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      以自然之力恢復(fù)自然
      ——湘潭縣鳳形山有益微生物篩選鑒定研究

      2017-12-04 10:33:56文湖南師大附中梅溪湖中學(xué)李潤龍中南大學(xué)第一附屬中學(xué)王子璇何凱科
      發(fā)明與創(chuàng)新 2017年42期
      關(guān)鍵詞:有益芽孢菌落

      文湖南師大附中梅溪湖中學(xué) 李潤龍中南大學(xué)第一附屬中學(xué) 王子璇 何凱科

      以自然之力恢復(fù)自然
      ——湘潭縣鳳形山有益微生物篩選鑒定研究

      文湖南師大附中梅溪湖中學(xué) 李潤龍中南大學(xué)第一附屬中學(xué) 王子璇 何凱科

      2016年暑假,我們?nèi)ハ嫣犊h鳳形山學(xué)習(xí)考察時得知,長沙某大酒店高管左叔叔一直想憑借自己的努力,在鳳形山建設(shè)有機農(nóng)場,帶動鄉(xiāng)親們致富。他決心告別目前“大農(nóng)藥、大化肥”等技術(shù)為主的化學(xué)農(nóng)業(yè)模式,轉(zhuǎn)向“動物、植物與微生物完美配合、自動循環(huán)”的有機生態(tài)農(nóng)業(yè)模式,以保證農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)、保護(hù)消費者健康,達(dá)到“以自然之力恢復(fù)自然”“天人合一”的理想境界。

      鳳形山區(qū)域零星分布著一些長勢良好的一季稻,主要供村民自己食用,幾乎沒有施用農(nóng)藥、化肥及除草劑等。

      村里長壽老人多,夏天蚊蟲少,水稻生長茂盛,很少發(fā)生病蟲害。而周邊幾個村子的水稻或多或少都發(fā)生過紋枯病之類的病害,造成嚴(yán)重的減產(chǎn)甚至絕收。

      我們猜想,鳳形山可能具有獨特的微生態(tài)環(huán)境,其中某些有益微生物抑制了水稻病害的發(fā)生。因此,有必要篩選經(jīng)濟高效、無副作用的有益微生物,將其應(yīng)用于有機水稻等農(nóng)產(chǎn)品病害防治的研究,并探索有益微生物協(xié)同防治水稻紋枯病的新途徑。

      一、擬建生態(tài)農(nóng)場區(qū)域環(huán)境檢測

      參考關(guān)于有機農(nóng)場開發(fā)與環(huán)境相適應(yīng)的評價方法的相關(guān)文獻(xiàn),鳳形山區(qū)域環(huán)境中大氣污染物、土壤和水源的重金屬及農(nóng)殘等技術(shù)指標(biāo)均達(dá)到有機農(nóng)場的建設(shè)要求。

      在無人工干預(yù)之下,該區(qū)域良好的自然環(huán)境及微生態(tài)系統(tǒng)經(jīng)過三十多年的自由生長,很可能孕育了一系列有益微生物種群,通過篩選、分離和鑒定,為有機水稻等農(nóng)產(chǎn)品病害防治和有機農(nóng)場的建設(shè)創(chuàng)造條件。

      二、土壤微生物取樣及培養(yǎng)

      1.土壤微生物取樣

      采樣地點為湘潭縣中路鋪鎮(zhèn)鳳形山。通過手機定位在擬建有機農(nóng)場定位三地塊15個點,每個點分四層取樣,培養(yǎng)和篩選優(yōu)勢菌株。

      2.樣品分類

      樣品分為四類:表層土壤;1cm~10cm土層土壤;10cm~20cm土層土壤;20cm~30cm土層土壤。

      表層土壤

      1cm~10cm

      10cm~20cm

      20cm~30cm

      3.土壤微生物培養(yǎng)

      a.取一定量陰干的土壤,置于滅菌后的研缽內(nèi)研磨,使土壤顆粒均勻、細(xì)膩。稱取1g研磨好的土樣,加入9mL無菌水用力振蕩15min,使土樣分布均勻,成為土壤懸液。

      b.取1mL土壤懸液滴入滅菌試管中,用無菌水依次稀釋成3個濃度梯度,分別為 10、100、1 000。分別取土壤稀釋液1 000倍液100uL,用滅菌的L型玻璃棒均勻地涂于LB培養(yǎng)基和PDA培養(yǎng)基平板上,于28℃恒溫培養(yǎng)48h。

      c.挑選各個菌落分離培養(yǎng)。挑取真菌菌落置于PDA平板培養(yǎng),挑取細(xì)菌菌落在LB平板進(jìn)行劃線培養(yǎng)。

      結(jié)果表明,鳳形山荒廢多年的平緩坡地土壤中的微生物種類豐富,且菌落種數(shù)表層土壤>1cm~10cm土層>10cm~20cm土層>20cm~30cm土層,底層微生物以厭氧真菌為主,好氧細(xì)菌很少。

      三、微生物菌落分離

      通過觀察在LB平板和PDA平板上生長的菌落的形態(tài)、顏色、生長狀況等,共挑選出6種細(xì)菌和2種真菌。

      其中細(xì)菌分別標(biāo)號為ZN-1、ZN-2、ZN-3、ZN-4、ZN-5、ZN-6,真 菌標(biāo)號 為ZN-A、ZN-B。

      隨后挑選了5株細(xì)菌(ZN-1、ZN-2、ZN-3、ZN-4、ZN-6)和 2 株真菌進(jìn)行菌種鑒定。

      四、微生物菌種鑒定

      樣品采用 Bacterial DNA Kit(Omega)試劑盒進(jìn)行基因組DNA提取,再經(jīng)過Sanger測序、建庫上機測序,得到的原始序列在Galaxy平臺進(jìn)行質(zhì)控后獲得初處理序列。將獲得的初處理序列中含有重疊部分的序列進(jìn)行拼接,然后將重復(fù)序列去除。

      將拼接后的序列在NCBI(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)上進(jìn)行核苷酸 blast比對,比對結(jié)果利用RDP獲取物種分類信息。

      五、微生物基因序列及分析鑒定

      NCBI的比對結(jié)果顯示,ZN-2基因序列有946個堿基,與芽孢桿菌屬的多個種的細(xì)菌完全匹配,E-value為0,且覆蓋率高達(dá)99%,可以確定ZN-2屬于芽孢桿菌屬。

      選擇其中相似性較高的分布在芽孢桿菌屬的15種細(xì)菌,下載它們的基因序列,使用軟件MEGA 5.0繪制系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)育樹顯示ZN-2與Bacillus pumilus strain NJ-M2的親緣關(guān)系最接近,所以推猜測ZN-2屬于短小芽孢桿菌Bacillus pumilus。

      ZN-2短小芽孢桿菌

      5株微生物中ZN-1為假單胞菌屬,ZN-2、ZN-3、ZN-4、ZN-6 分別為短小芽孢桿菌、海洋芽孢桿菌、甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌、蠟樣芽胞桿;ZN-A、ZN-B及ZN-5有待進(jìn)一步鑒定。

      由此可以初步斷定,鳳形山獨特的有益微生物極有可能是芽孢桿菌菌落。芽孢桿菌屬的絕大多數(shù)菌種都有很好的安全性,不會對環(huán)境造成再次污染。這些有益芽孢桿菌的發(fā)現(xiàn)為有機農(nóng)場的建設(shè)及有機水稻的生產(chǎn)奠定了良好的基礎(chǔ)。(指導(dǎo)老師:段家鐵 蔣銀生)

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