在患CyHV-2病的異育銀鯽腸道黏膜中膽固醇、膽汁酸代謝通路基因的差異表達

葉元土 吳 萍 蔡春芳 林秀秀 吳代武 何 杰 張寶彤 蕭培珍

(1. 蘇州大學基礎醫(yī)學與生物科學學院, 江蘇省水產(chǎn)動物營養(yǎng)重點試驗室, 蘇州 215123; 2. 北京營養(yǎng)源研究所水產(chǎn)動物系統(tǒng)營養(yǎng)研究開放試驗室, 北京 100000)

在患CyHV-2病的異育銀鯽腸道黏膜中膽固醇、膽汁酸代謝通路基因的差異表達

葉元土1吳 萍1蔡春芳1林秀秀1吳代武1何 杰1張寶彤2蕭培珍2

(1. 蘇州大學基礎醫(yī)學與生物科學學院, 江蘇省水產(chǎn)動物營養(yǎng)重點試驗室, 蘇州 215123; 2. 北京營養(yǎng)源研究所水產(chǎn)動物系統(tǒng)營養(yǎng)研究開放試驗室, 北京 100000)

為了探討CyHV-2疾病條件下異育銀鯽膽汁酸腸肝循環(huán)代謝途徑主要基因表達活性的變化, 以患CyHV-2病的、正常的異育銀鯽腸道黏膜為材料, 提取總RNA, 采用RNA-Seq測序、對單一基因進行注釋, 并進行KEGG富集分析、單一基因差異表達分析。結果顯示, 腸道黏膜組織有7770個基因顯著性差異表達, 其中, 差異表達上調基因數(shù)為3335個、差異表達下調的基因數(shù)為4435個, 表明CyHV-2病的發(fā)生對腸道黏膜組織基因表達產(chǎn)生了重大的影響。病魚膽固醇、膽汁酸生物合成代謝途徑的酶、蛋白質的基因顯著性差異表達, 顯示腸道黏膜膽固醇、膽汁酸合成代謝受到顯著性影響。參與膽固醇、膽汁酸合成代謝調節(jié)作用, 以及膽固醇、膽汁酸分泌、吸收、轉運等生理過程的蛋白質、酶的基因也是差異表達下調, 膽汁酸腸肝循環(huán)有出現(xiàn)代謝障礙的趨勢。結果表明, CyHV-2病的發(fā)生對腸道黏膜組織基因表達產(chǎn)生了嚴重影響, 對膽固醇、膽汁酸的合成代謝途徑、膽汁酸腸肝循環(huán)途徑的基因表達產(chǎn)生了嚴重影響, 將導致病魚體內膽固醇、膽汁酸量的不足?；糃yHV-2病病魚血清膽汁酸含量下降了99%、膽固醇含量下降了10%, 證實了上述基因差異表達的趨勢。

氧化魚油; 黏膜; 膽固醇; 膽汁酸; 異育銀鯽

油脂是水產(chǎn)動物飼料的主要營養(yǎng)物質和能量物質, 而油脂易氧化, 其氧化的中間產(chǎn)物、終產(chǎn)物對水產(chǎn)動物具有氧化損傷作用[1,2]。在草魚飼料中添加氧化魚油[3]或者對草魚灌胃氧化魚油[4], 導致草魚肝胰臟、腸道黏膜膽固醇生物合成通路基因差異表達, 血清、腸道內膽汁酸含量顯著下降; 膽汁酸的腸肝循環(huán)受到嚴重的障礙, 而膽汁酸的腸肝循環(huán)對于維護肝胰臟和腸道組織結構完整性和功能完整性具有重要的生理作用[4]。異育銀鯽(Carassius auratus gibelio)受到鯉皰疹Ⅱ型病毒(CyHV-2)感染后出現(xiàn)全身性出血癥狀, 并導致主要器官組織如肝胰臟、脾臟、腎臟、腸道黏膜、血液等組織嚴重損傷; 同時, 病魚血清的膽固醇和膽汁酸含量顯著下降[5—7]。腸道黏膜是動物體內代謝活躍的器官組織, 也是膽固醇、膽汁酸合成的重要器官組織之一, 本文分別以正常的、患CyHV-2病的異育銀鯽腸道黏膜為材料, 提取總RNA后采用高通量測序技術(RNA-Seq)進行轉錄組分析, 以正常異育銀鯽的結果為對照, 在轉錄組水平上, 對參與膽固醇、膽汁酸生物合成通路的蛋白質、酶的基因進行功能注釋和差異表達活性分析, 探討在患CyHV-2病的情況下, 異育銀鯽腸道黏膜組織中膽固醇、膽汁酸合成代謝的酶、蛋白質基因表達活性的變化, 以及參與膽汁酸腸肝循環(huán)的酶、蛋白質基因表達活性的變化, 從一個側面、從轉錄組水平較為宏觀的視覺探討異育銀鯽患CyHV-2病的病理代謝變化, 為該病的病理分析和防治提供參考。

1 材料與方法

1.1 試驗魚

江蘇鹽城大豐市池塘養(yǎng)殖的異育銀鯽。正常魚無CyHV-2病發(fā)病特征, 病魚則是具有CyHV-2病發(fā)病特征、經(jīng)過PCR定量檢測帶有CyHV-2病毒的異育銀鯽[5—7]。

參照林秀秀等[5—7]對異育銀鯽CyHV-2病鑒定方法, 用于血清膽固醇、膽汁酸含量分析的試驗魚包括正常(H)組(CyHV-2的PCR檢測結果陰性)、攜帶CyHV-2(CyHV-2的PCR檢測結果陽性)但未出現(xiàn)病癥(IH)組、典型的CyHV-2病癥(I)組(CyHV-2的PCR檢測結果陽性)異育銀鯽, 體重為350—510 g,每組各9尾、共27尾。

1.2 血清采集與總RNA提取

按照常規(guī)方法采集正常組(H)、攜帶CyHV-2但無病癥組(IH)、患CyHV-2病并具有典型病癥組(I)的異育銀鯽血清, 用雅培C800全自動生化分析儀測定血清膽固醇和膽汁酸含量。

正常組、患CyHV-2病組異育銀鯽腸道黏膜各9個樣本(每尾魚為1個樣本), 分別用試劑盒(EASYspin Plus)每尾魚獨立用于提取總RNA, 電泳檢測RNA質量。正常組、病魚組分別選取電泳條帶亮度高、清晰、無拖尾的高質量RNA進行等量混合, 正常組、病魚組各1個樣本(每個樣本至少有5尾試驗魚的總RNA樣本組成), RNA質量約4 μg。同樣方法再混合一個RNA樣本, 其余的RNA舍棄。正常組、病魚組分別得到2個(n=2)平行樣本用于RNA-seq分析。

1.3 轉錄組分析

RNA-Seq 樣品總RNA用DNaseⅠ消化DNA后, 用Oligo d (T)磁珠純化總RNA中的mRNA,向得到的mRNA中加入適量打斷試劑, 在高溫條件下使其片段化, 再以片段后的RNA為模板, 合成cDNA, 經(jīng)過磁珠純化、末端修復、3'末端加堿基A、加測序接頭后, 進行PCR擴增, 從而完成整個文庫制備工作。構建好的文庫用Agilent 2100 Bioanalyzer和ABI Step One Plus Real-Time PCR System質檢和測序。讀段長度125 bp。

無參轉錄組的轉錄本拼接與基因功能注釋

綜上所述，在經(jīng)濟社會發(fā)展的過程中，建筑施工企業(yè)想要保障自身的持續(xù)穩(wěn)定發(fā)展，必須要對自身成本管控工作進行完善，結合新時期發(fā)展趨勢轉變思想觀念，健全成本管控體制，加強專業(yè)人才培養(yǎng)，完善風險防控，如此才能為成本管控工作的實施創(chuàng)造良好的條件，為企業(yè)持續(xù)穩(wěn)定發(fā)展奠定堅實基礎。

經(jīng)過質控(QC)、過濾后得到讀段(clean reads)用Trinity (版本: v2012-10-05, min_kmer_ cov為2)軟件進行無參考基因組的轉錄本拼接。

對拼接好的轉錄本利用不同的數(shù)據(jù)庫進行unigene基因注釋。各數(shù)據(jù)庫及功能注釋所用到的方法: ①與SwissProt、KOG、KEGG GENES序列數(shù)據(jù)庫的比對采用NCBI blast 2.2.27+, 經(jīng)過Swissprot注釋得到了38071個、KOG注釋得到32345個單一基因。②PFAM蛋白結構域預測采用HMMER 3.0 package-hmmscan, 經(jīng)過Pfam注釋得到10227個單一基因。③GO功能注釋為基于Swissprot和Pfam兩部分的蛋白注釋結果, 軟件為Blast2GO v2.5, 經(jīng)過GO注釋得到36838個單一基因。

基因差異表達分析與KEGG通路分析 采用RSEM軟件, 以Trinity拼接得到的轉錄組作為參考序列, 將每個樣品的clean reads對參考序列做比對進行基因表達定量。差異表達分析用edgeR軟件包進行分析。對于所有基因, 當其表達量在正常組、病魚組兩個不同樣品間具有差異且統(tǒng)計分析中調整P值(假陽性率)＜0.05時, 認為其在兩個不同樣品中具有顯著差異表達。

以KEGG Pathway為單位, 應用超幾何檢驗, 找出與整個基因組背景相比、在差異表達基因中顯著性富集的Pathway。以correctedP-value≤0.05為閾值, 滿足此條件的定義為在差異表達基因中顯著富集的KEGG條目。

2 結果

2.1 血清膽固醇、總膽汁酸含量

由表 1可知, 異育銀鯽攜帶CyHV-2后, 在IH組、I組, 其血清中膽汁酸和膽固醇含量顯著下降。與正常魚體的結果比較, 病魚血清總膽汁酸含量下降了99%、血清膽固醇含量下降了10%。

表 1 異育銀鯽血清膽固醇和總膽汁酸含量與比較Tab. 1 Gibel carp serum total cholesterol and bile acid content

2.2 基于轉錄組分析的基因差異表達

基于通過注釋的單一基因結果, 在正常、患CyHV-2病異育鯽魚樣本間進行了基因差異表達分析, 總共有7770個顯著差異表達的基因, 其中, 顯著差異表達上調基因數(shù)為3335個, 占差異表達基因總數(shù)的43%; 顯著表達下調的基因數(shù)為4435, 占57%。由表 2可知, 在KEGG類固醇合成通路的21個基因中, 有15個基因差異表達, 占通路基因總數(shù)的71%;在KEGG初級膽汁酸合成通路的20個基因中, 有14個基因顯著差異表達, 占通路基因總數(shù)的70%;上述2個KEGG通路差異表達均達到顯著性水平(P＜0.05)。上述結果顯示, 異育銀鯽在患CyHV-2病后, 腸道黏膜組織的基因發(fā)生了顯著性的差異表達,其中膽固醇、膽汁酸的生物合成通路基因也發(fā)生了顯著性的差異表達。

表 2 基因顯著差異表達的KEGG路徑富集Tab. 2 Differentially expressed genes of KEGG enrichment

2.3 膽固醇合成通路基因的差異表達

基于患CyHV-2病與正常的異育銀鯽腸道黏膜轉錄組分析結果, 統(tǒng)計了膽固醇生物合成途徑有18個具有差異表達的基因(表 3)。將注釋得到的單一基因序列, 利用NCBI/ Blast進行相對于不同物種相同基因的同源性分析。表 3中的18個基因與斑馬魚、安水金線鲃、犀角金線鲅、滇池金線鲃中相同基因的同源性較高, 同源性達到78%—100%。

log2(I/H)是將患病組單一基因的表達量與對應的正常組基因表達量比對, 進行以2為底的對數(shù)值計算的結果, 該值越大表明基因表達量的差異越大,正值為差異表達上調、負值則為差異表達下調;當≥2、或≤–2時可以視為顯著差異表達。

表 3 CyHV-2病異育銀鯽腸道黏膜組織膽固醇生物合成通路基因差異表達信息Tab. 3 Differentially expressed genes of cholesterol biosynthetic pathway in intestinal mucosa

在表 3中, 僅有固醇O-酰基轉移酶1(SOAT1)的log2(I/H)為正值, 且大于2, 表明為顯著差異表達上調; 其他17個基因的log2(I/H)值全部為負值, 表明為差異表達下調, 其中, 膽固醇生物合成通路關鍵酶HMG-CoA還原酶等12個基因的log2(I/H)值小于“–2”, 為差異表達顯著下調。

上述結果表明, 異育銀鯽在患CyHV-2病后, 腸道黏膜組織的膽固醇生物合成通路的絕大多數(shù)基因顯著差異表達下調, 可能影響到腸道黏膜組織的膽固醇生物合成量的不足。

2.4 膽汁酸合成通路基因的差異表達

表 4中9個基因序列相對于斑馬魚、安水金線鲃、犀角金線鲅相同基因的同源性為83%—98%。由表 4可知, 參與膽汁酸合成的9個基因的log2(I/H)值均為負值, 均為差異表達下調; 其中, 膽汁酸合成通路關鍵基因膽固醇7-α單加氧酶(CYP7A1)、固醇26-羥化酶(CYP27A1)等7個基因的log2(I/H)值小于“–2”, 達到差異表達顯著下調的水平。

表 4 CyHV-2病的異育銀鯽腸道黏膜組織膽汁酸生物合成通路基因差異表達信息Tab. 4 Differentially expressed genes of bile acid biosynthesis pathway in intestinal mucosa

上述結果顯示, 在異育銀鯽患CyHV-2病后, 腸道黏膜組織中膽汁酸合成通路的基因差異表達均為下調, 可能影響到膽汁酸生物合成量的不足, 表明CyHV-2病的發(fā)生將嚴重影響腸道黏膜組織中膽汁酸生物合成代謝途徑基因的表達活性。

2.5 參與膽固醇、膽汁酸生物合成代謝調節(jié)的蛋白質、酶基因的差異表達

表 5 中11個基因序列相對于斑馬魚、安水金線鲃、犀角金線鲅、鯉魚、草魚相同基因的同源性為68%—99%。由表 5可知, 涉及膽固醇轉運的膽固醇酯轉移蛋白(CETP)的log2(I/H)值為–1.64, 調節(jié)膽固醇生物合成通路的限速酶HMG-CoA還原酶表達的固醇調節(jié)元件結合蛋白(SREBF1、SREBF2)的log2(I/H)值為–2.55、–1.51, 低密度脂蛋白受體(LDLR)的log2(I/H)值為–3.85, 氧固醇受體LXR-α的log2(I/H)值為–1.40, 均為負值, 顯示在患CyHV-2病后, 這些基因表達活性下調, 將會引起腸道黏膜組織膽固醇的生物合成量可能下降。

在涉及膽汁酸分泌、吸收和轉運的蛋白質中,僅有膽汁酸受體(FXR)的log2(I/H)值為2.63, 為差異表達上調, 其他的如膽鹽輸出泵(B S E P)的log2(I/H)值為–2.02, 回腸鈉/膽汁酸協(xié)同轉運蛋白(ASBT)的log2(I/H)值為–8.51, 腸膽汁酸結合蛋白(IBABP)的log2(I/H)值為–5.63, 肝膽汁酸結合蛋白(LFABP)的log2(I/H)值為–5.63, 膽汁酸輔酶A(BAAT)的log2(I/H)值為–1.06基因表達活性均為表達下調。

上述結果表明, 在腸道膽固醇、膽汁酸生物合成通路基因差異表達下調的同時, 涉及膽固醇生物合成調節(jié)、膽固醇轉運的蛋白質基因差異表達下調, 涉及膽汁酸分泌、吸收和轉運的蛋白質基因差異表達下調, 其結果可能導致膽固醇、膽汁酸生物合成量不足。而血清膽固醇、膽汁酸含量在患Cy-HV-2病后顯著下降, 也證實了上述結果。

表 5 參與膽固醇、膽汁酸代謝的蛋白質、酶基因的差異表達信息Tab. 5 Differentially expressed genes of cholesterol, bile acid metabolism

3 討論

3.1 患CyHV-2病的異育銀鯽腸道黏膜組織膽固醇生物代謝通路基因的差異表達下調

內環(huán)境穩(wěn)定(內穩(wěn)態(tài))是動物正常生理代謝的基礎。一些生理活性物質如膽固醇、膽汁酸在動物體內保持動態(tài)穩(wěn)定具有重要的生理意義[4,8,9]。膽固醇的來源包括2個方面, 一是由體內組織細胞釋放的膽固醇、從食物中攝取并進入血液的膽固醇;另一個來源則是, 魚類與其他動物一樣, 能夠以乙酰CoA為原料合成膽固醇。膽固醇在體內不能被徹底氧化分解為CO2和H2O, 而經(jīng)氧化和還原反應轉變?yōu)槠渌h(huán)戊烷多氫菲母核的化合物, 主要代謝去路包括作為甾醇類激素生物合成原料、作為膽汁酸合成的原料、轉化為維生素D等[8]。

固醇O-?；D移酶(SOAT)又稱?；D移酶(Cholesterol acyltransferase, ACAT), 是細胞內已知的、唯一催化游離膽固醇與長鏈脂肪酸連接形成膽固醇酯的酶, 有2種同工酶SOAT1、SOAT2或稱ACAT1、ACAT2。SOAT1在各種組織和細胞中都有表達, 主要作用是催化膽固醇的酯化反應、維持細胞內膽固醇的代謝平衡。同時, 有研究表明[10],在血液中的單核細胞分化成巨噬細胞后SOAT1大量表達, 導致細胞內膽固醇酯的過量堆積而形成泡沫細胞。林秀秀等在異育銀鯽CyHV-2病研究中發(fā)現(xiàn), 病魚血液細胞發(fā)生顯著變化, 產(chǎn)生過度的炎癥反應[5,6,7]。在本文中, 病魚腸黏膜中SOAT1的 log2(I/H)值為2.29, 是表 3中唯一差異表達顯著上調的基因, 這是否與血液單核細胞分化為巨噬細胞有關值得進一步的研究。SOAT2則只在肝臟和小腸細胞(主要在小腸上皮細胞絨毛的頂端)中表達, 主要參與膽固醇的吸收以及脂蛋白的裝配。食物來源的膽固醇是以游離的形式被腸道黏膜細胞被動吸收, 膽固醇進入腸黏膜細胞后受SOAT2催化, 膽固醇與脂酰輔酶A結合生成膽固醇脂肪酸酯, 并與載脂蛋白組裝為乳糜微粒進入淋巴系統(tǒng)或血液系統(tǒng)。病魚腸黏膜中SOAT2的log2(I/H)值為–4.31, 顯示腸道黏膜細胞內利用膽固醇形成膽固醇酯、組裝為乳糜微粒的SOAT2作用下降。也表明, 從食物、其他細胞轉運來的膽固醇量可能不足。在表 5中, 影響膽固醇吸收的低密度脂蛋白受體(LDLR)的log2(I/H)值為–3.85, 影響膽固醇轉運的膽固醇酯轉移蛋白(CETP)為–1.64, 顯示均為差異表達下調, 這些結果也表明, 異育銀鯽患CyHV-2病后,從其他器官組織吸收、轉運膽固醇能力下降。

細胞內膽固醇的另一個主要來源是以乙酰輔酶A為原料合成膽固醇, HMG-CoA還原酶(HMGCR)是膽固醇生物合成代謝途徑的限速酶, 該酶位于內質網(wǎng)上的膜整合糖蛋白, 是體內膽固醇生物合成的關鍵酶, 其log2(I/H)值為–6.20, 差異表達顯著下調。從表 3也可以發(fā)現(xiàn), 經(jīng)過基因注釋、差異表達分析得知, 膽固醇生物合成途徑的多個酶蛋白基因均是差異表達下調的, log2(I/H)值為(–6.20)—(–0.37)。在表 5中, 參與膽固醇生物合成代謝調節(jié)作用的固醇調節(jié)元件結合蛋白(SREBF1、SREBP-2)的log2(I/H)值為–2.55、–1.51, 也是差異表達下調的。

已經(jīng)有研究表明, 在飼料氧化油脂刺激下[3,4],以及草魚腸道疾病病理條件下[11], 都會導致腸道黏膜組織的膽固醇、膽汁酸合成代謝發(fā)生顯著的變化。綜合上述分析可以發(fā)現(xiàn), 異育銀鯽在患CyHV-2病后,一方面顯示膽固醇代謝受到嚴重影響, 食物吸收和轉運膽固醇的能力下降, 以乙酰輔酶A為原料合成膽固醇的能力下降, 參與膽固醇合成代謝起調節(jié)作用的蛋白、酶的基因表達活性下降, 可能導致魚體器官組織、血液中膽固醇含量的不足。病魚血清中膽固醇含量較正常魚下降10%也證實了這種趨勢。另一方面, 在對異育銀鯽CyHV-2病進行預防或治療的生產(chǎn)實踐中,有必要通過飼料途徑補充一定量的膽固醇, 這值得進一步的深入研究和驗證。

3.2 患CyHV-2病的異育銀鯽腸道黏膜組織膽汁酸代謝通路基因差異表達下調

以膽固醇為原料合成膽汁酸有2種途徑[8,9]: 經(jīng)典途徑和替代途徑。經(jīng)典途徑是由膽固醇7α羥化酶(CYP7A1)催化, CYP7A1是此反應的限速酶; 替代途徑是由甾醇27α羥化酶(CYP27A1)和甾醇12α羥化酶(CYP7B1)催化的途徑。膽固醇7-α單加氧酶(CYP7A1)是以膽固醇為原料合成膽汁酸代謝經(jīng)典途徑的限速酶, 膽汁酸的合成速度與CYP7A1的活性呈正相關關系, 決定了膽固醇向膽汁酸轉化的速度[3,4]。由表 4可知, CYP7A1的log2(I/H)值為–7.35, 顯示其差異表達顯著下調。代謝途徑中后續(xù)的膽汁酸合成代謝酶的log2(I/H)值均為負值, 顯示膽汁酸合成路徑的催化酶基因差異表達均為下調。CYP7A1的活性和表達量受固醇受體(LXR-α)的調節(jié), 而LXR-α的log2(I/H)值為–1.40, 也是差異表達下調。由表 4可知, 膽汁酸合成替代途徑有甾醇27α羥化酶(CYP27A1) log2(I/H)值為–3.46、甾醇12α羥化酶(CYP7B1) log2(I/H)值為–5.76, 也是差異表達顯著下調。結果表明, 無論是經(jīng)典途徑或是替代途徑, 膽汁酸合成途徑的限速酶、參與催化代謝途徑的酶, 其基因差異表達均為下調。

關于膽汁酸的分泌、重吸收途徑, 膽汁酸在肝臟合成后由膽鹽輸出泵(BSEP)泵入腸道, 游離膽汁酸在腸道由黏膜細胞通過擴散作用被動重吸收, 而結合膽汁酸通過小腸刷狀緣的鈉鹽依賴的膽汁酸轉運體(ASBT)被黏膜細胞主動重吸收, 黏膜細胞內的膽汁酸與回腸膽汁酸結合蛋白(IBABP)結合, 由黏膜基側膜吸收入靜脈、回到肝胰臟, 完成膽汁酸的腸肝循環(huán)[8,9]。在表 5中, BSEP的log2(I/H)值為–2.02, 顯示涉及膽汁酸分泌的蛋白質基因差異表達顯著下調。ASBT、腸膽汁酸結合蛋白(I-BABP)、肝膽汁酸結合蛋白(L-FABP)的log2(I/H)值分別為–8.51、–7.37、–5.63, 顯示涉及膽汁酸重吸收、轉運蛋白質的基因表達活性也是顯著性下調, 膽汁酸有在肝胰臟淤積的發(fā)展趨勢。這些結果顯示, 患CyHV-2病后, 異育銀鯽膽汁酸的分泌、膽汁酸的腸肝循環(huán)途徑中主要蛋白質基因的表達活性也發(fā)生了顯著性變化, 均為顯著性下調, 可能導致膽汁酸的腸肝循環(huán)障礙。病魚血清膽汁酸含量下降99%也證實了這種趨勢。

膽汁酸受體(FXR)是膽汁酸的感受器, 屬于核受體, 受FXR調控的靶基因主要有CYP7A1、BSEP、IBABP等。當膽汁酸濃度過大時, 使CYP7A 1轉錄受到抑制, 膽汁酸合成速度下降。由表 4、表 5可知, FXR、CYP7A1、BSEP、IBABP的log2(I/H)值分別為2.63、–7.35、–2.02、–7.37, 結果顯示, 即使FXR差異表達顯著上調, 但其下游涉及膽汁酸合成、重吸收、轉運的蛋白質基因還是差異表達顯著下調。

上述結果表明, 異育銀鯽在患CyHV-2病后, 腸道黏膜組織膽汁酸生物合成代謝能力下降, 可能導致膽汁酸含量的不足。膽汁酸的分泌、重吸收、轉運的蛋白質基因差異表達下調, 可能導致膽汁酸的腸肝循環(huán)障礙。病魚血清總膽汁酸含量下降99%也證實了這種發(fā)展趨勢。對于異育銀鯽Cy-HV-2病的預防、治療, 以及病后魚體生理健康的恢復, 通過飼料途徑補充適量膽汁酸可能具有可行性, 值得進一步的研究。

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GENE DIFFERENCE EXPRESSION OF CHOLESTEROL AND BILE ACID METABOLISM PATHWAY IN INTESTINAL MUCOSA WITH THE CYHV-2 DISEASE CARASSIUS AURATUS GIBELIO

YE Yuan-Tu1, WU Ping1, CAI Chun-Fang1, LIN Xiu-Xiu1, WU Dai-Wu1, HE Jie1, ZHANG Bao-Tong2and XIAO Pei-Zhen2
(1. Key Laboratory of Aquatic Animal Nutrition, School of Basic Medicine and Biological Science, Soochow University, Suzhou 215123, China; 2. Open Lab for Aquatic Animal Nutrition, Beijing Research Institute for Nutritional, Beijing 100000, China)

Gibel carp (Carassius auratus gibelio) infected with Cyprinid herpesvirus 2 (CyHV-2), damaged many organs including intestinal mucosa. Total RNA of intestinal mucosa from CyHV-2 diseased and normal gibel carp were extracted for RNA-Seq. Transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome was conducted by Trinity (version: v2012-10-05, min_kmer_cov 2) software. Single gene is annotated by using different databases. Software and the database of the functional gene annotation are SwissProt (NCBI blast 2.2.27+, Blast2GO v2.5), KOG (NCBI blast 2.2.27+), PFAM (HMMER 3.0 package), KEGG (KOBAS, NCBI blast 2.2.27+). Gene expression was analyzed by edgeR package. 3335 up-regulated genes and 4435 down-regulated genes were observed, indicating a significant injury in the intestinal mucosa by CyHV-2 infection. The metabolic disorder for enterohepatic circulation of bile acids was supported by the reduced gene expression that regulate cholesterol and bile acid synthesis metabolism and other physiological processes, secretion, absorption and transportation. As a consequence, CyHV-2 infection in Crucian carp decreased the serum bile acid content by 99% and cholesterol content by 10%.

Oxidized fish oil; Mucosa; Cholesterol; Bile acid; Gibel carp

S917

A

1000-3207(2017)05-0956-07

10.7541/2017.119

2016-09-07;

2016-12-24

江蘇省水產(chǎn)三新工程項目(D2015-12)資助 [Supported by the Jiangsu Province, Three New Aquatic Projects (D2015-12) Funding]

葉元土, 教授, 碩士生導師, E-mail: yeyt@suda.edu.cn, Tel./Fax: +86-13912629760