物。Aurora B通過(guò)NIR間接地與p53結(jié)合,促進(jìn)Aurora B介導(dǎo)的p53在DBD的多個(gè)位點(diǎn)磷酸化,從而抑制p53的轉(zhuǎn)錄活性[3]。除了p53之外,NIR還可以與TAp63相結(jié)合,進(jìn)而抑制TAp63的轉(zhuǎn)錄活性[4]。NOC2L與其他的INHAT一樣,在正常細(xì)胞的生長(zhǎng)、增殖和分化中發(fā)揮重要作用。Titus等人研究了NOC2L甲基化與乳腺癌的關(guān)系,結(jié)果顯示在Her2、LumA和LumB亞型的乳腺腫瘤中,NOC2L基因高甲基化,在基底樣乳腺腫瘤中低甲基化[5]。而有關(guān)研究顯示NOC2L可能為胰腺癌的易感基因[6]。因此我們期望能通過(guò)構(gòu)建NOC2L基因重組慢病毒表達(dá)載體,為進(jìn)一步研究NOC2L基因與各種腫瘤發(fā)生相關(guān)機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

    1?材料與方法

    1.1?試劑及儀器

    pCDH-GFP質(zhì)粒載體、包裝質(zhì)粒psPAX2和包膜質(zhì)粒pMD2.G為南京醫(yī)科大學(xué)盧春教授惠贈(zèng)。293T細(xì)胞株為本實(shí)驗(yàn)室保存,PCR引物由Takara生物公司合成,PCR試劑盒、DL 15 000 DNA Marker、DL 10 000 DNA Marker、DNA切膠回收試劑盒、real-time PCR (qPCR)試劑盒購(gòu)自Takara生物公司,限制性內(nèi)切酶購(gòu)自NEB公司,EasyGeno重組試劑盒、DH5α感受態(tài)細(xì)胞、質(zhì)粒小量提取試劑盒購(gòu)自北京天根生化科技有限公司,DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清、胰酶、lipofectamine2000購(gòu)自賽默飛世爾科技(中國(guó))有限公司。研究中主要使用下列儀器:5424R高速冷凍離心機(jī)(德國(guó)Eppendorf公司),PTC-200 PCR儀(美國(guó)Bio-Rad公司),DYY-6C 電泳儀(北京市六一儀器廠),NanophtoometerP360超微量分光光度計(jì)(美國(guó)IMPLEN公司),XRS凝膠成像系統(tǒng)(美國(guó)Bio-Rad公司)。

    1.2?方法

    1.2.1?NOC2L基因片段制備

    根據(jù)GenBank基因庫(kù)中登記的NOC2L基因序列設(shè)計(jì)PCR引物,引物序列如下:

    上游引物:ATGGCAGCTGCGGGGAGCCGCAAGAG

    下游引物:TCAACACAATGGCCCTGCCTCCCAC

    以人全基因組cDNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,得到NOC2L基因全長(zhǎng)片段。50 μL反應(yīng)體系如下:模板1 μL,Taq 0.5 μL,2×GC Buffer 25 μL,dNTP Mix 8 μL,上游引物 0.5 μL,下游引物0.5 μL,ddH2O補(bǔ)足50 μL。反應(yīng)條件如下:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸150 s,72℃加長(zhǎng)延伸5 min,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    以NOC2L基因序列及pCDH-GFP載體序列設(shè)計(jì)PCR引物,在NOC2L基因片段5端和3端分別加入與線性化載體兩端重疊的序列,引物序列如下:

    上游引物:CCTCCATAGAAGATTCTAGAGCCACCATGGCAGCTGCGGGGAGCCGCAAGAGGCGCCTGGCGGAGCTGACGGTG

    下游引物: TCCTTCGCGGCCGCGGATCCTCACGTAGAATCGAGACCGAGGAGAGGGTTAGGGATAGGCTTACCGTCGTCCTCTGAGAGCTGC

    以前述獲得的NOC2L全基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物為模板進(jìn)行擴(kuò)增,使擴(kuò)增的NOC2L基因片段上下游分別帶有與線性化載體兩端互補(bǔ)的序列,反應(yīng)體系及條件同前述。擴(kuò)增產(chǎn)物用DNA切膠回收試劑盒按說(shuō)明書回收并純化凝膠產(chǎn)物,并用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行濃度的測(cè)定。-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.2?線性化載體制備

    用限制性內(nèi)切酶XbaⅠ和BamHⅠ對(duì)pCDH-GFP質(zhì)粒載體進(jìn)行雙酶切。雙酶切反應(yīng)體系如下:載體1 μg,XbaⅠ1 μL,BamHⅠ1 μL,Cutsmart buffer 5 μL,以ddH2O補(bǔ)足50 μL。反應(yīng)條件如下:雙酶切體系37℃ 15 min后再65℃ 20 min使酶失活。雙酶切產(chǎn)物用DNA切膠回收試劑盒按說(shuō)明書回收并純化凝膠產(chǎn)物,并用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行濃度的測(cè)定。-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.3?同源重組

    將線性化的載體及插入片段進(jìn)行同源重組。10 μL重組反應(yīng)體系如下:線性化載體0.01 pmol,插入片段0.05 pmol,2×EasyGeno Assembly Mix 5 μL,以ddH2O補(bǔ)足至10 μL。重組反應(yīng)體系如下:50℃反應(yīng)15 min,冰上冷卻5 min。取5 μL上述重組反應(yīng)產(chǎn)物加入50 μL DH5α感受態(tài)細(xì)胞后冰浴30 min;42℃熱激90 s后冰浴150 s;加入350 μL LB液體培養(yǎng)基37℃180 rpm搖45 min;從中取100 μL接種于含氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基篩選陽(yáng)性克隆;從培養(yǎng)16 h的平板上挑取單菌落接入4 mL含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中180 rpm、37℃震蕩培養(yǎng)1 h;取1 μL培養(yǎng)液為模板進(jìn)行菌落PCR鑒定;鑒定使用引物及反應(yīng)體系均同1.2.1;菌落PCR結(jié)果為陽(yáng)性克隆的繼續(xù)180 rpm、37℃震蕩培養(yǎng)16 h后按照質(zhì)粒小量提取試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行質(zhì)粒提取。將提取質(zhì)粒按照1.2.2經(jīng)雙酶切鑒定陽(yáng)性后,送廣州艾基生物有限公司進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。

    1.2.4?NOC2L慢病毒包裝

    將構(gòu)建的pCDH-NOC2L-GFP與包裝質(zhì)粒psPAX2和包膜質(zhì)粒pMD2.G利用Lipofectamine 2000共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,同時(shí)將pCDH-GFP與包裝質(zhì)粒psPAX2和包膜質(zhì)粒pMD2.G利用Lipofectamine 2000共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞作為陰性對(duì)照。轉(zhuǎn)染8 h后將無(wú)血清DMEN更換為完全培養(yǎng)基,分別于48 h和72 h觀察熒光蛋白GFP表達(dá)情況,同時(shí)48 h和72 h分別收取上清,混合后離心吸取上層上清用0.45 μm濾器進(jìn)行過(guò)濾,所得濾液即為包裝好的NOC2L病毒液,-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.5?NOC2L慢病毒感染293T細(xì)胞

    把293T細(xì)胞按照1×105個(gè)細(xì)胞/孔接種入6孔板中,37℃培養(yǎng)24 h。將包裝好的NOC2L慢病毒及陰性對(duì)照慢病毒置于冰上融化。6孔板中的293T細(xì)胞吸棄上清后,取200 μL完全融化的慢病毒加入到6孔板中,加入無(wú)血清DMEM補(bǔ)足2 mL培養(yǎng)體積。培養(yǎng)8 h后將含有慢病毒的無(wú)血清培養(yǎng)基更換為完全培養(yǎng)基。繼續(xù)培養(yǎng)至96 h后觀察熒光蛋白GFP表達(dá)情況,同時(shí)收集細(xì)胞提取RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA后使用qPCR檢測(cè)NOC2L表達(dá)情況。

    1.3?統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

    采用SPSS 18.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)量資料符合正態(tài)分布,采用相對(duì)表達(dá)量2-△△Ct法比較基因的表達(dá)差異。組間比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05,雙側(cè)檢驗(yàn)。

    2?結(jié)?果

    2.1?NOC2L基因片段制備

    以人全基因組cDNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增后,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,在約2800 bp處出現(xiàn)條帶,與預(yù)期目的條帶位置相符,電泳結(jié)果見圖1。以該NOC2L全基因組片段為模板進(jìn)行擴(kuò)增,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,在約2800 bp處出現(xiàn)條帶,產(chǎn)物經(jīng)切膠回收后,獲得30 μL濃度為23.30 ng/μL的插入片段。

    2.2?線性化載體制備

    對(duì)pCDH-GFP質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切后,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,在約7500 bp處出現(xiàn)條帶,電泳結(jié)果見圖2。雙酶切產(chǎn)物經(jīng)切膠回收后,獲得30 μL濃度為24.20 ng/μL的線性化載體。

    2.3?同源重組

    將NOC2L基因片段及線性化載體進(jìn)行同源重組后,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,接種至含氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基篩選陽(yáng)性克隆。過(guò)夜培養(yǎng)后平板上有2個(gè)菌落生長(zhǎng),分別挑取單個(gè)菌落搖菌后進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,1%瓊脂糖凝膠電泳顯示只有1個(gè)菌落在約2800 bp處出現(xiàn)目的條帶,電泳圖結(jié)果見圖3。取菌落PCR陽(yáng)性菌液繼續(xù)培養(yǎng)后進(jìn)行質(zhì)粒小量提取,將提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證,1%瓊脂糖凝膠電泳顯示在2800 bp及7500 bp處分別出現(xiàn)條帶,電泳圖結(jié)果見圖4。送菌落PCR及雙酶切鑒定均為陽(yáng)性的克隆質(zhì)粒到廣州艾基生物有限公司進(jìn)行測(cè)序,結(jié)果回報(bào)顯示,重組的pCDH-NOC2L-GFP中的NOC2L序列與GenBank中登記的NOC2L基因100%同源。

    2.4?NOC2L慢病毒包裝

    轉(zhuǎn)染48 h后pCDH-NOC2L-GFP組及pCDH-GFP組均可看到熒光蛋白GFP表達(dá),熒光視野及明場(chǎng)視野對(duì)比圖見圖5。

    2.5?NOC2L慢病毒感染293T細(xì)胞

    感染96 h后pCDH-NOC2L-GFP組及pCDH-GFP組均可看到熒光蛋白GFP表達(dá)。提取RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA后使用qPCR檢測(cè)NOC2L表達(dá),檢測(cè)結(jié)果顯示兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001),pCDH-NOC2L-GFP組相對(duì)于pCDH-GFP組NOC2L上調(diào)。見表1。

    3?討?論

    NOC2L除了作為INHAT發(fā)揮作用外,還有研究證實(shí)其是皮膚發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,其編碼的NIR調(diào)節(jié)表皮發(fā)育中的角蛋白、整聯(lián)蛋白和層粘連蛋白等必需因子的表達(dá)[7]。p63基因是p53家族成員之一,與p53有高度的同源性,是一種序列特異性轉(zhuǎn)錄因子,可調(diào)節(jié)上皮干細(xì)胞維持和上皮分化。p63可以編碼具有反式激活域、氨基端全長(zhǎng)的TAp63亞型和氨基端截短的ΔNp63亞型[8~9]。研究顯示,NIR的中心部分可以與TAp63的反式激活結(jié)構(gòu)域和C末端寡聚化結(jié)構(gòu)域結(jié)合,抑制其乙?;痆4]。NIR主要定位于細(xì)胞核中,稱為Noc2p,參與60S核糖體亞基的成熟,在不同的人類細(xì)胞系中普遍表達(dá),主要是通過(guò)影響p53的修飾而不是影響p53的蛋白水平起作用[10]。p53是一種調(diào)節(jié)各種重要生物過(guò)程的轉(zhuǎn)錄因子,包括細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期停滯和衰老。p53可分為野生型p53與突變型p53,當(dāng)野生型p53轉(zhuǎn)變?yōu)橥蛔冃蚿53時(shí),p53作為原癌基因在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起作用,目前超過(guò)50%的人類癌癥中都發(fā)現(xiàn)了p53突變[11~13]。MDM2 作為p53 的下游效應(yīng)基因,可以與p53的轉(zhuǎn)錄活性區(qū),即 N端結(jié)合,從而抑制p53對(duì)其下游基因的轉(zhuǎn)錄促進(jìn)功能[14]。而Heyne等人的研究結(jié)果顯示,NIR可以直接與MDM2結(jié)合,與p53一起形成三元復(fù)合物。其中NIR作為INHAT起著阻斷p53與MDM2乙?;淖饔?,與MDM2合作抑制p53誘導(dǎo)的反式激活[15]。NOC2L參與對(duì)p53及其下游效應(yīng)基因表達(dá)的調(diào)控,同時(shí)已有研究證明NOC2L的異常表達(dá)與多種腫瘤的發(fā)生有聯(lián)系,因此我們認(rèn)為NOC2L可能通過(guò)調(diào)節(jié)p53及其下游基因表達(dá)參與到多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中。同時(shí)我們期望能夠通過(guò)NOC2L慢病毒來(lái)構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系以研究NOC2L與各種腫瘤發(fā)生發(fā)展的相關(guān)機(jī)制。

    慢病毒載體是以人類免疫缺陷病毒(HIV)為基礎(chǔ)發(fā)展起來(lái)的基因治療載體,該載體可以將外源基因有效地整合到宿主染色體上,從而達(dá)到持久性表達(dá),具有感染效率高、感染譜廣和穩(wěn)定表達(dá)等優(yōu)勢(shì)[16]。目前,慢病毒已經(jīng)非常廣泛地被用于構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)的哺乳動(dòng)物細(xì)胞系,在構(gòu)建慢病毒載體時(shí)可以在質(zhì)粒中插入螢光素酶基因、綠色和紅色熒光蛋白基因等報(bào)告基因,通過(guò)這些報(bào)告基因?qū)?gòu)建的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系進(jìn)行篩選,有效提高轉(zhuǎn)染效率。陳平等研究證實(shí)聯(lián)合使用慢病毒表達(dá)載體和流式細(xì)胞儀分選技術(shù)可以快速篩選出穩(wěn)定表達(dá)綠色熒光蛋白的293T細(xì)胞系[17]。本研究構(gòu)建了NOC2L基因重組慢病毒表達(dá)載體,載體質(zhì)粒中插入有綠色熒光蛋白基因報(bào)告基因,可以通過(guò)報(bào)告基因?qū)?gòu)建的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系進(jìn)行篩選,提高轉(zhuǎn)染效率。我們下一步將利用構(gòu)建的載體研究NOC2L基因在不同腫瘤中對(duì)p53及其下游基因的調(diào)控情況,以明確NOC2L在各種腫瘤發(fā)生機(jī)制中所起的作用。

    參?考?文?獻(xiàn)

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    (收稿日期:2019-09-25?修回日期:2019-11-25)

    (編輯:王琳葵?梁明佩)

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