流行病學(xué)、環(huán)境醫(yī)學(xué)

寨卡病毒病

林丹，嚴(yán)延生

摘要：目的：寨卡病毒病是由寨卡病毒引起的急性傳染病。通過(guò)受到感染的伊蚊屬蚊子叮咬傳播到人，還可能由孕母在懷孕或生產(chǎn)過(guò)程中傳播給胎兒或嬰兒，也可能發(fā)生性傳播或輸血傳播。寨卡病毒病可造成神經(jīng)和自身免疫系統(tǒng)的并發(fā)癥，如格林-巴利綜合征，孕婦感染寨卡病毒則可能引起嬰兒小頭畸形。2015年以來(lái)，報(bào)告寨卡病毒病本地傳播的國(guó)家和地區(qū)為41個(gè)。截至2016年3月 10日，我國(guó)內(nèi)地共報(bào)告輸入性顯性感染寨卡病毒病確診病例 13例，尚無(wú)本地感染病例報(bào)告，但不同省份在不同時(shí)期都極有可能面臨著寨卡病毒輸入和本地傳播的風(fēng)險(xiǎn)。本文通過(guò)研究總結(jié)寨卡病毒及寨卡病毒病的疾病特征，為我國(guó)寨卡病毒病的防控提供科學(xué)依據(jù)。方法：收集各國(guó)政府、WHO等官方網(wǎng)站及多國(guó)權(quán)威媒體信息，進(jìn)行總結(jié)分析。結(jié)果：寨卡病毒屬于黃病毒科黃病毒屬，是全長(zhǎng)為10794 kb的不分節(jié)段單股正鏈RNA病毒。寨卡病毒的全基因組序列分為非洲系和亞洲系兩大譜系。寨卡病毒主要的脊椎動(dòng)物宿主為猴子和人類。人體因受攜帶病毒的雌蚊叮咬感染寨卡病毒。母嬰傳播也是傳播途徑，目前還認(rèn)為寨卡病毒能通過(guò)性傳播與輸血傳播。許多病例提示了寨卡病毒出現(xiàn)直接人傳人的可能性，這將第一次證實(shí)蟲(chóng)媒疾病可通過(guò)性接觸傳播。20世紀(jì) 50年代起，赤道周圍的非洲和亞洲國(guó)家時(shí)有寨卡病毒病病例發(fā)生。2015年3月寨卡病毒病出現(xiàn)于巴西東北部并傳遍全國(guó)。2016年1月，WHO發(fā)布聲明，估計(jì)1500000人已經(jīng)感染了寨卡病毒，預(yù)測(cè)該病毒可能于年底前蔓延至整個(gè)美洲的大部分地區(qū)。在大多數(shù)情況下，寨卡病毒病是一種相對(duì)輕微的疾病，僅有1/5的患者出現(xiàn)癥狀。最常見(jiàn)的癥狀為輕微發(fā)熱，乏力，皮疹，關(guān)節(jié)肌肉痛和結(jié)膜炎。孕婦感染寨卡病毒后，通過(guò)母嬰傳播可能導(dǎo)致胎兒腦部發(fā)育異常，導(dǎo)致流產(chǎn)或小頭畸形。2015年3月至2016年1月寨卡病毒病流行期間，巴西至少報(bào)告了4783例孕婦感染寨卡病毒后的小頭畸形疑似病例，與以前相比增加了20倍。2016年2月1日，WHO宣布，鑒于孕期寨卡病毒感染與小頭畸形存在高度可疑的因果關(guān)系，繼2014年法屬波利尼西亞發(fā)生類似聚集性病例之后，巴西近期報(bào)告的小頭癥和其他神經(jīng)疾患聚集性病例構(gòu)成國(guó)際關(guān)注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件。寨卡病毒感染的實(shí)驗(yàn)室診斷方法包括PCR檢測(cè)病毒RNA，以及檢測(cè)血清中的寨卡病毒抗體（IgM）等。檢測(cè)樣本一般為血液，唾液，尿液。針對(duì)寨卡病毒病無(wú)有效的抗病毒藥物和特效疫苗。寨卡病毒病的預(yù)防措施與其他蟲(chóng)媒傳播疾病相同，即預(yù)防蚊蟲(chóng)叮咬和蟲(chóng)媒控制。結(jié)論：針對(duì)我國(guó)近期不斷出現(xiàn)輸入性病例的事實(shí)，建議外防輸入，內(nèi)防擴(kuò)散。各地政府有關(guān)機(jī)構(gòu)應(yīng)向公眾提供寨卡病毒病的健康知識(shí)宣傳。勸導(dǎo)孕婦及育齡婦女不去疫區(qū)，要切實(shí)做好環(huán)境整治，滅蚊控蚊等愛(ài)國(guó)衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)，并對(duì)來(lái)自疫區(qū)可能暴露于寨卡病毒的旅行人員進(jìn)行健康評(píng)估，有效防止輸入性寨卡病毒病的擴(kuò)散流行。

來(lái)源出版物：中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào), 2016, 32(3): 209-218

入選年份：2016

長(zhǎng)鏈非編碼RNA研究進(jìn)展

楊峰，易凡，曹慧青，等

摘要：基因組計(jì)劃研究表明，在組成人類基因組的30億個(gè)堿基對(duì)中，僅有1.5%的核酸序列用于蛋白質(zhì)編碼，其余 98.5%的基因組為非蛋白質(zhì)編碼序列。這些序列曾被認(rèn)為是在進(jìn)化過(guò)程中累積的“垃圾序列”而未予以關(guān)注，但在隨后啟動(dòng)的ENCODE研究計(jì)劃中卻發(fā)現(xiàn)，75%的基因組序列能夠被轉(zhuǎn)錄成 RNA，其中近 74%的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為非編碼RNA（Non-coding RNA，ncRNA）。在非編碼RNA中，絕大多數(shù)轉(zhuǎn)錄本的長(zhǎng)度大于200個(gè)堿基，這些“長(zhǎng)鏈非編碼RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）”能夠在轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)節(jié)蛋白編碼基因的表達(dá)，從而廣泛地參與包括細(xì)胞分化、個(gè)體發(fā)育在內(nèi)的重要生命過(guò)程，其異常表達(dá)還與多種人類重大疾病的發(fā)生密切相關(guān)。文章綜述了長(zhǎng)鏈非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)、分類、表達(dá)、作用機(jī)制以及其在個(gè)體發(fā)育和人類疾病中的作用。基因組研究計(jì)劃的成果表明，在人類基因組序列中僅有1.5%的核酸序列用于蛋白質(zhì)編碼，結(jié)合2012年發(fā)布的 ENCODE研究數(shù)據(jù)，人們意外地發(fā)現(xiàn)在占據(jù)人類基因組 98.5%的非蛋白編碼序列中，絕大多數(shù)被轉(zhuǎn)錄成長(zhǎng)度大于 200個(gè)堿基的所謂“長(zhǎng)鏈非編碼 RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）”。近年來(lái)，隨著二代測(cè)序技術(shù)的廣泛應(yīng)用，長(zhǎng)鏈非編碼 RNA的神秘面紗才逐漸被揭開(kāi)，積累的研究數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)鏈非編碼RNA在多個(gè)層面上參與細(xì)胞分化和個(gè)體發(fā)育等重要生命過(guò)程的調(diào)控，并與人類的重大疾病密切相關(guān)。本文結(jié)合國(guó)內(nèi)外長(zhǎng)鏈非編碼 RNA的研究現(xiàn)狀，對(duì)其發(fā)現(xiàn)過(guò)程、分類標(biāo)準(zhǔn)和表達(dá)、作用機(jī)制以及在個(gè)體發(fā)育和人類疾病中的作用進(jìn)行綜述。

來(lái)源出版物：遺傳, 2014, 36(5): 456-468

入選年份：2016

單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)的原理與應(yīng)用

柳延虎，王璐，于黎

摘要：?jiǎn)畏肿覦NA測(cè)序技術(shù)是近10年發(fā)展起來(lái)的新一代測(cè)序技術(shù)，也稱為第三代測(cè)序技術(shù)，包括單分子實(shí)時(shí)測(cè)序、真正單分子測(cè)序、單分子納米孔測(cè)序等技術(shù)。文章介紹了單分子實(shí)時(shí)（single-molecule real-time，SMRT）測(cè)序技術(shù)的基本原理、性能以及應(yīng)用。與Sanger測(cè)序法和下一代測(cè)序技術(shù)相比，SMRT測(cè)序具有超長(zhǎng)讀長(zhǎng)、測(cè)序周期短、無(wú)需模板擴(kuò)增和直接檢測(cè)表觀修飾位點(diǎn)等特點(diǎn)，為研究人員提供了新選擇。同時(shí)，SMRT測(cè)序的低準(zhǔn)確率備受爭(zhēng)議（約85%），其中約93%的錯(cuò)誤是插入缺失，因此，其數(shù)據(jù)應(yīng)用于基因組組裝前需先對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行糾錯(cuò)處理。目前，SMRT測(cè)序在小型基因組從頭測(cè)序和完整組裝中已有良好應(yīng)用，并且已經(jīng)或?qū)⒃诒碛^遺傳學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、大型基因組組裝等領(lǐng)域發(fā)揮其優(yōu)勢(shì)，促進(jìn)基因組學(xué)的研究。DNA序列蘊(yùn)藏了生物絕大部分遺傳信息，是生物遺傳和進(jìn)化的基礎(chǔ)。獲得 DNA序列對(duì)于闡明生命奧秘至關(guān)重要。為了測(cè)定 DNA序列，1977年，Maxam和Gibert發(fā)明了化學(xué)降解法。同年，Sanger發(fā)明了雙脫氧末端終止法，即至今廣泛應(yīng)用的 Sanger測(cè)序法。20世紀(jì) 90年代，熒光自動(dòng)測(cè)序技術(shù)用熒光代替Sanger法中的同位素，實(shí)現(xiàn)了自動(dòng)化測(cè)序。這些技術(shù)現(xiàn)在也被稱為第一代測(cè)序技術(shù)（first-generation sequencing）。應(yīng)用Sanger測(cè)序法，人們完成了人類基因組計(jì)劃。目前應(yīng)用最廣泛的第一代測(cè)序儀是ABI 3730xl測(cè)序儀，該測(cè)序儀擁有較長(zhǎng)讀長(zhǎng)（平均讀長(zhǎng)700 bp）和極高準(zhǔn)確率（99.9%），但是由于相對(duì)高昂的成本，目前主要應(yīng)用于細(xì)菌基因組測(cè)序、質(zhì)粒測(cè)序、細(xì)菌人工染色體末端測(cè)序、突變位點(diǎn)驗(yàn)證等研究，而在大型基因組組裝方面已很少應(yīng)用。

來(lái)源出版物：遺傳, 2015, 37(3): 259-268

入選年份：2016