張露, 溫睿, 李雪, 孟清, 林瑛
(1. 東華大學(xué) 生物科學(xué)與技術(shù)研究所; 2. 東華大學(xué) 環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院, 上海 201620)
蜘蛛可產(chǎn)生6種蛛絲和一種黏合物,包括主壺腹腺絲(MaSp)、次壺腹腺絲(MiSp)、鞭狀腺絲(FlSp)、葡萄狀腺絲(AcSp)、管狀腺絲(TuSp)、梨狀腺絲(PySp),不同的蛛絲分別具有不同生理功能和材料學(xué)性能,在蜘蛛的生命歷程中扮演著不同的角色[1-8]。如主壺腹腺絲、鞭狀腺絲等,因其優(yōu)異的強(qiáng)度或彈性等材料學(xué)性能在生物材料領(lǐng)域具有極大的潛在應(yīng)用價(jià)值,引起研究者的研究熱潮[9-13]。黏合物(ASG)是由聚狀腺體(aggregate silk gland)分泌,由ASG1和ASG2兩種蛋白組成[14-16]。黏合物能夠形成膠滴,以一定距離附著于鞭狀腺絲的表面,構(gòu)成具有極佳黏性的捕獲絲,能夠黏附獵物,防止其逃脫,對于蜘蛛捕獲獵物具有重要作用[15]。不同于上述幾種蛛絲,黏合物在天然狀態(tài)下不是以絲纖維的形態(tài)存在,因此對其的結(jié)構(gòu)功能研究和仿生應(yīng)用研究較少。
但是現(xiàn)有研究者對黏合物的組分進(jìn)行了探索研究[15],證明其組份ASG1屬于節(jié)肢動(dòng)物基因家族,編碼圍食基質(zhì)蛋白;而其一個(gè)組份ASG2,其基因結(jié)構(gòu)和序列特征卻與蛛絲蛋白的基因相似,屬于蛛絲蛋白家族,因此ASG2成絲也稱為聚狀腺蛛絲蛋白(aggregate spidroin 1: AgSp1)。同時(shí)也有研究者對AGS2進(jìn)行了外源重組表達(dá),發(fā)現(xiàn)AGS2在剪切力的作用下能夠形成絲纖維,也可通過濕紡的方式成絲[14];并且黏合物有其獨(dú)特的材料學(xué)性能,例如一種圓網(wǎng)蜘蛛角類肥蛛(Larinioidescornutus)的一個(gè)單一膠滴可以承受400 μN(yùn)的拉伸力,其可延展至800 μm3[17],所以ASG2也具有作為生物材料的潛在應(yīng)用價(jià)值,并且可能提供一種新型生物材料。因此,對AGS2蛋白的結(jié)構(gòu)功能研究和仿生應(yīng)用等方面的探索具有重要意義。
由已報(bào)道的絡(luò)新婦蛛(Nephilaclavipes)的ASG2蛋白的cDNA可知[15-16],ASG2蛋白同樣可分為N端非重復(fù)區(qū)(NT)、C端非重復(fù)區(qū)(CT)和中間重復(fù)模塊(RP),這與其他6種蛛絲蛋白的氨基酸序列特征相似[1, 3, 18]。隨著蛛絲蛋白研究的不斷深入,蛛絲蛋白各個(gè)模塊的結(jié)構(gòu)和功能逐漸明了,對于蛛絲的仿生具有重要的指導(dǎo)意義。研究表明,NT主要作用于蛛絲蛋白的高濃度儲(chǔ)存過程[19-20],RP是蛛絲蛋白成絲的負(fù)責(zé)模塊[21-22],而CT則是在蛛絲蛋白的成絲過程中具有重要作用[23-25]。目前,僅報(bào)道了MiSp、MaSp、AcSp的CT高級(jí)結(jié)構(gòu),對其功能也進(jìn)行了闡述[23-26]。研究表明,蛛絲蛋白CT的高級(jí)結(jié)構(gòu)雖具有一定的保守性,但是仍然存在一定的差異,也導(dǎo)致了不同蛛絲蛋白的CT的功能不同。而對ASG2 CT的結(jié)構(gòu)功能的相關(guān)研究更是少數(shù),因此ASG2 CT編碼基因材料的獲取、結(jié)構(gòu)功能的研究是非常必要的,這是后續(xù)ASG2蛋白仿生應(yīng)用的理論基礎(chǔ)。
因此,為了豐富ASG2 CT的編碼基因材料,我們利用錨定PCR方法,在本研究中首次獲取了大腹園蛛(Araneusventricosus) ASG2的C端非重復(fù)區(qū)編碼基因AvAGS2CT,并在大腸桿菌中對其進(jìn)行了重組表達(dá);進(jìn)一步利用圓二色譜(CD),對AvAGS2CT蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了初步探索分析,這為后續(xù)的ASG2 CT高級(jí)結(jié)構(gòu)解析和功能研究奠定了基礎(chǔ),例如為探索ASG2 CT在ASG2成絲過程中的作用等提供一定的理論支持。
質(zhì)粒抽提試劑盒、膠回收試劑盒、PCR產(chǎn)物回收試劑盒等購于生工生物工程股份有限公司(上海,中國);PCR相關(guān)試劑購于NEB公司(美國);T4連接酶、限制性內(nèi)切酶購于天根生化科技有限公司(北京,中國);Thermo Fisher Scientific公司(美國);表達(dá)宿主E.coli(DH5α和BL21)購于天根生化科技有限公司(北京,中國);蛋白純化相關(guān)試劑購于Qiagen公司(德國);Western-blot相關(guān)試劑購于Invitrogen 公司(美國);引物合成和基因測序反應(yīng)在上海睿迪生物有限公司進(jìn)行(上海,中國)。
1.2.1 目的基因的獲取
根據(jù)NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中一段EST序列(expressed sequence tag sequences) (GenBank: AT006577.1)設(shè)計(jì)兩條同向特異性外側(cè)引物Av glue F1和內(nèi)側(cè)引物Av glue F2,同時(shí)設(shè)計(jì)接頭引物AL和AS(序列見表1)。具體錨定PCR步驟:提取大腹園蛛基因組DNA為模板,加入外側(cè)特異性引物Av glue F1進(jìn)行單引物擴(kuò)增,PCR條件如下:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,72℃再延伸10 min,35個(gè)循環(huán);隨后對回收的PCR產(chǎn)物進(jìn)行加尾,利用TdT末端加尾酶進(jìn)行在PCR產(chǎn)物的3′端加C,反應(yīng)條件如下:PCR回收產(chǎn)物19 μL,TdT末端加尾酶buffer 9 μL,dCTP 1 μL,TdT末端加尾酶1μL,置于37℃,反應(yīng)15 min;回收加尾產(chǎn)物,并以此為模板,加入外側(cè)特異性引物Av glue F1和接頭引物AL進(jìn)行常規(guī)PCR,PCR條件如下:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,72℃再延伸10 min,35個(gè)循環(huán)。取1 μL上述PCR產(chǎn)物作為模板,加入內(nèi)側(cè)特異性引物Av glue F2和接頭引物AS進(jìn)行常規(guī)PCR,PCR條件如下:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸1 min,72℃再延伸10 min,35個(gè)循環(huán);進(jìn)行第二次常規(guī)PCR;隨后對該P(yáng)CR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳并切膠回收,送上海睿迪生物有限公司進(jìn)行測序。將上述測序結(jié)果與NCBI中已知ASG2序列進(jìn)行拼接,得到大腹園蛛ASG2 CT的完整編碼序列AvASG2CT序列。
表1 引物序列
注:下劃線所示為限制性酶切位點(diǎn)
1.2.2 重組質(zhì)粒的克隆構(gòu)建
根據(jù)上述獲得的目標(biāo)序列設(shè)計(jì)引物Glue2CT-P1和Glue2CT-P2,以基因組DNA為模板進(jìn)行PCR,PCR條件如下:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,53℃退火30 s,72℃延伸30 s,72℃再延伸10 min,35個(gè)循環(huán)。對PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收,并進(jìn)行BamH I和XhoI雙酶切;同時(shí)對修飾過的pet-32表達(dá)質(zhì)粒載體pet-M (含有6His-tag和凝血酶位點(diǎn))進(jìn)行BamH I和XhoI雙酶切;利用T4連接酶連接目標(biāo)插入片段與質(zhì)粒表達(dá)載體得到重組表達(dá)質(zhì)粒pet-M-AvAGS2CT;轉(zhuǎn)化大腸桿菌克隆菌株DH5α,進(jìn)行平板過夜培養(yǎng);挑取單克隆進(jìn)行液體培養(yǎng),抽取質(zhì)粒后,再進(jìn)行雙酶切鑒定和PCR鑒定,最后將陽性克隆送往上海睿迪生物有限公司進(jìn)行測序。
利用ClustalW2對AvASG2CT序列與已知的同源序列進(jìn)行比對分析,已知的同源序列從NCBI網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)獲得,其GenBank號(hào)等詳細(xì)信息見表2;利用psipred網(wǎng)站(http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/)對AvASG2CT進(jìn)行蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測;利用Geneious7軟件進(jìn)行進(jìn)化樹(phylogenetic tree)分析。
表2 已報(bào)道的AGS2 CT序列
將重組表達(dá)質(zhì)粒pet-M-AvAGS2CT,轉(zhuǎn)化大腸桿菌表達(dá)菌株BL21(DE3),進(jìn)行平板過夜培養(yǎng);挑取單克隆,接種于10 mL LB中,37℃、200 r/min進(jìn)行過夜培養(yǎng);隨后轉(zhuǎn)接于1 L LB中進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),37℃、200 r/min,培養(yǎng)至OD600約0.6~0.8,加入終濃度0.3 mmol/L的IPTG,20℃、200 r/min,進(jìn)行過夜誘導(dǎo)表達(dá);上述所用到的液體LB培養(yǎng)基中均含有終濃度100 μg/mL的Amp (氨芐青霉素)。
4000 r/min、20 min離心收集過夜誘導(dǎo)的菌體,加入50 mL lysis buffer (20 mmol/L Tris,pH 8.0)進(jìn)行重懸;隨后利用高壓破碎儀JN-3000 plus (廣州,中國)進(jìn)行菌體破碎,1200 bar;后10 000 r/min、40 min離心收集上清;根據(jù)Qiagen鎳柱使用說明進(jìn)行目標(biāo)蛋白純化,將上清與Ni-NTA柱子結(jié)合,利用wash buffer (20 mmol/L Tris,20 mmol/L 咪唑,pH 8.0),對柱子進(jìn)行沖洗,利用elute buffer (20 mmol/L Tris,250 mmol/L 咪唑,pH 8.0)對目標(biāo)蛋白進(jìn)行洗脫;隨后在收集的目標(biāo)蛋白中加入凝血酶,以切除目標(biāo)蛋白上的6His-tag,同時(shí)透析于2 L 10 mmol/L PB buffer (pH 7.0)中,每2 h換一次buffer,重復(fù)3次,以透析去除咪唑。
利用15%的SDS-PAGE檢測目標(biāo)蛋白的表達(dá)純化情況;利用6His-tag的特異性抗體對目標(biāo)蛋白進(jìn)行Western-blot免疫印跡,以對目標(biāo)蛋白進(jìn)行定性;Western-blot操作步驟按照標(biāo)準(zhǔn)操作步驟進(jìn)行,一抗(6His-tag的特異性抗體)以1∶5000加入;特異性的二抗以1∶5000加入;加入Invitrogen的ECL底物進(jìn)行顯色反應(yīng);后進(jìn)入暗室壓片。
對目標(biāo)蛋白AvAGS2CT進(jìn)行了圓二色譜(CD)測試,將透析后的目標(biāo)蛋白以0.5 mg/mL的終濃度利用 (Jasco J-810 spectropolarimeter)進(jìn)行CD測試,條件如下:25℃,掃描波長190~260 nm,0.1 mm比色皿,wavelength step 1 nm,掃3次平均,得到CD圖譜。
為獲取大腹園蛛(Araneusventricosus)黏合蛋白(聚合腺絲)ASG2的CT的編碼基因,利用其同源序列十字園蛛(Araneusdiadematus)的AGS2部分編碼序列(GenBank No KU132350.1)在NCBI中進(jìn)行序列搜索,找到一段EST序列(GenBank No.AT006577.1),該EST序列屬于大腹園蛛的cDNA文庫;通過序列比對分析,兩個(gè)序列的同源性可達(dá)89%,因此推測該段EST序列為大腹園蛛ASG2的部分編碼基因。所以,根據(jù)該段EST序列設(shè)計(jì)特異性引物,進(jìn)行單引物擴(kuò)增,利用接頭引物,進(jìn)行兩輪常規(guī)PCR擴(kuò)增。由圖1-A可見,目標(biāo)條帶被特異性擴(kuò)增。但是由于模板是將單引物擴(kuò)增產(chǎn)物,利用TdT末端加dCTP后所得到的,所以PCR擴(kuò)增得到的條帶大小不一;因此,將圖1-A中較亮的條帶約900 bp膠回收后,進(jìn)行測序反應(yīng)。
A:單引物擴(kuò)增后的第二輪PCR結(jié)果圖,M: DNA ladder;lane 1~6:第二輪PCR結(jié)果。B:以基因組為模板PCR擴(kuò)增AvASG2CT序列結(jié)果圖,M: DNA ladder;lane 1-3:PCR平行樣;lane 4:陰性對照
圖1AvASG2CT基因序列獲取PCR結(jié)果圖
Fig 1 The PCR results of theAvASG2CTgene obtaining
黑色框所示為AvASG2CT的終止密碼子;紅色框所示為AATAAA保守元件
圖2單引物擴(kuò)增獲得的AvASG2CT下游編碼序列
Fig 2 The downstream sequence of theAvASG2CT
from the single primer PCR
圖2展示了上述測序結(jié)果,分析序列可知,在開放閱讀框的后方發(fā)現(xiàn)了終止密碼子(圖2中黑色方框所示),且在其下游序列發(fā)現(xiàn)了AATAAA保守元件(圖2中紅色方框所示),其為轉(zhuǎn)錄成mRNA ployA的保守性元件[27]。因此,可以初步確定獲得了大腹園蛛ASG2 CT的下游完整編碼序列。
將測序結(jié)果與NCBI中已知的序列(GenBank No.AT006577.1)進(jìn)行拼接后,得到完整的AvASG2CT編碼序列,其氨基酸序列如圖3中三角所示。隨后,根據(jù)該編碼序列設(shè)計(jì)特異性引物Glue2CT-P1和Glue2CT-P2,以基因組為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,對該序列進(jìn)行回歸驗(yàn)證,如圖1(B)所示,得到了特異性的目標(biāo)條帶,條帶大小與理論值398 bp相符;將該P(yáng)CR產(chǎn)物克隆到質(zhì)粒載體pet-M中得到pet-M-AvAGS2CT,挑取陽性重組子進(jìn)行測序,將得到的序列與上述單引物擴(kuò)增得到序列進(jìn)行比對分析可知,兩次得到的序列完全一致,因此可確定成功獲取了大腹園蛛AvASG2CT的完整編碼序列。
圓柱示為 5 個(gè) α-helix (H1-H5);AvASG2CT序列為三角形所示
圖3不同蜘蛛種屬的ASG2 CT序列比對分析
Fig 3 The sequence align of the CT of ASG2 from different spider species
將獲得的AvASG2CT序列與現(xiàn)今已報(bào)道的AGS2 CT序列進(jìn)行比對分析可知, 不同種屬的蜘蛛的ASG2 CT,在初級(jí)結(jié)構(gòu)上具有較高的保守性,同源性可達(dá)55%。其中,本次獲得的AvASG2CT序列與十字園蛛(Araneusdiadematus)ASG2 CT(圖3中序列A.d.ASG2)的序列保守性可達(dá)92%,與黑寡婦蜘蛛(Latrodectushesperus) ASG2 CT(圖3中序列L.h.ASG2)的序列保守性可達(dá)44.8%,與絡(luò)新婦蛛(Nephilaclavipes) ASG2 CT(圖3中序列N.c.ASG2)的序列保守性可達(dá)63.2%,與格羅薩肥腹蛛(Steatodagrossa) ASG2 CT(圖3中序列S.g.ASG2)的序列保守性可達(dá)41.6%。
AvASG2CT蛋白序列由三角形所示
圖4不同種屬蜘蛛的ASG2 CT進(jìn)化樹分析
Fig 4 The phylogenetic tree of CT of ASG2 from different spider species
同時(shí),將獲得的AvASG2CT與已報(bào)道的其他種屬蜘蛛的ASG2 CT進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化樹分析。由系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果(圖4)可知,AvASG2CT與十字園蛛(Araneusdiadematus)的親緣關(guān)系最為相近,與上述序列保守性分析一致。因此,通過上述基因組PCR驗(yàn)證及序列比對分析和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析可確定獲得的AvASG2CT序列即為大腹園蛛AGS2 CT的編碼序列。
將重組質(zhì)粒pet-M-AvAGS2CT轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21,外源表達(dá)AvAGS2CT蛋白。pet-M質(zhì)粒載體源于改造過的pet-32系列載體,其含有純化標(biāo)簽6His-tag,可用于鎳柱純化和免疫印跡分析;且6His-tag標(biāo)簽下游即為凝血酶位點(diǎn),可用于切除標(biāo)簽,以去除標(biāo)簽對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能的影響。
利用鎳柱對目標(biāo)蛋白AvAGS2CT進(jìn)行親和純化,純化結(jié)果如圖5中SD-PAGE (Coomassie strained)所示,lane I為誘導(dǎo)后總蛋白樣,在14.4 ku marker大小處,與誘導(dǎo)前總蛋白樣lane N相比,出現(xiàn)大量表達(dá)的條帶,與目標(biāo)蛋白AvAGS2CT理論值15.3 ku相符,說明AvAGS2CT蛋白成功在大腸桿菌BL21中得到大量表達(dá),且絕大部分在上清中(lane S),沉淀中幾乎沒有目標(biāo)蛋白的存在(lane P),說明目標(biāo)蛋白以可溶的形式存在于上清中,同時(shí)也說明菌體破碎得較為徹底;用含有20 mmol/L咪唑的wash buffer對鎳柱中的非特異性結(jié)合的雜蛋白進(jìn)行沖洗,如lane W所示,泳道中既沒有雜蛋白的存在也沒有出現(xiàn)目標(biāo)蛋白,說明雜蛋白洗脫效果較好;隨后利用含有250 mmol/L咪唑的elution buffer對目標(biāo)蛋白進(jìn)行洗脫收集,如lane E1所示,所獲得的目標(biāo)蛋白純度可達(dá)90%以上。由序列分析可知,目標(biāo)蛋白AvAGS2CT序列中含有一個(gè)半胱氨酸Cys,推測可形成分子間二硫鍵,因此制備了非還原樣E1′(不含有還原劑DTT等),如lane E1′所示,確實(shí)有部分目標(biāo)蛋白AvAGS2CT形成了二聚體。為去除6His-tag,以減少其對目標(biāo)蛋白AvAGS2CT結(jié)構(gòu)功能的影響,利用凝血酶在透析過程中,對純化標(biāo)簽進(jìn)行切除,如lane T所示,去除標(biāo)簽后目標(biāo)蛋白符合理論值大小13.7 ku,表明6His-tag成功從目標(biāo)蛋白被切除;目標(biāo)蛋白經(jīng)過鎳柱親和純化和標(biāo)簽切除,最終的產(chǎn)量約75 mg/mL。經(jīng)過透析和標(biāo)簽切除的目標(biāo)蛋白樣品用于后續(xù)的CD測試。
同時(shí),為了對目標(biāo)蛋白AvAGS2CT(未切除6His-tag的目標(biāo)蛋白樣E1)進(jìn)行定性分析,利用6His-tag的特異性的抗體,對其進(jìn)行了Western-blot檢測。如圖5所示(Anti His),經(jīng)過免疫印跡成功檢測到了目標(biāo)條帶的存在,且條帶位置大小與理論值相符,因此,可進(jìn)一步證明目標(biāo)蛋白AvAGS2CT成功在體外得到表達(dá)純化。
M:蛋白質(zhì)marker;N:誘導(dǎo)前;I:誘導(dǎo)后;P:沉淀;S:上清;FT:穿柱液;W:沖洗;E1:洗脫樣;E1′:還原樣;T1:去標(biāo)簽樣;T1′:去標(biāo)簽還原樣
圖5AvAGS2CT蛋白表達(dá)的SDS-PAGE和Western-blot分析
Fig 5 SDS-PAGE and Western-blot analysis of the expression of AvAGS2CT
圖6 AvASG2CT的CD圖譜
為分析AvASG2CT蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),首先對其進(jìn)行預(yù)測,由預(yù)測結(jié)果可知,AvASG2CT蛋白包含5個(gè)α-helix (H1-H5),圖3中紅色圓柱所示。隨后,對AvASG2CT蛋白進(jìn)行CD測試,以檢測其二級(jí)結(jié)構(gòu)。其CD圖譜顯示(圖6),AvASG2CT蛋白在193 nm處有正吸收峰,在208 nm和222 nm處有負(fù)吸收峰,均為α-helix的特征吸收峰;該圖譜顯示AvASG2CT蛋白在溶液中以α-helix的構(gòu)象存在,與預(yù)測結(jié)果相符。
蛛絲蛋白的末端重復(fù)模塊NT和CT,在蛛絲蛋白的高濃度儲(chǔ)存和成絲過程中扮演著重要角色。目前,僅有MaSp (主壺腹腺絲蛋白)的NT的高級(jí)結(jié)構(gòu)和功能得到解析,研究表明其單體包含5個(gè)α-helix,以同向平行二聚體的形式,在pH值依賴條件下,在蛛絲蛋白儲(chǔ)存和成絲過程中發(fā)揮作用[20, 28]。而蛛絲蛋白的CT則主要是在成絲過程中發(fā)揮作用,已報(bào)道的CT結(jié)構(gòu)表明,不同蛛絲蛋白的高級(jí)結(jié)構(gòu)具有一定的保守性,其單體均包含5個(gè)α-helix,以同向平行的方式發(fā)揮功能;但是其結(jié)構(gòu)仍具有一定的差異,且功能也各不相同。如,MaSp的CT二聚體以鹽鍵和二硫鍵維持結(jié)構(gòu),能夠影響主壺腹腺絲蛋白重復(fù)模塊的成絲質(zhì)量,融合CT的重復(fù)模塊形成的絲纖維更為有序[24];MiSp的CT二聚體以分子間疏水作用力維持其結(jié)構(gòu),在次壺腹腺絲蛋白的成絲過程扮演著晶核的作用,能夠觸發(fā)絲纖維的形成[25];AcSp的CT二聚體同樣以鹽鍵等分子間作用力維持結(jié)構(gòu),對葡萄狀腺絲蛋白重復(fù)模塊具有調(diào)控作用,但是有無CT,葡萄狀腺絲蛋白重復(fù)模塊形成的絲纖維沒有較大的差異[29]。因此,可以看出雖然CT的高級(jí)結(jié)構(gòu)具有一定的保守性,但是其結(jié)構(gòu)和功能卻不盡相同;所以研究不同蛛絲蛋白的CT結(jié)構(gòu)功能研究是非常重要的,這是蛛絲蛋白的仿生應(yīng)用的所必須的。
但是迄今為止,關(guān)于ASG2的研究非常少,尤其是關(guān)于ASG2的結(jié)構(gòu)功能研究和仿生應(yīng)用。目前已經(jīng)證明,ASG2屬于蛛絲蛋白類[15],且已有研究者嘗試對ASG2進(jìn)行重組表達(dá),表明ASG2具有形成絲纖維的潛能[14]。由已發(fā)表的絡(luò)新婦蛛(Nephilaclavipes) ASG2的cDNA序列可知[14, 16],ASG2的重復(fù)模塊不同于MaSp含有大量的polyA模塊,也不同于鞭狀腺蛛絲蛋白(FlSp)含有大量的GPGGX和GGA模塊,造成重組的MaSp或FlSp外源表達(dá)非常困難,且表達(dá)產(chǎn)量較低,而ASG2的重復(fù)模塊不含上述序列,推測其表達(dá)產(chǎn)量會(huì)有所提高,且材料學(xué)性能方面可能相對于其他種蛛絲也可能會(huì)有新的發(fā)現(xiàn),因此,ASG2具有作為一種新的仿生蛛絲材料的潛在應(yīng)用價(jià)值。為了ASG2后續(xù)的仿生應(yīng)用,ASG2的結(jié)構(gòu)功能研究是非常必要的,尤其是對ASG2末端非重復(fù)功能模塊NT和CT的結(jié)構(gòu)功能的研究,是探索ASG2成絲機(jī)理的首要條件。
為了獲取大腹園蛛ASG2 CT的編碼基因,首先根據(jù)ASG2的同源基因在EST文庫中進(jìn)行了同源搜索,確定了大腹園蛛ASG2 CT的一段編碼序列,并根據(jù)該序列設(shè)計(jì)特異性引物,進(jìn)行了單引物擴(kuò)增,利用接頭引物經(jīng)過巢式PCR,最終獲得了大腹園蛛ASG2 CT的下游完整編碼序列。為了保證序列可靠性,再次根據(jù)獲得的序列涉及特異性引物,以基因組為模板,進(jìn)行PCR驗(yàn)證,測序結(jié)果表明,兩次得到的ASG2 CT編碼基因序列完全保持一致。同時(shí)經(jīng)過后續(xù)不同種屬蜘蛛ASG2 CT的同源性比對分析及進(jìn)化樹分析,可以充分確定本次實(shí)驗(yàn)所獲取大腹園蛛ASG2 CT的編碼基因的可靠性,豐富了ASG2 CT的基因序列資源;同時(shí)對AvASG2CT蛋白進(jìn)行外源表達(dá)純化,可用于后續(xù)的ASG2成絲機(jī)理及仿生研究。
現(xiàn)有的研究表明,蛛絲蛋白的CT結(jié)構(gòu)包含5個(gè)α-helix,對大腹園蛛ASG2 CT即AvASG2CT的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測,表明其也包含5個(gè)α-helix;同時(shí)其CD圖譜呈現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)的α-helix結(jié)構(gòu)特征峰,表明AvASG2CT蛋白在pH 7.0的磷酸鹽buffer中維持著α-helix結(jié)構(gòu),與已報(bào)道的CT結(jié)構(gòu)保持一致。本研究僅對AvASG2CT蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了初步探索,但是其高級(jí)結(jié)構(gòu)解析、二聚化機(jī)制及在成絲過程中所扮演的角色等都需要進(jìn)一步的探索。
本研究首次獲得了大腹園蛛(Araneusventricosus) ASG2 CT的完整編碼基因AvASG2CT,通過單引物擴(kuò)增和巣式PCR,獲得了大腹園蛛ASG2 CT的完整編碼基因,并經(jīng)過基因組PCR驗(yàn)證、同源序列比對分析和進(jìn)化樹分析,確定了ASG2 CT編碼基因AvASG2CT的可靠性;隨后對AvASG2CT進(jìn)行克隆表達(dá),利用鎳柱進(jìn)行親和純化,及凝血酶對親和標(biāo)簽進(jìn)行切除,最終其在大腸桿菌BL21中的產(chǎn)量可達(dá)75 mg/L;同時(shí),本研究對大腹園蛛ASG2 CT的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了初步的探索,AvASG2CT蛋白的CD圖譜顯示,AvASG2CT蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)在pH 7.0的磷酸鹽buffer中主要呈現(xiàn)α-helix結(jié)構(gòu);這是首次對ASG2 CT的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了探索,目前尚無ASG2 CT結(jié)構(gòu)功能等相關(guān)研究的報(bào)道。本研究為ASG2 CT的研究提供了基因材料,為ASG2 CT高級(jí)結(jié)構(gòu)解析和功能研究,以及后續(xù)ASG2蛛絲蛋白的成絲機(jī)理研究和仿生應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。