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    人HNRNPA1基因及蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析

    2018-03-01 06:06:03馬素珍劉丹丹張方方潘曉麗劉勝利朱艷琴
    關(guān)鍵詞:信號肽進(jìn)化樹氨基酸

    馬素珍,劉丹丹,張方方,潘曉麗,劉勝利,朱艷琴

    (河南中醫(yī)藥大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院實驗教學(xué)中心,河南 鄭州 450008)

    采用生物信息學(xué)的方法分析人HNRNPA1基因的啟動子情況及蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、信號肽及NLS、親疏水性、跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、相互作用的蛋白質(zhì)及GO注釋.選擇合適軟件對HNRNPA1相關(guān)信息進(jìn)行分析.結(jié)果顯示,預(yù)測的HNRNPA1基因存在1個啟動子;HNRNPA1蛋白質(zhì)是由372個氨基酸組成的具有NLS、無跨膜結(jié)構(gòu)的親水不穩(wěn)定蛋白質(zhì),其等電點為9.17;哺乳動物中氨基酸序列高度保守;二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)卷曲為主,預(yù)測的三級結(jié)構(gòu)經(jīng)拉曼圖分析可信度高;HNRNPA1多定位于細(xì)胞核,與RNA的選擇性剪接及mRNA運輸有關(guān).此外,啟動子的甲基化對HNRNPA1表達(dá)影響明顯,其蛋白質(zhì)具有NLS、無跨膜結(jié)構(gòu)且不穩(wěn)定,屬于親水蛋白質(zhì),分布于細(xì)胞核,對mRNA的成熟具有重要作用.

    HNRNPA1;RNA;選擇性剪接;生物信息學(xué)

    HNRNPA1(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1)是核不均一核糖核蛋白家族中重要的一員,是一種重要的RNA(ribonucleic acid)結(jié)合蛋白質(zhì),通過調(diào)控轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后RNA的剪接修飾調(diào)控了mRNA(messenger ribonucleic acid)的成熟及運輸過程[1-2].HNRNPA1可以影響多種生物學(xué)過程,如細(xì)胞的自我更新[3]、蛋白質(zhì)正常成熟[4]、免疫反應(yīng)[5]等.HNRNPA1與多種疾病的發(fā)生發(fā)展具有重要的關(guān)系,如HNRNPA1的突變會引起人遺傳性包涵體肌病[6],抑制HNRNPA1的表達(dá)會通過影響細(xì)胞周期而抑制肺腺癌的增殖[7],通過調(diào)控雄激素受體的表達(dá)影響前列腺癌的發(fā)生[8].另外,它還與乳腺癌[9]、胃癌[10]、胰腺癌[11]等腫瘤的發(fā)生發(fā)展相關(guān).分析HNRNPA1的生物信息學(xué)數(shù)據(jù),期望對深入研究該蛋白質(zhì)在機體生長發(fā)育、病情發(fā)生發(fā)展中的作用提供有價值的理論數(shù)據(jù)支持.

    1 材料與方法

    1.1 材 料

    從蛋白質(zhì)Uniprot數(shù)據(jù)庫中下載人(P09651)及黑猩猩(A5A6H4)、鼠(P49312)、牛(P09867)、鼠鳥(A0A091KA33)、斑馬魚(F1QS20)的HNRNPA1蛋白質(zhì)序列;其相應(yīng)的HNRNPA1基因及人上游的核酸序列由NBCI(National Center for Biotechnology Information)獲得.

    1.2 方 法

    通過NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)獲得基因相關(guān)信息;利用Promoter Scan(http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/)預(yù)測啟動子及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子;ProtParam(http://web.expasy.org/protparam)分析HNRNPA1蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、蛋白質(zhì)分子組成、等電點等相關(guān)信息;ClustalX2.1和njplot對多物種間HNRNPA1基因及氨基酸進(jìn)行同源性和系統(tǒng)進(jìn)化樹進(jìn)行分析;SignalP 4.1 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP)、核定位序列(nuclear localization sequence,簡稱NLS) Mapper(http://nls-mapper.iab.keio.ac.jp/cgi-bin/NLS_Mapper_form.cgi)和TMHMM(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM)分析蛋白質(zhì)的信號肽、核定位序列以及蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu);ProtScale(http://expasy.org/tools/protscale.html)分析了蛋白質(zhì)親/疏水性;SOMPA(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html)、Swiss-Model(http://swissmodel.expasy.org)和The Structure Analysis and Verification Server(http://services.mbi.ucla.edu/SAVES)對蛋白質(zhì)的二三級結(jié)構(gòu)及拉曼圖進(jìn)行預(yù)測分析;String(http://string-db.org)和Gene Ontology Consortium(http://amigo1.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi)分析與HNRNPA1相互作用蛋白質(zhì)及其參與的生物學(xué)功能.

    2 結(jié)果與分析

    2.1 HNRNPA1基因的啟動子及轉(zhuǎn)錄因子分析

    通過NCBI檢索發(fā)現(xiàn)HNRNPA1基因位于人12號染色體的長臂1區(qū)3帶(12q13)上,具有13個外顯子.Promoter Scan是基于與真核Pol II啟動子序列的同源性來預(yù)測目標(biāo)基因的啟動子區(qū)域的,對HNRNPA1基因上游2 000 bp和基因前1 000 bp的核酸序列,通過Promoter Scan對該基因的啟動子進(jìn)行預(yù)測,得到如表1所示的啟動子.

    表1 人HNRNPA1基因啟動子預(yù)測

    由表1可知,該啟動子位于負(fù)鏈區(qū),即905—655 bp之間.同時得到與該啟動子相結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子如表2所示.

    表2 Promoter結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子

    由表2發(fā)現(xiàn),存在大量與甲基化相關(guān)的SP-1、AP-2與該啟動子結(jié)合,這說明DNA的甲基化對該基因的表達(dá)調(diào)控具有重要的意義.

    2.2 人HNRNPA1基因及蛋白質(zhì)的同源性預(yù)測和分析

    ClustalX2.1是一種常用的序列比對軟件,不僅可以對核酸進(jìn)行比對,也可以對蛋白質(zhì)的序列進(jìn)行比對.它首先對不同來源的序列進(jìn)行兩兩比對,構(gòu)建合理的系統(tǒng)進(jìn)化樹,然后根據(jù)已構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹從最相近的兩條序列開始,逐步引入鄰近的序列,直至所有序列都完成比對.通過ClustalX2.1不僅可以完成序列比對,也可以構(gòu)建相應(yīng)的系統(tǒng)進(jìn)化樹,進(jìn)一步對研究目標(biāo)進(jìn)行分析.

    使用序列比對軟件對不同物種來源的HNRNPA1基因進(jìn)行多重序列比對,通過序列比對發(fā)現(xiàn)這些不同物種來源的基因在外顯子區(qū)域序列相似度較高,而在內(nèi)含子等非編碼區(qū)相似度低,如圖1所示(顯示部分序列).進(jìn)一步分析由HNRNPA1基因構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn)人與黑猩猩的進(jìn)化關(guān)系最近,與鼠較遠(yuǎn),與斑馬魚之間進(jìn)化距離最遠(yuǎn).說明該基因也隨著物種的進(jìn)化不斷發(fā)生變化.

    圖1 不同物種間HNRNPA1基因的同源性分析

    序列比對軟件對Uniprot蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中下載的多種物種的蛋白質(zhì)序列進(jìn)行多重序列比對,使用可視化分析軟件njplot對構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹進(jìn)行分析,得到如圖2所示結(jié)果.

    圖2 不同物種間HNRNPA1蛋白質(zhì)的同源性分析

    圖2的序列比對發(fā)現(xiàn),在人的第305—335位氨基酸突變率極低,保守性強,可能該區(qū)域是該蛋白的重要功能區(qū)域,這些區(qū)域可能與其與DNA和RNA的結(jié)合有關(guān).哺乳動物之間該蛋白質(zhì)的序列相似度極高,但人比其他哺乳動物多了52個氨基酸.分析系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),人與黑猩猩及其他哺乳動物之間的進(jìn)化距離極小,但鳥類和斑馬魚之間的進(jìn)化距離較大,分別是0.244和0.787,該蛋白質(zhì)在哺乳動物之間具有極高的保守性.

    綜合分析HNRNPA1基因和蛋白質(zhì)序列比對結(jié)果和構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹可以發(fā)現(xiàn),兩者所得出的親緣關(guān)系基本相同,與達(dá)爾文進(jìn)化論基本吻合,但通過基因分析所得出的進(jìn)化樹更加精確,可以計算出人和黑猩猩與牛、小鼠之間的進(jìn)化距離,而由蛋白質(zhì)序列構(gòu)建的進(jìn)化樹則無法將其區(qū)分.這是由于基因不僅包括編碼區(qū)還包括了內(nèi)含子等非編碼區(qū),而這些區(qū)域不會改變蛋白質(zhì)的氨基酸,因此這些區(qū)域的突變更容易積累.此外由于每3個堿基構(gòu)成1個密碼子,每個密碼子對應(yīng)1種氨基酸,而密碼子又具有簡并性,第3個堿基的改變多數(shù)情況下不會影響到蛋白質(zhì),這種突變在進(jìn)化過程中也被保存了下來.因此通過核酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹更能反映進(jìn)化的親緣關(guān)系,也能反映出HNRNPA1蛋白質(zhì)在人和黑猩猩之間的表達(dá)調(diào)控及功能上極為相似.

    2.3 人HNRNPA1蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)分析

    ProtParam是由瑞士生物信息學(xué)中心維護(hù)并提供的蛋白質(zhì)理化分析工具,以檢索目的蛋白質(zhì)的理化性質(zhì),并基于這些理化性質(zhì)分析未知蛋白質(zhì)的類別,為后續(xù)實驗提供數(shù)據(jù)支持.分析人HNRNPA1蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)發(fā)現(xiàn):HNRNPA1共有372個氨基酸殘基;理論等電點為9.17;蛋白質(zhì)總分子式為C1661H2491N515O551S8,其原子總數(shù)為5 226;分子質(zhì)量為38 746.6;帶負(fù)電荷氨基酸殘基Asp(aspartic acid)和Glu(glutamic acid)占9.68%(36/372),帶正電荷氨基酸殘基Arg(arginine)和Lys(lysine)占11.56%(43/372);HNRNPA1的不穩(wěn)定系數(shù)為42.00,屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì).

    2.4 人HNRNPA1蛋白質(zhì)的親水性/疏水性預(yù)測與分析

    ProtScale程序是一種簡便的蛋白質(zhì)親水性與疏水性分析的工具,該工具提供多種算法,常選擇Hphob. / Kyte & Doolittle算法.該算法將不同氨基酸進(jìn)行賦值,如Ala(alanine)為1.800,Arg為-4.500,Ile(isoleucine)為4.500等,通過分析蛋白質(zhì)中所有氨基酸疏水值的分布情況,判定蛋白質(zhì)的親疏水性.通過分析HNRNPA1蛋白質(zhì)的親疏水性發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的氨基酸處于正值區(qū)的均小于1.5,其中最大值是第61位蘇氨酸的1.411.有25個氨基酸的分值小于-2,其中最小值是51位蘇氨酸的-3.056,預(yù)測分析結(jié)果如圖3所示.

    圖3 人HNRNPA1親水性/疏水性分析

    由圖3可知,ProtScale分析的364個氨基酸(5-368)有87.64%(319個)分布在低分值區(qū),總得分-350.68;2.36%(45個)分布在Score>0區(qū),總得分為28.166.HNRNPA1具有大量的親水氨基酸,可形成親水域,屬親水蛋白質(zhì).多種親水結(jié)構(gòu)的存在,有利于該蛋白質(zhì)在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行游離擴散,多種親水結(jié)構(gòu)的存在可以使其在細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中以游離狀態(tài)存在,當(dāng)行使功能時,迅速與DNA或RNA結(jié)合,外部的親水結(jié)構(gòu)保護(hù)了內(nèi)部的疏水區(qū)域.

    2.5 人HNRNPA1蛋白質(zhì)的信號肽預(yù)測與分析

    SignalP 4.1 Server是根據(jù)信號肽位于新合成肽鏈的N(nitrogen)端,且在完成引導(dǎo)功能后切除的特性而開發(fā)的信號肽預(yù)測軟件,通過對目的肽鏈前70個氨基酸間潛在酶切位點的預(yù)測而推斷是否存在信號肽.將HNRNPA1蛋白質(zhì)氨基酸序列提交到信號肽預(yù)測服務(wù)器SignalP 4.1 Server,設(shè)置Cut-off值為0.450,得到如圖4的預(yù)測結(jié)果.

    圖4 人HNRNPA1信號肽分析

    圖4中C、Y、S的最大值分別為0.115、0.127、0.171,S-mean、D值分別為0.134、0.131,分析該數(shù)據(jù)可以得知人HNRNPA1蛋白質(zhì)無信號肽.HNRNPA1主要在細(xì)胞核內(nèi)參與RNA的形成,不需要進(jìn)入其他膜性細(xì)胞器,但需進(jìn)入核內(nèi),因此進(jìn)一步通過cNLS Mapper分析其核定位序列.不同氨基酸在cNLS中會有有利或不利的作用,cNLS Mapper給予相應(yīng)氨基酸或正或負(fù)的分?jǐn)?shù),通過計算每個氨基酸殘基對整個NLS活性的貢獻(xiàn)而計分,根據(jù)不同段的總分與設(shè)定閾值進(jìn)行比較而確定NLS存在與否,該結(jié)果可以用來指導(dǎo)設(shè)計特異于importin αβ的核輸入途徑的有效抑制劑.通過分析發(fā)現(xiàn)在HNRNPA1蛋白質(zhì)中存在一段序列為RGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTV(140-170)的NLS,其得分值為5.9分,高于設(shè)定的閾值(5分)

    2.6 人HNRNPA1蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)預(yù)測與分析

    TMHMM是目前蛋白質(zhì)跨膜區(qū)域分析結(jié)果可信度最高的軟件[12],因此選用TMHMM 2.0,各選項按其默認(rèn)選項,分析人HNRNPA1蛋白質(zhì)序列,進(jìn)行分析后得到如圖5的預(yù)測結(jié)果.

    圖5 人HNRNPA1跨膜區(qū)預(yù)測

    由圖5發(fā)現(xiàn),HNRNPA1不存在跨膜區(qū)域,這說明HNRNPA1蛋白質(zhì)不是跨膜蛋白質(zhì).HNRNPA1主要進(jìn)入細(xì)胞核中參與RNA的形成過程,主要作用區(qū)域分布在細(xì)胞核,因此,HNRNPA1不需要跨膜轉(zhuǎn)運的過程,該蛋白質(zhì)可能是在細(xì)胞質(zhì)中游離核糖體上合成,不經(jīng)過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體修飾運輸,而是經(jīng)由NLS引導(dǎo),通過核孔復(fù)合體直接進(jìn)入細(xì)胞核,參與RNA的形成,因此,該蛋白質(zhì)無跨膜結(jié)構(gòu).

    2.7 人HNRNPA1蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測與分析

    SMOPA是通過已知二級結(jié)構(gòu)的氨基酸數(shù)據(jù)庫,通過自優(yōu)化的預(yù)測方法對目標(biāo)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測分析的方法.采用SOMPA方法分析HNRNPA1蛋白質(zhì)所形成的二級結(jié)構(gòu),構(gòu)象狀態(tài)數(shù)選擇3(Helix,Sheet,Coil),相似性閾值選擇8,分析結(jié)果如圖6所示.

    h:α螺旋;e:β折疊;c:無規(guī)卷曲.圖6 人HNRNPA1二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

    圖6的分析發(fā)現(xiàn)HNRNPA1具有6個α螺旋(h所示區(qū)域),6個β折疊片層(e所示區(qū)域),其余大多數(shù)處于無規(guī)卷曲狀態(tài),α螺旋占15.05%(56/372),β折疊占11.29%(42/372),剩余274個氨基酸(73.66%)處于無規(guī)卷曲的狀態(tài),這與該蛋白質(zhì)高甘氨酸含量有關(guān).甘氨酸側(cè)鏈只有一個氫,二面角取值范圍較大,不易形成穩(wěn)定構(gòu)象.

    2.8 人HNRNPA1蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測與分析

    蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)決定了其生物學(xué)功能,分析蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)對探索其生物學(xué)功能具有重要的指導(dǎo)意義.蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的預(yù)測有串線法、同源建模法和從頭預(yù)測的方法,常用的預(yù)測方法是同源建模法.Swiss-Model是一個全自動化的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)同源建模服務(wù)器,提交蛋白質(zhì)序列至Swiss-Model,選擇默認(rèn)選項,通過與數(shù)據(jù)庫中已有的蛋白進(jìn)行序列比對,選擇相似度、覆蓋度最高的模板進(jìn)行建模,得到相應(yīng)的高級結(jié)構(gòu)的預(yù)測結(jié)果及相似性波形圖,如圖7所示.

    圖7 人HNRNPA1三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果

    圖7中,A、C兩個結(jié)果采用了相同的同源模板,預(yù)測結(jié)果相似度極高;B結(jié)果采用另一模板,但波形圖數(shù)值波動較大.綜合分析序列相似度、覆蓋度及與同源蛋白質(zhì)的相似性波形圖可以發(fā)現(xiàn),預(yù)測結(jié)構(gòu)A相似性波形圖預(yù)測值高,較穩(wěn)定,因此,預(yù)測結(jié)構(gòu)A可信度較高.

    蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)由于氨基酸側(cè)鏈基團(tuán)大小的區(qū)別,對形成的二面角有不同的要求.為了進(jìn)一步驗證結(jié)構(gòu)A的可信度,通過蛋白質(zhì)拉曼圖分析網(wǎng)站The Structure Analysis and Verification Server對預(yù)測模型各氨基酸的二面角進(jìn)行分析,從而判斷預(yù)測模型的可靠性.通過拉曼圖分析得到如圖8所示結(jié)果.

    ▲:甘氨酸;■:其他氨基酸.圖8 人HNRNPA1預(yù)測三級結(jié)構(gòu)模型的拉曼圖分析

    圖8所示的預(yù)測結(jié)構(gòu)中所涉及的188個氨基酸中147個處于最佳區(qū)域,即圖中紅色區(qū)域;19個處于允許區(qū)域,即黃色區(qū)域,另外還有14個甘氨酸對二面角的要求較低,因此該預(yù)測結(jié)構(gòu)形成的二面角穩(wěn)定可靠.

    2.9 人HNRNPA1相互作用蛋白質(zhì)預(yù)測及分析

    蛋白質(zhì)在機體內(nèi)不能單獨完成生物過程,需要與其他蛋白質(zhì)相互作用才可以正常行使生命過程.String是一個有效的相關(guān)功能蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)預(yù)測服務(wù)器,通過該服務(wù)器對與HNRNPA1相互作用的蛋白質(zhì)進(jìn)行了預(yù)測分析,輸入蛋白質(zhì)名稱為hnrnpa1,選擇生物類型為人類,通過檢索分析后對得分高的前10個蛋白質(zhì)進(jìn)行了統(tǒng)計介紹,如表3和圖9所示.

    表3 與人HNRNPA1相互作用可能性較大的10種蛋白質(zhì)

    圖9 人HNRNPA1蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測

    與HNRNPA1相互作用較強的蛋白質(zhì)主要是HNRNP家族的蛋白,另外還有一些mRNA前體形成中參與的剪切因子,這說明HNRNPA1需要與家族中其他成員共同參與mRNA前體的剪接成熟.同泛素C的結(jié)合說明HNRNPA1的降解會通過泛素化途徑.綜合相互作用蛋白質(zhì)的結(jié)果,可進(jìn)一步說明HNRNPA1進(jìn)入細(xì)胞核后與家族其他成員及mRNA前體形成相關(guān)蛋白質(zhì)結(jié)合后共同調(diào)控mRNA前體的形成.

    2.10 人HNRNPA1的GO注釋分析

    基因本體(gene ontology,簡稱GO)可對基因及其產(chǎn)物的細(xì)胞組分(cellular component)、生物過程(biological process)和分子功能(molecular function)進(jìn)行統(tǒng)一的歸納、解釋和分析.Gene Ontology Consortium服務(wù)器可以對基因本體進(jìn)行詳盡的分析,以“hnrnpa1”為關(guān)鍵詞,選擇“genes or proteins”條目進(jìn)行檢索,檢索后選擇人類相對應(yīng)的GO條目進(jìn)行分析.表4所示為人HNRNPA1進(jìn)行基因本體論分析后得到的結(jié)果.

    從表4所示的細(xì)胞組成上看,HNRNPA1分布在整個細(xì)胞中,但細(xì)胞核中相對較多,在剪接體及剪接體復(fù)合物中較多;從分子功能上來看,HNRNPA1主要是與蛋白質(zhì)和核酸結(jié)合,通過與核酸的結(jié)合調(diào)控mRNA的形成、端?;钚?,與蛋白質(zhì)的結(jié)合影響其出入核.

    表4 人HNRNPA1 基因注釋分析結(jié)果

    續(xù)表4

    3 結(jié)束語

    HNRNPA1作為核不均一核糖核蛋白家族中重要的一員,是RNA結(jié)合蛋白中重要的成分[13],與RNA轉(zhuǎn)錄及產(chǎn)生hnRNP(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein)顆粒有關(guān),參與信使RNA的代謝調(diào)控過程,但在RNA的選擇剪接過程中與SR蛋白的作用相拮抗[14],HNRNPA1通過與多種蛋白質(zhì)及DNA、RNA相互作用,對RNA的剪接成熟具有重要的調(diào)控作用.近來,越來越多的研究發(fā)現(xiàn)HNRNPA1與多種疾病的發(fā)生具有重要的關(guān)系,除了與乳腺癌、前列腺癌等腫瘤外,與神經(jīng)退行性疾病的發(fā)生也具有重要的關(guān)系[15-17],如與額顳葉的變性具有重要的關(guān)系[4],在阿爾茲海默癥中表達(dá)量也會下降[4].因此,對HNRNPA1的深入研究可以為疾病的研究及診斷治療帶來新的思路.

    筆者應(yīng)用生物信息學(xué)的方法,對HNRNPA1進(jìn)行深入的分析,發(fā)現(xiàn)其基因存在1個啟動子,其轉(zhuǎn)錄受甲基化的影響較大.HNRNPA1蛋白質(zhì)是由372個氨基酸組成的不具有核定位序列、無跨膜結(jié)構(gòu)的親水不穩(wěn)定蛋白質(zhì),其等電點為9.17.通過對多物種的序列比對發(fā)現(xiàn)其305—335氨基酸序列保守性強,是重要的功能區(qū)域,該蛋白質(zhì)在哺乳動物中具有極高的同源性.蛋白質(zhì)相互作用及GO分析表明,HNRNPA1多分布于細(xì)胞核中,參與mRNA的選擇性剪接.

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