云南省種子植物名錄數(shù)據集

陳家輝，鄧濤，張代貴，樂霽培，周卓，孫露，李彥波，李文慶，史鳴明，孫航

1.中國科學院昆明植物研究所，中國科學院東亞植物多樣性與生物地理學重點實驗室，云南昆明 650201

2.吉首大學，生物資源與環(huán)境科學學院，湖南吉首 416000

數(shù)據庫（集）基本信息簡介

數(shù)據服務系統(tǒng)網址基金項目數(shù)據庫（集）組成images/BZ_21_1113_317_1781_361.png云南省環(huán)境保護廳（2016年），云南生物物種名錄審核，530007081508006；中國科學院昆明植物研究所特色研究所服務項目（iFlora與綜合服務）；中國科學院昆明植物研究所自主部署重大專項（2016–2017年），植物全息數(shù)據庫與iFlora，KIB2016005。數(shù)據集包括云南省種子植物253科2 392屬16 064種（含種下等級）。其中，云南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級），被子植物244科2 367屬15 951種（含種下等級）。數(shù)據內容由4部分數(shù)據組成，分別為拉丁科名、中文科名、學名、中文名。

引 言

云南獨特的地理位置、復雜的地形地貌和多樣的生態(tài)環(huán)境為不同生態(tài)需求的植物提供了廣袤的生存空間，其素有“植物王國”的美譽，被認為是世界三個生物多樣性熱點地區(qū)即喜馬拉雅地區(qū)、中國西南山地、印度—馬來的交匯帶，受到世界極大關注[1-3]。依據萬本太等[4]提出的生物多樣性綜合評價等級，云南當之無愧位列“優(yōu)級”。就全國范圍而言，云南省的生物多樣性編目工作走在了前列，持續(xù)受到國內外植物學家和環(huán)境保護工作者的高度關注[5]。隨著近年來云南省生物多樣性調查和研究的深入，大量的新分類群被發(fā)現(xiàn)并發(fā)表，其中大部分為新種，部分為新屬，甚至還有通過研究提升為新科的類群，如節(jié)蒴木科（Borthwickiaceae）[6]。據我們的不完全統(tǒng)計，近年來，在云南每年約有20個新物種被發(fā)現(xiàn)或描述。

近20年來，植物分類學和系統(tǒng)學研究不斷取得新的進展，基于分子系統(tǒng)學研究的被子植物APG系統(tǒng)（I-IV）被提出并不斷完善，Christenhusz等人提出了一個裸子植物的新系統(tǒng)（簡稱“克氏系統(tǒng)”）[7-8]。但對于分類系統(tǒng)以分子證據為主還是以形態(tài)證據為主的爭議并沒有停止。同時，生物多樣性編目研究的深入，包括《云南植物志》等志書記載的大量科、屬和種范圍界定和系統(tǒng)位置發(fā)生變化，小科屬的合并、大科屬的拆分，以及種在科屬間的轉移、歸并等，導致各類志書、多樣性編目專著及科考報告等因各自所采用的分類系統(tǒng)不同，其科、屬和種級范疇的界定更是五花八門。顯然，各類植物分類學專著和志書的不同分類處理APG等新系統(tǒng)所導致的分類系統(tǒng)和分類處理的不一致給生命科學及農業(yè)、林業(yè)、醫(yī)藥和環(huán)境科學研究與保護以及政府管理工作者對植物名稱的使用帶來了不便甚至混亂。因此，綜合最新的植物分類學和系統(tǒng)學研究成果文獻以及APG等新系統(tǒng)，系統(tǒng)地整理云南種子植物名錄顯得十分迫切，這項工作不僅是植物系統(tǒng)學學科發(fā)展的需要，也是生態(tài)學、生物多樣性與保護和生物地理學等學科進一步研究的基石。

本數(shù)據集在參考《云南植物志》《Flora of China》等資料的基礎上，對云南的種子植物科、屬、種進行系統(tǒng)而全面的收錄和匯總，盡可能地整合最新的研究成果，同時聽取各類群專家意見，整理出了一套完整的《云南省種子植物物種名錄》（以下簡稱“《名錄》”）。

1 數(shù)據采集和處理方法

1.1 數(shù)據來源

本數(shù)據集的基礎數(shù)據主要來源于《云南植物志》各卷冊和《云南種子植物名錄》，同時補充了以下幾方面的內容：①《中國植物志》《Flora of China》《中國種子植物科屬詞典》等志書記載的云南有分布的物種名稱。②最新發(fā)表的分類修訂、分子系統(tǒng)發(fā)育和云南發(fā)現(xiàn)和發(fā)表的新類群和新記錄物種等期刊文獻中記錄的名稱。其中，云南新種和新記錄文獻收集自1984年后迄今。③出版的云南省境內的地方植物志、保護區(qū)科考報告、區(qū)域性生物多樣性專著（如《橫斷山高山冰緣帶種子植物》）等記錄的物種名稱。④中國科學院昆明植物研究所標本館（KUN）、中國科學院植物研究所標本館（PE）、中科院成都生物研究所標本館（CDBI）、四川大學生命科學學院植物標本館（SZ）、中國科學院西北高原生物研究所青藏高原生物標本館（HNWP）、西雙版納植物園標本館（HITBC）、云南大學標本館（YUKU）、西南林業(yè)大學標本館（SWFC）等標本館，以及中國數(shù)字植物標本館（CVH，http://www.cvh.org.cn）、國家標本平臺（NSII，http://www.nsii.org.cn/2017/home.php）、中國自然標本館（CFH，http://www.nature-museum.net）等網絡數(shù)據中記錄的云南分布的物種名稱。⑤最后，我們還整合了我們近年的野外考察成果和專家建議的觀點。對于歷史上曾經出現(xiàn)過的，但在《云南植物志》《中國植物志》《Flora of China》中未提及或處理為異名的屬種名稱，如《科屬詞典》《中國被子植物科屬綜論》及國內分類學相關期刊中出現(xiàn)的名稱，我們也盡可能地加以收錄，并作為原始數(shù)據。同時，我們也盡可能地收集了過去錯誤記載的云南產和非云南產名稱。此外，我們還糾正了存在名稱拼寫錯誤（主要見于《云南植物志》《中國植物志》《Flora of China》及地方植物志或專著）的物種，如豨薟屬（Sigesbeckia）被錯誤拼寫為“Siegesbeckia”等。收錄以上所有物種名稱信息數(shù)據以便于后續(xù)處理。

1.2 數(shù)據審核方法、標準

（1）通過異名庫對所有名稱進行初步異名處理

通過 Tropicos（http://www.tropicos.org）、The Plant List（http://www.theplantlist.org/）、物種2000（http://www.sp2000.cn/joaen/index.php）、Flora of China（http://www.efloras.org/flora_page.aspx?flora_id=2）等數(shù)據庫平臺進行初步異名匹配和處理。再由工作人員對所有的異名和無法匹配的名稱逐一進行初審。據此整理出《云南種子植物名錄》的學名列表及處理意見，以提交專家審核。

（2）參照最新的分子系統(tǒng)學和分類學成果決定啟用的名稱和系統(tǒng)位置

我們對科、屬范疇的界定盡量參照最新的分類學和系統(tǒng)學研究成果，裸子植物系統(tǒng)采用《Flora of China》系統(tǒng)，被子植物系統(tǒng)采用APG Ⅳ系統(tǒng)[9]。

（3）優(yōu)先采用相應類群的分類學專家的審核意見

考慮到不同的植物分類學家對其所研究的植物類群在分類學、系統(tǒng)學以及最新的研究進展等的掌握往往要遠多于非該類群的分類學家，對其所研究的植物類群往往具有更深的理解。故我們優(yōu)先采用類群專家的意見，但專家對于我們所提出的處理意見如有不同意見，需要提供理由。

（4）《云南植物志》發(fā)表的新物種處理原則

《云南植物志》在編寫時命名了部分新物種。對于這部分名稱，我們通過查閱《云南植物志》的原始描述，視其描述的情況作刪除或保留處理。所有被列入不合格發(fā)表的新物種，在本數(shù)據集中一律不予采納。

（5）種下等級處理原則

為了更加精細化體現(xiàn)云南植物多樣性，我們采用變種或亞種的概念。并且，當一個種的種下有2個以上的亞種或變種，若僅僅是某變種／亞種（包括原變種／亞種）分布于云南，則我們僅收錄該變種／亞種。但是在做物種統(tǒng)計時，若該物種僅有變種／亞種分布于云南而其原變種/原亞種不分布于云南時，我們將其作為種來統(tǒng)計。

（6）選用科屬種中文名的主要原則

選用的類群中文名優(yōu)先依據2015年由環(huán)保部和中國科學院聯(lián)合發(fā)布的《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》中的中文名稱，但有所修訂。對于《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》因各種原因沒有記載或者無法匹配時，我們依次優(yōu)先采用《云南植物志》和《Flora of China》所記載的中文名。對于發(fā)表在英文期刊的新種和中國新記錄種沒有中文名的，我們根據種加詞的譯意新擬中文名。

1.3 審核流程

《名錄》審核分為工作組初審、專家會審和函評、終審三個流程。

（1）工作組初審

初審主要由工作組完成，即根據以上原則對云南省記錄的所有物種名稱進行逐一審核。

（2）專家審核采用“會議評審”和“函評審核”兩種形式

會議評審：邀請云南省內外有關植物分類學專家在中科院昆明植物所進行2次《名錄》專家審核會。專家組成員提出質疑，由工作組成員根據專家意見進行審核和修改。

函評審核：對因故不能參會的專家，以及一些?？茖俚膶＜?，通過電子郵件的方式邀請專家對相應的科屬進行審核。由專家出具書面審核意見和建議。工作組據此進行修改、調整和完善。

（3）終審

所有審核意見匯總并修改完善后，工作組再根據專家的意見對所有名錄進行逐一核實、審校和完善，對名錄進行去除重復等處理，排除編輯和排版中出現(xiàn)的錯誤，最終擬定《名錄》初稿；同時完善審核依據，在提供每個物種的原始資料和信息的基礎上，形成最終評估報告，最后遞交專家委員會審定。

2 數(shù)據樣本描述

數(shù)據集包括云南省種子植物253科2 392屬16 064種（含種下等級，不含種下等級的物種數(shù)為14 538種）。其中，云南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級，不含種下等級的物種數(shù)為105種）；被子植物244科2 367屬15 951種（含種下等級，不含種下等級的物種數(shù)為14 433種）。數(shù)據內容由4部分數(shù)據組成，分別為拉丁科名、中文科名、學名、中文名。

圖1 云南省裸子植物數(shù)據集

圖2 云南省被子植物數(shù)據集

3 數(shù)據質量控制和評估

為了保證數(shù)據的質量，在對云南省種子植物評價和審核的過程中組建了顧問委員會、核心專家組、工作組。

顧問委員會：由中華人民共和國瀕危物種科學委員會、云南瀕危物種科學委員會、中國科學院、云南省環(huán)境保護廳、云南省林業(yè)廳和云南大學等高校的15位專家組成。其中，院士6位，對評估過程進行指導，并形成長效機制。

核心專家組：由國內外11個科研院所及高校的28位資深專家組成。其中，國際專家1人，具高級職稱24人。

工作組：由中國科學院昆明植物研究所和吉首大學研究人員組成。

4 數(shù)據價值

本數(shù)據集是迄今為止云南省最權威、最準確的種子植物物種名錄，為今后開展云南省種子植物的物種研究，生物多樣性的保護、科學利用、各級政府部門生物多樣性相關管理和決策提供了科學依據。

5 數(shù)據使用方法和建議

本數(shù)據集結構較為簡單，包含 4個字段的信息，在 Science Data Bank的鏈接地址為http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/489。如對名錄有超出數(shù)據集及所包含信息的需求，請聯(lián)系本文通訊作者陳家輝或孫航，郵箱：chenjh@mail.kib.ac.cn，sunhang@mail.kib.ac.cn。目前本數(shù)據集已建成專題數(shù)據庫（http://bio360.kun.ac.cn/index/special），本數(shù)據庫將持續(xù)進行數(shù)據更新和功能完善，以建成云南生物物種名錄的信息服務平臺。