葉維霞 郭建紅
(瀘州市人民醫(yī)院消化內(nèi)科 四川 瀘州 646000)
結(jié)腸癌是全球常見的消化道惡性腫瘤之一,盡管其臨床治療方案不斷提高,但由于缺乏有效的靶向治療,死亡率仍居高不下[1]。因此,尋找到結(jié)腸癌有效的治療靶點(diǎn)仍是當(dāng)前的一個(gè)研究課題。MicroRNA(miRNA)是為一組內(nèi)源性的非編碼小分子RNA,可在轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因的表達(dá)[2]。近年來(lái)多項(xiàng)研究證實(shí)miR-197在多種腫瘤中表達(dá)異常,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[3]。由此,本研究初步檢測(cè)了miR-197在結(jié)腸癌細(xì)胞及組織中的表達(dá),為下一步探討 miR-197在結(jié)腸癌中所發(fā)揮的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。
收集2016年8月至2017年3月我院肛腸科結(jié)腸癌手術(shù)標(biāo)本14例,每例包括結(jié)腸癌組織及對(duì)應(yīng)癌旁組織(均得到病理診斷證實(shí))。結(jié)腸癌細(xì)胞株HCT116、SW480、SW620、Lovo購(gòu)買于上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞庫(kù)。TRlZOl試劑購(gòu)自Invitrogen公司,反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自Vazyme公司,Taqman MicroRNA Assay購(gòu)自ABI公司。
1.2.1 結(jié)腸癌細(xì)胞的培養(yǎng)
在結(jié)腸癌細(xì)胞株HCT116、SW480、SW620、Lovo中加入含10%胎牛血清的1640培養(yǎng)基,至37℃、5% CO2培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),每2~3d換液,用0.25胰酶消化傳代。
1.2.2 RNA提取及質(zhì)量檢測(cè)
按說(shuō)明書用Trizol法分別提取4組結(jié)腸癌細(xì)胞株、14例結(jié)腸癌及對(duì)應(yīng)癌旁組織中的RNA。采用紫外分光光度儀測(cè)定總RNA的純度和濃度。
1.2.3 熒光定量RT-PCR
取1ugRNA按逆轉(zhuǎn)錄說(shuō)明書將其逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。按Tapman MicroRNA Assay說(shuō)明以miR-197和RNU6B作模板,miR-197和RNU6B熒光探針作引物擴(kuò)增,反應(yīng)條件為,預(yù)變性:95℃10min;變性:95℃ 10s,退火,60℃ 20s,延伸,72℃ 34s,擴(kuò)增40個(gè)循環(huán)。采用2-ΔΔCt計(jì)算miR-197的相對(duì)表達(dá)量。所有實(shí)驗(yàn)均重復(fù)3次,計(jì)算平均值。
我們利用生物信息學(xué)預(yù)測(cè)網(wǎng)站TargetScan、Pictar、microRNA.org預(yù)測(cè)miR-197作用的靶基因,通過取三者交集,預(yù)測(cè)出miR-197得分較高的靶基因。
所有試驗(yàn)結(jié)果運(yùn)用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料以(±s)表示,采用t檢驗(yàn)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
利用qRT-PCR結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-197在低轉(zhuǎn)移能力的結(jié)直腸癌細(xì)胞株HCT116、SW480中的表達(dá)高于高轉(zhuǎn)移能力的SW620和Lovo細(xì)胞株(P<0.05),如圖1。
圖1 miR-197在4種結(jié)腸癌細(xì)胞株的表達(dá)
利用qRT-PCR結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-197在14例結(jié)腸癌組織中,除6號(hào)、14號(hào)外,有12例在癌旁組織中的表達(dá)水平均明顯高于相應(yīng)癌組織,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),如圖2。
圖2 miR-197在結(jié)直腸癌組織和相配對(duì)正常組織中的表達(dá)
miRNA預(yù)測(cè)網(wǎng)站對(duì)miR-197靶基因預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,Pictar:99個(gè),TargetScan:140個(gè),microRNA.org:7644個(gè),綜合三者的交集,我們?nèi)》种递^高且有大量研究與腫瘤相關(guān)密切的的三個(gè)靶基因,即ETF1、SYNGR1、ZIC3作為后續(xù)研究對(duì)象,如圖3。
圖3 miRNA預(yù)測(cè)網(wǎng)站靶基因示意圖
結(jié)腸癌難以治愈、易出現(xiàn)轉(zhuǎn)移,因此尋找有效的靶基因并探討其功能,不僅有利于闡明結(jié)腸癌發(fā)生的分子機(jī)理,還能為臨床診治、預(yù)后判斷提供新的靶點(diǎn)。
miRNA是一類大小約21~25個(gè)堿基的非編碼微小RNA。研究發(fā)現(xiàn)miRNA通過靶向調(diào)控原癌基因或抑癌基因,發(fā)揮著促癌作用或抑癌作用,參與腫瘤生長(zhǎng)、轉(zhuǎn)移、血管生成等多種過程[4]。最近發(fā)現(xiàn)miR-197序列在多種物種間有高度保守性,提示它可能存在較強(qiáng)大的生物信息學(xué)功能。大量研究也證實(shí)了這一點(diǎn),在肝癌、甲狀腺濾泡癌、惡性星形膠質(zhì)細(xì)胞瘤、男性乳腺癌、肺癌的篩查過程中發(fā)現(xiàn)腫瘤組織中miR-197的表達(dá)顯著上調(diào)[5]。由此,本課題應(yīng)用qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)了miR-197在結(jié)腸癌細(xì)胞及組織中的表達(dá)情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-197在低轉(zhuǎn)移能力的結(jié)腸癌細(xì)胞株HCT116、SW480中的表達(dá)高于高轉(zhuǎn)移能力的SW620和Lovo細(xì)胞株,同時(shí)在14例結(jié)腸癌組織中,有12例在癌旁組織中的表達(dá)水平均明顯高于對(duì)應(yīng)結(jié)腸癌組織,只有兩例6號(hào)、14號(hào)的表達(dá)情況相反,這可能是個(gè)體差異造成的。由此,我們初步得出miR-197很可能參與了結(jié)腸癌的發(fā)生發(fā)展過程,但具體機(jī)制尚不清楚。我們通過miRNA預(yù)測(cè)網(wǎng)站對(duì)miR-197靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示Pictar:99個(gè),TargetScan:140個(gè),microRNA.org:7644個(gè),綜合三者的交集,我們選取了分值較高且與腫瘤相關(guān)密切的的三個(gè)靶基因,即ETF1、SYNGR1、ZIC3作為后續(xù)研究對(duì)象。
綜上所述,本研究初步發(fā)現(xiàn)了miR-197在結(jié)腸癌細(xì)胞及組織中的表達(dá)差異,提示它可能在結(jié)直腸癌發(fā)展過程中作為抑癌基因起作用,通過生物信息學(xué)預(yù)測(cè)它可能是通過靶向調(diào)控ETF1、SYNGR1、ZIC3的表達(dá)來(lái)實(shí)現(xiàn)。
[1]Zheng Z X, Zheng R S, Zhang S W, et al. Colorectal cancer incidence and mortality in China, 2010[J]. Asian Pac Cancer Prev, 2014, 15(19): 8455-8460.
[2]Calin GA, Croce CM. MicroRNA signatures in human cancers[J]. Nature Reviews Cancer. 2006, 6(11): 857-866.
[3]Hamada S, Satoh K, Miura S, et al. MiR-197 induces epithelial-mesenchymal transition in pancreatic cancer cells by targeting p120 catenin[J]. J Cell Physiol. 2013, 228(6):1255-1263.
[4]Ai RT,Wu SY, Wen XY, et al. 1,3,4-tri-O-galloyl-6-O-caffeoyl-β-D-glucopyranose, a new anti-proliferative ellagitannin, regulates the expression of microRNAs in HepG(2) cancer cells[J]. Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao.2011, 31(10):1641-1648.