高衛(wèi)利 葉國超 劉力偉
CDKN1A反義鏈啟動子DNA損傷激動RNA(promoter of CDKN1A antisense DNA damage activated RNA,PANDAR)是一種長度為1 506個核苷酸并定位于6p21.2的長鏈非編碼RNA(LncRNA)[1]。越來越多的研究證據(jù)表明,PANDAR參與胃癌、肝細胞癌、膀胱癌等多種人類腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,是腫瘤的重要基因調(diào)節(jié)因子和預(yù)后生物標(biāo)志物之一。因此,本研究通過檢測PANDAR在分化型甲狀腺癌(DTC)中的表達水平,探討PANDAR在DTC中表達的臨床意義,現(xiàn)報道如下。
1.1 對象 選取2010年1至12月在本院行手術(shù)切除治療的97例DTC患者的DTC組織及其配對的癌旁正常組織(距癌組織>2cm)?;颊咧心?2例,女75例;年齡 18~79(42.0±12.4)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)患者頸部未曾受放射線照射治療;(2)由常規(guī)病理學(xué)檢查確診DTC;(3)年齡18~80歲;(4)排除合并心、肝、肺、腎等臟器嚴(yán)重功能不全者;(5)合并其他惡性腫瘤者?;颊咝g(shù)中切除的組織標(biāo)本放入RNAlater保存試劑保存于-80℃液氮中凍存,于2013年初進行以下實驗操作。
1.2 方法
1.2.1 DTC組織、癌旁正常組織PANDAR表達水平檢測 采用qRT-PCR法。應(yīng)用TRIzol試劑(美國Invitrogen公司),按說明書所述方法提取DTC組織、癌旁正常組織總RNA。使用RNA反轉(zhuǎn)錄試劑PrimeScriptTMRT reagent Kit(日本TaKaRa公司),按說明書所述方法進行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA。按照qRT-PCR試劑盒SYBRPremix Ex TaqTM(日本TaKaRa公司)說明書的方法,以合成的cDNA為模板,加入反應(yīng)試劑進行qRTPCR反應(yīng)。PANDAR正義鏈為 5′-CTGTTAAGGTGGTGGCATTG-3′,反義鏈為 5′-GGAGGCTCATACTGGCTGAT-3′。GAPDH 正義鏈為 5′-CGCTCTCTGCTCCTCCTGTTC-3′,反義鏈為 5′-ATCCGTTGACTCCGACCTTCAC-3′。以GAPDH為內(nèi)參進行標(biāo)準(zhǔn)化處理,采用△△Ct法計算PANDAR的相對表達水平。
1.2.2 DTC組織BRAFV600E突變情況檢測 采用PCR法,具體方法詳見本團隊先前研究報道[2]。DTC組織進行DNA抽提后進行PCR擴增,設(shè)計引物:上游引物 5′-TCATAATGCTTGCTCTGATAGGA-3′;下游引物5′-GGCCAAAAATTTAATCAGTGGA-3′。然后瓊脂糖凝膠電泳檢測:PCR產(chǎn)物加入瓊脂糖凝膠的點樣孔中,觀察樣品彌散條帶及凝像分析。最后進行DNA雙向測序,以證實PCR結(jié)果的可靠性,并將測序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫進行比對以確定BRAFV600E有無突變。
1.3 觀察指標(biāo) (1)觀察并比較DTC組織、癌旁正常組織PANDAR表達水平;(2)以97例DTC患者的DTC組織PANDAR表達水平平均值為截點,將患者分為PANDAR高表達組(≥平均值)、低表達組(<平均值),比較PANDAR高表達組與低表達組DTC患者臨床病理特征與BRAFV600E突變情況。
1.4 統(tǒng)計學(xué)處理 應(yīng)用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件;計量資料以表示,組間比較采用配對t檢驗;計數(shù)資料以頻數(shù)和構(gòu)成比表示,組間比較采用χ2檢驗;P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 DTC組織、癌旁正常組織PANDAR表達水平比較DTC組織、癌旁正常組織PANDAR表達水平分別為3.684±0.089、1.273±0.078,DTC 組織 PANDAR 表達水平明顯高于癌旁正常組織(P<0.05)。
2.2 PANDAR高表達組與低表達組DTC患者臨床病理特征比較 以DTC患者的DTC組織PANDAR表達的平均值3.684為截點,PANDAR高表達組患者56例,低表達組41例。兩組患者性別、年齡、腫瘤直徑、病理類型、腫瘤個數(shù)、有無侵犯包膜情況比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05);與PANDAR低表達組比較,PANDAR高表達組患者T分期較晚、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率較高、TNM分期較晚、腫瘤復(fù)發(fā)率較高(均P<0.05),見表1。
表1 PANDAR高表達組與低表達組DTC患者臨床病理特征比較[例(%)]
2.3 PANDAR高表達組與低表達組DTC患者BRAFV600E突變情況比較 PANDAR高表達組患者中BRAFV600E突變48例(85.7%),低表達組中BRAFV600E突變22例(53.7%)。PANDAR高表達組患者BRAFV600E突變率高于低表達組(P<0.05)。
甲狀腺癌是臨床常見的惡性腫瘤之一,國民發(fā)病率有逐年上升趨勢[3]。DTC是分化良好的甲狀腺癌病理類型,約占所有甲狀腺癌的80%~90%。目前進展期DTC患者的數(shù)量及其發(fā)生腫瘤相關(guān)性病死率還在不斷上升[4]。因此,尋找新型生物標(biāo)志物以提高DTC的診治水平、改善患者預(yù)后,具有重要的臨床意義。
LncRNA是一類長度在200個核苷酸以上,不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA,在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。近來研究表明,LncRNA在參與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控、染色體重塑、轉(zhuǎn)錄后蛋白修飾、調(diào)控蛋白的功能和穩(wěn)定性、癌細胞耐藥性等方面起著重要的作用[5-12]。最初,Hung等[1]發(fā)現(xiàn),PANDAR是一種長度為1 506個核苷酸并定位于6p21.2新型LncRNA。PANDAR在成纖維細胞DNA損傷反應(yīng)中,被p53誘導(dǎo)激活,并通過與核轉(zhuǎn)錄因子NF-YA的相互作用,抑制促凋亡基因的表達,從而抑制細胞凋亡;DNA損傷和轉(zhuǎn)錄因子NF-YA與腫瘤發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[13-14]。因此,PANDAR可能在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。
研究發(fā)現(xiàn),PANDAR參與多種人類腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,而且在不同階段扮演著雙重角色。PANDAR在肝細胞癌[15]、膀胱癌[16]、胃癌[17]、結(jié)直腸癌[18]、宮頸癌[19]、腎癌[20]、膽管癌[21]中表達上調(diào),且PANDAR的高表達與患者的臨床病理特征與預(yù)后密切相關(guān),可促進腫瘤細胞的增殖、侵襲及轉(zhuǎn)移。然而,在肺癌研究中,Han等[22]發(fā)現(xiàn)PANDAR在非小細胞肺癌組織中表達下調(diào),且PANDAR低表達水平與腫瘤分期、腫瘤大小以及患者的不良預(yù)后密切相關(guān)。
在甲狀腺癌研究中,Li等[23]采用qRT-PCR法檢測DTC中PANDAR的表達,發(fā)現(xiàn)PANDAR在DTC中表達上調(diào)。本研究采用qRT-PCR法檢測PANDAR在DTC組織及配對的癌旁正常組織中的表達水平。結(jié)果發(fā)現(xiàn),PANDAR在DTC組織中的表達水平明顯高于癌旁正常組織,并且與DTC的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、T分期及TNM分期密切相關(guān)。同時PANDAR的高表達與DTC患者腫瘤復(fù)發(fā)密切相關(guān)。這說明PANDAR在DTC中是一種促癌基因,在DTC的發(fā)生、發(fā)展中起著一定的作用。因此,PANDAR或可成為評估DTC患者預(yù)后的生物標(biāo)志物之一。
在BRAF突變中,BRAFV600E突變(T1977A點突變)占90%以上。在DTC中,BRAFV600E突變是最常見的基因事件,文獻報道BRAFV600E在DTC中的突變率有很大的差異,為29%~83%[24]。BRAFV600E突變與DTC中甲狀腺包膜外浸潤、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、臨床病理分級等臨床病理特征及患者預(yù)后密切相關(guān)[25]。本研究結(jié)果顯示,PANDAR高表達組患者BRAFV600E突變率高于低表達組。
綜上所述,本研究結(jié)果顯示,PANDAR在DTC組織中表達上調(diào),PANDAR高表達的DTC患者預(yù)后較差。PANDAR或可成為評估DTC患者預(yù)后的生物標(biāo)志物之一。