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    數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度引力聚類新算法*

    2018-12-25 08:52:10溫曉芳楊志翀
    計(jì)算機(jī)與生活 2018年12期
    關(guān)鍵詞:集上引力復(fù)雜度

    溫曉芳,楊志翀,陳 梅

    蘭州交通大學(xué) 電子與信息工程學(xué)院,蘭州 730070

    1 引言

    隨著互聯(lián)網(wǎng)和信息產(chǎn)業(yè)的高速發(fā)展,數(shù)據(jù)量不斷增長,形式也呈現(xiàn)多樣化、復(fù)雜化。但傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理技術(shù)仍處于貧乏的狀態(tài)[1]。如何有效地識(shí)別各種數(shù)據(jù)集的真實(shí)結(jié)構(gòu)是數(shù)據(jù)挖掘目前面臨的一個(gè)主要問題。聚類分析作為數(shù)據(jù)挖掘的一項(xiàng)重要技術(shù)[2],能夠根據(jù)數(shù)據(jù)間的相似性識(shí)別出數(shù)據(jù)集中的內(nèi)在模式,特別適用于探索數(shù)據(jù)點(diǎn)之間的相互關(guān)系,以對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行評(píng)估[3]。然而,很多先進(jìn)的聚類算法在劃分不同類型的數(shù)據(jù)集時(shí),均遇到了精確性不高或者執(zhí)行效率較低等問題[4],因此聚類算法性能的提高勢(shì)在必行。

    目前,已有許多聚類算法被提出。其中,最經(jīng)典的基于劃分的方法有k-means和k-medoids,但是由于這兩種算法對(duì)初始中心的選取較為依賴,通常不能獲得全局最優(yōu)結(jié)果,并且只能發(fā)現(xiàn)球狀簇?;诿芏鹊囊粋€(gè)經(jīng)典聚類算法DBSCAN(density-based spatial clustering of application with noise)[5]將高密度點(diǎn)連通區(qū)域劃分為簇,它能夠識(shí)別任意形狀和任意大小簇,但當(dāng)數(shù)據(jù)集的密度變化較大時(shí),聚類質(zhì)量就會(huì)變差。OPTICS[6]通常被認(rèn)為是DBSCAN的改進(jìn)算法,它不顯示產(chǎn)生的結(jié)果簇,而是為聚類分析方便生成了一個(gè)有序的對(duì)象列表,但其依然對(duì)數(shù)據(jù)集中的密度變化較敏感。一個(gè)先進(jìn)的層次聚類方法——CHAMELEON[7]使用動(dòng)態(tài)模型通過簇間相對(duì)互連度和相對(duì)接近度將分開的小簇合并,直到最終簇形成。該算法雖然可以發(fā)現(xiàn)任意形狀簇,但其時(shí)間復(fù)雜度非常高。CURE[8]和ROCK[9]也是基于層次的聚類算法。CURE使用多個(gè)點(diǎn)表示簇,并使用隨機(jī)抽樣的方法來提高效率,從而可以有效處理大數(shù)據(jù),并且能檢測(cè)到異常點(diǎn),但其時(shí)間復(fù)雜度依然較高。相對(duì)于CURE,ROCK克服了其缺點(diǎn),但它對(duì)全局參數(shù)非常敏感,不能識(shí)別密度不均勻的數(shù)據(jù)集。AP(affinity propagation)[10]是一個(gè)根據(jù)數(shù)據(jù)點(diǎn)間相似度自動(dòng)聚類的方法。吸引度和歸屬度信息在數(shù)據(jù)點(diǎn)間迭代交換,直到高質(zhì)量的一組樣本和相應(yīng)的簇出現(xiàn)。該算法不需要用戶指定聚類個(gè)數(shù),但需事先設(shè)置參考度,且數(shù)據(jù)量大時(shí)運(yùn)行時(shí)間長。

    近年來,人們又提出了一些新的聚類方法。Attractor[11]是一個(gè)社團(tuán)檢測(cè)聚類算法。它通過檢測(cè)節(jié)點(diǎn)之間的“距離”變化,使得相同社區(qū)的節(jié)點(diǎn)互相靠近,不同社區(qū)的節(jié)點(diǎn)彼此遠(yuǎn)離,自動(dòng)在網(wǎng)絡(luò)中發(fā)現(xiàn)社區(qū)。為分析網(wǎng)絡(luò)中的社團(tuán)結(jié)構(gòu)提供了一種直觀的方法。CLUB(clustering based on backbone)[12]是一個(gè)根據(jù)簇的密度主干聚類的算法。它先將兩個(gè)互k-近鄰點(diǎn)聚在一起形成初始簇,然后取初始簇內(nèi)密度較大的半數(shù)點(diǎn),不斷吸引與其有k-近鄰關(guān)系的點(diǎn)來擴(kuò)展簇;最后將剩余不含標(biāo)簽的點(diǎn)分配給密度比它大的最近鄰所屬的簇,形成最終簇。該算法能自動(dòng)適應(yīng)不同密度,并正確檢測(cè)出簇的數(shù)目和結(jié)構(gòu),為發(fā)現(xiàn)任意簇提供了有價(jià)值的參考。一個(gè)無參聚類算法Txmeans[13]采用自頂向下分而治之的策略,迭代地將一個(gè)簇分成兩個(gè)不相交的子簇。其性能在噪聲和變化的聚類結(jié)構(gòu)上表現(xiàn)穩(wěn)定,并且可擴(kuò)展到大型數(shù)據(jù)集,為層次聚類提供了一種新的思路。Perch[14]是一個(gè)非貪心增量算法。它先將新數(shù)據(jù)點(diǎn)路由到生長樹的樹葉,然后通過旋轉(zhuǎn)操作來保持其質(zhì)量,最后以遞增的方式在數(shù)據(jù)點(diǎn)上構(gòu)建樹結(jié)構(gòu)。這種樹結(jié)構(gòu)使得有效搜索大數(shù)據(jù)集成為可能,同時(shí)為提取不同分辨率下的多個(gè)簇提供了豐富的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)。

    基于上述存在的問題,本文提出一種數(shù)據(jù)點(diǎn)間的密度引力聚類算法。從物理學(xué)角度來看,任何兩個(gè)物體間存在著萬有引力。由于數(shù)據(jù)集中的每個(gè)點(diǎn)可以看作為物體的質(zhì)點(diǎn),從而認(rèn)為兩個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)間也存在著某種引力。本文研究將這種引力與數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度建立起一種關(guān)系,稱之為密度引力。通過此引力將每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)與密度比它大且距離其最近的互近鄰點(diǎn)劃分到一起形成初始簇。然后合并具有共同點(diǎn)的初始簇,得到數(shù)據(jù)集的真實(shí)劃分。該算法可以發(fā)現(xiàn)任意簇,如實(shí)地反映了數(shù)據(jù)的實(shí)際情況。

    本文其余部分安排如下:第2章描述了數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度引力聚類算法;第3章分析比較了本文算法與對(duì)比算法在不同數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果;第4章對(duì)本文進(jìn)行總結(jié)和未來展望。

    2 密度引力聚類算法

    從物理學(xué)角度來看,任何兩個(gè)物體在自然界中是相互吸引的。數(shù)據(jù)集中的每個(gè)點(diǎn)可以看作為一個(gè)質(zhì)點(diǎn)。通過模擬事物在自然界中的運(yùn)行規(guī)律和自然狀態(tài),本文定義了密度引力的概念。進(jìn)一步,提出基于數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度引力聚類算法。

    設(shè)在歐式空間中,存在一個(gè)包含n個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的數(shù)據(jù)集D,記作D={x1,x2,…,xi,…,xn},i=1,2,…,n。其中,xi表示數(shù)據(jù)集D中的第i個(gè)點(diǎn),并且每個(gè)點(diǎn)都有p個(gè)屬性,屬性之間相互獨(dú)立,每個(gè)點(diǎn)可以表示為xi=(xi1,xi2,…,xip)。

    2.1 相關(guān)定義

    定義1(k-近鄰)對(duì)于D中的每個(gè)點(diǎn)xi,通過計(jì)算xi與D中其他點(diǎn)之間的歐氏距離并按從小到大的順序排列,其中排在前k個(gè)的點(diǎn)均被稱為xi的k-近鄰。記作Nk(xi),且Nk(xi)?D。

    定義2(互k-近鄰)設(shè)數(shù)據(jù)集D中,如果點(diǎn)xi是xj的k-近鄰點(diǎn),同時(shí)xj也是xi的k-近鄰點(diǎn),則稱xi和xj互為k-近鄰;否則,二者不互為k-近鄰。另外,xi所有的互k-近鄰記作MNk(xi)。

    定義3(點(diǎn)密度)數(shù)據(jù)集中點(diǎn)的局部密度與其周圍鄰居點(diǎn)的密集程度有關(guān)。若點(diǎn)xi的鄰居越多,鄰居距離該點(diǎn)越近,則點(diǎn)xi的密度就越大。因此定義點(diǎn)密度與其鄰居的個(gè)數(shù)成正比,與鄰居點(diǎn)到該點(diǎn)間的距離和成反比。點(diǎn)密度如式(1)所示:

    其中,ρi表示點(diǎn)xi的密度,K表示xi鄰居點(diǎn)的個(gè)數(shù),dij表示xi與其鄰居xj之間的歐氏距離。

    定義4(密度引力)自然界中任意兩個(gè)物體之間存在著引力,當(dāng)把物體看作為質(zhì)點(diǎn)時(shí),根據(jù)分布規(guī)律,本文提出兩質(zhì)點(diǎn)之間仍存在一種引力——密度引力。如式(2)所示:

    其中,F(xiàn)表示點(diǎn)xi和xj之間的密度引力,G表示一個(gè)引力常量。

    本文使用基于互k-近鄰的距離度量,彌補(bǔ)了單方向挖掘數(shù)據(jù)點(diǎn)而缺乏的信息,使得數(shù)據(jù)點(diǎn)之間的關(guān)系更加緊湊。采用這種方法可以將相關(guān)性強(qiáng)的點(diǎn)吸引進(jìn)同一個(gè)簇,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)集的真實(shí)劃分。

    2.2 聚類過程

    本文提出的密度引力聚類算法將通過三個(gè)階段來發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集中的真實(shí)簇。首先,通過式(1)獲得每個(gè)點(diǎn)的密度并尋找其互k-近鄰;然后,采用密度引力的思想形成初始簇;最后,將具有共同點(diǎn)的初始簇合并形成最終簇。具體過程如下描述。

    算法1獲得點(diǎn)密度及其互近鄰

    輸入:數(shù)據(jù)集D,最近鄰居個(gè)數(shù)k。

    輸出:每個(gè)點(diǎn)的密度ρi,互近鄰集合M。

    在第一階段,首先通過式(1)計(jì)算每個(gè)點(diǎn)的密度ρi。當(dāng)分子K依次增加1時(shí),分母依次增加一個(gè)距離diK且diK≥diK-1,因此整體點(diǎn)密度隨著K的增大而減小。然而每個(gè)點(diǎn)密度的相對(duì)大小幾乎保持不變。為了方便計(jì)算,將K設(shè)置為固定值5。然后,尋找D中每個(gè)點(diǎn)的互k-近鄰點(diǎn)(k≥K)。對(duì)于每個(gè)點(diǎn)xi,找到其k-近鄰后,依次判斷是否同時(shí)滿足條件xj∈Nk(xi)和xi∈Nk(xj),如果滿足,那么xi和xj為互k-近鄰;否則,掃描下一個(gè)點(diǎn),直到所有的點(diǎn)都被掃描完。最后,將點(diǎn)xi和其互k-近鄰放入mi中,再將所有的mi放入互近鄰集合M中。

    在第二階段,數(shù)據(jù)集中的每個(gè)點(diǎn)有三種情況:(1)沒有互k-近鄰。說明點(diǎn)xi周圍比較稀疏,成為孤立點(diǎn)的概率比較大,將該點(diǎn)獨(dú)自放在一個(gè)簇中。(2)點(diǎn)xi的密度大于其所有的互k-近鄰點(diǎn)的密度。說明點(diǎn)xi周圍的點(diǎn)比較密集,很有可能是簇的代表中心點(diǎn),且對(duì)每個(gè)互k-近鄰點(diǎn)的吸引比較大,從而將其與所有的互k-近鄰點(diǎn)聚集到同一個(gè)簇中。(3)點(diǎn)xi的密度小于或等于其所有的互k-近鄰點(diǎn)的密度。說明點(diǎn)xi的互近鄰中有比其密度大的點(diǎn),同時(shí)對(duì)xi具有很強(qiáng)的吸引力,將點(diǎn)xi分配給密度比它大且距離最近的互k-近鄰點(diǎn)形成初始簇,其中也包含密度相同的點(diǎn)。通過這種分配方式可以將密集的數(shù)據(jù)點(diǎn)劃分到同一個(gè)簇,稀疏的點(diǎn)相隔開,過于分散的點(diǎn)則被識(shí)別為異常點(diǎn)。

    算法2形成初始簇。

    輸入:每個(gè)點(diǎn)的密度ρi,互近鄰集合M。

    輸出:初始簇集合C。

    算法3合并得到最終簇

    輸入:初始簇集合C。

    輸出:最終簇集合C′。

    在第三階段,合并初始簇形成最終簇。上階段得到的初始簇都是一些比較小的簇集合,由于每個(gè)簇中的點(diǎn)相對(duì)密集,因此需要將多個(gè)具有相同數(shù)據(jù)點(diǎn)的初始簇合并,逐漸擴(kuò)大簇的規(guī)模,直到?jīng)]有可以合并的簇為止,最終形成真實(shí)的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)。采用這種方法不需要用戶輸入停止參數(shù),可以根據(jù)數(shù)據(jù)集的特點(diǎn)進(jìn)行自動(dòng)合并并停止。

    2.3 時(shí)間復(fù)雜度分析

    由于該算法使用k-d樹[15]作為數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),當(dāng)有效地檢索特定點(diǎn)給定距離內(nèi)的所有點(diǎn)時(shí),時(shí)間復(fù)雜度為O(nlbn),其中,n為數(shù)據(jù)集D中點(diǎn)的個(gè)數(shù)。在第一階段中,計(jì)算每個(gè)點(diǎn)的k個(gè)鄰居時(shí)需要花費(fèi)O(nlbn)的時(shí)間,尋找每個(gè)點(diǎn)的互k-近鄰時(shí)的時(shí)間復(fù)雜度為O(kn),其中,k為最近鄰居點(diǎn)的數(shù)量,由于k?n,因此尋找互k-近鄰的時(shí)間復(fù)雜度接近O(n)。第二階段形成初始簇時(shí),外循環(huán)中,由于依次掃描數(shù)據(jù)集中每個(gè)點(diǎn),時(shí)間復(fù)雜度為O(n);內(nèi)循環(huán)中,依次掃描每個(gè)點(diǎn)的互近鄰并進(jìn)行判斷,由于每個(gè)點(diǎn)的互近鄰個(gè)數(shù)不盡相等且遠(yuǎn)小于n,因此時(shí)間復(fù)雜度為O(mn),m為所有互近鄰的平均數(shù)且m≤k?n,從而此階段的時(shí)間復(fù)雜度接近O(n)。第三階段,合并具有相同點(diǎn)的初始簇平均時(shí)間復(fù)雜度為O(nlbn)。因此,最后整個(gè)算法的時(shí)間復(fù)雜度計(jì)算為O(nlbn)。

    3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

    為了評(píng)估算法性能,將本文提出的算法與六種對(duì)比算法分別在六個(gè)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行測(cè)試。其中,k-means(http://scikit-learn.org/stable/)、DBSCAN(http://scikitlearn.org/stable/)和 OPTICS(https://github.com/)是三種經(jīng)典算法;BOOL(binary coding oriented clustering)[16]、CLASP(towards effective and efficient mining of arbitrary shaped clusters)[17]和 CFDP(clustering by fast search and find of density peaks)[18]是三種新算法,代碼均由其作者提供。六個(gè)數(shù)據(jù)集分別為:三個(gè)二維數(shù)據(jù)集(Aggregation、Spiral、R15,https://cs.joensuu.fi/sipu/datasets/)和三個(gè)多維數(shù)據(jù)集(Ecoli、Glass、Iris,http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets.html)。

    同時(shí)使用ARI(adjusted rand index)和NMI(normalized mutual information)作為算法的評(píng)價(jià)指標(biāo)。它們的取值越大代表結(jié)果越接近真實(shí)情況。其中,用作比較的結(jié)果都是算法在數(shù)據(jù)集上的最優(yōu)取值,輸入?yún)?shù)通過迭代調(diào)整得到,具體分析如下。

    3.1 對(duì)比算法分析

    六種對(duì)比算法中的三種經(jīng)典算法已在引言中做過介紹,本節(jié)將對(duì)BOOL、CLASP和CFDP三種新算法進(jìn)行分析。

    BOOL是一個(gè)多變量數(shù)據(jù)聚類算法。它首先將所有數(shù)據(jù)點(diǎn)離散化,并用二進(jìn)制數(shù)字表示;然后使用定義的函數(shù)迭代地將所有的小簇合并,形成最終簇。盡管該算法對(duì)參數(shù)不敏感,且比一些算法更快,但在一些數(shù)據(jù)集上仍不能獲得正確劃分。

    CLASP首先通過刪除異常值來自動(dòng)縮小數(shù)據(jù)集的大小,使用k-means算法找到代表點(diǎn)來有效保持簇的形狀信息。然后,調(diào)整代表點(diǎn)的位置以提高它們的內(nèi)在關(guān)系,使得每個(gè)代表點(diǎn)更接近其鄰居同時(shí)遠(yuǎn)離其他點(diǎn)。最后它在基于互k-近鄰相似性度量下執(zhí)行凝聚聚類來識(shí)別簇結(jié)構(gòu)。不過,運(yùn)行時(shí)需要過多的參數(shù),而這些參數(shù)都不太容易確定[3]。

    CFDP的核心思想在于聚類中心的刻畫,聚類中心同時(shí)具有以下特點(diǎn):簇中心的密度大,由一些局部密度比較低的點(diǎn)圍繞,并且這些點(diǎn)距離其他高局部密度點(diǎn)的距離比較大。該算法使得簇的數(shù)量直觀出現(xiàn),離群值不論形狀和維度被自動(dòng)發(fā)現(xiàn)。然而,需要計(jì)算所有的點(diǎn)與點(diǎn)之間的距離,如果樣本太大,整個(gè)距離矩陣的內(nèi)存開銷特別大。

    3.2 算法難點(diǎn)與創(chuàng)新點(diǎn)分析

    本文算法特點(diǎn)在于通過將數(shù)據(jù)點(diǎn)分配給距離其最近且密度比它大的互近鄰點(diǎn)來形成初始簇,從而可以自動(dòng)識(shí)別數(shù)據(jù)集中任意簇。在對(duì)比算法中,kmeans將事先隨機(jī)確定的每個(gè)簇中心點(diǎn)看作為初始簇,然后就近分配其他點(diǎn),導(dǎo)致算法對(duì)初始簇具有一定的依賴性;CLASP同樣采用k-means找到簇中心并不斷調(diào)整形成初始簇,使得其最終簇與初始簇的形成緊密相關(guān);BOOL則通過將數(shù)據(jù)點(diǎn)離散化后用二進(jìn)制數(shù)字表示來形成初始簇,使得空間相對(duì)位置較近的數(shù)據(jù)點(diǎn)聚在一起。由于本文算法是根據(jù)數(shù)據(jù)點(diǎn)密度將每個(gè)點(diǎn)分配給其最緊密的互近鄰點(diǎn)形成初始簇,從而總是將關(guān)系最近的數(shù)據(jù)點(diǎn)聚在一起,使得算法整個(gè)過程對(duì)初始簇的形成沒有依賴性。

    3.3 二維數(shù)據(jù)集實(shí)驗(yàn)分析

    表1描述了本文算法與六種對(duì)比算法在二維數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,其中包含了算法最優(yōu)結(jié)果的參數(shù)值、ARI和NMI值。參數(shù)中k為最近鄰居的個(gè)數(shù),m為簇的數(shù)目。DBSCAN的兩個(gè)參數(shù)分別表示鄰居半徑和最小鄰居數(shù);BOOL的三個(gè)參數(shù)分別為簇個(gè)數(shù)的下界、距離參數(shù)、異常點(diǎn)參數(shù);CLASP的五個(gè)參數(shù)分別表示簇個(gè)數(shù)、最近鄰居數(shù)、數(shù)據(jù)集尺寸的調(diào)整參數(shù)、降維標(biāo)志和迭代最大次數(shù)。從表中清楚地看出,本文算法聚類結(jié)果與CFDP一樣優(yōu)于其他算法,評(píng)價(jià)指標(biāo)值高達(dá)0.99以上,更符合真實(shí)情況。

    3.3.1 Aggregation數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)分析

    圖1展示了本文算法與六種對(duì)比算法在Aggregation數(shù)據(jù)集上的結(jié)果。此數(shù)據(jù)集的特征是簇內(nèi)密度比較均勻,簇間密度差異不大,且簇的形狀是任意的。其中圖1(a)是Aggregation的真實(shí)情況,圖1(b)~圖1(h)是各種算法的聚類結(jié)果。

    顯然地,CFDP可以正確地識(shí)別出整個(gè)數(shù)據(jù)集的真實(shí)簇。其次,本文算法通過使用數(shù)據(jù)點(diǎn)間密度關(guān)系在互近鄰中聚類使得相同簇中的點(diǎn)相互吸引,不同簇中的點(diǎn)自然分開,從而能夠發(fā)現(xiàn)任意形狀的簇,與真實(shí)結(jié)果最接近,僅僅相差三個(gè)點(diǎn)。k-means由于受初始簇中心的影響,導(dǎo)致最終的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)被硬性分成七個(gè)簇,每個(gè)簇都是圍繞其中心點(diǎn)的一個(gè)球狀簇,從而沒能將該數(shù)據(jù)集的特征很好地體現(xiàn)出來。同理CLASP對(duì)最終的識(shí)別也不是很好。DBSCAN由于受密度參數(shù)影響,一部分簇邊緣的點(diǎn)被錯(cuò)誤劃分。作為DBSCAN的優(yōu)化算法,OPTICS結(jié)果有所改善,但仍有少數(shù)點(diǎn)無法被正確識(shí)別。同樣地,BOOL則將同一個(gè)簇中的部分點(diǎn)視為異常點(diǎn),最終導(dǎo)致劃分不夠精確。

    Table 1 Comparison results on 2-dimensional data sets表1 二維數(shù)據(jù)集上的對(duì)比結(jié)果

    Fig.1 Comparison results on data setAggregation圖1 Aggregation數(shù)據(jù)集上的比對(duì)結(jié)果圖

    3.3.2 Spiral數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)分析

    圖2展示了數(shù)據(jù)集Spiral上本文算法與六種對(duì)比算法的聚類結(jié)果。此數(shù)據(jù)集的形狀是螺旋型,且每個(gè)簇內(nèi)數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度由里到外逐漸變小,簇間距離相似。其中圖2(a)是 Spiral的真實(shí)情況,圖2(b)~圖2(h)是各種算法的最優(yōu)結(jié)果。

    Fig.2 Comparison results on data set Spiral圖2 Spiral數(shù)據(jù)集上的比對(duì)結(jié)果圖

    從圖2可以清楚地看出,本文算法的聚類結(jié)果與DBSCAN和CFDP一樣完全符合數(shù)據(jù)集真實(shí)情況。算法同時(shí)考慮密度與距離,使得數(shù)據(jù)集中各個(gè)簇自動(dòng)發(fā)現(xiàn),然后通過相同點(diǎn)串聯(lián)的方式實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)集的真實(shí)劃分。除此之外,其他算法聚類結(jié)果均不是很理想。k-means和CLASP一樣,受初始簇中心選取的影響,沒有考慮到密度,只是將整個(gè)數(shù)據(jù)集平均分成了三部分,導(dǎo)致大部分點(diǎn)被錯(cuò)誤劃分。OPTICS由于受密度差異影響,密度較大的點(diǎn)實(shí)現(xiàn)了正確劃分,而其他密度較小的點(diǎn)均被視為異常點(diǎn)。最后,BOOL則根據(jù)數(shù)據(jù)點(diǎn)的位置將整個(gè)數(shù)據(jù)集劃分成多個(gè)不同的小簇,合并后仍沒有很好地將真實(shí)簇識(shí)別出。

    3.3.3 R15數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)分析

    圖3顯示了本文算法與六種對(duì)比算法在數(shù)據(jù)集R15上的聚類結(jié)果。該數(shù)據(jù)集的特點(diǎn)是每個(gè)簇內(nèi)密度不均勻,簇間距離各有不同,且均為球狀簇。其中圖3(a)是R15的真實(shí)情況,圖3(b)~圖3(h)是各種算法的最優(yōu)結(jié)果。

    不難看出,本文算法與k-means、CFDP一樣可以發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集的真實(shí)結(jié)構(gòu),性能優(yōu)于其他幾種對(duì)比算法。通過對(duì)密度和距離的雙重考慮,本文算法不僅可以很好地發(fā)現(xiàn)任意形狀簇,還可以發(fā)現(xiàn)球狀簇。其次,DBSCAN受簇內(nèi)密度差異影響,將每個(gè)簇中密度較小的點(diǎn)劃分為同一個(gè)簇,導(dǎo)致簇中部分點(diǎn)被錯(cuò)誤劃分。相似地,OPTICS則將同一個(gè)簇中密度相對(duì)較小的點(diǎn)錯(cuò)誤地識(shí)別為異常點(diǎn)。同樣,BOOL和CLASP也沒能很好地檢測(cè)出真實(shí)簇。

    Fig.3 Comparison results on data set R15圖3 R15數(shù)據(jù)集上的比對(duì)結(jié)果圖

    Table 2 Comparison results on multi-dimensional data sets表2 多維數(shù)據(jù)集上的對(duì)比結(jié)果

    3.4 多維數(shù)據(jù)集實(shí)驗(yàn)分析

    表2描述了本文算法與六種對(duì)比算法在數(shù)據(jù)集Ecoli、Glass和Iris上的聚類結(jié)果。Ecoli數(shù)據(jù)集用于預(yù)測(cè)細(xì)胞蛋白質(zhì)定位位點(diǎn),七個(gè)屬性分別為Mc-Geoch信號(hào)序列識(shí)別方法、von Heijne信號(hào)序列識(shí)別方法、von Heijne信號(hào)肽酶II共有序列評(píng)分、預(yù)測(cè)的脂蛋白的N-末端存在電荷、外膜和周質(zhì)蛋白的氨基酸含量的判別分析得分、ALOM膜跨越區(qū)域預(yù)測(cè)程序的評(píng)分和從序列中排除可能的可切割信號(hào)區(qū)域之后的ALOM程序得分。Glass是對(duì)玻璃種類進(jìn)行分類的數(shù)據(jù)集,九個(gè)屬性包括折射率、鈉、鎂、鋁、硅、鉀、鈣、鋇和鐵含量。Iris描述了鳶尾植物類,四個(gè)屬性分別為:萼片長度、萼片寬度、花瓣長度和花瓣寬度。明顯地,在二維數(shù)據(jù)集上CFDP的聚類性能與本文算法相當(dāng),在多維數(shù)據(jù)集上,本文算法的聚類結(jié)果評(píng)價(jià)指標(biāo)均高于其他算法,說明其能更好地發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集中真實(shí)情況。

    最后,將七種算法在六個(gè)數(shù)據(jù)集上的評(píng)價(jià)指標(biāo)結(jié)果值用箱線圖直觀地表示,如圖4、圖5所示。二者分別描述了每種算法的六個(gè)ARI和NNI統(tǒng)計(jì)值的對(duì)比情況。其中,每個(gè)箱形有以下特征,分別為:箱體上下邊界位置對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)的上下四分位數(shù)(Q3和Q1);箱內(nèi)的虛線段為中位線位置,表示六個(gè)指標(biāo)值的中位數(shù);箱體最上方和最下方的實(shí)線稱為內(nèi)限,分別表示數(shù)據(jù)的最大和最小非異常值;+表示異常值。

    從圖4、圖5可以看出,本文算法對(duì)應(yīng)的箱線圖中各條線段所處位置(包含異常點(diǎn))幾乎都高于其他算法對(duì)應(yīng)的箱線圖,說明該算法的聚類性能優(yōu)于其他對(duì)比算法。綜上所述,新算法采用互近鄰的方法使關(guān)系緊湊的點(diǎn)聚集到一起,同時(shí)使用密度引力的思想在不論維度和形狀的情況下自動(dòng)發(fā)現(xiàn)任意簇,算法整體具有魯棒性。

    Fig.4 ARI comparison result of 7 kinds of algorithms圖4 7種算法聚類ARI值的對(duì)比圖

    4 結(jié)束語

    Fig.5 NMI comparison result of 7 kinds of algorithms圖5 7種算法聚類NMI值的對(duì)比圖

    為了解決聚類中精確性不高、執(zhí)行效率低等問題,本文提出了一個(gè)基于數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度引力聚類算法。該算法根據(jù)數(shù)據(jù)點(diǎn)的分布情況定義了密度引力的概念,通過密度引力使得自動(dòng)發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集中真實(shí)簇。為驗(yàn)證算法的高效性,使用六種先進(jìn)算法在六種不同維度和類型的數(shù)據(jù)集上與新算法進(jìn)行對(duì)比實(shí)驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)本文提出的新算法在性能上優(yōu)于其他算法。在未來的研究中,擬嘗試研究出更多高效的算法以便于聚類分析。

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