董安然 成智麗 張彤 王宏宇 柏彬彬
(大連海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;遼寧省水生生物重點實驗室,遼寧大連 116023)
魚類是人類重要的蛋白質(zhì)來源之一,且具有懷卵量大、體外發(fā)育,易于觀察等特點。因此,魚類不但是重要的經(jīng)濟動物也是研究中常用的模式動物。轉(zhuǎn)基因技術(shù)有效打破了動物細胞接納外源基因的進化壁壘,能將人為篩選改造過的基因遺傳給下一代。相比于傳統(tǒng)育種,為培育和改良優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)、抗逆性強的魚類新品系提供了更高效的途徑。1985年,朱作言等研制出世界首例轉(zhuǎn)基因魚并建立了第一個轉(zhuǎn)基因魚模型,隨后英國、法國、美國等幾十個實驗室開始了轉(zhuǎn)基因魚的研究[1]。近幾年,美國批準了轉(zhuǎn)基因大西洋鮭(Salmosalar)上市,成為全球第一例準入市場的轉(zhuǎn)基因動物食品[2]。極大促進了培育安全可靠轉(zhuǎn)基因魚新品種的步伐。
魚類轉(zhuǎn)基因是通過轉(zhuǎn)基因技術(shù),人工操作把外源目的基因?qū)胄约毎?,使外源目的基因整合到動物本身的基因組中,從而外源目的基因隨胚胎發(fā)育賦予受體動物新的生物學(xué)性狀并穩(wěn)定遺傳給后代。如果外源目的基因整合到動物的部分細胞的基因組中,叫作嵌合體動物;而動物所有的細胞均整合外源目的基因,并具有將外源基因遺傳給下一代的能力,叫作轉(zhuǎn)基因動物??梢哉f,魚類轉(zhuǎn)基因技術(shù)是分子生物學(xué)、細胞學(xué)、遺傳學(xué)、胚胎學(xué)、發(fā)育生物學(xué)等學(xué)科的綜合應(yīng)用[3]。
不論是原核顯微注射法等物理手段,或者DEAE-葡聚糖法等化學(xué)手段,還是逆轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)的生物手段,其目的是將外源目的基因?qū)胄约毎?,重點在于外源目的基因的整合與表達效率。通過對生物基因與表現(xiàn)型進行分析,從而了解外源目的基因的功能。
1.2.1 鋅指核酸酶技術(shù)
ZFN ( zinc finger endonuclease ),鋅指核酸酶是第一代人工核酸內(nèi)切酶。鋅指核酸酶包括DNA切割結(jié)構(gòu)域FokI和鋅指結(jié)構(gòu)的DNA識別結(jié)構(gòu)域兩部分。FokI內(nèi)切酶只有形成二聚體才有活性,DNA識別域包含3個或更多的Cys2-His2鋅指蛋白。這些鋅指蛋白每個可與3個連續(xù)的堿基對相互作用。ZFN技術(shù)開啟了基因組靶向修飾技術(shù)的大門,與同源重組相比大大提高了基因編輯效率,其缺點在于細胞毒性和脫靶現(xiàn)象,且成本相對昂貴,所以被TALEN取代。
1.2.2 類轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物核酸酶技術(shù)
TALEN( transcription activator-like effector nuclease),類轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物核酸酶是第二代人工核酸內(nèi)切酶,包括人工改造的核酸內(nèi)切酶切割域FokI以及DNA識別域。DNA的識別區(qū)域包含許多重復(fù)保守的氨基酸序列模塊組,其中每34個氨基酸組成一個模塊,第12位、第13位氨基酸種類可變,決定了模塊識別靶向點的特異性。TALEN與ZFN相似的是都是由一個結(jié)合域、DNA序列識別區(qū)以及一個DNA切割域構(gòu)成的,不同的是TALEN的兩個單體尾對尾對靶DNA進行特異性識別、結(jié)合,具有切割活性的非特異性二聚體FokI實現(xiàn)識別和切割。相比于ZFN,TALEN具有使基因操作簡便、低毒性、低脫靶率等優(yōu)點。但制約TALEN應(yīng)用推廣的因素在于其模塊組裝費時費力。
1.2.3 CRISPR/CAS核酸酶技術(shù)
CRISPR/CAS 9系統(tǒng),成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列/成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列關(guān)聯(lián)蛋白是第三代人工內(nèi)切酶技術(shù),CRISPR系統(tǒng)有Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型三種類型,CRISPR/CAS 9是由結(jié)構(gòu)較為簡單的Ⅱ型系統(tǒng)為基礎(chǔ)衍生而來。其原理簡述為crRNA-tracrRNA形成RNA雙鏈導(dǎo)向RNA分子(sgRNA),sgRNA與CAS 9蛋白結(jié)合,進而實現(xiàn)對靶DNA的編輯。其較前兩代的優(yōu)勢在于成本低、制作簡單、效率高、適用性廣。
基因編輯技術(shù)在轉(zhuǎn)基因魚類的研究中,主要應(yīng)用在基因敲除、基因定點整合和基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控三方面。對于培育新品系,實現(xiàn)多基因調(diào)控性狀的改良,基因編輯技術(shù)具有廣闊的前景和重要意義。近年來,利用基因編輯技術(shù)在斑馬魚的研究中,進行基因敲除實驗和轉(zhuǎn)基因?qū)嶒?。日本學(xué)者(2014年)運用CRISPR/CAS 9技術(shù),對evx2 基因位點和eng1b 基因位點進行修飾,用顯微注射法注射到斑馬魚性細胞系中,成功將外源目的基因整合并表達;劉斐斐(2017年)等利用CRISPR/CAS 9技術(shù)有效將外源目的基因整合到斑馬魚基因組的特定位置,通過顯微注射法將eGFP熒光蛋白導(dǎo)入斑馬魚性細胞系中,獲得了51.72%的轉(zhuǎn)基因斑馬魚。
1.3.1 顯微注射法
顯微注射法是借助顯微鏡的放大技術(shù),直接將外源目的基因注射到魚類卵母細胞、受精卵、早期胚胎、胚胎干細胞活體細胞中,然后生產(chǎn)個體的方法。此方法是制備轉(zhuǎn)基因生物最簡單可靠的方法,其應(yīng)用范圍廣,轉(zhuǎn)基因長度可達數(shù)百kb,即盡量在合子(受精卵)形成早期導(dǎo)入轉(zhuǎn)基因的DNA,當精子和卵細胞結(jié)合,DNA就被直接注射入細胞中,不需要載體。因此,不存在擾亂該過程的外源基因序列。其缺點在于導(dǎo)入的基因隨機整合在染色體DNA上,有時會導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因動物基因組的重排、易位、缺失或點突變。顯微注射法應(yīng)用依賴于魚類卵母細胞體外成熟技術(shù),至今報道的卵母細胞能在體外條件下完全成熟的只有金魚、斑馬魚和青鳉3種[3]。在斑馬魚、大西洋鮭魚、鯉魚、美國鲇魚、泥鰍魚、鯽魚等轉(zhuǎn)基因研究中廣泛采用此方法。1986年,Ozato等用顯微注射法將外源目的基因SV40PcCr導(dǎo)入青鳉魚體內(nèi)成功獲得了轉(zhuǎn)基因魚[4]。
1.3.2 電穿孔法
電穿孔法是利用脈沖電場提高細胞膜的通透性,在細胞膜上形成納米大小微孔,使外源目的基因轉(zhuǎn)移到細胞中。此方法可大批處理受精卵且操作簡便,但外源基因?qū)腚S機且轉(zhuǎn)移頻率相對較低[3]。1992年,Buono等用此技術(shù)成功使乙酰轉(zhuǎn)移酶基因在斑馬魚體內(nèi)表達[5]。
1.3.3 精子載體介導(dǎo)法
該方法是將精子作為外源目的基因運載工具,用人工授精的方法導(dǎo)入卵內(nèi)的技術(shù)。其優(yōu)點是準確性極高,且省略了顯微注射等方法的復(fù)雜過程和設(shè)備;缺點在于難以高效地將外源目的基因?qū)刖蛹毎?。目前,根?jù)外源目的基因的導(dǎo)入形式等,又可分為直接混合法、電穿孔精子載體法、脂質(zhì)體法三種。1989年,沈孝宙用鯉精子作為運載工具,成功獲得超過50%明顯表達生長素的轉(zhuǎn)基因魚[6]。
1.3.4 基因槍法(微彈轟入法)
基因槍法是用吸附DNA的鎢微粒子高速轟擊受體細胞,從而達到轉(zhuǎn)移外源目的基因的目的。此方法在植物轉(zhuǎn)基因領(lǐng)域應(yīng)用較多。其優(yōu)點在于可在短期內(nèi)處理多個細胞。但由于其穩(wěn)定性和表達的問題,以及魚類的卵核小而卵黃大的特點,導(dǎo)致該方法應(yīng)用較少[3]。1990年,Zelenin等用基因槍法將含有半乳糖酶和新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶的目的基因序列成功轉(zhuǎn)移到虹鱒、歐洲泥鰍和斑馬魚的胚胎中[7]。
此外,動物轉(zhuǎn)基因技術(shù)還有染色體片段微注入法、逆轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)法、胚胎干細胞介導(dǎo)法、磷酸鈣共沉淀法、激光處理法、DEAE-葡聚糖法等。但在魚類轉(zhuǎn)基因研究中,還沒有較為成功的報道。
轉(zhuǎn)基因動物研究中,抗病育種一直作為一個研究熱點,在魚類轉(zhuǎn)基因的研究中對比畜牧轉(zhuǎn)基因抗病育種工作,開展的工作相對晚一些。2004年,Mao等使用電穿孔法將hLF基因的cDNA轉(zhuǎn)入草魚的性細胞系中,獲得了超過55%的對嗜水氣單胞菌抗性顯著提高的轉(zhuǎn)基因草魚;2005年,EL-Zaeem and Assem將鯊魚的DNA注射到了羅非魚性細胞系中,獲得了具有抗體活性高、免疫球蛋白大量提高的轉(zhuǎn)基因魚類。
魚類的品種改良涉及到魚的生長速度、適應(yīng)性、營養(yǎng)組成和抗逆性等。對比傳統(tǒng)育種通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)對魚類進行品種改良可以極大縮短改良進程。在最早的轉(zhuǎn)基因魚類的研究中,首先是導(dǎo)入生長激素基因(GH)加快生長速度,提高經(jīng)濟效益。2000年,Martinez等成功從鮭魚提取生長激素,導(dǎo)入了羅非魚性細胞系中,在CMV啟動子驅(qū)動下,成功培育出食物轉(zhuǎn)化率顯著提高2.9倍的轉(zhuǎn)基因魚。在品種改良中,抗凍蛋白的轉(zhuǎn)基因魚類培育也是轉(zhuǎn)基因的熱點,但此前的轉(zhuǎn)抗凍蛋白基因魚類都未達到預(yù)期效果。2005年,Dunham等將轉(zhuǎn)抗凍蛋白的斑點叉尾鮰置入土池,存活率對比非轉(zhuǎn)基因斑點叉尾鮰約提高40%。通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)對魚類進行品種改良育種,將是未來的重要研究方向。
魚類具有個體適中,世代周期短、胚胎透明、體外發(fā)育等特點,斑馬魚是魚類中較有代表性的種類。因此,轉(zhuǎn)基因魚類作為模式生物對于基因的表達調(diào)控、形態(tài)發(fā)生發(fā)育、環(huán)境監(jiān)測藥物篩選等領(lǐng)域具有獨特優(yōu)勢。2009年,夏銘等成功用轉(zhuǎn)基因斑馬魚構(gòu)建了胰島素β-細胞發(fā)育模型;2013年,蒲韻竹等用轉(zhuǎn)基因斑馬魚建立了阿爾茨海默病動物模型[10]。隨著多種魚類基因組測序工作的完成,我們看到了魚類作為模式生物的廣闊前景,為人類在疾病治療、疾病機理、藥物研發(fā)等領(lǐng)域提供了更多科學(xué)依據(jù)。
近幾年,轉(zhuǎn)基因魚類的研究主要集中在提高生長速度、抗逆抗病育種等與經(jīng)濟效益有關(guān)的研究工作,但隨著分子生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域的不斷突破,魚類轉(zhuǎn)基因研究將越來越呈現(xiàn)多學(xué)科交叉的特點。最近,我國我國完成了大量魚類的基因組測序和功能基因注釋工作,包括鯉魚、草魚、大黃魚等,將已知魚類的優(yōu)良性狀通過轉(zhuǎn)基因平臺,可以廣泛的開展轉(zhuǎn)基因魚類的育種工作?;蚓庉嫾夹g(shù)的發(fā)展不僅顯著提高了轉(zhuǎn)基因效率,還在外源目的基因的定點整合中,對轉(zhuǎn)基因魚類的研究起到了不可替代的作用。未來的魚類轉(zhuǎn)基因,將會越來越依靠分子生物學(xué)、細胞學(xué)、遺傳學(xué)、胚胎學(xué)、發(fā)育生物學(xué)等學(xué)科等學(xué)科的理論技術(shù)突破,完成自身的創(chuàng)新發(fā)展。
隨著基因組、蛋白組等“組學(xué)”的發(fā)展,以及基因組測序、高通量基因篩選、基因組關(guān)聯(lián)分析等技術(shù)的大規(guī)模應(yīng)用,外源目的基因的來源呈現(xiàn)多樣化趨勢,可以從微生物、動物、植物等挖掘出抗旱、抗寒、抗蟲、營養(yǎng)改良等功能豐富的基因。魚類作為脊椎動物門中占半數(shù)以上的種類,其繁殖周期和繁殖數(shù)量的優(yōu)勢明顯,將會成為功能基因的“重要產(chǎn)地”和性狀輸出生物,為轉(zhuǎn)基因育種研究注入新的動力。
轉(zhuǎn)基因魚類在研發(fā)初期主要集中在單一功能的外源目的基因上。隨著生物技術(shù)的不斷進步,多基因復(fù)合性狀的轉(zhuǎn)基因技術(shù)將成為研發(fā)重點。多基因不僅能夠使性狀協(xié)同表達,還會大大提高基因轉(zhuǎn)化率。未來轉(zhuǎn)基因魚將具有肉質(zhì)好、生長快、耐低溫低氧等許多復(fù)合優(yōu)良性狀。
生物反應(yīng)器是指通過轉(zhuǎn)基因生物對外源目的基因的高效率表達,進而工業(yè)化生產(chǎn)功能蛋白質(zhì)的技術(shù)?,F(xiàn)在,世界許多公司利用轉(zhuǎn)基因生物反應(yīng)器生產(chǎn)醫(yī)用蛋白,例如β-乳球蛋白、hFVIII和紅細胞生成素等。但以轉(zhuǎn)基因魚類作為生物反應(yīng)器的研究還相對滯后,魚類作為高產(chǎn)量、低成本的生物反應(yīng)器優(yōu)勢明顯。隨著魚類轉(zhuǎn)基因技術(shù)的日趨成熟,魚類作為生物反應(yīng)器必將迎來屬于自己的時代。