李顯永 官潤云 柯坤彬 顧鵬 李同海 崔慶鵬 陳印 趙暉
昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿外科(昆明 650032)
前列腺癌(prostate cancer,PCa)占據(jù)全球男性惡性腫瘤發(fā)病率第二位[1]。據(jù)估計,2018年全美將新增164 690例PCa,占男性新發(fā)腫瘤的19%[2]。我國PCa已是70歲以上人群致死率最高的泌尿系腫瘤,且其致死率正逐年上升,嚴(yán)重影響男性健康[3]。因此,對PCa發(fā)生、發(fā)展及診治策略的深入研究迫在眉睫。近年研究發(fā)現(xiàn)表觀遺傳學(xué)在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中扮演重要角色。N6?甲基腺苷(m6A)是指發(fā)生在腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修飾。它是真核生物mRNA中一種高豐度表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)修飾,據(jù)報道,人類有近7 600種mRNA以及超過300個非編碼RNA存在m6A修飾[4]。最新研究揭示m6A是一種動態(tài)可逆的RNA甲基化修飾,由甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體(METTL3、WTAP、MET?TL14),去甲基酶(FTO、ALKBH5),相應(yīng)的閱讀蛋白(YTHDF、YTHDC)等協(xié)同調(diào)控[5]。METTL3作為催化RNA m6A修飾形成的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體成員之一,目前已被證實在肺癌、肝癌和白血病等腫瘤疾病中呈高表達(dá),并發(fā)現(xiàn)METTL3促進(jìn)了腫瘤相關(guān)癌基因的翻譯,影響腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展[6-8]。而MET?TL3在PCa中的表達(dá)水平及其作用尚不清楚。本實驗擬通過TCGA數(shù)據(jù)集資料分析并運用Westren blot、IHC技術(shù),從mRNA和蛋白水平來研究METTL3在PCa中的表達(dá)情況,并探索其臨床意義。
1.1 一般資料本實驗調(diào)取2014年4月至2018年1月昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院病理科PCa蠟塊32例和癌旁良性組織蠟塊29例,制作為厚度4 μm的連續(xù)切片,用于IHC檢測。其中年齡59~81歲,平均(66.09±5.49)歲;據(jù)2010年AJCC前列腺癌TNM分期標(biāo)準(zhǔn),T1~T2期21例,T3~T4期11例;N0期27例,N1期5例;Gleason評分 ≤ 7分22例,>7分10例。收集2018年2-4月昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院行腹腔鏡下前列腺癌根治術(shù)切除的5例新鮮PCa和配對癌旁良性組織標(biāo)本,依次編號為T1~T5,N1~N5,標(biāo)本離體后迅速置入-80℃冰箱保存,用于Westren blot檢測。實驗前所有標(biāo)本均由我院病理科HE染色證實為癌或癌旁良性組織;患者術(shù)前無長期內(nèi)分泌治療及放化療史;并排除合并其他惡性腫瘤、免疫疾病、代謝疾病以及臨床資料不全者。于 TCGA 數(shù)據(jù)集(https://portal.gdc.cancer.gov/proj?ects)下載PCa的mRNA數(shù)據(jù)和匹配的臨床資料,從中納入各項資料齊全的417例PCa以及52例配對癌旁的數(shù)據(jù)。本實驗經(jīng)醫(yī)院倫理委員會審核批準(zhǔn)。
1.2 實驗材料本實驗主要材料包括:DAB免疫組織化學(xué)顯色試劑盒(BBI);兔抗人METTL3單克隆抗體(Abcam,英國);HRP標(biāo)記的兔二抗(BBI);PBS(BBI);兔抗beta?action多克隆抗體(Abcam,英國);Tween?20(BBI);蛋白提取試劑盒(上海生工);BCA試劑盒(上海生工);PVDF膜(廣州譽維生物);發(fā)光試劑盒(上海生工)。
1.3 方法
1.3.1 免疫組化學(xué)方法所有切片依次行二甲苯脫蠟,梯度乙醇水化;檸檬酸三鈉抗原修復(fù)液,高壓鍋保壓4 min,冷卻至室溫,后PBS洗3次,各3 min;3%的過氧化氫阻斷內(nèi)源性過氧化物酶,室溫孵育15 min,后PBS洗3次,各3 min;6%正常山羊血清,室溫封閉30 min;加兔抗人METTL3單克隆抗體(稀釋濃度1∶500),4°C濕盒中孵育過夜,后PBS洗3次,各3 min;加HRP標(biāo)記的山羊抗兔二抗,室溫孵育45 min,PBS洗4次,每次3 min;DAB顯色,顯微鏡下觀察控制染色時間,蒸餾水終止顯色;蘇木素復(fù)染5 min,1%的鹽酸酒精分化,PBST洗返藍(lán);常規(guī)脫水、透明、封片;顯微鏡采圖。使用PBS代替一抗作陰性對照,按抗體說明書選用人膀胱癌組織作陽性對照。
1.3.2 免疫組化結(jié)果分析METTL3蛋白以細(xì)胞中出現(xiàn)棕黃色染色為陽性表達(dá)。所有切片在同一條件下隨機選取3個視野采圖。圖片使用image?pro?plus 6.0專業(yè)圖像分析軟件(美國Media Cybernetics公司)作免疫組化結(jié)果半定量分析[9-10],圖片選擇腺體區(qū)域(排除間質(zhì)和腺腔部分)測積分光密度(IOD)及面積(area),以平均光密度值(IOD/area,AOD)表示單位面積陽性程度,3個視野的平均AOD值代表METTL3蛋白的表達(dá)水平。
1.4 Western blot檢測取大約30 mg組織,加200 μL RIPA裂解液,低溫高速勻漿10 s,共3次,冰上裂解2 h,高速離心,吸取上清。二奎琳甲酸(BCA)法測定蛋白濃度,最終將濃度調(diào)整為5 μg/μL,加入5×的上樣緩沖液,沸水浴10 min變性。配制12%的分離膠,5%的濃縮膠。電泳后轉(zhuǎn)至PVDF膜,用5%的BSA?TBST封閉。分別與抗METTL3抗體(1∶1 000)和抗 β?action(1∶1 000)抗體溫室孵育15 min,4℃過夜。加入辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的二抗(1∶5 000),室溫 40 min。TBST洗膜5次,各3 min。加入增強型化學(xué)發(fā)光劑顯影3~5 min。曝光,定影,拍照。
1.5 統(tǒng)計學(xué)方法使用SPSS 20.0統(tǒng)計軟件作數(shù)據(jù)分析,結(jié)果數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示。實驗數(shù)據(jù)行正態(tài)性檢驗,組間比較采用配對或獨立樣本t檢驗,相關(guān)性分析采用Spearman等級相關(guān)分析。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 METTL3 mRNA在PCa和癌旁表達(dá)的差異TCGA數(shù)據(jù)集中52例PCa的METTL3 mRNA表達(dá)明顯高于配對癌旁組織[(7.718±2.151)vs.(5.700± 1.385)],差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(t=7.257,P<0.01),見圖1。
圖1 52例PCa和配對癌旁組織METTL3 mRNA表達(dá)情況Fig.1 Expression of METTL3 mRNA in 52 cases of prostate cancer and adjacent tissues
2.2 METTL3蛋白在PCa和癌旁表達(dá)的差異IHC結(jié)果表明PCa和癌旁組織中METTL3蛋白的表達(dá)主要定位于細(xì)胞核,細(xì)胞質(zhì)中少量表達(dá)。METTL3蛋白在PCa組織中表達(dá)水平明顯高于癌旁良性組織[0.074± 0.055)vs.(0.026±0.018)],其差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=4.655,P< 0.01),見圖2。Western blot結(jié)果顯示METTL3蛋白在PCa中表達(dá) 量明顯高于配對癌旁良性組織,見圖3。
圖2 METTL3蛋白在不同組織中的表達(dá)情況Fig.2 Expression of METTL3 protein in different tissues
圖3 5例PCa和配對癌旁組織METTL3蛋白的表達(dá)情況Fig.3 Expression of METTL3 protein in 5 cases of prostate cancer and adjacent tissues
2.3 METTL3 mRNA和蛋白在PCa中表達(dá)水平與臨床病理特征的相關(guān)性Spearman等級相關(guān)分析發(fā)現(xiàn),METTL3 mRNA表達(dá)水平與PCa的Gleason評分呈正相關(guān)(r=0.195,P<0.01),而與年齡、T分期和N分期無相關(guān)性(P>0.05),見表1;METTL3蛋白表達(dá)水平跟PCa的PSA值、Gleason評分呈正相關(guān)(r=0.381,P<0.05;r=0.449P<0.01),而與年齡、T分期、N分期無相關(guān)性(P>0.05),見表2。
METTL3最早是從Hela細(xì)胞裂解液中鑒定出的一個70 kDa的蛋白[11],后續(xù)的研究發(fā)現(xiàn)其包含結(jié)合S-腺苷甲硫氨酸(SAM)和催化m6A形成的兩個結(jié)構(gòu)域,具有獨立催化RNA的m6A修飾形成的活性[12]。近期研究表明METTL3還可以與MET?TL4結(jié)合形成異質(zhì)二聚體[13],WTAP促進(jìn)其在核斑點的定位,使其催化活性大大提升[14]。m6A是目前發(fā)現(xiàn)的100多種RNA轉(zhuǎn)錄后修飾中豐度最高的修飾方式[15-16]。m6A修飾在RNA中的定位主要存在Rm6ACH(R=G或A,H=A、C或U)這一共有序列[13],運用高通量測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)m6A峰分布在mRNA 的 3′非翻譯區(qū)(3′UTR)、5′非編碼區(qū)(5′UTR),內(nèi)部外顯子、翻譯起始和終止密碼子附近區(qū)域[17-18],鑒于其分布,進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)m6A可能對mRNA的剪切、3′端的加工、mRNA的出核,翻譯效率、mRNA的衰退以及對miRNA的加工發(fā)揮重要作用,從而影響多種生物學(xué)功能,包括:DNA損傷修復(fù)、晝夜節(jié)律、組織發(fā)育、性別的決定和腫瘤的發(fā)生[5,19]。
表1 TCGA PCa數(shù)據(jù)集METTL3 mRNA的表達(dá)與PCa臨床病理特征的相關(guān)性分析Tab.1 The relationship between the expression of METTL3 mRNA and clinical characteristics of prostate cancer in TCGA PCa dataset±s
表1 TCGA PCa數(shù)據(jù)集METTL3 mRNA的表達(dá)與PCa臨床病理特征的相關(guān)性分析Tab.1 The relationship between the expression of METTL3 mRNA and clinical characteristics of prostate cancer in TCGA PCa dataset±s
注:**在置信度(雙側(cè))為0.01時,相關(guān)性是顯著的
P值例數(shù)METTL3 mRNA表達(dá)水平r值294 123特征年齡≤65歲>65歲Gleason評分≤7≥8 T分期T1~T2 T3~T4 N分期8.486±2.608 8.596±2.269 0.0220.650 228 189 8.056±2.627 9.076±2.244 0.1950.000**143 274 8.331±2.416 8.616±2.557 0.0490.314 0.0570.242 N0 N1 339 78 8.450±2.514 8.815±2.489
表2 METTL3蛋白的表達(dá)與PCa臨床病理特征的相關(guān)性分析Tab.2 The relationship between the expression of METTL3 protein and clinical characteristics in prostate cancer±s
表2 METTL3蛋白的表達(dá)與PCa臨床病理特征的相關(guān)性分析Tab.2 The relationship between the expression of METTL3 protein and clinical characteristics in prostate cancer±s
注:*在置信度(雙側(cè))為0.05時,相關(guān)性是顯著的;**在置信度(雙側(cè))為0.01時,相關(guān)性是顯著的。PSA:前列腺特異性抗原。Gleason評分:PCa病理分級使用的評分系統(tǒng)
特征年齡≤65歲>65歲Gleason評分≤7≥8 PSA≤20 ng/mL>20 ng/mL T分期T1~T2 T3~T4 N分期例數(shù)METTL3蛋白表達(dá)水平AOD值r值P值18 14 0.080±0.045 0.065±0.066-0.1660.363 22 10 0.061±0.043 0.102±0.068 0.3810.031*21 11 0.064±0.048 0.091±0.064 0.4490.010**21 11 0.063±0.051 0.094±0.058 0.2290.096 N0 N1 27 5 0.079±0.057 0.043±0.023-0.2280.209
METTL3在惡性腫瘤中扮演重要角色。本實驗發(fā)現(xiàn)PCa組織中METTL3的mRNA和蛋白水平均明顯高于癌旁良性組織,且METTL3蛋白在前列腺細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中均有表達(dá)。LIN等[17]在肺癌的研究中也發(fā)現(xiàn)METTL3表達(dá)上調(diào),并在人肺癌細(xì)胞的細(xì)胞核和胞質(zhì)裂解液中分別檢測到METTL3蛋白的表達(dá),而其他甲基催化酶則只在細(xì)胞核中檢測到表達(dá),這與本實驗結(jié)果相符。該研究還運用meRIP?Seq技術(shù)發(fā)現(xiàn)人肺癌細(xì)胞系中癌基因EGFR、TAZ、MAPKAPK2(MK2)和DNMT3A的終止密碼子附近存在一個或多個m6A峰;敲低METTL3后,相關(guān)癌基因mRNA的m6A修飾水平下降,其蛋白水平也明顯下降;進(jìn)一步研究還發(fā)現(xiàn)METTL3也可以獨立于其他m6A修飾酶招募翻譯起始因子eIF3來促進(jìn)目的基因的翻譯。在白血病的研究中也表明,METTL3呈高表達(dá),并促進(jìn)了c?MYC、BCL2和PTEN癌基因的翻譯,維持急性髓系白血病的增殖[8]。CAI等[20]在乳腺癌中發(fā)現(xiàn)上調(diào) METTL3 可使腫瘤相關(guān)蛋白HBXIP的mRNA m6A修飾豐度增加,從而使其蛋白表達(dá)增加,促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖和生長,沉默METTL3后有效地抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖和促進(jìn)凋亡。然而,在宮頸癌和腎癌中METTL3呈低表達(dá),上調(diào)其表達(dá)可有效抑制腫瘤進(jìn)展,表現(xiàn)出腫瘤抑制因子的角色[21-22]。由此可見METTL3在不同腫瘤中發(fā)揮著促癌或者抑癌的雙重作用,筆者推測METTL3在PCa中發(fā)揮促癌的作用,高表達(dá)的METTL3可能促進(jìn)了PCa某些癌基因的翻譯,從而影響PCa的發(fā)生和發(fā)展。
METTL3催化mRNA的m6A修飾形成,影響著多種生物進(jìn)程。本實驗發(fā)現(xiàn),PCa中METTL3 mRNA和蛋白的水平與Gleason評分呈正相關(guān),即METTL3 mRNA和蛋白的表達(dá)水平與PCa細(xì)胞分化呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。VU等[23]在急性髓系白血病中得出相似的結(jié)論,高表達(dá)的METTL3抑制了骨髓造血干細(xì)胞的分化,敲低METTL3后急性髓系白血病細(xì)胞周期停滯,有效地促進(jìn)造血干細(xì)胞的分化。METTL3催化的mRNA m6A修飾還可以調(diào)節(jié)精原細(xì)胞的分化,促進(jìn)精子成熟[24]。LI等[25]研究還發(fā)現(xiàn)m6A修飾影響了T細(xì)胞在體內(nèi)的平衡和分化,這也暗示m6A修飾可能參與了腫瘤的免疫調(diào)節(jié)。此外,在胰腺癌的治療研究中發(fā)現(xiàn),敲低METTL3后,癌細(xì)胞對化療藥物:吉西他濱、5-氟尿嘧啶、順鉑和放療具有更高的敏感性[26],這也提示METTL3可能是腫瘤治療的一個新靶點。
PCa的診療中,PSA被作為一項有效的臨床篩查和風(fēng)險評估的指標(biāo)。本實驗發(fā)現(xiàn)METTL3蛋白的表達(dá)水平與PSA值呈正相關(guān)關(guān)系,結(jié)合METTL3與多種腫瘤的相關(guān)性,提示METTL3具有與PSA聯(lián)合作為PCa診斷標(biāo)記物的潛能。
綜上所述,本研究通過對TCGA數(shù)據(jù)集資料分析并運用Western blot、IHC技術(shù),從mRNA、蛋白水平證明METTL3在PCa中呈高表達(dá),其蛋白表達(dá)主要定位在前列腺細(xì)胞核,胞質(zhì)少量表達(dá),METTL3表達(dá)水平與Gleason評分和PSA值呈正相關(guān)。因而我們推測高表達(dá)的METTL3可能調(diào)控某些癌基因的翻譯,促進(jìn)PCa的發(fā)生、發(fā)展,影響PCa細(xì)胞的分化,同時可能與PSA聯(lián)合作為PCa的診斷標(biāo)記物。本課題組后續(xù)將擴大樣本量研究,繼續(xù)探討METTL3在PCa中的表達(dá)及臨床意義,并結(jié)合分子生物學(xué)實驗、細(xì)胞實驗進(jìn)一步闡述其在PCa可能的機制以及與其他m6A修飾酶的相互關(guān)系。