腫瘤學(xué)研究領(lǐng)域的國際權(quán)威雜志《癌癥研究》在線發(fā)表了武漢大學(xué)李楓教授團隊和中國科學(xué)院北京基因組所呂雪梅研究員最新合作研究成果。該研究以“KDM4B通過激活LINE-1促進(jìn)DNA損傷”為題,解析了組蛋白去甲基化酶(KDM4B)在腫瘤中所扮演的新角色,從全新角度揭示了KDM4B在腫瘤細(xì)胞中高表達(dá)的致病分子機理,并為腫瘤的預(yù)防和靶向治療提供了線索。
近年來,組蛋白去甲基化酶在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中所扮演的角色越來越受到重視,去甲基化酶能夠催化組蛋白H3第9位的賴氨酸三甲基化修飾(H3K9me3)的去甲基化反應(yīng),在乳腺癌、結(jié)腸癌、卵巢癌、肺癌和前列腺癌中均有高表達(dá)。
據(jù)悉,高等生物基因組中存在一類可以“跳躍”的重復(fù)序列,在漫長的歷史演變中擴增或者改變位置,對于基因組的進(jìn)化起到了重要的作用,這種序列稱為轉(zhuǎn)座子。其中有一類RNA 轉(zhuǎn)座子,又稱為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子, 是以 RNA 為媒介進(jìn)行轉(zhuǎn)座的,其復(fù)制方式通常被形容為“復(fù)制-粘貼”模式,即首先通過轉(zhuǎn)錄合成 RNA中間體,再以該 RNA 為模板逆轉(zhuǎn)錄合成 DNA 整合入基因組其他位置。
近年的研究表明,逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子在腫瘤組織中拷貝數(shù)增加,而且更活躍,但是其調(diào)控機制和生物學(xué)功能尚未很清楚。
組蛋白去甲基化酶KDM4B是一個逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子LINE-1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,并驅(qū)動進(jìn)化上年輕的LINE-1在基因組中的跳躍,引起 DNA損傷以及基因組的不穩(wěn)定,從而可能促進(jìn)了腫瘤的發(fā)生發(fā)展。該研究首次揭示了組蛋白去甲基化酶對逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的調(diào)控,并與基因組不穩(wěn)定聯(lián)系起來,從全新的角度解釋了KDM4B在腫瘤細(xì)胞中高表達(dá)的致病分子機理。
李楓課題組系統(tǒng)性的分析了在H3K9me3全基因組元件中的分布,結(jié)果顯示很大部分富集在LINE-1元件,而受KDM4B調(diào)控的H3K9me3主要分布在進(jìn)化上年輕的活躍LINE-1上。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),過表達(dá)KDM4B通過對H3K9me3的去甲基化會導(dǎo)致LINE-1拷貝數(shù)、轉(zhuǎn)座活性和DNA損傷程度增加。有趣的是,KDM4B抑制劑的使用抑制了LINE-1介導(dǎo)的DNA損傷。